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Objetivo
La bioqumica tiene como objetivo ms importante el estudio de la estructura,
organizacin y funciones de la materia viva desde el punto de vista molecular.
Segn los aspectos tratados, esta puede dividirse en 3 bloques:
1.- bioqumica estructural
2.- bioqumica metablica o metabolismo
3.- biologa molecular
La bioqumica estructural estudia la composicin, conformacin, configuracin y estructura
de las molculas de la materia viva, relacionndolas con su funcin bioqumica.
El metabolismo estudia las transformaciones, funciones y reacciones qumicas que sufren
o llevan a cabo las molculas de la materia viva.
La biologa molecular estudia la qumica de los procesos y molculas implicadas en la
transmisin y el almacenamiento de la informacin biolgica.
La bioqumica, fundamentalmente extrae conocimientos de biologa, qumica y gentica, y
usa tcnicas que ha importado de la fsica.
Estudio e importancia
bioqumica se emplea en espaol para identificar a la ciencia que se encarga
de estudiar desde una perspectiva qumica la estructura y las funciones de los
seres vivos. Tambin se conoce como bioqumico o bioqumica al especialista en esta
materia y a todo lo que est asociado o hace referencia a los fenmenos que estudia.
Qumica General: Estudia los fenmenos comunes a toda la materia, sus propiedades y
leyes. Ciencia experimental que se ocupa de las transformaciones de unas sustancias en
otras sin que se alteren los elementos que las integran.
La Qumica es la ciencia que estudia la materia y sus transformaciones. La Fsica se
ocupa de la
energa y sus transformaciones. La Fisicoqumica abarca el estudio de las interacciones
entre la
materia y la energa, y explica los principios que rigen las transformaciones de la
materia
conocidas como reacciones qumicas, mediante el estudio de las propiedades fsicas de
las
sustancias y del efecto de los cambios fsicos sobre las reacciones.
Los elementos: son sustancias que estn constituidas por tomos
iguales, o sea de la misma naturaleza. Por ejemplo: hierro, oro, plata, calcio, etc. Los compuestos estn
constituidos por tomos diferentes
TOMOS
Los tomos estn constituidos por un ncleo central y electrones, de carga negativa, que
giran
alrededor de l. A su vez el ncleo est formado por protones, de carga positiva, y
neutrones,
que no poseen carga. El tomo es neutro, por lo tanto el nmero de protones es igual al
nmero
de electrones. En general la masa de un tomo es aproximadamente la masa del ncleo,
pues la
masa del electrn es 1840 veces menor que la masa del protn. La masa del neutrn es
aproximadamente igual a la masa del protn.
En cuanto al tamao del tomo, ste es ms o menos 10 000 veces menor que el tamao
del
ncleo, por lo tanto casi todo es vaco.
Cada elemento qumico est caracterizado por el nmero de protones que tienen sus
tomos.
Este nmero se denomina nmero atmico Z.
ESTRUCTURA ATMICA Y MOLECULAR: CONFIGURACIN
ELECTRNICA
De acuerdo con la Mecnica Cuntica no es posible establecer, en un instante dado, la
velocidad y la posicin de un electrn en un tomo. Se habla de probabilidad de hallar a
un
electrn en un determinado lugar alrededor del ncleo.
Los electrones estn dispuestos en capas o niveles que corresponden a zonas con mayor
probabilidad de hallar al electrn. Al aumentar el nmero de electrones, conforme
aumenta el Z,
aumenta el nmero de niveles. Estas capas se denotan con las letras K, L, M, N, O, P, Q,
y
admiten un nmero mximo de electrones, dado por la expresin 2n2
, siendo n el nmero de
capa. As la K admite 2 electrones, la L 8, la M 18, la N 32.
DIFUSION
Es el movimiento de los tomos, iones o molculas, dentro de un material. Estos se mueven
de manera predecible, tratando de eliminar diferencias de concentracin y producir una
composicin homognea y uniforme.
Soluto
Cuando se realiza una disolucin, se le llama soluto al compuesto de menor proporcin al
solvente.
Esta sustancia se encuentra disuelta en una determinada disolucin de cualquier
elemento. En lenguaje comn, tambin se le conoce como la sustancia que se
disuelve,1 por lo que se puede encontrar en un estado de agregacin diferente al comienzo
del proceso de disolucin y experimentar una transicin de fase.
Lo ms habitual es que se trate de un slido en un disolvente lquido, lo que origina una
solucin lquida. Una de las caractersticas ms significativas de una disolucin suele ser
su concentracin de soluto, es decir la medida de la cantidad de soluto contenida en ella.
Otra caracterstica a considerar sera la facilidad para disolverse o solubilidad que pueda
presentar en el disolvente. La solubilidad de un compuesto qumico depende en gran
medida de su estructura molecular. En general, los compuestos
inicos y moleculares polares son solubles en disolventes polares como el agua o
el etanol; y los compuestos moleculares apolares en disolventes apolares como el hexano,
el ter o el tetracloruro de carbono.
SOLUTO:
Se llama soluto a la sustancia minoritaria (aunque existen excepciones) en una disolucin o, en
general, a la sustancia de inters.
Lo ms habitual es que se trate de un slido que es contenido en una solucin lquida (sin que
se forme una segunda fase)
La solubilidad de un compuesto qumico depende en gran medida de su polaridad. En general,
los compuestos inicos y moleculares polares son solubles en disolventes polares como el
agua o el etanol; y los compuestos moleculares apolares en disolventes apolares como el
hexano, el ter o el tetracloruro de carbono
SOLVENTE:
aquella sustancia que permite la dispersin de otra en su seno. Es el medio dispersante de la
disolucin. Normalmente, el disolvente establece el estado fsico de la disolucin, por lo que se
dice que el disolvente es el componente de una disolucin que est en el mismo estado fsico
que la disolucin. Tambin es el componente de la mezcla que se encuentra en mayor
proporcin.
Las molculas de disolvente ejercen su accin al interaccionar con las de soluto y rodearlas. Se
conoce como solvatacin. Solutos polares sern disueltos por disolventes polares al
establecerse interacciones electrostticas entre los dipolos. Los solutos apolares disuelven las
sustancias apolares por interacciones entre dipolos inducidos.
Enlace inico
El enlace inico consiste en la atraccin electrosttica entre tomos con cargas
elctricas de signo contrario. Este tipo de enlace se establece entre tomos de
elementos poco electronegativos con los de elementos muy electronegativos.
Es necesario que uno de los elementos pueda ganar electrones y el otro
perderlo, y como se ha dicho anteriormente este tipo de enlace se suele
producir entre un no metal (electronegativo) y un metal (electropositivo).
Un ejemplo de sustancia con enlace inico es el cloruro sdico. En su
formacin tiene lugar la transferencia de un electrn del tomo de sodio al
tomo de cloro. Las configuraciones electrnicas de estos elementos despus
del proceso de ionizacin son muy importantes, ya que lo dos han conseguido
la configuracin externa correspondiente a los gases nobles, ganando los
tomos en estabilidad. Se produce una transferencia electrnica, cuyo dficit se
cubre sobradamente con la energa que se libera al agruparse los iones
formados en una red cristalina que, en el caso del cloruro sdico, es una red
cbica en la que en los vrtices del paraleleppedo fundamental alternan iones
Cl- y Na+. De esta forma cada ion Cl - queda rodeado de seis iones Na + y
recprocamente. Se llama ndice de coordinacin al nmero de iones de signo
contrario que rodean a uno determinado en una red cristalina. En el caso del
NaCl, el ndice de coordinacin es 6 para ambos
Los compuestos inicos estado slido forman estructuras reticulares cristalinas.
Los dos factores principales que determinan la forma de la red cristalina son las
cargas relativas de los iones y sus tamaos relativos. Existen algunas
estructuras que son adoptadas por varios compuestos, por ejemplo, la
estructura cristalina del cloruro de sodio tambin es adoptada por muchos
haluros alcalinos y xidos binarios, tales como MgO.
Enlace covalente
Lewis expuso la teora de que todos los elementos tienen tendencia a
conseguir configuracin electrnica de gas noble (8 electrones en la ltima
capa). Elementos situados a la derecha de la tabla peridica ( no metales )
consiguen dicha configuracin por captura de electrones; elementos situados a
la izquierda y en el centro de la tabla ( metales ), la consiguen por prdida de
electrones. De esta forma la combinacin de un metal con un no metal se hace
por enlace inico; pero la combinacin de no metales entre s no puede tener
lugar mediante este proceso de transferencia de electrones; por lo que Lewis
supuso que deban compartirlos.
Es posible tambin la formacin de enlaces mltiples, o sea, la comparticin de
ms de un par de electrones por una pareja de tomos. En otros casos, el par
compartido es aportado por slo uno de los tomos, formndose entonces un
enlace que se llama coordinado o dativo. Se han encontrado compuestos
covalentes en donde no se cumple la regla. Por ejemplo, en BCl 3, el tomo de
boro tiene seis electrones en la ltima capa, y en SF 6, el tomo de azufre
consigue hasta doce electrones. Esto hace que actualmente se piense que lo
caracterstico del enlace covalente es la formacin de pares electrnicos
compartidos, independientemente de su nmero.
Fuerzas intermoleculares
A diferencia que sucede con los compuestos inicos, en las sustancias
covalentes existen molculas individualizadas. Entre estas molculas se dan
fuerzas de cohesin o de Van der Waals, que debido a su debilidad, no pueden
considerarse ya como fuerzas de enlace. Hay varios tipos de interacciones:
Fuerzas de orientacin (aparecen entre molculas con momento dipolar
diferente), fuerzas de induccin (ion o dipolo permanente producen en una
molcula no polar una separacin de cargas por el fenmeno de induccin
electrosttica) y fuerzas de dispersin (aparecen en tres molculas no polares).
Electrovalencia y covalencia
Teniendo presenta las teoras de los enlaces inicos y covalentes, es posible
deducir la valencia de un elemento cualquiera a partir de su configuracin
electrnica.
ENLACE METLICO
Los elementos metlicos sin combinar forman redes cristalinas con elevado
ndice de coordinacin. Hay tres tipos de red cristalina metlica: cbica
centrada en las caras, con coordinacin doce; cbica centrada en el cuerpo,
con coordinacin ocho, y hexagonal compacta, con coordinacin doce. Sin
embargo, el nmero de electrones de valencia de cualquier tomo metlico es
pequeo, en todo caso inferior al nmero de tomos que rodean a un dado, por
lo cual no es posible suponer el establecimiento de tantos enlaces covalentes.
grupos funcionales
. Estos grupos engloban compuestos con estructuras similares, y por
lo tanto, propiedades fsicas y qumicas muy parecidas.
Los grupos funcionales son tomos o grupos de tomos unidos a
cadenas de hidrocarburos alifticas o aromticas y es la zona de
reactividad de las molculas.
Las reglas de nomenclatura de la IUPAC para los compuestos con
diferentes grupos funcionales son semejantes, slo se tiene que tomar
en consideracin el o los grupos presentes en las molculas para
indicar cul es el sustituyente de un grupo funcional.
Grupos funcionales
Tipo de
compuesto
Frmula
Alcano
R-CH2-CH2-R'
Grupo
funcional
Estructura
R-H
Ejemplo
Doble enlace
Alqueno
R-CH=CH-R'
Alquino
R-CC-R'
Triple enlace
Aromtico
Ar-R
Anillo
bencnico
Alcohol
R-OH
Grupo
Hidroxilo
CH3-OH
ter
R-O-R'
Grupo
alcoxi
CH3-O-CH3
Aldehdo
R-C(=O)H
Cetona
R-C(=O)-R'
cido
carboxlico
R-COOH
ster
R-COO-R'
Amina
R-NR2
Grupo
carbonilo
Grupo
carbonilo
Grupo
carboxilo
Grupo
alcoxicarbonilo
Grupo
amino
CH3-CHO
CH3-OC-CH3
CH3-CH2-COOH
CH3-COO-CH3
Amida
R-C(=O)N(-R')R"
Haluro
R-X
Grupo
carboxamida
X = F, Cl, Br o I
R-X
CH3-CH2-Br
Unidades qumicas
En las reacciones qumicas intervienen partculas muy pequeas como tomos,
iones molculas; para contar y pesar tales partculas, el qumico cuanta con
ciertas unidades que se llaman unidades qumicas, siendo las principales:
Peso atmico
tomo gramo
Molcula gramo
Mol
Peso molecular
Volumen molar o Volumen molecular gramo
Peso atmico
El valor de 4.003 uma para el peso atmico del helio indica que un tomo de
helio pesa aproximadamente la tercera parte de un tomo de carbono 12.
tomo gramo
Molcula gramo
Peso molecular
Clculos qumicos
Estructura atmica
Estructura
atmica
Como el tomo no tiene carga elctrica neta, el nmero de protones y electrones debe ser
el mismo, pero en la mayora de los tomos la masa es mucho mayor a la correspondiente
a los electrones y protones juntos. Debido a esto, Rutherford sugiri la existencia de
partculas
masivas
sin
carga.
Aos despus James Chadwick por medio de experimentos con radiacin probo la
existencia de estas partculas a las que se les llamo neutrones.