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Planta Piloto de Fermentaciones

Departamento de Biotecnologa

Rompimiento celular

Sergio Huerta Ochoa


UAM-Iztapalapa

Planta Piloto de Fermentaciones


Departamento de Biotecnologa

Productos Extracelulares
-Antibiticos
-Enzimas extracelulares
-Muchos polisacridos
-Mayora de aminocidos

Esteroides
(Se extraen sin romper)

Productos Intracelulares
-Mayora de protenas modificadas
genticamente
-Lpidos
-Algunos antibiticos

Biomasa

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Departamento de Biotecnologa

Productos que requieren de una ruptura celular

Tipo de producto

Ejemplos

Protenas recombinantes

Insulina, HC, Protena A, Protena G

Enzimas

L-Asparaginasa, Invertasa, Glucosinasa

Plsmidos

Terapia gnica

Vacunas

Ttanos, Meningitis

Otros

Mitocondrias, Esporas, Toxinas

Tejeda y col. 2011 Bioseparaciones

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Departamento de Biotecnologa
Esquema de la pared celular de clulas procariotas
Procariotes Gram
(E. coli produce la mayora de las protenas recombinantes)

Membrana externa
(Protenas y lipopolisacridos)
8 nm

Fuerza mecnica

Polipptidoglucanos
8 nm

Espacio Periplasmtico
(Protenas)

Membrana de plasma

Permeabilidad

Procariotes Gram +
Polipptidoglucanos
Espacio Periplasmtico
(Protenas)

Membrana de plasma
(Fosfolpidos, protenas dispersas, iones metlicos)

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Departamento de Biotecnologa

Tomado de Advances in product release strategies and impact on bioprocess design (2009)
Bangaru Balasundaram, Sue Harrison and Daniel G. Bracewell

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Departamento de Biotecnologa

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Departamento de Biotecnologa

Tomado de
Advances in product
release strategies and
impact on bioprocess
design (2009)
Bangaru
Balasundaram, Sue
Harrison and Daniel
G. Bracewell

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Departamento de Biotecnologa

Tomado de
Advances in product
release strategies and
impact on bioprocess
design (2009)
Bangaru
Balasundaram, Sue
Harrison and Daniel
G. Bracewell

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Departamento de Biotecnologa
Fermentacin
Cosecha de clulas

Centrifugacin, filtracin con vaco,


filtracin con membranas

Rompimiento Celular

Homogenizacin, molienda, lisis


(enzimtica o qumica)

Remocin de restos celulares

Centrifugacin, filtracin con vaco,


filtracin con membranas

Concentracin y/o
fraccionamiento

Precipitacin, extraccin, filtracin con


membranas, evaporacin

Operaciones de alta
resolucin

Cromatografa, cristalizacin

Etapas primarias
de recuperacin

Operaciones finales
Producto

Adaptado de: Sanchez-Ruiz, 1989


Studies on cell disruption and cell debris
removal in downstream processing

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Ruptura Celular de Saccharomyces cerevisiae

Antes de la ruptura celular

Despus de 2 pasos a 1000 bar dando un


rompimiento celular de 95%

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Departamento de Biotecnologa

Equipo de ruptura

Industria Alimentaria
(Homogenizacin de la leche)

Aplicacin en
Industria de la Pintura
(Reduccin de Pigmentos)

Industria Biotecnolgica

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Departamento de Biotecnologa
Mtodo

Qumico

Mecnico

Tcnica

Principio

Estrs
sobre el
producto

Costo

Ejemplo

Choque osmtico

Ruptura osmtica de la membrana

Suave

Barato

Ruptura de clulas de sangre

Digestin
enzimtica

Rompimiento por digestin de la


pared celular

Suave

Caro

Micrococcus lysodeikticus tratado con lisozima


de huevo

Solubilizacin

Detergentes solubilizan la
membrana celular

Suave

Moderadocaro

Sales biliares actuando sobre E.coli

Disolucin de
lpidos

Solventes orgnicos se disuelven en


la pared celular y la desestabilizan

Moderado

Barato

Ruptura de levadura con tolueno

Tratamiento
alcalino

La saponificacin de lpidos
solubiliza la membrana

Fuerte

Barato

Homogenizacin
(tipo navaja)

Clulas cortadas en una licuadora

Moderado

Moderado

Molido

Ruptura celular por molido con


abrasivos

Moderado

Barato

Ultrasonicacin

Clulas rotas con cavitacin


ultrasnica

Fuerte

Caro

Suspensin de clulas a pequea escala

Homogenizacin
(tipo orificio)

Se hace pasar clulas por un


pequeo orificio y se rompen por
estrs

Fuerte

Moderado

Tratamiento a gran escala de suspensin de


clulas excepto bacterias

Rompimiento en
molino de perlas

Se aplastan las clulas entre el


vidrio y perlas de acero

Fuerte

Barato

Tratamiento a gran escala de suspensin de


clulas y clulas de plantas

Tejido animal y clulas

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Departamento de Biotecnologa
Dificultad de la ruptura

Esporas
Cocos
gram Levaduras
Clulas vegetales
Bacilos gram +
Bacilos gram - y cocos
Micelios
Clulas animales

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Departamento de Biotecnologa

Eleccin del mtodo de ruptura

Naturaleza de la fuente de la enzima


Escala de la operacin
Velocidad del mtodo de extraccin
Estabilidad del enzima
Pureza requerida
Costo del proceso

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Factores que inactivan las enzimas durante su aislamiento
Factor inactivante

Fuente de
enzima

Frecuencia

Modo de
contrarrestarlo

Calor

Cualquiera

Universal

Enfriamiento

Fro

Cualquiera

Raro

Calentamiento

Proteasa

Mayora

Comn

Inhibidores de proteasas o fro

Productos oxidacin de
fenoles

Plantas y hongos

Bastante comn

Agentes reductores

Oxidacin

Cualquiera

Comn

Agentes reductores

Dilucin protena

Cualquiera

Bastante comn

Concentracin rpida

Prdida de estabilidad

Cualquiera

Bastante comn

Restauracin de ese factor

Inhibidores especficos

Plantas y bacterias

Raro

Separacin del inhibidor

Metales pesados

Cualquiera

Raro

Agentes quelantes

Cambio de fase

Cualquiera

Comn

Mnima agitacin

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Choque osmtico
1. Suspensin de clulas en solucin tamponada hipertnica (sacarosa 20%)
2. Equilibrio osmtico
3. Centrifugacin: concentracin de las clulas
4. Resuspensin en agua (4 C)
5. Ruptura celular por entrada de agua en el interior
celular
Mayor sensibilidad en GRAM (GRAM + alta
presin osmtica interna)
Ventajas:
Extraccin de enzimas del espacio
periplasmtico, simplificacin de los procesos
de purificacin
NO a gran escala:
Grandes volmenes de medio (400 L/10 kg
pasta celular)
Elevado nmero de pasos de centrifugacin
Necesidad de refrigeracin

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Departamento de Biotecnologa
Tratamiento con lisozima + EDTA
Digestin de las paredes celulares por ruptura de los enlances beta-(1.4)
glicosdicos entre el cido N-acetilmurmico (NAM) y la N-acetilglucosamina
(NAG) del mucopptido

Mayor susceptibilidad GRAM +


Combinacin con EDTA: quelante del Ca2+
Otros policationes: GRAM +: quitosano, hidroglutamato, polilisina,
antiobiticos GRAM -: lipasas, fosfolipasas, policationes
Hongos/levaduras: quitinasa/glucanasas
Necesidad de choque osmtico
No empleo a gran escala:
Alto precio de la lisozima
Eliminacin de lisozima tras extraccin

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Departamento de Biotecnologa
Tratamiento con detergentes
Permeabilizacin de clulas por solubilizacin de protenas de membrana,
debido a apertura de poros
Tipos:
1. Inicos: provoca desnaturalizacin proteica
Aninicos: Lauril sulfato sdico, colato sdico, SDS
Catinicos: Bromuro de cetil-trimetil-amonio

2. No inicos: preservan estructura nativa e interacciones de la enzima


Tween, Spam, Triton

Inconvenientes:
Precipitacin de protenas
Necesidad de eliminacin (cromatografa, ultrafiltracin)

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Tratamiento con lcalis
Tratamiento de las clulas con soluciones alcalinas
(KOH, NaOH, pH 11.5-12.5; 20-30 min)
Hidrlisis de la pared celular
Ventajas:
Simpleza, barato
Fcil aplicacin a gran escala
Desventajas:
Tratamiento fuerte, es un ejemplo extremo de la solubilizacin
(Saponificacin de lpidos que se convierten a detergentes)
No selectivo
Aplicacin SLO si las enzimas a aislar son estables a pH alcalino

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Departamento de Biotecnologa
Disolventes orgnicos

Mtodo tradicional de ataque ( tolueno).

No se usan a gran escala.

Inconvenientes:
Precio
Toxicidad
Desnaturalizacin de protenas
Inflamabilidad

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Departamento de Biotecnologa
Homogeneizacin con abrasivos
Mortero + abrasivo (cristal, albmina, kieselgurh)
Dispositivos de funcionamiento continuo:
Agitador Mickle (agitador vibratorio)
Dyno-mill (agitador de discos giratorios)

Efectividad depende de:


Tipo y concentracin de abrasivo
Tipo, concentracin y edad de las clulas: levaduras >bacterias
Velocidad de agitacin
Cantidad y flujo a travs de la cmara
Temperatura
Dispositivo de discos

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Departamento de Biotecnologa
Sonicacin
Aplicacin de frecuencia superiores a 20 kHz
Aparicin de reas de compresin/enrarecimiento/cavidades colapso de
cavidades ondas de choque dao celular
Aplicacin continua o discontinua
Eficacia dependiente de:
Tipo de microorganismo: diversidad
Gram ->Gram +
Bacilos > Cocos
pH
Temperatura
Fuerza inica del medio
Tiempo de exposicin
Densidad de la clula
Uso a pequea escal, NO a gran escala:
Elevados requerimientos de energa
Dificultad de transmisin de la energa
Problemas de disipacin del calor producido

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Departamento de Biotecnologa
Congelacin/Descongelacin

Formacin y fusin de cristales de hielo

liberacin de protenas

Combinacin con otros mtodos: congelacin de sedimentos bacterianos


Ventajas:
Simplicidad
Bajas temperaturas de trabajo

NO a gran escala:
Elevado tiempo de tratamiento
Resistencia de algunos microorganismos
Sensibilidad de las enzimas a congelacin/descongelacin

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Departamento de Biotecnologa
Cizalla lquida
Paso de la suspensin de clulas a elevada presin (>55MPa) a travs de un
orificio estrecho
Homogeneizador de Manton-Gaulin
Mecanismo:
Ruptura celular por cada brusca de presin y choque

Modos de uso:
Paso nico, series de reciclaje, reciclaje continuo con eliminacin de
sustancia
Efectividad depende de:
Tipo de microorganismos: GRAM -> GRAM +
Historia de la materia de partida:
Condiciones de crecimiento (fase estacionaria > fase exponencial)
Congelacin/descongelacin

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Departamento de Biotecnologa
Cizalla slida

Paso de clulas congeladas (-20 C) a travs de orificio


Mecanismo:
Agitacin en presencia de abrasivo (cristales de hielo) +
ruptura por cizalla lquida
Fuerzas de cizalla: paso a travs de orificio + desgarro por
cristales de hielo
No produce la desnaturalizacin de las enzimas
NO a gran escala:
Manejo complicado y costoso

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Departamento de Biotecnologa

Tomado de Advances in product release strategies and impact on bioprocess design (2009)
Bangaru Balasundaram, Sue Harrison and Daniel G. Bracewell

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Departamento de Biotecnologa

Tomado de Advances in product release strategies and impact on bioprocess design (2009)
Bangaru Balasundaram, Sue Harrison and Daniel G. Bracewell

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Departamento de Biotecnologa
Ecuaciones utilizadas en rompimiento celular
(Tejeda y col., 1995, Bioseparaciones)
Choque osmtico: El clculo del gradiente de presin se basa en el equilibrio qumico

Pe Pi = R T ci

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Departamento de Biotecnologa
Molino de perlas de alta velocidad

Parmetros operacionales
- Velocidad del agitador
- Velocidad de alimentacin de la suspensin celular
- Diseo del agitador
- Tamao de las perlas de vidrio
- Carga de las perlas de vidrio
- Concentracin celular
- Temperatura
Tejeda y col., 2011, Bioseparaciones

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Departamento de Biotecnologa

Velocidad del Agitador


La Velocidad Perifrica Normalizada de los Anillos agrupa varios parmetros
relacionados con la velocidad del agitador

Dm
U=
60x1000

: velocidad angular del agitador (rpm)


Dm : dimetro
En impulsores concntricos,
Dm = dimetro del impulsor (mm)

Tejeda y col., 2011, Bioseparaciones

En impulsores excntricos,
Dm = dimetro promedio (mm)
d : dimetro de los anillos
del agitador (mm)
d2
2
Dm = 2 e +
e : dimetro de la flecha
4
del agitador (mm)

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Departamento de Biotecnologa

Flujo de alimentacin, F
El flujo permisible en un molino de perlas depende:
Del volumen del molino
De la carga de perlas
Velocidad del agitador

Al aumentar el
flujo de
alimentacin

Disminuye el grado de
desintegracin

El proceso resulta
ms econmico

NOTA: Conviene operar con


altos flujos de alimentacin y
usar varios pasos para obtener
el rendimiento requerido

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Departamento de Biotecnologa

Diseo del Agitador y Efectos del Mezclado


El comportamiento de un molino de perlas depende del patrn
de flujo y mezclado que produce el agitado (intermedio a los
dos modelos ideales: Flujo tapn (sin mezclado axial) y tanque
continuo agitado (100% agitado)

El tipo de mezclado puede ser


determinado por tcnicas con
trazadores

Tejeda y col., 2011, Bioseparaciones

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Ecuaciones utilizadas en rompimiento celular
(Tejeda y col., 1995, Bioseparaciones)

Molino de Perlas (operacin intermitente): El rompimiento celular con perlas agitadas


a altas velocidades sigue una cintica de primer orden. El balance de masa de protena
liberada puede ser expresado mediante la ecuacin:

VM

dR
= k (Rm R )VM
dt

Integrando y re-arreglando

ln

Rm
= kt
Rm R

ln

Rm
Rm R
Ejemplo 5.2
k

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Departamento de Biotecnologa
Ecuaciones utilizadas en rompimiento celular
Grado de mezclado en un Molino de Perlas (operacin continua):
El grado de desviacin del flujo tapn ideal en los molinos de perlas comerciales, ha sido
simulado utilizando el modelo de Tanques en serie perfectamente agitados. Esto
permite realizar experimentos con pulsos de tinta para determinar el nmero de tanques
equivalentes al grado de mezclado que tiene el molino de perlas utilizado y calcular la
eficiencia esperada del rompimiento.

C1

C0
1

C2
2

CN

C3
3

Al aplicar un pulso de tinta en la primera etapa de una serie de tanques perfectamente


agitados de igual volumen, el balance de la masa de tinta para cualquier etapa N es:

V M dC N
= F (C N 1 C N )
N dt

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Utilizando un tiempo adimensional definido por:

tF
t
=
VM t R

El balance de masa de tinta puede expresarse como:

dC N
= N (C N 1 C N )
d
Integrando para cada etapa, se obtiene que para la etapa N la expresin:

C N N N N 1
E ( ) =
=
exp( N )
(N 1)!
C0
E() es una medida de la distribucin de tiempos de residencia del fluido dentro del
recipiente. Derivando con respecto e igualando el resultado a cero se tiene:

N=

1
1 mx

Donde mx es el tiempo adimensional en el cual E es mxima:

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Departamento de Biotecnologa
Eficiencia de un Molino de Perlas (operacin continua):
Para relacionar el nmero de etapas con la eficiencia de rompimiento es necesario
realizar un balance de protena liberada (clulas rotas) considerando que el molino
consta de N etapas tipo tanque perfectamente agitado en serie y que el rompimiento
sigue una cintica de primer orden.
El balance de protena liberada en la primera etapa est dada por

Vm dR1
V
= FR1 + k (Rm R1 ) m
N dt
N
Expresando la ecuacin en funcin de un tiempo adimensional e integrando obtenemos

kVm
R1 NF
=
Rm 1 + kVm

NF

Eficiencia de la etapa !!!

Re-arreglando y generalizando para N etapas, tenemos:

Rm
kV
= 1 + m
Rm RN
NF

Ejemplo 5.3

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Departamento de Biotecnologa
Ecuaciones utilizadas en rompimiento celular
Homogeneizador de alta presin: La desintegracin celular
en un homogeneizador de alta presin a una presin fija puede
ser descrita mediante una cintica de primer orden respecto al
nmero de pasos, de tal manera que:

dR
= k ' (Rm R )
dN
Integrando obtenemos la ecuacin:

ln

Rm
= k' N
Rm R

Se ha determinado experimentalmente que la constante


k tiene una dependencia con la presin de la siguiente
forma:
a

k ' = k" P

Combinando las ecuaciones anteriores se tiene:

ln

Rm
= k " NP a
Rm R

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Departamento de Biotecnologa
Ecuaciones utilizadas en rompimiento celular
Microflidizador: En el caso del microfluidizador la cintica de rompimiento presenta una
cierta dependencia no lineal con el nmero de pasos expresada mediante la ecuacin:

ln

Rm
= k" N b P a
Rm R

Ejemplo 5.4

Donde b es un exponente que vara con el tipo de clula y toma valores entre 0.28 y 1

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Departamento de Biotecnologa
Chang and Su, 2006
Kinetic model for simultaneous cell
disruption and aqueous two-phase
extraction

A = Am[1 exp(kt)]

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Departamento de Biotecnologa
La Ruptura celular, cuando se estn procesando cientos o miles de
litros de material, represanta un reto diferente a la ruptura celular a
nivel laboratorio
Factores claves son: Eficiencia y reproducibilidad
A nivel Industrial slo se emplean los molinos de perlas agitados y
los homogeneizadores a alta presin. El diseo de los molinos
est basado en ecuaciones empricas y en experimentos piloto.

GEA Liquid Processing cell rupture


skid for biologic cell lysing. The
homogenizer feature the high
efficiency sharp profile rupture valve
type R which enable cell disruption at
lower pressures

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