-Tema 10 y 11 Regulacin de la expresin gnica

Regulacin en procariotas
La regulacin de la expresin gnica es necesaria porque una clula no tiene porque expresar todos
sus genes, ya que las clulas tienen diferentes funciones segn la zona donde estn localizadas.
Los genes responsables de las funciones vitales y los que mantienen la vida celular estn siempre
activos.
El resto solo estn activos aquellos para los que la clula debe tener una funcin correspondiente a
esos genes, han de ser capaz de producir las protenas necesarias para la diferenciacin de esa
clula.
Los procariotas pueden encontrarse en ambientes variables y dependiendo de las condiciones
ambientales necesitaran unas protenas u otras, tienen que adaptarse para vivir.
Esto se consigue alterando la expresin de los genes.
Es necesario que todas las clulas sean capaces de responder a las condiciones ambientales y de
desarrollar la funcin para las que estn encaminadas.
Esto se leva a cabo por la regulacin gnica.

Niveles de regulacin

Replicacin del DNA

Estructura del DNA y de la cromatina
Transcripcin del DNA
Procesamiento del RNAm
Estabilidad de RNAm
Traduccin del RNAm: permitiendo que se produzca de manera correcta o no.
Modificacin postraduccional de protenas: despus de formarse la protena puede
modificarse hasta llegar a ser una protena funcional

Este control se lleva a cabo de diversas maneras:

Nmero de copias de un gen
Existen genes que pueden tener un aumento en el numero de replicaciones con respecto al resto del
genoma, o puede suceder que en determinadas clulas se produzcan varios ciclos de replicacin
seguidos sin que haya divisin. Es comn en plantas.
Su ADN se replica varias veces sin que se divida y se forman clulas endopoliploides.
Dentro de un mismo genoma no todos los genes se expresan igual, algunos se expresan ms fciles
que otros porque la conformacin de la cromatina es diferente.
La heterocromatina en muchos casos contiene secuencias de ADN repetidas pero tambin tiene
secuencias que corresponden a genes, y que no se expresan.
Solo se expresan los de la eucromatina, pero aun as la organizacin de la fibra se modifica en las
zonas donde hay genes que se activan.
Hay ARN que pueden sufrir procesos de splicing alternativos y se puede llevar a cabo el control de
la expresin dirigiendo por una alternativa o por otra el procesamiento del ARN.
Para que el ARN se exprese necesita que estar intacto, el ARN tiene un periodo de vida y cuando
mayor sea esa vida ms posibilidades hay de producir productos gnicos.

El opern Lac: control negativo y control positivo

Regulacin de la transcripcin del DNA
Se estudi en bacterias y lo llevaron a cabo Jacob y Monod en 1961.
El desciframiento de la regulacin de la transcripcin estaba basado en estudios relacionados con el
metabolismo de la lactosa en E.coli.
Las bacterias pueden vivir en un medio con una fuente de hidratos de carbono.
La lactosa penetra en la bacteria y por la accin de la -galactosidasa se descompone en galactosa y
glucosa que utilizar en las rutas metablicas.
Esta enzima la produce la bacteria solo si hay lactosa presente en el medio y es una enzima
inducible.
Cuando no est presente el inductor que es la lactosa, la cantidad de la enzima es mucho inferior a
cuando si est presente que hace que aumente considerablemente.
Ese inductor puede ser un derivado de la lactosa como los galactosilos, que actan como la lactosa
pero con menor eficacia.
Descubrieron que los inductores eran capaces de hacer que la clula empezase a producir la galactosidasa y la permeasa que cataliza la entrada de lactosa al interior de la bacteria.
El inductor tambin induca la formacin de togalactsido transacetilasa.
El inductor disparaba la sntesis de la induccin de las 3 enzimas a la vez de manera coordinada.
Los 3 genes correspondientes son los Z, Y, y A.

Utilizando mutantes de esos genes en distintas combinaciones Y-, Z- y A- si producan las dems
enzimas pero no la -galactosidasa. As se pudo elaborar el mapa gentico completo.
Utilizando el paso de informacin a otra mediante un virus, utilizando la transduccin que se usa
para llevar a cabo la ordenacin de genes muy prximos, se ordenaron los 3 genes.
Se encontr otro gen Y que estaba relacionado con los dems.
El sistema por el que esos genes se transcriben est codificado por el gen Y, que es el mecanismo
por el cual se regula la expresin de los 3 genes.
El gen Y es un gen regulador que produce un RNA que da lugar a una protena represora donde
existen 2 dominios.
El de la derecha es capaz de unirse al DNA y por el de la izquierda es capaz de unirse al inductor.
Las clulas producen esta protena y este se une a un lugar delante del gen Z y bloquea la molcula
de DNA en ese punto e impide la transcripcin, ya que la ADN polimerasa no se puede unir al
promotor. La regin a la cual se une el inductor es el operador.
Cuando est presente el inductor se une a un lugar del represor llamado centro alostrico, cambia la
conformacin del represor y se separa del DNA. Queda libre y la ADN pol puede llevar a cabo la
transcripcin.
Se forma una molcula de RNA que contiene las secuencias codificadoras de los 3 genes y as se
forman las 3 enzimas distintas.
Esto es un RNA policistrnico de 3 genes, es una sola molcula con informacin correspondiente a
3 genes.
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Este es el mecanismo por el cual se regula la expresin de esa zona del DNA y a esa zona se le
llama opern lactosa, y su expresin est regulada por el gen Y.
Cuando el represor est unido a la regin del operador no hay transcripcin y cuando est presente
el inductor se une y cambia su configuracin dejando libre al operador.
El control negativo impide que se de la transcripcin.
Primero se realiz el mapa gentico y se vi como estaban localizados los genes.
Despus se determinaron las funciones de los distintos genes.
La accin de I era desconocida hasta que se encontraron un tipo de mutantes I-, que producen un
RNA que no origina una protena represora normal, no forman represores, por lo que el opern est
funcionando continuamente. La clula siempre tiene las 3 enzimas haya o no inductor.
A las clulas I- se las denomin mutantes constitutivos, siempre se produce de manera continua.
Un sistema inducible es el que se produce si est presente el inductor.
Con esos mutantes determinaron que la localizacin de I era al lado de Z.

Efecto en trans de I+
Obtuvieron diploides parciales que son bacterias que tienen en el cromosoma el opern y un factor
F donde estaban presentes los genes del opern. Con estos diploides se consigue tener repetido 2
veces en la misma bacteria el opern, uno en el factor F y otro en el cromosoma.
Cuando haba inductor se expresaban los dos.
Cuando se aade inductor en el diploide parcial I+ produce un represor e inhibe los dems genes y
esa bacteria produce los 2 tipos de enzimas
El represor producido por el alelo normal era activo y cuando estaba presente el inductor dejaba
libre a los operadores, el otro alelo no produce represor activo y nunca interfiere en la transcripcin,
es un alelo recesivo que no se manifiesta cuando est el alelo normal.
Puede actuar tanto sobre los genes de un lado como en los de otro.
-galactosidasa
I- 0 ' Z+ YI+

0' Z- Y+
permeasa

El inductor se une al represor y a partir de 0 se produce en uno una enzima y en el otro la otra
enzima.

Mutantes de Is
Is en un diploide parcial es dominante sobre I+, cierra los dos operones y nunca funcionan.

Mutante operador constitutivo Oc

Son operadores constitutivos que actan en cis.
Son mutantes que producen de manera continua la sntesis de estas enzimas al igual que los I-, pero
cuando se forman los diploides parciales se ve que actan el operador Oc solo sobre los genes que
estn unidos a el.

I+

Z+

Y-

Inductor +represor
permeasa
I+

0c

Z-

Y+

El represor reconoce al operador normal O pero no puede reconocer al Oc por lo que en ausencia de
inductor se produce permeada, y si le aadimos inductor se desbloquea el operador, queda libre, hay
transcripcin y se produce -galactosidasa. El operador sigue abierto abajo y se sigue produciendo
permeasa.
En ambos casos siempre se produce permeasa.
Todo esto explica como se produce el control negativo de la transcripcin.
La transcripcin del opern Lac est regulada por la accin de un represor que interacciona con el
opern.
Existe un gen regulador que produce un represor que se une a la regin del operador.
A continuacin del operador estn Z, Y y A que son genes estructurales ya que codifican para las
enzimas. Tambin hay una regin promotora a la que se une la ARN polimerasa.
El control negativo reprime la transcripcin.
Existe otro tipo de control positivo porque favorece o promueve la transcripcin.
Se puso de manifiesto porque el control negativo lo podemos poner en relieve cuando las bacterias
crecen en un medio que solo contiene lactosa. Esta acta como inductor y se promueve la
transcripcin,
Pero si crecen en un medio que contiene glucosa y lactosa el sistema no funciona igual porque a la
bacteria le interesa la glucosa y si la tiene en el medio produce enzimas que la introducen dentro de
la bacteria y la utiliza para sus funciones metablicas.
El hecho de que la glucosa entre en la bacteria da lugar a que se modifique y se transforme en otros
productos y uno de ellos llamado catabolito impide que funcione este sistema porque no penetra la
lactosa en la bacteria.
No se lleva a cabo la induccin porque no se forma la permeasa que es la que permite que la lactosa
entre.
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Este catabolito es un producto resultante de la descomposicin de la glucosa pero no est

identificado, se produce en el proceso de modificacin de la glucosa y ser uno de los productos
originados y actuar con la penetracin de la lactosa en la bacteria y con el funcionamiento de la
induccin.

Control catablico del opern Lac:

La induccin del opern por la lactosa es mxima cuando AMPc y CAP forman un
complejo.
Cuando hay mucha glucosa, uno de sus productos catablicos inhibe a la enzima ciclasa del
adenilato, impidiendo la conversin de ATP en AMPc.

Cuando hay poca glucosa no hay producto catablico, la ciclasa del adenilato est activa y
se forma AMPc.

Cuando hay AMPc, esta acta como un efecto alostrico formando un complejo con CAP.

El complejo AMPc-CAP acta como un activador de la transcripcin del opern Lac,

unindose a una regin del promotor Lac.

La bacteria utiliza glucosa hasta que no haya ms en el medio y entonces se empiezan a activar el
sistema de induccin y se desreprime el operador.
Esto tiene que ver con el hecho de que cuando hay glucosa en el medio y entra en la bacteria los
niveles de AMP cclico son bajos y este es un compuesto importante para que se produzca la
transcripcin de estos genes.
A pesar de eso no es el nico que interviene en el proceso de promover la transcripcin de otros
genes, ya que hay otro compuesto que es la protena CAP, relacionada con el catabolito y producida
por un gen crp.
Esta protena se asocia con AMP c y forma un compuesto que estimula la transcripcin del opern
Lac.

Cuando los niveles de glucosa son altos en el medio, la glucosa o un derivado suyo inactiva la
enzima ciclasa del adenilato responsable de que se forme AMPc a partir de ATP.
Cuando hay poca glucosa o nada, esta enzima se activa y se puede producir el AMPc, que es capaz
de asociarse con CAP y forma el complejo CAP-AMPc que tiene la propiedad de reconocer la
regin promotora de este opern.
Cuando eso ocurre la ARN polimerassa llega ms fcil al promotor e inicia la transcripcin de los
genes estructurales.
Se encontraron mutantes del gen crp que produca una protena CAP no productiva y esos mutantes
tenan muy bajos niveles de esas enzimas ya que se formaban pocas molculas de ARNm y se
transcriban pocas veces esos genes.
Si el represor es normal se inhibe la transcripcin y esto ocurre cuando existe glucosa en el medio.
Si desaparece la glucosa totalmente del medio la nica fuente de hidratos de carbono es la lactosa.
La bacteria forma un complejo que cada vez que llega una molcula de ARN polimerasa llega ms
fcilmente por lo que llegan ms molculas al promotor y se producen muchos ARN.
La interaccin con el ADN hace que forme una curva y esa modificacin estructural es una seal
que acta como seuelo de las ARN polimerasas que acuden all y empiezan a transcribir el ARN
correspondiente.
El compuesto CAP-AMPc se pega al DNA y en bacterias se puede llevar a cabo una digestin del
DNA que se romper siempre y cuando no este asociado con otras protenas.
Si est asociado el trozo de DNA unido al CAP est protegido contra las enzimas que lo degradan.
Ese fragmento se mantiene y se puede aislar para hallar su secuencia.
La zona del promotor tiene el sitio que reconoce CAP y otro sitio que reconoce a la ARN
polimerasa.
El represor protege contra la digestin el DNA y se ha podido determinar la secuencia del DNA
unida al receptor ya que es el ltimo trozo que es capaz de unirse con la ARN polimerasa.
Si est el represor, la ARN polimerasa no se puede unir y as se impide la transcripcin.
Si est libre puede unirse al promotor y llevar a cabo la transcripcin.
Este complejo acta como un sistema que favorece la transcripcin, es un control positivo y es justo
lo contrario a lo que ocurre con el represor.
Ambos sistemas interfieren en la transcripcin de los genes de la transcripcin.
Si existe una seal del complejo CAP-AMPc esto ocurre mucho ms rpido.

Sistemas enzimticos inducibles y represibles

Existen sistemas enzimticos que son inducibles, porque en presencia de un compuesto inductor
como la lactosa empieza a formarse el ARN a partir del cual se originan las protenas
correspondientes.
Existen sistemas enzimticos que son represibles, porque hay un compuesto que reprime o impide
que aparezcan los sistemas enzimticos. Uno de ellos es el triptfano que es un aminocido esencial
y que se produce en unas reacciones a partir de unos elementos como glutamina y cido corsmico.
Se dan una serie de transformaciones hasta que aparece el triptfano y esas reacciones estn
catalizadas por enzimas, cada una de las cuales estn controladas por unos genes distintos.
Hay 5 genes estructurales que producen la formacin de triptfano y catalizan cada una de esas
reacciones.
Los genes estn seguidos en el cromosoma uno junto a otro en orden.
El operador est junto al gen trp y los otros producen las enzimas que intervienen en el final de la
ruta.
El orden de los genes en el opern est relacionado con el orden de las reacciones que catalizan las
enzimas.
Esto se determin por mapas genticos y el operador se detect por la presencia de mutantes.

Opern del triptfano, atenuacin

Regulacin de la sntesis del triptfano
Existen 3 sistemas distintos que inciden en la produccin de triptfano y el elemento comn a esos
sistemas es el propio triptfano.
Cuando una clula tiene abundante cantidad o cuando existe en el medio la clula deja de fabricarlo.
Retroinhibicin
El propio triptfano inhibe la enzima producida por los genes trpE y trpD, que codifica las primeras
reacciones, se asocia a ella, se inactiva y la ruta se para.
Represin de la transcripcin
El represor est formado por el producto del gen trpR y el triptfano.
Trp R es inactivo, es una protena que por si sola no es capaz de reconocer el operador, lo hace
cuando existe triptfano en la bacteria o en el medio.
Este represor inactivo y el triptfano forman un complejo que es capaz de reconocer al operador y
reprimir la transcripcin.
El elemento que se une al represor ayuda a que ese represor sea funcional, por eso no es un
inductor, es un correpresor que forma un complejo que reprime la transcripcin.
Deja de formarse ARN y no se producen las enzimas de la ruta metablica del triptfano.
Atenuacin
Este sistema se descubri por el aislamiento de mutaciones que estaban localizadas en una zona que
forma parte de la secuencia lder del ARN.
Cuando esto se transcribe y antes del gen de la iniciacin de la transcripcin existe una secuencia
lder 5 UTR que es una secuencia larga.
Se determin que a los mutantes les faltaba una parte que tenia unos niveles de transcripcin
elevados.
Esa zona es una regin reguladora importante, por ello se secuenci y la zona que cubra la delecin
era la secuencia que faltaba en el mutante que produca altos niveles de triptfano.
Hay 160 nucletidos antes de ese triplete.
Se puede traducir un pequeo pptido a partir de un cierto nmero de tripletes de la secuencia lder.
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Cuando la secuencia se estudia en profundidad se ve que hay secuencias donde pueden

autoaparearse esas regiones y formar diversas estructuras en la regin lder del ARN.

El ribosoma reconoce el ARN y empieza a unirse a el, y cuando llega al triplete AUG introduce un
aa y despus se va desplazando.
Llega un momento que alcanza los tripletes que codifican para triptfano.
Si en la clula hay alto contenido en triptfano, este se incorpora a la protena y se sigue
traduciendo, y esto permite que se asocien dos regiones y se forme un lazo que la ARN polimerasa
interpreta como final de la transcripcin, por lo que no se forma el ARN completo.
Si hay poco triptfano cuando llega a esos tripletes el ribosoma se queda quieto porque no puede
seguir la sntesis de protenas y es incapaz de pasar a la regin 2.
Se une con la regin 3 y forma un lazo que no es una seal de terminacin, por lo que la
transcripcin sigue y se forma el ARN completo.
Hay una protena sin papel relevante, solo su traduccin acta como un elemento regulador de la
propia traduccin.
En E.coli la mayora de los genes estn regulados por operones.

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Regulacin en cascada de fagos

En los fagos T7 la regulacin opera de tal manera que la promocin de la actividad de un gen da
lugar al producto de ese gen que acta como activador de otros genes.
El cromosoma tiene en un extremo 5 genes de la clase 1, luego los de la clase 2 y luego los de la
clase 3.
Los genes que se expresan cuando se produce la infeccin son los de la clase 1 porque en el
extremo existe ms de un promotor reconocido por la ARN polimerasa de E.coli.
Lo reconoce y transcribe una molcula de ARN que lleva ese conjunto de genes.
Despus se puede fragmentar y producir distintos ARN que formaran distintas protenas.
Este proceso produce una protena que le da seguridad al fago porque impide que las nucleasas de
restriccin de la bacteria ataquen al fago. Estas son enzimas que se asocian al ADN del fago y lo
destruyen.
Tambin produce una protena kinasa que fosforila la ARN polimerasa bacteriana y descompone el
sistema de transcripcin de las bacterias.
Adems se produce una ARN polimerasa producida por el gen 1 especifica del fago, solo reconoce
el cromosoma del fago y sus promotores correspondientes.
Esta ARN pol transcribe los genes de las regiones de las clases 2 y 3 y tambin produce una ligasa
que interviene el la replicacin del ADN.
Las nucleasas rompen el cromosoma bacteriano y los nucletidos liberados lo utiliza el fago para
multiplicar su fago.
Hay una regulacin iniciada por la ARN pol de E.coli que termina con la regulacin de la ARN pol
especifica del fago.
Existe un sistema que puede llevar a cabo la regulacin de la traduccin.
Esto sucede por la accin de interruptores ribosmicos que son conformaciones que adopta la
secuencia lder del RNA.
Los interruptores ribosmicos son secuencias de ARN presentes en el ARNm que afectan a la
transcripcin gnica.

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El ARN se une al ribosoma por la secuencia lder, y esa secuencia puede adoptar distintas
configuraciones que vienen determinadas por los lazos y por una protena que se asocia al ARN.
Si la protena est ausente, la configuracin que adopta la secuencia lder es distinta y se puede
producir la unin al ribosoma y la traduccin.
Estos sistemas dependen de la conformacin de la regin lder y de la interaccin con protenas
reguladoras de la traduccin.

Regulacin de la expresin gnica en eucariotas

Diferencias entre eucariotas y procariotas:
Los genes eucariotas no estn organizados en operones.
La estructura de la cromatina afecta a la expresin gnica.
Los activadores parecen ser ms comunes que los represores en eucariotas.
La membrana nuclear en eucariotas separa en el tiempo transcripcin y traduccin. En
procariotas suceden de forma simultnea.
Cada gen tiene su propio sistema de regulacin, un mismo sistema no acta simultneamente sobre
un conjunto de genes que estn en un opern si no solo en un determinado gen.
La regulacin es individual.
La estructura de la cromatina en procariotas el DNA est libre en el citoplasma o unido a protenas y
los elementos reguladores tienen acceso a el.
En eucariotas est asociado a histonas y a otras protenas que hacen que la cromatina este ms o
menos compactada.
La regulacin de la actividad gnica est relacionada con el grado de empaquetamiento de la
cromatina, si esta compactada poco es ms fcil de acceder que si est muy compactada.
Cuando los genes se activan en la zona de unin de la ARN pol la cromatina facilita el acceso.
El hecho de que este unido el ADN con las histonas es un obstculo para que se expresen los genes.
En eucariotas existen secuencias que pueden estar lejos o cerca del gen y esas secuencias pueden
unirse a protenas con efecto promotor o activador de la transcripcin y a veces como represor.
La regulacin tiende a activar genes silenciados en un determinado momento.
La membrana nuclear en eucariotas separa en el tiempo en el espacio la transcripcin y la
traduccin, en procariotas ocurren a la vez.
En eucariotas se forma el RNA y cuando madura como mensajero sale al citoplasma y ah se
traduce.
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Esto implica que este ARN tiene una vida ms larga que el bacteriano para que pueda ser expresado,
y esto condiciona como debe ser la regulacin de la expresin gnica, por lo que aade variantes a
esa regulacin.

Control en cis de la transcripcin

Existen elementos reguladores que hay en la propia molcula de DNA en el cual estn los genes que
van a ser regulados en cis.
Dentro de los elementos en cis est el promotor a la cual se asocia la ADN pol y comienza la
transcripcin.
El promotor en eucariotas tiene secuencias TATA y la distancia a la cual est respecto al inicio de
transcripcin es mayor. Tambin son distintos los factores de transcripcin y las ARNasas.
Dentro del promotor hay otras regiones importantes para que se lleve a cabo la unin de la ARNpol
y el inicio de la transcripcin.
Su importancia se puso de manifiesto en experimentos en los cuales se usaban modificaciones
puntuales para ver que ocurra en determinados genes, como los que codificaban la protena de la
globina humana.
Si se alteran los nucletidos de esas secuencias el nivel de expresin baja, esas secuencias juegan un
papel importante como lugares donde fijarse la ARN polimerasa y as se tiene garanta de que se
produzca la transcripcin.
Se conoce a partir de las mutaciones que se producen en las bases dentro de esas secuencias
promotoras y se determina su efecto sobre el nivel de expresin del gen.
El SV40 es un virus animal que su genoma es utilizado para estudios de expresin para determinar
los promotores.
Cerca de ellos hay secuencias intensificadoras, que son secuencias que estn relativamente
prximas al promotor y que son importantes para que se consiga un nivel de transcripcin
adecuado.
Estn presentes en otros muchos genes que tienen este tipo de identificadores que actan como
seales donde acuden protenas que ayudan a que se exprese un gen con un mayor nivel de
expresin.

Para que se inicie la transcripcin tienen que unirse dos promotores y uno de ellos es TAF que
reconoce a la secuencia TATA.
Si acude un segundo factor de transcripcin 2A se une al complejo y esto es un paso ms para que
se produzca la transcripcin.
Si no se une correctamente llega un inhibidor y cuando alcanza esos elementos se impide la
transcripcin.
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El factor 2A impide que lleguen los inhibidores y cuando se han unido acta como seuelo para otro
factor D y la ARN pol 2 que transcribe los genes nucleares asociada a otro factor de transcripcin
2F, llega al complejo y se pega.
Despus llegan los factores E, H y J y se unen al conjunto y ese conjunto de receptores basales son
los que permiten que se inicie la transcripcin.
Estos factores pueden estar lejos o muy prximos a la secuencia del promotor.
Pueden existir intensificadores prximos a la zona del promotor y otros que estn a miles de pares
de distancia y pueden actuar colaborando para que se produzca una transcripcin ms activa.
Esto ocurre porque la fibra de cromatina integrada por el ADN y las histonas, se pliega.
Lo ms frecuente es que haya activadores, pero puede haber elementos que impiden la
transcripcin.
Los intensificadores se asocian a protenas que son los activadores y estos que se unen a la
secuencia intensificadora de ADN.
Por otro dominio interaccionan con otro nmero de protenas que son coactivadores que hacen de
intermediario entre el activador y el complejo del factor de transcripcin basal y la ARN
polimerasa.
El activador no tiene por que estar asociado, si no que tiene una protena que es el coactivador.
As se consigue que la transcripcin se lleve a cabo con un nivel adecuado.
Todos los intensificadores actan de forma simultnea sobre el gen en cuestin.
Estas secuencias son reconocidas por protenas especficas y se unen a ellas, pero no tienen porque
estar presentes en todas las clulas.
En las que estn facilitan la expresin del gen, y si no puede disminuir en niveles muy bajos la
expresin de los genes.
En organismos pluricelulares distintos tejidos tienen distintas protenas activadoras, y cada una
reconoce un intensificador distinto.
Para un mismo gen pueden existir activadores especficos de tejidos y su expresin puede llevarse a
cabo de distinta manera en distintos tejidos, segn la secuencia con la que promueve los
intensificadores correspondientes y los factores la transcripcin.
Los intensificadores estn a una distancia grande del gen activador.
Si hay una rotura ocurre una translocacin o una inversin y los intensificadores se van a otro lugar,
con lo cual la expresin de ese gen se ve mermada.
Cuando esos intensificadores se van a otro cromosoma se sitan cerca de otro gen distinto y
tambin promueven su activacin.
Esto ocurre en cncer o leucemias que estn en una zona prxima a un gen y los intensificadores se
van a otro lugar, merman la expresin de un gen y potencian otro y esto transciende en el
comportamiento de las clulas.
Por una parte interaccionan con la molcula de ADN y por el otro dominio interaccionan con un
coactivador.
A los elementos en cis llegan protenas y factores de transcripcin y esos elementos estn
codificados por genes de otra parte del cromosoma.
Son productos de otras protenas que actan en la expresin.

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Elementos reguladores en trans: factores de transcripcin y esteroides

Los factores de transcripcin son factores que junto con la ARN pol transcriben en trans, es decir, se
producen en un sitio distinto a donde acta.
Los elementos reguladores en trans son los que interaccionan con los cis para que se lleve a cabo la
expresin de la informacin gentica.
Los esteroides son hormonas que se producen en distintas glndulas y en distintos tipos de rganos
y a travs de la sangre llegan a todas las clulas.
Dentro de los distintos tejidos las clulas producen distintas protenas que reaccionan con esos
esteroides, son las protenas receptoras de esteroides, y pueden reaccionar o no con su presencia.
Son solubles por lo que se difunden por la membrana y pasan al interior.
Cuando en la clula existe la protena receptora, se forma un complejo hormona-receptor que puede
llegar al ncleo.
El receptor es una protena con dominios que interaccionan con el ADN y reconoce secuencias
relacionadas con la hormona que transporta.
El receptor por si solo no reconoce esas secuencias, pero si est asociado con la hormona si
reconoce elementos reguladores que son equivalentes a un intensificador y potencian la asociacin
del promotor de un determinado gen con la ARN pol para que se lleve a cabo la sntesis de ADN.
Cuando el complejo entra en el ncleo activa determinados genes, la unin del complejo est
determinada por la presencia de la hormona.
Puede ocurrir que estos complejos puedan reprimir genes, aunque lo normal es que lleven a cabo la
expresin de los genes.
La ovoalbmina se produce en las clulas y el gen es activado por el complejo receptor estrgeno.
Se activa el gen y produce muchas protenas que forman la clara de huevo.
La hormona llega a todas partes pero solo se activa el receptor de esa hormona.
Esas protenas que se asocian con el ADN pueden ser variadas como los activadores o otras
protenas que tambin se asocian como el opern Lac o CAP y que intervienen en el control
positivo.
Hay multitud de protenas que interaccionan con el DNA.
Lo hacen porque son portadoras de dominios que les permite esa asociacin al ADN.
Las protenas hometicas interaccionan con el ADN y tienen dominios formados por NH2, 3 hlices y COOH. Es un homeodominio hlice-vuelta-hlice.
Esta estructura tambin la tiene el represor Lac, CAP y receptores de los esteroides.

Dominios y motivos estructurales en los factores de transcripcin

Los receptores de esteroides y factores de transcripcin tienen distintos dominios.
Hay otros dominios como la cremallera de leucina que tiene 2 subunidades que interaccionan entre
si por la interaccin entre aa y leucina.
Pueden producir asociaciones con el DNA y son protenas codificadas por protooncogenes, que son
genes con actividad normal y cuando se modifican pueden dar lugar a la aparicin de procesos
cancerigenos.
Otra asociacin es entre dmeros de protenas y DNA. Una molcula del dmero de conformacin
hlice-lazo-hlice y por otros dominios positivos interacciona con el DNA que tiene cargas
negativas.

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La estructura de la cromatina es un condicionante para la expresin de los genes, y la formacin de

los nucleosomas es una barrera contra la llegada de la ARN pol que impide la transcripcin.
Las histonas estn organizadas en octmeros que estn rodeados por la molcula de DNA que da
dos vueltas.
En el octmero estn las protenas H2A, H2B y H4 y la H1 est fuera del octmero.
Las colas de esas protenas interaccionan con las cargas del ADN y esto puede ser modificado por la
modificacin que sufren las histonas al aadir restos de acetil.
Cuando se produce la acetilacin de las histonas la capacidad de asociacin de la cola de la histona
con el ADN se limita.
La molcula de ADN pierde la asociacin con las histonas y se relaja y la ARNpol puede llegar ms
fcil con los factores de transcripcin y permitirla.
La activacin de los genes est asociada con la acetilacin de las histonas y la organizacin de la
estructura de la cromatina cambia. Es una caracterstica propia de eucariotas.
La acetilacin de residuos de las histonas est asociada a la expresin de los genes de esas zonas.
Estas modificaciones ocurren para silenciar o activar los genes.
Las que acetilan son las acetilasas, para que el gen se reprima tiene que desaparecer la acetilacin y
hay una desacetilacin.
Modificacin de las histonas:
Las colas de las protenas histonas, cargadas positivamente, interactuaran con los
grupos fosfato del ADN, cargado negativamente.
La acetilacin de las colas debilita sus interacciones con el ADN y permitiran
que algunos factores de la transcripcin se unan al ADN.
La acetilacin de las histonas altera la estructura de la cromatina y permite que
ciertos factores de la transcripcin se unan al ADN.

Metilacin del ADN y procesamiento diferencial del ARN

La citosina puede metilarse mediante la accin de metilasas que estn asociadas a
protenas implicadas en el proceso de remodelacin de la cromatina.
La citosina est asociada con silenciamiento gnico, y est presente en el ADN.
Hay regiones cercanas a las zonas promotoras donde existen bases ordenadas
CpG o GpC, y en esos lugares hay acetilacin de la citosina.
Son islas CpG donde se metilan la citosinas que silencian los genes prximos,
tienen que ver con la represin gnica.
Es una seal para que acudan protenas que compactan la cromatina, por lo que no pueden llegar los
factores ni la ARN pol y no se produce la transcripcin de esos genes.
Para que se modifique la histona tienen que llegar las acetilasas, y para que lleguen tiene que haber
complejos que sirven de llamada para que esto se pueda producir.
La calcitonina es una hormona que regula el calcio y el fsforo, y dependiendo del tejido en el que
se exprese el gen correspondiente se expresa de una forma y de otra.
Este gen produce un transcrito que en el hipotlamo se expresa de forma distinta a en el tiroides.
Esto es comn en genes eucariticos de animales que pueden tener vas de procesamiento
alternativo dependientes de los tejidos.

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Regulacin por RNAi

Acta sobre la molcula de RNAm, es la regulacin por ARN de interferencia.
El ARNi son molculas de RNA de doble hlice que pueden existir o no en la clula.
Si se introduce, cuando est presente en la clula, tiene una protena diferente que lo corta y forma
trozos pequeos que son reconocidos por complejos proteicos ris, que se asocia con uno de los
elementos y solo con una de las hebras.
Este elemento ris asociado con un trozo del ARNi llega a un ARNm con una secuencia
complementaria al fragmento y se pega.
El ris corta esa molcula de ARN que rota deja de ser funcional e impide la expresin.
En otro caso, tiene partes que se asocian entre si que son reconocidas por la cortadora, lo rompe en
fragmentos, ris se asocia a uno de ellos y a una hebra que llega al ARN e impide la traduccin.
Puede ocurrir que algunos ARN se asocien con el ADN y esto es una seal para que acudan enzimas
metiladoras que metilan el ADN.
Esto es una seal para que la cromatina se compacte y se impida la transcripcin.
En los dos primeros hay regulacin de la vida del ARN y por tanto de la transcripcin, se impide
que llegue a los ribosomas porque se rompe.
A) El ARN de cadena doble es cortado por la enzima Dicer para producir pequeos ARN
interferentes (ARNsi).
Los ARNsi se combinan con el complejo proteico RISC y se aparean con las secuencias
complementarias del ARNm.
El complejo corta al ARNm y despus del corte, el ARN se degrada.
Los ARNsi degradan a los ARNm por ruptura.
B) Otras regiones de cadena doble de las molculas del ARN son cortadas por la Dicer para
producir microARN.
Algunos ARNmi se combinan con el complejo proteico RISC y se aparean en forma imperfecta con
un ARNm lo que conduce a la inhibicin de la traduccin.
Los ARNmi conducen a la inhibicin de la traduccin.
C) Otro ARNmi se unen a secuencias complementarias del ADN y atraen enzimas metiladoras las
cuales metilan el ADN o a las histonas e inhiben la transcripcin.
Algunos ARNsi metilan las histonas o ADN e inhiben la transcripcin.
El silenciamiento del ARN conduce a la degradacin de ARNm o a la inhibicin de la traduccin o
de la transcripcin.

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Regulacin de los genes del cromosoma X

Tienen diferentes dosis en hembras y machos, con un sistema de determinacin XX e XY.
En las clulas el funcionamiento de las clulas est adaptado al contenido de esos genes.
Si no existe ningn tipo de compensacin, la hembras produciran en todas sus clulas el doble de
material gentico que los machos, como consecuencia se pueden producir alteraciones en el
desarrollo.
Para evitarlo hay mecanismos de compensacin gnica que afectan a los genes del cromosoma X.
En los mamferos la compensacin de la dosis gnica se lleva a cabo de tal manera que uno de los
cromosomas X esta inactivado y as se consigue una dosis gnica efectiva en la misma proporcin
en machos y hembras, inactivando parte o el cromosoma X entero.
Esto es la compensacin de la dosis gnica.
Eso se traduce en la aparicin de clulas femeninas donde aparece un ncleo ms pigmentado, ya
que la cromatina est ms condensada.
Esa mancha no aparece en clulas masculinas ya que en esa mancha est condensada toda la
cromatina del cromosoma X, esto es la cromatina sexual o corpsculo de Barr.
Todos los cromosomas X de una clula de mamfero se inactivan excepto uno.
Como resultado de la inactivacin aparecen fenotipos, como las gatas que aparecen con el cuerpo
dividido en sectores con colores distintos.
La aparicin de las zonas blancas dependen de un gen autosmico, pero el negro y el naranja
dependen del cromosoma X. O es naranja y o es negro.
XOXo parte de las clulas tienen activo el cromosoma XO y se expresa el naranja, y otras clulas
tienen activo el Xo y el resultado es un fenotipo variegado.
Ese fenmeno de la inactivacin es algo que ocurre transcurrido un cierto tiempo del desarrollo
embrionario en una etapa temprana.
En el ser humano sucede hacia los dos meses y medio despus de producirse la fecundacin, y
ocurre durante la gestacin.
Uno de los cromosomas X de las clulas en ese momento se inactiva. En unas clulas se inactiva el
cromosoma X paterno y el otras el materno, y esto es al azar.
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Cuando en una clula se inactiva el XO todas las clulas descendientes de ella que se generan en el
desarrollo mantienen inactivo ese cromosoma.
La inactivacin se transmite a las generaciones filiales, as se originan clones de clulas y unas
tienen inactivado un cromosoma y otras otro.
Este fenotipo variegado solo se encuentra en hembras y nunca en machos.
La inactivacin se lleva a cabo por un mecanismo donde estn implicadas modificaciones de las
histonas para que se impida la expresin gnica y la cromatina se compacte y se haga menos
accesible a los agentes que facilitan la expresin gnica.
Se produce la metilacin de la citosina en determinadas posiciones del cromosoma X, y una vez que
se metila se transmite en la generacin celular y as la inactivacin se mantiene a lo largo del
desarrollo. Esto es la epigentica.
Desarrollo y diferenciacin celular
Actividad gnica diferencial en el desarrollo
La actividad y la diferenciacin celular es que a medida que aumenta el nmero celular, estas
clulas se dirigen a determinados linajes.
En cada linaje se expresan genes distintos y as las clulas se separan funcionalmente, adquieren
fisiologas distintas y se constituyen en lneas de diferenciacin celular diferentes.
Se produce a lo largo del desarrollo, inicialmente la clula huevo y las embrionarias mantienen la
totipotencia, por lo que la clula por si misma es capaz de desarrollar un organismo.
Esa totipotencia en las plantas la mantienen muchas clulas, pero en animales la capacidad de
generar un individuo completo se pierde.
Las clulas madre tienen una gran capacidad de desarrollo porque conservan la totipotencia del
cigoto y no se han diferenciado.
Esa totipotencia que existe en el cigoto pero se pierde en las adultas se pierde por varias causas.
A medida que avanzan las clulas en el desarrollo se pierden genes y por tanto su funcin
Los genes se mantienen por igual en todas las clulas, pero a lo largo del desarrollo se expresan de
distinta manera en distintas clulas segn el linaje.
Se comprob que los genes se mantienen salvo casos particulares como los anticuerpos, y eso se
puso de manifiesto con experimentos de plantas que tienen todos los genes y que generan un
organismo completo cultivndolo en un medio adecuado.
Se forma una masa de clulas de la cual puede diferenciarse una clula completa y la clula adulta
mantiene todos los genes porque mantiene la totipotencia.
Concepto de totipotencia: plantas y transplante nuclear en anfibios
En plantas se fragment tejido del floema de una zanahoria y se aislaron las clulas individuales.
Despus se coloc una sola clula en un medio nutritivo que contena hormonas de crecimiento y
finalmente se obtuvo una planta completa de una zanahoria.
Esto demuestra que muchas plantas pueden clonarse a partir de clulas individuales aisladas.
Por tanto el material gentico original no se pierde durante el desarrollo.
En los animales se han echo experimentos que tratan de determinar que los genes de las clulas
diferenciadas estn presentes en su totalidad dentro de esas clulas.
El experimento consisti en hacer un transplante de ncleos de clulas diferenciadas al citoplasma
del vulo, porque si no se usa el citoplasma de la clula huevo no funciona.
Se elimin el ncleo irradiando los vulos por luz ultravioleta, y estos vulos solo contenan el
citoplasma.
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En ellos se inyect el ncleo de una clula diferenciada del epitelio del intestino del renacuajo.
Se obtuvieron resultados que no daban lugar a nada, otros que comenzaban a dividirse pero no
terminaban y un bajo porcentaje si consigui que el desarrollo del organismo se completase, por lo
que no hay prdida de genes y el ncleo contiene toda la informacin, a pesar de que las clulas
diferenciadas no sean capaces de producir un organismo adulto.
Un grupo de investigadores escoceses utilizaron una metodologa equivalente, aislaron vulos de
oveja de cara negra a los cuales se les extraa el ncleo.
Por otro lado aislaron clulas somticas de la glndula de una oveja de cara blanca, las cultivaron y
las trataron para que se pusieran en reposo en el periodo G0 del ciclo celular.
Despus los ncleos los transplantaron al ovulo sin ncleo, aplicaron corriente elctrica y se
desencadeno su divisin que form una masa que transplantaron al tero de la oveja de cara negra.

Algunos dieron como resultado el nacimiento de una oveja de cara blanca, se haba conseguido
clonar un mamfero a partir de una clula somtica y del citoplasma de un ovulo distinto para
comprobar que el individuo naca del ncleo derivado de la oveja de cara blanca.
Esa oveja es la oveja Dolly.
Estos experimentos ponen de manifiesto que los genes se mantienen en la diferenciacin celular
pero hay un cambio de expresin.
Desarrollo en Drosophila: etapas del desarrollo, citoplasma polar, mutantes que afectan al
desarrollo, anlisis molecular de las mutaciones que afectan al desarrollo.
Clula huevo: cuyos ncleos se dividen muchas veces. A las 9 divisiones el ncleo emigra a la
periferia y se forman unas invaginaciones que originaran clulas que se ponen en torno a los
ncleos.
Larva: tiene unas masas de clulas que son conjuntos de clulas que sirven para formar las
estructuras del adulto de la cabeza, el trax y el abdomen. El resto son tejidos larvarios que
desaparecen en la metamorfosis.
Estos estadios en el desarrollo temprano se producen por la accin de unos genes divididos en tres
tipos:
Genes maternos o de polaridad del huevo: son genes que se expresan en la clula del ovocito o
en las clulas que lo rodean y el producto de esos genes lo transporta el citoplasma del ovocito.
Establecen la polaridad del embrin, determinan los ejes del cuerpo y una vez que est determinado
empiezan a actuar otros genes.
Genes de segmentacin: determinan el nmero y la polaridad de los segmentos del cuerpo. Una
vez decidido el nmero y polaridad se establece la identidad de cada segmento.
A continuacin hay una regulacin en cascada.
Genes hometicos: establecen la identidad de cada segmento.
Se expresan los genes del grupo uno y cuando estn sus productos gnicos activan la expresin del
grupo 2, que sus productos activaran los del grupo 3 y darn lugar a la estructura del cuerpo del
animal.

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Algunos genes clave que determinan el eje anteroposterior en las moscas:

Bicoid: est dentro del primer grupo. Se expresa en el ovario regula la expresin de genes
responsables de las estructuras anteriores y estimula al gen Hunchback del segundo grupo.
Nanos: est dentro del primer grupo. Se expresa en el ovario y regula la expresin de los
genes responsables de las estructuras posteriores e impide la traduccin del ARNm debida a
la activacin de Huchback.
Hunchback: se expresa en el embrin y regula la transcripcin de los genes responsables de
las estructuras anteriores.
A partir de los mutantes se lleg a los genes y a partir de ellos al producto gnico.
El RNA bicoid est en la zona anterior del huevo, y cuando se traduce la protena resultante est
localizada en la parte anterior, y en el nos ambos se localizan en el interior.
Esto se consigue por que el ARN de bicoid en la 3 UTR tiene una secuencia que interacciona con
protenas situadas en los extremos - de los microtbulos (por el que se fijan a los cromosomas).
Caudno es dos se fija a los extremos + y as se consigue la distribucin geogrfica de los
mensajeros que da lugar al gradiente de la protena.
Rodeando a la capa de clulas est un fluido donde existen unos componentes donde hay una
protena SPC.
Esto est localizado en la parte ventral porque cuando esta formndose el ovocito est rodeado de
una capa de celular foriculares que producen esa parte y las otras no.
Esa protena se difunde, pasa al ovocito y se concentra en la regin ventral del embrin.
La protena dorsal Dl est difundida por todo el cigoto y entra por igual en todas las clulas de la
blstula, pero estas tienen una protena que captura a la protena dorsal y la secuestra inactivndola.
Cuando se produce la unin de spz con tol emite una seal que se transmite por el citoplasma, hay
una fosforilacin de estas protenas y se separan quedando la dorsal suelta y es capaz de entrar en
los ncleos.
Cuando entra en el ncleo puede inactivar otros genes de la parte ventral y activar los de la parte
dorsal.
Los genes de segmentacin son numerosos y se dividen en:
Genes gap: Anula los segmentos adyacentes.
Los genes gap dividen el territorio del blastmero en 3 o 4 secciones grandes, y esas
secciones se dividen en otras ms pequeas por la accin de los otros genes.
As se establece el nmero de segmentos totales y los ltimos genes determinan la polaridad
de los segmentos, la parte posterior y la anterior. Unos genes estimulan a otros.

Genes de polaridad segmentaria: afecta a la polaridad de los segmentos. Parte del

segmento es reemplazada por una imagen en espejo de parte de otro segmento.

Genes de la regla de los pares: se expresan en secciones. Anula la misma parte del patrn
en segmentos alternados.

Una vez definidos los segmentos, en la parte anterior y la posterior se expresan los genes
hometicos que hacen que cada segmento sin caractersticas se especialice para formar una parte del
cuerpo.
Los genes homeoticos que determinan la identidad de los segmentos individuales en Drosophila, se
encuentran en 2 complejos.

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Son 5 genes que producen las estructuras de los segmentos, estn en el mismo cromosoma y en un
orden que es justo el orden en el cual se produce su expresin en el desarrollo.
No se conoce el porque de su disposicin.
Se llaman hometicos porque cuando mutan, dan lugar a que una estructura del cuerpo aparezca en
un lugar que no le corresponde.
Los genes producen un factor de transcripcin que se une al ADN y desencadena la expresin de
otros genes.
Al ser factores de transcripcin tienen un dominio que produce una parte de la protena que
interacciona con el DNA, es el homeodominio.
Esto es comn en vertebrados y en la Drosophila.
As se van desarrollando las caractersticas celulares que formaran el adulto.

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