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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTNOMA DE MXICO

FACULTAD DE QUMICA

COMPENDIO DE BIOQUMICA: PROTENAS, MEMBRANAS Y


METABOLISMO
Dra. Laura Carmona Salazar. Dpto. de Bioqumica, Fac. de Qumica,
UNAM. arual_cas@yahoo.com.mx
Dra. Marina Gavilanes Ruz. Dpto. de Bioqumica, Fac. de Qumica, UNAM.
gavilan@unam.mx
Dra. Vanessa Maya Ampudia. Dpto. de Bioqumica, Fac. de Qumica,
UNAM. vanemaya@gmail.com
Dra. Consuelo Plata Ramos. Dpto. de Bioqumica, Fac. de Qumica,
UNAM. Dpto. de Nefrologa, Inst. Nal. Cien. Mdicas y Nutricin, Salvador
Zubirn. consueloplata@hotmail.com
Coordinacin y edicin
Dra. Marina Gavilanes Ruz
Cd. Universitaria, Mxico, D. F. Febrero de 2010.

PRLOGO
.
El curso de Bioqumica de los nuevos planes de estudio (implantados en la Facultad de
Qumica en el ao de 2005) es un curso terico sin contraparte experimental simultnea y que se
imparte en clases de cuatro horas a la semana durante las diecisis semanas del semestre. Su
programa es cursado de manera obligatoria por los alumnos del 5 semestre de las licenciaturas de
Qumico-Farmacutico-Bilogo y de Qumico de Alimentos y resulta esencial para materias que se
cursan posteriormente como Bioqumica Experimental, Gentica y Biologa Molecular, Bioqumica
Clnica e Introduccin a la Genmica. La asignatura se imparti por primera vez en el semestre 08-I y
desde entonces se hizo evidente que el curso era muy complejo por la extensin y diversidad de su
contenido, ya que abarca los temas de estructura y funcin de protenas y membranas y los de la
parte bsica del metabolismo intermediario. Su grado de dificultad se ha hecho evidente a travs de
las opiniones de los profesores y de parmetros de evaluacin del curso mismo. Por lo anterior, un
grupo de profesoras de la materia cremos conveniente crear un instrumento didctico que
contribuyera a facilitar la comprensin y mejorar el aprendizaje del estudiante de este curso, que es
fundamental en su formacin. El presente Compendio de Bioqumica: Protenas, Membranas y
Metabolismo conjunta de forma resumida el material didctico que las profesoras han desarrollado
para el curso que han impartido a travs de cuatro semestres, por lo que su contenido est ajustado y
organizado especficamente para el programa correspondiente. Por ello, en este trabajo, los alumnos
pueden encontrar de una manera abreviada los aspectos bsicos del programa, lo que puede resultar
til para comprender y reforzar los fundamentos de cada tema. Este Compendio de Bioqumica:
Protenas, Membranas y Metabolismo no pretende en absoluto sustituir a los libros de texto o de
consulta, cuyo uso es indispensable para un ptimo aprendizaje de la materia. Slo intenta concentrar
de una manera organizada, condensada, clara y articulada, los aspectos esenciales de los temas que
se cubren en el temario.
Adems de constituir un apoyo para los alumnos del curso de Bioqumica de las licenciaturas
de Qumico Farmacutico Bilogo y de Qumico en Alimentos de los actuales planes de estudio de
esta Facultad, este Compendio tambin puede ser utilizado como una gua de estudio para los
Exmenes Ordinarios y Extraordinarios de la materia y adicionalmente, como una gua de estudio
para el Examen Extraordinario de la Bioqumica II de los anteriores planes de estudio, as como para
la seccin de Bioqumica del Examen de Ingreso al Posgrado en Ciencias Bioqumicas de la UNAM,
ya que el contenido de este compendio cubre los temas que se evalan en estos exmenes.
Parcialmente, este compendio revisa temas de los cursos de Bioqumica para la carrera de Qumica
del actual plan de estudios y de la Bioqumica I del anterior plan de estudios.
Este Compendio de Bioqumica: Protenas, Membranas y Metabolismo constituye una
herramienta que podr ser mejorada en el transcurso de los semestres por venir para que cumpla con
la funcin que deseamos. Por ello, invitamos a profesores y alumnos, a que nos hagan saber sus
opiniones a las direcciones electrnicas de las autoras.
Marina Gavilanes Ruz.
Febrero, 2010

ii

3.0 Balance energtico.


4.0 Regulacin.
VII. Ciclo del cido Ctrico. 6 horas
1.0 Generalidades.
2.0 Fuentes del acetil-CoA. Reacciones
anaplerticas.
3.0 Productos de la va y balance energtico.
4.0 Importancia del ciclo como proveedor de
esqueletos carbonados para otras vas metablicas.

DEPARTAMENTO DE BIOQUMICA
FACULTAD DE QUMICA, UNAM
LICENCIATURAS DE QFB Y QA
CURSO DE BIOQUMICA (CLAVE 1508)
TEMARIO DEL CURSO

VIII. Fosforilacin Oxidativa y Fotosntesis. 6


horas
1.0 Fosforilacin Oxidativa. Generalidades.
Productos de la va. Hiptesis quimiosmtica.
Balance energtico.
2.0 Reacciones de la fase luminosa de la
fotosntesis. Generalidades. Productos de la va.
Balance energtico.
3. 0 Reacciones de la fase oscura de la
fotosntesis. Generalidades. Productos de la va.
Balance energtico.

I. Estructura y Funcin de las Protenas. 10 horas


1.0 Estructura y Funcin de los aminocidos.
2.0 Niveles de estructuracin de las protenas:
Estructuras primaria, secundaria, terciaria y
cuaternaria. Caractersticas, representaciones
grficas.
3.0 Funciones de las protenas: Colgena,
mioglobina, hemoglobina: Relacin estructurafuncin. Enzimas: Clases de reacciones sitio activo,
catlisis, cintica, energtica y regulacin.
II. Estructura y funcin de membranas. 5 horas
1.0 Componentes de las Membranas Biolgicas:
Lpidos, Protenas y Carbohidratos.
2.0 Modelo del mosaico fludo de las membranas
biolgicas. Estructura y propiedades de la bicapa
lipdica.
3.0 Termodinmica, cintica y mecanismos del
transporte transmembranal.
4.0 Comunicacin intercelular.

IX. Metabolismo del Glucgeno. 4 horas


1.0 La glucogenlisis. Generalidades. Productos
de la va y balance energtico. Regulacin.
2.0 Glucognesis. Generalidades. Productos de
la va y balance energtico. Regulacin.
X. Metabolismo de Lpidos. 6 horas.
1.0 La -oxidacin. Generalidades. Productos de
la va y balance energtico. Regulacin.
2.0 La sntesis de cidos grasos. Generalidades.
Productos de la va y balance energtico.
Regulacin.
4.0 Generalidades de la sntesis de colesterol y
de las hormonas esteroides.

III. Introduccin al Metabolismo. 4 horas


1.0 Generalidades.
2.0 Termodinmica de los sistemas vivos.
3.0 Termodinmica de las reacciones de los
compuestos fosforilados.
4.0 Formas de regulacin de las vas
metablicas.

XI. Metabolismo de compuestos nitrogenados. 4


horas.
1.0 Mecanismos de asimilacin del nitrgeno.
Generalidades. Productos de la va y balance
energtico. Regulacin
2.0 Catabolismo de aminocidos y nucletidos.
Generalidades. Productos de las vas y balance
energtico. Regulacin.

IV. Gluclisis. 4 horas


1.0 Generalidades.
2.0 Reacciones de la gliclisis.
3.0 Productos de la va y balance energtico.
4.0 Regulacin.
V. Gluconeognesis. 2 horas
1.0 Generalidades
2.0 Productos de la va y balance energtico.
3.0 Regulacin

XII. Integracin Metablica. 2 horas.


1.0 Las principales vas metablicas y las
estrategias del metabolismo energtico.
2.0 Situaciones metablicas anormales: la
inanicin y la diabetes mellitus.

VI. Metabolismo de las pentosas fosfato. 2 horas.


1.0 Generalidades.
2.0 Productos de la va.

iii

BIBLIOGRAFA
Los siguientes son libros en los que se puede
encontrar una versin ms amplia y profunda
de los temas que se revisan en este
Compendio.
En algunos casos se anotan las claves de
colocacin de los volmenes respectivos en
la Biblioteca del Conjunto A, de la Facultad
de Qumica, UNAM, misma que da servicio
los sbados y domingos.
lberts, Johnson; A. Lewis; J. Raff et al.
Molecular Biology of the Cell. 4a ed.
New York, Garland Science, 2002.
QH581.2/M64/2002 (10 ejemplares)
Armstrong, F.B. Biochemistry. 3 Ed.
Oxford University Press. New York.
1989. QP514. R3718. V.1 y V.2
Becker, W. M., Kleinsmith, L. J. y
Hardin, J. El Mundo de la Clula. 6
Ed. Pearson Addison Wesley,
Bohinski. Bioqumica. 5 Ed. Adisson
Wesley Iberoamericana. Delawere,
USA. 1991. QP514 S14. 1988
Campbell, M y S. Farell. Bioqumica.
4a ed. Mxico, Thomson, 2004.
QD415/C3518 (3 ejemplares)
Cooper, G. M. The Cell. A Molecular
Approach. ASM Press. Washington, D.
C. 1997.
Darnell, J.E., Lodish, H.F.D., Baltimore,
D. Molecular Cell Biology. Scientific
American Books. Inc. New York. 1986.
QH5812.D37.
Devlin,
T.M.
Textbook
of
Biochemistry
with
Clinical
Correlations. 3 Ed. Wiley-Triss. New
York. 1992. QP514.2. A75 1989.
Hames, B. y N. Hooper. Instant Notes
in Biochemistry. 2a ed. New York,
Springer, 2000. QP518.3/H36/2000 ( 7
ejemplares)
Horton, R.H., Moran, L.A., Ochs, R.S.,
Rawn,
J.D.
y
Scrigeour,
K.G.
Bioqumica.
Ed.
Prentice
Hall
Hispanoamericana. Mxico. 1995.

Lodish, H., Matthew, P., Scott, M.,


Matsudaira, P., Darnell, J., Zipursky, L.,
Kaiser, C., Berk, A., Krieger, M.
Molecular
Cell
Biology.
QH581.2/M65/2000. (8 ejemplares)

McKee, T. y McKee, J. R. Bioqumica.


La Base Molecular de la Vida. 3 Ed.
McGraw Hill-Interamericana. Madrid.
2003. 773 pp
Melo, V. y Cuamatzi, 0. Bioqumica de
los Procesos Metablicos. 2 Ed.
Revert, Mxico, D. F. 2008. 404 pp
Murray, R.K.; D.K. Granner, P.A.
Mayes, V.W. Rodwell. Bioqumica de
Harper. 13 Ed. El Manual Moderno.
Mxico, D.F. 1994.
Nelson, D. y M. Cox. Lehninger
Principles of Biochemistry. 3a ed.
New York, Worth Publishers, 2000.
QH345/L43/2000. (8 ejemplares)
Nelson, D. L. y Cox, M. M. Lehninger
Principles of Biochemistry. 5th Ed.
W. H. Freeman and Co. New York.
2008. 1158 pp
Pingoud, A.; C. Urbanke; J. Hoggett; et
al. Biochemical Methods; A concise
guide for students and researchers.
New
York,
Wiley,
2002.
QH345/B52118. (2 ejemplares)
Rawn, J.D. Bioqumica. 3a Ed.
Interamericana-Mc Graw Hill. Madrid
1989. QP514.2 B63. 1987.
Stryer, L. Bioqumica. 5 Ed. Editorial
Revert, S. A. Barcelona. 2003 QP
514.2
Turner, P. C., McLennan, A.D., Bates,
A. D. y White, M. R. H. Instant Notes
in Molecular Biology. 2a. Ed. Bios,
Oxford. 2001
Vzquez Contreras, E. Bioqumica y
Biologa Molecular en Lnea. Instituto
de Qumica, UNAM. 2003
http://laguna.fmedic.unam.mx/~evazque
z/0403/

Jimnez, L. y H. Merchant. Biologa


Celular y Molecular. Mxico, Prentice
Hall,
2003.
QH581.2/B564.
(8
ejemplares)
Koolman, J y K. Rohm. Bioqumica;
Texto y Atlas. 3 ed. Buenos Aires,

iv

Mdica
Panamericana,
2004.
QP514.2/K6618/2004. (15 ejemplares)
Laguna, J. y Pia, E. Bioqumica de
Laguna. 5 Edicin. Co-edicin El
ManuaL
Moderno-UNAM.
Mxico.
2002.Lehninger, A.L. Principles of
Biochemistry. 2a Ed. Worth Publishers
Inc. New York. 1993. QP514.2. T48.
1992.

http://www.biochemlinks.com/bclinks/bi
ochem.cfm
http://www.laguna.fmedic.unam.mx/~leo
nor/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
http://www.wortpublishers.com/lehninge
r/index.htmhttp://laguna.fmedic.unam.m
x/~evazquez/0403/

Van Holde, Mathews y K. Ahern.


Bioqumica. 3 ed. Mxico, Pearson,
2002. QP514.2/M38818. (14 ejemplares
Voet and Voet. Biochemistry. New
York, Wiley, 2004. QP514.2/V64/2004.
(2 ejemplares)
Wilson, P.; J. Walter y J. M. Walker.
Principles
and
Techniques
of
Practical
Biochemistry.
5a
ed.
Cambridge,
Cambridge
University
Press, 2000. QP519.7/P75/2000.
(1
ejemplar).
Pginas WEB y bases de datos:

El material grfico presentado en el presente Compendio proviene de las autoras y de


varias fuentes, incluidas pginas de Internet. Por ello, este Compendio no est a la
venta en ninguna modalidad que implique un lucro directo o indirecto y tiene slo un
propsito educativo

CONTENIDO

I.

II.

III.

IV.

V.

VI.

VII.

VIII A.

Prlogo
Temario del Curso de
Bioqumica. Licenciaturas de
QFB y QA
BIBLIOGRAFA
CONTENIDO
ESTRUCTURA Y FUNCIN
DE LAS PROTENAS
Aminocidos
Niveles de estructura
Desnaturalizacin
Colgena, mioglobina y
hemoglobina
Enzimas
ESTRUCTURA Y FUNCIN
DE LAS MEMBRANAS
BIOLGICAS
Componentes moleculares
Estructura y topologa
Transporte transmembranal de
solutos
Comunicacin celular
INTRODUCCIN AL
METABOLISMO
Generalidades
Anabolismo y catabolismo
Coenzimas
Termodinmica
GLUCLISIS
Generalidades
Productos de la va y balance
energtico
Reacciones de la va
Regulacin
GLUCONEOGNESIS
Generalidades
Productos de la va y balance
energtico
Reacciones de la va
Regulacin
VA DE LAS PENTOSAS
FOSFATO
Generalidades
Reacciones de la va
Productos de la va y balance
energtico
Regulacin
CICLO DE KREBS
Generalidades
Reacciones de la va
Productos de la va y balance
energtico
Regulacin
FOSFORILACIN OXIDATIVA
Generalidades de la cadena
respiratoria

ii
iii
iii
vi
VIII B.
1
3
8
9
10
IX.
14
17
18
21
X.

22
23
24
25
27
27
28
29
31
31
31
32

XI.
34
35
36
36
37
37
37

XII.

39
40

vi

Complejos respiratorios
Reacciones de la va
Teora Quimiosmtica
Productos de la va y balance
energtico
FOTOFOSFORILACIN
Generalidades de la
fotosntesis
Productos de la va y balance
energtico
Reacciones de la Fase
Luminosa
Reacciones de la Fase Oscura
METABOLISMO DEL
GLUCGENO
Generalidades
Reacciones de la va de
Degradacin del Glucgeno
Regulacin
Reacciones de la va de
Sntesis del Glucgeno
Regulacin
METABOLISMO DE LPIDOS
Generalidades
Reacciones de la va de
Degradacin de los cidos
Grasos
Productos de la va y balance
energtico
Regulacin
Reacciones de la va de
Sntesis de los cidos Grasos
Productos de la va y balance
energtico
Regulacin
Sntesis y utilizacin de cuerpos
cetnicos
Sntesis de colesterol.
Generalidades.
METABOLISMO DE
COMPUESTOS
NITROGENADOS
Generalidades
Formas de degradacin de los
aminocidos
Incorporacin de los productos
de degradacin al metabolismo
Degradacin de nucletidos
INTEGRACIN METABLICA
Compartamentalizacin
Metabolitos de encrucijadas
metablicas
Desrdenes del metabolismo.
en la Inanicin y Diabetes

41
42
45
45
46
46
47
49
51
52
53
53
53
55
55
56
57
57
58
58
59
60

61
61
63
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