Aufbau, Struktur, Funktion von DNA, RNA und Proteinen

Mitarbeiterseminar der Medizinischen Fakultt

Ruhr-Universitt Bochum
Andreas Friebe
Abteilung fr Pharmakologie und Toxikologie

Aufbau, Struktur, Funktion von DNA, RNA und Proteinen

Aufbau, Struktur, Funktion von DNA, RNA und Proteinen

Zentrales Dogma der Molekularbiologie
Informationsfluss geht von DNA ber RNA zum Protein

DNA
Replikation

RNA
Transkription

Protein
Translation

DNA
Gen:

DNA-Abschnitt, der die Information fr ein spezifisches Genprodukt codiert:

- Protein bzw. RNA-Molekl

Chromosomen:

Erbinformation

Genom:

Gesamtheit aller Chromosomen einer Zelle (Erbgut)

- 3 Milliarden Basen
- > 20.000 Gene (Mensch)
- 2 Meter DNA-Faden pro Zelle

Aufbau der DNA

Aufbau, Struktur, Funktion von DNA, RNA und Proteinen

Wasserstoffbrcken
- Zwischen Dipolmoleklen herrschen zwischenmolekulare Krfte

Funktionelle Gruppen
- Hydroxyl-Gruppe

R-OH

- bildet Wasserstoffbrcken
- in Alkoholen und Zuckern

- Carboxyl-Gruppe

R-COOH

- bildet Wasserstoffbrcken, oft ionisiert:

COOH COO- + H+

- in organischen Suren: Zitronensure, Essigsure

- Amino-Gruppe

R-NH2

- bildet Wasserstoffbrcken, Base:

NH2 + H+ NH3+

- in Aminosuren

- Phosphat-Gruppe

R-PO4-

- bildet Wasserstoffbrcken, immer geladen

- in DNA, RNA

- Sulfhydryl-Gruppe

R-SH

- zwei SH-Gruppen knnen zu einer Disulfid-Brcke reagieren

- Verknpfung von Proteinketten -SH + -SH -S-S- + 2H+

Aufbau der DNA: Nukleotide und Nukleoside

Desoxyribonukleinsure:

DNS

(deoxyribonucleic acid, DNA)

Bausteine:
Nukleotide:

Jedes Nukleotid besteht aus 3 Bestandteilen:

- einer organischen Base:

A, G, C, T

- einem Zucker:

Desoxyribose

Desoxyribose

- Phosphat

Adenin

Purine

Guanin

Nukleosid: organische Base + Zucker

Adenosin, Cytidin, Thymidin, Guanidin
Pyrimidine
Cytosin

Thymin

Aufbau der DNA: Einzelstrang

Desoxyribose
5

Trinukleotid
1

Dinukleotid

5'-Ende

Mononukleotid

3'-Ende

Nukleotid-Bindung: Phosphat am 5'-Kohlenstoff verbunden mit Hydroxyl-Gruppe am 3'-Kohlenstoff

Aufbau der DNA: Doppelstrang (Helix)

Basenpaar
Phosphat
Zucker
Nukleotid

Basenpaare:
Adenin - Thymin: 2 H-Brcken
Guanin - Cytosin: 3 H-Brcken

DNA: Denaturierung und Renaturierung

Doppelstrang-DNA
- Denaturierung: Spaltung bei Erhitzen (Schmelzen)
Aufbrechen der Wasserstoffbrcken

- Renaturierung: Zusammenlagern der Einzelstrnge bei langsamen Abkhlen (Hybridisierung)

Wiederausbildung der Wasserstoffbrcken

Anwendung: PCR, Mutagenese, Southern blot Hybridisierung

Aufbau, Struktur, Funktion von RNA

Ribonukleinsure:

RNS

(ribonucleic acid, RNA)

Bausteine:
Nukleotide
Jedes Nukleotid besteht aus 3 Bestandteilen:
- einer organischen Base:

A, G, C, U

- einem Zucker:

Ribose

- Phosphat

Adenin

Cytosin

Guanin

Uracil

Aufbau und Vorkommen der RNA

m-RNA

t-RNA

r-RNA

messenger-RNA (Boten-RNA):

transfer-RNA:

ribosomale RNA

entsteht beim Kopieren der Gene

transportiert Aminosuren zu den

Bestandteile der Ribosomen

Ribosomen
Aminosure

Unterschiede RNA - DNA

- Der Zucker ist eine Ribose (statt Desoxyribose)
- Die Base Thymin ist durch Uracil ersetzt
- RNA kann auch als Einzelstrang vorliegen
- keine Helix als Raumstruktur

Aufbau und Vorkommen der RNA

m-RNA

t-RNA

r-RNA
Translation

Aufbau, Struktur, Funktion von Proteinen

Funktionen verschiedener Proteine
- katalytisch wirksame Proteine:

Enzyme

- Faserproteine:

Seide, Spinnengewebe

- Sttzproteine:

Knorpel > Slze, Knochenmatrix, Haare, Hautschuppen, Keratin

- Sehnenproteine:

Gelatine

- kontraktile Proteine:

Muskelproteine

- Transportproteine im Blut:

Albumine fr den Fettsuretransport

- Antikrper:

Gammaglobuline

- Sauerstoffbindende Proteine:

Hmoglobin, Myoglobin

- Bakterientoxine:

Botulinustoxin, Diphtherietoxin

- Kanalproteine:

Ionenkanle

Aufbau, Struktur, Funktion von Proteinen

Unterscheidung von Proteinen
- Gre:

Insulin 51 AS, Serumalbumin 584 AS

- Form:

globulr, fibrillr etc.

- Konformation:

einfach oder zusammengesetzt

- Lokalisation:

intra-/extrazellulr, zytosolisch oder in der Membran

- Funktion:

Enzyme, Membranproteine, Transkriptionsfaktoren etc.

- Sequenzverwandtschaft, Aufbau aus Domnen

kein stets sinnvolles Einteilungsschema vorhanden

Struktur
- Primrstruktur:

Aminosuresequenz

- Sekundrstruktur: -Helix, -Faltblatt

- Tertirstruktur:

rumliche Faltung der Aminosurekette

- Quartrstruktur:

rumliche Struktur von Proteinkomplexen

Aufbau von Proteinen: Aminosuren

Nicht-ionische Form

Geladene Form (Zwitterion) bei pH 7,4

Amino-Gruppe::

NH2 / NH3+

Suregruppe:

COOH / COO-

Aminosurerest:

Aufbau, Struktur, Funktion von Proteinen: Aminosuren

Aminosuren mit hydrophoben Resten

Bausteine
- 20 verschiedene Aminosuren

Vorkommen
- Dipeptide
- Oligopeptide

Aminosuren mit hydrophilen Resten

2-100 Aminosuren

- Proteine (Eiweie): > 100 Aminosuren

saure Aminosuren

basische Aminosuren

Neutrale Aminosuren

Aromatische Aminosuren

Peptidbindung
Kondensationsreaktion

N-Terminus

C-Terminus
Peptidbindungen

Struktur von Proteinen: Sekundrstruktur

WasserstoffbrckenBindung

Ionen-Bindung

DisulfidBrcke

hydrophobe
Wechselwirkung

Struktur von Proteinen: Sekundrstruktur

Alpha-Helix

Struktur von Proteinen: Sekundrstruktur

Beta-Faltblatt

Struktur von Proteinen: Tertir- und Quartrstruktur

Beispiel: Hmoglobin
Tertirstruktur

Quartrstruktur

Enzyme
Enzyme:

'Biokatalysatoren'

Zelle = Fabrik, Zellorganellen = Maschinen, Enzyme = Arbeiter

- mehr als 2000 Enzyme bekannt
- Leberzelle: ca. 50 Millionen Enzymmolekle

Eigenschaften
- Endung:

-ase

- Enzyme sind substratspezifisch und wirkungsspezifisch

- Enzyme wirken ber einen Enzym-Substratkomplex
- Enzyme haben ein aktives Zentrum
- Enzyme lassen sich inaktivieren durch hohe Temperatur, pH-Wert-nderung, Schwermetallionen
Denaturierung (= Verlust der Konformation)

Eigenschaften von Enzymen

Temperatur-Abhngigkeit

pH-Abhngigkeit

- Oxidation/Reduktionsreaktionen: Oxidoreduktasen oder Dehydrogenasen

Bsp.: Katalase, ADH

- bertragen von funktionellen Gruppen: Transferasen

Bsp.: Aminotransferase

- Bindungsspaltungen: Hydrolasen und Lyasen

Bsp.: Peptidasen

- Verknpfungsvorgnge: Ligasen

Bsp.: DNA-Ligase