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CONCOURS G2E
BIOLOGIE
Dure : 3 heures
Les calculatrices programmables et alphanumriques sont interdites.
Lusage de tout ouvrage de rfrence et de tout document est strictement interdit.
Si, au cours de lpreuve, un candidat repre ce qui lui semble tre une erreur dnonc, il
en fait mention dans sa copie et poursuit sa composition. Dans ce cas, il indique clairement
la raison des initiatives quil est amen prendre.
Les candidats doivent respecter les notations de lnonc et prciser, dans chaque cas, la
numrotation de la question pose.
Une grande attention sera apporte la clart de la rdaction et la prsentation des
diffrents schmas.
Remarque importante : Les deux parties Biologie 1 et Biologie 2 sont indpendantes. Au
sein de chaque partie, les questions suivent une problmatique progressive et le jury vous
demande donc de les aborder dans lordre.
On utilise deux souches de levures : une sauvage et une mutante ne synthtisant pas la protine
SCC1. Le document 1 reprsente lvolution des caractristiques suivantes au cours du temps :
bourgeonnement cellulaire, sparation des chromatides et extension du fuseau de division.
Les graphes de droite reprsentent la quantit dADN par cellule.
Dans deux lots, on utilise du nocodazole qui dpolymrise les microtubules.
On cre une souche de levure possdant la squence codante sauvage du gne scc1 associe
un pitope Myc. L'pitope Myc est le domaine de la protine Myc reconnu spcifiquement par
l'anticorps anti-Myc. La protine SCC1-myc est ainsi aisment dtectable par
immunofluorescence.
Le document 2 dcrit lvolution, au cours du temps la quantit dADN par cellule (2-A), la
quantit de protine SCC1-myc (2-B) et la localisation cellulaire de cette protine, en relation avec
lADN et les microtubules (2-C). Le temps 0 correspond au transfert dans un milieu complet
25C.
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On construit une nouvelle souche de levure exprimant une protine SCC1 non dgradable.
Aprs trois jours de culture, la souche sauvage et la souche mutante sont mises en contact avec
de la colchicine, alcalode vgtal qui dpolymrise les microtubules.
Les cellules cultives sont alors toutes au mme stade de division : la mtaphase.
Afin de localiser la chromatine, les souches expriment une histone modifie : lhistone H2-GFP
correspond la fusion de la protine histone H2 avec la protine fluorescente verte GFP.
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On utilise une souche sauvage de cellules humaines, exprimant des protines homologues de
celles tudies chez S. cerevisiae. On constitue deux lots : un lot tmoin sans modification et un
lot test o lon injecte un ARN interfrent dESP-1.
Document 4 : Photographies de mitoses.
A, B et C: Cellules sauvages.
Les deux flches en C pointent le sillon de
division.
D, E et F: Cellules avec ARNi.
Les deux flches en F pointent des ponts de
chromatine de deux cellules interphasiques.
La barre dchelle mesure 20 m.
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On construit une souche de S. cerevisiae exprimant une protine chimre sous le contrle du
promoteur de lopron galactose. De lextrmit N-terminale lextrmit C-terminale, cette
protine chimre est la fusion d'un pitope FLAG, de la protine ESP-1 et d'un domaine de liaison
la chitine CBD. L'pitope FLAG est reconnu spcifiquement par un anticorps anti-FLAG.
Cette souche exprimant FLAG-ESP-1-CBD sera utilise dans les documents 5 et 6.
On utilise deux cultures de la souche construite de S. cerevisiae, lune en prsence de galactose,
lautre non.
Les protines cellulaires totales ou les protines retenues sur une colonne de chromatographie
daffinit billes recouvertes de chitine sont purifies partir de chaque culture puis on effectue
une lectrophorse et un transfert sur membrane (= Western blot).
Les protines fixes la membrane sont rvles comme indiqu sur le document 5.
Document 5 : Western blot des protines de la souche exprimant la protine chimre FLAGESP-1-CBD en prsence ou en absence de galactose.
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On utilise la souche exprimant FLAG-ESP-1-CBD. Les protines cellulaires totales sont extraites
et passent sur une colonne de chromatographie daffinit billes recouvertes de chitine.
On fait ensuite passer la protine SCC1 sur cette colonne. Lluat rcupr est analys par
Western blot et on rvle la protine SCC1 par un anticorps spcifique anti-SCC1.
Les rsultats sont prsents sur le document 6-A.
Le document 6-B prsente les rsultats dun Western blot rvlant la protine SCC1 par un
anticorps spcifique anti-SCC1.
Avant la migration, la protine a t incube en prsence de diverses substances extraites de
cellules en mtaphase de mitose, comme indiqu sur le document. La protine ESP-1 est membre
dune famille protique possdant un domaine catalytique conserv nomm CD Clan.
On utilise des concentrations croissantes (0-1 mM) de la molcule cmk, un inhibiteur spcifique du
domaine CD Clan sur la protine ESP-1.
La protine ESP-1 mutante nest pas fonctionnelle.
Document 6 : Western blot de la protine SCC1 aprs incubation avec divers composants
cellulaires.
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Partie 3 (3 points)
On utilise la mme souche que pour le document 7. Le milieu ractionnel est diffrent puisquil
contient des quantits dcroissantes de protine ESP-1. LADN dun plasmide gnrique est aussi
prsent dans une partie des puits (+). La protine SCC1 est rvle par un anticorps anti-SCC1.
Les rsultats sont prsents sur le document 8.
Les variations apparentes de masse sont dues un artfact de migration.
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Document 9-A : Variation du pH au cours dun test de pathognie de B. cinerea sur pomme.
Le pH est mesur diffrents temps aprs le dbut de linfection (hpi = heures postinfection). Les taches ncrotiques traduisent la croissance et linfection de lchantillon par
B. cinerea. Le pH initial de la surface de la tranche de pomme est de 4.
Document 9-B : Variation du pH dans une
culture de Botrytis cinerea.
Des spores de B. cinerea sont mises en
culture dans un milieu liquide sans agitation et
dont le pH est tamponn. Au bout de 7 jours
de culture, les cultures sont filtres et le pH
final des milieux est dtermin. Les rsultats
correspondent la moyenne obtenue partir
dau moins trois cultures indpendantes.
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Cellulase
U5
S4
S17 S21
U12
Cellulase
Arabinogalactan endo-1,4-galactosidase
-amylase
Protase
U1
Mannosyl-oligosaccharide
-1,2-mannosidase
-arabinofuranosidase
Glucan 1,3--glucosidase
U2, U3
U4, U7, S5
S16
S1, S2
S3
U15, S24
U16, S23
U 19
U14
Parmi les protines tudies, on sintresse lexpression du gne Bcacp1, un gne codant une
protase scrte pH 4. Pour cela, on ralise des lignes transgniques dans lesquelles le gne
rapporteur GUS codant une glucuronidase est plac sous contrle du promoteur du gne Bcacp1
(document 11-A). Les lignes transgniques sont places dans des cultures liquides tamponnes
pH 4,5 ou pH 7,5 et on mesure lactivit GUS aprs 16h de culture.
Question 11.a. Rappeler prcisment ce que mesure un gne rapporteur.
A
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Document
12-B :
Localisation
subcellulaire de H2O2 dans les
cellules vgtales dA. thaliana au
cours de linfection.
La prsence dH2O2 est mise en
vidence par ajout de CeCl3 qui
prcipite proportionnellement sa
prsence. Des clichs sont pris
diffrentes heures post-infection
(hpi) et la surface des prcipits sur
les clichs est dtermine pour
chaque compartiment.
Les rsultats sont la moyenne dau
moins 40 sections indpendantes
avec 15 cellules chaque fois.
IS : cellules du site dinfection.
AIS : cellules voisines du site
dinfection.
Nd : non dtect.
Document 12 : Localisation du peroxyde dhydrogne chez A. thaliana au cours dune infection.
Question 12. Analyser les rsultats des documents 12-A et 12-B et en dduire un rle
pour le peroxyde dhydrogne dans les interactions plantes-pathognes.
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Pour mieux comprendre cette rponse, on sintresse un mutant cerk1-1 dA. thaliana
particulirement sensible aux infections par des champignons comme B. cinerea (document 13).
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Partie 6 (2 points)
Feuilles
initialement
intactes
Feuilles
initialement
lses
Souche de
B.cinerea
sauvage
Souche de
B.cinerea
mutante
bcsak1
Question 15. Interprter les rsultats prsents dans la figure 15 et proposer un rle
au gne bcsak1.
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Lun des effets du peroxyde dhydrogne est dinduire lapoptose, ou mort cellulaire programme
des cellules suite aux lsions causes sur les molcules dADN. Pour tester si le peroxyde
dhydrogne a cet effet sur B. cinerea, trois souches diffrentes sont mises en prsence d H2O2 :
- Une souche sauvage B05.10 ;
- Un mutant bir14 pour lequel lexpression du gne BcBir1est trs attnue ;
- Un mutant BIR124 qui surexprime le gne BcBir1.
On dtermine alors par deux mthodes diffrentes le pourcentage de cellules en apoptose, soit en
recherchant par coloration DAPI du noyau des marqueurs dune condensation anormale de la
chromatine, soit en quantifiant les cellules prsentant des cassures double brin dans lADN
(mthode TUNEL) (document 16-A). La pathognie des trois souches de B. cinerea est par
ailleurs teste sur des feuilles dA. thaliana (document 16-B).
Document 16-A : Rle de la protine BcBIR1
dans lapoptose chez B. cinerea.
Des filaments mycliens sont mis en culture en
prsence dH202 pendant 24h puis sont
observs au microscope la recherche de
marqueurs de lapoptose, soit en marquant des
condensations anormales de la chromatine
(coloration DAPI agent intercalant), soit en
recherchant des cassures double-brin dans
lADN (mthode TUNEL).
Les rsultats sont prsents en pourcentage de
noyaux possdant des marqueurs dapoptose
dtermin laide de chacune des mthodes.
Chaque rsultat correspond la moyenne dau
moins 4 expriences indpendantes.
Document 16-B : Rle du
gne
BcBir1
dans
la
pathognie de B. cinerea.
Lobservation des lsions sur
des feuilles darabette 48 et
72h aprs le dpt de spores
des diffrentes souches de
B. cinerea.
B05.10 : souche sauvage
BIR124 :
souche
surexprimant BcBir1.
bir14 : souche ayant une
expression trs attnue de
BcBir1.
Document 16 : Le rle du gne BcBir1 chez B. cinerea.
Question 16. Interprter les rsultats obtenus dans les documents 16-A et 16-B et en
dduire un rle du gne BcBir1.
Bibliographie :
Partie 4 : Espino JJ et coll., Proteomics, 10(16) : 3020-3034 (2010); Manteau S. et coll., FEMS,
Microbiol. Ecol. 43 : 359-366 (2003); Rolland S. et coll., Microbiol. 155, 2097-2105 (2009); Parties 5 et
6 : Miya A et coll., PNAS 104 : 19613-19618 (2007); Temme M. et coll., MPMI : 22, 987-998 (2009)
Shlezinger N. et coll., PLoS pathog : 7-8 (2011); Simon UK. et coll. PLoS one : 8 (2013)
FIN DE LPREUVE
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