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BIOQUIMICA
TRABAJO COLABORATIVO 2
Metabolismo catabolismo.
Presentado por:
LEONEL ANDRES DANGOND MUOZ
CODIGO: 1095907557
GRUPO: 100416_67
Presentado a:
GOLDA MEYER TORRES VARGAS
TUTORA DEL CURSO
BUCARAMANGA, SANTANDER.
NOVIEMBRE DE 2015
metabolismo
de
Significado de
metabolismo.
Temtica que
desconozco
Diferencia entre
catabolismo y
anabolismo.
originan las
reacciones
bioqumicas del
metabolismo celular.
Beta oxidacin de
cidos grasos.
La fase de beneficios o de
rendimiento energtico: implica la
transformacin de la molcula de
gliceraldehdo-3 -fosfato en piruvato,
mediante una serie de reacciones
que liberan energa. Se obtienen
cuatro molculas de ATP y dos de
NADH + H+ por molcula de glucosa,
por lo que se libera ms energa que
la gastada en la fase preparatoria, lo
que da una ganancia neta de 2 ATP y
2 NADH + H+ por molcula de
la
glucosa.
Irreversible
bajo
condiciones
(Feduchi, 2010)
CICLO DE KREBS
El ciclo de Krebs, o ciclo del cido ctrico o ciclo de los cidos tricarboxlicos, toma
su nombre de su descubridor, Hans Adolf Krebs, un bioqumico alemn premiado
con el Nobel en el 1953.
Esta ruta metablica es la tercera etapa de la respiracin celular, el proceso de
produccin de energa en las clulas. Forma parte de la respiracin aerobia, es
decir, se realiza en presencia de oxgeno y se desarrolla entre los procesos de
glicolisis y cadena respiratoria. Su fin es la obtencin de NADH, una molcula con
poder reductor, que se utiliza para la produccin de ATP mediante la cadena
respiratoria.
En general, el ciclo consiste en la formacin de citrato, una molcula de 6 tomos
de carbono, mediante la reaccin del acetil-CoA (2 carbonos) con oxalacetato (4
carbonos). A continuacin, el citrato sufre algunas transformaciones qumicas
hasta llegar a formar otra vez oxalacetato (4 carbonos). La reduccin del nmero
de tomos de carbono a lo largo del ciclo ocurre porque el compuesto pierde dos
grupos carboxlicos como CO2, respectivamente en el paso 4 y 5. Todos los pasos
son catalizados por enzimas.
ENTRADAS Y SALIDAS EN EL CICLO DE KREBS
En total, en el ciclo de Krebs entran 1 molcula de acetil-CoA y 3 molculas de
H2O. Despus de su transcurso obtenemos:
1 molcula de Coenzima A
El Ciclo de Krebs.
Las enzimas que juegan un papel en el ciclo de Krebs y las reacciones que
catalizan son las siguientes:
1 - La citrato sintetasa facilita la unin del oxalacetato con el resto aclico que
lleva la coenzima A. Para ello se necesita adicionalmente un H 2O y al final la
coenzima A queda libre.
2 y 3 La aconitasa cataliza la produccin de cis-aconitato quitndo un H 2O del
citrato. Despus incorpora un H2O al cis-aconitato para formar isocitrato.
Antes de que la oxidacin beta puede ocurrir, los cidos grasos necesitan ser
activados, es decir reciben "ms energa" a travs de la unin a la Coenzima A
(HSCoA). La reaccin del cido graso con la coenzima A para formar Acil-CoA la
cataliza la enzima Acil-CoA-sintetasa (en la imagen naranja) que se encuentra en
la membrana externa de la mitocondria. (Recordamos que las mitocondrias son
rodeadas por dos membranas lipdicas dobles, mientras que las clulas disponen
de una capa solamente.)
fermentaciones. Las rutas metablicas no suelen estar aisladas, sino que suelen
conectar unas con otras, formando redes complejas. A los compuestos intermedios
que intervienen en una ruta metablica se los denomina metabolitos. Un ejemplo:
el cido ctrico en el ciclo de Krebs o el fosfoenolpirvico en la gluclisis. Hay rutas
que pueden ser catablicas y anablicas, a estas se las denomina anfiblicas; el
ejemplo ms caracterstico lo constituye el ciclo de Krebs. En el metabolismo hay
rutas centrales donde confluyen otras rutas metablicas. Un ejemplo es el ciclo de
Krebs.
Qu diferencia existe entre un organismo aerobio y uno anaerobio?
El organismo aerobio utiliza el oxgeno molecular como ltimo aceptor de
electrones. La oxidacin de la molcula se puede considerar completa. Los
productos resultantes son CO2, H2O y sustancias minerales que carecen de
energa. Por ello, en la respiracin aerobia es donde ms energa se desprende.
El organismo anaerobio emplea otras molculas aceptoras. La oxidacin es parcial
e incompleta.
En qu consiste la glucolisis? Cul es su balance energtico?
La gluclisis es un conjunto de reacciones anaerbicas que degradan la glucosa
(6C), transformndola en dos molculas de cido pirvico. Es utilizada por casi
todas las clulas como medio para obtener energa. Cualquiera que sea la fuente
de glucosa utilizada, el resultado final ser la obtencin de cido pirvico, ATP y
NADH. Las reacciones que se producen tienen lugar en dos etapas sucesivas: 1.
La glucosa, tras su activacin y transformacin en otras hexosas, se descompone
en dos molculas de 3 tomos de C, gliceraldehdo-3-fosfato. Para ello se necesita
la energa aportada por dos molculas de ATP. 2. Las dos molculas de
gliceraldehdo-3-fosfato se oxidan despus, a travs de una serie de reacciones,
hasta rendir dos molculas de cido pirvico. En esta oxidacin se necesita como
coenzima el NAD+, que se reduce a NADH. Asimismo, la energa liberada en el
proceso es utilizada para fabricar cuatro molculas de ATP.
Por cada molcula de glucosa que ingresa en esta va, se obtiene: 2 molculas de
cido pirvico. 2 molculas de ATP (cuatro formadas menos dos gastadas). 2
molculas de NADH + H+. Estas reacciones tienen lugar en el hialoplasma. El
destino del cido pirvico es diferente segn las condiciones: En condiciones
aerobias, el cido pirvico es descarboxilado a acetil-CoA y oxidado
completamente mediante el ciclo de Krebs en la mitocondria. En condiciones
anaerobias, el cido pirvico es reducido mediante la fermentacin a cido lctico
u otro compuesto en el citoplasma.
Cmo se lleva a cabo la respiracin celular? En qu lugar de la clula se
lleva a cabo?
Segunda fase: ciclo del cido ctrico o de Krebs. El acetil-CoA se condensar con
un cido de 4 carbonos para formar el cido ctrico, de 6 carbonos. A lo largo de
esta ruta circular se oxidarn intermediarios hasta rendir dos molculas de CO2 y
8 hidrgenos (4 pares de electrones) transportados por NAD+ y FAD. En la ruta
entra un esqueleto de dos carbonos, el cido actico, y salen dos carbonos en
forma oxidada. El ciclo cataliza la descomposicin del actico. En cada vuelta se
incorporar una molcula de cido actico.
Tercera fase: cadena de transporte electrnico y fosforilacin oxidativa. Los
intermediarios NADH y FADH2 ceden los electrones a una cadena de transporte
en la que una serie de protenas en cascada transfieren los electrones al O2.
Acoplada a esta cadena se produce la sntesis de ATP a partir de ADP + Pi.
FRAGMENTO 2:
Mecanismo bioqumico de gran importancia para las clulas aerobias y que
tiene al oxgeno como aceptor final de electrones.
Paso1.fragmento2.problema1:
El fragmento nos recomienda indagar en todo el mecanismo bioqumico que se
genera en las clulas aerobias para llevar a cabo su metabolismo, en donde el
oxgeno es el aceptor final de electrones.
Paso2.fragmento2.problema1:
Temtica que conozco
Significado de clulas
aerobias y
anaerobias y sus
diferencias.
Temtica que
desconozco
Importancia del
oxgeno en las
clulas aerobias para
llevar a cabo su
metabolismo.
Paso3.fragmento2.problema1:
Cules son los principales mecanismos de la regulacin metablica?
En qu consiste la fosforilacin oxidativa?
En qu consiste la cadena transportadora de electrones?
Qu funcin tiene la cadena de transporte electrnico en la mitocondria?
En qu lugar de la mitocondria se localiza fsicamente?
Las reacciones redox son reacciones qumicas en las cuales los electrones son
transferidos desde una molcula donadora hacia una molcula aceptora. La fuerza
que conduce a esta clase de reacciones es la energa libre de Gibbs de los
reactivos y los productos. La energa libre de Gibbs es la energa disponible para
realizar un trabajo. Ninguna reaccin que baje la energa libre de Gibbs total de un
sistema se realizar de forma espontnea.
La transferencia de electrones desde molculas altamente energticas
(donadoras) hacia molculas de bajo poder energtico (aceptoras) puede ser
espaciado en una serie de reacciones redox intermediarias, que en definitiva
forman una cadena de transporte. El hecho de que estas reacciones sean
termodinmicamente posibles no significa que puedan ocurrir; por ejemplo una
mezcla de hidrgeno y oxgeno no entra en ignicin de forma espontnea, se
requiere suplementar cierta energa de activacin o bajar la energa de activacin
de la reaccin.
Los sistemas biolgicos usan estructuras complejas que reducen la energa de
activacin de las reacciones bioqumicas. El transporte de electrones se realiza
mediante reacciones que son termodinmicamente favorables, y han sido
acopladas a reacciones que termodinmicamente no lo son, como por ejemplo son
la separacin de carga o la creacin de un gradiente osmtico. De esta forma la
energa libre del sistema baja y hace posible que el proceso se lleve acabo.
Las macromolculas biolgicas que catalizan este tipo de reacciones
desfavorables, termodinmicamente hablando, se han encontrado en todas las
formas de vida conocidas, y slo realizan estas funciones s y solo s estn
acopladas a reacciones termodinmicas favorables y que ocurran a la vez de las
que no lo son.
La cadena de transporte de electrones produce energa para la formacin de un
gradiente electroqumico, es decir se utiliza ese flujo para el transporte de
sustancias a travs de membrana. Este gradiente se utiliza para realizar,
posteriormente un trabajo mecnico, como puede ser la rotacin de un flagelo
bacteriano o la sntesis de ATP, que es imprescindible para un organismo.
El ATP tambin se puede obtener de otras formas como por ejemplo en la
fosforilacin a nivel de sustrato. Existen organismos que obtienen el ATP
exclusivamente mediante fermentacin, pero en la mayora de los casos la
generacin de grandes cantidades de ATP se realiza a travs de cadenas de
transportes de electrones.
Cadenas de transporte de electrones en mitocondrias
Las clulas de todos los eucariotas contienen organelos intracelulares conocidos
con el nombre de mitocondrias que producen ATP. Las fuentes de energa como la
glucosa son inicialmente metabolizados en el citoplasma y los productos obtenidos
Paso5.fragmento2.problema1:
Cules son los principales mecanismos de la regulacin metablica?
En las clulas se producen simultneamente una enorme cantidad de reacciones
metablicas (anablicas y catablicas), que estn catalizadas por diferentes
enzimas. Estas reacciones estn organizadas en rutas metablicas. Cada una de
estas rutas posee uno o varios puntos de control, que se encargan de asegurar las
necesidades que en cada instante posee la clula. La regulacin debe cumplir dos
condiciones: Debe ajustarse a las necesidades de la clula en cada instante. La
clula produce la energa, las macromolculas y los eslabones estructurales que
necesita en cada momento, con independencia de la abundancia en el medio. Es
decir, lo que determina la velocidad del catabolismo es la necesidad de ATP. Debe
ser flexible con las variaciones de nutrientes que presenta el medio en diferentes
momentos.
La regulacin del metabolismo celular se produce principalmente a tres niveles
que son los siguientes: Controlando la cantidad de los enzimas. Los enzimas, al
igual que otras molculas celulares, sufren recambio metablico y, por
consiguiente, se degradan y se sintetizan continuamente. Esto permite regular la
cantidad de un enzima que hay en un momento dado. La velocidad de sntesis
enzimtica depender de la velocidad de transcripcin del gen que la codifica.
Controlando la actividad enzimtica. Los organismos disponen de varios
mecanismos para modificar la actividad enzimtica. Uno de los ms importantes
es la regulacin por retroinhibicin. En este mecanismo intervienen los enzimas
alostricos, los cuales catalizan reacciones que estn localizadas en puntos clave
de una ruta metablica, como puede ser la primera reaccin de una ruta
metablica o el punto de ramificacin de una ruta. En este tipo de control, el
producto final de la ruta acta como inhibidor del enzima alostrico. Otros
mecanismos de regulacin son: la regulacin por isoenzimas y la regulacin por
modificacin covalente reversible del enzima. Controlando la cantidad de sustrato.
Otro mecanismo que permite regular el metabolismo es controlar la cantidad de
sustrato que llega al interior de un orgnulo a travs de la membrana.
PROBLEMA 2- CONTEXTO
BIOENERGETICA, ENZIMAS Y BIOQUIMICA MITOCONDRIAL
En su sentido ms amplio, se llama Bioenergtica a la aplicacin de la
Termodinmica en los sistemas biolgicos, esto incluyen todas las
transformaciones de energa que se producen en los seres vivos. Sin embargo,
prcticamente en todos los procesos que se dan en los seres vivos, existe un
intermediario comn en los intercambios de energa, el Trifosfato de Adenosina
(ATP) de ah que en forma clsica la Bioenergtica se ocupe del estudio de los
mecanismos de sntesis de ATP, dejando los mecanismos de consumo para su
revisin durante el estudio del metabolismo.
Significado de ATP
Algunos conceptos
de glucolisis y ciclo
de Krebs
Temtica que
desconozco
Como se integran las
rutas metablicas
para llevar a cabo los
procesos bioqumicos
y obtener energa en
forma de ATP.
Paso3.fragmento1.problema2:
Qu importante ruta metablica se inicia con la condensacin del acetato y
el oxalacetato?
Qu relacin existe entre el ciclo de Krebs y la Gluclisis?
Qu es un proceso de oxidacin?
Cules son los principales compuestos que intervienen como
transportadores de electrones en el metabolismo?
Cules son los principales intermediarios que participan en el metabolismo
y qu papel desempean?
Cuantas molculas de ATP se obtienen en el rendimiento energtico,
producido por la degradacin total de una molcula de glucosa?
OXIDACION DE CARBOHIDRATOS
Los alimentos, a travs de complicadas reacciones qumicas, proveen energa que
sirve para producir ATP. Est energa proviene de los carbohidratos, las grasa y
protenas. Los hidratos de carbono se depositan en el organismo en forma de
glucgeno en los msculos y el hgado. El glucgeno pasa a la sangre en forma
de glucosa que al degradarse, produce ,1 Kcal/g. la oxidacin de los carbohidratos
implica la puesta en marcha de diferentes reacciones qumicas que completan el
proceso de gluclisis, el ciclo de krebs y la cadena transportadora de electrones o
cadena respiratoria mitocondrial. Tanto el ciclo de krebs como la cadena
respiratoria mitocondrial se llevan a cabo en el interior de la mitocondria celular.
El resultado de esto procesos ser por lo tanto, agua, anhdrido carbnico, y 38 o
34 moles de ATP, dependiendo si viene de la degradacin del glucgeno o la
glucosa.
La capacidad oxidativa muscular depende de los niveles de enzimas oxidativas, de
la composicin del tipo de fibra muscular y la disponibilidad del oxgeno.
OXIDACIN DE LAS GRASAS.
La oxidacin de las grasas comienza con la beta - oxidacin de los cidos grasos
libres y a continuacin siguen el mismo proceso de la oxidacin de los
carbohidratos: en el ciclo de krebsy la cadena de transporte de electrones. La
energa producida por la oxidacin de un cido graso vara en funcin de la
composicin qumica del cido graso oxidad, pero normalmente es mayor que la
energa obtenida por la oxidacin de una glucosa.
Paso5.fragmento1.problema2:
Qu importante ruta metablica se inicia con la condensacin del acetato y
el oxalacetato?
Esta ruta es el ciclo de Krebs (llamado tambin del cido ctrico o de los cidos
tricarboxlicos) en la que la condensacin de estos dos compuestos origina el
cido ctrico. Al final del ciclo se recupera el oxalacetato, que puede incorporar una
nueva molcula de acetato. El acetato proviene de: La degradacin de los cidos
grasos en la -oxidacin o hlice de Lynen. La descarboxilacin oxidativa del
piruvato obtenido fundamentalmente, en la gluclisis. El ciclo de Krebs tiene lugar
en la matriz mitocondrial.
Qu relacin existe entre el ciclo de Krebs y la Gluclisis?
La gluclisis constituye una primera fase en la degradacin de la glucosa. Su
balance es 2 molculas de pirvico, 2 ATP y 2 NADH por molcula de glucosa.
Ahora bien, el pirvico sigue siendo materia orgnica que puede ser oxidada y
transformada en materia inorgnica (CO2). Esta transformacin ocurre en la ruta
metablica denominada ciclo de Krebs, que tiene lugar en la matriz mitocondrial.
El ciclo de Krebs se inicia con la incorporacin del acetil-CoA (2C) a una molcula
de cido ctrico. A lo largo del ciclo se produce su oxidacin total, generando dos
molculas de CO2, una de FADH2, 3 de NADH y una de GTP, recuperndose
finalmente el cido ctrico. El acetil-CoA procede, en gran medida, de la
descarboxilacin oxidativa del cido pirvico, producto final de la gluclisis,
aunque tambin puede proceder de la degradacin de los cidos grasos, glicerina
o desaminacin de los aminocidos. La gluclisis es una va anaerbica en la que
se inicia la degradacin de los azcares, mientras que en el ciclo de Krebs se
completa la destruccin no solo de los azcares, sino tambin de otros principios
inmediatos. El objeto de todo ello es conseguir el mximo posible de coenzimas
reducidos, lo que finalmente se traducir en una gran cantidad de ATP en la
cadena de transporte de electrones de la mitocondria.
Qu es un proceso de oxidacin?
La -oxidacin es un proceso catablico mediante el cual se oxida el carbono
situado en posicin beta. Por medio de este proceso, los cidos grasos se van
fragmentando en molculas de acetil-CoA. Esta ruta metablica tiene lugar en la
matriz mitocondrial.
FRAGMENTO 2:
Medicin de la capacidad de realizar trabajo durante una reaccin a temperatura
y presin constante. Explicacin del significado de la magnitud de dicha
capacidad ya sea positiva o negativa.
Paso1.fragmento2.problema2:
El fragmento nos lleva a examinar el comportamiento celular desde un enfoque
termodinmico y desde el punto de vista bioqumico entender y analizar las
reacciones que se llevan a cabo teniendo presente las condiciones de temperatura
y presin (energa libre de gibss).
Paso2.fragmento2.problema2:
Temtica que conozco
Temtica que
desconozco
Principios de la
termodinmica.
Importancia de la
termodinmica para
entender los
procesos bioqumicos
y sus reacciones.
para resolver el
problema.
Reacciones
termodinmicas a
nivel celular.
Energa libre de
gibss.
Paso3.fragmento2.problema2:
A qu se llama sistema termodinmico?
De qu depende que una reaccin transcurra espontneamente?
Qu es energa libre de Gibbs?
Paso5.fragmento2.problema2:
A qu se llama sistema termodinmico?
Un sistema termodinmico es cualquier regin macroscpica del universo,
formada por el conjunto de materia en estudio, que se separa del resto mediante
una superficie cerrada denominada superficie termodinmica. Principalmente, se
diferencian tres tipos de sistemas: Sistema cerrado. Un sistema es cerrado cuando
puede intercambiar energa con el entorno, pero no materia. Sistema abierto. Un
sistema es abierto cuando puede intercambiar materia y energa con el entorno.
Sistema aislado. Un sistema es aislado cuando no intercambia ni materia ni
energa con el entorno. Sistema adiabtico. Un sistema es adiabtico cuando no
intercambia materia ni energa en forma de calor con el entorno, pero s
intercambia energa en forma de trabajo.
De qu depende que una reaccin transcurra espontneamente?
Lo que permite predecir que una reaccin transcurra espontneamente o no es la
variacin de la energa libre ( G). Si G < 0, la reaccin es exergnica y transcurre
espontneamente. Si G > 0, la reaccin es endergnica y no transcurre
espontneamente; ocurrir en sentido contrario. Si G = 0, el sistema est en
equilibrio y no hay cambios.
Qu es energa libre de Gibbs?
La energa libre de Gibbs se usa en qumica para describir si una reaccin ocurrir
de forma espontnea o no. Podemos basarnos en dos cosas para calcular la
energa libre de Gibbs: el incremento o decremento de la entropa asociada con la
reaccin, y la cantidad de calor requerida o liberada por la misma, tambin
conocida como cambio en la entalpa.
Entropa
La entropa, definida como la medida del desorden del universo, debe
incrementarse para que una reaccin sea favorable. La ecuacin de la energa
libre de Gibs denota el cambio de entropa como "delta S", a veces escrito como
un tringulo, por la forma de la letra griega delta mayscula, y a veces como una
D. La entropa se incrementa en cualquier reaccin en la que un slido se
convierta en lquido, o un lquido en un gas. Tambin se incrementa en cualquier
reaccin en donde el nmero total de molculas es mayor al final que al comienzo.
Esto hace que el valor de delta S sea positivo para este tipo de reacciones.
Entalpa
El cambio en la entalpa, conocida como delta H, nos dice si la reaccin absorber
o liberar calor. Se describe a la entalpa como la cantidad de energa almacenada
en los productos y reactivos, y la ecuacin general como (delta H de productos) (delta H de reactivos), o sea, el total de energa almacenada en los productos
menos el total de energa almacenada en los reactivos. Estos valores para los
reactivos y productos tambin se conocen como entalpas de formacin.
Endotrmico y exotrmico
Si la entalpa de los productos es mayor que la de los reactivos, esto significa que
el producto tiene ms energa, y que por lo tanto, se debe aadir energa para que
ocurra la reaccin. Un delta H positivo denota una reaccin endotrmica (que
absorbe calor). De manera similar, los productos que tienen menos energa que
los reactivos implican que se ha escapado energa durante la reaccin, de modo
que una variacin de entalpa negativa describe una reaccin exotrmica (que
libera calor).
Clculos
La ecuacin de la energa libre de Gibbs como "delta G = delta H - T. delta S". La
temperatura en Kelvins aparece en la ecuacin para considerar la cantidad de
energa en el entorno. Como regla general, una variacin de entalpa negativa
(exotrmica) y una variacin de entropa positiva (aumento de entropa) dan un
valor de delta G negativo, lo cual significa que la reaccin se producir de forma
espontnea. Un valor de delta H positivo (endotrmico) y un valor de delta S
negativo (disminucin de la entropa) da un valor de delta G positivo, lo cual
significa que la reaccin no se produce de forma espontnea.
BIBLIOGRAFIA