Tema: Marcadores Biolgicos

Curso: Paleontologa general

Profesor: Ing. Manuel Elescano
Alumno: Terrazas Huamani Dany Jerson
E.A.P: Ingeniera Geolgica

2016

Introduccin
Los marcadores biolgicos, tambin rastreadores orgnicos, son
compuestos orgnicos especficos que son tiles en la evaluacin de las
fuentes genticas de la materia orgnica lipdica o bituminosa. Los
marcadores biolgicos como muestras geolgicas de la Tierra son los
productos derivados de precursores bioqumicos (productos naturales) por
procesos de alteracin oxidativa y/o reductora (por ejemplo, Colestanos a
partir del colesterol). Tienen estructuras qumicas que brindan datos sobre
sus compuestos precursores, los cuales se relacionan con la biota
contempornea o extinta. En general, los lpidos, pigmentos y
biomembranas se conservan mejor durante largos tiempos geolgicos.
Por mucho tiempo, los marcadores biolgicos ms antiguos eran de hace
1,7 G.a. (Giga aos), pero Jochen J. Brocks report, Australia con restos
orgnicos que tenan 2,7 G.a. de antigedad. Estos marcadores biolgicos
al tener 1 billn de aos ms que los anteriores probaron la existencia de
vida mucho ms antigua de lo que se crea. Se encontraron dos tipos,
primero indicadores de cianobacterias, que eran 2-metilhopanos, productos
de la descomposicin de 2-metilbacteriahopanopolioles, lpidos
especializados que slo se encuentran en las membranas de
cianobacterias. Esto indica que la fotosntesis oxignica evolucion antes
de que la atmosfera estuviera completamente oxidada. Tambin se
encontr la presencia de esteranos, particularmente colestano y sus
anlogos de 28- a 30 - carbono, proporciona evidencia convincente de la
existencia de eucariotas 500 millones a 1 mil millones de aos antes de que
el registro fsil existente lo indica.

Como analizar marcadores biolgicos

Para la extraccin de marcadores biolgicos, de 15 a 30 g de muestra de

roca fueron aplastados a un tamao de partcula de 3cm se agitan con
vrtex en 25 ml de 9: 1 de diclorometano (DCM) a metanol. El disolvente se
decanta y se almacena, las muestras secas se trituran hasta que las
partculas eran, en promedio, <1 cm. Las muestras se agitaron en 25 ml de
9: 1 DCM a metanol y el disolvente se decantaron y almacenado. Las
muestras se secaron, se trituraron a un polvo y de 15 a 30 g se cargaron en
tefln tubos con 30 ml de 9: 1 de DCM: solucin de metanol y se coloca en
una reaccin asistida por microondas Sistema (MARS) durante 15 min a
100 C. Los residuos se filtraron, y despus se infla hasta sequedad con
N2 (g) y criado con 20 ml de pentano. Las muestras se dejaron reposar
durante la noche a 0 C a precipitar asfaltenos. Solucione s de pentano se
decantaron y se centrifugaron durante 5 min a 3000 rpm. El pentano se
decant y se evapor bajo N2 (g), y las muestras se criaron en 3 ml de
DCM. Las muestras se dejaron sentarse con cuentas de cobre activados y
limpiadas durante 2-3 horas para eliminar de azufre despus de lo cual se
decantaron, soplado hacia abajo con N2 (g) y aproximadamente 1 ml de
extracto retirado y colocado en una pipeta llena lleno de slice
desactivado (2% DI) purgado con hexano. La fraccin saturada del extracto
se obtiene haciendo pasar 0,5 ml de hexano a travs de la pipeta. La
fraccin insaturada del extracto fue adquirida mediante el paso de 3,25 ml
de una mezcla 4: 1 de hexano: solucin de DCM de la pipeta, y, finalmente,
la fraccin aromtica haciendo pasar aproximadamente 3 ml de un 7: 3
DCM para solucin de metanol a travs de la pipette.1.5 ml de cada
fraccin respectiva se decantaron en cromatografa de gases (GC) viales
separados y llevados hasta 0,5 ml. Estos se llevaron a cabo en el GC-MS
(Trace GC Ultra Thermo Scientific, DSQ II Thermo Scientific) y se inyecta
por auto Sampler (AI / AS 3000) a 40 C y la rampa hasta 130 C a 20 C /
min y eleva a 320 C a 5 C / min y se mantuvo a 320 C durante 3 min. El
tiempo total de ejecucin fue de 45 min, y el helio gas portador.

Marcadores Biolgicos
Hace 251 millones de aos atrs, es un abrir y cerrar de ojos para la
geologa, hasta el 95 por ciento de especies marinas y el 85 por ciento de
la tierra se extinguieron. Fue la mayor masa la extincin del mundo ha
sufrido alguna vez, y que marc el final del perodo Prmico. La vida tom
10 millones de aos en recuperarse.

Esquistos

en

Pilbara

Este evento catastrfico es a menudo descrito como el momento en que "la

vida estuvo a punto de morir". Las formas de vida ms antiguas y de mayor
xito en la Tierra - las bacterias y arqueas - Navegado a travs de
prcticamente ilesos. La extincin del Prmico se ve mejor como un tiempo
donde la vida casi volvi a la normalidad - cuando las condiciones
biolgicas que haban prevalecido en Tierra durante ms de 3 mil millones
de aos brevemente a s mismos restablecida. Los microbios hicieron no
slo sobrevivir; ahora parece que jugaron un papel destacado en las

extinciones.

Esta nueva visin del Prmico no proviene del estudio de huesos

fosilizados, dientes y conchas, son a partir de productos bioqumicos que
han sido atrapados dentro de las rocas durante miles de millones de aos.
Esta rama de la ciencia emergente se llama el anlisis de marcadores
biolgicos, o la paleontologa qumica y ahora es tan poderosa que
amenaza con convertir la paleontologa clsica en obsoleta. Eso
proporciona nada menos que una nueva perspectiva sobre la historia de la
vida en la Tierra. Nosotros ahora sabemos exactamente cuando los
primeros organismos multicelulares evolucionaron, y han hecho ideas
sorprendentes en las extinciones en masa que venan afectando a ellos. La
investigacin de marcadores biolgicos tiene sus races en la exploracin
de petrleo. Mientras que los paleontlogos dedicados en s mismos para
descubrir y describir organismos extintos, los gelogos rompan las rocas
sedimentarias en la bsqueda de molculas orgnicas que revelara dnde
buscar petrleo. En todo el mundo, se encontraron restos de lquido de oro
en el interior sedimentario de rocas ricas en materia orgnica. Con el tiempo
aprendieron a extraer estos lquidos, incluso a partir de rocas sedimentarias
con muy poco contenido orgnico, incluyendo algunas de las ms antiguas
de la Tierra, a los 3 mil millones de aos de edad o Ms. La mayora de
estos lquidos fueron compuestos de hidrocarburos que ya estn
familiarizados con el petrleo, tales como etano. Pero tambin hubo
algunos extraos, incluso de cadena larga alcanos y molculas policclicos
llamados hopanos. De dnde vienen ellos? La respuesta vino de los
bioqumicos que estudian los organismos vivos. Ellos descubrieron que si te
sujetas ciertas molculas biolgicas - principalmente lpidos que se
encuentran en las membranas celulares y - otras estructuras a la
calefaccin, la refrigeracin y la presin de la clase que se enfrentaran
despus del entierro en la roca sedimentaria, se descomponen en
compuestos muy estables y orgnicos.
Tan estable, de hecho, que algunos pueden permanecer sin cambios
durante miles de millones de aos. Igualmente importante es que, a
diferencia de muchas otras molculas orgnicas, que no sean hechos por
cualquier conocido procesos inorgnicos. Lo que es ms, algunos de los
compuestos resultan ser nicos para ciertos grupos de organismos, y
muchas clases de molculas han sido ahora definitivamente vinculado a
especfica grupos de microbios, plantas y animales. Estos son conocidos
como marcadores biolgicos. Por ejemplo, los cidos grasos polienoicos
C28 a C32 se encontraron recientemente a ser un marcador biolgico nico
para esponjas.

El descubrimiento de estos "fsiles moleculares" significa que los antiguos

organismos que de otro modo dejado rastro en el registro fsil ahora se
pueden identificar. El escenario estaba listo para marcadores biolgicos
para hacer frente a su primer gran misterio - el origen de la vida compleja.
Los organismos de nuestro mundo se dividen en dos tipos muy diferentes:
la sencilla procariotas, incluyendo bacterias y arqueas, y los eucariotas ms
complejos. El principal diferencia entre los dos es que los eucariotas tienen
un ncleo y otros orgnulos dentro de la clula. Las clulas eucariotas son
tambin ms grandes y se prestan a multicelular integrada vida. Pero
cundo evolucionaron? El registro fsil no es de ayuda aqu. Organismos
unicelulares fosilizadas, presumiblemente procariotas, apareci por primera
vez hace unos 3,5 millones de aos. Sin embargo, no es posible saber a
partir de fsiles solo cuando aparecieron las clulas eucariotas. El primer
eucariota habra sido un organismo unicelular y, a diferencia de algunos
eucariotas unicelulares como las microscpicas plantas que fosilizan en
gran nmero para formar tiza, no habran tenido un microscpico esqueleto.

Introduzca la
tripulacin de marcadores biolgicos. A finales de 1990, Roger Citacin del
australiano Organizacin Geological Survey en Canberra y Roger Buick de
la Universidad de Sydney fue en busca de marcadores biolgicos llamados
esteranos - signos reveladores de eucariota - organismos en rocas

sedimentarias antiguas de Australia. Trazaron el marcador biolgico de

nuevo a rocas 2,7 mil millones de aos, pero no ms. As que parece que
los eucariotas aparecieron por primera vez alrededor de ese tiempo
(Science, vol 285, p 1033).
Citacin y Buick tambin descubrieron un cambio discernible en los
marcadores biolgicos en el tiempo. Los primeros esteranos eucariotas son
ni abundantes ni diversos. En lugar de ello, son las rocas dominadas por los
marcadores biolgicos llamado Lisoprenoides, que son signos de bacterias
y arqueas. Por hace 800 millones de aos, sin embargo, el perfil de
marcadores biolgicos haba cambiado. Se convirti dominado por
hopanos, que revelan la presencia de cianobacterias (una vez por error
conocidas como algas azul-verdes). Las cianobacterias son componentes
clave de los estromatolitos; la capa de las tortas de bacterias y sedimentos
que eran la forma ms compleja de la vida en la Tierra antes de la evolucin
de pluricelularidad. Los esteranos eucariotas tambin se vuelven ms
diverso y abundante en toda esta vez, y otros marcadores biolgicos
eucariotas para las algas rojas y verdes, as como grande, protozoos
unicelulares como las amebas como se encuentran ahora. Todo esto pone
de manifiesto que las grandes, algas similares a las plantas tales como
algas y el mar lechuga haba evolucionado pero que los precursores de
animales estaban todava en la etapa unicelular. Tras la explosin cmbrica
hace alrededor de 542 millones de aos, cuando la mayora de los animales
grupos aparecieron, el perfil cambiaron de nuevo, y por primera vez nos
encontramos con los ricos y registro complejo de marcadores biolgicos
asociados con los animales. El animal recin evolucionado literalmente, se
comi los estromatolitos de la existencia. "Los animales de reciente
evolucin, literalmente comieron los estromatolitos de la existencia" Los
marcadores biolgicos tambin estn ayudando con otra espina de larga
data en los lados de los paleontlogos - las extinciones en masa. El estudio
moderno de las extinciones en masa comenz en 1980 con la El anuncio
sensacional por Luis Alvarez y su hijo Walter, ambos de la Universidad de
California, Berkeley, que la extincin que mat a los dinosaurios fue
causada por una asteroide impacto - un evento ahora conocido como la
extincin K / T. Esta afirmacin extraordinaria exigida pruebas
extraordinarias, pero el registro fsil era equvoco. Si el impacto que
realmente ocurri, sin duda habra sido acompaado por una repentina y
simultnea

Extincin. Sin embargo, el registro fsil cont una historia de una extincin
gradual, en lugar de una catastrfica sbita. En 1982, Phil seor y Jere
Lipps, de la Universidad de California, Davis, demostraron que el registro
fsil siempre parece ser progresiva, incluso despus de una extincin
repentina debido a las dificultades de muestreo de especies raras. Aun as,
la mayora de los paleontlogos atrapados a la idea de una extincin
gradual y no fue hasta 1990, cuando el crter de Chicxulub fue encontrado
en Yucatn, Mxico, que la hiptesis del impacto fue ampliamente
aceptada.
Los paleontlogos ms tarde hicieron un trabajo minucioso que muestra
que los amonitas y otras especies marinas invertebrados se extinguieron
exactamente al mismo tiempo que los dinosaurios. A pesar de esto, la
registro fsil se qued con una reputacin de ser demasiado poco fiables
para resolver muchos importantes enigmas geolgicos y biolgicos. Tras el
debate K / T, el estudio de las extinciones en masa se puso de moda, y
paleontlogos se desplegaron para trabajar en los otros miembros de los
"cinco grandes" el Ordovcico, Devnico, las extinciones en masa Prmico
y Trisico. El nuevo primer orden paradigma era que las extinciones
masivas fueron causadas por los impactos, pero, una vez ms, la
investigacin en los tiempos y la naturaleza de la extincin de especies fue
equvoca. Se necesitan nuevas herramientas y marcadores biolgicos
intensificaron.
En 2005, un equipo dirigido por Tetsuya Arinobu de Aichi Escuela de
Medicina de la Universidad de Medicina en Japn tom una nueva mirada a
uno de los ms famosos sitios de K / T, la tiza blanca gruesa de Caravaca
en Espaa, que se estableci en el mar. Cuando las rocas del equipo a
travs de la muestra el lmite K / T, se hizo un descubrimiento que fue
consistente con una sbita extincin: una capa delgada, depositada poco
despus del lmite K / T, rica en marcadores biolgicos de diagnstico de la
tierra plantas, incluyendo arbustos y rboles. Esto demostr que se haba
producido una corta vida diluvio de material vegetal muerto en el mar, en
consonancia con la repentina destruccin de bosques enteros
(Palaeogeography, Paleoclimatologa, Paleoecologa, vol 224, p 108).
Pruebas de marcadores biolgicos similar se ha encontrado en otros sitios
K / T en Japn y en otra parte. Por ejemplo, un estudio en Hokkaido
encontr una disminucin repentina en la abundancia de las plantas
terrestres empieza justo despus del evento K / T y una duracin de 7000
aos.

Estos estudios fueron slo el acto de apertura para el uso de marcadores

biolgicos en el estudio de los medios de extinciones. Despus de todo, la
hiptesis de asteroides K / T ya es apoyado por muchas lneas de
evidencia. Sin embargo, lo de las otras extinciones?
Pronto, los investigadores estaban extrayendo los lquidos orgnicos a partir
de rocas de finales del Prmico, el tiempo de la extincin masiva ms
grande de todos y el tema de gran debate en cuanto a su causa. Me gusta
el evento K / T, esta extincin en masa a veces se ha atribuido a un
impacto. Pero resultados de marcadores biolgicos sugieren lo contrario. En
2005 Citacin, ahora en el Instituto de Tecnologa de Massachusetts,
asociado con geoqumico Kliti Grice, de la Universidad Tecnolgica de
Curtin en Perth, Australia Occidental.

Trabajar con ncleos de roca sedimentaria de China y Australia occidental,

identificado un marcador biolgico orgnico interesante conocido como
isorenieratene. Hoy en da, los precursores de esta molcula se encuentran

slo en las paredes celulares de dos muy especfica grupos de microbios bacterias verdes del azufre y prpura. Estos microbios peculiares hacen
una viviendo por la fotosntesis, pero no pueden tolerar el oxgeno y no
extraer electrones de agua como la mayora de los organismos
fotosintticos hacen. En su lugar utilizan sulfuro de hidrgeno, el de gas a
"huevo podrido", que es altamente txico para las plantas y los animales.
Citacin y Grice se dieron cuenta de que la presencia de estos microbios
indica un ocano ambiente que fue suficiente para que la luz penetre y la
fotosntesis poco profunda, sin embargo, fue completamente carente de
oxgeno. En su lugar, se satur con sulfuro de hidrgeno. Pareca que los
mares del Prmico tardo estaban inundados de veneno mortal.

Desde entonces, el equipo ha encontrado el marcador biolgico bacterias

del azufre en una docena de sitios de finales del Prmico en todo el mundo,
buena evidencia de que los ocanos sulfuro de hidrgeno eran un mundial

fenmeno. En 2005 Citacin, Grice y otros combinaron sus pruebas de

marcadores biolgicos en un influyente que elimin los asteroides como
sospechoso para la extincin del Prmico y sealado con el dedo a una
intoxicacin masiva (Science, vol 307, p 706). Desde marcadores biolgicos
han convertido en la principal evidencia de apoyo para una nueva hiptesis
para la extincin - la muerte por sulfuro de hidrgeno. Esto fue propuesto
por un equipo dirigido por el geoqumico
Lee Kump de la Universidad Estatal de Pensilvania en University Park.
Kump sugiri que por lo tanto el sulfuro de hidrgeno se produce en un
ocano desprovisto de oxgeno que se escap en la atmsfera y
envenenadas plantas y animales, as como agotamiento de la capa de
ozono que protege a la Tierra de la radiacin UV nociva del sol. El
estancamiento de los mares El sulfuro de hidrgeno se produce por
bacterias que vivan en el estancamiento, desoxigenada agua. Estas
bacterias no dejan rastro en el registro sedimentario - No se conocen
marcadores biolgicos que ellos revelan - pero su presencia puede inferirse
de la abundancia de bacterias prpuras y verdes de azufre, que necesitan
el sulfuro de hidrgeno para sobrevivir. Entonces, cmo el ocano
estancada ocurrido? El culpable principal era intensa mundial el
calentamiento provocado por las emisiones masivas de gases de efecto
invernadero a partir de uno de los ms grandes y la mayora de las
erupciones volcnicas sostenidos jams conocidos, el basalto de
inundacin trampas siberianas. Como en mundo de hoy de efecto
invernadero, las latitudes ms altas calientan ms rpido, lo que reduce la
diferencia de temperatura entre las regiones polares y los trpicos. Este
diferencial es el controlador de las corrientes ocenicas y el aire que
mantienen los ocanos oxigenados. En el invernadero de la tarde Prmico,
las temperaturas en las latitudes altas eran apenas diferentes de los de la
ecuador, las corrientes de tierra a un alto y el ocano se estanc, en ltima
instancia, causando una enorme y letal acumulacin de sulfuro de
hidrgeno producido por las bacterias anaerobias. No slo es la extincin
del Prmico que ha sido atado a sulfuro de hidrgeno. Los isorenieratene
marcadores biolgicos ahora se ha identificado en rocas que datan del
Devnico y extinciones trisicas. Est empezando a parecer que la
extincin masiva K / T fue nico en despus de haber sido causada por un
impacto. Despus de haber contribuido a las extinciones en masa, a
continuacin, los microbios se aprovechan. Rocas del Trisico de Meishan,
China, contener evidencia de un evento de "toma de control microbiano" en
la forma de una molcula llamada 2-methylhopane, que es diagnstica del
fomento de estromatolito cianobacterias. En los sedimentos que marcan la

extincin del Prmico en todo el mundo, diversos fsiles de arrecifes de

coral dan paso a microbiolitos, estructuras de estromatolitos similares
acumulados de sedimentos depositados en biofilms hechas por masas de
bacterias. Un ejemplo an ms dramtico se encuentra en la cuenca
Canning occidental de Australia, donde de finales del Devnico arrecifes de
coral fsiles se han depositado los arrecifes formados enteramente de
origen microbiano depsitos. La extincin masiva del Devnico fue otro
caso de los microbios que arrebata los ecosistemas del mundo de distancia
de los animales durante un milln de aos o ms. pruebas de marcadores
biolgicos ha contribuido as a una nueva visin sorprendente de las
extinciones en masa, uno que sugiere que los seres humanos son
combatientes sin saberlo en una lucha sin fin para supremaca, librada entre
los terrcolas "nativos" - las bacterias y arqueas - y la Johnny-comeltimamente animales y plantas. Para los eones del Precmbrico, el planeta
era el dominio exclusivo de los microbios. El ascenso de las plantas y los
animales complejos que rindi obsoleta mundo - pero volver a aparecer
peridicamente en las secuelas de las extinciones en masa. Y las bacterias
no son slo los beneficiarios inocentes de este tipo de eventos, que
contribuyen activamente a llevarlas a cabo. Hace algunos aos, el drama
del evento K / T apoy una suposicin generalizada de que extinciones
masivas fueron causadas por impactos de asteroides. Ahora parece que el
pndulo tiene se apart de nuevo. Slo la extincin masiva K / T fue
causado por un impacto; el resto eran el resultado de la adquisicin hostil
microbiana. Al final del Prmico, los microbios casi prevalecido.

Bibliografa

- https://blog.richmond.edu/paleontology/files/2008/03/bi
omarkers.pdf

- Sedimentary Hydrocarbons, Biomarkers for

Early Life

Biomarker and Paleontological Investigations of

the Late Devonian Extinctions, Woodford Shale,
Southern Oklahoma