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Energa
Es la capacidad de realizar un trabajo. A pesar que existen varias formas de
energa: qumica, luminosa, mecnica, etc., solo hay dos tipos bsicos:
Potencial: es la capacidad de realizar trabajo como resultado de su
estado o posicin. Puede estar en los enlaces qumicos, en un gradiente
de concentracin, en un potencial elctrico, etc.
Cintica: es la energa del movimiento, puede existir en forma de calor,
luz, etc.
En trminos bioqumicos, representa la capacidad de cambio, ya que la vida
depende de de que la energa pueda ser transformada de una forma a otra, cuyo
estudio es la base de la termodinmica. Sus leyes son aplicables a los sistemas
cerrados o aislados, es decir aquellos que no intercambian energa con el medio
que los rodea; las clulas son sistemas abiertos, o sea pequeas partes de un
sistema cerrado mayor. Las leyes de la termodinmica expresan:
1 Ley: en un sistema aislado la energa no se crea ni se destruye, puede
ser transformada de una forma en otra.
2 Ley: no toda la energa puede ser usada y el desorden tiende a
aumentar, lo que se conoce como entropa.
Metabolismo
Cada clula desarrolla miles de reacciones qumicas que pueden ser
exergnicas (con liberacin de energa) o endergnicas (con consumo de
energa), que en su conjunto constituyen el METABOLISMO CELULAR. Si las
reacciones qumicas dentro de una clula estn regidas por las mismas
leyes termodinmicas... entonces cmo se desarrollan las vas metablicas?
1. Las clulas asocian las reacciones: las reacciones endergnicas se llevan a
cabo con la energa liberada por las reacciones exergnicas.
2. Las clulas sintetizan molculas portadoras de energa que son capaces de
capturar la energa de las reacciones exergnicas y las llevan a las reacciones
endergnicas.
3. Las clulas regulan las reacciones qumicas por medio de catalizadores
biolgicos: ENZIMAS.
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usan para capturar, transferir y almacenar energa libre necesaria para realizar
el trabajo qumico. Funciona como una MONEDA ENERGTICA.
La funcin del ATP es suministrar energa hidrolizndose a ADP y Pi. Esta
energa puede usarse para:
obtener energa qumica: por ejemplo para la sntesis de macromolculas;
transporte a travs de las membranas
trabajo mecnico: por ejemplo la contraccin muscular, movimiento de
cilios y flagelos, movimiento de los cromosomas, etc.
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REDOX
Cuando los grupos fosfatos se transfieren al ADP para formar ATP, se est
almacenando energa. Otra forma es transferir electrones (e-), las reacciones se
denominan de oxidorreduccin o reacciones redox.
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Cofactores Redox
Durante las principales reacciones redox del catabolismo de la glucosa
intervienen dos molculas intermediarias: NAD y FAD. Se denominan
cofactores Redox: alternativamente se reducen y luego se oxidan.
NAD: nicotinamida adenina dinucletido. NAD+ en su forma oxidada y
NADH + H cuando est reducido.
La concentracin de NAD+ en la clula es pequea; por lo tanto debe
reciclarse continuamente de la forma oxidada a la reducida y viceversa.
NAD+ (oxi) + 2H+ + 2e- ----> NADH (red) + H+
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La mayor parte de los usos de la energa en las clulas vivas comprenden pares
de reacciones asociadas con enlaces ATP. En la primera reaccin la energa
liberada por medio de una reaccin exergnica produce la sntesis de ATP, en la
segunda, la hidrlisis del ATP produce una reaccin endergnica que requiere
energa. Cada reaccin acoplada es catalizada por una enzima especfica que
coloca a las molculas a los canales de energa de ATP de manera adecuada.
El ATP es usado como donante de energa en muchas reacciones anablicas (de
sntesis) acoplndose a las mismas en manera tal que el
reaccin se produzca espontneamente.
G sea negativo y la
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Enzimas
La actividad vital no es ms que el desarrollo de una serie de reacciones
qumicas entre un conjunto de molculas. Si un qumico en un laboratorio
realiza estas reacciones lo normal es que el rendimiento (cuantificado como la
cantidad de producto deseado frente a la cantidad total del producto) sea muy
bajo, mientras que esta misma reaccin en un sistema biolgico tiene un
rendimiento del 99% y se realiza a una mayor velocidad. Esto se debe a la
existencia de catalizadores, la mayora de los catalizadores biolgicos que se
conocen son ENZIMAS.
Las enzimas son protenas altamente especializadas que tienen como funcin
la catlisis o regulacin de la velocidad de las reacciones qumicas que se
llevan a cabo en los seres vivos.
Casi todas las reacciones qumicas de las clulas son catalizadas por enzimas,
con la particularidad de que cada enzima solo cataliza una reaccin, por lo que
existiran tantas enzimas como reacciones, y no se consumen en el proceso. Los
catalizadores no biolgicos son inespecficos.
En una reaccin catalizada por enzima (E), los reactivos se denomina sustratos
(S) , es decir la sustancia sobre la que acta la enzima. El sustrato es modificado
qumicamente y se convierte en uno o ms productos (P). Como esta reaccin es
reversible se expresa de la siguiente manera:
La enzima libre se encuentra en la misma forma qumica al comienzo y al final
de la reaccin.
Especificidad
Las molculas del sustrato se unen a un sitio particular en la superficie de la
enzima, denominado sitio activo, donde tiene lugar la catlisis. La estructura
tridimensional de este sitio activo, donde solo puede entrar un determinado
sustrato (ni siquiera sus ismeros) es lo que determina la especificidad de las
enzimas. El acoplamiento es tal que E. Fisher (1894) enunci: "el sustrato se
adapta al centro activo o cataltico de una enzima como una llave a una
cerradura".
Clases de Enzimas
El nombre de las enzimas es el del sustrato + el sufijo: -asa. Los nombres de las
enzimas revelan la especificidad de su funcin:
Oxido-reductasas: catalizan reacciones de oxido-reduccin, las que
implican la ganancia (o reduccin) o prdida de electrones (u oxidacin).
Las ms importantes son las deshidrogenasas y las oxidasas
Transferasas: transfieren grupos funcionales de una molcula a otra. Ej.:
quinasas; transfieren fosfatos del ATP a otra molcula.
Hipertextos del rea de la biologa-2012 www.biologia.edu.ar
Dr. Jorge Raisman y Dra. Ana M. Gonzalez
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Imagen original de la Universidad de Virginia
En el diagrama estn representados los niveles de energa, durante el curso de
la reaccin, de molculas intervinientes en una reaccin tipo: A + B ---> C. La
curva azul muestra el curso de la reaccin en ausencia de una enzima que
facilite la reaccin, mientras que la curva roja la muestra en presencia de la
enzima especfica de la reaccin. La diferencia en el nivel de energa entre el
estado inicial y la necesaria para iniciar la reaccin (picos de las curvas) es la
energa de activacin. Tal como se observa la presencia de enzima baja la
energa de activacin.
El complejo Enzima- sustrato posee menor energa de activacin que las
especies en estado de transicin que la correspondiente reaccin no catalizada.
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Hierro Fe 2+ o Fe 3+
Oxidacin / reduccin
Cobre, Cu + o Cu 2+
Oxidacin / reduccin
Cinc, Zn2+
transporta -COO-
Coenzima A
transporta -CH2-CH3
NAD y FAD
transportan electrones
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Flavina
Une electrones
Retinal
Regulacin enzimtica
El metabolismo consiste en una serie de reacciones catalizadas por enzimas,
donde los productos de una reaccin se convierten en los reactivos de la
siguiente, lo que se conoce como VAS METABLICAS.
Las clulas deben poder regular estas vas metablicas y lo hacen a travs de
reguladores enzimticos. Los inhibidores naturales regulan el metabolismo
mientras que los artificiales son utilizados por la medicina, para destruir plagas,
etc.
Inhibicin reversible: pueden inhibidores competitivos, los que se unen a
la enzima ingresando en el sitio activo, impidiendo as su enlace con el sustrato.
Los inhibidores no competitivos se unen a la enzima en un lugar diferente al sitio
activo cambiando la forma de la protena y por lo tanto la forma del sitio activo.
Sus efectos son reversibles.
Inhibicin irreversible: hay inhibidores que se unen covalentemente al
sitio activo de una enzima, esta unin es permanente e inactiva a la enzima
destruyendo su capacidad de unirse al sustrato. Ej: el DIPF reacciona con el
aminocido serina del sitio activo de la enzima acetilcolinesterasa, inhibindola
irreversiblemente. Esta enzima participa en el mecanismo de propagacin de
los impulsos nerviosos. El DIPF es conocido como gas nervioso, algunos ej. son
la SARINA (usado en el ataque terrorista en un subte en Tokio en 1995)y el
MALATION (insecticida).
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GLUCLISIS
Del griego glycos: azcar y lysis: ruptura. Es el primer paso de la respiracin, es
una secuencia compleja de reacciones que se realizan en el citosol de la clula y
por el cual la molcula de glucosa se desdobla en dos molculas de c. pirvico.
Es el ciclo metablico ms difundido en la naturaleza, tambin se lo conoce
como ciclo de Embden-Meyerhof . Se lo encuentra en los cinco reinos. Muchos
organismos obtienen su energa nicamente por la utilizacin de este ciclo. El
mismo esta catalizado por 11 enzimas que se encuentran en el citoplasma de la
clula pero no en las mitocondrias.
Recuerde que es el inicio de un proceso que puede continuar con la respiracin
celular (si existe oxgeno) o con la fermentacin (en ausencia del oxgeno)
Antes de empezar vea la animacin de la gliclisis.
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Dado que una glucosa produce dos molculas de piruvato, la "cosecha" total,
en esta etapa, es de 4 ATP. Como se invirtieron 2 ATP en la primera etapa...
Balance neto:
glucosa + 2 ADP + 2 Pi + 2 NAD+---> 2 piruvatos + 2 ATP + 2 (NADH + H+)
La energa total que se puede obtener de la glucosa por oxidacin aerbica es
= 688 kcal/mol.
La energa total acumulada en 2 ATP = 2 x 7.3 = 14.6 kcal/mol
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RESPIRACIN CELULAR
Es el conjunto de reacciones en las cuales el c. pirvico producido por la
gluclisis es desdobla a CO2 y H2O y se producen 36 ATP. En las clulas
eucariotas la respiracin se realiza en la mitocondria. Se da en dos etapas:
OXIDACIN DEL PIRUVATO
CICLO DEL C. TRICARBOXLICO
El "problema" con la fermentacin es que, al usar molculas orgnicas como
aceptores terminales de electrones y tener que eliminar como residuo al
producto resultante (c. lctico / etanol), se pierde la energa potencial de esos
compuestos.
La solucin alternativa es usar alguna molcula no orgnica que pueda aceptar
electrones y convertirse as en una molcula reducida. El oxgeno es perfecto
para esto, porque luego de recibir los electrones se combina con dos protones
convirtindose as en el residuo lquido perfecto para el ambiente: H2O.
Nota: la respiracin depende de la disponibilidad de receptor externo de los
electrones. Tan pronto como el mismo desaparece, la respiracin cesa. A
diferencia, la fermentacin, donde el aceptor es interno (por ej. piruvato) y es un
producto del desdoblamiento de la glucosa, el aceptor estar disponible en
tanto exista alimento para oxidar.
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desarma por una constante re-entrada de los mismos, y teniendo en cuenta que
la ATP sintetasa complejo proteico (conocido tambin como "lollipops",
complejo F1, ATPasa mitocondrial) contiene el nico canal para la entrada del
protn, por lo tanto a medida que los protones pasan por el canal, se produce la
siguiente reaccin:
ADP + Pi ---> ATP.
Este proceso puede llamarse: fosforilacin quimiosmtica (asumiendo que la
hiptesis quimiosmtica sea la correcta), o fosforilacin oxidativa (sin asumir
respecto al mecanismo).
http://www.people.virginia.edu/~rjh9u/eltrans.html
Los Protones (indicados por +) entran nuevamente en la matriz mitocondrial a
travs de los canales que forma el complejo enzimtico de la ATP sintetasa.
Esta entrada se acopla a la sntesis de ATP a partir de ADP y Fosfato (Pi)
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2 ATP
2 NADH->
Rinde:
2 ATP
6 ATP
2 NADH->
6 ATP
+ 2 ATP
6 NADH->
2 FADH2 >
+ 2 ATP
18 ATP
4 ATP
3. Cadena respiratoria:
los 10 NADH+ 2 FADH2 de los pasos anteriores dan --->
1 NADH --> 3 ATP= 30 ATP
1 FADH2 --> 2 ATP=4 ATP
TOTAL
38 ATP
-2 ATP
total=
36 ATP
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Fermentacin
Esquema bsico: usar una molcula orgnica producida durante el proceso
metablico como aceptor.
El trmino fermentacin, en su acepcin estricta, se refiere a la obtencin de
energa en ausencia de oxgeno y generalmente lleva agregado el nombre del
producto final de la reaccin.
Pasteur la denomin "la vie sans l'air" o "la vida sin aire".
El piruvato (o molculas derivadas del piruvato) se encuentra disponible luego
del proceso de gliclisis.
Muchas clulas los usan como aceptor terminal, creando productos de desecho
que se excretan de la clula.
Nota: estos residuos se excretan en enormes cantidades dado que, en razn del
bajo rendimiento, son necesarias muchas molculas de glucosa para producir la
energa que necesita la clula. Estos residuos todava contienen energa
aprovechable.
Si bien este sistema no es tan eficiente como la respiracin, permite que el
catabolismo contine, y esto es mejor que nada.
Fermentacin Lctica
piruvato + NADH + H+-------> cido lctico + NAD+
Se produce en muchas bacterias (bacterias lcticas), tambin en algunos
protozoos y en el msculo esqueltico humano. Es responsable de la
produccin de productos lcteos acidificados ---> yoghurt, quesos, cuajada,
crema cida, etc. El cido lctico tiene excelentes propiedades conservantes de
los alimentos.
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Fermentacin alcohlica
Dos reacciones sucesivas:
1. piruvato --------> acetaldehido + CO2
2. acetaldehido + NADH +H+ -------> etanol + NAD+
Se lo encuentra en levaduras, otros hongos y algunas bacterias. La fermentacin
alcohlica es la base de las siguientes aplicaciones en la alimentacin humana:
pan, cerveza, vino y otras.
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La luz tiene una naturaleza dual: se comporta como onda y partcula. Entre las
propiedades de la onda luminosa se incluyen la refraccin de la onda cuando
pasa de un material a otro. El efecto fotoelctrico demuestra el comportamiento
de la luz como partcula. El zinc se carga positivamente cuando es expuesto a
luz ultravioleta en razn de que la energa de las partculas luminosas elimina
electrones del zinc. Estos electrones pueden crear una corriente elctrica. El
sodio, potasio y selenio tienen longitudes de onda crticas en el rango de la luz
visible. La longitud de onda crtica es la mayor longitud de onda (visible o no)
que puede causar un efecto fotoelctrico. Albert Einstein desarroll en 1905 la
teora de que la luz estaba compuesta de unas partculas denominadas fotones,
cuya energa era inversamente proporcional a la longitud de onda de la luz. La
Luz por lo tanto tiene propiedades explicables tanto por el modelo ondulatorio
como por el corpuscular.
El tilacoide
El tilacoide es la unidad estructural de la fotosntesis. Procariotas y eucariotas
poseen estos sacos/vesculas aplanados en cuyo interior se encuentran los
productos qumicos que intervienen en la fotosntesis. Solo los eucariotas
poseen cloroplastos (ver el siguiente esquema) con una membrana que los
rodea.
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pigmentos blancos reflejan prcticamente toda la energa que les llega. Los
pigmentos tienen un espectro de absorcin caracterstico de cada uno de ellos.
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Etapas de la fotosntesis
La fotosntesis es un proceso que se desarrolla en dos etapas:
Reacciones lumnicas: es un proceso dependiente de la luz (etapa clara),
requiere de energa de la luz para fabricar ATP y molculas portadoras
de energa NADPH reducido, a usarse en la segunda etapa.
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Dr. Jorge Raisman y Dra. Ana M. Gonzalez
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Etapa clara
En la etapa clara la luz que "golpea" a la clorofila excita a un electrn a un nivel
energtico superior. En una serie de reacciones la energa se convierte (a lo
largo de un proceso de transporte de electrones ) en ATP y NADPH. El agua se
descompone en el proceso liberando oxgeno como producto secundario de la
reaccin. El ATP y el NADPH se utilizan para fabricar los enlaces C-C en la
etapa oscura.
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Fotorrespiracin.
La rubisco tiene una desventaja: tiene tanta facilidad para combinarse con el
CO2 para activar la formacin de azcar como de combinarse con el Oxgeno y
dar glicolato---> y luego glicina, que termina ---> serina + CO2 en la
mitocondria. Este proceso llamado Fotorrespiracin usa ATP y NADPH pero
libera CO2 en lugar de fijarlo.
La va de 4 Carbonos
Algunas plantas han desarrollado un ciclo previo para evitar la
Fotorrespiracin, donde la fijacin del CO2 comienza en el fosfoenolpiruvato
(PEP), molcula de tres a 3-C, que se convierte en oxalactico de cuatro
carbonos. El oxlico es convertido en cido mlico (tambin de cuatro carbonos).
Todo esto ocurre en las clulas del parnquima clorofiliano del mesfilo y
luego el cido mlico pasa a las clulas de la vaina fascicular donde se desdobla
nuevamente en PEP y anhdrido carbnico, que entra en el ciclo de Calvin,
mientras que el PEP vuelve a las clulas del mesfilo. La glucosa formada
puede ser transportada rpidamente al resto de la planta.
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