DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Sammanfattning: Aminosyrametabolism

Redogr fr generell aminosyrametabolism och ammoniaks metabolism

1. Generell aminosyrametabolism
NH3 tas bort frn aminosyran och flyttas till en annan. Det sker ett hattbyte: En aminosyra
byter sin NH3 hatt mot en C=O hatt.
Aa- NH3

Aminotransferas

Ketosyra

NH3 + NADH + H+

-ketoglutarat

Glutamat dehydrogenas

NAD+

Glutamat

Aminosyror kan delas in i glukogena och ketogena beroende p vad de ger upphov till nr
kolskelettet bryts ner.
Glukogena = alla aminosyror frutom de ketogena. De som kan ge upphov till glukos.
Ger upphov till:
- Pyruvat
- Oxaloacetat
- Fumarat
TCA-cykel intermedirer
- -ketoglutarat
- Succinyl CoA
Ketogena = Leucin och Lysin.
Ger upphov till:
- Acetyl CoA
- Acetoacetyl CoA

Kan bilda ketonkroppar

Bde ketogena och glukogena = Fenylalanin, Tyrosin, Tryptofan och Isoleucin.

2. Ammoniaks metabolism
Ammoniumjonerna (NH4+) bildas som restprodukt nr aminosyror bryts ner bildar i vissa fall
kvvefreningar. Det som inte binds till en frening mste elimineras ur kroppen d
ammoniak r basiskt. Drfr ombildas det till urea i lever och NH4+ i njurar och kissas ut.
NH3 + N (frn aspartat) + CO2 (frn HCO3-)
NH3 + H+

Urea

NH4+ som elimineras via urinen

Vid normalt tillstnd elimineras kvvet till strsta delen i form av urea. Vid svlt elimineras
den strsta delen i form av NH4+.
Hyperammonemi (frhjda niver ammoniak i blodet) kan bero p ett flertal olika saker:

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

1. Stort intag av proteiner eller GI-bldning (blod innehller mycket protein). Detta kar
ammoniakmngden eftersom bakterier i tarmen bryter ner proteinerna med hjlp av
ureaser. Levern hinner inte omvandla allt till urea och fritt ammoniak ker runt i
blodet.
2. Vid njurfel kar mngden urea i tarmen (normalt ca 25 %). Bryts ner i tarmen av
ureaser.
3. Defekt ureasyntes i levern leder till att ammoniak inte kan tas omhand och ker fritt i
blodet.
4. Defekt lever + metabol acidos (pga. att man krks upp saltsyra).
Normalt: Glutamin blir till glutamat och ammoniak som i njuren regerar med vtejoner
och bildar ammoniumjoner.
Vid metabol acidos: brist p vtejoner vilket leder till att ammoniak inte kan ombildas till
ammoniumjoner. Detta leder till att ammoniak kar i blodet.
5. Portal hypertension leder till at blodammoniaknivn kar. Detta beror p att ammoniak
som bildats i tarmen inte kommer frbi levern om man har stopp i v.porta utan
ammoniaken ker direkt ut i systemkretsloppet. Stopp i v.porta leder ven till ett
vertryck i krlen som ofta leder till brck.
Varfr r ammoniak farligt?
1. Man stjl -ketoglutarat frn TCA-cykeln fr att binda ammoniaken till glutamat.
Detta leder till minskad energiproduktion.
2. pH kar vilket leder till att proteiner denatureras.
3. Normalt tas alla aminosyror utom de grenade upp i levern. 70 % av aminosyrorna i
blodet r grenade. Vid stopp i v.porta transporteras alla aminosyror runt i blodet. Detta
pverkar upptaget av aminosyror i CNS (tar normalt upp grenade aminosyror)

Redogr fr mekanismer vid transaminering, vilka -ketosyror som deltar i upptaget

av aminogrupper, vilka specifika reaktioner som katalyseras av ALAT respektive
ASAT, samt kunna beskriva pyridoxalfosfats roll.

-ketosyror:

Aminosyra
Oxaloacetat
Pyruvat
-ketoglutarat

-ketoglutarat
Pyruvat
Oxaloacetat
-ketosyra

Till TCA-cykeln eller glukoneogenes

Apartat
Alanin
Glutamat

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

I reaktionerna ovan r det NH3 som flyttas. Detta katalyseras av enzymet aminotransferas.
Transamineringar sker i muskel, lever, njure och tarmmucosa.
Nr Aspartat terbildas frn oxaloacetat bildas en frn NH3 + NADH + H+ frn NAD+ + H2O.
NH3 + H+ bildar tillsammans NH4 som kan g i njuren kan elimineras via urinen. Annars gr
ammoniaken in i ureacykeln.
Alanin

-ketoglutarat
ALAT

Pyruvat

Glutamat

ALAT = Alanin aminotransferas

ALAT finns frmst i levern. Frhjda niver av ALAT i blodet r en biomarkr fr att
nedbrytning av hepatocyterna har skett. Detta kan ske vid t.ex. hepatit eller intag av giftiga
svampar.
Oxaloacetat

Glutamat
ASAT

Aspartat

-ketoglutarat

ASAT = Aspartat aminotransferas

Hattbyte sker. Dvs. flyttas frn Alanin respektive Glutamat till -ketoglutarat respektive
oxaloacetat. Ketogruppen flyttas samtidigt t andra hllet.
ASAT finns frmst i hjrtmuskulatur och skelettmuskulatur (ven lever). Frhjda niver av
ASAT i blodet r en biomarkr fr att nedbrytning av celler i ngot av dessa organ har skett.
Detta kan ske vid t.ex. hjrtinfarkt, hrd fysisk trning (trningsvrk) eller infektion i muskler.
Pyridoxalfosfats roll:
Pyridoxalfosfat (PLP) r en prostetisk grupp som finns p alla aminotransferaser (coenzym).
PLP r ett vitamin B6 derivat som sitter p en lysinrest i enzymets aktiva site.
PLP flyttar NH3: Aminotransferaset flyttar NH3 till pyridoxalfosfatet som d blir
pyridoxalaminofosfat (PMP). Pyridoxalaminofosfat reagerar med -ketosyran fr att forma en
aminosyra dvs. den ger aminogruppen till -ketosyran, samtidigt som coenzymet tergr till
PLP.

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Redogr fr bildning av alanin och glutamin i muskulatur.

Glutamat dehydrogenas

-ketoglutarat

NH3
Pyruvat

Alanin aminotransferas

glutamat

Glutamin syntetas

NH3, ATP

glutamin

ADP + Pi

Alanin

Glutamin har tv aminogrupper och kan transporteras ut i blodet utan att pverka pH. Detta r
viktigt fr bortfrandet av ammoniak i ureacykeln.

Redogr fr glutamat dehydrogenasets roll vid oxidativ deaminering och var denna
sker.

Glutamat genomgr en snabb oxidativ deaminering, katalyserat av enzymet glutamat

dehydrogenas. Alla NH3 frn aminosyror mste lmnas av till ureacykeln fr att elimineras.
Oxidativ deaminering sker i mitokondrien i lever och njurarna och ger upphov till
intermedirer i citronsyracykeln och ammonium som gr till ureacykeln.

Vid den omvnda reaktionen kan NADPH anvndas istllet fr NADH.

Glutamat dehydrogenaset regleras allostert av:
+ GDP, ADP (energibrist)
ATP, GTP

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Beskriv glukos-alanin-cykeln.

Muskeln gr sig av med NH3 genom glukos-alanin-cykeln.

Glutamat

Glutamin syntetas

NH3, ATP

glutamin

ADP + Pi

Andra vvnader (ven muskel)

Ut i blodet

Glutamat

H2O

1
-ketoglutarat

Glutamin
NH3

Glutamat

NH3
Urea

Lever

Glutaminas

Pyruvat

Urea
Glukoneogenes

Glukos

2
Alanin

Ut i blodet
Muskel

Glukos
Glykolys
Alanin

Pyruvat
2

-ketoglutarat

Glutamat
1

Aminosyra

NH3

1 = Glutamat dehydrogenas
2 = Alanin aminotransferas

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Redogr fr ureacykeln

Ureacykelns funktion r att transportera bort ammoniak, NH3 frn blodet eftersom det r
basiskt och skulle hja blodets pH ifall det ansamlades i stor mngd.
Ureacykeln sker i levern. Urea (urinmne) elimineras urinen.
Urea

Karbamoyl fosfatas syntetas

Urea cykeln:

2ATP
Karbamoyl fosfatas syntetas

Arginas

2ADP+Pi +
3H+

Ornitin transkarbamoylas

Arginosuccinat lyas

Pi

Arginosuccinat syntas

ATP

AMP +Ppi

Karbamoylfosfat bildas inne i mitokondrien. Ornitin och Citrulin transporteras ver

mitokondrie membranet. Resten sker ute i cytosolen.
Det gr t tv vid bildandet av karbamoylfosfat. Den ena fosfatgruppen frsvinner dock p
vgen och kvar i karbamoylfosfatet finns bara 1 P.

Redogr fr ureacykelns huvudreglerade steg (substrat, produkt och enzym) samt

kunna beskriva hur karbamoyl fosfatas syntetas regleras.

NH3 + CO2 + 2ATP

Karbamoyl fosfat syntetas

Karbamoyl fosfat + Pi + 2 ADP + 3H+

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Substrat: NH3 + CO2 + 2ATP

Produkt: Karbamoyl fosfat
Enzym: Karbamoyl fosfat syntetas
Alloster reglering:
N-acetylglutamat aktiverar karbamoyl fosfat syntetas. Eftersom Arginin allostert
reglerar bildandet av N-acetylglutamat r ven det en aktivator fr Karbamoyl
fosfat syntetaset.
Nr man tit protein kar mngden arginin vilket kar mngden
N-acetylglutamat. Detta kar i sin tur mngden karbamoyl fosfat som leder till
mer urea.
Acetat

Glutamat

Acetyl CoA
N-acylglutamat syntas

N-acylglutamat

CoA

+ Arginin

Beskriv bildningen och nedbrytning av hgenergifreningen kreatinfosfat. Vad har

freningen fr funktion?

Kreatinfosfat r en hgenergimolekyl som finns i musklerna och hjrnan, samt andra organ
som har behov av snabb energi.
Kreatinfosfat kan bidra till snabb syntes av ATP vid muskelarbete. Frrdet i musklerna rcker
i ca 10 sekunder vid hrt arbete (enligt boken Exercise Physiology) drefter mste ATP syntes
ske ifrn kolhydrater eller fett.
Nedbrytning:
Kreatinfosfat + ADP

Kreatin + ATP

Syntes:
Amidinotransferas

Arginin + Glycin

Guanidinoacetat

Metyl transferas

Kreatin

Ornitin
SAM

SAH

Ovanstende reaktionssteg sker i levern.

Kreatin

Kreatin kinas

ATP

Kreatinfosfat

ADP + H+

Ovanstende reaktion sker i muskeln i cytosolen.

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Kreatin och kreatinfosfat ringsluts spontant och irreversibelt till kreatinin. Kreatinin kissas ut.
Vid vvnadsskada lcker kreatin kinas ut ur cellen och kan mtas genom blodprov. Detta r ett
stt att diagnostisera hjrtinfarkt.

Redogr fr omvandling av fenylalanin till adrenalin (med strukturformler) samt

kunna beskriva vilken enzymdefekt som leder till fenylketonuri samt knna till andra
sjukdomar associerade med denna metabola vg.

1. Fenylalanin omvandlas till Tyrosin av enzymet Fenylalanin hydroxylas (O2 in, H2O
ut).
2. Tyrosin omvandlas till dihydroxyfenylalanin (L-DOPA) av enzymet Tyrosin
hydroxylas (O2 in, H2O ut). Under reaktionen omvandlas tetrahydrobiopterin till
dihydrobiopterin.
3. L-DOPA omvandlas till dopamin av enzymet dopa dekarboxylas (CO2 spjlkas bort).
4. Dopamin omvandlas till noradrenalin av enzymet Dopamin hydroxylas (O2 in, H2O
ut). Under reaktionen omvandlas askorbinsyra till dehydroxyaskorbinsyra.
5. Noradrenalin omvandlas till adrenalin av enzymet fenyletanolamin N-metyl transferas.
Under reaktionen donerar SAM en metylgrupp och omvandlas till SAH.
Fenylalanin hydroxylas brist eller mutation p det enzymet leder till fenylalaninketonuri
(PKU). Detta leder till en ansamling av fenylalanin som transamineras till fenylpyruvat.
Detta kan i sin tur omvandlas till fenylacetat eller fenyllaktat (fenylketoner).
Symtom:
- mental retardation
- kramp
- hyperaktivitet, aggressivitetsutbrott
8

DFM1:6 Aminosyrametabolism
-

Annelie Pettersson

ofrmga att g och prata.

Hypopigmentering (ljust hr och ljus hy)
Myskluktande urin
muskelsvaghet

Hyperfenylalaninemi kan ocks bero p defekter p det hr enzymet.

Bildning och nedbrytning av serotonin

Serotonin = 5 hydroxytryptamin = 5HT

Tryptofan

Hydroxylas

5 hydroxytryptofan

Dekarboxylas

Serotonin

CO2
O2

H2O

Tetrahydrobiopterin

Dihydrobiopterin

Den strsta mngden serotonin hittas i tarmmucosan. Finns ven i CNS dr det fungerar som
signalsubstans vid t.ex. smrthmning via de smrthmmande banorna frn PAG och NRM.
Serotonin terupptagshmmare ges till patienter med depression eftersom de har brist p
serotonin.
Nedbrytning:
MAO och aldehyd dehydrogenas

Serotonin

5 HIAA

MAO = Monoamidoxidas

Beskriva bildning av NO och histamin, samt dess funktioner.

NO:
NO syntas

L-arginin

L-citrulin

O2,
NADPH +H+

NO,
NADP+

Funktioner:
Relaxerar glatt muskulatur
Vasodilatation mm
Frebygger blodkoagulering genom att hindra blodplttar frn att kleta
ihop.
kar makrofagernas aktivitet
Histamin:
Histidin

Dekarboxylas

Histamin
CO2

DFM1:6 Aminosyrametabolism
Funktioner:

Annelie Pettersson

Kemisk signalsubstans som r viktig vid bl.a. inflammatoriska processer och

allergiska reaktioner (slpps ut frn mastceller och fr slemhinnor att svullna).
Magsyra sekretion pverkas.
Neurotransmittor i CNS
Kraftig vasodilator

Redogr fr omsttning av glutamin och dess betydelse fr syra-bas balansen

Glutamat
NH3, ATP

glutamin
ADP + Pi

Glutamat r surt och om det skulle slppas fritt i blodet skulle metabol acidos uppst.
NH3 r basiskt vilket leder till metabol alkidos d ammoniak kan binda protoner och ta med
dem ut i urinen.

Redogr fr upptag och fristtning av aminosyror i muskulaturen och hur dessa

processer regleras hormonellt.

Upptag av aminosyror sker genom aktiv transport med ATP (7 olika system i olika vvnader)
Muskelproteiner bryts ner av proteaser till aminosyror. Detta regleras hormonellt av insulin
och kortisol.
Kortisol

Insulin
+
Proteaser

Muskelproteiner

aminosyror

Proteosomer bryter ner proteiner som r mrkta med ubiquitin till grenade aminosyror (valin,
leucin och isoleucin)

Vad menas med katekolaminer och hur inaktiveras dessa?

Katekolaminer r biologiskt aktiva aminer (adrenalin, noradrenalin och dopamin).

Dopamin och noradrenalin r neurotransmittorer i autonoma nervsystemet.
Adrenalin och noradrenalin syntetiseras i binjuremrgen (medulla pararenales). Utanfr
nervsystemet pverkar dessa kolhydrat- och lipidmetabolismen.
Inaktivering sker genom oxidativ deaminering katalyserat av monoamidoxidas (MAO) och
genom O-metylering (metylgrupp stts p syret) av enzymet katekol-O-metyltransferas
(COMT). Dessa tv reaktioner kan ske i valfri ordning.

10

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson
Enkolpoolen

Beskriv versiktligt omvandlingen av enkolfragment. Vilka aminosyror kan avge

enkolfragment?

Omvandling av enkolsfragment innebr att enkolfragment, bundna till speciella brare (THF
och SAM) kan slppas som metylgrupper till specifika strukturer som modifieras eller
syntetiseras.
THF (tetrahydrofolat) r den aktiva formen av folsyra.
Aminosyror som kan avge enkolfragment:
- Histidin
- Glycin
- Serin (frmsta enkolfragmentdonatorn)

Redogr fr bildning, nedbrytning och funktion av S-adenosylmetionin (SAM).

Bildning:
Metionin

SAM syntetas

ATP

SAM

PPi + Pi
2Pi

Nedbrytning:
Metyltransferas

SAM

SAH

Metylacceptor

Metylerad
produkt

L-homocystein
H2O

Adenosin

SAH = S-adenosylhomocystein
Funktion:
SAM r huvudsakliga enkolsdonatorn som lmnar ifrn sig metylgrupper till metylacceptorer.
SAM finns med i fljande reaktionssekvenser:
1. Kreatinsyntes
2. Adrenalinsyntes
3. Purinsyntes (GMP och AMP)
4. 7-metyl guanosin (cap p 5nden p RNA)
5. DNA-metylering (epigenetisk reglering)

Redogra fr metabolism av homocystein till metionin

Metionin syntas
5

L-homocystein + N -Metyltetrahydrofolat

L-metionin + Tetrahydrofolat
11

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Cofaktor till enzymet metionin syntas r ett vitamin B12-derivat (metyl-kobalamin)

Redogr fr enkolpoolens betydelse vid bildning av nukleotider och metionin

Puriner = Guanin och Adenin

Pyrimider = Tymin, Cytosin och Uracil
Puriner kan inte bildas utan enkolpoolen, detsamma gller metionin.
THF + Format

N10-Formyltetrahydrofolat
SAM

Puriner
SAH

homocystein metyltransferas

N-metyltetrahydrofolat

Metionin + THF

Beskriv innebrden av folatfllan

Brist p vitamin B12 leder till brist p kobalamin. Kobalamin r coenzym till enzymet
homocystein metyltransferas. Finns inte kobalamin s fungerar inte enzymet ordentligt och
det leder till att N-metyltetrahydrofolat ansamlas och att THF (aktiva formen av folsyra) och
metionin inte kan bildas (inte heller SAM).
Detta leder till att DNA inte kan bildas d brist p puriner (A och G) uppstr. Om man inte
kan kopiera sitt DNA s kan man inte heller delas. Detta drabbar frmst de celler som delas
ofta t.ex. erytrocyter. Brist p rda blodkroppar leder till megablastisk anemi.
Brist p intrinsic faktor leder till att B12 inte kan tas upp ur kosten. Detta pverkar kroppen p
samma stt, men d kallar man sjukdomen som uppstr fr pernicis anemi.
Folatfllan kan ven bero p mutationer p enzymet homocystein metyltransferas.
Folsyra r essentiellt och behvs fr att bygga upp THF. Brist p folsyra leder ocks till brist
p puriner, vilket i sin tur leder till anemi och defekt neuralrrsslutning. Fr att motverka att
felaktig neuralrrsslutning sker ges folsyra ofta till mammor tidigt i graviditeten.

12

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson
Hemmetabolism

Redogr fr bildning och nedbrytning av hem.

1. Bildning
Syntesen av hem sker i levern och av erytropoider i erytropoesen (benmrgen).
ALA syntas

Glycin + Succinyl CoA

ALA

CoA

CO2

ALA dehydratas

2 ALA

Porfobilinogen
2 H2O

4 Porfobilinogen

Hydroxymetylbilan syntas

Uroporfinogen III

Uroporfinogen
dekarboxylas

Hydroxymetylbilan

Uroporfinogen III
syntas

Uroporfinogen III

Ferrokelatas

Coproporfyrinogen III

Protoporfyrin IX
Fe2+

4 CO2

Hem

H+

Det frsta och de tre sista stegen sker i mitokondrien, medan de vriga ger rum i cytosolen.
Frsta enzymet (ALA syntas) inhiberas av hem och hemin.
Andra (ALA dehydratas) och sista enzymet (Ferrokelatas) inhiberas av bly.
2. Nedbrytning
Nedbrytning av Hem sker nr erytrocyterna dr efter att ha simmat runt i blodet i ca 120
dagar.
Nedbrytningen sker av det reticuloendoteliala systemet dr lever, mjlte och makrofager i
blodet ingr.
1. Erytrocyterna fagocyteras av en makrofag. I makrofagen bryts hem ner till bilirubin.
Hem

Hem oxygenas

O2,
NADPH + H+

Biliverdin

Fe2+, CO,
NADPH

Biliverdin reduktas

NADPH + H+

Bilirubin

NADPH

Drefter gr bilirubinet ut i blodet dr det binder till albumin. Bilirubin-albumin komplexet tar
sig sedan till levern.

13

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

2. I levern omvandlas bilirubinet till bilirubin diglukuronid.

Bilirubin glukuronyl transferas

Bilirubin

Bilirubin diglukuronid

2 UDPGlukuronsyra

2 UDP

Drefter gr bilirubin diglukuronoid ut till gallan och ger gallan dess frg.
Bilirubin diglukuronoid dekonjugeras av bakteriellt diglukuronidas i tunntarmen och
reduceras av bakterier till sterkobilin (ger faeces sin frg). 85 % elimineras p detta stt direkt.
15 % reabsorberas igen av lever och njure. I njuren oxideras bilirubin diglukuronoid till
urobilin som kissas ut.

Knna till lite om hemoglobinopatier

Finns flera olika hemoglobinopatier med olika orsaker:

-

Hemoglobin S sjukdom (Sickelcell anemi)

Hemoglobin C sjukdom (mindre allvarlig n S)
Hemoglobin SC sjukdom (kan vara livshotande vid barnafdsel och operation)

Dessa tre beror p en av tre mjliga mutationer. Det rcker med mutation p en enda
aminosyra fr att bli sjuk.
-

Metemoglobinemi (Fe2+ oxideras Fe3+till vilket leder till att O2 ej kan bindas)
Thalessemi (felsyntes av globulin p antingen - eller -subenheten)

Mutationen som leder till Thalessemi r den vanligaste mutationen i Sverige.

Vad r de principiella orsakerna till ikterus (gulsot)

Orsaken till ikterus r hyperbilirubinemi (ansamling av bilirubin).

Kan vara:
1. Prehepatisk
(Sickelcell anemi, Gilberts syndrom, Malaria)
Beror p kad produktion pga. accelererad hemolys eller minskat upptag i levern.
2. Hepatisk
(Hepatit ABC, alkoholskador, rftliga sjukdomar)
Beror p nedsatt leverfunktion eller konjugeringsproblem.

14

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

3. Posthepatisk
(Gallsten, Cancer i pankreas, graviditet)
Beror p stopp i gallflde.

Vad r porfyri?

Porfyrirer beror p defekt i ngot av de enzymatiska stegen i hembiosyntesen. Detta leder till
en ackumulering av porfyriner.
Det finns akuta, cutana, hepatiska och eryropoetiska porfyrier. Symtomen r frmst akuta
neurovicerala (smrta) samt fotosensitivitet och hudskador.
Ljus + O2 ger via porfyriner syreradikaler vilket ger fotosensitivitet och hudskador.
Nukleotidmetabolism

Principiell struktur hos naturligt frekommande nukleosider samt deras

nukleotidformer.

Puriner = adenin och guanin

Pyrimider = tymin, cytosin och uracil.

Addition av pentossocker till baserna leder till bildandet av en nukleosid. Om sockret r ribos
kallas den fr en ribonukleosid och om det r deoxyribos kallas den fr deoxyribosnukleosid.
Ribonukleosiderna kallas guanosin, adenosin, cytidin och uridin.

15

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Deoxyribonukleosiderna kallas deoxyguanosin, deoxyadenosin, deoxycytidin och

tymidin.
Om man tillfr en eller flera fosfatgrupper till en nukleosid s fr man en nukleotid (ATP).
Det frsta fosfatet r bundet med en esterbindning till 5-OH p pentoset. Detta leder till att de
kallas fr 5nukleotider.

Beskriv skillnaden mellan deoxy- och ribonukleotider, mellan puriner och pyrimidiner
samt redogra fr dess nomenklatur.

Deoxynukleotider har deoxyribos bundet till sig istllet fr ribos som ribonukleotiderna har.
Puriner bestr av tv kolringar, medan pyrimider bestr av en kolring.

Ribonukleotiderna kallas Guanylat (GMP), Adenylat (AMP), Cytiylat (CMP) och Uridylat
(UMP).
Deoxyribonukleotiderna kallas deoxyguanylat (dGMP), deoxyadenylat (dAMP),
deoxycytiylat (dCMP) och tymidylat (dTMP).

Redogr fr tre olika reaktioner dr PRPP ingr i nukleotidmetabolismen.

PRPP (5-fosforibosyl-1-pyrofosfat) r en aktiverad pentos som deltar i bildandet av puriner

och pyrimidiner.
PRPP syntetas

Ribos 5 fosfat
ATP

PRPP

AMP

Enzymet PRPP syntetas aktiveras allostert av Pi och inhiberas av purinribonukleotider.

16

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

1. PRPP r en ribos-5 fosfat donator vid omvandlingen av purinbaser till nukleotider via
terabsorbtion.
Hypoxantin-guanin fosforibosyltransferas

Hydroxantin

IMP
PRPP

PPi

Hypoxantin-guanin fosforibosyltransferas

Guanin

GMP
PRPP

Adenin

PPi

Adenin fosforibosyltransferas

PRPP

AMP

PPi

Dessa reaktioner r irreversibla d PPi hydrolyseras till 2 Pi av pyrofosfatas.

2. Deltar vid degradering av nukleotider till urinsyra (se sidan 20)
3. Deltar vid de novo pyrimidin syntes:
Glutamin + CO2

Karbamoylfosfat

2ATP
Karbamoyl aspartat

2ADP + Pi
Dihydroorotas

H+
Orotat

Aspartat
transkarbamoylas

Karbamoylfosfat syntetas II

Orotat fosforibosyl
transferas

Aspartat

Pi

Dihydroorotat
dehydrogenas

Dihydroorotat
H2O

Karbamoyl aspartat

NAD+

Oritidin 5 monofosfat (OMP)

Orotat
NADH + H+

OMP dekarboxylas

UMP

CO2
PRPP

PPi

Redogr fr de reaktioner som katalyseras av ribonukleotidreduktas, tymidylatsyntas

och dihydrofolatreduktas.

17

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

1. Ribonukleotidreduktas
Bestr av tv olika dimera subenheter, R1 och R2. Det reducerar nukleotid difosfater (ADP,
GDP, CDP och UDP) till deras dioxyform (dADP, dGDP, dCDP och dUDP).
Ribonukleosid difosfat

Deoxyribonukleosid difosfat
Ribonukleotidreduktas

Thioredoxin (2SH)
reducerad

Thioredoxin (S-S)
oxiderad
Thioredoxin reduktas

NADP+

NADPH +H+

Detta regleras p tv stt:

1. On/off-reglering:
+ ATP
dATP
2. Substratspecificitet reglering:
dTTP minskar affiniteten fr UTP och CTP. Detta leder till att dUTP och
dCTP bildas i lgre grad.
dGTP minskar affiniteten fr GTP och ATP. Detta leder till att frre dGTP och
dATP bildas.
2. Tymidylatsyntas
dUMP omvandlas till dTMP av tymidylatsyntas, vilket anvnder N5, N10 metylen
tetrahydrofolat som metyldonator.
Tymidylat syntas

dUMP

dTMP
N5, N10 metylen tetrahydrofolat

Dihydrofolat
NADP + H+
NADP+
Dihydrofolat reduktas

Tetrahydrofolat

18

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

3. Dihydrofolatreduktas
Omvandlar folsyra till THF (tetrahydrofolat) i en tvstegsreaktion som krver tv molekyler
av NADPH.
Dihydrofolatreduktas

Folsyra
2 NADPH
+ 2 H+

THF

2NADP+

Redogr fr bildning av urat frn puriner, tervinning av purinbaser via HGPRT och
fosforylering av nukleosider upp till trifosfat niv.

1. Nedbrytning av purinnukleotider till urinsyra (urat).

Ribonukleaser och deoxyribonukleaser seceneras frn pankreas och hydrolyserar RNA och
DNA till oligonukleotider. Dessa bryts sedan ner av pankreas fosfodiesteraser till 3- och
5mononukleotider. En familj av nukleosidaser tar sedan bort fosfatgrupperna.
Nukleotiderna kan sedan brytas ner till fria baser och sedan reabsorberade.
Dietra puriner och pyrimidiner konverteras till urinsyra av tarmmucosans celler. Det mesta
av urinsyran gr sedan ut i blodet och elimineras via urinen.
Urinsyra bildas enligt fljande (se nsta sida):

19

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

2. tervinning av purinbaser via HGPRT

Hypoxantin-guanin fosforibosyltransferas = HGPRT
Hypoxantin-guanin fosforibosyltransferas

Hydroxantin

IMP
PRPP

PPi

Hypoxantin-guanin fosforibosyltransferas

Guanin

GMP
PRPP

PPi

3. Fosforylering av nukleosider upp till trifosfat niv

20

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Difosfat nukleosider syntetiseras frn de motsvarande monofosfat nukleosiderna genom

basspecifika monofosfat nukleosid kinaser. ATP r oftast kllan till fosfatgruppen eftersom de
finns i strre mngs n de andra trifosfat nukleotiderna.
Difosfat nukleosider fosforyleras av difosfat nukleosid kinas till motsvarande trifosfat
nukleosid. Detta enzym har tillskillnad frn monofosfat nk en bred specificitet.

Redogr fr verkningsmekanismer fr allopurinol, hydroxyurea, 5-fluoruracil,

metotrexat, AZT samt acyklovir.

1. Allopurinol
Gikt r en sjukdom som beror p att urinsyra ansamlas som kristaller i leder vilket leder till
inflammation (portvinst).
Allopurinol r en giktmedicin som frebygger att sjukdomen uppkommer genom att hmma
syntesen av urinsyra.
Allopurinol omvandlas till alloxantin, som hmmar enzymet Xantin oxidas. Detta leder till en
ansamling av hypoxantin och xantin, vilket r mer lttlsligt n urinsyra och drfr inte leder
till samma inflammatoriska respons.
Hypoxantin

Xantin oxidas

Xantin

Xantin oxidas

Urinsyra

2. Hydroxyurea
Medicin mot cancer som frstr fria radikaler som behvs fr den enzymatiska aktiviteten hos
ribonukleotid reduktas. Detta hmmas allts, vilket leder till att ribonukleotider inte
omvandlas till deoxyribonukleotider. Detta leder till att cancercellerna inte kan dela p sig.
3. 5-fluoruracil
5-fluoruracil omvandlas till 5FdUDP som r en pyrimidinanalog med ett F p kol 5 som
irreversibelt hmmar tymidylatsyntas (komplexet elimineras ur kroppen), vilket leder till att
dTMP inte kan bildas frn dUTP. Detta leder till att cellerna inte kan dela sig och fungerar
drfr som cancermedicin.
4. Metotrexat
21

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Hmmar enzymet dihydrofolat reduktas som omvandlar dihydrofolat till tetrahydrofolat.

Detta leder till att N5, N10 metylen tetrahydrofolat inte kan bildas och det leder till att hela
purinsyntesen pverkas. Cancerceller kan drfr inte dela p sig.
5. AZT
r en medicin mot retroviruset HIV (RNA-virus som anvnder sig av reverse transcriptase).
AZT r en tymidin analog med ett N p 3kolet istllet fr OH. Nukleotider r laddade och
kan drfr inte in i cellen. Man ger drfr nukleosider som mste fosforyleras fr att
aktiveras:
Tyrosinkinas 1

AZT

Adenylat cyklas

AZTMP

AZTTP

Tyrosin kinaset r humant och drfr kan ven DNA polymeras pverkas. Detta drabbar
frmst snabbt delande celler.
AZTTP hmmar reverse transcriptase vilket leder till hmmad DNA syntes. Reverse
transcriptase har ingen proof reading och stter drfr dit den felaktiga basen, vilket leder till
att nsta bas inte kan sttas dit och DNA syntesen avstannar.
6. Acyklovir
Acyklovir r en medicin mot herpes. Det r en analog till guanosin. Mste likt AZT
fosforyleras till sin aktiva form. Detta sker av herpesvirusets eget tyrosinkinas vilket leder till
att frre biverkningar uppstr.

Knna till de olika molekylra kllorna till purin respektive pyrimidin

Puriners byggstenar kommer ifrn aspartat, koldioxid, glycin, glutamin och N10Formyltetrahydrofolat.
Pyrimidinringens substrat kommer ifrn glutamin, aspartat och koldioxid.

22

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Knna till vilka nukleotider som ingr i DNA respektive RNA samt kunna rita upp hur
DNA-kedjan byggs upp, inklusive strukturer i sockerkedjan.

Sockerringen kommer frn HMP-shunten. Trifosfonukleotider anvnds vid DNA och RNA
syntes.
1. DNA

DNA r en deoxyribonukleosid monofosfat kedja kovalent bundna med 35fosfodiesterbindningar. Dessa bindningar sammanbinder 3-hydroxylgruppen p
deoxypentosen p en nukleotid till 5-hydroxylgruppen p deoxypentosen p nsta nukleotid.
Detta bidrar till att DNA-kedjan blir polr med en 5-nde med en fri fosfatgrupp och en 3nde med en fri hydroxylgrupp. Pbyggnaden sker i en 53 riktning dvs. nya baser byggs
p vid 3-nden.
Baserna i DNA r adenin, tymin, cytosin och guanin. Dessa basparar A-T och C-G med
vtebindningar mellan i dubbelhelixen.
2. RNA
RNA r en ribonukleosid monofosfat kedja kovalent bundna med fosfodiesterbindningar likt
DNA.
Baserna i RNA r adenin, uracil, cytosin och guanin.

23

DFM1:6 Aminosyrametabolism

Annelie Pettersson

Knna till de reglerade stegen i purin och pyrimidin syntesen

Purinsyntes:
Det tv frsta enzymstegen r reglerade:
Ribos-5-fosfat reagerar med ATP och bildar PRPP och AMP med hjlp av enzymet PRPPsyntetas. Fritt fosfat aktiverar enzymet, medan AMP, GMP och IMP inhiberar.
Glutamin fosforibosylpyrofosfat amidotransferas inhiberas av GMP, AMP och IMP
(slutprodukt feedback inhibering). Aktiveras av PRPP.
Pyrimidinsyntes:
Det frsta enzymsteget r reglerat:
Karbamoylfosfat syntetas II inhiberas av UTP genom feedbackreglering. Aktiveras av ATP
och PRPP.

Principiella orsaker till gikt

Ansamling av urinsyra i leder vilket leder till inflammation.

Primr gikt beror p:
1. Delvis avsaknad p HGPRT (hypoxantin-guanin fosforibosyl tansferas)
2. kad aktivitet hos PRPP
Sekundr gikt beror p:
1. Njursjukdom som leder till att njuren inte kan eliminera urinsyra.
2. Hgt intag av nukleotider (ktt, fisk etc.)
3. Lesch-Nyhan syndrom

Vad r Lesch-Nyhan syndrom?

r en X-bunden recessiv sjukdom som beror p nstan fullstndig avsaknad av HGPRT.

Denna brist resulterar i ofrmga att bilda hypoxantin och guanin, vilket leder till att stora
mngder urinsyra produceras. Dessutom leder det till att PRPP kar och IMP och GMP
minskar. Detta leder till att glutamin: fosforibopyrofosfat amidotransferas har en stor mngd
substrat och ingen inhibering. Detta leder till att nysyntesen av puriner kar.
Kombinationen av detta leder till att puriner bryts ner och stora mngder urinsyra bildas.
Detta leder till att njurstenar bildas och att gikt uppstr. Sjukdomen ger ven motoriska
problem, kognitiv strning och sjlvskadande beteende (biter snder lppar och fingrar).

24