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Nomenclatura de las
enzimas
n
Nombres particulares
Nombres sistemtico
El nombre sistemtico de un enzima
consta actualmente de 3 partes:
n
n
n
n
el sustrato preferente
el tipo de reaccin realizado
terminacin "asa"
Oxidorreductasas.
n
AH2 + B
Ared + Box
A + BH2
Aox + Bred
Transferasas.
n
glucosa + ATP
A + C-B
ADP + glucosa-6-fosfato
Hidrolasas.
n
n
glucosa + galactosa
Liasas.
n
A+B
CO2 + acetona
Isomerasas.
n
La fosfoglucosa
isomerasa,
glucosa-6-fosfato
fructosa-6-fosfato
Ligasas.
n
A-B + XDP + Pi
oxaloacetato + ADP + Pi
Nomenclatura.
n
n
n
Las molculas que favorecen la forma R pero que actan sobre una
regin del enzima distinta del centro activo son los activadores
alostricos.
REGULACIN ALOSTRICA
REGULACIN A NIVEL DE SUSTRATO
A CONCENTRACIN DE S, ACTIVIDAD ENZIMTICA
P SE UNE A E COMO SI FUERA UN INH COMP
CONTROL POR RETROACCIN
A
E1
E2
E3
E4
C
K
E-S1
S2
E-S2
S1
E-S1-S2
E
S2
E + P1 + P2
UNIN ORDENADA
E
S1
E-S1
S2
E-S1-S2
E + P1 + P2
PING-PONG
E
S1
E-S1
E + P1
E*
S2
E*-S2
E + P2
INHIBICIN
Inhibidor no competitivo
Para que una reaccin qumica tenga lugar, las molculas de los reactantes
deben chocar con una energa y una orientacin adecuadas. La actuacin de
la enzima:
! permite que los reactantes (sustratos) se unan a su centro activo con una
orientacin ptima para que la reaccin se produzca
! modifica las propiedades qumicas del sustrato unido a su centro activo,
debilitando los enlaces existentes y facilitando la formacin de otros
nuevos.
CINTICA
! En una reaccin de orden cero, la velocidad de formacin del producto es
independiente de la concentracin de sustrato: v = k
! En una reaccin de primer orden la velocidad de formacin de los productos
es directamente proporcional a la concentracin del sustrato: v = k [A]
sacarosa + agua
glucosa + fructosa
CINTICA DE UN SUSTRATO
CINTICA ENZIMTICA
La cintica enzimtica estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por
enzimas. Estos estudios proporcionan informacin directa acerca del
mecanismo de la reaccin cataltica y de la especifidad del enzima.
La velocidad de una reaccin catalizada por una enzima puede medirse con
relativa facilidad, ya que en muchos casos no es necesario purificar o aislar el
enzima.
La medida se realiza siempre en las condiciones ptimas de pH, temperatura,
presencia de cofactores, etc, y se utilizan concentraciones saturantes de
sustrato.
En estas condiciones, la velocidad de reaccin observada es la velocidad
mxima (Vmax).
La velocidad puede determinarse midiendo la aparicin de los productos o la
desaparicin de los reactivos.
ACTIVIDAD ENZIMTICA
Se define la unidad de actividad enzimtica (U) como la cantidad de enzima
que cataliza la conversin de 1 mol de sustrato en un minuto.
La actividad especfica es el nmero de unidades de enzima por miligramo de
protena (U/mg prot) o por mililitro de disolucin (U/ml).
Recientemente, el Sistema Internacional de unidades (SI) ha definido la
unidad de actividad enzimtica como la cantidad de enzima que transforma 1
mol de sustrato por segundo. Esta unidad se llama katal (kat). Como 1 mol son
106 moles y 1 minuto son 60 segundos, resulta que 1 katal equivale a 60 x 106
U. Esta unidad es muy grande, de forma que se utilizan frecuentemente los
submltiplos como el microkatal (kat, 10-6 kat) o el nanokatal (nkat, 10-9 kat).
Cuando se conoce el peso molecular de la enzima puro y el nmero de centros
activos por molcula de enzima, las medidas de actividad enzimtica permiten
calcular el nmero de recambio del enzima, o sea, el nmero de reacciones
elementales que realiza la enzima por cada centro activo y por unidad de
tiempo.
IMPORTANCIA DE LA Km
1. KM es la concentracin de sustrato para la cual la velocidad de reaccin es
la mitad de la velocidad mxima. En efecto, si KM = [S], la ecuacin de
Michaelis-Menten se reduce a: v = Vmax/2.