Cabe recalcar que comenz a perfilarse la individualizacin de las tres
subcuencas marinas; Huarmey, Santa y Chavn, las cuales fueron
controladas por movimientos verticales traducidos en fallamientos paralelos a la cuenca andina y al cratn brasilero, estas fallas marcaron la acumulacin de secuencias slico-clsticas y carbonatadas hacia el este (Cuenca Chavn) y acumulaciones volcnicas y sedimentarias al oeste (Cuenca Huarmey). Las variaciones de los niveles marinos en la cuenca acumularan en ambientes deltaicos-playeros y plataforma secuencia gruesas de areniscas (Fm. Chim) seguidas de niveles de calizas grises, verdes y rojas (Fm. Carhuaz) que evidencian una profundizacin de la cuenca. Posteriormente en un ambiente de plataforma se acumularon las secuencias carbonatadas correspondientes a las formaciones: Pariahuanca, Pariatambo, Jumasha y Celendn y donde los niveles de vida marina fueron excepcionales. La Formacin Celendn inici la regresin marina a fines del cretceo, vinculada a la deformacin conocida como Fase Peruana. Paralelamente hacia el occidente, la cuenca Huarmey experimentaba la acumulacin de gruesas secuencias volcnicas producto de la intensa actividad volcnica submarina (Fm. Junco) del arco volcnico occidental. La Formacin Cochapunta compuesta de calizas silicificadas puede ser equivalente a las formaciones Santa-Carhuaz, siendo producto del metamorfismo termal de las secuencias Casma. A la acumulacin del cretceo superior se produce un levantamiento y retiro de los mares (Fase Peruana) con una paleogeografa continental sometida a los eventos exgenos, acumulndose cientos de metros de secuencias sedimentarias denominadas capas rojas en ntida discordancia sobre el cretceo superior. Esta secuencia denominada Formacin Casapalca, prcticamente se deposit a lo largo de todos los andes centrales, tomando diferentes nombres tanto en el norte (Fm. Chota, Huaylas), centro (Casapalca) y sur (Huanca, Muani), pero que han tenido una gnesis similar. El levantamiento de los andes comenz a hacerse evidente. En pleno proceso de ascenso se acumularon secuencias volcanoclsticas (Gpo. Calipuy) asociadas posiblemente a procesos distensivos, conformando una ntida discordancia angular tanto sobre rocas del cretceo como palegenas, lo que evidencia un fuerte proceso de erosin pre-Calipuy. El Grupo Calipuy fue afectado por la deformacin andina ocurrida durante el Mioceno inferior. Hecho que es evidente en las secuencias inferiores que se encuentran ms deformadas que la parte superior que sobreyace en discordancia angular suave. Con esta fase, deben haberse emplazado cuerpos intrusivos dentro del Grupo Calipuy y en sus niveles superiores rocas subvolcnicas en el lapso Mioceno-Plioceno. Despus de los procesos de plegamiento mayores, la deformacin se manifest como levantamientos corticales, levantando la superficie de erosin y dando lugar a la profundizacin de valles; simultneamente,
ocurrieron eventos de volcanismo explosivo que dieron lugar a la Formacin
Fortaleza y Huayllay en el Plioceno inferior. Los procesos de levantamiento y fuerte erosin han continuado hasta el Cuaternario, dando lugar a la acumulacin de las secuencias clsticas gruesas (Fm. La Unin) hacia el lado oriental de la cordillera de Huayhuash y a los depsitos glacio-fluviales que se observan en el Valle del Santa. La continuidad del levantamiento es evidente por las fallas que se observan en la secuencia de morrenas que flanquean a la Cordillera Blanca.