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Facultad de Ingeniera
Ingeniera en Nanotecnologa
Ensayo General Bioqumica
Profesor asignado: Perez Torrero Esther
Rendon Reyes Marcos Jair
Resumen
Resumen contenido del siguiente archivo es acerc de lo visto en el semestre en la asignatura de Bioqumica I, esta misma impartida por la profesora Perez Torrero Esther, en la cual se incluyen temas que van
desde: La leyes de la termodin
amica y los seres vivos, pasando pro los carbohidratos, lpidos, protenas y
enzimas, hasta la bioqumica en la industria alimenticia. Esta asignatura tambien aportara al egresado de
la carrera de Ingeniera en nanotecnologa la aplicacion de conocimientos basicos para lograr comprender
los procesos bioqumicos y abordar el estudo en escala nanometrica a partir de sus propiedades fsicas,
qumicas y biol
ogicas que permitan evaluar los indicadores boqumicos en las condicones normal y patologica, con el fin de desarrollar pruebas de diagnostico.
The content of the following file is close to what was seen in the semester in the subject of Biochemistry I, the same taught by Professor Perez Torrero Esther, which includes topics ranging from: The
laws of thermodynamics and living things, Passing for carbohydrates, lipids, proteins and enzymes, to
biochemistry in the food industry. This subject will also contribute to the graduate of the degree in Engineering in nanotechnology the application of basic knowledge to understand the biochemical processes
and approach the study at nanometric scale from its physical, chemical and biological properties that
allow to evaluate the boqumicos indicators in the conditions normal and pathological, in order to develop
diagnostic tests.
Palabras clave:Bioqumica, termodin
amica, carbohidratos, nanometrca, enzimas, nanotecnologa.
keywords:Biochemistry, thermodynamics, carbohydrates, nanometrics, enzymes, nanotechnology.
Indice general
1. Bioqumica y biodiversidad
2. Las
2.1.
2.2.
2.3.
2.4.
leyes de la termodin
amica y los seres
Ley cero de la termodin
amica . . . . . . .
Primer principio de la termodin
amica . .
Segundo principio de la termodinamica . .
Tercer principio de la termodin
amica . . .
vivos
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3. Biomoleculas
4. Propiedades fisicoqumicas del agua
4.1. Introducci
on . . . . . . . . . . . . . .
4.2. Propiedades fsicas del agua . . . . .
4.3. Propiedades qumicas del agua . . .
4.4. Procesos fsico-qumicos . . . . . . .
4.4.1. Difusi
on . . . . . . . . . . . .
4.4.2. Capiliridad . . . . . . . . . .
4.4.3. Polaridad del agua . . . . . .
4
4
4
5
5
7
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7. Acidos
nucleicos
7.1. Composici
on qumica y estructura . . .
7.2. Nucleosidos y nucle
otidos . . . . . . . .
7.3. Funciones y diferencias en ADN y ARN
7.4. Acidos
nucleicos artificiales . . . . . . .
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8. Enzimas y enzimologa
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9. Hormonas
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2
Captulo 1
Bioqumica y biodiversidad
constituidos por moleculas de ARN y en algunos fagos (virus que atacan a las bacterias) tienen ADN
de una sola cadena. Los virus no cuentan con un metabolismo que les permita vivir en forma aut
onoma,
solo se pueden reproducir y expresarse dentro de las
celulas que invaden. Las reacciones que constituyen
el metabolismo estan localizadas en determinadas
estructuras celulares que forman unidades discretas
que se llaman organelos. Las reacciones se llevan a
cabo en los lugares en donde se encuentran las enzimas que las catalizan. La celula no es un saco sin
estructura, sino que es un sistema muy complejo
y altamente organizado. El termino biodiversidad
se refiere a la variedad de formas de vida en un h
abitat, ya sea un entorno local o de todo un planeta.
La mayora de las especies que componen nuestra
biodiversidad planetaria estan a
un poco estudiadas,
o son completamente desconocidas, los expertos estiman que pueden haber por lo menos cuatro veces
mas especies complejas (eucariotas) vivas en nuestro
planeta, que los 1,9 millones que ya se han descubierto y nombrado, posiblemente a
un mas. A pesar
de que cada vez somos conscientes de la enorme biodiversidad de la Tierra, tambien estamos en medio
de una crisis de biodiversidad, con especies extinguiendose a un ritmo que rivalizan con los de las
mayores extinciones masivas de la historia de la Tierra. Por lo tanto, aunque la definicion del termino
biodiversidad es simple, de hecho, encierra parte
de los mayores retos para la humanidad (y la ciencia). Son muchas las razones por la que la comprension y la preservacion de la diversidad biologica son
importantes. Por encima de todo, cada especie es
u
nica en su historia de evolucion y funcion ecol
ogica, por lo que en conjunto son un recurso mundial,
como una biblioteca que preserva el patrimonio de
la vida misma.
Captulo 2
La Termodin
amica es la rama de la Fsica que
estudia a nivel macrosc
opico las transformaciones
de la energa, y c
omo esta energa puede convertirse en trabajo (movimiento). Hist
oricamente, la Termodinamica naci
o en el siglo XIX de la necesidad
de mejorar el rendimiento de las primeras maquinas
termicas fabricadas por el hombre durante la Revolucion Industrial. La Termodin
amica cl
asica (que es
la que se tratar
a en estas p
aginas) se desarrollo antes de que la estructura at
omica fuera descubierta
(a finales del siglo XIX), por lo que los resultados
que arroja y los principios que trata son independientes de la estructura at
omica y molecular de la
materia. El punto de partida de la mayor parte de
consideraciones termodin
amicas son las llamadas leyes o principios de la Termodin
amica. En terminos
sencillos, estas leyes definen c
omo tienen lugar las
transformaciones de energa. Con el tiempo, han llegado a ser de las leyes m
as importantes de la ciencia.
2.1.
2.2.
2.3.
2.4.
Captulo 3
Biomoleculas
molecular de la materia viva es universal, y este hecho debe hacernos pensar una vez mas en un origen com
un de todas las formas de vida. Adem
as,
los principales tipos de biomoleculas desempe
nan
identicas funciones en todos los seres vivos. As, los
acidos nucleicos act
uan universalmente almacenando y transmitiendo la informacion genetica; las protenas son en todas las celulas los productos directos
y efectores de la accion de los genes, desempe
nando en ellas una gran variedad de funciones entre
las que destacan la catalticas y las estructurales;
los az
ucares y los lpidos suministran y almacenan
energa qumica para los procesos celulares, o bien
act
uan como elementos estructurales, en todas las
formas de vida. Se puede decir, con ciertas precauciones, que protenas y acidos nucleicos son biomoleculas informativas mientras que az
ucares y lpidos son biomoleculas energeticas. Por otra parte, las
biomoleculas son enormemente versatiles en cuanto
a su funcion: la mayor parte de ellas desempe
nan
diferentes cometidos celulares. Se puede comprobar
que esta bacteria posee alrededor de 6000 compuestos qumicos diferentes, entre los que se encuentran
unas 3000 protenas y otros tantos tipos de
acidos
nucleicos. Un analisis semejante para organismos vivos de mayor tama
no y complejidad, como los animales o las plantas superiores, arrojara cifras m
as
espectaculares: se calcula que el organismo humano
puede contener unas 30,000 protenas diferentes y
una cantidad similar de acidos nucleicos. Aunque
existen protenas de Escherichia coli con funciones
analogas a las de algunas protenas humanas, no hay
protenas que sean identicas en una y otra especie.
Es mas, cada especie de organismos vivos posee un
conjunto de protenas y acidos nucleicos que difiere
completamente del de las demas especies. Si tenemos en cuenta ahora que, seg
un estimaciones, en
Los bioelementos se combinan entre s para formar las moleculas que componen la materia viva.
Estas moleculas reciben el nombre de Biomoleculas o Principios Inmediatos. Las biomoleculas, para poder ser estudiadas, deben ser extradas de los
seres vivos mediante procedimientos fsicos, nunca
qumicos, ya que si as fuera, su estructura molecular
se alterara. Los procedimientos fsicos son la filtracion, la dialisis, la cristalizaci
on, la centrifugacion,
la cromatografa y la electroforesis. Los compuestos qumicos de la materia viva reciben el nombre
de biomoleculas. Las biomoleculas se clasifican atendiendo a su composici
on. Las biomoleculas inorganicas son las que no est
an formadas por cadenas de
carbono, como son el agua, las sales minerales o los
gases. Las moleculas org
anicas est
an formadas por
cadenas de carbono y se denominan Gl
ucidos, Lpi
dos, Protidos y Acidos
nucleicos. Las biomoleculas
organicas, atendiendo a la longitud y complejidad
de su cadena, se pueden clasificar como monomeros o polmeros. Los mon
omeros son moleculas peque
nas, unidades moleculares que forman parte de
una molecula mayor. Los polmeros son agrupaciones de monomeros, iguales o distintos, que componen una molecula de mayor tama
no. Antiguamente
se les llamaba tambien principios inmediatos, pero esta denominaci
on ha cado en desuso. Las biomoleculas se clasifican en org
anicas e inorganicas
seg
un sean o no compuestos del carbono. En el siguiente cuadro se muestran los distintos tipos de
biomoleculas. En realidad, si dejamos de considerar las partes relativamente inertes de los organismos vivos (exoesqueleto, porci
on mineral del hueso,
depositos de sustancias de reserva, etc.), todas las
celulas vivas contienen aproximadamente las mismas proporciones de los principales tipos de biomoleculas. Podemos concluir que la composicion
7
yendo organulos celulares (mitocondrias, cloroplastos, etc.). La integracion de los distintos org
anulos
da lugar a la celula, que ya no pertenece al nivel molecular sino al celular. El ensamblaje de los distintos
sillares estructurales para dar lugar a los diferentes
tipos de macromoleculas se lleva a cabo mediante
enlaces covalentes de gran estabilidad. Aunque como resultado de reacciones qumicas entre diferentes
grupos funcionales existe en la naturaleza una gran
variedad de este tipo de enlaces, un reducido n
umero de ellos es el responsable de la construcci
on de la
inmensa mayora de las biomoleculas.
As, los monosacaridos se ensamblan mediante enlaces glucosdicos para dar lugar a los polisac
aridos,
los aminoacidos mediante enlaces peptdicos para
dar lugar a las protenas, los enlaces ester predominan entre los componentes de los lpidos y de los
acidos nucleicos. La utilizacion de solo unos pocos tipos
de enlace qumico para construir sus biomoleculas
resulta muy ventajosa para los seres vivos, ya que
ello les permite llevar a cabo un control muy eficaz
y economico de las reacciones qumicas celulares.
En la formacion o rotura de enlaces covalentes entre
atomos vecinos se ve implicada una cantidad importante de energa. Existe un tipo adicional de interacciones interatomicas, denominadas interacciones
debiles, que son mucho menos energeticas y que por
lo tanto pueden romperse o establecerse con extraordinaria facilidad. Muchos de los acontecimientos
que a nivel molecular tienen lugar en las celulas vivas, entre los que destacan la determinaci
on de la
estructura tridimensional de las macromoleculas o
la relacion estereoespecfica entre el enzima y su sustrato, responden a este tipo de interacciones. Las interacciones debiles de importancia biologica pueden
ser de varios tipos: puentes de hidrogeno, interacciones ionicas, interacciones hidrofobicas y fuerzas
de Van der Waals. La base fsico-qumica de estas
interacciones se comprendera mejor en relaci
on con
las propiedades de las disoluciones acuosas, por lo
que su estudio se pospondra para un captulo posterior. Los compuestos organicos, tan abundantes en
la materia viva, se encuentran en la corteza terrestre, en el agua del mar y en la atmosfera en cantidades muy peque
nas (incluso las llamadas rocas
organogenas, como el carbon y el petroleo, proceden de la actividad de seres vivos de epocas preteritas). Cabe preguntarse, pues, como adquirieron los
primeros organismos vivos sus biomoleculas constituyentes en un entorno tan pobre en este tipo de
sustancias.
En 1922, el bioqumico ruso Aleksandr I. Oparin formulo una hipotesis acerca del origen de la vida sobre
la Tierra, que inclua una explicaci
on sobre el origen
de las primeras biomoleculas. Seg
un esta hipotesis,
la primitiva atm
osfera de la Tierra era rica en gases
como el metano, el amonaco y el vapor de agua, y
estaba practicamente exenta de oxgeno; era, pues,
una atmosfera netamente reductora, muy diferente
al entorno oxidante que hoy conocemos. La energa
liberada por las descargas electricas de las frecuentes tormentas y por la intensa actividad volcanica,
habra propiciado que estos gases atmosfericos reaccionasen entre s para formar compuestos organicos sencillos, que a continuaci
on se disolvan en los
primitivos oceanos. Este proceso dur
o millones de
a
nos, durante los cuales los oceanos se fueron enriqueciendo paulatinamente en una gran variedad de
compuestos org
anicos; el resultado fue una disolucion caliente y concentrada de moleculas organicas:
la sopa primigenia. En esta sopa.algunos de estos compuestos simples reaccionaban con otros para
dar lugar a estructuras m
as complejas, y as fueron
apareciendo las distintas biomoleculas. La tendencia de algunas biomoleculas concretas a asociarse
en estructuras cada vez m
as complejas culmino con
el paso del tiempo con la aparici
on de alguna forma
primitiva de organizaci
on celular, que sera el antepasado com
un de todos los seres vivos. Es proba-
Captulo 4
Introducci
on
Nombre com
un que se aplica al estado lquido
del compuesto de hidr
ogeno y oxgeno H2 O. Los
antiguos filosofos consideraban el agua como un elemento basico que representaba a todas las sustancias lquidas. Los cientficos no descartaron esta idea
hasta la u
ltima mitad del siglo XVIII. En 1781 el
qumico britanico Henry Cavendish sintetizo agua
detonando una mezcla de hidr
ogeno y aire. Sin embargo, los resultados de este experimento no fueron
interpretados claramente hasta dos a
nos mas tarde, cuando el qumico frances Antoine Laurent de
Lavoisier propuso que el agua no era un elemento
sino un compuesto de oxgeno e hidr
ogeno. En un
documento cientfico presentado en 1804, el qumico frances Joseph Louis Gay-Lussac y el naturalista
aleman Alexander von Humboldt demostraron conjuntamente que el agua consista en dos vol
umenes
de hidrogeno y uno de oxgeno, tal como se expresa
en la formula actual H2 O.
4.2.
1)Estado fsico: s
olida, liquida y gaseosa
2)Color: incolora
3)Sabor: inspida
4)Olor: inodoro
1g
5)Densidad:
a 4 C
c.c
6)Punto de congelaci
on: 0 C
7)Punto de ebullici
on: 100 C
8)Presi
on critica: 217, 5 atm.
9)Temperatura critica: 374 C
inspido; incoloro y transparente en capas de poco enfra hasta 0 C: a esta temperatura su densidad
10
4.3.
Propiedades
agua
qumicas
del
11
y comprimen el
angulo de enlace hasta los 105.Las
fuerzas de repulsi
on se deben a que los electrones
tienden a mantenerse separados al m
aximo (porque
tienen la misma carga) y cuando no est
an apareados tambien se repelen (principio de exclusion de
Pauling). Adem
as n
ucleos at
omicos de igual carga
se repelen mutuamente.
Las fuerzas de atracci
on se deben a que los electrones y los n
ucleos se atraen mutuamente porque
tienen carga opuesta, el espn opuesto permite que
2 electrones ocupen la misma regi
on pero manteniendose alejados lo m
as posible del resto de los electrones. La estructura de una molecula es el resultado
neto de la interacci
on de las fuerzas de atraccion y
de repulsion (fuerzas intermoleculares), las que se
relacionan con las cargas electricas y con el espn de
los electrones.
De acuerdo con la definici
on de
acido y alcali de
Bronsted-Lowry, los 2 pares de electrones no compartidos del oxgeno en la molecula H2 O le proporciona caractersticas alcalinas. Los 2 enlaces covalentes de la molecula H2 O son polares porque
el atomo de oxgeno es m
as electronegativo que
el de hidrogeno, por lo que esta molecula tiene
un momento dipolar electrost
atico igual a 6,13e30
(coulombs)(angstrom), lo que tambien indica que la
molecula H2 O no es lineal, H-O-H.El agua es un
compuesto tan vers
atil principalmente debido a que
el tama
no de su molecula es muy peque
no, a que
su molecula es buena donadora de pares de electrones, a que forma puentes de hidr
ogeno entre s y
con otros compuestos que tengan enlaces como: NH, O-H y F-H, a que tiene una constante dielectrica
muy grande y a su capacidad para reaccionar con
compuestos que forman otros compuestos solubles.
El agua es, quiz
a el compuesto qumico m
as importante en las actividades del hombre y tambien mas
versatil, ya que como reactivo qumico funciona como acido, alcali, ligando, agente oxidante y agente
reductor.
4.4.
4.4.1.
Procesos fsico-qumicos
Difusi
on
lentamente a traves del agua, pero si no se remueve el lquido pueden pasar semanas antes de que la
solucion se aproxime a la homogeneidad.
4.4.2.
Capiliridad
4.4.3.
12
Captulo 5
acido-base
Casi todos los procesos biologicos son dependientes del pH; un peque
no cambio en el pH lleva a
un gran cambio en la velocidad de un proceso. Lo
anterior es cierto no solo para aquellas reacciones
en donde esta involucrado directamente el ion H + ,
sino tambien para aquellas en donde aparente no
esta involucrado. Las enzimas, un tipo particular de
protenas que catalizan las reacciones que se llevan a
cabo en los seres vivos y muchas otras biomoleculas,
contienen en su estructura grupos con pKas caractersticos. Los grupos amino y carboxilo protonados
de los aminoacidos as como los grupos fosfato de
los nucleotidos, por ejemplo, funcionan como
acidos
debiles y, por tanto, su estado ionico depende del
pH de la solucion que los contiene. Las interacciones
ionicas juegan, ademas, un papel fundamental en la
estructura y reconocimiento de las macromoleculas
de los seres vivos. Las celulas y organismos mantienen un pH especfico y constante manteniendo sus
biomoleculas en su estado ionico optimo que generalmente se encuentra alrededor de pH 7, 0. En los
organismos multicelulares el pH de los fluidos extracelulares esta tambien fuertemente regulado. La
constancia en el pH se logra gracias a los amortiguadores biologicos que son mezclas de acidos debiles y
Kw = [H + ][OH ]
sus bases conjugadas.
Estos sistemas a diferencia de las macromoleculas
OH H2 O
estan formados por metabolitos de bajo peso mo
Acido acetico(CH3 COOH) Acetato (CH3 COO ) lecular y son los sistemas de fosfato y bicarbonato.
El sistema amortiguador de fosfato act
ua en el citoplasma
de
las
c
e
lulas
y
consiste
de:
[H + ][Acetato ]
Ka =
H2 P O4 H+ + HP O42 ...........................(1)
Acidoac
etico
NOTA:Representaci
on de los equilibrios que ocurren al agregar
un
acido d
ebil(ac
etico) al agua.
13
[H + ][HCO3 ]
.......................................(3)
H2 CO3
[H2 CO3 ]
...........................................(5)
[CO2 ][H2 O]
[CO2 (d)]
.............................................(7)
[CO2 (g)]
14
Captulo 6
Carbohidratos
6.1.1.
Clasificaci
on de los carbohidratos
alimenticios
Az
ucares
La glucosa y la fructosa son monosacaridos y se
pueden encontrar en las frutas, las bayas, las verduras, la miel y los siropes de glucosa-fructosa. El
az
ucar com
un o de mesa, es decir, la sacarosa, es
un disacarido compuesto por glucosa y fructosa y
esta presente en la naturaleza en alimentos tales como la remolacha azucarera, la ca
na de az
ucar y las
frutas. La lactosa, que es un disacarido compuesto
de glucosa y galactosa, es el principal az
ucar de la
leche y de los productos lacteos; por su parte, la
maltosa, que es un disacarido compuesto s
olo de
glucosa (dos moleculas de glucosa), esta presente en
la malta y en los siropes (extractos lquidos) derivados del almidon. Tanto el az
ucar de mesa (sacarosa)
y los siropes de glucosa-fructosa contienen glucosa
y fructosa, bien en estado libre (siropes de glucosafructosa) o en forma de disacarido (sacarosa). Los
polioles se denominan alcoholes de az
ucar. Hay polioles naturales, pero la mayora se fabrican mediante
la transformacion de az
ucares. El poliol utilizado
con mayor frecuencia es el sorbitol; por su parte, el
xilitol se usa frecuentemente en las gomas de mascar y en los caramelos. El isomaltol es otro poliol,
que se usa en repostera/confitera y se obtiene a
partir de la sacarosa. Los polioles son dulces y se
pueden utilizar en los alimentos (a
nadiendolos a los
mismos) de forma similar a lo que se hace con los
az
ucares, aunque dichos polioles pueden tener un
efecto laxante si se ingieren en cantidades excesivas.
Oligosac
aridos
La Organizacion Mundial de la Salud (OMS) define
a los oligosacaridos como carbohidratos formados
15
6.1.2.
Fuente
energa
almacenamiento
de
6.2.
Lpidos
16
aclarar que los lpidos no son lo mismo que las gra- beneficiosos para la salud.
sas, ya que estas u
ltimas son una clase de lpidos de
origen animal. Tambien biomoleculas, algunos son
flexibles, rgidos, arom
aticos, lineales, con estructu- 6.2.2. Fosfolpidos
ra de anillo, etc.
Existen diferentes tipos de acidos grasos que
forman parte de nuestro organismo, y que son ne6.2.1. Tipos de lpidos y su composici
on cesarios para su buen funcionamiento. Dentro del
grupo de lpidos, se pueden encontrar los fosfolpidos, para que entiendas su importancia, te explicare
Existen dos tipos de lpidos principales:
que son y cuales son sus funciones.
aciColesterol, ya que forman parte de membranas Existen diferentes tipos de tipos de lpidos o
dos grasos que forman parte de tu organismo, y
organicas.
Fosfolpidos, principal componente de las mem- que son necesarios para su buen funcionamiento.
Dentro del grupo de lpidos, se pueden encontrar
branas biologicas.
los fosfolpidos. Para que entiendas su importancia,
Ademas, los lpidos est
an formados por
acidos gra- te explicare que son y cuales son sus funciones; es
uan en tu cuerpo. Los fosfolpidos
sos, que se clasifican en
acidos grasos saturados y decir, como act
son lpidos anfipaticos; es decir, que una parte de
acidos grasos insaturados.
ellos son solubles en agua y otra region la rechaza.
-Fosfatidiletanolamina.
-Fosfatidilcolina.
-Fosfatilinositol.
-Fosfatilserina.
Funciones de los fosfolpidos
Acidos
grasos insaturados
Los fosfolpidos estan presentes en todos los aliSon aquellos cuyos enlaces son dobles, dentro de mentos, porque son parte de la membrana celular.
Debido a eso, sus funciones son fundamentales para
los cuales se pueden mencionar los
acidos grasos:
que la celula exista como tal. Conoce cuales son:
-palmitoleico,
-Confieren estructura a la membrana celular.
-oleico,
-Activan las enzimas. Act
uan como mensajeros en
-linoleico,
la transmision de se
nales al interior de la celula.
-linolenico,
-Act
uan como surfactantes pulmonares. Por eso son
-araquidonico.
indispensables para el buen funcionamiento de los
Dentro de esta clasificaci
on se encuentran los aci- pulmones.
dos grasos esenciales, es decir los que no pueden ser -Regulan el colesterol. Este componente esencial de
sintetizados por el organismo del hombre.Teniendo los acidos biliares, estos cumplen la funcion de soluon
en cuenta esta definici
on de lpidos, es importante bilizar el colesterol, si existe una baja concentraci
tener presente que los lpidos son importantes y de- de fosfolpidos, se pueden producir calculos biliares
ben formar parte de la dieta, ya que a traves de ella de colesterol.
uan como precursores de la sntesis de prostatienes acceso a diferentes tipos de
acidos grasos, los -Act
cuales consumidos en su justa medida, pueden ser glandinas, tromboxanos y leucotrienos.
17
19
Captulo 7
Acidos
nucleicos
Los acidos nucleicos son las biomoleculas portadoras de la informaci
on genetica. Tienen una estructura polimerica, lineal, cuyos mon
omeros son
los nucleotidos. El grado de polimerizacion puede
llegar a ser altsimo, con moleculas constituidas por
centenares de millones de nucle
otidos en una sola estructura covalente. De la misma manera que
las protenas son polmeros lineales aperiodicos de
aminoacidos, los
acidos nucleicos lo son de nucleotidos. La aperiodicidad de la secuencia de nucleotidos
implica la existencia de informaci
on. De hecho, sabemos que los acidos nucleicos constituyen el deposito
de informacion de todas las secuencias de aminoacidos de todas las protenas de la celula. Existe una
correlacion entre ambas secuencias, lo que se expresa diciendo que
acidos nucleicos y protenas
son colineares; la descripci
on de esta correlacion
es lo que llamamos C
odigo Genetico, establecido
de forma que a una secuencia de tres nucleotidos
en un acido nucleico corresponde un aminoacido en
una protena. Son macromoleculas y complejas, que
estan formadas por C (carbono), H (hidrogeno), O
(oxgeno), N (nitr
ogeno) y P (fosforo), encontrandose presentes en todos los seres vivos.
-Por el gl
ucido (pentosa) que contienen: la desoxirribosa en el ADN y la ribosa en el ARN;
-Por las bases nitrogenadas que contienen: adenina,
guanina, citosina y timina, en el ADN;
adenina, guanina, citosina y uracilo, en el ARN.
-En los organismos eucariotas, la estructura del
ADN es de doble cadena, mientras que la estructura del ARN es monocatenaria, aunque puede pre-
7.2.
7.1.
Composici
on qumica y estructura
Los acidos nucleicos resultan de la polimerizacion de monomeros complejos denominados nucleotidos. Un nucleotido esta formado por la uni
on
de un grupo fosfato al carbono 5 de una pentosa. A
su vez la pentosa lleva unida al carbono 1 una base
nitrogenada. Las bases nitrogenadas son moleculas
cclicas y en la composicion de dichos anillos participa, ademas del carbono, el nitrogeno. Estos compuestos pueden estar formados por uno o dos anillos.
Aquellas bases formadas por dos anillos se denominan bases p
uricas (derivadas de la purina). Dentro
de este grupo encontramos: Adenina (A), y Guanina
(G). Si poseen un solo ciclo, se denominan bases pirimidnicas (derivadas de la pirimidina), como por
ejemplo la Timina (T), Citosina (C), Uracilo (U).
Existen dos tipos de
acidos nucleicos:ADN (acido Estos derivados de la purina y la pirimidina son las
desoxirribonucleico) y ARN (
acido ribonucleico), bases que se encuentran con mayor frecuencia en los
acidos nucleicos.
que se diferencian:
Nucle
osidos y nucle
otidos
20
7.3.
Funciones y diferencias en
ADN y ARN
acidos tenemos:
-Duplicacion del ADN
-Expresion del mensaje genetico:
-Transcripcion del ADN para formar ARNm y otros
-Traduccion, en los ribosomas, del mensaje contenido en el ARNm a proteinas.
El ADN y el ARN se diferencian porque:
-El peso molecular del ADN es generalmente mayor
que el del ARN
-El az
ucar del ARN es ribosa, y el del ADN es desoxirribosa
-El ARN contiene la base nitrogenada uracilo, mientras que el ADN presenta timina
La configuracion espacial del ADN es la de un doble
helicoide, mientras que el ARN es un polinucleotido
lineal, que ocasionalmente puede presentar apareamientos intracatenarios.
7.4.
Acidos
nucleicos artificiales
Acido
nucleico peptdico, donde el esqueleto
de fosfato-(desoxi)ribosa ha sido sustituido por 2(N-aminoetil)glicina, unida por un enlace peptdico
clasico. Las bases p
uricas y pirimidnicas se unen al
esqueleto por el carbono carbonlico. Al carecer de
un esqueleto cargado (el ion fosfato lleva una carga
negativa a pH fisiologico en el ADN/ARN), se une
con mas fuerza a una cadena complementaria de
ADN monocatenario, al no existir repulsi
on electrostatica. La fuerza de interaccion crece cuando se
forma un ANP bicatenario. Este acido nucleico, al
no ser reconocido por algunos enzimas debido a su
diferente estructura, resiste la accion de nucleasas y
proteasas.
Morfolino y
acido nucleico bloqueado (LNA,
en ingles). El morfolino es un derivado de un
acido
nucleico natural, con la diferencia de que usa un
anillo de morfolina en vez del az
ucar, conservando el enlace fosfodiester y la base nitrogenada de
los acidos nucleicos naturales. Se usan con fines de
investigacion, generalmente en forma de olig
omeros de 25 nucleotidos. Se usan para hacer genetica
inversa, ya que son capaces de unirse complementariamente a pre-ARNm, con lo que se evita su
posterior recorte y procesamiento. Tambien tienen
un uso farmaceutico, y pueden actuar contra bacterias y virus o para tratar enfermedades geneticas al
impedir la traduccion de un determinado ARNm.
Acido
nucleico glic
olico. Es un acido nucleico
artificial donde se sustituye la ribosa por glicerol,
conservando la base y el enlace fosfodiester. No
existe en la naturaleza. Puede unirse complementariamente al ADN y al ARN, y sorprendentemente,
lo hace de forma mas estable. Es la forma qumicamente mas simple de un acido nucleico y se especula
con que haya sido el precursor ancestral de los actuales acidos nucleicos.
Acido
nucleico tre
osico. Se diferencia de los
acidos nucleicos naturales en el az
ucar del esqueleto,
que en este caso es una treosa. Se han sintetizado
cadenas hbridas ATN-ADN usando ADN polimerasas. Se une complementariamente al ARN, y podra
haber sido su precursor.
21
Captulo 8
Enzimas y enzimologa
Las enzimas son biocatalizadores de naturaleza
proteica. Todas las reacciones qumicas del metabolismo celular se realizan gracias a la accion de
catalizadores o enzimas. La sustancia sobre la que
act
ua una enzima se denomina substrato. Pasteur
descubrio que la fermentaci
on del az
ucar mediante levaduras, con su conversi
on en alcohol etlico
y anhdrido carb
onico es catalizada por fermentos
o enzimas. En 1897 Buchner logr
o extraer de las
celulas de levadura las enzimas que catalizan la
fermentacion alcoh
olica. Sumner en 1926, aislo en
forma cristalina la enzima ureasa, a partir de extractos obtenidos de Cannavalia enzyformis (Fabaceae)
la que hidroliza la urea seg
un la siguiente reaccion:
(N H2 )2 CO + H2 O CO2 + 2N H3
En 1930, Northrop aisl
o en forma cristalina las enzimas digestivas: pepsina, tripsina y quimotripsina.
En la actualidad se conocen m
as de 2000 enzimas
que han sido aisladas en forma cristalina.
En terminos generales los catalizadores se
caracterizan por las siguientes propiedades:
1.- Son eficaces en peque
nas cantidades. Tienen un
n
umero de recambio alto, que varia entre 100 y
36 millones (anhidrasa carb
onica). El n
umero de
recambio o actividad molar, se define como la cantidad de substrato transformado en la unidad de
tiempo por una cantidad dada de enzima, por ej.
la catalasa hidroliza 5, 6 * 106 moleculas de H2 O2
por molecula de enzima por minuto, por lo que su
n
umero de recambio es 5, 6 * 106 .
2.-No se alteran durante las reacciones en que par- 1. Oxidorreductasas. Reacciones de transferencia
de electrones.
ticipan.
2. Transferasas. Transferencia de grupos funciona22
E + S ES E + P
Una enzima reduce mas eficientemente la energa
de activacion (Ea) de una reaccion que un catalizador inorganico, lo que permite que una reacci
on se
realice a menor temperatura.
Reacciones de las enzimas
El hecho de que una reaccion qumica sea termodinamicamente favorable depende de la diferencia
de energa libre que haya entre los sustratos y los
productos. Si esta diferencia es negativa, la reacci
on
es espontanea. Aunque una reaccion sea espont
anea
no significa que la velocidad de la reaccion sea elevada, existiendo reacciones espontaneas que tardan
segundos y otras que tardan horas. En las reacciones
qumicas sencillas la transformacion de un sustrato
en un producto suele pasar por un estado intermedio llamado estado de transicion. Este estado de
transicion es muy inestable y suele necesitar aporte
de energa. La velocidad de una reaccion qumica
depende de esta energa de activacion. Para que se
produzca una reaccion qumica, sin intervenci
on de
enzimas, es necesario que los reactivos entren en
contacto, para lo que es necesaria una concentracion suficiente, y que el choque de moleculas tenga
energa para superar la barrera de activaci
on. Este
es el motivo por el que la temperatura influye en
el equilibrio qumico. La enzima acelera la reacci
on
qumica disminuyendo la energa de activaci
on. La
enzima lleva a cabo esta disminucion de la barrera
energetica interaccionando con los elementos que
participan en la reaccion qumica estabiliz
andolos
en el centro reactivo. As, aumenta enormemente la
probabilidad de que se produzca la reaccion qumica
ya que concentra y pone en contacto los elementos
necesarios para la reaccion. En algunas reacciones
enzimaticas participan coenzimas que permiten que
durante la reaccion la enzima no sufra modificaciones qumicas que le impidan repetir el proceso. La
actividad enzimatica se restaura con solo reemplazar la coenzima y el complejo enzimatico queda listo para catalizar una nueva reaccion.Adem
as de las
enzimas de naturaleza puramente proteica existen
moleculas no proteicas capaces de catalizar reacciones como las ribozimas, formadas por moleculas de
ARN.
23
Captulo 9
Hormonas
Sustancias qumicas que por lo general son liberados directamente dentro del torrente sanguneo,
solas (biodisponibles) o asociadas a ciertas protenas
(que extienden su vida media) y hacen su efecto en
determinados organos o tejidos a distancia de donde se sintetizaron, de ah que las gl
andulas que las
producen sean llamadas endocrinas (endo dentro).
Pueden actuar sobre la misma celula que la sintetiza
(accion autocrina) o sobre celulas contiguas (accion
paracrina) interviniendo en el desarrollo celular.
Caractersticas
-Intervienen en el metabolismo
-Se liberan al espacio extracelular.
-Se difunden a los vasos sanguneos y viajan a traves
de la sangre.
-Afectan tejidos que pueden encontrarse lejos del
punto de origen de la hormona.
-Su efecto es directamente proporcional a su concentracion.
-Independientemente de su concentraci
on, requieren
de adecuada funcionalidad del receptor, para ejercer
su efecto.
-Regulan el funcionamiento del cuerpo.
Efectos
-Estimulante: promueve actividad en un tejido. ( ej,
prolactina).
-Inhibitorio: disminuye actividad en un tejido. (ej,
somatostatina).
-Antagonista: cuando un par de hormonas tienen
efectos opuestos entre s, (ej, insulina y glucagon)
-Sinergista: cuando dos hormonas en conjunto tienen un efecto m
as potente que cuando se encuentran
separadas. (ej: hGH y T3/T4)
-Tropico: esta es una hormona que altera el metabolismo de otro tejido endocrino, (ej, gonadotropina
24
y excrecion.
Las hormonas pueden ser estimuladas o inhibidas por:
-Otras hormonas.
-Concentracion plasmatica de iones o nutrientes.
-Neuronas y actividad mental.
-Cambios ambientales: por ej. luz, temperatura, presion atmosferica.
Un grupo especial de hormonas son las hormonas
troficas que act
uan estimulando la producci
on por
las glandulas endocrinas. Por ej. TSH estimula la
liberacion de hormonas tiroideas ademas de estimular el crecimiento de la glandula. Recientemente se
han descubierto las hormonas del hambre: Grelina,
Orexina y Peptido Y y sus antagonistas como la
Leptina.
Clasificaci
on qumica
Las hormonas pertenecen a tres grupos de compuestos:
-Esteroides.
-Plipeptidos.
-Derivados de acidos aminados.
25