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POPOLAZIONI
Si occupa dello studio della
costituzione genetica delle
popolazioni e di come cambia
da generazione a generazione
LeggediHardy
LeggediHardyWeinberg
(Equilibrium)
GodfreyHaroldHardy
M t
Matematicoinglese
ti i l
(18771947)
(1877
WilhelmWeinberg
Fisicotedesco
d
(18621937)
(1862
Utilizzaronolalgebraperspiegarecomele
frequenzeallelichepossonopredirelefrequenze
genotipicheefenotipiche.
ti i h f
ti i h
La
LaLeggediHardy
LaLeggediHardy
Legge di Hardy
HardyWeinberg
Datalacostanzadellefrequenze
geniche frequenze genotipiche
geniche,frequenzegenotipiche
raggiungonoinunagenerazionedi
unioniacaso,unequilibrioaivalori:p2
perAA
per
AA 2pqperAa
2pqperAa eq2 per
peraa
aa
Lapopolazionevienedettainequilibrioperchtalifrequenzerimangono
costantifinchleassunzionirimangonoverificate
A livello di DNA
Microsatelliti
La variazione genetica si pu
misurare con due parametri
Polimorfismo: numero di loci polimorfici sul numero
totale di loci esaminati in una popolazione (non
preciso, dipende dal n. individui analizzati)
Eterozigosit: frequenza totale degli eterozigoti
per un dato locus. Stima la probabilit che 2 alleli
scelti a caso in una popolazione siano diversi
Frequenze genotipiche
Frequenzegenotipiche
Nelcasodiungeneconduesolialleli
P=f(AA)H=f(Aa)Q=f(aa)
eancheinquestocaso
P+H+Q=1
Cherapportoctrafrequenze
allelicheegenotipiche?
P=
2n AA + n Aa
2
2n
2n AA
+
2n
=P +
n Aa
2n
n AA
n
n Aa
H
2
n= numeroindividuidelcampione
nAA e
e nAa= numero
enAa=
numerodiindividuirispettivamenteAAeAa
numerodiindividuirispettivamenteAAe
di individui rispettivamente AA e Aa
alleliche
Frequenze alleliche
Lefrequenzeallelichesipossonoricavareanchedalle
frequenzegenotipichetenendopresentecheinindividui
omozigoti i due geni sono di un dato tipo mentre negli
omozigotiiduegenisonodiundatotipomentrenegli
eterozigotilesonopermet.
Lafrequenzadiunallelelafrequenzadegliindividui
omozigotiperquellallelepilametdellafrequenzadegli
individui eterozigoti per lo stesso allele
individuieterozigotiperlostessoallele.
Genetica di popolazioni
Parametri:
Frequenza allelica:
allelica la proporzione di uno
specifico allele in un dato locus, considerando
che la popolazione pu avere da uno a pi alleli a
quel locus
Frequenza genotipica:
genotipica la proporzione di uno
specifico genotipo ad un dato locus,
considerando che sono possibili molti genotipi
diversi
Frequenza fenotipica:
fenotipica la proporzione di individui
in una popolazione con un dato fenotipo
con frequenza p
con frequenza q
La
LaLeggediHardy
LaLeggediHardy
Legge di HardyWeinberg
Frequenze
genotipiche
p2
2pq
q2
0.36AA+0.48Aa+0.16aa=1
P
36
48
16
6
Leproporzionitraivaricolorinonsonocambiateenon
cambierannopi,amenoche....
=100
100
2 (chiquadrato)
2(chi
quadrato)
Iltestcipermettediverificareselefrequenzegenotipiche
osservatesidiscostanodaquelleattesepersoloeffettodel
caso
Sequestoscostamentosignificativoquestovuoldireche
unaopiassunzionisonostateviolate.
N B Il contrario non vero!!
N.B.Ilcontrariononvero!!
Verificadellostatodiequilibrio
Osservati
AA
Aa
aa
17
53
57
Attesi
N*p
p2
127(0.3425)2
14.90
N*2pq
2(0.3425)(0.6575)
57.20
N*q2
127(0 6575)2
127(0.6575)
54.90
N =57+53+17 = 127
frequenze genotipiche
P = f(AA) = 17/127 = 0.134
H = f(Aa) = 53/127 = 0.417
Q = f(aa) = 57/127 = 0.449
frequenze geniche
p = P +H/2 = 0.134 + 0.417/2 = 0.3425
q = 11-p = 11-- 0.3425 = 0.6575
((oss att))2
att
Lipotesinonpuessererifiutata
L
Lanostrapopolazioneallequilibrio
l i
ll
ilib i
Gruppi sanguigni MN
MM
MN
NN
Totale
1787 individui
3039 individui
1303 individui
6129
p = 0,54
q = 0,46
AA = p2 = 0,98
Aa = 2pq = 0,02
CONSEGUENZA:
Gli alleli rari esistono nella popolazione per lo pi nei genotipi eterozigoti.
Infatti la frequenza di a nella popolazione di 0,01 negli eterozigoti e
0,0001 negli omozigoti.
La migrazione
Si ha quando individui si spostano da una
popolazione ad unaltra, con la quale si
accoppiano
Determina un cambiamento locale delle
frequenze alleliche
Dipende dal tasso della migrazione
p = m (px-py)
proporzione dei
migranti nella
popolazione finale
differenza
nelle frequenze
alleliche
http://www.anselm.edu/homepage/jpitocch/genbios/evolutionbi04.html
La deriva genetica:
Determina sempre il raggiungimento della
omogeneit
Pi grande il numero degli individui, maggiore
sar il numero di generazioni necessario per
arrivare allomogeneit
Non genera propensione verso laumento di un tipo
genetico o dellaltro, ma tende alla
omogeneizzazione della popolazione
La deriva genetica:
determina cambiamenti nelle frequenze alleliche
di una popolazione nel tempo
porta ad una riduzione della variabilit genetica
in una popolazione
essendo casuale, determina la divergenza delle
frequenze alleliche nelle popolazioni
ha un effetto maggiore in popolazioni piccole
http://tidepool.st.usm.edu/crswr/founder.html
http://www.mie.utoronto.ca/labs/lcdlab/biopic/biofigures.htm
La selezione naturale
Insieme dei fattori che tendono a favorire, o a sfavorire, la
tendenza a riprodursi di un dato genotipo.
L'effetto della selezione l'adattamento; in termini evolutivi
indica una variazione dellecaratteristiche di un organismo in
relazione all'ambiente.
FITNESS (w)
Misura lefficienza riproduttiva di un dato
genotipo
Componenti della fitness:
sopravvivenza
tasso di sviluppo
successo nellaccoppiamento
fertilit (n. gameti)
generazioni
generazioni
Selezione e mutazione
Il risultato finale della selezione
leliminazione dellallele
La mutazione fa s che questi alleli
rimangano nella popolazione
Selezione e mutazione hanno effetti
opposti
Accoppiamento assortativo
Individui con un dato genotipo hanno pi probabilit di
accoppiarsi con individui di un altro genotipo di quanto atteso in
base alle loro frequenze
Laccoppiamento assortativo cambia le frequenze genotipiche
Se la probabilit di accoppiamento fra genotipi simili maggiore
rispetto a quanto atteso in base al caso, la frequenza degli
omozigoti tender ad aumentare
Se tale probabilit minore, la frequenza degli omozigoti
tender a diminuire
INBREEDING
Si ha quando laccoppiamento fra individui imparentati pi
frequente rispetto a quanto atteso in base al caso
Causa un aumento della frequenza degli omozigoti e una diminuzione
di quella degli eterozigoti
A
(a1a2)
B
(a3a4)
D
E
A produce 2
ciascuno con
B produce 2
ciascuno con
1/4
1/4
1/4
1/4
B
(a3a4)
A
(a1a2)
1/2
C
1/4
1/2
1/2
D
1/2
1/4
1/16
LA PROBABILITA CHE E SIA OMOZIGOTE PER UNO QUALUNQUE DEI 4
ALLELI PRESENTI NEI NONNI E DATA DALLA SOMMA DELLE PROBABILITA
DEI SINGOLI EVENTI: 1/16 + 1/16 + 1/16 + 1/16 = 1/4
Depressione dellibrido
Riduzione della fitness conseguente
alla pratica sistematica dellinbreeding
Dovuta allomozigosi per alleli recessivi
con effetto deleterio
Si osservano ad es. riduzione di fertilit,
ridotto tasso di sopravvivenza, comparsa di
malformazioni, aumentata suscettibilit alle
infezioni
http://maizeandgenetics.tamu.edu/hybridvigor.htm