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La Nutricin personalizada:
nutrigentica y nutrigenmica
DOLORES CORELLA PIQUER
Conceptos clave
Desde hace dcadas es conocida la existencia de una respuesta interindividual
distinta a la misma dieta, habindose clasificado los individuos con respuestas extremas como hiporrespondedores o hiperrespondedores, en funcin de su
menor o mayor cambio. Sin embargo, los factores implicados en esta diferente
respuesta no son bien conocidos, hipotetizndose una importante modulacin
gentica.
En la Nutricin del siglo XXI ser crucial la incorporacin de los descubrimientos del genoma humano para un mejor conocimiento de la relacin entre dieta
y la salud, as como para el diseo de dietas personalizadas para la prevencin y
tratamiento de la enfermedad.
Actualmente, se estn identificando los principales genes candidatos implicados en la modulacin gentica de la respuesta fenotpica a la dieta. Estos genes
candidatos poseen variaciones en su secuencia que pueden ser utilizadas como
biomarcadores adaptados a cada problema de salud que se est estudiando (DM,
obesidad, cncer, ECV, enfermedades digestivas, alergias, etc.).
Las variaciones ms estudiadas son los polimorfismos de un solo nucletido
(SNP, por sus siglas en ingls: single nucleotide polymorphism), aunque actualmente se estn incorporando otros marcadores genticos como variaciones en el
nmero de copias (CNV, por sus siglas en ingls: copy number variations) y otros
polimorfismos en el genoma.
Los estudios de asociacin de genoma completo (GWA) han permitido identificar nuevos genes hasta ahora desconocidos y que tienen gran inters en Nutricin.
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MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD NUTRICIN EN LAS DIFERENTES ETAPAS Y SITUACIONES DE LA VIDA
1 Variabilidad en la respuesta
a las intervenciones dietticas
La Nutricin personalizada est cobrando cada
da mayor relevancia para conseguir una mayor
eficiencia en la consecucin de los ON. Tras
dcadas en las que se prestaba menos atencin a las particularidades de cada persona en
cuanto a preferencias alimentarias, dificultades
en el seguimiento de las dietas, etc., los profesionales de la Nutricin son cada vez ms conscientes del mayor porcentaje de xito en el resultado de una intervencin diettica si se
dedica una mayor atencin a las caractersticas
individuales de la persona participante para
adaptar mejor las dietas.
Adems de esta personalizacin basada en variables sociodemogrficas (sexo, edad, nivel de
estudios, etc.), conductuales, psicoculturales y
fenotpicas (mayor o menor peso, presencia o
ausencia de hipercolesterolemia, hiperglucemia,
etc.), existe tambin otro nivel ms profundo de
individualizacin de las dietas basado en el genoma. En este sentido, desde hace varias dcadas, decenas de trabajos han demostrado diferencias interindividuales en la respuesta
fenotpica de los individuos a la dieta, fundamentalmente en el mbito de las ECV, la obesidad, la DM, etc.
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16. LA NUTRICIN PERSONALIZADA: NUTRIGENTICA Y NUTRIGENMICA MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD
15
10
5
Porcentaje de cambio
(basal-final)
Hiporrespondedores
-5
-10
Normorrespondedores
-15
-20
-25
-30
Hiperrespondedores
-35
-40
(1)
Fairweather-Tait SJ. Contribution
made by biomarkers of status to
an FP6 Network of Excellence,
EURopean micronutrient
RECommendations Aligned
(EURRECA). Am J Clin Nutr
2011;94:651S-654S.
258
MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD NUTRICIN EN LAS DIFERENTES ETAPAS Y SITUACIONES DE LA VIDA
(2)
Collins FS, Green ED,
Guttmacher AE y col.; US
National Human Genome
Research Institute. A vision for
the future of genomics research.
Nature 2003;422:835-847.
brevemente las generalidades del genoma humano, las importancia del Proyecto Genoma
Humano y la situacin actual del anlisis de las
variaciones en el genoma y su aplicacin en los
estudios nutricionales.
259
16. LA NUTRICIN PERSONALIZADA: NUTRIGENTICA Y NUTRIGENMICA MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD
A
Variaciones cromosmicas
1pb
Pequeas
10 pb
100inserciones-delecciones
pb 1 kb
10 kb
Variaciones puntuales
Variaciones
de un solo nucletido
1pb
10 pb
Variaciones
de un solo nucletido
100 pb
100 kb
1 Mb
10 Mb
100 Mb
1 kb
10 kb
100 kb
1 Mb
10 Mb
100 Mb
B
B
Figura 2. Tipos de variaciones en el ADN en funcin de su tamao (A) y deteccin de las mismas
a travs de la ultrasecuenciacin (B)
260
MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD NUTRICIN EN LAS DIFERENTES ETAPAS Y SITUACIONES DE LA VIDA
(3)
Perry GH, Dominy NJ, Claw
KG y col. Diet and the evolution
of human amylase gene copy
number variation. Nat Genet
2007;39:1256-1260.
(4)
Davey JW, Hohenlohe PA,
Etter PD y col. Genome-wide
genetic marker discovery and
genotyping using next-generation
sequencing. Nat Rev Genet
2011;12:499-510.
261
16. LA NUTRICIN PERSONALIZADA: NUTRIGENTICA Y NUTRIGENMICA MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD
con distintas dietas. Sin embargo, en la actualidad existen cada vez ms estudios de expresin gnica publicados en seres humanos en
los que se analiza la expresin de los genes de
inters en leucocitos o muestras de TA tras el
consumo de diferentes dietas. En estos estudios, el investigador puede centrarse en un
conjunto pre-seleccionado de genes candidatos relacionados con el fenotipo que est investigando (por ejemplo, DM) y analizar estos genes de manera especfica (por ejemplo,
investigar la influencia del consumo de aceite de
oliva sobre los niveles de expresin del gen
POLK), u optar por realizar tcnicas de investigacin masiva de miles de genes al mismo
tiempo utilizando los denominados arrays de
expresin de genoma completo(5). Estos arrays
permiten estudiar el efecto del consumo del alimento o patrn de alimentos elegidos al mismo
tiempo sobre todos los genes del genoma. Mediante un anlisis estadstico complejo, podemos obtener informacin de cuales son los genes sobre- o infraexpresados en comparacin
con una situacin control. Debido a que estas
tcnicas tienen gran variabilidad, actualmente
suelen utilizarse como primer cribado para identificar los genes diferencialmente expresados,
siendo necesaria la posterior validacin de los
genes identificados a travs de estudios de expresin individual mediante RT-PCR. En la Figura 3 se esquematiza este proceso.
En la actualidad se estn publicando muchos
estudios de anlisis de expresin de este tipo,
uno de los pioneros fue el realizado en 2006 por
van Erk y col.(6), en el que estudiaron cmo un
desayuno alto en protenas o alto en HC influa en
la expresin gentica en hombres sanos. Para
ello partieron de ocho voluntarios que sometieron
a los dos desayunos diferentes y analizaron la
influencia de estos desayunos en la expresin del
genoma completo a travs del Affymetrix Human
Expression U133A 2.0 Genechip. Concluyeron
(5)
Masotti A, Da Sacco L, Bottazzo
GF y col. Microarray technology:
a promising tool in nutrigenomics.
Crit Rev Food Sci Nutr
2010;50:693-698.
(6)
van Erk MJ, Blom WA, van
Ommen B y col. High-protein
and high-carbohydrate
breakfasts differentially change
the transcriptome of human
blood cells. Am J Clin Nutr
2006;84:1233-1241.
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Extraccin ARN
Anlisis en chip
de expresin del
genoma completo
Identificacin de genes
diferencialmente expresados
Validacin de genes
Absolute quantification
amplification plot
3,0
2,5
Efectos en el genoma
2,0
1,5
1,0
0,5
0
5 10 15 20 25 30 35 40
Dieta
Elucidacin de
pathways
Figura 3. Esquema de las etapas para el anlisis del efecto de la dieta en la expresin de genes
empleando chips de genoma completo
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16. LA NUTRICIN PERSONALIZADA: NUTRIGENTICA Y NUTRIGENMICA MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD
5 Concepto de genmica
nutricional: nutrigentica
y nutrigenmica
La integracin de los conocimientos y herramientas derivadas de la genmica en el mbito
de las ciencias de la Nutricin ha dado lugar a
la nueva disciplina denominada genmica nutricional(9). La genmica nutricional es una disciplina muy reciente y todava existe cierta confusin en la delimitacin de sus conceptos.
Muchas veces se utilizan como sinnimos los
trminos de genmica nutricional, nutrigentica, nutrigenmica, Nutricin molecular, etc. Sin
embargo, en los tres ltimos aos se est empezando a observar un mayor consenso en la
delimitacin del alcance de estos conceptos(9,10). As, el concepto de genmica nutricional supone una mayor generalizacin, hace
referencia al estudio conjunto de la Nutricin y
el genoma incluyendo todas las dems -micas
derivadas de la genmica, y que dependiendo
de su nivel de actuacin, se han denominado:
transcriptmica (estudio del ARN), protemica
(estudio del proteoma) y metabolmica (estudio
del metaboloma). Un nivel similar de generalizacin se expresa cuando se hace referencia al
concepto de interaccin gen-dieta. Este concepto, ampliamente utilizado por su analoga
con las interacciones gen-ambiente(10), se aplica para expresar la idea del estudio de una influencia conjunta de la susceptibilidad gentica
y un comportamiento ambiental (no gentico),
en este caso la dieta, en la etiologa de una
determinada enfermedad.
Dentro del amplio marco del concepto de genmica nutricional, podemos destacar dos
(7)
Cai Z, Zhao JS, Li JJ y col.
A combined proteomics and
metabolomics profiling of
gastric cardiac cancer reveals
characteristic dysregulations in
glucose metabolism. Mol Cell
Proteomics 2010;9:2617-2628.
(8)
Rakyan VK, Down TA, Balding
DJ y col. Epigenome-wide
association studies for common
human diseases. Nat Rev Genet
2011;12:529-541.
(9)
Ordovas JM, Corella D. Nutritional
genomics. Annu Rev Genomics
Hum Genet 2004;5:71-118.
(10)
Corella D, Ordovas JM. Single
nucleotide polymorphisms that
influence lipid metabolism:
Interaction with Dietary Factors.
Annu Rev Nutr 2005;25:341-390.
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MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD NUTRICIN EN LAS DIFERENTES ETAPAS Y SITUACIONES DE LA VIDA
(9)
Ordovas JM, Corella D. Nutritional
genomics. Annu Rev Genomics
Hum Genet 2004;5:71-118.
(10)
Corella D, Ordovas JM. Single
nucleotide polymorphisms that
influence lipid metabolism:
Interaction with Dietary Factors.
Annu Rev Nutr 2005;25:341-390.
(11)
Brennan RO. Nutrigenetics.
New Concepts for Relieving
Hypoglycemia. M Evans Inc. New
York. 1975.
265
16. LA NUTRICIN PERSONALIZADA: NUTRIGENTICA Y NUTRIGENMICA MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD
relacionarse con una distinta respuesta a la dieta. Paralelamente a nivel nutrigenmico, los estudios de transcriptmica, metabolmica e incluso epigenmicos pueden ir aportando las
bases mecansticas de los efectos observados
a nivel nutrigentico.
7 Ejemplos relevantes
de interacciones gen-dieta
Nuestro grupo de investigacin, liderado por el
doctor Jos M. Ordovs, en el Nutrition and
Genomics Laboratory del Human Nutrition Research Center en Boston, Estados Unidos, ha
sido pionero en la investigacin y publicacin de
las denominadas interacciones gen-dieta que
han sentado las bases del nacimiento de la nutrigentica y de la nutrigenmica. En este sentido, cabe destacar el primer estudio de interaccin gen-dieta publicado por el grupo de
investigacin a principios del ao 2000(12), que
sirvi de base para establecer la metodologa de
la investigacin en nutrigentica y ha sido posteriormente tomado como ejemplo metodolgico por el resto de grupos de investigacin en
genmica nutricional para realizar los posteriores estudios. En dicho trabajo, llevado a cabo
en la cohorte de Framingham, en Estados Unidos, investigamos qu componente de la dieta
poda modificar el efecto del gen APOE en las
concentraciones de LDLc. El gen APOE est
localizado en el cromosoma 19 y codifica una
protena con diversas funciones que ha sido
implicada en el metabolismo lipdico, determinando fundamentalmente las concentraciones
plasmticas de LDLc. Este gen presenta variaciones comunes en su secuencia que dan lugar
a cambios de aa en la protena en posiciones
112 y 158. En funcin de estos cambios, se
distinguen tres alelos en la poblacin, denominados: E2, E3 y E4. El alelo E2 posee el aa cistena en las dos posiciones, el E3 posee cistena
(12)
Corella D, Tucker K, Lahoz C y
col. Alcohol drinking determines
the effect of the APOE locus on
LDL-cholesterol concentrations
in men: the Framingham
Offspring Study. Am J Clin Nutr
2001;73:736-745.
266
MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD NUTRICIN EN LAS DIFERENTES ETAPAS Y SITUACIONES DE LA VIDA
C
A
Salud
G
T
Se admite la variabilidad
en la respuesta a la dieta
en funcin del genoma de
cada individuo
267
16. LA NUTRICIN PERSONALIZADA: NUTRIGENTICA Y NUTRIGENMICA MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD
(13)
Corella D, Peloso G, Arnett DK y
col. APOA2, dietary fat, and body
mass index: replication of a genediet interaction in 3 independent
populations. Arch Intern Med
2009;169:1897-1906.
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MANUAL PRCTICO DE NUTRICIN Y SALUD NUTRICIN EN LAS DIFERENTES ETAPAS Y SITUACIONES DE LA VIDA
(9)
Ordovas JM, Corella D. Nutritional
genomics. Annu Rev Genomics
Hum Genet 2004;5:71-118.
bargo, dadas las crecientes inversiones, se espera que en plazo medio se puedan obtener los
yciencia.es/Archivos/11-07_Ordovas.pdf