Beruflich Dokumente
Kultur Dokumente
ORF
2
Pada gambar diatas. Dapat diketahui yaitu ada dua prediksi ORF.
Dilihat dari ORF 1: diprediksi terdapat 5 ekson. Dimana Init
menandakan adanya ekson pertama yang terdapat start kodon,
sedangkan term yaituekson terakhir dan terdapat stop kodon.
Sedangkan, pada prediksi ORF 2 terdapat 14 ekson.
c. Apakah prediksi urutan asam aminonya dari setiap ORF dan apakah
fungsinya? Berikan data dukung (45)
Tidak adanya fungsi yang ditemukan dari urutan asam amino ORF 1.
Sedangkan urutan asam amino ORF 2 ditemukan data sebagai berikut:
Penjelasan yang didapatkan dari protein katalitik domain (accnumber:
cd14137) yaitu sebagai berikut:
Pada gambar di atas juga menunjukkan bahwa protein tersebut
memiliki ATP binding site dengan 18 residu. Kemudian terdapat axin
binding site dengan 13 residu, dimer interface dengan 25 residu,
polypeptide substrate binding site dengan 12 residu, active site
yaitu 13 residu, dan activation loop (Aloop) dengan 22 residu.
Namun, apabila kita mencari fungsi dari urutan asam amino ORF
yang didapatkan dari CDS di GenBank dari Drosophila
melanogaster, hasil yang ditemukan sebagai berikut:
Urutan asam aminonya yaitu:
Sedangkan untuk urutan asam amino pada ORF 2 GENSCAN, hasil yang
diperoleh yaitu sebagai berikut:
Daerah functional domain yang didapatkan yaitu mengkodekan protein
kinase dom yaitu pada asam amino 1061 hingga 1345.
Juga diprediksi terdapat functional domain lainnya yang ditemukan pada prosite yaitu
Protein kinase ATP(Protein kinases ATP-binding region signature ) (aa1067-aa1091), dan
Protein Kinase ST (Serine/Threonine protein kinases active-site signature) (aa1182-
aa1194).