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Enseñanza del Metabolismo Asistida por Computadora

Miguel Ángel Ordorica Vargas, María de la Luz Velázquez Monroy & Juan Guillermo Ordorica Vargas.
Departamento de Bioquímica. Escuela Superior de Medicina. Instituto Politécnico Nacional. Plan de San
Luis y Díaz Mirón. Del. Miguel Hidalgo. CP 11340. México D.F. Becarios del SIBE-COFAA y del
PEDD-IPN.
Resumen
El metabolismo es uno de los temas que presenta mayor dificultad para los estudiantes de Bioquímica. El
tema es muy amplio y su comprensión requiere de la integración total, la cual no es fácil conseguir en el
aula. Por tal motivo, estamos elaborando material de apoyo, para el estudio asistido por computadora del
metabolismo. Nuestro objetivo es elaborar el esquema básico de las rutas metabólicas estudiadas en el
curso de Bioquímica Médica de la Escuela Superior de Medicina del I. P. N. El material se presenta en
forma de hipertextos elaborados en HTML, para que nuestros alumnos puedan usarlo en cualquier
navegador de WEB.
Introducción
El metabolismo está constituido por secuencias de reacciones químicas, llamadas rutas metabólicas,
controladas por varios mecanismos de regulación. A su vez, las rutas metabólicas también están
relacionadas en forma compleja, de manera que además de la importancia que tienen por si mismas, deben
considerarse de manera integral, como una unidad, para entender las patologías que producen su
desbalance, y diseñar la forma de corregirlos. En todo momento es necesario correlacionar los tres
niveles, primero todos los aspectos químicos de reacciones individuales, luego su ordenamiento, relación
y regulación dentro de las rutas metabólicas y por ultimo el esquema de integración global de estas en el
metabolismo. Entonces, resulta comprensible porque el estudio del metabolismo es la parte más
complicada de la Bioquímica, si no es abordado de la forma correcta desde su inicio. Sí a lo anterior
agregamos los requerimientos de información y formación específicos de cada alumno, el problema del
aprendizaje se vuelve aún mayor.
Una característica sobresaliente de la enseñanza asistida por computadoras es la posibilidad de
individualizar la instrucción. Mediante la planeación e implementación adecuada del material de
instrucción, se puede crear un ambiente de aprendizaje flexible, que se adapte a las necesidades de cada
estudiante. Por ejemplo, es posible brinda apoyo en aspectos básicos, de manera que quienes lo requieran
puedan recurrir a él, en el momento apropiado, y quienes no lo necesiten puedan avanzar con mayor
velocidad. Conforme el alumno avanza se pueden presentar ejercicios de auto evaluación para que él
mismo determine cuando ha adquirido el conocimiento deseado, o si necesita revisar el material
nuevamente. Además, la instrucción asistida por computadora permite adaptar la velocidad de aprendizaje
a cada alumno porque le brinda la posibilidad de revisar el material de aprendizaje tantas veces como sea
necesario. Por último, pero no menos importante, el estudiante puede utilizar el material cuando y donde
lo considere necesario.
Por todo lo anterior, desde hace algún tiempo, en el Departamento de Bioquímica de Escuela Superior de
Medicina del IPN, nos dimos a la tarea de crear recursos de enseñanza de este tipo, algunos de los cuales
fueron presentados en ediciones anteriores de este foro. Recientemente el Instituto Politécnico Nacional ha
establecido programas para estimular en forma importante el avance en este campo, a la par que se plantea
el desarrollo de un nuevo modelo educativo en el que se aproveche al máximo dichos recursos. En este
trabajo describimos el material para el aprendizaje del metabolismo intermediario que hemos desarrollado
hasta hoy, como apoyo para los estudiantes del curso de Bioquímica Médica. Nuestra meta es crear un
ambiente de aprendizaje global, que resulte atractivo y estimulante para los estudiantes, y los ayude a
lograr la comprensión del metabolismo, y su importancia para su desempeño como profesionales de la
Medicina.
La idea central del proyecto es que al seguir las reacciones químicas que forman el metabolismo, los
alumnos tengan acceso a los principios de química, termodinámica y cinética que requirieran, y mediante
los vínculos apropiados, vayan construyendo las relaciones que les permitan la integración del tema.
También planeamos presentar, en donde sea conveniente, vínculos a diversos aspectos de interés médico,
como uso diagnóstico, patologías y terapias, relacionados con las enzimas e intermediaros que participan
en las reacciones del metabolismo.
Desde que iniciamos nuestro trabajo, sabíamos de la existencia de recursos semejantes, muchos de ellos
de gran calidad, accesibles a través de Internet, así que parecería que nuestro esfuerzo es redundante. Sin
embargo, también sabemos que la mayoría de dichos recursos están elaborados en inglés u otro idioma,
distinto al español, y es nuestra experiencia como docentes que en la realidad, el idioma coloca estos
recursos fuera del alcance de la mayoría de nuestros estudiantes.
Métodos
Medio de elaboración. Como primer paso de nuestro trabajo, decidimos elaborar nuestro ambiente de
estudio en lenguaje HTML. Tomamos esta decisión a sabiendas que todos nuestros alumnos tienen en sus
computadoras versiones recientes de los navegadores de WEB que les permitirán seguir usar el material
sin problemas. Además, las características del hipertexto de las versiones modernas de este lenguaje
permiten establecer con facilidad vínculo entre temas e incluir imágenes, sonidos y material de otro tipo
mediante el uso de programas accesorios (plug-in). Cuando dichos programas no son estándar, siempre
usamos programas de dominio público (freeware) o gratuitos, que incluimos junto con el material de
instrucción, o bien los dirigimos a ellos mediante vínculos, para que los alumnos los instalen en sus
computadoras, y puedan emplear el material sin problemas. Aunque sabemos que existen programas
enfocados a la elaboración de este tipo de apoyos en ambientes realmente multimedia, los tiempos y
ubicación de nuestro sitio de trabajo, nos hacen difícil el acceso a ellos y por otro lado, a pesar de ser muy
simple, hasta el momento, el HTML ha resultado adecuado a nuestros propósitos.
Contenido. Elaboramos un esquema básico del metabolismo intermediario, que cubre totalmente el
contenido del curso de Bioquímica Médica que se imparte en nuestra escuela. En dicho esquema,
identificamos un número mínimo de intermediarios que nos permitiera enlazar las vías metabólicas
principales, tomando como base el metabolismo como se presenta en los textos de Bioquímica que
empleamos como referencia en el curso.
Iniciamos el trabajo elaborando un esqueleto básico con la vía de la glicólisis y su continuación al ciclo de
Krebs y la cadena respiratoria. Después, le añadimos otras rutas del metabolismo de glúcidos, y
actualmente estamos iniciando el trabajo en el metabolismo de lípidos.
Para cada reacción química de las vías, elaboramos un documento HTML que contienen la información
siguiente

• nombre y clasificación de la enzima que la cataliza


• nombre y estructura química de sustratos, productos e intermediarios
• tipo de reacción y su mecanismo, cuando es conocido
• regulación de la enzima y su relación con el funcionamiento de la vía de que forma parte y con el
metabolismo general

Además se incluye vínculos a datos de interés médico conocidos como:

• empleo diagnóstico de la enzima


• patologías por deficiencia, exceso o fallas en la regulación
• y terapias en las que se involucre la modificación de su actividad.
Para facilitar el trabajo, cuando se elabora el documento correspondiente, indicamos los vínculos
apropiados, aunque en la mayoría de los casos aún no hemos elaborado el documento al que se refiere.
Resultados
Mapa metabólico. En la Figura 1, presentamos el esquema del mapa metabólico que elaboramos para
nuestro proyecto. En él se indican los intermediarios que consideramos básicos, que usamos únicamente
como referencia. Encerrados en figuras geométricas, rectángulo o círculos, se presentan los nombres de las
vías metabólicas que se estudian.

Figura 1. Esquema resumido del Metabolismo Intermediario.


Los nombres de las vías del mapa, están vinculados a esquemas de las rutas metabólicas correspondientes,
por ejemplo, al hacer clic sobre el nombre del Ciclo del Ácido Cítrico, se abre el documento que contiene
el esquema de esta ruta. (Figura 2)

Figura 2. Esquema del Ciclo del Ácido Cítrico


Ejemplo. En la Figura 3 se muestra la imagen de ventan del documento HTML para la enzima Isocitrato
deshidrogenasa, del Ciclo del Ácido Cítrico, como ejemplo del formato que estamos dando a nuestros
documentos. También se muestra la ventana que se abre cuando se hace clic sobe el nombre de uno de los
sustratos, la Acetil-Coenzima A (Acetil-CoA)
El resto de las características del material, como la vinculación y el material gráfico y de otro tipo, no se
puede incluir en un texto estático como este, pero se demostrará durante la ponencia.
Discusión y Conclusiones
Como se muestra en la Figura 1, el trabajo esta en su inicio y aún falta mucho por hacer sin embargo, los
primeros grupos de alumnos a los que hemos presentado el material, comentan favorablemente sobre su
uso. Estos comentarios nos animan a continuar nuestro trabajo, pero no nos hacen perder de vista la
necesidad de una evaluación controlada que nos permita soportar esta información anecdótica. Como parte
del proyecto, estamos planeando el mecanismo de dicha evaluación.

Figura 3. Izquierda, documento HTML de la enzima Citrato Sintasa. Derecha, Forma tridimensional del
intermediario metabólico Acetil-CoA.
Algunos alumnos nos han comentado sobre la necesidad de evitar que la presentación de la información se
vuelva tediosa. En este aspecto, la creatividad debe ser nuestro principal recurso, pero también sabemos
una mejor preparación nos permitirá mejorar la calidad del material. Dentro de nuestras posibilidades,
estamos actualizándonos en el diseño e implementación de documentos HTML. Siguiendo estas
consideraciones, los comentarios que se puedan generar en la presentación nos serán de mucha utilidad.
Otros alumnos consideran que el material sería más útil si se incluye información sobre aspectos básicos
de Química, Física, Biología y Matemáticas, que ellos necesitan para comprender mejor los temas que se
van tratando. Estos comentarios no nos sorprenden, sabemos por la experiencia, que la mala preparación
en materias básicas es la limitante principal de la mayoría de los alumnos.
En realidad, ya habíamos considerado la inclusión de este tipo de material, pero como una extensión del
proyecto, porque queremos completar el esquema metabólico básico lo más pronto posible. Con la
inclusión de este material contaremos con un verdadero ambiente global de aprendizaje de la Bioquímica,
lo cual constituye nuestra meta final.
Bibliografía
Robert K. Murray, Daryl K. Ganner, Peter A. Mayes y Victor W. Rodwell.
“Harper. Bioquímica Ilustrada” 16a edición. 2004. El Manual Moderno.
Christopher K. Mathews, K. E. van Holde y Kevin G. Ahern.
”Bioquímica”. 3a edición. 2003. Addison Wesley.
Michael W. King. “The Medical Biochemistry Page”.
(http://www.indstate.edu/thcme/mwking/home.html)
2004. Indiana State University
Karl J. Miller. ”The Metabolic Pathways of Biochemistry”.
(http://www.gwu.edu/~mpb/)
1998. The George Washington University
Jim Hardy. “Pathways”.
(http://ull.chemistry.uakron.edu/Pathways/)
1999. University of Akron
Título:

Enseñanza del Metabolismo Asistida por Computadora


Autores:
Miguel Ángel Ordorica Vargas, María de la Luz Velázquez Monroy & Juan Guillermo Ordorica
Vargas.
Institución:
Escuela Superior de Medicina.
Instituto Politécnico Nacional.
Ponente:
M. en C. Miguel Ángel Ordorica Vargas.
Departamento de Bioquímica. Escuela Superior de Medicina. Instituto Politécnico Nacional.
Plan de San Luis y Díaz Mirón. Del. Miguel Hidalgo. CP 11340. México D.F.
Tels:
57 29 63 00 extensión 62791
53 96 70 98
Fax:
53 41 53 57
Email:
ordorica_vargas@prodigy.net.mx
Necesidades de equipo:
Computadora con lectora de disco laser, 2 Mb libres en disco duro con Proyector digital.
Grupo de Trabajo:
4. Modelo de uso de tecnologías

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