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Qu es la
epigentica ?
Blanca Alicia Delgado-Coello

l ADN basura (junk DNA) es un concepto inte- Waddington desarroll el concepto del paisaje

E resante, que recuerdo haber escuchado alguna


vez en mis clases de licenciatura. En ese enton-
ces no se saba la funcin de estos tramos de
cido desoxirribonucleico (ADN). A travs de los aos
este concepto ha cambiado, y ahora se sabe que este
epigentico, que se visualiza como cimas y valles que
representan regiones con alta y baja concentracin de
marcas epigenticas, respectivamente. El paisaje epi-
gentico describe las opciones que una clula en un
embrin sigue en puntos clave del desarrollo, y se diri-
material gentico no codificante (es decir, que no con- ge hacia un punto u otro por accin de factores induc-
tiene informacin para producir protenas) es funda- tores embrionarios o genes hometicos (aquellos que, al
mental en la regulacin de la expresin gentica, y sufrir mutaciones, producen cambios en las rutas del
ocupa la mayor parte del genoma humano. desarrollo y ocasionan defectos fenotpicos conocidos
Dado lo complejo del tema, esta revisin tiene como transformaciones hometicas; Slack, 2002).
como objetivo ilustrar en forma sencilla lo que se en- En la actualidad, el trmino epigentica se entien-
tiende por epigentica, y su estrecha relacin con la de como la regulacin gnica mediada por modificacio-
genmica. Enseguida, se tratar el impacto del cmulo nes de la estructura de la cromatina (material gentico
de conocimientos en esta rea, no slo a nivel de in- empaquetado alrededor de protenas), o como aquellos
vestigacin bsica, sino socialmente, al ver cmo esta cambios heredables en la expresin gentica que son
regulacin est directamente involucrada con enferme- independientes de la secuencia de nucletidos, es de-
dades complejas como cncer y diabetes, entre otras. cir, que ocurren sin cambios en la secuencia del ADN.
Por ltimo, se intenta una visin prospectiva de los Una generalizacin til es que, a mayor tamao del
alcances de la aplicacin de la epigentica a largo genoma, mayor complejidad tendr la regulacin epi-
plazo, como podran ser terapias gnicas perfectamen- gentica (Mager y Bartolomei, 2005). Ms an si to-
te dirigidas a la cura o control de enfermedades que mamos en consideracin que la mayora del genoma
son reguladas por cambios epigenticos. eucarionte es no codificante. Si bien la regulacin epi-
gentica ocurre implcitamente en organismos euca-
riontes, considerados evolutivamente superiores, cabe
Qu es epigentica? destacar que los mecanismos de regulacin gentica
El trmino epigentica fue introducido en los basados en la metilacin de ADN son comunes a virus
aos cincuenta por Conrad H. Waddington, quien y bacterias.
la concibi como el anlisis causal del desarrollo, Los organismos eucariontes tienen un alto grado de
que implica todas las interacciones de los genes con su compartamentalizacin, y presentan un ncleo don-
medio ambiente. de se alberga el ADN altamente condensado, que se

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conoce como cromatina. La unidad bsica de la cro- ADN para transcribirla a una molcula de cido ri-
matina es el nucleosoma, formado por un octmero de bonucleico, ARN, para que pueda salir del ncleo y
protenas llamadas histonas (dos de cada una de las his- dirigir la fabricacin de protenas en el citoplasma
tonas H2A, H2B, H3 y H4), rodeado por 147 pares de celular) y, por tanto, la expresin gentica (Jenuwein
bases de ADN. La cromatina adquiere un grado mayor y Allis, 2001). Las combinaciones posibles de modifi-
de compactacin al incorporarse una histona ms, la caciones a las histonas son mltiples; algunas combi-
H1, que permite el agrupamiento de seis nucleosomas naciones son especficas de un sitio, y se han asociado
para formar la estructura llamada solenoide. El siguien- con activacin o represin de genes.
te y mayor nivel de compactacin est dado por el cro- Los mecanismos que intervienen en la regulacin
mosoma metafsico. La importancia de la cromatina epigentica son: 1) la metilacin del ADN; 2) las modi-
radica en que mantiene estrictamente regulado el acce- ficaciones post-traduccionales de las histonas; y 3) la
so de protenas reguladoras con sitios de unin al ADN. remodelacin (o remodelaje) de la cromatina depen-
Las modificaciones de las histonas alteran la es- diente de ATP (Recillas y Escamilla, 2004).
tructura de los nucleosomas y por tanto de la cromati-
na, y activan as el proceso de transcripcin, en los que 1. Metilacin del ADN. En eucariontes superiores, la
la cromatina est en estado de eucromatina (confor- metilacin de citosinas en dinucletidos CpG se
macin laxa, en que la informacin del ADN puede ser traduce en una represin transcripcional determi-
leda), o estado apagado, en que la cromatina adop- nada por una cromatina en conformacin compac-
ta conformacin de heterocromatina (conformacin ta, y por tanto inaccesible. En el genoma normal,
compacta, que impide la lectura), respectivamente la metilacin del ADN ocurre en secuencias repeti-
(Figura 1). das y en sitios de secuencias de insercin virales y
El llamado cdigo de histonas predice que las transposones. De esta forma, se mantiene estable el
modificaciones de stas determinan la unin de prote- genoma y se evitan inestabilidades cromosmicas
nas llamadas factores remodeladores de la cromati- propias de una clula tumoral. La metilacin del
na al nucleosoma; stos a su vez regularan el acceso ADN es fundamental para sealar qu genes deben
de otras protenas, los factores de transcripcin, sus encenderse o apagarse de manera definitiva en mo-
cofactores y en general la maquinaria de la transcrip- mentos especficos del desarrollo, o para procesos
cin (el proceso por el que se lee la informacin del como la inactivacin del cromosoma X, impronta

Figura 1. Modificaciones de histonas que confieren una conformacin laxa (eucromatina) o compacta (heterocromati-
na). (Tomado de Jenuwein y Allis, 2001.)

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Ubiquitinacin (lisina)

Desubiquitinacin Ubiquitinacin

HATs
HATs PRMTs
Acetilacin (lisina) Metilacin (lisina, arginina)
HDACs
Lisina desmetilasa (LSD1)
Nucleosoma Arginina desmetilasa
Histonas

Cinasas Fosfatasas

Fosforilacin (serina, treonina)

Figura 2. Marcas epigenticas en histonas: HATs (acetiltransfrasas de histonas); HDACs (desacetilasas de histonas); HMT
(metiltransferasas de histonas); PRMTs (metiltransferasas de protena-arginina). (Tomado de Tomasi y colaboradores, 2006.)

gentica, recombinacin y mantenimiento de la es- talk, y potencian eventos de represin epigentica.


tabilidad genmica. Un ejemplo es que ocurra metilacin de un promo-
2a.Modificacin de histonas o marcas epigenticas. Las tor determinado y alteraciones en la cromatina por
modificaciones covalentes ocurren en residuos acetilacin o desacetilacin de histonas. La lisina
especficos del extremo amino-terminal de las his- se acetila en la cromatina que contiene ADN en
tonas, o en regiones internas de las mismas. Las transcripcin activa, y se desacetila para reprimir
modificaciones pueden ocurrir por acetilacin, fos- la transcripcin. Despus de la desacetilacin, las
forilacin, metilacin, ubiquitinacin, sumoilacin histonas son metiladas, lo que conduce al recluta-
(proceso similar a la ubiquitinacin) y ADP-ribosi- miento de metiltransferasas de ADN, que metilan
lacin (Figura 2), y ocurren jerrquicamente, en las islas CpG, provocando una hipermetilacin del
ciertos casos mutuamente excluyentes. La metila- promotor y el silencio transcripcional del gen.
cin de histonas ocurre en lisinas (pueden ser 2b.Variantes de histonas. Existe un intercambio din-
mono, di o trimetiladas) y argininas (mono o dime- mico de histonas o variantes de histonas en la cro-
tiladas); la acetilacin, ubiquitinacin, y sumoila- matina, que se correlaciona con el estado transcrip-
cin, en lisinas, y la fosforilacin en residuos de cional de un locus determinado. En el ratn se han
serina y treonina. La trimetilacin de histonas es detectado variantes como protaminas o macro-H2A,
considerada ms estable que la fosforilacin, la ubi- que se correlacionan con cambios epigenticos (Ma-
quitinacin y la acetilacin. Los cambios en histo- ger y Bartolomei, 2005). Una de las variantes de
nas son reversibles, para lo que existen enzimas que histonas ms estudiadas de los ltimos aos es la
se encargan de remover las modificaciones. histona H3.3, la cual se encuentra incorporada de
Los mecanismos de metilacin de ADN e histo- manera activa a la cromatina en zonas transcrip-
nas se interrelacionan a travs del llamado cross cionalmente activas (Schwartz y Ahmad, 2005). El

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nucleosoma tiene, adems del tetrmero H3-H4 y tilacin en lisinas de histonas son mucho ms
de los dmeros H2A-H2B, una molcula de la his- numerosos en el ser humano que en la levadura.
tona H1 (que forma parte de una familia compleja c) Chaperonas intercambiadoras de histonas. Estas prote-
de protenas) la cual se une al ADN de nucleosomas nas se encargan de facilitar el intercambio de his-
en sitios de secuencia desconocida. A pesar de no tonas ncleo e histonas variables, en particular
contar con una variante de la histona H1, sta durante la fase duplicativa del genoma. Algunas de
inhibe el deslizamiento del nucleosoma, condensa estas protenas pueden interactuar con la maquina-
la cromatina y reprime la transcripcin. Aparente- ria transcripcional, aumentando la complejidad de
mente, H1 puede modular la condensacin de la la forma en que se reconocen los loci especficos
cromatina alterando la accesibilidad de protenas para intercambio de histonas.
remodeladoras tales como los complejos remodela- d) Protenas delimitadoras (insulator). Son secuen-
dores dependientes de ATP, SWI/SNF. cias a las cuales se unen factores transcripcionales
3a.Formacin de asas (looping) y conformacin local. y protenas con actividad remodeladora de la cro-
La estructura de la cromatina local se ha definido matina, que bloquean o facilitan la formacin de
por su accesibilidad a la maquinaria transcripcio- asas de cromatina local e interacciones entre ele-
nal. El modelo de looping postula la formacin mentos reguladores (que pueden ser secuencias
de asas (bucles) de cromatina que favorecen la acti- potenciadoras o enhancers). Por ejemplo la pro-
vacin transcripcional, acercando elementos de re- tena CCCTC (CTCF), que se une a elementos
gulacin distales a los promotores que deben ser especficos del ADN y evita interacciones entre pro-
activados. motores y potenciadores en cis. Adems, estas se-
3b.Estructuras de la cromatina de orden superior. En la cuencias contribuyen a definir la autonoma de un
actualidad se han confirmado las nociones de que dominio gnico consistente con sus funciones deli-
en los cromosomas existen territorios definidos de mitadoras.
eucromatina y heterocromatina. e) Complejos modificadores de la cromatina. Son com-
plejos formados por protenas que pueden incluir
Para la ejecucin de las modificaciones epigenti- molculas de los otros grupos mencionados, y cuya
cas se han identificado protenas y ARNs que pueden composicin es regulada en tiempo y espacio. En
clasificarse en seis grupos (Mager y Bartolomei, 2005): aos recientes se han caracterizado un conjunto de
complejos multipeptdicos conocidos como com-
a) Metiltransferasas de ADN (DNMTs) y protenas con plejos de remodelaje dependientes de ATP, cuya
dominios de unin metil-CpG (MBD o MeCP). El funcin es la de movilizar nucleosomas para dejar
nmero de isoformas vara de acuerdo a la especie; al descubierto u ocultar secuencias blanco en el
en el ratn se han descrito cuatro DNMTs y seis ADN, como por ejemplo los complejos SWI/SNF
MBDs. (Switch/Sucrose non fermenting), NURF (nucleosome-
b) Protenas modificadoras de histonas. Incluyen a las remodeling factor) y CHRAC (chromatin-accessibility-
metiltransferasas (HMT, por histone methyl transfera- complex; Lusser y Kadonaga, 2003). Otro ejemplo
se), acetiltransferasas (HAT, por histone acetyl trans- es el de los complejos Polycomb (PCG) y
ferase), desacetilasas (HDAC, por histone deacetyla- Trithorax (TRXG), que participan de manera nega-
se), y cinasas como MAPK (por mitogen activated tiva y positiva, respectivamente, en la regulacin
protein kinase) y SAPK (por stress activated protein epigentica de algunos loci y en la identificacin de
kinase). Coherentemente con la nocin de que a actividad modificadora de histonas en estos com-
mayor tamao genmico, mayor complejidad epi- plejos (Lund y van Lohuizen, 2004). An no se
gentica, el nmero de metiltransferasas aumenta sabe con certeza la funcin de dichos complejos,
de manera dramtica de eucariontes inferiores a pero s se ha reportado la relacin del complejo
eucariontes superiores. Igualmente, los sitios de me- PCG en la regulacin de genes de control del ciclo

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celular. Asimismo, la expresin anormal de las pro- modificaciones epigenticas, como metilacin de ADN
tenas de los complejos PCG y TRXG se asocia con y modificaciones de histonas, de manera muy especfi-
la aparicin de distintos tipos de cncer (ver revi- ca. En Arabidopsis, planta silvestre de la familia de la
sin de Recillas y Escamilla, 2004). mostaza, se tiene evidencia de que, en respuesta a se-
f) Transcritos no codificantes. Este grupo comprende ales del ARN, distintas metiltransferasas de ADN, que
genes cuya actividad particular no se conoce, aun- metilan secuencias CG y citosinas adyacentes (no
que se sabe que participan en la regulacin epi- CG) cooperan entre s y con enzimas modificadoras
gentica. Tal es el caso de ARNs no codificantes y de histonas para establecer y mantener un estado inac-
microARNs. En eucariontes se ha descrito que usan tivo en un promotor blanco homlogo. La metilacin
ARN para silenciar transgenes, transposones y par- del ADN, en este caso, puede ser causa y consecuen-
sitos genmicos como mecanismos de defensa. Los cia del silenciamiento, probablemente debido a que
ARNs de doble cadena con especificidad para un existe semejanza estructural entre hbridos pequeos
gran nmero de genes se procesan para dar origen ARN-ADN, que son sustrato de nuevas mutilaciones, y
a ARNs pequeos (21-23 nucletidos), que son horquillas de replicacin de ADN, donde pueden pre-
mediadores del mecanismo de interferencia del servarse modificaciones epigenticas preexistentes.
ARN. Los genes de microARNs intervienen a nivel Los factores epigenticos alteran el fenotipo sin
transcripcional y post-transcripcional en el silen- cambiar el genotipo. La visin clsica de estas varia-
ciamiento de genes en el ncleo. ciones fenotpicas tiene su origen a travs de cambios
genticos y medioambientales. Sin embargo, an en
poblaciones homogneas genticamente es posible ob-
Importancia prctica de la servar variaciones de origen epigentico que surgen de
epigentica manera aleatoria o como resultado de estrs fisiolgi-
En plantas, el silenciamiento gentico mediado co. Tales variaciones pueden transmitirse va mitosis y
por ARN ms comn ocurre en el citoplasma, y se meiosis. Desde el punto de vista mdico, estas observa-
denomina silenciamiento post-transcripcional de ciones se traducen en el
genes; en animales se llama ARN de interferencia, y reconocimiento de que la
en hongos como Neurospora crassa, sofocamiento regulacin epigentica es
(quelling). La importancia de este mecanismo radica clave en la comprensin de
en que interviene durante el desarrollo en la defensa las enfermedades complejas,
del genoma y en la arquitectura cromosmica de ml-
tiples eucariontes. Adems, existe evidencia de que las
interacciones de secuencias ARN-ADN pueden dirigir

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y que a la vez es un mecanismo que puede explicar que delaje de la cromatina, el cual regula a su vez la me-
si un gameto o un embrin es expuesto a situaciones tilacin del ADN, su replicacin, recombinacin, re-
de estrs, esto lo predisponga en un futuro a padecer paracin y expresin gentica. Aparentemente, las
alguna enfermedad (Cho y colaboradores, 2004). distorsiones en el remodelaje de la cromatina durante
En la literatura se dice que, dado que muchos tipos el desarrollo tienen relacin con una memoria mole-
de cncer albergan numerosas mutaciones, existe una cular que predispone a sufrir enfermedades en etapas
inestabilidad genmica, que implica deficiencias en adultas (Cho y colaboradores, 2004). Los mecanismos
la reparacin del ADN o en la integridad cromosmica. de acetilacin y desacetilacin de histonas se encuen-
En la actualidad, esta visin se ve complementada por tran estrechamente relacionados con la presencia de
la inestabilidad epigentica, relacionada con los eventos cncer y otros trastornos. La actividad anormal de las
que se describen a continuacin: desacetilasas de histonas reprime la transcripcin y
De los mecanismos epigenticos descritos, varios de conduce a neoplasias, dado que se ven alterados genes
ellos tienen estrecha relacin con el origen de distintas directamente involucrados con el control del ciclo
neoplasias. La metilacin del ADN es un mecanismo celular, la apoptosis, la reparacin de ADN y la funcin
involucrado en la regulacin durante el crecimiento del proteosoma.
normal. Pero cuando la metilacin es inadecuada, lle- A manera de conclusin sobre lo que se sabe del
va en general a un crecimiento acelerado, y ste a su cncer, es claro que la evasin del sistema inmune por
vez al cncer, en particular cuando dicha metilacin tumores obedece en gran medida a eventos epigenti-
anormal tiene como blanco genes supresores de tumo- cos que no conllevan mutaciones, y que la epigentica
res u oncogenes. Se ha llegado a sugerir que el silen- es de gran importancia, pues conjuntamente con las
ciamiento epigentico en cncer puede ser una causa mutaciones los eventos epigenticos son responsables
de inactivacin de genes tan frecuente como pueden del inicio y progresin de un proceso neoplsico
serlo las mutaciones (Tomasi y colaboradores, 2006). (Tomasi y colaboradores, 2006; Baylin y Ohm, 2006).
La metilacin de zonas originalmente no metilables Se ha propuesto que los mecanismos epigenticos
(islas CpG) que corresponden comnmente a promo- pueden intervenir en enfermedades complejas como la
tores de genes supresores de tumores, genes inhibido- esquizofrenia, y aun cuando se sabe del sustento genti-
res de cinasas dependientes de ciclina o a genes de co que subyace a estos trastornos, slo se han sugerido
reparacin de ADN, est directamente relacionada con genes candidatos para explicar problemas psiquitricos,
el origen y progresin de tumores, como los cnceres como aquellos que codifican para los receptores de
colorrectales espordicos y las neoplasias intraepitelia- dopamina, serotonina y N-metil-D-aspartato (NMDA).
les precursoras del cncer de prstata. A futuro, un reto ser el entender la etiologa gentica
Otro mecanismo epigentico relacionado con dis- de los desrdenes psiquitricos mediante un abordaje
tintas neoplasias y sndromes diversos es el de remo- que considere de manera sistemtica factores genti-
cos y epigenticos. La bsqueda de frmacos que ac-
ten a nivel de remodelaje de cromatina y sean capa-
ces de cruzar la barrera hematoenceflica ser de vital
importancia en el conocimiento y control teraputico
de estas enfermedades.
Un campo de indudable importancia mdica se re-
laciona con las consecuencias del tratamiento de pa-
rejas con problemas de fertilidad mediante mtodos
de reproduccin asistida (que incluye fertilizacin in
vitro y procedimientos relacionados). Los escasos es-
tudios de seguimiento de nios concebidos por repro-
Tomado de: http://medicinacuantica.net/?p=1581 duccin asistida indican que es frecuente un bajo peso

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al nacer, aun de embarazos con un solo producto, pero


no han evidenciado defectos en el desarrollo.
A primera vista, la observacin de bajo peso no
parece fuera de lo comn, pero precisamente este par-
metro es controlado en parte epigenticamente; de ah
su importancia. Un estudio report que, adems del
bajo peso, los defectos mayores al nacimiento se dupli-
caron. Otro mecanismo epigentico relacionado con
la reproduccin asistida es el de impronta genmica, que
implica expresin gentica monoallica dependiente
del origen parental del alelo. Los genes improntados
generalmente se ubican cerca de islas CpG o dominios
ricos en GC que se metilan de manera distinta si pro-
vienen del padre o de la madre. La expresin de
genes dirigidos por impronta genmica es frecuen-
temente especfica para cada tejido. El fenmeno
de impronta genmica es fundamental durante
el desarrollo embrionario, y la prdida de la expre-
sin monoallica produce la desregulacin de ge-
nes, como oncogenes y algunos supresores de
tumores (Recillas y Escamilla, 2004).

Epigentica en el futuro
El campo de la epigentica en su
mxima expresin es relativamente
nuevo y muy dinmico, dado que es
un rea interdisciplinaria donde intervie-
nen anlisis de tipo estructural, molecular, celular, de
biologa del desarrollo, imagenologa, genmica, pro-
temica, bioinformtica y de matemticas aplicadas.
Entender la informacin que alberga el ADN de los
organismos y su regulacin, tanto gentica como epi-
gentica, requiere grandes esfuerzos humanos y econ-
micos. Por ello, en 2004 se form el consorcio deno-
minado Red Epigenmica de Excelencia (NoE, por sus seguridad; quiz el cncer pueda tratarse con drogas
siglas en ingls, Network of Excellence), cuyos objetivos que inhiban las desacetilasas de histonas y a las metil-
en un futuro tendrn impacto en el conocimiento de transferasas de ADN.
los mecanismos epigenticos bsicos que subyacen la Actualmente se reconoce que la epigentica es fun-
biologa humana, y las enfermedades asociadas a ellos. damental en la comprensin del desarrollo de los ma-
Los avances en el conocimiento de la regulacin mferos: sin esta regulacin, la embriognesis normal
epigentica y cncer darn lugar a nuevas terapias. En no ocurrira. Adems, en el genoma humano es fre-
estudios clnicos preliminares se ha probado que la cuente la presencia de elementos ricos en secuencias
hiperacetilacin de histonas y la desmetilacin del CpG, que son objeto potencial de modificacin epi-
ADN pueden usarse en humanos con buen margen de gentica.

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Genmica y epigentica: el epigenoma cin gentica contenida, pero ello todava requiere
Si el genoma representa la infraestructura bsica mucho estudio para obtener mayor conocimiento so-
de la vida, la epigentica se encarga de estudiar bre aspectos evolutivos del genoma humano. En las
cmo trabaja, considerando factores genticos, aproximadamente 3.1 109 (3.1 mil millones) de
topolgicos y ambientales, para comprender la plas- pares de bases que conforman el genoma humano, hay
ticidad propia del genoma. La combinacin de estas cerca de 25 mil genes, distribuidos entre zonas sin
disciplinas origina la epigenmica (Figura 3). genes de hasta 3 megabases (millones de pares de ba-
El conocimiento de la secuencia total del genoma ses), pero cuya distribucin no parece ser aleatoria, y
humano gener muchas expectativas sobre su aplica- est altamente conservada en la evolucin. La alta fre-
cin biomdica, aunque es claro que esto tardar al- cuencia de edicin alternativa por gen da lugar a una
gunos aos. Una expectativa a un plazo menor es el gran variabilidad de protenas traducidas, es decir, una
conocimiento fundamental de la cantidad de informa- gran diversidad en el proteoma.

Medio ambiente

Destino celular
RNAs no-codificantes Clulas madre

Cdigo epigentico Regeneracin


Modificaciones de la cromatina

Naturaleza de la memoria celular Ensamblaje y Identidad celular


herencia
Control Memoria
transcipcional celular

Herencia epigentica Envejecimiento

Silenciamiento basado en RNA


Impronta de lnea germinal (X y impronta)
Disfuncin epigentica

Enfermedad

Medio ambiente

Figura 3. Impacto del control epigentico: las modificaciones bioqumicas del A D N (metilacin, hexgonos pequeos) y
las histonas (metilacin, hexgonos grandes), acetilacin (tringulos) y fosforilacin (crculos), ocurren como respuesta
a condiciones ambientales, y modulan la estructura de la cromatina. La organizacin de la cromatina controla el acceso
de protenas como factores de transcripcin (valos) al A D N , y por lo tanto regula la expresin gentica. El control epi-
gentico tiene gran influencia en multitud de procesos biolgicos con implicaciones para la agricultura, la biologa
humana y las enfermedades asociadas a la estructura del A D N , adems de permitir conocer mejor los procesos que invo-
lucran clulas troncales, cncer y envejecimiento (tomado de Akhtar y Cavalli, 2005).

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En el humano se han des-


crito 481 UCEs que son con-
servados tambin en rata y ratn,
y un 45 por ciento del ADN consis-
te de elementos repetidos intercalados
con elementos no repetidos. Una expli-
cacin a su naturaleza ultraconserva-
da es que son elementos promotores
(enhancer) de genes cercanos.
Es evidente que la informacin pro-
vista por la secuencia del genoma humano
no tiene sentido si no se analiza en su conjun-
to: la informacin gentica bsica no puede ser
leda ni entendida si no se toma en consideracin
su entorno real, compuesto por la organizacin del
genoma en cromatina. La relevancia del epige-
noma es an ms sobresaliente si consideramos
que cerca de un 98 por ciento del genoma hu-
mano es no codificante, y que las secuencias
El genoma humano ha permitido la intergnicas, lejos de representar ADN basura,
identificacin de muchos genes con una tienen la responsabilidad de llevar a buen tr-
funcin asociada, pero muchos otros mino la expresin regulada de los genes en
cuya funcin es desconocida, como los tiempo y espacio.
llamados fragmentos transcritos (trans-
frags), cuya transcripcin podra estar
relacionada en la reorganizacin de do- Conclusiones
minios de cromatina, de forma que puedan Aunque se reconoce la importancia de los meca-
transcribirse en etapas posteriores del desarrollo en nismos modificadores de histonas, an se desco-
una manera controlada, o para que secuestren polime- noce cmo las clulas descifran las seales que
rasas de ARN y algunas protenas accesorias. As, la disparan estos cambios.
importancia biolgica de la transcripcin sera el con- Considerando el carcter reversible de la mayora
trol de la disponibilidad de factores basales de trans- de las modificaciones epigenticas, es factible en un
cripcin y especficos para cada tipo de clula. futuro el uso de frmacos epigenticos, que permitan
Posiblemente los ARNs no codificantes tengan fun- corregir o disminuir trastornos como los implicados en
ciones reguladoras, dado que en el ADN existe evi- las enfermedades complejas.
dencia de que muchos genes apagan su transcripcin Dada las diferencias entre individuos, ser posi-
en cadenas codificantes y no codificantes. Otros ARNs ble, mediante terapias especficas, el anlisis y tra-
no codificantes son los microARNs, cuyos genes pueden tamiento individual de enfermedades reguladas epige-
sumar ms de 800 en el genoma humano. Muchos son nticamente.
de funcin desconocida, pero se tiene evidencia de su La gran mayora de los procesos biolgicos que ocu-
papel en la regulacin a nivel transcripcional y pos- rren durante la vida de una clula requieren de una
transcripcional. Destacan tambin en el genoma hu- estricta interdependencia entre procesos genticos y
mano secuencias de promotores actuando en cis que epigenticos, para as coordinar las acciones del geno-
controlan la actividad gentica de los llamados ele- tipo con el epigenotipo, y viceversa.
mentos ultraconservados (UCEs, por sus siglas en ingls).

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Agradecimientos Lecturas recomendadas


A la Universidad Autnoma de la Ciudad de Mxico por la Akhtar, A. y G. Cavalli (2005), The epigenome network
imparticin de diplomados en genmica de alta calidad, con of excellence, PLoS boil., vol. 3, p. 177.
la presencia de importantes especialistas en el campo. Agra- Baylin, S. B. y J. E. Ohm (2006), Epigenetic gene silencing
dezco infinitamente a Flix Recillas Targa, Elisa Azuara Licea- in cancer a mechanism for early oncogenic pathway
ga y Jaime Mas Oliva por la minuciosa correccin y por sus
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82 ciencia enero-marzo 2011

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