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Abstracto
El descubrimiento de que la expresin gnica puede ser controlada por el Watson-Crick de
apareamiento de bases de ARN pequeos con los ARN mensajeros que contienen secuencia
complementaria - un proceso conocido como interferencia de ARN - marcadamente ha
avanzado nuestra comprensin de la regulacin de genes eucariotas y funcin. La
capacidad de las secuencias cortas de ARN para modular la expresin de genes ha
proporcionado una poderosa herramienta con la que estudiar la funcin de genes y va a
revolucionar el tratamiento de la enfermedad. Sorprendentemente, a pesar de ser tan slo
una dcada desde su descubrimiento, el fenmeno ya est siendo utilizado teraputicamente
en ensayos clnicos en humanos, y las empresas de biotecnologa que se centran en
productos teraputicos basados en la interferencia del ARN ya se negocian pblicamente.
Hace slo diez aos, el repertorio funcional del ARN se ampli con el descubrimiento en el
nematodo Caenorhabditis elegans 1 que naci ARN de doble cadena (dsRNA) pueden
desencadenar el silenciamiento de las secuencias de ARN mensajero complementarias, y el
trmino "interferencia de ARN" (ARNi). Poco despus, dsRNAs cortos - o ARN de
interferencia cortos (siRNAs) (revisado en ref. 1 ) - se generaron artificialmente y se usan
para demostrar que este proceso tambin se produce en clulas de mamfero, por lo general,
pero no siempre, sin desencadenar la innata tem sys inmune , que normalmente reconoce
ARN como parte de un mecanismo de defensa antiviral (vase la pgina 421). El
conocimiento de que los pequeos RNAs pueden afectar la expresin gnica ha tenido un
enorme impacto en la investigacin bsica y aplicada, y ARNi es actualmente uno de los
nuevos enfoques ms prometedores para la terapia de la enfermedad.
Que el ARNi puede ser activado in vivo en mamferos se mostr por primera vez en los
animales infectados con el virus de la hepatitis B 2 . Esto fue seguido por la primera
aplicacin teraputica de siRNAs: siRNAs estaban dirigidos a Fas mRNA en un modelo de
ratn de la hepatitis autoinmune, lo que resulta en la proteccin de los animales tratados
contra la fibrosis heptica 3 . En 2004, slo seis aos despus del descubrimiento de RNAi,
las primeras terapias humanas basadas en siRNA - desarrollados como tratamientos para la
degeneracin macular relacionada con la edad hmeda - entraron en la fase I de ensayos
clnicos. El ARNi es uno de los campos de ms rpido avance en la biologa, y el flujo de
los descubrimientos da verdadero sentido a la expresin "desde el banco a la cabecera '.
Aunque se sabe mucho sobre los mecanismos de RNAi, hay una serie de retos que las
aplicaciones de esta tecnologa silenciamiento de genes necesitan para vencer. Por un lado,
RNAi es un mecanismo regulador de fundamental importancia en la clula, y aprovechando
que en inters de beneficio teraputico podra resultar en efectos secundarios.
Exgenamente introducido secuencias de ARN de doble cadena pueden secuestrar
componentes que constituyen la maquinaria celular implicada en el silenciamiento de genes
(vase la pgina 396), reduciendo as la accesibilidad de la maquinaria a una clase de ARN
pequeos conocidos como microRNAs (miRNAs) que estn entrando en la va celular
natural 4 , 5 . Adems, algunos siRNAs sintticos contienen motivos de secuencia que
pueden inducir interfern de tipo I respuestas y estimular la produccin de citoquinas pro-
inflamatorias 6 - 8 .
Durante los ltimos aos, muchos cientficos han buscado soluciones para superar estas
limitaciones y para aumentar la seguridad de los potenciales teraputicos basados en RNAi.
Este artculo explora las recientes estrategias para minimizar los efectos secundarios
indeseables, describe nuevos enfoques para la entrega y discute las terapias RNAi que se
estn probando. Como se prev que esta tecnologa se puede aplicar a una variedad cada
vez mayor de las enfermedades, los problemas potenciales y soluciones que podra un da
transformar RNAi en un tratamiento convencional para enfermedades humanas merecen
una atencin especial.
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Figura 1
Los mecanismos de silenciamiento de genes celulares
tabla 1
Pequeos RNAs celulares implicados en el silenciamiento de genes
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Allanamiento de morada
Las aplicaciones teraputicas de siRNAs requieren la entrega eficaz a las clulas diana y
tejidos. Las dos estrategias principales son la entrega de siRNAs (entrega no viral)
sintetizado qumicamente, o la entrega de shRNA-codificacin de los genes de los virus de
ingeniera que en ltima instancia generar siRNAs por transcripcin en las clulas diana.
de administracin no viral
Figura 2
En las estrategias de prestacin vivo para siRNAs teraputicos
Dos polmeros que han sido examinados por sus propiedades de suministro se
atelocolgeno y quitosano. Los quitosanos tienen propiedades mucoadhesivas y se han
utilizado para la entrega intranasal a las clulas epiteliales bronquiolares 43 . Administracin
intranasal ha demostrado ser un medio eficaz para la entrega de siRNA en ratones 44 y en
primates no humanos 45 para bloquear la infeccin por virus respiratorio sincitial del tracto
respiratorio superior. De hecho, la entrega de siRNAs a las membranas mucosas parece ser
un enfoque eficaz en general. Por ejemplo, la entrega de siRNAs intravaginal lpidos
encapsulado de orientacin virus del herpes simple 2 (HSV-2) proporcion proteccin
contra la infeccin viral letal en ms de dos tercios de los ratones tratados con siRNA 46 .
Un avance importante para la entrega de siRNA fue la aplicacin con xito de partculas
lipdicas de cidos nucleicos estables decoradas con poli etilenglicol (PEG) cadenas
polimricas (denominados SNALPs) para la entrega de siRNAs dirigidos contra APOB
ARNm (APOB -targeted siRNAs) para los hgados de primates no humanos 50 . En este
caso, el efecto de ARNsi de una nica inyeccin intravenosa dur ms de 11 das y dio
como resultado objetivo mayor que 90% desmontables y no toxicidad 50 . Estos resultados
emocionantes han aumentado la confianza en el potencial de siRNAs teraputicos para el
tratamiento de enfermedades hepticas.
Hasta hace poco, la mayora de los enfoques para la administracin in vivo se han dirigido a
un rgano particular, principalmente los ojos, los pulmones o el hgado. Un avance
significativo en la seleccin de siRNAs a una clase especfica de leucocitos implicadas en
la inflamacin intestinal ahora se ha informado 51 . En este estudio, una ciclina D1 (Cyd1) -
targeted siRNA se carg en nanopartculas estabilizadas, las superficies de las cuales
incorporan un anticuerpo especfico para un receptor expresado por los leucocitos. Las
nanopartculas que contienen siRNA dirigidos regulados hacia abajo el objetivo de ciclina
D1, la proliferacin de leucocitos suprimida y revirti la colitis inducida experimentalmente
en ratones 51 .
Otro enfoque interesante que permite la entrega de siRNA sistmica y dirigida utiliza una
protena de fusin de protamina-anticuerpo 58 . El resto de protamina est ligada a la regin
de unin a antgeno de cadena pesada (Fab) de un anticuerpo para el virus de la
inmunodeficiencia humana 1 (VIH-1) protena de la envoltura gp160. La protamina cargada
positivamente se une los siRNAs con carga negativa - que estn dirigidos en contra de la
mordaza gen VIH - permitiendo la administracin selectiva a las clulas que expresan la
protena de envoltura gp160 en sus superficies 58 . Esto da como resultado la internalizacin
del complejo anticuerpo-siRNA, la liberacin de los siRNAs y regulacin a la baja de los
Gag-codificacin de las transcripciones de VIH en un modelo murino in vivo. En este
mismo estudio, la fusin a la protamina de un anticuerpo especfico para el receptor de la
hormona de ERBB2 permiti siRNA dirigidos de las clulas cancerosas que expresan ese
receptor 58 .
entrega Viral
Un medio alternativo de activacin de RNAi es a travs de secuencias de siRNA-promotor
expresado transformados a base de shRNAs o miARN imita. Los genes que codifican estas
estructuras de horquilla se insertan ms comnmente en las columnas vertebrales de
vectores virales bajo el control de la pol II o pol III promotores. Una ventaja potencial de
entrega de vectores es que una sola administracin desencadena la expresin a largo plazo
de la RNAi teraputico. Esto es particularmente apropiado para las enfermedades vricas
crnicas como el VIH y la hepatitis viral.
Los vectores lentivirales se han utilizado con xito para entregar construcciones shRNA en
varios sistemas de mamfero. Por ejemplo, se demostr que la regulacin a la baja de un
oncogn Ras activado por un shRNA entregado-lentiviral como resultado la supresin del
crecimiento tumoral en ratones 63 . Y la baja regulacin de la expresin de una forma
mutante de la superxido dismutasa 1 (SOD1) en modelos de ratn de la esclerosis lateral
amiotrfica retras la aparicin de la enfermedad 64 , 65 . Ms recientemente, un vector
lentiviral se utiliz para entregar un Smad3 -targeted shRNA para la regeneracin de las
clulas satlite y reparacin del tejido muscular de edad en edad y heridos 66 . La expresin
viral-vector de shRNAs tambin se ha explorado en modelos de ratn de enfermedades
neurodegenerativas como la enfermedad de Huntington y la enfermedad de Alzheimer 67 .
Para administrar genes al sistema nervioso central, los vectores adenovirales han
demostrado ser muy tiles. Por ejemplo, la inyeccin directa del cerebro de un vector
adenoviral que expresa un shRNA dirigido contra el mRNA que codifica la SCA1 codifica
transcripcin polyQ-albergar de ataxia espinocerebelosa tipo 1 ha demostrado ser un
tratamiento eficaz en un modelo de ratn de este trastorno 68 .
A pesar de los xitos de la entrega viral, es importante tener en cuenta que, aunque algunos
virus no son patgenos, siguen siendo potencialmente inmunognica. Otra preocupacin
importante con esta tcnica es el riesgo de incurrir mutaciones en secuencias virales,
haciendo que la mutagnesis de insercin o activacin de la expresin gnica aberrante. Sin
embargo, los vectores virales pueden transducir clulas que se dividen ambos y que no se
dividen, producir una expresin prolongada del gen teraputico y no necesitan ser
entregados en grandes dosis. En ltima instancia, cualquier gen teraputico cuando se
expresa en grandes cantidades tiene el potencial de causar toxicidad e inmunogenicidad.
Los parmetros crticos tales como la tolerancia, la expresin a largo plazo, la eficacia y la
capacidad de regular la expresin y la orientacin deben tenerse en cuenta a la hora de
elegir un mtodo de entrega. No existe un sistema ideal de entrega para cada aplicacin;
ms bien, el mtodo de entrega tiene que adaptarse a la aplicacin.
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Tabla 2
Los actuales ensayos clnicos de terapias basadas en el ARNi
Otras dos empresas tambin se estn centrando en los tratamientos a base de siRNA contra
la degeneracin macular: de Merck Sirna Therapeutics (San Francisco, California) con un
siRNA (siRNA-027) que se dirige al receptor de VEGF VEGFR1, y Quark Pharmaceuticals
(Fremont, California), en colaboracin con Silence Therapeutics (Londres y Berln;
previamente SR Pharma), con una excepcin dirigida contra un gen inducible por hipoxia,
RTP801 (tambin conocido como DDIT4), que se sabe que estn implicados en la
progresin de la enfermedad. Este siRNA, RTP801i-14, ha sido licenciada a Pfizer, Reino
Unido, que ahora se est ejecutando un ensayo clnico / IIA fase. Quark farmacuticos
tambin ha recibido el estatus de IND para otro ensayo preclnico, en el que est
actualmente reclutando pacientes. Este ensayo es para un siRNA dirigidos a TP53 ARNm
(que codifica la protena p53), la inhibicin de lo que retrasa la induccin de las vas de
muerte celular y por lo tanto reduce la lesin renal aguda despus de la ciruga.
Algunas compaas, como Regulus Therapeutics (Carlsbad, California), han optado por
centrarse en los miRNAs como dianas teraputicas. Santaris Pharma en Hrsholm,
Dinamarca, ha comenzado recientemente el primer ensayo de fase I para dirigirse a un
miARN humana (miR-122). En este ensayo, el miR-122 est siendo objeto de regulacin a
la baja con un cido nucleico bloqueado (LNA) anti-miARN (SPC3649). LNA es una
modificacin del esqueleto que potencia la hibridacin del oligonucletido con su diana y
lo protege de la degradacin por nucleasas. El enfoque est destinado a tratar la infeccin
por el virus de la hepatitis C, porque el miR-122 facilita la replicacin de este virus en el
hgado 72 , 73 . Regulacin a la baja de miR-122 tambin es potencialmente til en el
tratamiento de la hipercolesterolemia. MiRNAs dirigidos expresan en el corazn, como
miR-208, que regula la hipertrofia cardiaca y fibrosis 74 , pueden tener una ventaja, ya que
en el campo de la medicina hay una considerable experiencia en la entrega de
medicamentos directamente en este rgano.
Las complejidades de regulacin de miRNAs tambin deben tenerse en cuenta a la hora sea
la ablacin o la restauracin de la funcin de los genes miARN est siendo considerado en
un entorno teraputico. Una sola miARN puede regular los niveles de cientos de protenas
de 78 , 79 , levantando banderas de advertencia sobre las consecuencias de la regulacin
negativa o ectpica expresar incluso una sola especie miARN.
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El problema de seguridad
La aplicacin de siRNAs a la teraputica ha planteado una serie de preocupaciones acerca
de su seguridad. Despus de la excitacin inicial, un nmero de informes subray
inconvenientes potenciales para esta tecnologa prometedora. La primera advertencia fue
realizada por un estudio que registra la muerte de los ratones despus de la expresin
dirigida por el promotor Pol III de shRNAs en el hgado 4 . Los mecanismos exactos que
conducen a la mortalidad estn todava bajo investigacin, pero parecen ser debido al
menos en parte a la saturacin del factor de transporte, exportin 5, que los transbordadores
miRNAs desde el ncleo hasta el citoplasma. En la actualidad hay indicios de que otros
factores que intervienen en el proceso de ARNi tambin pueden ser saturados por la
expresin de alto nivel de siRNAs exgenas, que pueden secuestrar ellos de sus miRNAs
celulares afines. Debido a que cada miRNA celular potencialmente puede modular la
expresin de varios cientos de genes 78 , 79 , alteraciones menores en la va de miRNA
pueden tener importantes consecuencias.
Una de las estrategias para mitigar este problema es usar la menor concentracin posible de
siRNAs que proporciona eficacia teraputica mediante el diseo de los siRNAs exgenos a
ser sustratos Dicer (mediante el aumento de su longitud). Estos ARN entran en la va de
RNAi aguas arriba del RISC en la etapa de Dicer de escisin, lo que facilita pasar el siRNA
a AGO2 para la seleccin de la hebra gua, a menudo resulta en una mayor RNAi a
concentraciones ms bajas que se puede lograr con la entrega exgena de cognado 21
siRNAs -Base 80 - 83 . Aunque no se espera que las pequeas cantidades de siRNAs para
saturar la maquinaria RNAi, que pueden competir con los miRNAs para la incorporacin
selectiva en el RISC 5 . Las consecuencias a largo plazo de este tipo de competencia, son
poco conocidos.
A pesar de que an no han alcanzado una solucin universal para evitar los efectos de todo
fuera de objetivo, es previsible que estos problemas se pueden superar mediante el uso de
modificaciones del esqueleto apropiadas, as como sistemas de liberacin que puede
enmascarar los ARN de los receptores de la inmunidad innata sistema 94 .
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Sin embargo, aunque se ha avanzado mucho, todava quedan obstculos que dificultan la
carrera a la clnica. El objetivo ltimo de lograr terapias basadas en el ARNi para
enfermedades potencialmente mortales o debilitantes no puede alcanzarse sin una mejora
de la seguridad, la eficacia y la fiabilidad de los sistemas de suministro de ARNi-gatillo. El
uso de estrategias de administracin dirigida que permita la liberacin sistmica ser un
gran paso hacia el cumplimiento de esta tarea difcil. El desarrollo de nuevos mtodos, de
imagen no invasivas para supervisar la administracin in vivo de siRNAs, como el
etiquetado con tintes de infrarrojo cercano 95 , ayudar a los estudios de biodistribucin y la
captacin tisular.