Sie sind auf Seite 1von 14

was sollte man nun wissen?

(Kapitel: Nukleotide, DNA)


- Bestandteile, Aufbau und wichtigste Funktionen von Nukleotiden

- Worin unterschieden sich die Nukleotide von DNA und RNA?

- Warum kann ATP als Energielieferant dienen?

- Aufbau und Struktur der DNA, was versteht man unter DNA-Sequenz?

- Organisation des Genoms: Unterschiede Pro- zu Eukaryonten

- was wird unter Basenkomplementaritt verstanden und welche Auswirkungen hat diese
auf die DNA-Replikation?

- wichtige Stufen der DNA-Synthese (Replikation)

1
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

RNA (Ribonukleinsure)

RNA unterscheidet sich von DNA durch:

Anstelle von Desoxyribose wird bei der RNA


als Zucker Ribose verwendet.

Anstelle der Base Thymin enthlt die RNA


die Base Uracil.

RNA liegt fast immer als Einzelstrang vor


(Basenpaarung durch rumliche
Faltung mglich).

2
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

RNA (Ribonukleinsure)
RNA kommt in der Zelle in 3 Formen vor:

RNA Funktion Anteil ungefhre Gre


mRNA bertrgt Information aus dem Zellkern 5% 100-10000 Nukleotide
(messenger RNA, zu den Ribosomen (Abschrift des Gens)
Boten-RNA)

tRNA transportiert Aminosuren zu den Ribosomen 15% 80-90 Nukleotide


(transfer RNA) wo die Proteinsynthese stattfindet.

rRNA bildet zusammen mit einem Proteinanteil 80% bei Eukaryonten 4 Arten
(ribosomale RNA) die Ribosomen mit ca. 120, 150, 1700 +
3500 Nukleotiden

3
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

Vom Gen zum Protein: RNA-Synthese - Transkription

Die Nukleotidsequenz eines Gens bestimmt


die Aminosuresequenz eines Proteins!

Transkription: mRNA wird nach der in der


DNA kodierten Information erzeugt
basierend auf Basenpaarungen
(Basenkomplementaritt)

Translation: die in der mRNA enthaltene


Information wird an den Ribosomen in
Protein bersetzt unter Beteiligung von
tRNAs
Grundlage ist der genetische Code

Genexpression 4
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

RNA-Synthese - Transkription

Prinzip: hnlich wie Replikation


es wird jedoch nicht die gesamte DNA abgeschrieben, sondern nur ein kleiner Teil
ein Gen (oder mehrere Gene: Operon)
eine Genkopie = mRNA entsteht

Voraussetzungen:
- DNA-abhngige RNA-Polymerase
- DNA als Matrize
- Ribonukleosid-Triphosphate
(ATP, GTP, CTP, UTP)
- Mg2+

DNA
5 GCGGCATCGTACGCTA 3
3 CGCCGTAGCATGCGAT 5 DNA-Matrize

5 GCGGCAUCGUACGCUA 3
mRNA = Gegenstck zur DNA-Matrize
5
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION: Bakterien
1) Initiation: erfolgt an bestimmtem DNA-Abschnitt = Promoter
bei Bakterien: TTGACA (bei -35) und TATAAT (bei 10) als Konsensus

- RNA-Polymerase gleitet DNA entlang


bis zum Promoter.
- Untereinheit bindet an den Promoter
(abhngig von Konsensus-Sequenz)
- Polymerase entwindet die DNA
- Untereinheit verlsst die RNA-Polym.
- das Core-Enzym beginnt mit der
Transkription

6
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION: Bakterien
RNA-Polymerase von E. coli

Core Enzym

Core-Enzym
Holo-Enzym
(vollstndige RNA-Polymerase)
7
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION: Bakterien

-Elongation: Erzeugung des mRNA-Stranges durch Einbau


des passenden Nukleotids und dessen
Verknpfung
Synthese in 5 3 Richtung
Weiterbewegung des Enzyms an der DNA

- Termination: am Terminator
(GC-reiche Region gefolgt von AU-reicher Sequenz)
fhrt zur Bildung einer Haarnadelstruktur in der
synthetisierten RNA
RNA dissoziiert von DNA-Matrize und vom
Enzym ab

8
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION
Prokaryoten Eukaryoten
Gene sind in Operons zusammengefat. einzelne Gene
Eine mRNA kann das Transkript fr mehrere Gene Eine mRNA enthlt das Transkript nur eines Gens
enthalten (polycistronisch). (monocistronisch).
Transkription und Translation sind gekoppelt. Das Transkription und Translation sind nicht verbunden.
Transkript wird schon whrend der Transkription Transkription erfolgt im Kern, Translation im Cytosol
translatiert. Prokaryotische mRNA wird ko- (Cytoplasma) ermglicht kompliziertere Regulation
transkriptionell translatiert. kein Zellkern! der Genexpression
Genregulation findet nicht nur ber die
Genregulation findet ber die Transkriptionsrate statt. Transkriptionsrate statt, sondern kann auch ber RNA-
Processing, RNA-Stabilitt und RNA-
Translatierbarkeit realisiert werden.
nur eine RNA-Polymerase (mehrere Untereinheiten) besitzen 3 Typen von RNA-Polymerasen:
synthetisiert mRNA, tRNA, rRNA I: in Nukleoli: transkribiert rRNA Gene
II: im Kernplasma: synthetisiert mRNA
III: im Kernplasma: synthetisiert tRNA

Wenig oder keine Modifikation der mRNA Umfangreiche Processierung der mRNA (zB. Splicing)

Promotoren enthalten TATA-Box und andere Elemente,


die von Transkriptionsfaktoren erkannt werden
9
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION: Eukaryonten

RNA-Polymerasen von Eukaryonten:

- Aufbau aus vielen Untereinheiten


- mache UE werden von allen 3 Polymerasen genutzt
- Bindung an DNA durch grte UE
- Bindung der Nukleotide durch zweitgrte UE
- die drittgrte UE bernimmt eine Stabilisierungsfunktion

Transkription:
- Start am Promoter
- zustzliche Transkriptionsfaktoren ntig
- im Bereich von 29 bis 34 liegt die TATA-Box
- sonst wenige gemeinsame Strukturen eukaryontischer
Promotoren

10
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION: Eukaryonten
Allgemeine Transkriptionsfaktoren des RNA-Polymerase II -Komplexes

TF ntig, damit RNA-Polymerase II


effizient an den Promoter binden kann

Dieser Komplex wird auf allen Genen


ausgebildet und ist damit nicht fr eine
spezifische Regulation der Genexpression
verantwortlich!

11
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION

Eukaryonten:
nur wenige % des Genoms kodieren fr Proteine.
Cap: enthlt Methylguanylat Schutz gegen Abbau, Bindung ans Ribosom bei Translation
poly(A) Tail: ca. 250 A-Reste
Splicing: Entfernen der Introns 12
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION: Introns/Exons

Eukaryonten enthalten unterbrochene Gene


bestehend aus:

Introns: nicht-kodierende Sequenz zwischen


2 Exons

Exons: kodierende Sequenzen, die in mRNA


bersetzt werden und fr Teile
des Proteins kodieren

13
I. Grundlagen der Biochemie: zentrale Molekle des Lebens: Nukleotide

TRANSKRIPTION: Splicing der eukaryontischen mRNA

Introns beginnen, enthalten und enden


mit spezifischen Sequenzen

kleine mit Proteinen assoziierte RNA-


Molekle (snRNPs) binden die mRNA
und bilden groe Komplexe
(Spleiosomen)

beim Spleien entstehen intermedire


Lassostrukturen

snRNPs: kleine Kern-Rinonucleoprotein-


partikel 14