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Matriz de distancias
En matemtica, una matriz de distancias es una matriz cuyos elementos representan las distancias entre los puntos, tomados por pares, de un conjunto. Se trata, por lo tanto,
de una matriz simtrica de tamao NxN (dado un conjunto de N puntos en el espacio eucldeo) conteniendo nmeros reales no negativos como elementos. El nmero N de
pares de puntos, (N-1)/2, es el nmero de elementos independientes en la matriz de distancias.

Las matrices de distancias estn relacionadas con las matrices de adyacencia, diferencindose en que las ltimas slo informan sobre qu vrtices estn conectados, pero no
especifican costes o distancias entre los vrtices; adems, cada elemento de una matriz de distancias es ms pequeo cuanto ms cercanos se encuentren los puntos, mientras
que vrtices cercanos (conectados) producen elementos mayores en una matriz de adyacencia.

Supngase, por ejemplo, el siguiente conjunto de datos a analizar, donde la distancia euclidiana entre pxeles es la mtrica de la distancia:

Datos en bruto.
distancia
La matriz de distancias podra ser: del espacio eucldeo equivale a la longitud del
segmento de la recta que los une, expresado
a b c d e f numricamente. En espacios ms complejos,
a 0 184 222 177 216 231 como los definidos en la geometra no

b 184 0 45 123 128 200

c 222 45 0 129 121 203

d 177 123 129 0 46 83

e 216 128 121 46 0 83

f 231 200 203 83 83 0

Estos datos pueden ser vistos de forma grfica como un mapa de calor. En la siguiente imagen, el negro denota una distancia de 0, representando el blanco la distancia
mxima:

Vista grfica.

En bioinformtica se usan las matrices de distancias para representan estructuras de protenas de una forma independiente de las coordenadas, adems de como distancias de
emparejamiento entre dos secuencias. Son usadas en alineamientos tanto estructurales como de secuencias, y en la determinacin de las estructuras de las protenas en RMN
(resonancia magntica nuclear) o cristalografa de rayos X.

Algunas veces es ms convenientes expresar la informacin como una matriz de sustitucin.

Vase tambin
Algoritmo de agrupamiento
Alineamiento de secuencias
Alineamiento estructural
Matriz de sustitucin
Visin artificial

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