Seminario de Gentica 1 07/09/2016

Genoma humano

Dra. M.I. Pigozzi- Fmed UBA

Genomas nuclear y mitocondrial

Genoma nuclear Genoma mitocondrial
Tamao 3300 Mb 16.6 kb
No. de distintas molculas de ADN 23 (en XX) or 24 (en XY) todas lineales Una molcula de ADN circular
No. total de molculas de ADN por 23 en clulas haploides; 46 en clulas Varios miles
clula diploides
Protenas asociadas Varias clases de histonas y no histonas Libre de protenas
No. de genes ~ 20 000 37
Densidad gnica ~1 / 40 kb 1 / 0.45 kb
ADN repetitivo Fraccin grande Muy poco
Transcripcin La mayora de los genes se transcriben Transcripcin continua de
individualmente varios genes
Intrones Presentes en la mayora Ausentes
% de ADN codificante ~3% ~93%
Recombinacin Al menos una vez por cada par de homlogos No evidente
Herencia Mendeliana para las secuencias del X y los Exclusivamente materna
autosomas; paterna para las secuencias del Y

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Genoma humano: qu aprendimos

Alrededor del 1,5% del genoma codifica para protenas
Las secuencias repetidas que no codifican para protenas
constituyen al menos el 50% del genoma humano
Algunas secuencias repetidas no tienen funciones directas, pero
influyen en la estructura de los cromosomas.
Los genes parecen distribuirse en regiones al azar, con grandes
regiones intermedias de ADN no codificante
La secuencia del genoma es casi (99.9%) idntica en todas las
personas
Se han identificado unos 3 millones de sitios en el genoma donde
la secuencia del ADN entre individuos difiere en un nico nucletido
(Polimorfismos de Nucletido Simple = SNPs).

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Polimorfismos de Nucletido Simple

(SNP)
Individuo 1

Individuo 2

Individuo 3

Individuo 4

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Polimorfismos de Nucletido Simple

(SNP)
Variantes de un solo par de nucletidos en una secuencia
de ADN entre una parte de la poblacin y otra
La variante debe darse en al menos un 1% de los
individuos para considerarse como SNP
La diferencia de secuencia en el genoma entre dos
individuos es de ~0.1%
Eligiendo dos personas al azar: diferencia entre genomas ~
3 millones de diferencias
Se estudian para determinar la relacin entre las
secuencias y enfermedades comunes como la diabetes,
enfermedades cardiovasculares, artritis y el cncer.

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Clasificacin de las secuencias de ADN

Segn su grado de repeticin
De alta repeticin (ADN satlites o el centrmero)
De moderada repeticin (Retroposones, transposones, ADN
telomrico, familias gnicas, microsatlites, minisatlites)
De secuencia nica (Genes, ADN intergnico no repetido)

Segn su funcin
De elementos propios (ARNs y protenas)
Codificantes De elementos accesorios (retroposones, transposones)

De funcin estructural (ADN satlites y telomrico)

No codificantes De funcin regulatoria (Promotores, reguladores)
De funcin desconocida (ADN intergnico)

Adaptado de Gentica humana. AJ Solari 4 Edicin

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El ADN codificante de protenas es alrededor

del 1,5% del genoma humano
Porcentaje

intrones
elementos simil-retrovirus regiones codificantes de protenas = EXONES

fsiles de transposones slo de ADN

ELEMENTOS GENTICOS MVILES

ADN no repetitivo que no
est en exones ni intrones

SECUENCIAS REPETIDAS SECUENCIAS NICAS

Introduccin a laFmed
Dra. M.I. Pigozzi- Biologa
UBA Celular. Alberts y col 3 Edicin

Clasificacin de las secuencias de ADN

Segn su grado de repeticin
De alta repeticin (ADN satlites o el centrmero)
De moderada repeticin (Retroposones, transposones, ADN
telomrico, familias gnicas, microsatlites, minisatlites)
De secuencia nica (Genes, ADN intergnico no repetido)

Segn su funcin
De elementos propios (ARNs y protenas)
Codificantes De elementos accesorios (retroposones, transposones)

De funcin estructural (ADN cetromrico y telomrico)

No codificantes De funcin regulatoria (Promotores, reguladores)
De funcin desconocida (ADN intergnico)

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Tipos de ADN repetitivo

n x 106 copias 10 copias a n x 104 copias

Centrmeros

Familias
gnicas

Muy polimrficos

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ADN altamente repetido: satlite (ADN

centromrico)

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Tipos de ADN satlite

n x 106 copias

Tipo Tamao de la Localizacin cromosmica

repeticin
(ADN 171 bp Heterocromatina centromrica de
alfoide) todos los cromosomas
(Sau3A 68 bp Centromeric heterochromatin of 1, 9, 13,
family) 14, 15, 21, 22 and Y
Satellite 1 25-48 bp Centromeric heterochromatin of most
(AT-rich) chromosomes and other
heterochromatic regions
Satellite 2 and 5 bp Most, possibly all, chromosomes
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Clasificacin de las secuencias de ADN

Segn su grado de repeticin
De alta repeticin (ADN satlites o el centrmero)
De moderada repeticin (Retroposones, transposones, ADN
telomrico, familias gnicas, microsatlites, minisatlites)
De secuencia nica (Genes, ADN intergnico no repetido)

Segn su funcin
De elementos propios (ARNs y protenas)
Codificantes De elementos accesorios (retroposones, transposones)

De funcin estructural (ADN satlites y telomrico)

No codificantes De funcin regulatoria (Promotores, reguladores)
De funcin desconocida (ADN intergnico)

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ADN moderadamente repetido

Repeticiones en tandem Repeticiones dispersas

ADN telomrico Retroposones o Pseudogenes

procesados:
Micro- y minisatellites SINEs (short interspersed elements)
LINEs (long interspersed elements)
Familias gnicas
Familias gnicas

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Tipos de ADN repetitivo

n x 106 copias 10 copias a n x 104 copias

Centrmeros

Familias
gnicas

ADN
Telomrico

Muy polimrficos

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ADN moderadamente repetido en tandem:

ADN telomrico

Secuencia del ADN telomrico en diferentes organismos

n x 104 copias

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ADN moderadamente repetido

n x 106 copias 10 copias a n x 104 copias

Centrmeros

Familias
gnicas

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ADN moderadamente repetido en tandem:

ADN minisatlite (VNTRs) y microsatlites

Huella dactilar gentica

Determinacin del
nmero de copias
de minisatlites

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Tipos de ADN repetitivo

n x 106 copias 10 copias a n x 104 copias

Centrmeros

Familias
gnicas

Muy polimrficos

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Secuencias repetidas dispersas: Pseudogenes procesados

y Retrotransposones

- Son copias no funcionales de los exones de un gen

- Se originaron por accin de la retrotranscriptasa de algunos virus a

partir de transcriptos de la ARNpol II o de la ARNpol III

- Principales secuencias repetidas dispersas en el genoma humano:

o SINEs: (Ej: familia Alu)

o LINEs: (familia L1)

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SINEs (Short Interspersed Nuclear Elements)

Elementos dispersos cortos

En el humano : familia de secuencias Alu

Secuencia de ~300 pb

500.000 copias (10% del genoma)

Localizadas predominantemente en las bandas R (G+C)

Parece originada a partir del gen que codifica para el ARN de la PRS, copiado
por una transcriptasa inversa e insertado en el ADN

Importancia clnica: tienen movilidad (aunque en bajo porcentaje) y esto puede

causar que se inserten dentro de un gen causando mutaciones

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LINEs (Long Interspersed Nuclear Elements)

Elementos dispersos largos

En el humano : secuencias L1

Secuencia de 6,4 kb

10.000 copias

Localizadas en las bandas G (T+A)

Parece originada a partir de ARNm (o sea de transcriptos de la RNApol II),

copiado por una transcriptasa inversa e insertado en el ADN (tiene cola poli A y
algunas tienen marco de lectura abierta)

Importancia: tienen movilidad (aunque en bajo porcentaje) y esto puede causar

que se inserten dentro de un gen causando mutaciones

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Clasificacin de las secuencias de ADN

Segn su grado de repeticin

De alta repeticin (ADN satlites o el centrmero)
De moderada repeticin (Retroposones, transposones, ADN
telomrico, familias gnicas, microsatlites, minisatlites)
De secuencia nica (Genes, ADN intergnico no repetido)

Segn su funcin
De elementos propios (ARNs y protenas)
Codificantes De elementos accesorios (retroposones, transposones)

De funcin estructural (ADN satlites y telomrico)

No codificantes De funcin regulatoria (Promotores, reguladores)
De funcin desconocida (ADN intergnico)

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Exoma: conjunto de todas las regiones del genoma que

codifican para protenas
- El exoma comprende aproximadamente el 1,5% del genoma.
- All se concentran ms del 85% de las mutaciones que causan las
enfermedades Mendelianas.

Porcentaje

intrones
elementos simil-retrovirus regiones codificantes de protenas = EXONES

fsiles de transposones slo de ADN

ELEMENTOS GENTICOS MVILES

ADN no repetitivo que no es
exn ni intrn

SECUENCIAS REPETIDAS SECUENCIAS NICAS

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Qu es un gen?

DEFINICIN CLSICA: unidad elemental de la herencia

que codifica la informacin de un rasgo

DEFINICIN MOLECULAR:
-clsica: segmento de ADN que codifica una protena
-modificada: segmento de ADN que codifica un polipptido
-actual: segmento de ADN que contenga una unidad de
transcripcin y las secuencias reguladoras necesarias para codificar
un producto gnico (sea ste un ARN, uno o varios polipptidos)

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Estructura de un gen eucarionte

Elementos reguladores Unidad de transcripcin

SANT SPNT

Secuencias anteriores y posteriores

no traducidas

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Clasificacin de las secuencias de ADN

Segn su grado de repeticin
De alta repeticin (ADN satlites o el centrmero)
De moderada repeticin (Retroposones, transposones, ADN
telomrico, familias gnicas, microsatlites, minisatlites)
De secuencia nica (Genes, ADN intergnico no repetido)

Segn su funcin
De elementos propios (ARNs y protenas)
Codificantes De elementos accesorios (retroposones, transposones)

De funcin estructural (ADN satlites y telomrico)

No codificantes De funcin regulatoria (Promotores, reguladores)
De funcin desconocida (ADN intergnico)

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Familias gnicas

Las familias gnicas contienen genes con secuencias muy similares

(homologa de secuencias)

Un slo grupo (cluster) en una misma regin cromosmica

Varios grupos

Dispersos

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Familia gnica de las histonas

11 grupos que comprenden 60 genes

distribuidos en 7 cromosomas distintos

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Las familias gnicas contienen frecuentemente

pseudogenes*

*gen inactivo originado por duplicacin de un gen ancestral

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Pseudogenes

Pseudogen: copia no funcional de todo un

gen o de la mayor parte de un gen
No procesado: copias de un gen con exones e intrones. Poseen
con frecuencia codones de terminacin en sitios errneos.
Frecuentes en las familias gnicas

Procesado o retroposon: copia no funcional de exones de un

gen. Originado por accin de la retrotranscriptasa de algunos
virus a partir de transcriptos de la ARNpol II o de la ARNpol III

Ejemplos: SINEs y LINEs

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