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Bioqumica
CURSO METODOLGICO DE 3 CREDITOS
PREGRADO.
Biomolculas
BIOQUMICA
Bucaramanga
2015
ESCUELA DE CIENCIAS BSICAS, TECNOLOGA E INGENIERA - ECBTI
Bioqumica
CURSO METODOLGICO DE 3 CREDITOS
PREGRADO.
BIOMOLCULAS
BIOMOLCULAS (Componentes qumicos de la Clula)
Agua H2O
Inorgnicas
Sales minerales NaCl, CaCO3, Ca3(PO4)2
Oxgeno molecular O2
Biomolculas Glcidos C, H y O
Lpidos C, H y O
Orgnica
Protenas C, H, O, N y S
cidos nucleicos C, H, O, N y P
Tomado de http://www.bioygeo.info/pdf/Bioquimica.pdf
Las biomolculas inorgnicas son las que no estn formadas por cadenas de
carbono e hidrgeno, como son el agua, las sales minerales o los gases. Las
molculas orgnicas estn formadas por cadenas de carbono
BIOMOLCULAS INORGNICAS
organismos se han diseado alrededor de las propiedades del agua, tales como su
carcter polar, su capacidad para formar enlaces de hidrgeno y su alta tensin
superficial.
Adems del agua, existen otras biomolculas inorgnicas como las sales minerales.
En funcin de su solubilidad en agua se distinguen dos tipos: insolubles y solubles.
Forman estructuras slidas, que suelen tener funcin de sostn o protectora, como:
Funciones catalticas. Algunos iones, como el Cu+, Mn 2+, Mg2+, Zn+,...actan como
cofactores enzimticos.
Funciones osmticas. Intervienen en los procesos relacionados con la distribucin
de agua entre el interior celular y el medio donde vive esa clula. Los iones de Na,
K, Cl y Ca, participan en la generacin de gradientes electroqumicos,
imprescindibles en el mantenimiento del potencial de membrana y del potencial
de accin y en la sinapsis neuronal.
Funcin tamponadora. Se lleva a cabo por los sistemas carbonato-bicarbonato,
y tambin por el monofosfato-bifosfato
Las biomolculas son las molculas constituyentes de los seres vivos. Los cuatro
bioelementos ms abundantes en los seres vivos son el carbono (C), hidrgeno
(H), oxgeno (O) y nitrgeno (N), representando alrededor del 99 por ciento de la
masa de la mayora de las clulas.
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Los compuestos del carbono fabricados por los organismos vivos estn divididos en
cuatro grandes grupos: carbohidratos, lpidos, protenas y cidos nucleicos. Estos
son distintos en sus propiedades fsicas y qumicas, pero los tres primeros son
similares metablicamente, al menos, en el hecho de que son fuentes de energa
para los organismos. El rompimiento de las molculas orgnicas complejas da como
resultado la liberacin de energa
http://www.virtual.unal.edu.co/cursos/ciencias/2000024/lecciones/cap01/01_01_00.htm
4.- Permiten la posibilidad de que con pocos elementos se den una enorme variedad
de grupos funcionales (alcoholes, aldehdos, cetonas, cidos, aminas, etc.)
con propiedades qumicas y fsicas diferentes.
GLCIDOS
Nmero de C Caractersticas
Las triosas Glcidos de 3 Metabolitos intermediarios de la degradacin de la
tomos de glucosa. Aldosa porque posee un grupo aldehdo
carbonos (-CHO) y gliceraldehido, corresponde a una cetosa por
tener un grupo cetona (C=O ). Es la dihidroxiacetona.
Las pentosas Glcidos de 5 Ribosa y Desoxirribosa (cidos nuclicos) y la ribulosa
tomos de que desempea un importante papel en la
carbonos fotosntesis.
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EL ENLACE GLUCOSDICO.
OLIGOSACRIDOS.
Los sidos, glcidos formados por la unin de varios monosacridos, pueden ser
holsidos, si estn formados exclusivamente por monosacridos, o hetersidos, si
adems contienen otros componentes de naturaleza no azucarada. Entre los
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holsidos se distinguen, en funcin del nmero de unidades que los forman, dos
tipos: oligosacridos y polisacridos.
Los oligosacridos (del griego oligos = poco) son holsidos compuestos por un
nmero reducido de unidades monosacardicas unidas mediante enlaces
glucosdicos. El nmero de unidades monosacardicas que forman parte de un
oligosacrido puede oscilar entre 2 y 10. Si estn formados por slo dos
monosacridos se denominan disacridos, si lo estn por tres trisacridos; a
los que estn formados por ms de tres monosacridos no se le suele asignar
ninguna denominacin especfica y se suelen nombrar sencillamente como
oligosacridos.
MALTOSA Glucosa-(14)-Glucosa
ISOMALTOSA Glucosa-(16)-Glucosa
CELOBIOSA Glucosa-(14)-Glucosa
LACTOSA Galactosa-(14)-Glucosa
TREHALOSA Glucosa-(11)-Glucosa
SACAROSA Fructosa-(21)-Glucosa
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DISACRIDOS
Los monosacridos, se unen mediante enlaces glucosdicos (C-O-C) por sntesis de
deshidratacin para formar disacridos y polisacridos. El enlace glucosdico se
forma entre el hidroxilo ( este aporta un -H ) del carbono 1 del primer monosacrido
con el -OH del carbono 2, 3 o 4 del segundo monosacrido formando una molcula
de agua; los enlaces resultantes sern alfa (a ) o beta ( ) segn la posicin del -
OH en el primer azcar.
POLISACRIDOS
Los carbohidratos ms abundantes, unin de ms de 10 unidades de azcares
sencillos (generalmente la glucosa) mediante enlaces glucosdicos.
http://www.virtual.unal.edu.co/cursos/ciencias/2000024/lecciones/cap01/01_01_07.htm
MUCOPOLISACRIDOS O GLUCOSAMINOGLUCANOS
Los glucosaminoglucanos De aspecto amorfo, tan viscosos como las secreciones mucosas, entre
los ms comunes se pueden citar: el cido hialurnico, el condroitn
sulfato A, la heparina, el keratosulfato y el dermatn sulfato.
El cido hialurnico es un Formado por la repeticin de un disacrido formado por el cido
glucurnico y la N- acetil glucosamina, unidos entre s por enlaces
mucopolisacrido. glucosdicos (1-- 3) y los disacridos mediante enlaces (1-- 4).
http://www.virtual.unal.edu.co/cursos/ciencias/2000024/lecciones/cap01/01_01_07.htm
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ISOMERA PTICA
Las sustancias que rotan como dextrgiras (D) a la derecha y levgiro (L) se
designa (-) o izquierda. Ismeros pticos o molculas de diferente actividad ptica
Los pares de ismeros pticos que rotan la luz en igual magnitud pero en sentido
contrario se llaman enantimeros
Los Glcidos pueden tener actividad ptica porque tienen en su estructura carbonos
quirales. Los seres vivos (las enzimas) son capaces de diferenciarlos y solamente
utilizan uno de ellos (en los monosacridos el ismero D casi siempre). Forma parte
de lo que se conoce como la asimetra de la vida.
LPIDOS
Los lpidos son un grupo muy heterogneo que usualmente se clasifican en dos
grupos, atendiendo a que posean en su composicin cidos grasos (lpidos
saponificables) o no lo posean (lpidos insaponificables).
CIDOS GRASOS
Son cadenas largas de hidrocarburos no ramificados con un grupo carboxilo en un
extremo.CH3 (CH2)n COOH. cido graso libre
cido graso es saturado: todos los carbonos estn unidos por enlaces simples.
CH3(CH2)7CH=CH (CH2)7COOH
El extremo carboxilo del cido graso es soluble en agua y muy polar; en cambio, la
cadena hidrocarbrica es insoluble en agua y no polar. El extremo carboxilo
soluble queda incorporado al agua como una capa, quedando las colas de los
cidos grasos fuera de la superficie del agua.
Fosfoglicridos o glicerofosfolpidos
ROL BIOLGICO
FOSFOLPIDO
Los fosfolpidos son un tipo de lpidos antipticos compuestos por una molcula
de glicerol, al que se le unen dos cidos grasos (1,2-diacilglicerol) y un grupo fosfato.
Este fosfolpido tensoactivo es producido por las clulas epiteliales del tipo II e
impide la atelectasia al final de la fase de espiracin de la respiracin.
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FOSFOGLICRIDO
En los organismos vivos tiene funcin estructural puesto que son uno de los
principales componentes de las bicapas de las membranas celulares y subcelulares.
https://sites.google.com/a/ps.edu.pe/biologiaps/bioquimica/lipidos/clasificacion-de-los-
lipidos
http://www.edu.xunta.es/centros/iespuntacandieira/system/files/03_L%C3%ADpidos.pdf
EJEMPLOS DE FOSFOGLICRIDOS
PROTENAS
Las protenas son las biomolculas que ms diversidad de funciones realizan en los
seres vivos; prcticamente todos los procesos biolgicos dependen de su presencia
y/o actividad.
Son protenas casi todas las enzimas, catalizadores de reacciones metablicas de
las clulas; muchas hormonas, reguladores de actividades celulares; la
hemoglobina y otras molculas con funciones de transporte en la sangre; los
anticuerpos, encargados de acciones de defensa natural contra infecciones o
agentes extraos; los receptores de las clulas, a los cuales se fijan molculas
capaces de desencadenar una respuesta determinada; la actina y la miosina,
responsables finales del acortamiento del msculo durante la contraccin; el
colgeno, integrante de fibras altamente resistentes en tejidos de sostn.
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AMINOCIDO Y PROTENAS
AMINOCIDOS
Met -
Metionina 2.1 9.3
M
cido
Asp - D 2.0 9.9 3.9
Asprtico
Asn -
Asparagina 2.1 8.8
N
cido
Glu - E 2.1 9.5 4.1
Glutmico
Aminocidos bsicos
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Aminocidos aromticos
Trp -
Triptofano 2.4 9.4
W
Iminocidos
Tomado de http://themedicalbiochemistrypage.org/es/amino-acids-sp.php
*
El esqueleto de los aminocidos es rojo y los grupos-R negros
Los grupos -COOH y -NH2 de los aminocidos son capaces de ionizarse (al igual
que los grupos-R cidos y bsicos de los aminocidos). Como resultado de su
capacidad de iotizacin las siguientes reacciones de equilibrio inico pueden ser
escritas:
Los radicales carboxilo y amino de los aminocidos pueden ionizarse, por lo que su
comportamiento es anftero, es decir, se pueden comportar como cidos o bases
dependiendo del pH del medio. El pH en el que tienden a adoptar la forma de dipolo
elctrico es distinto para cada aminocido y se conoce como punto isoelctrico.
Tomado: http://e-ducativa.catedu.es/44700165/aula/archivos/repositorio/3250/3374/html/11_aminocidos_y_pptidos.html
Como los cidos orgnicos tpicos, la fuerza cida de los grupos carboxilos, amino
y grupos-R ionizables en los aminocidos se pueden definir por la constante de
disociacin, Ka o ms comnmente el logaritmo negativo de K a, la pKa. La carga
neta (la suma algebraica de todos los grupos con carga presentes) de cualquier
aminocido, pptido o protena, depender del pH del ambiente acuoso circundante.
Cuando el pH de una solucin de aminocido o protenas cambia la carga neta de
los aminocidos tambin cambiar. Este fenmeno se puede observar durante la
titulacin de cualquier aminocido o protena. Cuando la carga neta de un
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EL ENLACE DE PEPTDICO
La formacin del enlace de peptdico es una reaccin de condensacin que lleva a
la polimerizacin de aminocidos en los pptidos y las protenas. Los pptidos son
pequeos y tienen pocos aminocidos. Muchas hormonas y neurotransmisores son
pptidos. Adems, varios antibiticos y agentes antitumorales son pptidos. Las
protenas son polipptidos de gran longitud que varan mucho. El pptido ms
simple, un dipptido, contiene un solo enlace peptdico formado por la condensacin
del grupo carboxilo de un aminocido con el grupo amino del segundo aminocido
con la eliminacin concomitante del agua. La presencia del grupo de carbonilo en
un enlace de pptido permite que la estabilizacin de la resonancia de los electrones
ocurra de tal forma que el enlace peptdico exhibe rigidez a diferencia del tpico
doble enlace C=C. Se dice por tanto que el enlace peptdico tiene un carcter de
doble-enlace.
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LAS ENZIMAS
Las molculas deben poseer suficiente energa de activacin para reaccionar. Las
enzimas actan como catalizadores; disminuyendo la energa de activacin,
incrementando enormemente la velocidad a la que se producen las reacciones
qumicas en las clulas. Una reaccin no catalizada requiere ms energa de
activacin que una catalizada, como una reaccin enzimtica. La menor energa de
activacin en presencia del catalizador frecuentemente est dentro del intervalo de
energa que poseen las molculas, de tal modo que la reaccin puede ocurrir
rpidamente, sin adicin o con poca adicin de energa.
Las enzimas tambin pueden estar reguladas por inhibicin competitiva, en la cual
una molcula, semejante al sustrato normal, compite por el sitio activo. La inhibicin
competitiva puede ser revertida aumentando las concentraciones de sustrato. Los
inhibidores no competitivos se unen en otro sitio de la molcula, alterando la
estructura terciaria, de modo que la enzima ya no puede funcionar. La inhibicin no
competitiva habitualmente es reversible, pero no por el incremento en la
concentracin de sustrato. Los inhibidores irreversibles se unen permanentemente
al sitio activo o desorganizan irreparablemente la estructura terciaria.
La informacin en las clulas reside en el genoma, que est formado por DNA
menos en el caso de algunos virus que es RNA. El DNA es donde se almacena la
informacin. El alfabeto del DNA con cuatro smbolos (nucletidos) y l de protenas
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El cdigo gentico que posibilita la traduccin libre de ambigedad del lenguaje del
DNA al de las protenas, requiere de reconocimientos estructurales especficos
(informacin analgica) entre aminocidos y RNA de transferencia (t-RNA) y entre
aminoacil-RNA-sintetasas (aa-rnasa) y t-RNA y entre aquellas y aminocidos.
El Cdigo Gentico
http://www.scientificpsychic.com/fitness/aminoacidos1.html
=
= ,
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Ahora conocemos que la informacin gentica puede fluir del RNA a ADN
En los cidos nucleicos nunca estn sin sustituir. Todas la bases tienen grupos que
pueden formar puentes de hidrgeno con ms facilidad que la purina y la pirimidina.
En el DNA las purinas sern adenina y guanosina mientras que las pirimidinas sern
timina y uracilo. En el RNA las purinas son las mismas pero las pirimidinas sern
uracilo y citosina pero nunca timina. Las bases nitrogenadas se unen mediante un
enlace N-glicosdico. El N es el 1-pirimidinas y el 9-purinas.
Base nitrogenada + azcar nuclesido + P nucletido
El P siempre est en el carbono 5 del azcar. Los nucletidos pueden tener ms de
un grupo P.
Molcula de adenina del DNA
CH2 unido a ribosa y sta a una base
Estas formas existen libres en la naturaleza y son muy importantes para la clula.
Al enlace que une P con otro tomo se le llama fosfoanhidro. Si las base en la
adenina tendremos AMP, ADP ATP respectivamente. Todos los nucletidos de la
misma cadena estn orientados de la misma forma y se une el 3 de un nucletido
con el 5 del siguiente. Al principio siempre habr un P libre (5) y al final un OH (3).
Se representan siempre en direccin 5 3,que es la direccin en que se
sintetizan. El enlace que une dos nucletidos es fosfodister y el esqueleto es muy
regular, siendo lo nico que vara las bases. Esta secuencia de bases es la que
recoge el cdigo gentico.
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El fosfato tiene pKa 1 por lo que a pH fisiolgico estar disociado, por lo que habrn
cargas negativas que no estarn desestabilizando porque estn asociadas a cargas
positivas casi siempre. Como la estructura ha de abrirse para llevar a cabo sus
funciones, la molcula de DNA podr desnaturalizarse (separacin de las dos
cadenas). Esto se consigue cuando la temperatura sube (temperatura de fusin). A
esta temperatura encontraremos 50% de doble hlice y 50% de cadena sencilla.
Cuanto mayor sea la cantidad de citosina y timina mayor ser la temperatura de
fusin porque habr que romper ms puentes de hidrgeno.
Al formarse la doble hlice aparecen unos surcos que sern de dos tipos:
Estos surcos son importantes porque a travs de ellos se pueden ver las bases.
> DNA-Z: doble cadena enrollada a la izquierda de 12 residuos por vuelta. Aparece
cuando en la cadena hay citosina y timina alternadas y siempre en cortos
fragmentos.
Estructura del RNA
Se enrolla sobre s misma tantas veces como le demos vueltas o se las quitemos.
Cuando no est superenrollado se dice que est relajado. La forma relajada siempre
est en un plano.
Procariotas
El genoma de un virus puede estar formado por DNA RNA y con cualquier
combinacin. En general las bacterias tienen DNA de doble cadena cerrada y los
eucariotas doble cadena de DNA abierta. El genoma es el conjunto de material
gentico. Todos los genes estn en la misma molcula. El tamao del genoma
puede ser de unos 5000 genes y 106 pares de bases. De estos genes slo algunos
estarn repetidos y estos codificarn para un mismo RNA. La mayor parte de los
pares de bases tienen significado. Esto sera el cromosoma de la bacteria que en
una bacteria est superenrollado para que ocupe un espacio menor, pero no lo
veremos circular. Aparte existen otras pequeas molculas de DNA llamadas
plsmidos. Son circulares y no llevan incorporadas protenas esenciales, en muchos
casos incorporan resistencias a los antibiticos.
En procariotas es muy frecuente que las protenas que trabajan juntas tengan
coordinada su expresin. La forma de expresin es el opern, y si se expresan
conjuntamente es porque se expresan con un nico mensajero. A los mensajeros
con ms de una informacin se les llama policistrnicos. Es muy frecuente en
procariotas pero rarsimo en eucariotas.
Eucariotas
En el genoma de los eucariotas no todos los genes estn en la misma molcula sino
en varias llamadas cromosomas. El nmero de genes es mucho mayor al igual que
el tamao. Molcula de DNA lineal. Muchos ms genes repetidos aunque los
policistrnicos no suelen aparecer. Tiene zonas codificadas que no sirven para nada
y en algunos casos estn muy repetidas. Los exones es lo que se expresa y los
intrones lo que no. Los intrones pueden ser eliminados con facilidad obteniendo as
la protena final.
El DNA est formado por cromatina, asociado a protenas siendo mayora las
histonas, que tienen cargas positivas por lo que se enlazarn al DNA que tiene
negativas. La cromatina estar difusa en el ncleo y cuando se va a dividir se
compacta y se pueden ver bien los cromosomas.
Tipos de histonas: Hay 5 tipos: H1, H2A, H2B, H3 Y H4. Se organizan formando un
octmero sobre el que se enrolla el DNA. Al octmero de histonas rodeado por 2
vueltas y pico de DNA se le conoce como nucleosoma y el DNA que hay entre
nucleosomas es el DNA espaciador. A la H1 se le llama sellando del nucleosoma.
Forman una especie de collar de perlas.
Estructura del gen
Un gen es una unidad de expresin y siempre dar lugar a un RNA. Algunos RNA
dan lugar a protenas (mRNA 6%), otros funcionan como RNA en la clula (rRNA
80%), tRNA (15%) y 5nRNA (RNA del ncleo, muy pequeo, algunos con funcin
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cataltica y otros que no se sabe bien su utilidad). El proceso por el cual se obtiene
RNA es la transcripcin. El lugar donde se inicia la transcripcin es el promotor.
Asociado a cada gen hay elementos reguladores que tienen que estar delante del
promotor y constan de dos partes:
- Una protena.
http://www.fisicanet.com.ar/quimica/q2_bioquimica.php
http://www.fisicanet.com.ar/quimica/bioquimica/ap07_adn.php
http://www.fisicanet.com.ar/quimica/bioquimica/ap07_adn.php
Flujo de informacin: es siempre unidireccional.
Grupos funcionales
El carbono puede formar hasta cuatro enlaces con otros tomos (cada enlace
representa uno de los electrones del carbono y uno de los electrones del tomo que
se enlazan).
La diversidad de los productos qumicos orgnicos se debe a la infinidad de
opciones que brinda el carbono para enlazarse con otros tomos. Los qumicos
orgnicos ms simples, llamados hidrocarburos, contienen slo carbono y tomos
de hidrgeno; el hidrocarburo ms simple (llamado metano) contiene un solo tomo
de carbono enlazado a cuatro tomos de hidrgeno.
GRUPOS FUNCIONALES
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FUNCIONES OXIGENADAS
Tabla. FUNCIONES OXIGENADAS
FUNCIONES OXIGENADAS
Las funciones oxigenadas son las que contienen, adems de tomos de carbono
y de hidrgeno, tomos de oxgeno
Compuesto Descripcin Se nombran Ejemplo
ALCOHOLES Un alcohol es un Los alcoholes que 2-Hexanol (Hexan-2-ol)
CH3CHOHCH2CH2CH3
(R OH) compuesto que contienen slo un grupo
contiene uno o ms OH se nombran aadiendo
grupos hidroxilos (-OH) la terminacin ol al nombre
enlazados a un radical del hidrocarburo
carbonado R correspondiente del cual
deriva.
TERES los teres son los teres se nombra la Metoxietano (Etil metil ter)
CH3 OCH2 CH2CH3
(R O R) derivados de los cadena ms sencilla unida
alcoholes en los que el al oxgeno (RO-) terminada
hidrgeno del grupo en oxi (grupo alcoxi)
OH es reemplazado seguido del nombre del
por un radical R hidrocarburo que
corresponde al otro grupo
sustituyente
ALDEHDOS En los aldehdos, el Se elige como cadena 2-Metilpentanal
CH3 CH2 CH2CH(CH3)CHO
(R CHO) grupo carbonilo (C=O) principal la cadena ms
se encuentra unido a larga que contenga al grupo
un radical R y a un CHO. Si se encuentra
hidrgeno. alguna instauracin (doble o
triple enlace) se elegir
como cadena principal la
que contenga al grupo
CHO y la citada
instauracin. El nombre del
compuesto se obtiene
aadiendo al nombre del
compuesto que constituye
la estructura principal la
terminacin al
CETONAS En las cetonas el grupo Se obtiene aadiendo la 2-Hexanona (Hexan-2-ona)
CH3COCH2 CH2 CH2CH3
(R CO R) principal es tambin el terminacin ona al nombre
grupo carbonilo (C=O), del compuesto que
pero a diferencia de los
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FUNCIONES NITROGENADAS
FUNCIONES NITROGENADAS
FUNCIONES NITROGENADAS
Las funciones nitrogenadas son las que contienen, adems de tomos de carbono y de
hidrgeno, tomos de nitrgeno, aunque tambin pueden contener tomos de oxgeno.
Compuesto Descripcin Se nombran Ejemplo
AMINAS Las aminas son los Las aminas pueden ser Pentanamina (Pentan-2-
amina)
(R NH2) derivados orgnicos primarias, secundarias y CH3CH(NH2)CH2 CH2CH3
del amoniaco, donde terciarias segn presenten
uno o ms grupos uno, dos o tres radicales R
alquilo o arilo estn
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http://www.gobiernodecanarias.org/educacion/3/usrn/lentiscal/1-cdquimica-
tic/ficherosq/apuntesformulacionOrganica.htm#alcanos
http://www.uam.es/departamentos/ciencias/qorg/docencia_red/qo/l1/gfunc.html
alquenos CH3CH=CH2
Propeno
(homo)
aromticos
Tolueno
(hetero)
aromticos
3-Metilpiridina
alquinos CH3-CC-CH3
2-Butino
haluros de CH3-CH2-Br
-halgeno
alquilo Bromuro de etilo
alcoholes CH3-CH2-OH Etanol
-OH
fenoles Ph-OH Fenol
teres -O- CH3-CH2-O-CH2-CH3
Dietilter
aminas CH3-NH2
-NH2
primarias Metilamina
aminas (CH3)2NH
-NH-
secundarias Dimetilamina
aminas (CH3)3N
terciarias Trimetilamina
boranos (CH3)3B
Trimetilborano
CH3Li Metillitio
-metal
organometlicos (CH3)2Mg Dimetilmagnesio
(Li, Mg, Al, etc.)
(CH3)3Al Trimetilalano
aldehdos
Etanal
cetonas
Propanona
iminas
Metilimina de la
propanona
cidos
carboxlicos
cido actico
steres
Acetato de etilo
amidas
Acetamida
haluros de acilo
anhdridos
Cloruro de acetilo Anhdrido
actico
CH3CN
nitrilos -CN Acetonitrilo
cidos CH3CH2CH2SO2OH
-SO2-OH
sulfnicos cido propanosulfnico
Una vez reconocidos los grupos funcionales que contiene una molcula hay que
determinar cul es la funcin principal, segn el siguiente orde
Las aminas pueden ser primarias, secundarias y terciarias segn presenten uno, dos o tres radicales
R unidos al tomo de nitrgeno. Para nombrar las aminas primarias (R NH2) se puede proceder de
dos formas.
Una consiste en considerar el grupo R como un alcano al cual se le aade la terminacin amina.
En este caso hay que buscar para el grupo NH2 el localizador ms bajo posible. La segunda forma
consiste en considerar el grupo NH2 como la estructura
fundamental y se nombra el grupo R como un radical al que se le aade el sufijo amina.
Para nombrar las aminas secundarias (R1 NH R2) y terciarias (R1 NR2R3) se toma como
estructura principal aquella que contenga un radical R con mayor prioridad de acuerdo con los
criterios de seleccin de cadena principal ya vistos y para indicar que los otros radicales se unen al
nitrgeno se utiliza la letra N seguido del nombre del radical correspondiente.
Tambin se pueden nombrar las aminas secundarias y terciarias indicando los nombres de todos los
radicales sustituyentes seguidos del sufijo amina.
3.
Si existen dos grupos CHO se elegir como cadena principal la que contiene a
dichos grupos y se nombran de igual manera que en el caso anterior
finalizando con el sufijo dial y si adems hay presentes instauraciones se les
debe asignar los localizadores ms bajos. Cuando el grupo CHO, siendo el grupo
principal, se encuentra unido a un sistema cclico el nombre se formar indicando
el sistema cclico seguido de la terminacin carbaldehdo.
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Los hidrocarburos simples son compuestos orgnicos que slo contienen carbono
e hidrgeno. Estos hidrocarburos simples vienen en tres variedades (llamadas
alcanos, alquenos y alquinos) dependiendo del tipo de enlace carbono-carbono
(sencillo, doble o triple) que ocurre en la molcula.
Alcanos
Los alcanos son la primera clase de hidrocarburos simples y contienen slo enlaces
sencillos de carbono-carbono e hidrogeno. Para nombrarlos, se combina un prefijo,
que describe el nmero de los tomos de carbono en la molcula, con la raz que
termina en ano.
He aqu los nombres y los prefijos para los primeros diez alcanos.
tomos
Nombre de Frmula
de Prefijo Frmula semidesarrollada
alcanos Qumica
carbono
1 Meth Metano CH4 CH4
2 Eth Etano C2H6 CH3CH3
3 Prop Propano C3H8 CH3CH2CH3
4 But Butano C4H10 CH3CH2CH2CH3
5 Pent Pentano C5H12 CH3CH2CH2CH2CH3
6 Hex Hexano C6H14 CH3CH2CH2CH2 CH2CH3
7 Hept Heptano C7H16 CH3CH2CH2CH2CH2CH2CH3
8 Oct Octano C8H18 CH3CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH3
9 Non Nonano C9H20 CH3CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH3
10 Dec Decano C10H22 CH3CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH2CH3
http://www.profesorenlinea.cl/Ciencias/Biomoleculas.html
ESCUELA DE CIENCIAS BSICAS, TECNOLOGA E INGENIERA - ECBTI
Bioqumica
CURSO METODOLGICO DE 3 CREDITOS
PREGRADO.
http://www.profesorenlinea.cl/Quimica/grupos_funcionales.html
Funciones oxigenadas
A continuacin, un cuadro resumen de los grupos funcionales (con su correspondiente funcin qumica)
donde participan tomos de carbono, hidrgeno y oxgeno.
Grupo Funcin o
Frmula Estructura Prefijo Sufijo
funcional compuesto
Grupo alcoxi (o
ter R-O-R' -oxi- R-il R'-il ter
ariloxi)
-al
Aldehdo R-C(=O)H oxo-
-carbaldehdo
Grupo carbonilo
R-C(=O)-
Cetona oxo- -ona
R'
Importante:
Ntese que en las funciones alcohol y ter hay slo enlaces sencillos (de la forma C O), en cambio en todas
las otras funciones oxigenadas hay enlaces dobles (de la forma C = O). Este aspecto es muy importante para
definir el nmero de tomos de hidrgeno que tiene algn compuesto qumico. (Ver: PSU: Qumica,
Pregunta 08_2005).
ESCUELA DE CIENCIAS BSICAS, TECNOLOGA E INGENIERA - ECBTI
Bioqumica
CURSO METODOLGICO DE 3 CREDITOS
PREGRADO.
Funciones nitrogenadas
A continuacin, un cuadro resumen de los grupos funcionales (con su correspondiente funcin) donde
participan tomos de carbono, hidrgeno y nitrgeno.
Grupo
Funcin o
funciona Frmula Estructura Prefijo Sufijo
compuesto
l
Grupo
amino
Imina R-NCR2 _ _
R-
Amida C(=O)N( _ _
Grupos -R')-R"
amino
y
carbonilo Grupo nitro
alquil isocianur
Isocianuro R-NC _
Grupo o
nitrilo
Grupo R-N=N-
Azoderivado azo- -diazeno
azo R'
ESCUELA DE CIENCIAS BSICAS, TECNOLOGA E INGENIERA - ECBTI
Bioqumica
CURSO METODOLGICO DE 3 CREDITOS
PREGRADO.
R1R2N-
_ Hidrazina _ -hidrazina
NR3R4
-
_ Hidroxilamina -NOH _ hidroxilamin
a
Funciones halogenadas
A continuacin, un cuadro resumen de los grupos funcionales donde participan tomos de carbono,
hidrgeno y elementos halgenos.
Frmula del
Tipo de compuesto Prefijo Sufijo
Grupo funcional compuesto
http://organica.fcien.edu.uy/gf/nitrilos.htm
http://corinto.pucp.edu.pe/quimicageneral/contenido/72-grupos-funcionales.html
http://highered.mheducation.com/sites/dl/free/0072442123/65764/samplech05.pdf.
http://www.mpcfaculty.net/mark_bishop/Bishop_12_1A_eBook.pdf.