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ALGORITMOS E INTELIGNCIA

ARTIFICIAL NOS DIAGNSTICOS DE


SADE E NA EDUCAO

Prof. Dr. Dante Augusto Couto Barone

So Leopoldo, 31 de agosto 2017


Sumrio

1) Conceitos Introdutrios
Inteligncia Artificial
Aprendizado de Mquina (Machine Learning)
Aprendizado Profundo (Deep Learning)
2) Inteligncia Artificial e Educao
3) Inteligncia Artificial e Medicina
4) Estudo de Caso: IA Aplicada no Diagnostico de Diabetes
5) Evoluo dos Algoritmos de IA e Funo do Dr.
Algoritmo
6) Pesquisas Atuais em Sade do Instituto de Informtica da
UFRGS
7) Workshop Latino-Americano de Neurocincia
Computacional
8) Concluses
Conceitos Introdutrios

https://medium.com/data-science-brigade/a-diferen%C3%A7a-entre-
intelig%C3%AAncia-artificial-machine-learning-e-deep-learning-
930b5cc2aa42
Conceitos Introdutrios Inteligncia Artificial

Precursor da Inteligncia Artificial:


Alan Turing Artigo: Can the Machines think? 1950

Conferencia de Dartmouth 1956 cunhado o termo:


Interesse em desenvolver sistemas computacionais complexos
com caractersticas similares inteligncia humana.
Conceitos Introdutrios Inteligncia Artificial
Conceitos de IA Fraca e IA Forte

Inteligncia Artificial Simblica :


Inspirao em modelos mentais
Reproduo do Raciocnio
Replicao do conhecimento de especialistas
Explicao do conhecimento
Inteligncia Artificial Conexionista
Inspirao Biolgica
Conhecimento Implcito
Redes Neurais Artificias

Novo Boom 2015:

Disponibilidade de GPUs (Graphical Processing Units)


Maior e mais efetiva capacidade de clculos empregando processamento
paralelo e distribudo

Big Data
Maior disponibilidade de dados quantidades massivas
Desenvolvimento de Tcnicas Adequadas para processar Big Data
Data Mining
Conceitos Introdutrios Machine Learning
Como usar algoritmos para coletar dados, aprender com os mesmos e
ento fazer determinaes ou predies sobre algo no mundo real.

Diferena entre aplicaes de tcnicas de Viso Computacional e Deep


Learning. Exemplo: deteco de placas de transito como PARE

Utilizao de:
Classificadores como Filtros
detectores de Bordas em Imagens
Determinao de Formatos
Reconhecedor de Letras em
Palavras

Objetivo: Construo de Algoritmos que entendem uma imagem e aprendem


a determinar se e uma placa de PARE.

Mas o que acontece se:


Dia esta muito nublado?
Arvore tapa parte da placa?
http://www.emgu.com/wiki/index.php/Traffic_Sign_Detection_in_CSharp
Conceitos Introdutrios Deep Artificial
Mltiplas camadas de Redes Neurais
Processamentos sucessivos pelas diferentes camadas
Calculo de vetor de probabilidades
Treinamento com centenas de milhares ou mesmo milhes de
imagens

Andrew Ng da Google 2012

Algumas aplicaes com Deep Learning possuem taxas de


acerto maiores que humanos

https://cdn-images-1.medium.com/max/1200/0*p_wrnuhmSaou2I_N.jpg https://cdn-images-1.medium.com/max/1600/1*5egrXWuyrLA7gBEXdg5A.png
Conceitos Introdutrios Aplicaes na vida diria
Sistemas de Recomendao

AMAZON 35% das ofertas so oriundas de produtos recomendados

NETFLIX Patrocinou competio de 1 milho de dlares para melhorar


recomendaes 70% das escolhas dos usurios surgem a partir de
recomendaes online.
Tirar motoristas de congestionamentos ou indicar melhor rota

Waze criado por uma startup de Israel

Exibio de postagens e publicidades mais interessantes para os usurios

FACEBOOK TWITTER GOOGLE

https://cdn-images-1.medium.com/max/1200/0*p_wrnuhmSaou2I_N.jpg https://cdn-images-1.medium.com/max/1600/1*5egrXWuyrLA7gBEXdg5A.png
Conceitos Introdutrios Benefcios na Medicina
Clculos relacionados predio de riscos

Analise automtica de diagnsticos


Radiologia (exemplo: mamografias)

Desenvolvimento de medicamentos especficos

Sugesto de tratamentos mais adequados para pacientes com certas


enfermidades (exemplo: cncer)

Exemplos:

Startup TROUXAR do Vale do Silcio:


Cruzamento de diversos dados pblicos e particulares para estabelecer
relaes entre melhores frmacos para doenas especificas

WATSON IBM:
Watson Oncology A partir de dados de pacientes, o sistema acaba agindo
como um conselheiro do medico no tratamento
Conceitos Introdutrios Benefcios na Medicina
Principais reas de investimentos da IA em Sade so:

Cirurgia Robtica

Assistentes de Enfermagem Virtuais

Processos de workflow administrativos

Deteco de fraudes

Reduo de erros de dosagem de medicamentos


Inteligncia Artificial e Educao

A Inteligncia Artificial, alm de procurar compreender a formao da


inteligncia humana, prope tambm a construo de entidades
inteligentes (RUSSEL; NORVIG, 2004)

Sistemas Tutores Inteligentes apresentam-se como ferramentas ou


softwares educacionais com a capacidade de assistir os aprendizes,
objetivando a aquisio do conhecimento com interatividade,
incentivando sua autonomia e criatividade. (FERREIRA; SOBRAL, 2001)
Inteligncia Artificial e Educao Arquitetura STI
Inteligncia Artificial e Educao - Modulo especialista

Regras
lgicas

Objetos
Halgrafos

Representao
do
Conhecimento

Frames e
scripts Lgica de
predicados

Redes
semnticas
Inteligncia Artificial e Educao - Modulo Aluno
Armazena conhecimentos e preferncias do aluno, onde ressalta-se a
importncia duma constante atualizao dos dados do aluno;

Diferencial

Agentes Overlay

Modelos de
representao

Simulao Perturbao

Esteretipo
Inteligncia Artificial e Educao - Modulo Aluno
Estratgias de ensino
quando interromper?
que razes justificam
interromper o curso de
raciocnio ou aprendizagem do
aluno?
o que dizer?
como dizer?
Mtodos de
Exposio

Socrtico Hipertextos Treinamento


Inteligncia Artificial e Educao - Modulo Interface

Desenvolver interfaces adaptativas assim a preocupao do aluno deve ser


apenas em compreender o assunto abordado.

Adaptabilidades

Navegacional Apresentao
Inteligncia Artificial e Educao - Benefcios

Permitem maior flexibilidade no ensino;


Geram um ambiente cooperante;
Possuem comportamento que se assemelha
ao de um professor.
Com o apoio das tcnicas de IA pode-se
considerar caractersticas individuais;
Um STI um trabalho multidisciplinar;
Realimentao do sistema por meio dos
histricos dos alunos;
Modelagem do conhecimento como ponto
focal em STI;
Embasamento pedaggico.
Inteligncia Artificial e Medicina
Na medicina, o modelo automatizado, baseado no KDD, vem se
estacando nas ltimas dcadas, por extrair conhecimento de bases de
dados, por meio da sua etapa de minerao de dados, facilitando assim
os trabalhos entre o engenheiro do conhecimento e o mdico
especialista, que passa a supervisionar o processo (GUINZANI, 2006).

Inteligncia Artificial e Medicina Aquisio do conhecimento em


sistemas especialistas probabilsticos (SEP), por meio do KDD, para a
gerao de redes bayesianas.

Utilizao de um algoritmo para a realizao da extrao de


conhecimento de uma base de dados mdica, para a gerao
automtica de uma rede bayesiana, sendo esse processo
intermediado por um especialista.
Inteligncia Artificial e Medicina
KDD APLICADO EM REDES BAYESIANAS
Inteligncia Artificial e Medicina
Redes Bayesianas so modelos grficos para raciocnio baseado na
incerteza, onde os ns representam as variveis, e os arcos
representam a conexo direta entre eles (Korb & Nicholson, 2003).

Probabilidades

SISTEMA 2,7
ESPECIALISTA 7,5
PROBABILSTICO
0,4
Base de
conhecimento
Inteligncia Artificial e Medicina
Probabilidades da ocorrncia das complicaes de acordo com os fatores de
risco.

Causas

Efeitos

Potencial das RBs em domnios de aplicaes na rea Mdica que no


envolvam diagnstico, como por exemplo, em aplicaes voltadas a rea de
Bioestatstica, voltando-se questes que envolvem fatores de risco e
complicaes.
Estudo de Caso: IA Aplicada no Diagnostico de
Diabetes
Sistema Inteligente para Apoio ao Diagnstico de Diabetes
Empregando Redes Neurais

Cirurgia Trabalho desenvolvido na UFSM de Frederico Westphalen


Uso de base de dados da comunidade indgena americana PIMA
Taxa de acertos de 81,3%
264 milhes de casos de diabetes em todo mundo
350 milhes de casos ate 2025
Brasil: 11 milhes de casos (7,5 tem conscincia)
Tempo para deteco do Diabetes pode ser superior a 10 anos
Causas da Diabetes;
Obesidade
Hereditariedade
Hbitos alimentares
Sedentarismo
Vrios fatores devem ser levados em considerao pelos mdicos no
diagnostico
Desenvolvimento do SND: Sistema Neural de Apoio ao Diagnostico do
Diabetes.
Estudo de Caso: IA Aplicada no Diagnostico de
Diabetes
Redes Neurais Artificias (RNA)
Baseadas no sistema neural biolgico
Sistemas massivamente paralelos e distribudos, formadas por unidades
de processamento simples, que calculam determinadas funes,
normalmente no lineares.
Operao das RNA
Fase de Treinamento
Fase de Teste
Aprendizado
Supervisionado
No Supervisionado
Arquiteturas
Camada nica
Mltiplas camadas
Tipos de conexes
No recorrentes Feedforward
Algoritmos de aprendizagem Back propagation
Recorrentes - Backforward
Mltiplas camadas
Estudo de Caso: IA Aplicada no Diagnostico de
Diabetes
Redes Neurais Artificias (RNA)

Operao das RNA


Fase de Treinamento
Fase de Teste
Aprendizado
Supervisionado
No Supervisionado
Arquiteturas
Camada nica
Mltiplas camadas
Estudo de Caso: IA Aplicada no Diagnostico de
Diabetes
Base de dados PIMA Indians
Universidade de California (UCI, 2014): PIMA Indians Diabetes (PID)
Comunidade indigena Pima Phoenix, Arizona, EUA
Mulheres com idades iguais ou superiores a 21 anos
Esta comunidade tem a mais alta taxa de incidncia de diabetes no mundo
Entre adultos, 50% so diabticos

Base PID - 768 pessoas

268 Diabetes do tipo 2 (34,9% da base)


Dados de cada mulher da base:
Numero de vezes que a paciente ficou gravida
Presso arterial diastlica (mmHg)
Espessura da dobra cutnea do trceps (mm)
Idade (anos)
Classe a qual pertence a paciente (possui ou no diabetes)
Estudo de Caso: IA Aplicada no Diagnostico de
Diabetes
Resultados
SND: Sistema Neural para Auxlio ao Diagnstico de Diabetes

Dados de treinamento e teste da RNA


Estudo de Caso: IA Aplicada no Diagnostico de
Diabetes
Resultados

Grfico do Erro Quadrtico com as iteraes.


Evoluo dos Algoritmos de IA e Funo do Dr.
Algoritmo
Segundo Lloyd Minor de Stanford: Os algoritmos vo
comandar os futuros ganhos na sade... Ns estamos agora em
um momento onde a inovao esta no nvel algortmico

Interessante repensar a sade, tornando-a mais abrangente e de


menos custo

Quais algoritmos de IA devem ser empregados ?


Aprendizagem de Mquina (Machine Learning)
Aprendizagem Profunda (Deep Learning) Deteco de vrios tipos de
cncer

Processamento de Linguagem Natural (NLP)


Assistentes Virtuais (Chatbots)
Processamento de informaes textuais ou manuscritas
Evoluo dos Algoritmos de IA e Funo do Dr.
Algoritmo
Principais problemas para implementao de algoritmos em sade:
Integrao de mltiplas fontes de dados
Cumprimento de exigncias legais

Exemplos de chats em hospitais:


Babylon Health rede britnica de hospitais
Processamento de fala no atendimento aos clientes:
Agendamento de consultas
Registro de pessoas que entram no hospital
Emprego de NLP analise de artigos de revistas e outros documentos
sumarizao para mdicos

Sade:
Mercado muito promissor para IA
Grandes volumes de dados:
Inferncias
Reconhecimento de padres
Big Data:
Dados histricos dos pacientes
Imagens medicas
Estticas epidemiolgicas

Despesas com sade atingiram 10% do PIB mundial em 2014


INF/UFRGS: Pesquisas na rea da Sade

Esta apresentao sumariza o material recebido pela Direo do INF


referente a projetos de pesquisa desenvolvidos no INF/UFRGS que
possuem relao com a rea da Sade.
Ao total, 12 professores se manifestaram.
Do ponto de vista da Cincia da Computao, estes projetos de
pesquisa abrangem principalmente as seguintes reas:

Computao grfica e Aprendizagem de Desenvolvimento de Desenvolvimento


processamento de Mquina e Minerao aplicativos mveis e tecnolgico em udio e
imagens de dados ambientes inteligentes vdeo

Bioinformtica e Modelagem de
Engenharia de software Otimizao
Biologia Computacional processos

2
Funes essenciais de um Hospital

A Organizao Mundial da Sade e o Ministrio da Sade definem trs


funes essenciais para hospitais gerais, de referncia:
Assistncia: cuidados com a sade da populao, a qual podemos
subdividir em:
Atividades fins, que tratam da ateno direta ao paciente
Servios de apoio, referentes ao suporte tcnico especializado
essencial para o cumprimento das atividades fins
Ensino: formao de recursos humanos qualificados
Pesquisa: gerao de conhecimentos inovadores, com potencial
de aprimorar as atividades assistenciais (preveno, diagnstico, e
tratamento)

3
Organizao desta apresentao

Dadas as definies apresentadas acerca de funes essenciais de um


hospital geral de referncia, esta apresentao est organizada de
forma a aproximar-se desta estrutura

Embora todo o material aqui contido seja referente a projetos de


pesquisa na rea da Computao, os mesmos possuem diferentes
aplicaes e relaes com as funes essenciais de um Hospital

Portanto, os projetos de pesquisa sero apresentados conforme suas


potenciais aplicaes no aprimoramento e apoio ao desenvolvimento
das atividades bsicas de um Hospital: assistncia, ensino e pesquisa,
estando a assistncia subdividida em atividades fins (ateno direta ao
paciente) e servios de apoio

4
Aplicaes
Os projetos de pesquisa conduzidos no INF desenvolvem e viabilizam a
Computao como uma importante aliada na execuo das funes
essenciais de um hospital, prestando apoio s atividades de:

Atividades fins Servios de Apoio

Assistncia

Ensino Pesquisa

Hospitais gerais de referncia visam: excelncia na assistncia populao,


preventiva e curativa, na formao de recursos humanos, e na gerao de
conhecimentos inovadores
5
Aplicaes: assistncia Atividades fins

Aplicativos mveis e ambientes


Verificao e inteligentes para apoio na adeso a
disseminao de tratamentos e reabilitao dos
instrutivos mdicos pacientes

Sistemas de apoio Modelos preditivos


telessade e de diagnstico,
telemedicina prognstico
e tratamento
Assistncia

Ensino Pesquisa

6
Aplicaes: assistncia Atividades fins

MIR - Sala Cirrgica Inteligente


Desenvolvimento e validao de um modelo de sala
cirrgica inteligente modular e de baixo custo, voltada
para ambientes de cirurgias assistidas distncia.
Vantagens:
Cirurgio especialista: maior preciso, reduo de
tempo do ato cirrgico
Cirurgio residente: treinamento de recursos
humanos capacitados em cirurgias minimamente
invasivas no mais limitado a grandes centros,
orientao remota por especialistas
Paciente: maior conforto durante procedimentos
que no exigem anestesia geral, possibilidade de
bom atendimento mesmo em unidades
assistenciais de baixa complexidade
Envolvidos:
Prof. Valter Roesler
Laboratrio do PRAV (Projetos em udio e Vdeo)

7
Aplicaes: assistncia Atividades fins

MIR - Sala Cirrgica Inteligente

Primeira cirurgia utilizando o primeiro prottipo


desenvolvido, no Hospital Santa Casa de
Misericrdia de Porto Alegre (abril/2012)

8
Aplicaes: assistncia Atividades fins

Projeto MobileCare
Servio para monitoramento remoto de pacientes com doenas
crnicas (diabetes, hipertenso, etc), permitindo assistncia
ininterrupta e alerta de necessidade de ateno especial
Laureado com o Social Systems Innovation Award, melhor
soluo mvel, International Society for Telemedicine and
eHealth ISFTEH (Japan, 2013).

Pacientes monitoram sua sade em casa com No centro de monitoramento, informaes so


smartphone/tablet conectado a dispositivos mdicos, analisadas e quando apresentam-se fora do
conforme prescrio personalizada. Informaes so threshold normal, so enviadas equipe de sade
enviadas automaticamente ao centro de monitoramento. para atendimento especial/emergencial ao paciente.
9
Aplicaes: assistncia Atividades fins

Projeto WebECG
Completo sistema de gerenciamento de tele-eletrocardiograma
de repouso que permite controle total e digitalizao do
processo de tele-ECG.
Permite que cardiologistas facilmente preparem um laudo de
eletrocardiograma remotamente, usando um navegador web
simples ou um smartphone on-the-go. Compatvel com vrios
fabricantes de dispositivos ECG e pode ser integrado aos
sistemas HIS ou PACS usados por hospitais e clnicas.

10
Aplicaes: assistncia Atividades fins

Verificao e disseminao de instrutivo mdico para tratamento da


Leshmaniose cutnea
Envolvidos: Prof. rika Cota, em colaborao com FIOCRUZ/MG
Guideline original Gramtica de Grafos, representando cada ao do guideline
com seu respectivo conjunto de pr-condies e de efeitos

Mltiplos rounds de verificao possibilitou deteco de


problemas referentes a ambiguidade, omisso de
informaes, excees e diferentes cenrios de aplicao

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Aplicaes: assistncia Atividades fins

Verificao e disseminao de instrutivo mdico para tratamento da


Leshmaniose cutnea
Fase de verificao: Guideline final dividida em 4 partes, sendo i) anlise da
leso, ii) infiltrao em leses pequenas (1 ponto de infiltrao), iii) infiltrao
em leses maiores, iv) infiltrao adicional em caso de no saturao.

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Aplicaes: assistncia Atividades fins

Verificao e disseminao de instrutivo mdico para tratamento da


Leshmaniose cutnea
Fase de disseminao: Proposto o desenvolvimento de um aplicativo mvel
para disseminao do instrutivo mdico verificado, e armazenamento de dados
coletados em campo para futuras anlises

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Aplicaes: assistncia Atividades fins

Aplicativos mveis para apoio na adeso ao tratamento e na reabilitao


de pacientes
Estudo PREVER: ensaios clnicos randomizados com foco na preveno e
tratamento da hipertenso
Muitos pacientes no aderem ao tratamento de forma eficaz. Aplicativos mveis
utilizados em 2 grupos para captura de valores de presso arterial* (enviados ao
servidor), e envio de frases motivacionais com dicas de sade por push
notification, visando aumentar adeso ao tratamento e a melhora da qualidade
de vida dos pacientes
Envolvidos: Prof. Cirano Iochpe, prof. Valter Roesler, colaborao com Estudo PREVER

*Imagens meramente ilustrativas 14


Aplicaes: assistncia Atividades fins

Ambientes inteligentes para apoio na adeso ao tratamento e na


reabilitao de pacientes
Ambientes inteligentes capazes de perceber o contexto do usurio e reagir
apropriadamente a fim de auxiliar em um melhor bem estar
Desenvolvido um modelo conceitual para analisar informaes e executar aes
relevantes referentes aos cuidados com populao idosa, acometida com
doenas que requerem cuidado especial e constante
Envolvidos: Prof. Jos Palazzo de Oliveira, Prof. Leandro Krug Wives

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Aplicaes: assistncia Atividades fins

Modelos preditivos de diagnstico, prognstico e tratamento


Mtodos de aprendizagem de mquina para treinamento de modelos de
classificao ou regresso aplicveis como apoio clnica mdica
A partir de um conjunto de dados de pacientes com diagnstico/prognstico/
tratamento conhecido, generalizar este conhecimento para auxiliar na tomada de
deciso referente a novos casos.
Envolvidos:
Profa. Mariana Mendoza;
Prof. Cludio Jung (colaborao com Lab. Psiquiatria Molecular/HCPA e UFPel)

Pacientes j tratados Novo paciente

? Modelo de
classificao
Tratamento
B

Dados clnicos
Treinamento e avaliao a
(atributos)
partir de dados conhecidos,
com mtodos computacionais
Tratamento A Dados
Tratamento B clnicos
Tratamento C 16
Aplicaes: assistncia Servios de apoio

Anlise de sentimentos
Otimizao da alocao
de profissionais e
facilidades

Processamento e
Extrao de anlise de imagens
processos mdicas
e anlise de Assistncia
excees em
domnios mdicos

Ensino Pesquisa

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Aplicaes: assistncia Servios de apoio

Extrao de processos a partir de linguagem natural e anlise de excees


em domnios mdicos
Avaliar a corretude e eficincia na
execuo de processos internos.
Caracterizar possveis excees,
investigando estratgias para
incorpor-las ao processo,
tornando-o mais dinmico e apto a
lidar com as mesmas
Envolvidos: Profa. Lucinia Thom

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Aplicaes: assistncia Servios de apoio

Otimizao da alocao de profissionais e facilidades na rea da sade


Envolvidos: Profa. Luciana Buriol
Otimizao uma rea que trata da resoluo de problemas difceis e com
diversas restries a serem respeitadas
Por exemplo, definir os avies e a tripulao de cada rota de uma companhia area
um problema de otimizao bem difcil: prazos tm que ser cumpridos,
capacidades respeitadas, disponibilidade da aeronave, pessoal, etc.
Alocao de profissionais nos postos de trabalho: problema comum a todas as
instituies da rea da Sade
Diversas restries existentes, tais como regras da CLT do profissional, horrios da
instituio, habilidades do profissional, nmero de profissionais de cada
especialidade em cada turno, etc.

Tabelas de escala so preparadas com at 2 meses de antecedncia


humanamente impossvel produzir tabelas otimizadas para bases de dados
grandes (>50 pessoas).

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Aplicaes: assistncia Servios de apoio

Otimizao da alocao de profissionais e facilidades na rea da sade


Projetos e aplicaes na Sade:
Resoluo da tabela de escala dos mdicos (>600),
em colaborao com o HCPA
Resoluo da tabela de escala de enfermeiras e
outros profissionais de um hospital da Blgica (em
conjunto com KU Leuven)

Outros projetos:
Definio de rota e ordem de entrega de produtos
de uma grande rede de farmcias (variaes deste Ex: Alocao de enfermeiras e
problema ocorrem na rede pblica) mdicos de um hospital. Tabela
de 9 profissionais em uma semana
Outros problemas de definio de rotas, alocaes (E: manh, L: tarde, N: noite, -: livre)
de profissionais, cirurgias, etc, podem ser
elaborados.
Experincia na resoluo de problemas de
otimizao de outras reas, tais como transporte,
telecomunicaes, bioinformtica, entre outros.

20
Aplicaes: assistncia Servios de apoio

Anlise de sentimentos
Envolvidos: Profa. Karin Becker Documentos (avaliaes, blogs,
Aplicaes na Sade: emails, tweets, literatura, etc)
Avaliao (atendimento de sade
recebido, condies de trabalho de
profissionais)
Caracterizao de estados ou distrbios
mentais (ex: suicdio, depresso) visando
previso, acompanhamento, identificao
Anlise de
de personalidade
Sentimento
Acompanhamento de doenas ou
tratamentos pelos sentimentos dos
pacientes (ex: cancer)
Apoio social/emocional (ex: como Sentimento
escrever emails no agressivos, Exemplos de Sentimentos
desenvolvimento de argumentos Polaridade: positivo, negativo
persuasivos, empowerment , etc ) Emoo: triste, alegre, surpreso,
Avaliao de leituras adequadas ( idade, brabo, sobrecarregado, etc
ao gnero, ao estado emocional, etc) pelo Posicionamento: a favor, contra
sentimento expresso
21
Aplicaes: assistncia Servios de apoio

Processamento e anlise de imagens mdicas


Envolvidos: Prof. Jacob Scharcanski
Processamento e medies baseadas em imagens na clnica mdica
Dermatologia, acompanhamento do tratamento (por exemplo, tumores pulmonares),
tecnologias assistivas baseadas em viso computacional, screening endoscpico e
summaries, mamografia de screening e summaries, etc.

Projetos:

Segmentao de imagens obtidas por Segmentao de achados Deteco de achados em vdeos


cmera padro (ex: smartphone). Uso suspeitos a partir de mdicos, identificao de trechos
para pre-screening de leses de pele imagens mdicas clinicamente relevantes para
com potencial maligno diagnstico/prognstico

22
Aplicaes: ensino

Sistemas de multipresena
para educao continuada

Assistncia

Ensino Pesquisa

Realismo grfico em simuladores


virtuais de cirurgias

Modelos personalizados para


planejamento de cirurgias 23
Aplicaes: ensino
Sistemas de multipresena para educao continuada
MIR - Sala Cirrgica Inteligente: fornece suporte para
interao com grandes auditrios atravs de video
conferncia
Aplicao no ensino: especialista pode efetuar a cirurgia
e transmitir a mesma em tempo real, inclusive podendo
responder a dvidas que surjam remotamente
Envolvidos: Prof. Valter Roesler

24
Aplicaes: ensino
Sistemas de multipresena para educao continuada
Mconf: sistema de Conferncia Web baseado em software
livre, com capacidade de interoperar transparentemente entre
computadores e dispositivos mveis conectados web
Possibilitar que usurios distantes geograficamente interajam
por meio de udio, vdeo, quadro de notas e bate-papo,
compartilhem textos, apresentaes, imagens e telas de
computador, tudo atravs do navegador web
Envolvidos: Prof. Valter Roesler

25
Aplicaes: ensino
Sistemas de multipresena para educao continuada
Sistema de video conferncia de baixo custo que permite a
interoperao de muitas tecnologias para atender a uma
infinidade de dispositivos e padres de comunicao
O projeto integra salas de telepresena, sistema de
Conferncia Web, vdeo de alta definio, e possibilidade de
colaborao e compartilhamento de contedo
Envolvidos: Prof. Valter Roesler

26
Aplicaes: ensino
Modelos anatmicos especficos de pacientes para simuladores cirrgicos
A gerao de modelos anatmicos a partir de dados de pacientes, como
exames de imagem, pode auxiliar no planejamento de procedimentos cirrgicos
atravs da definio de modelos personalizados dadas as condies de sade
de um paciente, bem como no incremento de simuladores virtuais de cirurgia
Envolvidos: Prof. Anderson Maciel, Prof. Marcelo Walter, Prof. Joo Comba

27
Aplicaes: ensino
Realismo grfico em simuladores virtuais de cirurgia
Sistema grfico interativo para cortes arbitrrios em estruturas anatmicas,
reconstruindo a textura nas superfcies da zona de corte de forma a respeitar
as estruturas internas.
Aquisio de dados de rgos in vivo a partir de videolaparoscopia para
renderizao com alto nvel de aproximao da interao luz matria
Envolvidos: Prof. Anderson Maciel, Prof. Marcelo Walter
3 Lugar no Workshop de Teses e Dissertaes SIBGRAPI
Dissertao de mestrado de Augusto L.P. Nunes

28
Aplicaes: pesquisa

Bioinformtica estrutural para


desenho racional de frmacos

Assistncia

Ensino Pesquisa

Identificao de biomarcadores Integrao de dados


genmicos e alvos teraputicos micos para estudo de
doenas complexas
29
Aplicaes: pesquisa
Bioinformtica estrutural para desenho racional de frmacos
Aprendizagem de mquina e meta-heursticas para problemas de bioinformtica
estrutural
Envolvidos: Prof. Mrcio Dorn

30
Aplicaes: pesquisa
Anlise integrativa de dados genmicos para estudo de doenas complexas
Aplicar e desenvolver estratgias computacionais para integrao eficiente e
consistente de dados genmicos utilizando uma abordagem baseada em redes
Identificar genes e mdulos associados a doenas complexas a partir da anlise
da rede gerada
Envolvidos: Prof. Mariana Mendoza, colaborao com HCPA
Lab. de Pesquisa Cardiovascular
Lab. de Medicina Genmica

Fonte: EMBL-EBI 31
Aplicaes: pesquisa
Identificao de biomarcadores genmicos e alvos teraputicos
Desenvolvimento de mtodos computacionais para descoberta de
biomarcadores de valor diagnstico, prognstico e teraputico a partir de
dados genmicos em larga escala
Colaborao com HCPA (Profa. Mariana Mendoza)
Lab. de Biologia das Ilhotas Pancreticas Humanas
Lab. de Pesquisa Cardiovascular
Lab. de Medicina Genmica

32
Aplicaes: pesquisa
Identificao de biomarcadores genmicos e alvos teraputicos
Projeto Bioinformtica aplicada medicina personalizada: do diagnstico ao
tratamento de doenas (FAPERGS/PRONUPEQ 2016)
Envolvidos: Prof. Mrcio Dorn, Profa. Mariana Mendoza, Profa. Ana Bazzan,
HCPA, FURG e outras instituies regionais e internacionais colaboradoras

33
Workshop Latino-Americano de Neurocincia
Computacional LAWCN
LAWCN - 2017
LAWCN 2017 Keynote Speakers

Francisco Sotres Bayn, PhD

Understanding the brain


mechanisms of learned and innate
motivational conflict.

Short Bio: Dr. Francisco Sotres-Bayon, studied Biology at Universidad Nacional


Autnoma de Mexico (UNAM), then did Doctorate studies at New York University
(NYU) with Joseph LeDoux and Postdoctoral work at University of Puerto Rico
(UPR) with Gregory Quirk. Currently he runs his own laboratory as Research
Associate Professor in the Instituto de Fisiologa Celular at UNAM. He has studied
the neurobiology of defensive responses to threats (fear) and its extinction.
Currently his research focuses on the brain mechanisms that underlie the
competition between threat-related behaviors and reward-related behaviors in rats.
He has published 18 articles and two book chapters which have been cited more
than 2,000 times. He has received several honors, including the Return Home
Fellowship awarded by the International Brain Research Organization.
LAWCN 2017 Keynote Speakers

Prof. Laurence Devillers

Towards social and affective


relations with a robot : Joke
and Empathy of a Robot/ECA

Short Bio: PhD in Computer science (1992), Combining TDNN and HMM in a hybrid system for acoustic-phonetic decoding,
University Paris-Orsay, France, HDR (habilitation dissertation) in Computer Science (2006), Emotion in interaction:
Perception, detection and generation University Paris-Orsay, France. Full Professor of Computer Science (Affective
Computing and AI) at Paris-Sorbonne University (2011-present) Researcher at LIMSI-CNRS Distinguished Lecturer for ISCA
2017-2018 Research work: Her research background is in affective computing, machine learning, speech recognition, signal
analysis, spoken dialog system, evaluation and ethics. Since 2001, she leads a team at LIMSI-CNRS (Orsay) on Affective
and social dimensions in spoken interaction with robots (5-10 researchers). She already directed 10 PHD thesis (+ 4 current
PHDs) and 5 post-docs. She participates in BPI ROMEO2 project, which has the main goal of building a social humanoid
robot. She leads the EU CHISTERA project JOKER: JOKe and Empathy of a Robot. She is involved in the Eurobotics Topic
Groups on social and affective robotics. She is member of the CERNA (French national committee) on the ethics of the
Research in Robotics and heads the Machine Learning/AI and Ethics WG. She is also involved in the Affective Computing
Committee of the IEEE Global Initiative for Ethical Considerations in the Design of Autonomous Systems (2016-17). She also
wrote a book for a wide audience on the regulation, the ethics and the interaction man-robot (Plon editor in France): Robots
and Humans: myths, fantasms and reality (Des robots et des homes: mythes, fantasmes et ralit) (2017).
LAWCN 2017 Keynote Speakers

Prof. Dr. Sen Cheng

Intrinsic sequences in the


hippocampus for spatial
navigation and memory storage

Short Bio: Sen Cheng is Professor of Computational Neuroscience in the Institute for Neural
Computation at the Ruhr University Bochum, co-chair of the Mercator Research Group
Structure of Memory, and speaker of the Research Department of Neuroscience. The goal of
his research is to understand the cognitive and neural mechanisms of episodic memory and
spatial representations. To this end, he mostly uses computational methods, including
spiking neural networks, cognitive modeling and machine learning. He has published more
than 20 peer-reviewed articles in the field of learning and memory.
LAWCN 2017 Keynote Speakers

Guillermo Cecchi, Ph.D.

Speech-based automated
diagnosis and prognosis of
neuropsychiatric disorders

Short Bio: Guillermo Cecchi received an education in Physics (MSc, University of La


Plata, Argentina), Physics and Biology (PhD, The Rockefeller University), and Imaging in
Psychiatry (Postdoctoral Fellow, Cornell University). He has been interested in diverse
aspects of theoretical biology, including Brownian transport, molecular computation, spike
reliability in neurons, song production and representation in songbirds, statistics of natural
images and visual perception, statistics of natural language, and brain imaging. In 2001
he joined IBM Research to work on computational approaches to brain function. In recent
years, Dr. Cecchi has pioneered the use of a computational linguistics approach to
quantify psychiatric conditions from short speech samples, applying it successfully to
conditions as diverse as schizophrenia, mania, prodromal psychosis, and drug and
alcohol intake.
LAWCN 2017 Keynote Speakers
Prof. Dr. Antonio C. Roque

A spiking neural network


model of spontaneous brain
activity dynamics.

Short Bio: Antonio C. Roque was born in Sao Paulo, Brazil in 1963. He received his BSc degree
in Physics from the State University of Campinas, Brazil, in 1983, and his PhD degree in
Computer Science and Artificial Intelligence from the University of Sussex, UK, in 1992. He joined
the faculty of the Department of Physics of the University of Sao Paulo at Ribeirao Preto, Brazil, in
1993 where he is now Associate Professor. He founded and is the current coordinator of the
Laboratory of Neural Systems (sisne.org), a pioneer laboratory in computational neuroscience in
Brazil. His research interests are detailed computational modeling of neurons and brain structures
and animal behavior. Throughout his career, he published more than fifty journal papers and
supervised eighteen PhD theses. He is the creator and organizer of the Latin American School on
Computational Neuroscience (LASCON). He is currently Principal Investigator and Technology
Transfer Coordinator of the Research, Innovation and Dissemination Center for
Neuromathematics (NeuroMat), a Sao Paulo Research Foundation (FAPESP) Center. He is also
former member of the Board of Directors of the Organization for Computational Neuroscience
(OCNS) and the Brazilian Society for Neuroscience and Behavior (SBNeC).
LAWCN 2017 Keynote Speakers
Vinicius Rosa Cota, PhD

Toward a neural prosthesis to the


epileptic brain by tackling neural
hypersinchronism

Short Bio:Vincius R. Cota is associate professor in the Department of Electrical Engineering


of Federal University of So Joo Del-Rei (UFSJ) in the field of Neuroengineering. He
received his bachelor degree of Electrical Engineer from Federal University of Minas Gerais
in 2002 and received his PhD in Bioinformatics from the same institution in 2007. During his
doctorate, Dr. Cota studied the neurodynamics of forebrain areas in Epilepsy, aiming at EEG
feature extraction for seizure prediction and the usage of electrical stimulation for seizure
suppression. During his post doctorate in the International Neuroscience Institute of Natal
(Rio Grande do Norte, Brazil), he investigated causal relations between states of the sleep-
wake cycle and memory consolidation according to Hebbian postulates. At UFSJ, he currently
researches both neurobiological and technological aspects of neuroengineering as a means
to treat epilepsy and related comorbidities. With collaborators, he was the developed a
nonstandard, temporally unstructured low frequency pattern of therapeutic brain electrical
stimulation, of which he holds a patent. He is also the founder and leader of the Laboratory of
Neuroengineering and Neuroscience (LINNce) at UFSJ.
LAWCN 2017 Keynote Speakers
Pedro Schestatsky, MD, PhD

Electricity and the Brain:


past, present and future

Short Bio: Possui Graduao em Medicina pela Faculdade de Medicina da Universidade Federal do Rio Grande do Sul
(UFRGS) (1999), Mestrado (2004) e Doutorado (2007), ambas pela Ps-Graduao em Cincias Mdicas da UFRGS, sendo
a ltima realizada parcialmente no Hospital Clnico de Barcelona. Foi consultor em medicamentos da Secretaria da Sade
do Rio Grande do Sul, Ministrio da Sade e Agncia Nacional de Vigilncia Sanitria (ANVISA). neurologista e
neurofisiologista do Hospital de Clnicas de Porto Alegre. Tem experincia na rea de Neurologia com principal nfase em
Eletroneuromiografia (Especializao pela Universidade de Barcelona - 2005 a 2007), Doenas Neuromusculares (Fellow
Observer pela Harvard University - 2011) e Neuromodulao (Harvard University, 2012). Como professor da Ps-Graduao
em Cincias Mdicas e Psiquiatria da UFRGS, suas linhas de pesquisa incluem Fisiologia da Dor, Sistema Nervoso
Autonmico e Distrbios do Movimento. revisor de peridicos representativos na rea da Neurologia e Neurofisiologia, tais
como "Brain", "Movement Disorders", "Clinical Neurophysiology", "Parkinsonism and Related Disorders", "European Journal
of Neurology", "Expert Opinion on Drugs Safety" entre outros. Em 2009 foi nomeado Chefe do Comit de Dor da European
Neurological Society (ENS) e do Departamento Cientfico de Dor da Academia Brasileira de Neurologia, cargos exercidos
at o ano de 2014. Em 2012 realizou Ps-Doutorado pela Universidade Harvard na rea de Neuromodulao e em janeiro
de 2013 iniciou suas atividades como Professor Adjunto do Departamento de Medicina Interna da Universidade Federal do
Rio Grande do Sul (UFRGS) aps realizao de Concurso Pblico
LAWCN 2017 Keynote Speakers

Prof. Fernando Cendes

Imaging normal and


abnormal brain plasticity

Short Bio: After graduating in medicine and completing a neurology residency at UNICAMP,
Brazil, Fernando Cendes did a postdoctoral fellowship on EEG, neuroimaging, and epilepsy
at McGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital, Montreal, QC, Canada
from 19911997 and received a Ph.D. in Neuroscience from McGill University in 1997. He is
currently Full Professor of Neurology and Coordinator of the epilepsy surgery program at the
Department of Neurology, Medical School of the University of Campinas (UNICAMP), Brazil.
He is a member of the Diagnostic Methods Commission of the International League Against
Epilepsy and Associate Editor of Epilepsy. His current research interests include
neuroimaging and the medical and surgical treatment of epilepsy.
LAWCN - 2017
Concluses

Benefcios da IA:
Ajudar mdicos na melhora de
diagnsticos
Prever disseminao de doenas
Personalizar tratamentos

Binod Khosla, cunhou em 2014 a expresso Dr Algoritmo:

A tecnologia ira reinventar a Sade como a conhecemos.


E inevitvel que, no futuro, a maioria dos diagnsticos,
prescries e monitoramento dos pacientes, que ao longo
do tempo podem aproximar 80% do tempo total de
mdicos/residentes, ser substituda por hardware,
software e testes inteligentes.
Obrigado!

Duvidas?

Contato: dante.barone@gmail.com

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