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y

MATCONT and CL MATCONT:

Continuation toolboxes in matlab

A. Dhooge, W. Govaerts, Yu.A. Kuznetsov, W. Mestrom, A.M. Riet and B. Sautois December 2006

1

0.5

0

−0.5

−1

1 0.6 0.4 0.5 0.2 0 −0.2 0 −0.4 −0.6
1
0.6
0.4
0.5
0.2
0
−0.2
0
−0.4
−0.6

x −0.8

α

0 −0.5 −1 1 0.6 0.4 0.5 0.2 0 −0.2 0 −0.4 −0.6 x −0.8 α

Belgium

0 −0.5 −1 1 0.6 0.4 0.5 0.2 0 −0.2 0 −0.4 −0.6 x −0.8 α

Utrecht University The Netherlands

Contents

1 Introduction

 

5

1.1

Features

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5

1.2

Software requirements

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1.3

Availability

 

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1.4

Disclaimer

 

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9

2 Numerical continuation algorithm

 

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2.1

Prediction

 

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10

2.2

Correction

 

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10

2.2.1 Pseudo-arclength continuation

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10

2.2.2 Moore-Penrose continuation

 

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11

2.3

Stepsize control

 

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3 Singularity handling

 

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3.1 Test functions

 

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13

3.2 Multiple test functions

 

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13

3.3 Singularity matrix

 

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3.4

User location

 

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4 Software

 

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4.1 System definition

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4.2 Continuation and output

 

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4.3 Curve file

 

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4.4 Options

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18

 

4.4.1 The options-structure

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18

4.4.2 Derivatives of the ODE-file

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20

4.4.3 Singularities and test functions

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21

4.4.4 Locators

 

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21

4.4.5 User functions

 

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21

4.4.6 Defaultprocessor

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22

4.4.7 Special processors

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22

4.4.8 Workspace

 

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22

4.4.9 Adaptation

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4.4.10 Summary

 

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4.5 Error handling

 

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23

4.6 Structure

 

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4.7 Directories

 

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25

5 Continuer example:

a circle object

 

27

6 Time integration and Poincar´e maps

 

29

6.1 Time integration

 

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29

 

6.1.1 Solver output properties .

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29

6.1.2 Jacobian matrices

 

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30

6.2 Poincar´e section and Poincar´e map

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30

 

6.2.1

Poincar´e maps in MatCont

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30

 

2

6.2.2

The Steinmetz-Larter example

 

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31

7 Equilibrium continuation

 

34

7.1 Mathematical definition

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34

7.2 Bifurcations

 

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34

7.2.1

Branch point locator

 

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7.3 Equilibrium initialization

 

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7.4 Bratu example

 

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36

8 The Brusselator example: Continuation of a solution to a boundary value problem in a free parameter

41

9 Continuation of limit cycles

 

46

9.1 Mathematical definition

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46

9.2 Bifurcations

 

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46

9.2.1 Branch Point Locator

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9.2.2 Processing

 

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48

9.3 Limitcycle initialization

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9.4 Example

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50

9.5 The phase response curve

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53

10 Continuation of codim 1 bifurcations

 

57

10.1 Fold Continuation

 

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57

10.1.1 Mathematical definition

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57

10.1.2 Bifurcations

 

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10.1.3 Fold initialization

 

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58

10.1.4 Adaptation

 

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59

10.1.5 Example

 

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59

10.2 Hopf Continuation

 

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61

10.2.1 Mathematical definition

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61

10.2.2 Bifurcations

 

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61

10.2.3 Hopf initialization

 

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62

10.2.4 Adaptation

 

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62

10.2.5 Example

 

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10.3 Period Doubling

 

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64

10.3.1 Mathematical definition

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