Toma de Muestra Examenes Microbiologicos

SISTEMA DE GESTION DE LA CALIDAD
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PROCEDIMIENTOS DE TOMA DE MUESTRA DE EXAMENES Versin 1
MICROBIOLGICOS, V1 Emisin: 09/2015
Vigencia: 09/2020
2. Objetivo
Proporcionar la informacin necesaria al profesional que se enfrenta a la toma de

muestra de exmenes bacteriolgicos; con el propsito de que pueda aplicar
correctamente los procedimientos de toma de muestra de este tipo, a fin de obtener un
espcimen libre de contaminacin y que de acuerdo a su localizacin, permita un
diagnostico bacteriolgico preciso, el cual se logra a travs de la estandarizacin de las
condiciones requeridas del paciente; de las condiciones de la muestra: recoleccin,
manejo, transporte y del material necesario para ello.
3. Alcance
Aplica a la totalidad de las muestras que se solicitan para exmenes microbiolgicos al

Laboratorio Clnico del Hospital la Serena, independiente de su procedencia, las cuales
se describen a continuacin:
3.1 Muestras de sangre

Hemocultivos
Cateter endovenoso
Cultivo semicuantitativo de cateter (tcnica de Maki)
Hemocultivos tiempo diferencial
3.2 Muestras del tracto urinario

Urocultivo
Cateter de permanencia prolongada.
Puncin suprapbica.
3.3 Muestras del tracto gastrointestinal

Coprocultivo.
Rotavirus, Leucocitos Fecales.
Deteccin de GDH (Glutamato deshidrogenasa) y toxinas de Clostridium difficile
Bilicultivo.
3.4 Muestras de lquidos biolgicos

Lquido cefalorraqudeo (LCR)
Lquido de cavidades serosas
Lquido de peritoneodilisis
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3.5 Muestras del tracto respiratorio

Muestras del tracto respiratorio superior
Secrecin farngea
Secrecin nasal
Secrecin ocular
Secrecin tica
Muestras del tracto respiratorio inferior

Expectoracin
Lavado bronco alveolar
Aspirado traqueal o secreciones traqueales
3.6 Muestras del tracto genital

Secreciones del tracto genital femenino
Secreciones del tracto genital masculino
3.7 Muestras de piel y tejidos blandos

Heridas superficiales y abscesos abiertos
Herida quirrgica
3.8 Muestras para estudio micolgicos

Micosis superficiales
Candidiasis sistmica
3.9 Cultivos anaerobios
4. Responsables de su aplicacin
Mdico tratante, Enfermera, Matrona; Dentista, Otros profesionales de la Salud:

Solicitud del examen, toma de muestras y/o rotulacin de la muestras
Tcnicos Paramdicos, Auxiliares de Servicio de los Servicios Clnicos: Transporte

de la muestra
Tcnicos Paramdicos del Laboratorio: Recepcin de la Muestra.
Tcnicos Paramdicos de la seccin de Microbiologa: Siembra de cultivos.

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Tecnlogos Mdicos de la seccin de Microbiologa: identificacin y anlisis

microbiolgicos. Planificacin y control de calidad.
Tecnlogo Mdico Encargado de la Seccin de Microbiologa y Jefe del

Laboratorio: Supervisin.
5. Referencias
Manual del estndar general de acreditacin para prestadores institucionales de

atencin cerrada; Caracterstica APL 1.2
Carmen Guerrero Gmez Carlos Snchez Carrillo Sociedad espaola de

enfermedades infecciosas y microbiologa clnica. 1 edicin 1993 Protocolo 1:
Recogida, transporte y conservacin de las muestras. Disponible en :
https://www.seimc.org/contenidos/documentoscientificos/procedimientosmicrobiol
ogia/seimc-procedimientomicrobiologia1a.pdf
Inmaculada Garca Garca ; Fernando Garca Garrote; Jos Elas Garca

Snchez ;Isabel Snchez Romero, Sociedad espaola de enfermedades
infecciosas y microbiologa clnica. Protocolo 41: 2 edicin 2011.Diagnstico
microbiolgico de las infecciones intraabdominales, Disponible en:
ogia/seimc-procedimientomicrobiologia41.pdf
Almudena Burillo Antonio Moreno Carlos Salas Sociedad espaola de

enfermedades infecciosas y microbiologa clnica. Protocolo 22: 2 edicin 2007.
Diagnstico microbiolgico de las infecciones de piel y tejidos blandos.
Disponible en
ogia/seimc-procedimientomicrobiologia22.pdf
Weissfeld, A. Laboratory Diagnosis of Urinary Tract Infections. Cumulative

Techniques and Procedures in Clinical Microbiology. ASM Press. Washington
DC, USA.1998.
Comit de Microbiologa Clnica. Sociedad Chilena de Infectologa.

Recomendaciones para el diagnstico microbiolgico de la infeccin urinaria. Rev
Chil Infect (2001); 18:57-63.
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Vigencia: 09/2020
Garcia L. Clinical Microbiology Procedures Handbook. ASM Press. Washington

DC, 2007.
Montiel F., Lam M. (2001) Seleccin, recoleccin y transporte de muestras para

el estudio microbiolgico Manual de Microbiologa Clnica. Santiago:
Publicaciones Tcnicas Mediterrneo. BQ. Rodrigo Fasce Pineda TM. Graciela
Torres Iriarte. ISP (2013), Recomendaciones para la toma de muestras
respiratorias para la tcnica de Inmunofluorescencia para deteccin de virus
respiratorio. Disponible en
http://www.ispch.cl/sites/default/files/normativo%20rresp%20exant%20rev%20-
%2028022013A.pdf
6. Trminos y definiciones
Trminos Definiciones
compuesto qumico para evitar el proceso de coagulacin
ANTICOAGULANTE
de la sangre y otros lquidos orgnicos
ADA adenosin deaminasa
procedimiento que est dirigido a evitar la contaminacin
ASEPTICA
de un campo o de un objeto estril
BACTEREMIA presencia de bacterias en la sangre
medio de transporte para muestras bacteriolgicas,
CARY BLAIR
especfico para coprocultivos
COPROCULTIVO cultivo bacteriano de una muestra de deposicin
DISURIA dificultad o dolor en la evacuacin de la orina
Cultivo de una muestra de sangre obtenida en forma
HEMOCULTIVO
asptica del torrente sanguneo por una puncin
I.T.U. infeccin del tracto urinario
GDH glutamato deshidrogenasa
L.C.R. Lquido cefalorraqudeo
es todo organismos vivo, de tamao microscpico
MICROORGANISMOS
(bacterias y hongos)
PORTAGERM
especfico para cultivos anaerobios
REDOX reduccin, oxidacin
SEPTICEMIA foco infeccioso secundario en diversos rganos, como
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Trminos Definiciones
consecuencia de una bacteriemia
STUART
especfico para muestras de secreciones
cultivo bacteriano de orina obtenida en condiciones
UROCULTIVO
aspticas de segundo chorro
7. Descripcin del procedimiento
El estudio del cultivo microbiolgico de una muestra tiene como fin aislar el o los agentes
etiolgicos de una probable infeccin a fin de apoyar al clnico en el diagnstico y
orientar el uso racional de antibiticos en el tratamiento del paciente.
Debido a la gran variedad de agentes potencialmente infecciosos, y la alta probabilidad

de contaminacin por la flora comensal y ambiental, es necesario una adecuada
recoleccin, transporte y evaluacin, lo cual se refleja en un resultado de alta calidad. Si
el laboratorio no recibe una muestra apropiada, el resultado entregado no ser confiable,
la calidad del laboratorio ser cuestionable y lo ms importante el paciente se ver
directamente afectado y no recibir el tratamiento adecuado.
Es importante entonces el correcto procesamiento de la muestra, que es responsabilidad

de todos los profesionales de la salud, mdicos, tecnlogos mdicos, enfermeras,
paramdicos, auxiliares y recepcionistas.
7.1 SOLICITUD DE EXAMENES
Los exmenes se solicitan por intermedio de un documento diseado para tales fines
(ver Formato de registro); donde se deja constancia de la solicitud del mdico tratante u
otro profesional de la salud (enfermera, matrona, dentistas) del examen Microbiolgico
que est solicitando. Esta solicitud debe cumplir con los siguientes requisitos exigidos
por el laboratorio:
Nombres y apellidos del paciente.

Nmero de identificacin personal (N Rut)
Procedencia:
Atencin Cerrada: especificar Servicio y sala donde se encuentra.
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Atencin Abierta:
Consultorio de Especialidades: especificar Policlnico.
Consultorio de Atencin Primaria: especificar Policlnico
Nmero de ficha
Edad del paciente o fecha de nacimiento.
Hora de realizacin de la toma de muestra.
Tipo de muestra: especificar procedencia anatmica.
Contenedor de la muestra apropiado (medios de transporte).
Cantidad de muestra suficiente para realizar el estudio bacteriolgico.
Concordancia entre datos de la solicitud del examen y el contenedor de la
muestra.
Posible diagnstico.
Si al momento de la recoleccin de la muestra el paciente est con
tratamiento antibitico.
Nombre del mdico que solicita el examen.
7.2 PREPARACIN DEL PACIENTE
La preparacin del paciente se realiza segn tipo de muestra y examen solicitado. Previa
toma de muestra, informe al paciente acerca del procedimiento a realizar y solicitar su
consentimiento verbal. Al mismo tiempo verifique:
La identidad del paciente. En pacientes hospitalizados compruebe la identidad a travs
del brazalete de identificacin. En pacientes ambulatorios verifique nombre y RUT
solicitando el carn de identidad al paciente o verbalmente. Constate que el paciente
est preparado para tomarse el examen.
Compruebe si cumple con: rgimen, hora de toma de muestra y administracin de
medicamentos u otra indicacin especfica para cada toma de muestra en particular.
En el caso de que el paciente se encuentre tomando algn tratamiento antibitico u otro
medicamento, deje registro de aquello al reverso de la solicitud de examen.
7.3 RECOLECCIN DE MUESTRAS MICROBIOLGICAS
Lo ms importante es la correcta recoleccin de una muestra, a pesar de que algunos

tipos de muestras requieren de una metodologa ms especializada, se debe tener en
cuenta algunos aspectos generales:
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Se debe realizar en un ambiente confortable y limpio, en condiciones de mxima

asepsia, con material limpio y estril, evitando contaminaciones ambientales, del
personal, y del propio paciente.
Seleccionar el sitio anatmico exacto de la lesin para tomar la muestra, evitando

la contaminacin con flora saprofita.
Aplicar la tcnica y material apropiados para la obtencin de la muestra.
Recolectar una muestra apropiada que sea representativa al cuadro clnico del
paciente, en un recipiente adecuado dependiendo del tipo de muestra.
Identificar correctamente la muestra y anotar cualquier informacin que sea

necesaria para el diagnstico.
Poner la muestra recolectada en un envase que favorezca la viabilidad de los

microorganismos causantes del proceso infeccioso, y que adems impida la
filtracin o derrame de la muestra, como medida de proteccin para el personal
que posteriormente la manipula, respetando rigurosamente las Normas de
Bioseguridad.
Enviar la muestra en forma rpida y expedita al laboratorio, y en el caso que esto

no sea posible, asegurarse que sea almacenada a la temperatura y en los medios
adecuados.
Es de vital importancia que, antes de realizar cualquier tipo de procedimiento,

efectuar lavado de manos de acuerdo al procedimiento vigente.
Toda la informacin diagnstica que el laboratorio de microbiologa puede proporcionar,

depende de la calidad de la muestra recibida. Por ello, una toma mal realizada,
pobremente recogida o mal transportada determinar un posible fallo en la recuperacin
de los agentes patgenos, que puede inducir a errores diagnsticos, e incluso a un
tratamiento inadecuado del paciente.
7.4 ROTULACIN DE LAS MUESTRAS
La rotulacin de la muestra se realiza en el Servicio o Unidad clnica de procedencia y

por el profesional responsable de la toma de muestra.
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Se diferenciaran 2 formas de rotular las muestras
7.4.1 Rotulo digital (Con cdigo de barra):
Generado por el sistema informtico OMEGA (LIS)

Nombre y apellidos del paciente.
Nmero de identificacin personal (N Rut)
Servicio del que proviene.
Nmero de peticin (LIS)
Tipo de muestra.
7.4.2 Rotulacin de forma manual:
Rotule los contenedores con cinta adhesiva pegada a lo largo del contenedor, la cual
debe llenarse con la identificacin del paciente con letra clara y legible: Nombre, dos
apellidos y procedencia.
Los rtulos para los contenedores de hemocultivos deben colocarse sin ocultar el cdigo
de barras del frasco de hemocultivo.
El no cumplimiento de estas exigencias ser motivo de rechazo de las muestras.
7.5 CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS
Como recomendacin general todas las muestras deben ser enviadas al laboratorio
inmediatamente despus de su obtencin. Los detalles de la forma de conservar cada
tipo de muestra sern descritos en forma individual en el tema correspondiente.
Conserve a temperatura ambiente, por un tiempo no mayor a 2 horas en un lugar fresco

y alejado de la luz directa, las siguientes muestras:
Lquidos estriles.
Bolsa de dilisis peritoneal crnica.
Hemocultivos.
Estudio de dermatofitos.
Medio de transporte Cary Blair (Para coprocultivo).
Lavado bronquialveolar (BAL).
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Conserve en refrigeracin con unidades refrigerantes (4C), por un tiempo no mayor a 2

horas, las siguientes muestras:
Urocultivo.
Cultivo punta catter Tcnica de MAKI.
Estudio de Rotavirus /Adenovirus.
Estudio de Clostridium difficile.
Expectoracin.
Transporte inmediatamente al laboratorio (tiempo mximo 30 minutos):

Bilicultivo.
Secrecin vaginal.
Secrecin uretral.
Secrecin de crvix.
Biopsias.
Estudio de Anaerobios
7.6 TRASLADO DE LAS MUESTRAS
Las muestras una vez obtenidas deben ser enviadas lo ms rpidamente posible al
laboratorio, antes de 2 horas.
El recipiente debe estar bien cerrado para evitar el derrame de la muestra y la posible
contaminacin. Es obligatorio que las muestras sean transportadas en los recipientes
adecuados para cada una de ellas con informacin explicita de contencin biolgica. En
caso de envos mltiples, el derrame de una de las muestras implicar el rechazo de
todas ellas.
Las muestras deben ser colocadas una vez obtenidas en el medio de transporte que el
laboratorio entrega para ese efecto:
Cary Blair.
Stuart.
Portagerm (anaerobios).
Tubos estriles (tapa blanca sin aditivos)
El personal que transporta las muestras debe utilizar guantes y pechera.

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7.7 RECEPCION
Encargado de recepcin tiene la responsabilidad de:

Entregar las indicaciones respectivas a quin consulte respecto a los
requerimientos de un examen Microbiolgico.
Recepcionar la solicitud de examen y verificar el cumplimiento de los datos
requeridos, en su defecto completar en lo posible contactando al personal del
servicio si fuera necesario.
Verificar que la muestra a recepcionar est tomada y transportada en forma
correcta (cumpliendo las Normas de Bioseguridad).
Aplicar criterios de rechazo.
Derivar la muestra a la seccin de Microbiologa del laboratorio.
7.8 CRITERIOS DE RECHAZO DE SOLICITUDES Y/O MUESTRAS
Los criterios de rechazo de muestras para estudio microbiolgico son fundamentales

para prevenir el informe de resultados con escaso o nulo valor para el diagnstico o
tratamiento del paciente, as como aquellas por sus condiciones puedan atentar contra
la seguridad biolgica del personal de laboratorio. El rechazo de una muestra por parte
del laboratorio no debe ser interpretado como una negativa ni una dejacin de funciones
por parte del laboratorio, tampoco tiene la finalidad recriminatoria para el solicitante; sino
como una simple peticin de nueva muestra que aportar informacin de mayor
relevancia.
Rechazo definitivo Rechazo temporal

- Muestra coagulada (MR1) - Contenedor sin solicitud de examen
(MR9)
- Muestra hemolizada (MR2) - Solicitud de examen sin contenedor
(MR10)
- Muestra mal rotulada: Inconsistencias - Solicitud de examen sin procedencia
entre los datos de la solicitud de (MR11)
examen y etiqueta del contenedor - Rut de paciente NO concuerda con los
(MR3) datos de la solicitud del examen (MR 14)
Muestra escasa (MR4)
- Muestra Derramada (MR5)
- Muestra con cantidad excesiva (MR6)
- Contenedor que no corresponde (MR7)
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- Contenedor sin rtulo (MR8)

- Incumplimiento de requisitos
especficos (no procede cultivo
anaerobio en: exudado farngeo,
expectoracin, orina, secreciones
vaginales, lceras o fstulas entre otras,
cantidad insuficiente de muestra, no
procede cultivo a: cultivos de loquios,
escaras, entre otros) (MR13)
- Presencia de burbujas de aire en
jeringa de gases en sangre (MR15)
- Interrupcin de la cadena del fro en
- Ausencia de tapn hermtico en
- Recepcin de 2 muestras del paciente,
con caractersticas diferentes (MR18)
- Contenedor sin muestra (vaco) (MR12)
En el caso de un rechazo, el funcionario del Laboratorio avisa al servicio

correspondiente sealando los motivos de este.
Si al realizar un rechazo temporal este no es resuelto dentro de las 2 hrs de

haber llamado al servicio correspondiente, se considera como rechazo
definitivo.
Se registra en la solicitud del examen la causa del rechazo, hora de aviso y

nombre del funcionario receptor de la informacin, para posteriormente
realizar el registro en el L.I.S del Laboratorio Clnico en los casilleros
dispuestos para este fin.
Realizar nueva toma de Muestra, si las condiciones del paciente lo permiten,

de no ser as y el mdico tratante insiste en que se analice el examen
solicitado, se dejar constancia de este hecho mencionndolo como NOTA en
el Informe de Resultado de Exmenes.
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7.9 MUESTRAS DE SANGRE
7.9.1 HEMOCULTIVOS
A) GENERALIDADES
La sangre es un fluido estril. En el caso de infecciones graves o en complicaciones de

una infeccin primaria puede haber una invasin de bacterias al torrente sanguneo.
Esta invasin puede ser eliminada en un periodo de tiempo corto, minutos u horas, o
bien persistir cuando existe una infeccin masiva o est presente un foco intravascular
infectado, la presencia de estas bacterias en la sangre se denomina bacteriemia (Fig.1).
Como consecuencia de la bacteriemia se pueden producir focos infecciosos secundarios

en diversos rganos Ej.: hgado, rin, lo cual se denomina septicemia.
El objetivo principal es obtener una muestra de sangre con tcnica asptica para
pesquisar septicemia o bacteriemia.
Fig. 1
La sensibilidad del hemocultivo depende de diversos factores, como: volumen de sangre,

nmero de muestras, dilucin de la muestra.
B) INDICACIONES
Este examen es de indicacin mdica y se recomienda tomar hemocultivos en las

siguientes circunstancias:
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Sospecha de bacteriemia en pacientes con o sin foco aparente de infeccin.

3
Leucocitosis mayor a 10.000 x mm especialmente si se acompaa de desviacin
a la izquierda o granulocitopenia (menor a 1000 leucocitos polimorfonucleares x
3
mm ), o una combinacin de ellos.
Leucopenia, leucocitosis o trombopenia no hematolgica.
Shock de origen indeterminado.
Como apoyo diagnstico en infecciones localizadas: Osteoarticulares, meningitis,
neumona, celulitis periorbitaria, pielonefritis, absceso de rganos profundos.
Los factores clsicos asociados a la presencia de bacteriemia son:

Presencia de calofros y fiebre mayor a 38.3C
Cuadros de abdomen agudo
Antecedente de drogadiccin intravenosa
Sospecha de endocarditis
Sospecha de infecciones relacionadas con catter
C) MATERIALES A USAR PARA LA TOMA DE MUESTRA.
Mascarillas.
Guantes estriles.
Jeringas.
Trulas para aseo de piel.
Trulas estriles para antisepsia.
Ligadura.
Alcohol puro (70%)
Clorhexidina
Frascos de Hemocultivos.
Receptculo para material sucio.
Receptculo para material cortopunzante.
D) PROCEDIMIENTO DE LA TOMA DE MUESTRA.
La toma de muestra debe efectuarse antes de la terapia antimicrobiana, en pacientes en

los que ya se haya iniciado el tratamiento antimicrobiano y en los que no se considere
conveniente retirarlo, deber realizarse la extraccin justo antes de la administracin de
la prxima dosis.
El procedimiento de extraccin de sangre debe cumplir con la Norma establecida para

este procedimiento.
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Vigencia: 09/2020
Personal responsable de la toma de muestra.

Enfermera (o): ejecutor(a) de la tcnica.
Tcnico Paramdico: colaborador o ayudante.
Preparacin de la piel.
Es esencial para evitar la contaminacin de los Hemocultivos respetar
acuciosamente estos procedimientos.
Colocarse mascarilla.
Lavarse las manos.
Seleccionar la vena perifrica de ms fcil acceso, debe utilizarse una vena
distinta para cada extraccin.
Realizar la antisepsia de la piel aplicando trulas estriles de algodn,
impregnadas en alcohol al 70% en forma concntrica (desde el sitio de puncin a
la periferia.), y no volver a palpar la vena (Fig. 2).
Pincelar con Clorhexidina y dejar secar.
Esperar que se seque el antisptico (30segundos a 1 minuto) para que ejerza su
accin residual, antes de puncionar.
Fig. 2
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Vigencia: 09/2020
Puncin.
Colocar ligadura.
Colocarse guantes estriles. Fig. 3
Proceder a la extraccin de sangre (Fig.3),
extraer la sangre sin tocar la zona
desinfectada :
Paciente Adulto: 8-10 ml. de sangre (segn frasco).
Paciente Peditrico: 1-3 ml (segn frasco).
Nota: Si el primer intento en la obtencin de sangre es fallido cambiar la aguja e

intentarlo nuevamente.
Soltar la ligadura.
Sellar el sitio de puncin con trula seca y tela adhesiva.
No tomar muestra del brazo en que se est administrando solucin Venosa.
Inoculacin de los frascos.
Descontaminar el tapn de goma antes de

puncionar el frasco y esperar que se seque.
Se recomienda el cambio de aguja para

disminuir el porcentaje de contaminacin.
Fig. 4
Inocular la sangre en el frasco
correspondiente (Fig. 4), si fuese un frasco comercial; esperar que el frasco
realice por s solo el vaco.
Agitar suavemente cada frasco.
Etiquetar de forma correcta.
Enviar al laboratorio todos los frascos juntos lo antes posible.
E) MOMENTO DE LA TOMA DE MUESTRA
En bacteriemias intermitentes debe realizarse cuando el paciente tiene calofros o

durante el pick febril.
En bacteriemias continuas de origen intravascular, en cualquier momento.
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En sepsis agudas y en pacientes en situacin crtica se considera como un

procedimiento de urgencia.
F) VOLUMEN DE LA MUESTRA
La cantidad de sangre a introducir en cada botella es de 8-10 ml en el caso de pacientes

adultos, volmenes inferiores implican la perdida de un nmero significativo de bacterias.
En caso de neonatos y nios pequeos en que no se pueden obtener volmenes

grandes de sangre, es suficiente una cantidad de 1-2 ml por frasco.
Se recomienda mantener una proporcin sangre/caldo de cultivo de 1:10, esta dilucin

permite neutralizar las propiedades bactericidas de la sangre y de los agentes
antimicrobianos que puedan estar presentes en la muestra.
G) NMERO DE MUESTRAS.
La recomendacin general es de 2 frascos por cada puncin, es decir un set de 4

frascos en un perodo de 24 hrs. Se ha demostrado que en un episodio bacterimico la
positividad de uno, dos, y tres sets de Hemocultivos corresponde a un 61.4%, 78.2%y
93.1%% respectivamente.
La obtencin de 2 a 3 sets de Hemocultivos en un perodo de 24 hrs. son recomendados

para optimizar la deteccin de bacteriemia y fungemia.
En la prctica para el Adulto se establecen 2 (4 frascos) a 3 muestras de sangre (6

frascos) y para pacientes peditricos 2 frascos; dichas muestras deben ser obtenidas de
diferentes punciones venosas, con un intervalo de 1 hora entre las tomas, salvo casos
de urgencia donde los intervalos deben ser reducidos a minutos (hasta 30 min. si la
situacin de urgencia lo amerita).
En sospecha de Endocarditis Infecciosa se recomienda obtener el primer set de 3

Hemocultivos (6 frascos) y si estos son negativos en las primeras 24 hrs. obtener un
segundo set de tres Hemocultivos ms.
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Vigencia: 09/2020
H) TRANSPORTE DE LA MUESTRA
El transporte debe ser inmediato o en el menor tiempo posible. Los frascos de

hemocultivos inoculados se transportan de inmediato al laboratorio, en caja metlica o
plstica.
I) CONSERVACIN DE LA MUESTRA
Mantener a temperatura ambiente, para su incubacin en estufa a 35C, nunca deben

refrigerarse ni congelarse.
J) OBSERVACIONES
No son adecuadas las muestras extradas a travs de catteres para estudio

bacteriemias, exceptuando si se sospecha de bacteriemia asociada a catter. (Ver ms
abajo)
En caso que el paciente est recibiendo antibiticos realizar la toma de la muestra previa
a la administracin de la prxima dosis de antimicrobiano.
En sala de inmunodeprimidos es aconsejable el uso de gorro y mascarilla.
Los frascos de Hemocultivo deben de ser etiquetados de forma correcta, indicando la
primera, segunda, tercera muestra y la hora en que fue tomada.
Se deber incluir en la peticin la mxima informacin clnica.
NO COLOCAR LA ETIQUETA SOBRE EL CODIGO DE BARRAS DEL FRASCO.
7.9.2 CULTIVOS SEMI CUANTITATIVOS (TECNICA DE MAKI)
A) GENERALIDADES
El catter endovenoso permite un acceso vascular fcil y continuo para tomar muestras
de sangre, administrar productos sanguneos, medicamentos, nutricin parenteral
completa y otros fluidos. Debido a que el catter se inserta a travs de la piel, el paciente
tiene el riesgo de desarrollar una infeccin ya sea por bacterias de su propia flora o por
microorganismos transportados en las manos del personal mdico.
La contaminacin de los dispositivos intravasculares es una causa frecuente y grave de
infeccin hospitalaria. El cultivo de dicho catter puede ayudar al clnico a determinar si
el cuadro que presenta el paciente es debido al catter y actuar en consecuencia.
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B) INDICACIONES
Este procedimiento se aplicar en aquellos catteres intravasculares en los que se

solicite cultivo semicuantitativo de punta de catter (Tcnica de Maki).
C) MATERIALES A USAR PARA LA TOMA DE MUESTRA
Guantes de goma estriles.

Gasas estriles.
Pinzas y tijeras estriles.
Recipiente estril con tapa de rosca.
Alcohol etlico a isoproplico al 70%.
Clorhexidina.
D) PROCEDIMIENTO DE LA TOMA DE MUESTRA
Personal responsable de la toma de muestra.

Enfermera (o): ejecutor(a) de la tcnica.
Tcnico Paramdico: colaborador o ayudante.
Desinfectar con alcohol una zona de piel de unos 10 cm correspondiente a la zona de

entrada del catter. Hacerlo en forma de crculos comenzando par el centro.
Repetir la misma operacin, pero con Clorhexidina dejando que se seque durante un
minuto.
Retirar el catter con la mxima asepsia. Ayudndonos de las pinzas y las tijeras
estriles, cortar los 3-5 cm de catter a partir de la punta del mismo (esto es crtico, ya
que mayor tamao ocasiona manipulacin excesiva y contaminacin)
Introducir el segmento del catter en un en placa de Petri estril humedecida con suero
fisiolgico estril o en un tubo de tapa blanca estril. Enviar al laboratorio
inmediatamente.
E) VOLUMEN DE LA MUESTRA
No aplica.
F) NMERO DE MUESTRAS
3-5 cm. de la porcin ms distal, del catter endovenoso.

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G) TRANSPORTE DE LA MUESTRA
La muestra deber enviarse al laboratorio en un periodo inferior a 30 minutos.
H) CONSERVACION DE LA MUESTRA
Cuando esto no sea posible deber conservarse a una temperatura de 4C, mediante
unidades refrigerantes.
I) OBSERVACIONES
El criterio de positividad (15 ufc) fue elegido porque la mayora de los pacientes con
recuentos inferiores no presentaban datos sugestivos de infeccin, mientras que todos
los casos que cursaban con bacteriemia tuvieron recuentos superiores a 15 ufc y con
frecuencia las colonias fueron incontables. La especificidad de sta tcnica fue del 76%.
Este procedimiento no detecta las infecciones asociadas a catteres por
microorganismos de crecimiento lento. Asimismo, no detecta las infecciones asociadas a
catteres causadas por microorganismos que no crecen en las condiciones establecidas
(Malassezia furfur, Haemophilus spp.). El tratamiento antimicrobiano previo a la
obtencin de la muestra puede alterar los resultados de los cultivos.
Fig. 5.
Tcnica de
MAKI.
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7.9.3 HEMOCULTIVOS DE TIEMPO DIFERENCIAL DE POSITIVIDAD (DPT)
A) GENERALIDADES
En la actualidad el mtodo recomendado y utilizado como confirmacin para el

diagnstico de infeccin relacionado a catteres venosos centrales, sin retiro del mismo,
son los hemocultivos de tiempo diferencial de positividad. Si hay sospecha de infeccin
se debe tomar una muestra del catter y de la vena perifrica del brazo opuesto del
paciente, para diferenciar si la infeccin es propia del catter o del paciente.
B) INDICACIONES
Esta tcnica compara el tiempo diferencial de positividad de hemocultivos cualitativos de

sangre obtenida a travs del catter y por venopuncin, utilizando sistemas de
hemocultivos automatizados.
Mascarillas.
Guantes estriles.
Jeringas.
Trulas para aseo de piel.
Trulas estriles para antisepsia.
Ligadura.
Alcohol puro (70%)
Clorhexidina
Frascos de Hemocultivos.
Receptculo para material sucio.
Receptculo para material cortopunzante.
Refirase a la toma de hemocultivo general (Punto 7.9.1)

La muestra se debe tomar en frascos de hemocultivos adultos o peditricos segn
corresponda. Se requieren dos frascos de hemocultivos con sangre perifrica (una
puncin) y un frasco de hemocultivo para cada lumen del catter .El volumen para
inocular cada frasco es 10 ml de sangre exacto para adultos y 1 ml de sangre exacto
para nios.
En esta tcnica es crtico recolectar el mismo volumen en cada uno de los frascos.
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10 ml de sangre exacto (en cada frasco) para adultos y 1 ml de sangre exacto para nios
(en cada frasco).
2 frascos de hemocultivos (Aerobio adulto o peditrico, segn corresponda)

para la puncin perifrica.
1 frasco para cada lumen de catter.
El transporte debe ser inmediato o en el menor tiempo posible. Los frascos de

hemocultivos inoculados se transportan de inmediato al laboratorio, en caja metlica o
plstica.
H) CONSERVACIN DE LA MUESTRA
Mantener a temperatura ambiente, para su incubacin en estufa a 35C, nunca deben

refrigerarse ni congelarse.
I) OBSERVACIONES
Se ha sealado como indicativo de bacteriemia relacionada a CVC un tiempo diferencial

(valor de corte) de 120 minutos a favor del hemocultivo central con respecto del
perifrico. El fundamento de este mtodo es que a mayor carga bacteriana, menor es el
tiempo necesario para que un hemocultivo sea positivo en un sistema automatizado con
monitorizacin continua.
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7.10 MUESTRAS DEL TRACTO URINARIO
7.10.1 UROCULTIVO
A) GENERALIDADES
Las infecciones del tracto urinario son unas de las ms

comunes dentro de las infecciones humanas. Son ms
prevalentes y recurrentes en la mujer, y su incidencia
aumenta con la edad. A la presencia de microorganismos
en la orina se le denomina bacteriuria (Fig. 5 y 6).
Fig. 5
El cultivo de orina establece el diagnstico etiolgico de

una infeccin urinaria tanto sintomtica como asintomtica
(bacteriuria asintomtica) en pacientes con riesgo de
infeccin. Permite a su vez la realizacin de estudios de
sensibilidad.
Fig. 6
Existen varios factores que determinan la epidemiologa de la infeccin urinaria, entre

ellos destacan la edad, determinadas enfermedades, cateterismos u otros tipos de
instrumentacin del tracto genitourinario. Estos han de tenerse siempre en cuenta a la
hora de interpretar los urocultivos.
B) INDICACIONES
El urocultivo se debe realizar en los siguientes casos:
Disuria, hematuria, orina turbia, tensin vesical.

Sndrome febril en estudio.
Diabetes mellitus descompensada.
Sospecha de pielonefritis
Sospecha de ITU en neonatos, lactantes y nios
Sospecha de ITU en varones.
ITU recurrente en mujeres.
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Sospecha de ITU complicada en mujeres: anomalas estructurales y

funcionales del tracto urinario, cuerpo extrao en el tracto urinario,
manipulacin urolgica reciente, estados de inmunodepresin y tratamientos
antibiticos prolongados.
Sospecha de ITU en portadores de sonda permanente.
Sospecha de sepsis de origen urinario.
Bacteriemia de origen desconocido.
Obstruccin del tracto urinario.
Como control de tratamiento en todos los casos anteriores.
Como screening en 1er trimestre del embarazo (16 semanas).
Antes de instrumentalizacin o ciruga de vas urinarias.
Gasas estriles.
Jabn neutro.
Tubos o frascos estriles con su tapa correspondiente.
Bolsas de plstico o colectores estriles para nios.
Guantes quirrgicos.
La muestra idnea es la primera miccin de la maana en pacientes adultos y no

sondados, ya que permite la multiplicacin de bacterias durante la noche. El
procedimiento va a depender si el paciente es hombre o mujer (Fig.7) y tener un cuidado
especial en muestras de nios.
Fig. 7
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7.10.2 TOMA DE MUESTRA PARA PACIENTES MUJERES

Orina de segundo chorro (de miccin limpia)
Debe ser tomada por personal adiestrado. Tomar la primera miccin de la maana. Si no
es posible, dejar permanecer la orina en la vejiga, por el mayor tiempo posible, con el fin
de aumentar el nmero de microorganismos por volumen, sin ingesta de lquido.
Teniendo en cuenta la anatoma femenina se procede a colocar a la paciente en camilla

ginecolgica.
El encargado de la toma de muestra deber lavarse las manos cuidadosamente con
agua y jabn, enjuagar y secarse con toalla o papel desechable.
Es necesario lavar la zona por donde pasa la orina, con algodn estril con jabn,
limpiando suavemente la vulva desde adelante hacia atrs, no devolverse con la misma
trula, entre los pliegues de la piel, repetir el proceso 3 a 4 veces (Figura 8a).
Despus enjuagar con agua tibia estril usando el resto de los algodones slo una vez
cada uno.
Usando guantes desechables, se separarn los labios mayores y menores, y los
mantendr separados en todo momento hasta que se haya recogido la orina.
Colocar tapn vaginal para evitar contaminacin con flora genital.
Se indica a la paciente que orine una pequea cantidad en una palangana o rin y
despus recolectar la orina restante directamente en el tubo o frasco estril, cerrar
evitando el contacto con dedos , genitales externos o ropa y eliminar el ltimo chorro.
(Figura 8b)
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Fig. 8 a,b.
7.10.3 TOMA DE MUESTRA PARA PACIENTES HOMBRES

Orina de segundo chorro (de miccin limpia)
Tambin debe ser tomada por personal adiestrado. Tomar la primera miccin de la
maana. Si no es posible, dejar permanecer la orina en la vejiga, por el mayor tiempo
posible, con el fin de aumentar el nmero de microorganismos por volumen, sin ingesta
de lquido.
Lavado de las manos con agua y jabn.
Lavar el glande con algodn estril y jabn.
Enjuagar con algodn con agua tibia estril para eliminar los restos del jabn.
Teniendo en cuenta la anatoma masculina (Fig. 9) se procede a retraer el prepucio, que
se mantendr as en todo momento, hasta que se haya recogido la orina.
Se le pide al paciente que orine el primer chorro de orina se elimina en una palangana y
se toma la orina restante directamente en el tubo o frasco estril desechando el ltimo
chorro (Fig. 10)
Fig. 9
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Fig. 10
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7.10.4 TOMA DE MUESTRA PARA PACIENTES NIOS.
En nios y nias mayores la orina se recoge de forma similar a los adultos.

Debe realizarse un lavado cuidadoso de los genitales y del rea donde colocar la bolsa
de plstico o el colector.
En nios y nias ms pequeos, la orina se recoger en recolectores o bolsas estriles

especialmente diseadas para ellos.
El recolector puede permanecer puesto como mximo 45 minutos a 1 hora y ser

cambiado con un mximo de tres veces (con aseo genital entre los cambios)
evaluando la irritacin de la zona durante la recoleccin.
Es suficiente un volumen de orina de 10 ml.
Basta con una sola muestra de orina bien tomada en un frasco o tubo estril bien
tapado.
La orina debe llegar al laboratorio en el plazo de una hora.

El transporte siempre se debe realizar en un contenedor con unidades
refrigerantes, en gradilla y con el cuidado de evitar el derramamiento de la muestra.
Si no es posible enviar la muestra dentro de 1 hora de tomada, mantener refrigerado a 4

C durante un tiempo mximo de 2 horas.
I) OBSERVACIONES (Ver cuadro 1)
Es recomendable suspender cualquier tratamiento antimicrobiano de 3 a 5 das antes de

la toma de la muestra.
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En pacientes ingresados con imposibilidad de recoger la muestra por s mismos, se

realizar sondaje vesical por personal sanitario experto con las medidas aspticas
oportunas.
Para la investigacin de anaerobios es necesario que la orina se obtenga por puncin

suprapbica.
Para la bsqueda de micobacterias, la orina se recoge durante tres das consecutivos.

En este caso el volumen de orina debe ser 100-150 ml. y se elegir preferentemente la
primera miccin de la maana.
Cuando se sospecha la presencia de hongos y virus, el volumen de orina ser superior

a 20 ml.
En el caso de parsitos se recoger la orina de 24 horas.
Cuadro 1: Recomendaciones sobre el volumen y forma de conservacin de la orina segn el tipo de

microorganismo.
7.10.5 CATETER DE PERMANENCIA PROLONGADA
A) GENERALIDADES
Permite el paso para la toma de muestra estril directa desde la vejiga y necesita de un
personal entrenado.
B) INDICACIONES
Se indica principalmente en pacientes que estn inconscientes y en pacientes

hospitalizados que no pueden miccionar normalmente.
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C) MATERIAL A USAR PARA LA TOMA DE MUESTRA
Gasas
Alcohol 70
Jeringa y aguja estriles.
Tubos estriles de 18 x 18.
D) PROCEDIMIENTO PARA LA TOMA DE MUESTRA
Limpiar el catter con un algodn con alcohol 70% y dejar secar unos minutos.
Puncionar directamente la zona desinfectada del catter con aguja y jeringa (en forma
asptica), no desde la bolsa de drenaje, porque ste sitio puede estar contaminado con
flora externa.
Extraer la orina aspirando unos 10 ml y colocarla en frasco o tubo estril.
No recoja orina de la bolsa del catter.

No desconecte el catter de su bolsa durante la coleccin de la muestra.
Al igual que en una toma de muestra de orina corriente, es suficiente un volumen de

orina de 10 ml.
Basta con una sola muestra de orina bien tomada en un frasco o tubo estril.


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I) OBSERVACIONES
Como regla general se considera que la muestra de catter no es una muestra adecuada
para estudio microbiolgico y que est justificado rechazar su procesamiento. Paciente
con catter por 48h72h pueden ser colonizados con ms de un microorganismo.
Al igual que en la toma de muestra de orina corriente, hay que tomar en consideracin la
diferencia anatmica que hay entre hombres y mujeres al colocar el catter, pero el
funcionamiento de este es el mismo en ambos casos (Fig. 11).
Fig. 11
7.10.6 PUNCION SUPRAPUBICA.
A) GENERALIDADES
Mtodo preferido para la coleccin de orina en nios y pacientes en los cuales la

interpretacin de resultados de muestra de 2 miccin es difcil. Adems ste mtodo
evita la contaminacin asociada con la recoleccin de 2 chorro.
B) INDICACIONES
Evidencia clnica de infeccin urinaria con recuentos bajos o nulos.

Neonatos y lactantes.
Urocultivos repetidos con dos o ms bacterias.
Cateterizacin contraindicada o difcil.
Bsqueda de anaerobios.
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La muestra se deja en tubo o frasco estril y se debe indicar en la hoja de pedido la

tcnica empleada para su extraccin (dato importante a la hora de valorar el recuento de
colonias).
C) MATERIALES A USAR EN LA TOMA DE MUESTRA
Gasas
Alcohol 70
Clorhexidina
Jeringa y aguja estriles larga(calibre 19)
Tubos estriles de 18 x 18.
El procedimiento de la toma de muestra solo debe ser realizado por personal profesional
entrenado. Se punciona la vejiga a 1,5 cm. de la snfisis pubiana, en la lnea media,
estando el paciente en decbito supino, con una jeringa de 10 ml. y con aguja larga
(calibre 19) se aspira el contenido vesical (ver figura 12).
En caso de bsqueda de anaerobios se enviar la muestra al laboratorio lo antes posible

en la misma jeringa de la extraccin, tras expulsar el aire de su interior y con la aguja
pinchada en un tapn de goma estril.
E) VOLUMEN DE LA MUESTRA.
Es suficiente un volumen de orina de 5-10 ml.
F) NUMERO DE MUESTRAS
Basta con una sola muestra de orina bien tomada en un frasco o tubo estril.
En caso de bsqueda de anaerobios se enviar la muestra al laboratorio lo antes posible

en la misma jeringa de la extraccin, tras expulsar el aire de su interior y con la aguja
pinchada en un tapn de goma estril.
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Para estudio de anaerobios solo se aceptaran muestras enviadas inmediatamente.
I) OBSERVACIONES
Es muy importante indicar en la solicitud que se trata de una puncin suprapbica (dato
importante a la hora de valorar el recuento de colonias).
Fig. 12
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7.11 MUESTRAS DEL TRACTO GASTROINTESTINAL
7.11.1 COPROCULTIVO
A) GENERALIDADES
La diarrea aguda es el proceso que se acompaa de la eliminacin frecuente de heces,

disminucin de su consistencia o ambas cosas, y puede ser causada por diferentes
agentes: bacterias, virus y protozoos.
La enfermedad diarreica puede variar de leve a severa dependiendo del volumen y

frecuencia de las evacuaciones, el nmero de microorganismos involucrados en cuadros
entricos ha aumentado en los ltimos aos.
Los antecedentes epidemiolgicos (edad, historia reciente de viajes, aparicin

espordica o como parte de un brote, tipo de alimento sospechoso, perodo de
incubacin), la existencia de factores predisponentes (SIDA, inmunosupresin), la
presencia de signos y sntomas clnicos (fiebre, dolor abdominal, manifestacin de
nauseas y vmitos) y el tipo de diarrea (acuosa, mucosa o sanguinolenta) pueden
orientar acerca del microorganismo implicado. No obstante, el diagnstico etiolgico
definitivo se debe obtener mediante pruebas de laboratorio.
B) INDICACIONES
Ante la sospecha de un cuadro de infeccin gastrointestinal se debe hacer una detallada

historia clnica y un correcto estudio microbiolgico.
El coprocultivo se indica en caso de sospecha de diarrea bacteriana, intoxicacin

alimentaria e investigacin de portadores asintomticos.
Tubo estril con medio de transporte (Cary Blair)
Se debe tomar antes de iniciar tratamiento antibitico. La muestra de deposicin debe

obtenerse de la siguiente forma:
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Recoleccin de deposicin emitida

El paciente debe emitir la deposicin en un recipiente muy limpio, sin orinar. Se introduce
la trula estril en la zona ms alterada de las deposiciones (sangre, pus, mucosidad).
La muestra se debe colocar de inmediato en medio de transporte Cary Blair.
No se recomienda obtener muestra con trula rectal, porque su rendimiento es

deficiente.
En caso de heces lquidas puede utilizarse jeringa para aspirado del material fecal del
recipiente en donde ha sido emitido.
E) VOLUMEN DE MUESTRA
Se considera suficiente tomar una muestra del tamao de una lenteja.
Una muestra es suficiente para realizar el estudio, pero se sugiere tomar entre dos a tres
muestras de deposicin en tiempos diferentes, lo que permite aumentar la sensibilidad
del coprocultivo.
Transportar la muestra al laboratorio de inmediato en envase resistente y lavable, a

temperatura ambiente.
Se puede conservar la muestra en medio de transporte a temperatura ambiente.
I) OBSERVACIONES
Las muestras para coprocultivo, debern tomarse antes de la administracin de

antimicrobianos o agentes antidiarricos.
En diarreas inducidas por drogas en las que el paciente presenta colitis leve o grave, con
formacin de pseudomembranas, se debe investigar Clostridium difficile.
En la mayor parte de los casos el cuadro clnico no es til para identificar el agente
etiolgico, pero se pueden tomar como referencia los tipos de diarrea que presente el
paciente.
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IMPORTANTE: INDICAR EN LA ORDEN DEL EXAMEN SI LA DIARREA ES CON

SANGRE.
7.11.2 LEUCOCITOS FECALES, ROTAVIRUS/ADENOVIRUS, CLOSTRIDIUM

DIFFICILE
A) GENERALIDADES
La presencia de leucocitos fecales es un ndice de alteracin de la integridad de la

mucosa intestinal, y por lo tanto, se asocia a infecciones por enteropatgenos capaces
de invadir la pared o a enfermedades primarias de la mucosa (como la colitis ulcerosa).
La presencia muy intensa (+++) de leucocitos fecales positivos puede deberse a agentes
como: Shigella sp., Campylobacter sp., Escherichia coli.
Los leucocitos fecales negativos pueden indicar etiologas causadas por enterotoxinas,
como en el caso del Vibrio colera, Rotavirus, parsitos como las amebas, otras cepas
bacterianas de la Escherichia coli y toxinas bacterianas de Staphylococcus aureus.
Rotavirus produce una infeccin intestinal (o gastroenteritis) que es la causa ms comn

de diarrea severa en nios, especialmente entre los 6 meses y 5 aos de vida. En los
casos ms graves, la deshidratacin generada puede llegar a ser mortal.
Los adultos tambin pueden infectarse, aunque la enfermedad tiende a ser leve.
Los Adenovirus corresponden a un grupo de virus que causan diferentes tipos de

enfermedades. La mayora produce infecciones respiratorias, y otros, menos
frecuentemente, infecciones gastrointestinales. Pueden afectar a personas de cualquier
edad aunque es ms frecuente en los nios. Se presentan durante todo el ao con un
discreto ascenso a fines del invierno, primavera y principios del verano.
La infeccin por Clostridium difficile es la principal causa de diarrea infecciosa en

pacientes hospitalizados. Su incidencia ha cambiado durante las ltimas dcadas. Los
pacientes pueden ser portadores asintomticos o presentar desde una diarrea leve a una
colitis pseudomembranosa, megacolon txico, sepsis y muerte.
B) INDICACIONES
Se les realizara estos estudios a los pacientes con diarrea y/o dolor abdominal.
El estudio de Rotavirus/Adenovirus est especialmente dirigido en nios.
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Se sospechar de diarrea asociada a C. difficile en pacientes hospitalizados, que han

recibido terapia antibitica en los ltimos 30 das, pacientes que pertenecen a grupos de
alto riesgo (mayores de 65 aos, inmunocomprometidos, enfermedad subyacente grave)
con independencia si estn hospitalizados o no.
Toda diarrea que dure ms de 3 das sin que exista otro patgeno conocido.
Recipiente de boca ancha para recoger las heces (tipo orinal o similar). No es
necesario que est estril, slo es preciso que est limpio. No contendr restos
de jabones, detergentes, desinfectantes o iones metlicos.
Recipiente limpio y seco para estudio de leucocitos fecales, Rotavirus-
Adenovirus.
Recipiente estril de boca ancha y cierre hermtico para estudio de Clostridium
difficile (Fig. 13).
Esptulas, cucharillas o depresores para tomar la muestra.
Para estudio de leucocitos fecales, rotavirus-Adenovirus, se debe enviar deposicin

fresca, recin emitida, en un frasco limpio y seco, sin utilizar hisopos ni medios de
transporte.
Para estudio de Clostridium difficile enviar deposicin fresca de consistencia acuosa o

no formadas (10 grs. o 10 ml), recin emitida en un frasco estril, sin medio de
transporte.
El volumen mnimo es de 2 g de heces pastosas (el tamao aproximado de una nuez) y

de 5-10 ml de heces lquidas.
Se enva para estudio 1 envase conteniendo la cantidad de muestra adecuada.
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Transportar la muestra al laboratorio de inmediato en envase resistente y lavable.
Si el envo al laboratorio no es de inmediato, conservar a 4C, NO CONGELAR.
I) OBSERVACIONES
Las toxinas de C. difficile se degradan a temperatura ambiente y puede llegar a no

detectarse a las 2 horas de emitida la deposicin.
Fig. 13
7.11.3 BILICULTIVO
A) GENERALIDADES
Las infecciones del tracto biliar se producen en la mayora de los casos por la
obstruccin de la va biliar por colelitiasis o estenosis benignas. Segn su localizacin
anatmica se pueden distinguir dos entidades clnicas: las colecistitis, procesos
relacionados con la inflamacin de la vescula biliar y las colangitis que son aquellos
procesos que afectan a las vas biliares.
B) INDICACIONES
Colangitis
Estudio de portacin de Salmonella Typhi.
El material a usar debe ser estrictamente estril y solo debe ser usado por personal
profesional entrenado.
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La obtencin de las muestras se realiza por procedimientos quirrgicos y endoscpicos.

En una colecistitis con colecistectoma las muestras se obtienen durante la ciruga
abierta o por va laparoscpica. En los pacientes que por su enfermedad de base tienen
un elevado riesgo quirrgico se puede realizar una colecistostoma percutnea. En las
colangitis agudas las muestras se pueden obtener durante el drenaje de la va biliar bien
por va endoscpica o quirrgica.
La obtencin de las muestras se realiza por procedimientos quirrgicos y endoscpicos.

En una colecistitis con colecistectoma las muestras se obtienen durante la ciruga
abierta o por va laparoscpica. En los pacientes que por su enfermedad de base tienen
un elevado riesgo quirrgico se puede realizar una colecistostoma percutnea. En las
colangitis agudas las muestras se pueden obtener durante el drenaje de la va biliar bien
por va endoscpica o quirrgica.
Colocar la muestra en un tubo de medio de transporte Stuart.
Para estudio de grmenes anaerobios la muestra se debe colocar en el medio de

transporte Portagerm.
En todos los casos sospechosos de infeccin biliar deben obtenerse muestras de sangre
para la realizacin de hemocultivos.
Una cantidad de 2 a 3 ml es suficiente.
Basta con solo una muestra.

Asociar siempre 4 frascos de hemocultivos para estudio de bacteriemia.
Transportar la muestra al laboratorio de inmediato en envase resistente y lavable, a

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La muestra debe ser transportada inmediatamente al laboratorio. Permite como mximo

la conservacin a temperatura ambiente durante 2 horas.
I) OBSERVACIONES
Indicar si hay sospecha clnica de que la muestra procede de un paciente portador de

Salmonella spp.
La observacin de microorganismos en la tincin de Gram, permite dar un diagnstico
presuntivo rpido de la etiologa bacteriana y orientar el tratamiento emprico. Es tambin
un control de calidad del transporte y procesamiento de la muestra al correlacionar lo
que se asla en el cultivo con los morfotipos observados en la tincin. La sensibilidad de
la tincin de Gram en las muestras biliares es cercana al 80%.
Los cultivos de bilis de poco menos de la mitad de los pacientes con colecistitis aguda
son positivos mientras que en las colangitis agudas el cultivo de la bilis, las biopsias o las
prtesis biliares son positivos en alrededor del 90% de los casos. Los casos de cultivo de
bilis negativo suelen estar relacionados con un tratamiento antibitico previo, un
transporte inadecuado de la muestra (especialmente en el caso de los microorganismos
anaerobios) o con la recogida en fase temprana, sin tiempo suficiente para permitir la
invasin bacteriana.
7.12 MUESTRAS DE LIQUIDOS BIOLOGICOS
7.12.1 LIQUIDO CEFALORRAQUIDEO
A) GENERALIDADES
El L.C.R. es la muestra clnica que con mayor urgencia debe ser procesada, ya que
habitualmente proviene de un paciente grave en el que se ha sospechado el diagnstico
de meningitis, los microorganismos presentes suelen ser escasos y generalmente con
baja resistencia a las condiciones ambientales adversas.
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Vigencia: 09/2020
B) INDICACIONES
Sospecha de meningitis.
Alteracin de la conciencia, especialmente en el nio.
El material a usar para la toma de muestra solo ser de conocimiento de los

profesionales entrenados para realizarla.
La muestra de LCR debe ser obtenida por un mdico entrenado en la tcnica de puncin
lumbar utilizando una tcnica estrictamente asptica (campo estril y equipo de
profesionales con vestimenta de proteccin estril).
Se recolecta el LCR en dos tubos estriles, sin aditivos (tapa blanca). Se utiliza el
primero para estudio citoqumico y celular. El segundo frasco para estudio
microbiolgico, ya que el primero tiene ms posibilidades de contaminacin.
Si la prioridad la tiene el estudio bacteriolgico habr que centrifugar toda la muestra y

utilizar el sobrenadante para la deteccin de antgenos capsulares y estudio qumico.
Se debe adems tomar muestras de sangre para estudio de hemocultivos.
La cantidad de LCR afecta directamente la sensibilidad del diagnstico bacteriolgico.

En general cantidades de 1 a 3 ml de LCR para estudio bacteriolgico son adecuadas.
F) NUMERO DE LA MUESTRA
Basta con una muestra para estudio bacteriolgico en la cantidad requerida.

Recuerde que se necesita otro tubo para estudio citoqumico y celular.
Transportar la muestra en caja plstica, resistente y lavable, en forma inmediata al

laboratorio, en gradilla, a temperatura ambiente.
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El producto debe enviarse inmediatamente al laboratorio, pues alguno de los agentes

etiolgicos como S. pneumoniae, pueden lisarse rpidamente a partir de una hora tras su
recogida. Como mximo se conservar a temperatura ambiente por el lapso de 1 hora
desde el momento de la toma de muestra hasta la llegada al laboratorio.
Nunca deber refrigerarse pues se puede afectar la viabilidad de N. meningitidis y H.

influenzae.
Slo los tubos para cultivo de virus se deben refrigerar a 4 C. como mximo durante 24
horas, posterior a este tiempo deben conservarse a una temperatura de -70C.
I) OBSERVACIONES
La muestra se recoger, preferentemente, antes de instaurar cualquier teraputica

antibitica.
Se debe recoger una cantidad adecuada del LCR para asegurar la recuperacin del
organismo infectante, por lo que resultan adecuados de 1 a 3 ml para cultivo
convencional.
En caso de sospechar una meningitis por micobacterias o por hongos, se deber

obtener una cantidad mayor de LCR (2 o ms ml. en cada caso), ya que la concentracin
de microorganismos es inferior. En el caso de que se desee procesamiento para
diagnstico de virus, la cantidad ser de al menos 1 ml.
Se debe rotular en los tubos, en caso de que sea tomado ms de uno, el orden en el
cual fueron tomados (1. 2. Etc.), ya que el tubo N 2 ser utilizado para estudio
bacteriolgico y el N1 ser destinado para estudio citoqumico y celular y/o molecular.
Si se recibe una cantidad de muestra inferior a la necesaria para realizar todas las
pruebas solicitadas, el microbilogo debe contactar con el mdico para determinar las
pruebas que se van a realizar. Si a pesar de la escasa cantidad se siguen pidiendo las
mismas pruebas, stas se deben realizar, pero advirtiendo que el volumen recibido es
inadecuado.
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Vigencia: 09/2020
Si la extraccin de la muestra se ha realizado en un solo tubo y se solicitan pruebas para

distintos laboratorios, ser imprescindible remitirlo en primer lugar al laboratorio de
Microbiologa, para evitar su contaminacin.
En el caso de que se sospeche una meningitis bacteriana, es muy importante extraer

tambin hemocultivos.
Cuando hay derivaciones ventriculares para el drenaje del exceso de LCR, es

importante que estas muestras se etiqueten como Lquido de derivacin ventricular
y no Lquido Cefalorraqudeo, ya que microorganismos que podran considerarse
contaminantes para una puncin lumbar pueden ser serios patgenos en infecciones de
la derivacin ventricular.
7.12.2 LQUIDOS DE CAVIDADES SEROSAS
A) GENERALIDADES
El lquido pleural, peritoneal, pericrdico y sinovial son normalmente estriles. En

procesos infecciosos aumenta su volumen y dan lugar al desarrollo de diversos
microorganismos.
B) INDICACIONES
Se debe obtener estas muestras frente a la sospecha clnica, radiolgica y/o ecogrfica
de derrame pleural, ascitis, derrame pericrdico y artritis supurada.
Paos estriles.
Gasas estriles.
Guantes estriles.
Jeringuillas y agujas estriles. No se deben utilizar jeringuillas
heparinizadas, pues heparina lleva conservantes que pueden interferir la
viabilidad de los microorganismos.
Alcohol etlico o isoproplico al 70%.
Clohexidina.
2 Tubos estriles con tapn blanco.
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Vigencia: 09/2020
1 Tubo con EDTA tapn lila.

Sistemas de transporte para estudio de anaerobios (Portagerm).
Frascos de hemocultivos.
Estas muestras se obtienen generalmente por puncin percutnea, por lo tanto se debe
realizar un riguroso aseo y antisepsia de la zona que se va a puncionar para evitar la
contaminacin de la muestra con flora cutnea. La muestra debe ser obtenida por un
mdico experimentado en la tcnica y un asistente, ambos vestidos con ropa estril,
guantes y mascarilla.
Se recolecta el lquido en dos tubos estriles, sin aditivos con tapa blanca, y un tubo
con anticoagulante (EDTA) con tapa lila para estudio de ADA.
Orden de la toma de muestra:

- Tubo N 1 (tapa blanca estril) para estudio citoqumico.
- Tubo N 2 (tapa blanca estril) para estudio bacteriolgico.
- Tubo N 3 (tapa lila) para estudio de ADA.
Se recomienda adems tomar en forma paralela muestras de sangre para estudio de

Hemocultivos.
En los casos que se sospeche de empiema pleural se podr solicitar estudio de

anaerobios (frasco Portagerm).
Para el estudio bacteriano, una muestra de 3 ml es ms que suficiente para cada tubo.
En casos especiales en que se sospeche de Mycobacterium spp. enviar un tubo tapa

blanca estril extra, cubierto con un envoltorio negro en una cantidad superior a 10 ml.
D) NUMERO DE MUESTRAS
Se requiere un tubo para estudio citoqumico y un tubo para estudio bacteriolgico.

Si se solicita estudio de ADA , el tubo de tapa lila con anticoagulante (EDTA).
Si se sospecha de anaerobios se enviar muestra en el frasco portagerm.
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F) TRANSPORTE DE LA MUESTRA
Llevar la muestra al laboratorio de inmediato, a temperatura ambiente, en gradilla, en un

envase plstico resistente y lavable.
G) CONSERVACION DE LA MUESTRA
Si es necesario evitar la coagulacin de algunos de estos lquidos se usar heparina sin

conservantes; otros anticoagulantes pueden tener accin bacteriana.
El producto debe enviarse inmediatamente al laboratorio, pues alguno de los agentes

etiolgicos pueden lisarse rpidamente. Como mximo se conservar a temperatura
ambiente por el lapso de 1 hora desde el momento de la toma de muestra hasta la
llegada al laboratorio. NO REFRIGERAR.
Cuando las muestras se destinen a la investigacin de micobacterias y hongos, debern

mantenerse en refrigeracin a una temperatura de 4C.
I) OBSERVACIONES
Cuando se utilice una anestesia local, hay que cambiar de jeringuilla y aguja para hacer
la extraccin de la muestra, ya que los anestsicos pueden inhibir el crecimiento
bacteriano.
7.12.3 LQUIDOS DE DIALISIS PERITONEAL CRNICA AMBULATORIA
A) GENERALIDADES
La dilisis peritoneal es el primer escaln del tratamiento de la insuficiencia renal crnica

que requiere depuracin. La dilisis peritoneal implica la insercin de un catter en la
pared abdominal que abre una puerta de entrada que puede ser utilizada por distintos
microorganismos para invadir y producir diversos tipos de infecciones.
En estos pacientes pueden aparecer infecciones de la zona por la que trascurre el

catter en la pared y/o en la cavidad peritoneal. La bacteriemia es muy infrecuente y
generalmente se asocia a la coexistencia de diversas patologas intraabdominales.
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La peritonitis de la dilisis peritoneal, puede ser considerada como un tipo de peritonitis

primaria, dado que no se suele evidenciar ningn foco infeccioso intraabdominal ni una
solucin de continuidad en el tracto gastrointestinal, o como un cuarto tipo de peritonitis
porque su origen est en la rotura permanente de la pared abdominal y en la
introduccin repetida de lquidos en la cavidad.
El diagnstico microbiolgico de estas infecciones se basa en el aislamiento de los

microorganismos responsables a partir del cultivo de los exudados, catter o lquido
efluente.
B) INDICACIONES
Pacientes con IRC cuya dilisis es de tipo ambulatoria y que presentan cuadros
sospechosos de peritonitis.
El material corresponde a los utilizados habitualmente por personal entrenado en

tcnicas de peritoneo dilisis y bajo estrictas condiciones de asepsia.
La obtencin de la muestra debe realizarse preferentemente antes de iniciar el

tratamiento antimicrobiano.
Se recoge el lquido efluente en la bolsa donde se realiza la peritoneo dilisis. Enviar al

laboratorio la bolsa completa del dializado, preferentemente la ms turbia.
Enviar para su procesamiento la bolsa de peritoneo dilisis ms turbia.
Una bolsa de peritoneo dilisis.

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La bolsa con el lquido efluente se introduce en una bolsa de plstico y posteriormente

dentro de un receptculo de plstico a prueba de derrames. La muestra debe enviarse al
laboratorio en forma inmediata (< 1 hora).
Si el transporte no es de inmediato, mantener a temperatura ambiente por un tiempo no

mayor a 6 horas.
NO CONGELAR.
I) OBSERVACIONES
La tincin de Gram suele ser negativa, pero en caso contrario orienta la etiologa
bacteriana. sta y otras tinciones son tiles para la deteccin de hongos precozmente.
En todo caso se observar una numerosa celularidad particularmente de leucocitos
PMN.
El tratamiento antimicrobiano previo a la obtencin de la muestra o el uso de sustancias

antispticas puede dar lugar a cultivos negativos.
Ante una peritonitis cuya etiologa se sospecha que es infecciosa pero que los cultivos
son negativos, a los 3 das se debe repetir la peticin microbiolgica s el recuento de
clulas indica infeccin. En un 35% de los casos se obtiene un cultivo positivo en el
segundo estudio.
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7.13 MUESTRAS DEL TRACTO RESPIRATORIO
7.13.1 MUESTRAS DEL TRACTO RESPIRATORIO SUPERIOR
INTRODUCCION
Las infecciones del tracto respiratorio superior (Fig. 14) son una de las causas ms
frecuentes de consulta mdica. La mayora de estas infecciones son autolimitadas y de
origen viral, otras son causadas por bacterias especficas y requieren tratamiento
antimicrobiano.
La densidad y naturaleza de los microorganismos presentes a lo largo del tracto

respiratorio superior vara, por lo tanto conocer la flora comensal es fundamental para la
interpretacin de los resultados de laboratorio.
La flora que normalmente se presenta en el trato respiratorio superior se encuentran:

Streptococcus (alfa hemolticos, no hemolticos, beta hemolticos) Neisseria spp,
Corynebacterium spp., Staphylococcus spp., Micrococcus spp., Bacteroides spp.,
Fusobacterium spp., Veillonella spp., Peptostreptococcus spp., Actinomyces spp.,
Moraxella spp.
Las infecciones del tracto respiratorio superior ms frecuentes son: faringitis, sinusitis,
otitis, difteria, tos ferina y Angina de Vincent.
Fig. 14
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7.13.1.1 SECRECIN FARNGEA
A) GENERALIDADES
La principal causa de faringitis es Streptococcus pyogenes, otros agentes menos

frecuentes son Streptococcus grupo C y G, Corynebacterium diphtheriae y
Arcanobacterium haemolyticum.
El estudio de Neisseria meningitidis generalmente se hace con propsitos

epidemiolgicos.
Corynebacterium diphtheriae, se debe buscar slo cuando se solicita expresamente.
El estudio de faringitis gonoccica debe ser solicitado en forma especfica por el
mdico al laboratorio.
B) INDICACIONES
Se indica principalmente en pacientes con problemas respiratorios y que presentan las

faringes comprometidas (inflamacin).
Bajalenguas (imprescindible)
Dos tubos con medio de transporte Stuart (gelatina tapa celeste).
Se debe contar con buena iluminacin y exposicin de la faringe del paciente.

Deprimir la lengua con baja lengua.
Frotar la trula contra la pared posterior de la faringe y las amgdalas tocando cualquier
exudado (Fig. 15).
Evitar tocar la lengua, vula y la pared de la boca.
Colocar ambas trulas en medio de transporte Stuart
Fig. 15
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Impregnar las trulas con la muestra del sitio afectado.
Dos trulas con muestra en su medio de transporte.
Se debe transportar la muestra al laboratorio de inmediato,
Conservar a temperatura ambiente, en un recipiente resistente y lavable.
H) OBSERVACIONES
Se investigar rutinariamente la presencia de Streptococcus beta-hemoltico del grupo A

(S. pyogenes) y otros grupos beta hemolticos como C y G, Arcanobacterium
haemolyticum.
Bsqueda de otros microorganismos:
Corynebacterium diphtheriae
Tomar muestra con cuatro trulas utilizando baja-lengua, pasndola por el reborde de la
pseudomembrana y enviar en tubo estril seco, a la brevedad al laboratorio, no
remover la membrana.
Es aconsejable adems enviar una una trula nasofarngea por va pernasal.
Neisseria meningitidis
Muestra nasofarngea. Tomar la muestra por detrs de la vula en la porcin nasal de la
faringe.
Neisseria gonorrhoeae
Secrecin farngea. Tomar la muestra como para cultivo corriente.
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Bordetella pertussis
Aspirado nasofarngeo. Slo se realiza estudio de Inmunofluorescencia.
7.13.1.2 SECRECIN NASAL
A) GENERALIDADES
Esta muestra solo se utiliza para buscar portadores de S. aureus o en el diagnstico

etiolgico de imptigo. No es til para el diagnstico etiolgico en casos de rinitis,
rinosinusitis ni en casos de otitis media ni cuadros respiratorios altos prolongados.
Recordamos que gran parte de la poblacin es portadora de este microorganismo a nivel

nasofarngeo por lo cual su hallazgo no tiene habitualmente significancia clnica salvo en
situaciones especiales.
B) INDICACIONES
Slo en pacientes que se sospecha que son portadores de S. aureus, y en pacientes

que sufren de imptigo.
C) MATERIAL NECESARIO
Dos tubos con medio de transporte Stuart.

Suero fisiolgico estril.
Introducir la trula humedecida en solucin salina y rotar en el vestbulo de ambas fosas

nasales, tabique y cara interna de aletas nasales y colocarlas en medio de transporte
Stuart.
Basta con frotar la zona con las trulas.

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Se debe transportar la muestra al laboratorio de inmediato, en un recipiente resistente y

lavable.
Conservar temperatura ambiente por un mximo de 2 horas.
I) OBSERVACIONES
En el personal de salud slo se realizar la bsqueda de portadores en el caso de brotes

de infecciones en los que no se ha encontrado otra fuente de infeccin.
Este tipo de investigacin se realizar en coordinacin con el Comit de Infecciones
Intrahospitalarias, quien determinar la oportunidad de su realizacin.
7.13.1.3 MUESTRAS OCULARES
A) GENERALIDADES
El agente etiolgico de la infeccin ocular se asla con mayor frecuencia en las primeras
etapas de la enfermedad. Por ello, es fundamental una muestra precoz, tomada en la
forma ms asptica posible y antes de la aplicacin de antimicrobianos.
Este tipo de muestras sirve para el diagnstico de conjuntivitis de causa bacteriana.

Estas son a menudo unilaterales. De todas maneras se solicita que se haga la toma de
muestra de ambos sacos conjuntivales por separado, de manera de poder valorar la flora
normal.
B) INDICACIONES
Se indica principalmente en pacientes con conjuntivitis, secrecin ocular e irritacin

excesiva del ojo (Fig. 16).
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C) MATERIAL NECESARIO PARA LA TOMA DE MUESTRA
Tomar la muestra para cultivo antes de la aplicacin de anestsico tpico.

Tomar la muestra con extremo cuidado, con la ayuda de otra persona que inmovilice la
cabeza del paciente.
Obtener la secrecin con trula estril del fondo del saco inferior en el ngulo interno del
ojo o del extremo del prpado.
Rotar la trula suavemente para que toda la superficie del algodn se empape de
secrecin purulenta.
Colocar ambas trulas en medio de transporte Stuart.
Dos trulas impregnadas con secrecin.
Dos trulas con muestra en su medio de transporte Stuart.

lavable.
I) OBSERVACIONES
Los cultivos de conjuntiva preoperatorios no son tiles. El nmero y tipo de

microorganismos de la conjuntiva normal vara diariamente, por lo que estas muestras no
son vlidas, excepto en el caso de signos inflamatorios a nivel ocular.
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Fig. 16
7.13.1.4 SECRECION OTICA: OTITIS MEDIA
A) GENERALIDADES
La otitis media es una de las infecciones del odo ms comunes de los nios de 3 meses
hasta 3 aos.
La muestra ms adecuada es el aspirado del odo medio, obtenida por timpanocentesis.
B) INDICACIONES
Se indican en casos de pacientes con infeccin del odo medio aguda, otitis crnica y
pacientes inmunodeprimidos.
El de una Timpanocentesis.
Trulas estriles.
Contenedor estril.
Medio de transporte para anaerobios.
Povidona iodada al 10%.
D) PROCEDIMIENTO DE LA TOMA DE LA MUESTRA
Tcnica
Timpanocentesis: (Figura 19.)
Debe obtener la muestra un especialista en otorrinolaringologa o personal entrenado
para ello.
Se limpiar el canal auditivo externo con una trula impregnada en antisptico suave.
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Se puncionar el tmpano a travs de un otoscopio estril.

La muestra se enviar en un contenedor estril (Portagerm). Cuando no sea suficiente
se tomar con trula, aunque no es lo ms recomendable. Las muestras en trula no
sirven para cultivo de anaerobios.
Muestras con tmpano roto:

Tras la limpieza del canal externo se tomar la muestra con trula fina a travs de un
otoscopio estril, llegando a las cercanas del tmpano.
Estas muestras no son vlidas para anaerobios.
El fluido suele colonizarse con flora de CAE, con lo que la interpretacin de los
resultados es siempre complicada.
Colocar la(s) trula(s) en medio de transporte Stuart.
Se intentar obtener la mayor cantidad de exudado posible.

Dos trulas impregnadas con secrecin en caso de tmpano roto.
1 frasco Portagerm y/o 2 trulas

lavable.
I) OBSERVACIONES
No es conveniente usar trula, pues habitualmente se contamina con la flora normal del
odo externo, haciendo la interpretacin de resultados difcil y confusa.
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Fig. 19 a, b.
7.13.1.5 SECRECION OTICA: OTITIS EXTERNA
A) GENERALIDADES
El odo medio e interno son estriles, no as el conducto auditivo externo, el que se

encuentra colonizado por una variada flora normal.
B) INDICACIONES
Se indican en casos de pacientes con inflamacin al odo externo y que presentan

secrecin visible. Los principales agentes causales son bacterias y hongos.

Antes de tomar la muestra proveniente de odo externo (Secrecin del conducto auditivo
externo), hacer un aseo cuidadoso de la piel de modo de disminuir las posibilidades de
arrastrar bacterias presentes normalmente en esa zona.
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Dirigir la trula en sentido oblicuo de atrs hacia adelante y de abajo hacia arriba (dos
trulas). Colocar ambas trulas en medio de transporte Stuart.
Basta tocar la zona ms representativa con la trula.
Transportar la muestra al laboratorio de inmediato, en envase resistente y lavable, a

I) OBSERVACIONES
La muestra representativa es la secrecin del conducto auditivo externo. Cuando se

presenta exudado, es mejor recolectar pus con una trula fina.
Fig. 20
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7.13.1.6 MUESTRAS DE SENOS PARANASALES
A) GENERALIDADES
Las vas areas paranasales se comunican con la cavidad nasal adyacente y por lo tanto
son vulnerables a la infeccin por organismos del tracto respiratorio superior.
B) INDICACIONES
Sinusitis aguda
Sinusitis crnica
Antisptico suave.
Medio de transporte para anaerobios (Portagerm).
Material quirrgico de O.R.L.
La muestra debe ser obtenida por un especialista en otorrinolaringologa.

Desinfectar la mucosa nasal en el punto de aspiracin para eliminar organismos
contaminantes.
Introducir una aguja en el antrum maxilar por debajo del cornete inferior, o en el seno
frontal por debajo del marco supraorbital del ojo.
Aspirar el lquido del seno. Cuando no se obtenga lquido, instilar 1 ml. de suero salino
estril y aspirarlo nuevamente.
Inyectar la muestra en un medio de transporte para anaerobios (Portagerm).
De 1 a 5 ml
1 frasco Portagerm
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Enviar la muestra al laboratorio de inmediato, en medio de transporte Portagerm, en un

recipiente resistente y lavable.
La muestra debe ser transportada de forma inmediata, mantenindola hasta su llegada

al laboratorio a temperatura ambiente.
I) OBSERVACIONES
El frasco Portagerm es un medio capaz de transportar tanto grmenes aerobios como

anaerobios.
7.13.2 MUESTRAS DEL TRACTO RESPIRATORIO INFERIOR
7.13.2.1 EXPECTORACION
A) GENERALIDADES
Las infecciones del tracto respiratorio inferior, es decir las que comprometen traquea,
bronquios, bronquolos, alvolos y/o parnquima pulmonar, constituyen en Chile la
primera causa de mortalidad infantil tarda y unas de las primeras causas de muerte por
infeccin nosocomial.
El diagnstico etiolgico de estas infecciones no es fcil, debido a que la muestra clnica

necesariamente pasa a travs de la orofaringe, lugar donde se contamina con
numerosas especies bacterianas, salvo en aquellas circunstancias en que la muestra se
obtiene directamente desde el sitio de la lesin.
B) INDICACIONES
Pacientes con neumona.

Enfermedad bronquial crnica reagudizada.
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C) MATERIALES A USAR PARA LA TOMA DE MUESTRAS
Recipiente estril (placa de Petri estril) Solicitar a Laboratorio.
D) PROCEDIMIENTO PARA LA TOMA DE MUESTRA
Esta muestra debe ser obtenida desde un paciente que comprenda las indicaciones.
Instruir al paciente sobre la diferencia entre expectoracin y saliva.
Explicar al paciente que debe obtener un esputo tras una expectoracin profunda,
preferentemente la primera de la maana.
Para pacientes con dentaduras postizas, stas deben ser quitadas primero.
El paciente debe lavarse los dientes y realizar enjuagues con agua destilada estril o
solucin salina para limpiar la cavidad oral.
Mediante tos espontnea o provocada (inducida), eliminar el esputo en una placa Petri
estril (Fig. 20).
De no producirse la expectoracin espontanea, puede inducirse con nebulizaciones de
suero fisiolgico estril (15ml durante 10 minutos), siendo til adems realizar un drenaje
postural o fisioterapia respiratoria.
El mdico, kinesilogo o enfermera son responsables de la toma de muestra y deben
asistir al paciente durante su obtencin.
Fig. 20
De 2 a 10 ml si es posible.
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Basta con una sola muestra, pero tambin se recomiendan dos muestras. Siempre
previas al inicio de la terapia antimicrobiana.
Transportar la muestra al laboratorio de inmediato, en caja plstica resistente y lavable,

evitando derramamientos.
Envo inmediato al laboratorio (no superior a 1 hora). Si no es posible, conservar a 4C.

No congelar.
I) OBSERVACIONES
Es preferible realizar la toma antes de instaurar el tratamiento antibitico.

No es til para anaerobios.
La expectoracin debe rechazarse hasta obtener un esputo de calidad suficiente segn
los criterios de Murray y Washington (ms de 25 leucocitos polimorfonucleares y
menos de 10 clulas epiteliales por campo 10x).
7.13.2.2 LAVADO BRONCOALVEOLAR ( LBA)
A) GENERALIDADES
La neumona bacteriana ha sido difcil de identificar microbiolgicamente. En la mayora

de los estudios, el agente etiolgico se recupera en menos del 60% de los casos por lo
difcil que es obtener una muestra adecuada del tracto respiratorio inferior.
El LBA ha tenido gran aceptacin como herramienta clnica y de investigacin, pues ha
demostrado ser un mtodo seguro y prctico para el diagnstico de infecciones
pulmonares oportunistas en pacientes inmunodeprimidos con aproximadamente 80% de
aislamiento de organismos responsables de estas neumonas.
Consiste en el lavado de un segmento pulmonar, previo anclado del broncoscopio,

introduciendo de 20 a 50 ml de suero fisiolgico estril. Es til sobre todo en procesos
pulmonares intersticiales.
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B) INDICACIONES
Pacientes con neumona de difcil diagnstico.

Pacientes inmunodeprimidos con neumona.
Sospecha de neumona por Pneumocystis jiroveci.
Broncoscopio y materiales propios de esta tcnica realizada por mdico especialista
La muestra debe ser tomada por un mdico especialista.
Se enva al laboratorio todo el contenido aspirado despus de la introduciendo de 20 a

50 ml de suero fisiolgico estril.
Con una muestra tomada adecuadamente es suficiente.
La muestra se debe enviar al laboratorio en un tubo estril (con tapa blanca) en gradilla,
en un recipiente resistente y lavable evitando su derramamiento.
La muestra debe enviarse inmediatamente al laboratorio.

Si no es posible mantener a temperatura ambiente durante un tiempo mximo de 1
hora.
I) OBSERVACIONES
La inhibicin de las bacterias por la solucin anestsica puede ser un problema, por lo
que es muy importante procesar rpidamente estas muestras para cultivo.
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Las muestras broncoscpicas tienen la consideracin de muestras invasivas y por tanto

no pueden ser rechazadas sin consultar previamente con el mdico responsable de su
obtencin a fin de subsanar, en lo posible, el motivo del rechazo. Si esto fuera imposible,
la muestra debe procesarse anotando el problema en el informe y avisando de las
posibles consecuencias que ello pudiera haber tenido en la interpretacin de los
resultados.
7.13.2.3 ASPIRADO TUBO ENDOTRAQUEAL

(SECRECIONES TRAQUEALES)
A) GENERALIDADES
Los cultivos de las secreciones del tracto respiratorio inferior pueden ser de ayuda para
el diagnstico de la infeccin del tracto respiratorio inferior, aunque hay que tener
presente que, en general, tienen un valor limitado debido a la baja sensibilidad de las
tcnicas microbiolgicas convencionales segn el cuadro clnico.
B) INDICACIONES
Esta muestra se utiliza fundamentalmente para valorar infeccin v/s colonizacin del
tracto respiratorio inferior en el paciente sometido a ventilacin mecnica.
Sonda de aspiracin con recipiente para la recogida de muestras tipo

Lukens.
Solucin fisiolgica estril.
Guantes estriles.
Equipo de aspiracin.
La muestra se obtiene con sonda de aspiracin por personal de enfermera o

kinesiologa, debidamente entrenado.
Si secrecin es muy densa se puede instilar y aspirar 10 ml. de Solucin fisiolgica
estril.
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Vigencia: 09/2020
El correspondiente a la secrecin aspirada.
Una muestra correctamente tomada es suficiente.
La muestra se debe enviar al laboratorio en un tubo estril (tubo de centrfuga plstico

con tapa rosca) en gradilla dentro de un receptculo plstico lavable, evitando su
derramamiento.
H) CONSERVACION
Envo inmediato al laboratorio (no superior a 1 hora). Si no es posible, conservar a 4C.

No congelar.
I) OBSERVACIONES
6
Este examen tiene un resultado de cultivo cuantitativo, donde un recuento de >1 x 10
UFC/ml, se correlaciona bien con la etiologa de la neumona en el paciente ventilado.
Recuentos inferiores deben ser considerados como colonizacin.
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7.14 MUESTRAS DEL TRACTO GENITAL
7.14.1 SECRECIONES TRACTO GENITAL FEMENINO
Las infecciones del tracto genital femenino son causadas por una gran variedad de
microorganismos incluyendo bacterias, hongos, virus y Chlamydia spp. El tipo de
infeccin y el agente etiolgico son referidos a varios factores como: actividad sexual,
uso de anticonceptivos, instrumentacin del tracto genital e infeccin base.
7.14.1.1 SECRECION VAGINAL
A) GENERALIDADES
Ver punto 7.14.1
B) INDICACIONES
Esta muestra se utiliza para conocer la etiologa en casos de vaginitis y vaginosis.

Puede utilizarse para bsqueda de portadoras de Streptococcus del grupo B en
embarazadas.
Camilla ginecolgica.
Espculo estril.
Medio de transporte Stuart (2 tubos con sus respectivas trulas)
Tubo con 6 ml de suero fisiolgico estril.
La paciente no debe utilizar en los das previos a la recogida de la muestra, soluciones

antispticas vaginales, vulos ni pomadas.
La toma de muestra debe ser realizada por personal profesional especializado.
Colocar el espculo sin lubricante. (si es necesario para lubricar utilizar agua templada).
Tomar muestra, bajo visin directa con trula (2 trulas) de la zona con mayor exudado,
o en su defecto, del fondo del saco vaginal posterior y colocarlas en medio de transporte
Stuart.
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APL 1.2
Vigencia: 09/2020
Hacer lavado vaginal con el suero (a travs de sonda o directamente a travs del
espculo).
Colocar el producto del lavado en tubo estril.
Segn lo indicado en el procedimiento para toma de esta muestra (ver letra D anterior).
2 tlulas con medio de transporte Stuart.

1 tubo con el producto del lavado vaginal.
Transportar la muestra al laboratorio en forma inmediata, en gradilla, en un envase

resistente y lavable, a temperatura ambiente.
La muestra para estudio de examen en fresco (tubo con el producto del lavado vaginal)
debe enviarse al laboratorio en forma crtica antes de 15 minutos.
Las trulas con medio de transporte Stuart se mantendrn a temperatura ambiente, por
un tiempo mximo de 2 horas.
I) OBSERVACIONES
La sensibilidad diagnstica del test examen en fresco disminuye en un 20% por cada 10
minutos una vez tomada la muestra. Al transcurrir ms de una hora de tomada la
muestra, la viabilidad de trichomonas vaginalis es nula.
Aunque ocasionalmente puede aislarse Neisseria gonorrhoeae de muestras vaginales,

esta no es la localizacin habitual de la infeccin, por lo que no debe descartarse esta
posibilidad con un cultivo normal.
Cuando se sospeche la infeccin por Neisseria gonorrhoeae, deber enviarse muestra
endocervical.
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7.14.1.2 SECRECION DE CERVIX
A) GENERALIDADES
Los exudados cervicales son las muestras ms adecuadas cuando se sospecha

infeccin por N. gonorrhoeae. Las manifestaciones clnicas ms frecuentes son uretritis
cervicitis. En el 1%-3% de las infecciones gonoccicas hay diseminacin hematgena.
B) INDICACIONES
Se utiliza para el estudio de Neisseria gonorrhoeae

(Fig. 21).
Fig. 21
Camilla ginecolgica.
Espculo estril.
Torundas secas sin medio de transporte (para limpieza de exocrvix).
Medio de transporte Stuart (2 tubos con sus respectivas trulas de
alginato clcico o Dracon).
Con la paciente en posicin ginecolgica introducir suavemente el espculo sin lubricar

(o lubricado con agua templada).
Limpiar el exocrvix de las secreciones vaginales, con una trula seca.
Bajo visin directa comprimir cuidadosamente el crvix con palas del espculo e
introducir una torunda en el canal endocervical con un suave movimiento de rotacin.
Repetir la operacin con la segunda trula.
Colocar ambas trulas en medio de transporte

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Vigencia: 09/2020
TOMA DE MUESTRA Y SIEMBRA INMEDIATA EN POLI ETS
Materiales
Medio de transporte Stuart (2 tubos con sus respectivas trulas).
Placa de Agar Thayer Martin.
Portaobjeto (frotis)
Procedimiento
Seguir los pasos descritos anteriormente para la toma de muestra.
Realizar con una trula siembra en placa de Thayer Martin (placa con gelatina caf,
color chocolate) y un frotis (para la tincin de Gram) en un portaobjeto limpio
desengrasado del tamao de una moneda de 50 pesos.
Enviar la otra trula en su medio de transporte Stuart.
No aplica
2 trulas en medio de transporte Stuart. Una destinada al examen microscpico y otra al

cultivo.
Transportar la muestra al laboratorio en forma inmediata, en gradilla, en un envase

resistente y lavable.
Cuando las muestras no puedan enviarse antes de 15 minutos, se mantendrn a

temperatura ambiente, durante un tiempo mximo de 2 horas.
No puede garantizarse la viabilidad de Neisseria gonorrhoeae transcurridas 6-8 horas.

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Vigencia: 09/2020
I) OBSERVACIONES
Debe evitarse el uso de torundas de algodn ya que contienen cidos grasos que
pueden inhibir el crecimiento de Neisseria gonorrhoeae.
7.14.1.3 LIQUIDO AMNIOTICO
A) GENERALIDADES
El lquido amnitico es un fluido lquido acuoso, claro y ligeramente amarillento, estril,

que permite el movimiento y sustentacin hidrulica del feto.
Evidencias sugieren que la infeccin juega un rol en la patognesis del parto prematuro.
La prevalencia promedio de infeccin intraamnitica en el parto prematuro con
membranas intactas, reportada en la literatura es de 5-15%.
B) INDICACIONES
Para estudio de bacterias aerobias y anaerobias cuando se sospecha de infeccin del

lquido amnitico.
Gasas estriles.
Clorhexidina.
Aguja y jeringa.
Contenedor estril.
Se requiere la monitorizacin del feto.
Este procedimiento es responsabilidad del profesional mdico.

La toma de muestra puede ser mediante amniocentesis o aspiracin transcutnea. La
aspiracin es con jeringa y aguja tras desinfeccin de la piel.
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Vigencia: 09/2020
Se intentar obtener una muestra de 1-5 ml.
Una muestra correctamente tomada es suficiente.
Enviar la muestra al laboratorio en un tubo estril (tapa blanca), en gradilla. Para estudio
de grmenes anaerobios colocar la muestra en un frasco para cultivo de grmenes
anaerobios (portagerm). Transportar en un envase resistente y lavable, a temperatura
ambiente.
H) CONSERVACION
Envo inmediato al laboratorio. Conservar a temperatura ambiente por un tiempo no

superior a 1 hora.
I) OBSERVACIONES
Debe informarse en la solicitud de la existencia de rotura de membranas de ms de 24

horas.
7.14.2 TRACTO GENITAL MASCULINO
7.14.2.1 SECRECION URETRAL
A) GENERALIDADES
La uretritis es una de las infecciones del tracto urogenital ms comunes. Los sntomas
van desde leves a intensos.
Las muestras genitales se obtienen de zonas altamente colonizadas por flora comensal
por lo que la seleccin de las muestras y los mtodos de obtencin son crticos. La
supuracin espontnea no es la mejor muestra, por el alto nmero de comensales y las
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dificultades de la interpretacin de los cultivos. Los agentes productores de infecciones

genitales en el hombre tienen un rea especfica (2-3 cm en el interior de la uretra)
donde la rentabilidad es mayor.
B) INDICACIONES
Estudio indicado a todo varn que presente disuria, secrecin uretral.
Dos trulas uretrales finas, de alginato clcico o dacron con medio de

transporte Stuart.
Gasas estriles.
La muestra ha de recogerse preferentemente antes de la primera miccin de la maana.

Si es imposible, esperar al menos una hora tras la ltima miccin para recogerla.
Si hay secrecin abundante se toma la muestra con trula. El exudado puede

estimularse exprimiendo la uretra.
Si la secrecin es escasa introducir la trula suavemente unos dos centmetros por la
uretra, realizando movimientos de rotacin, permitiendo que absorba secrecin y luego
retirarla.
Repetir la operacin con una segunda trula.
TOMA DE MUESTRA Y SIEMBRA INMEDIATA EN POLI ETS
Materiales
Medio de transporte Stuart (2 tubos con sus respectivas trulas finas).
Placa de Agar Thayer Martin.
Portaobjeto (frotis)
Procedimiento
Seguir los pasos descritos anteriormente para la toma de muestra.

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Realizar con una trula siembra en placa de Thayer Martin (placa con gelatina caf,
color chocolate) y un frotis (para la tincin de Gram) en un portaobjeto limpio
desengrasado del tamao de una moneda de 50 pesos.
Enviar la otra trula en su medio de transporte Stuart.
No Aplica
Debern enviarse 2 trulas, una destinada al examen microscpico y otra para cultivo.
Transportar la muestra al laboratorio de inmediato, en envase resistente y lavable.
Por la labilidad de Neisseria gonorrhoeae, la muestra debe enviarse a temperatura

ambiente inmediatamente al laboratorio.
I) OBSERVACIONES
Debe evitarse el uso de torundas de algodn ya que contienen cidos grasos que
pueden inhibir el crecimiento de Neisseria gonorrhoeae.
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7.15 MUESTRAS DE PIEL Y TEJIDOS BLANDOS
7.15.1 ULCERAS, HERIDAS SUPERFICIALES Y ABSCESOS ABIERTOS
A) GENERALIDADES
En la toma de muestras para cultivo se debe considerar que la viabilidad de los

microorganismos disminuye por:
El pH cido del pus.

La disminucin de la temperatura.
La desecacin.
Para evitar esta prdida y obtener el mximo rendimiento de los exmenes

microbiolgicos, se debe acortar al mnimo el tiempo transcurrido entre la extraccin de
la muestra y su posterior siembra en el medio de cultivo en el laboratorio.
La desecacin es uno de los factores que contribuye a disminuir el rendimiento del

cultivo, por lo tanto la muestra tomada con trula seca es la menos adecuada. Para
mejorar la viabilidad, la trula debe ser introducida en un medio de transporte (Stuart) y
enviada al laboratorio para su siembra lo ms rpidamente posible.
Toda muestra de cultivo debe ser realizada con tcnica asptica usando material estril.
NO PROCEDE REALIZAR ESTUDIO BACTERIOLGICO A ESCARAS, POR EXISTIR

COLONIZACIN BACTERIANA.
B) INDICACIONES
Se indica en pacientes con heridas complicadas agudas, que presentan inflamacin y

secrecin caractersticas de una infeccin bacteriana.

Suero fisiolgico estril o solucin de Ringer lactato.
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La infeccin puede ser superficial o profunda dependiendo de las estructuras

comprometidas.
En la infeccin superficial, existe compromiso de dermis, epidermis y celular
subcutneo. Infeccin profunda, estn involucradas la fascia y msculo, pudiendo o no
comprometer cavidades u rganos. Esto determina que la muestra se tome de manera
distinta.
CULTIVO AERBICO SUPERFICIAL
Es necesario eliminar la flora superficial colonizante, para esto limpiar la herida por
arrastre mecnico con abundante suero fisiolgico estril, Ringer lactato (a chorro).
Frotar con trula (2 torulas) estril el centro y los bordes internos en zigzag, en
aproximadamente diez puntos de referencia de la superficie comprometida.
Colocar las trulas en medio de transporte Stuart y enviarlas al laboratorio para su
siembra y estudio.
CULTIVO AERBICO PROFUNDO
Es necesario eliminar la flora superficial colonizante, para eso limpiar la superficie

daada con abundante suero fisiolgico estril.
Tomar muestra con las dos trulas de la parte ms profunda de la herida.
Colocar las trulas en medio de transporte Stuart y enviarlas al laboratorio para su
siembra y estudio.
No aplica.
Se necesita una muestra en la cantidad adecuada y tomada con dos trulas en medio
de transporte Stuart.

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Conservar a temperatura ambiente por un periodo mximo de 2 horas.
I) OBSERVACIONES
Las muestras recibidas en trula son de escasa rentabilidad y deben obtenerse slo en
circunstancias muy excepcionales, cuando no se pueda recoger la muestra por otros
mtodos.
7.15.2 CELULITIS O EXANTEMAS SIN PRDIDA DE CONTINUIDAD DE LA

PIEL
A) GENERALIDADES
La toma de muestras en exantemas puede superponerse a la toma de heridas

superficiales, aunque conviene diferenciar la toma en casos de pstulas, vesculas,
petequias y otras lesiones especficas, ya que puede haber ligeras variaciones.
B) INDICACIONES
Se indica en pacientes con lesiones en piel de caractersticas infecciosas, que no

presenten prdida de continuidad.
Gasas estriles.
Clorhexidina al 2%.
Jeringa estril.
Aguja IM.
Medio de transporte para anaerobios.
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Desinfectar la piel, limpiando la zona con alcohol, de forma concntrica comenzando por
el centro. Abarcar una zona de unos 10 cm. Repetir la operacin con clorhexidina al 2%.
Dejar secar al menos 1 minuto para que la ejerza su accin antisptica.
Inocular 0,5 a 1 cc de suero fisiolgico estril.
Aspirar y enviar en medio de transporte Stuart y para estudio de grmenes anaerobios
en medio de transporte Portagerm.
Se obtendr el mximo volumen de muestra.
Con una muestra adecuadamente tomada es suficiente.
G) TRASNSPORTE DE LA MUESTRA

I) OBSERVACIONES
Las muestras recibidas en trula son de escasa rentabilidad y no deben obtenerse, ya

que no son representativas.
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7.15.3 ABSCESOS CERRADOS
A) GENERALIDADES
Los microorganismos causales pueden llegar al parnquima por extensin directa desde
un foco contiguo de infeccin o por va hematgena desde un foco distante.
B) INDICACIONES
Se indica en pacientes con abscesos complicados.
Gasas estriles.
Clorhexidina al 2%.
Jeringa estril.
Aguja IM.
Medio de transporte para anaerobios
Desinfectar la piel, limpiando la zona con alcohol, de forma concntrica comenzando por
el centro. Abarcar una zona de unos 10 cm. Repetir la operacin con clorhexidina al 2%.
Dejar secar al menos 1 minuto para que la ejerza su accin antisptica.
Realizar una puncin-aspiracin del absceso con jeringa y aguja.
Colocar la muestra en medio de transporte Stuart y para estudio de grmenes
anaerobios en medio de transporte Portagerm.
Deber enviarse un volumen de muestra entre 2 y 5 ml.
Con una muestra adecuadamente tomada es suficiente.

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I) OBSERVACIONES
Es muy importante especificar en la solicitud la localizacin del absceso y el estado

inmunitario del paciente con vistas a la bsqueda e interpretacin de los resultados. La
recogida de la muestra con trula es poco deseable, por tener mayor riesgo de
contaminacin, y ser poco representativo.
7.15.4 ULCERAS CRONICAS Y BIOPSIAS
A) GENERALIDADES
Dado el aumento de la patologa geritrica, las lceras crnicas son ms frecuentes en

este tipo de pacientes, aunque pueden darse a cualquier edad, las ms frecuentes son
las lceras varicosas, las lesiones por presin y el sndrome del pie diabtico.
Dado que este tipo de lceras tiende a ser profundo, los microorganismos aislados son
muy variables, Staphylococcus aureus es el ms frecuentemente aislado, seguido de
Streptococcus spp, bacilos gramnegativos como Escherichia coli, Pseudomonas
aeruginosa y anaerobios sobre todo Peptostreptococcus y Bacteroides spp.
B) INDICACIONES
Indicado en pacientes que presenten ulceras crnicas.
El material quirrgico estril que precise la tcnica empleada para la

obtencin de las biopsias de distintas localizaciones.
Recipientes estriles con tapa de rosca y boca ancha (frascos de Urocultivos)
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Suero salino estril.

Jeringas y agujas estriles
Medio de transporte para anaerobios (Portagerm).
Muestras slidas:
Las muestras deben obtenerse mediante el curetaje de lesiones profundas (raspado del
tejido de la base de la lcera, despus del desbridamiento, con hoja de bistur estril y la
toma de biopsia de los tejidos desbridados (muy til en caso de osteomielitis). Cuando
las lesiones estn bien delimitadas se intentar incluir tambin el borde activo de la
lesin.
Para prevenir la desecacin de las muestras de pequeo tamao pueden aadirse 3-10
gotas de suero salino estril, evitando que la muestre quede inmersa (Figura 22).
Los tejidos no deben ponerse en contacto con formol o cualquier sustancia.
Se recomienda recoger ms de una muestra, de diferentes zonas de la herida, porque

una nica muestra puede no reflejar todos los microorganismos productores de infeccin.
Muestras lquidas: Se obtendrn por aspiracin con jeringa y aguja siguiendo tcnicas
estrictamente aspticas. Colocar la muestra en medio de transporte Stuart y para
estudio de grmenes anaerobios en medio de transporte Portagerm.
Muestras slidas: Se recomienda obtener una pieza de al menos 2-5 cm.

Muestras lquidas: 5-10 ml.
Como mnimo una muestra adecuadamente tomada.
Las muestras slidas se introducirn en un recipiente estril con tapa de rosca de boca
ancha (frasco de urocultivo estril).
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Muestras lquidas Colocar la muestra en medio de transporte Stuart y para estudio de

grmenes anaerobios en medio de transporte Portagerm.
El transporte de la muestra es determinante para el resultado, el aislamiento del agente

causal es inversamente proporcional al tiempo transcurrido entre la obtencin y el
procesamiento.
Conservar a temperatura ambiente por un periodo mximo de 1/2 hora desde la toma de
muestra.
I) OBSERVACIONES
La toma se debe de realizar antes de la administracin de antibiticos o tras un periodo

libre de al menos 48 horas.
Debe de etiquetarse de forma correcta, si hay ms de una toma, indicar claramente cada
una de las muestras.
Es muy importante especificar en la solicitud la localizacin y el estado inmunitario del

paciente con vistas a la bsqueda e interpretacin de los resultados.
Las muestras de trayectos fistulosos no representan la verdadera etiologa en casos de
osteomielitis subyacente.
Se debe evitar tomar muestras superficiales mediante trula. Estas muestras estn
contaminadas con microbiota colonizadora e incluso con microorganismos
potencialmente patgenos que no participan en la infeccin, y no reflejan toda la
microbiota que produce infeccin en la profundidad de la herida.
Si no puede asegurar la esterilidad del suero salino (utilizado para evitar la desecacin),
envi la muestra lo antes posible sin agregar el suero salino.
Los tejidos no deben ponerse en contacto con formol o cualquier sustancia.

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Fig. 22
Tejido dentro recipiente estril con tapa rosca

de boca ancha.
Agregar unas gotas de solucin salina estril,
evitando el exceso.
7.15.5 HERIDA QUIRURGICA
A) GENERALIDADES
La infeccin posoperatoria de la herida quirrgica es la mayor causa de morbilidad

infecciosa en el paciente quirrgico. Ocasiona prolongadas estadas hospitalarias,
incremento de los costos de la atencin mdica e inconvenientes para el paciente
B) INDICACIONES
Se indica en pacientes con infeccin de herida quirrgica.

Suero fisiolgico estril o solucin de Ringer lactato.
La toma de muestra se realizar con tcnica asptica luego de limpieza de la zona con
suero fisiolgico estril para eliminar la flora microbiana superficial.
La muestra es obtenida con 2 trulas realizar embebiendo el material exudado y
colocarlas en el medio de transporte Stuart.
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Vigencia: 09/2020
No Aplica.
Se necesita una muestra en la cantidad adecuada y tomada con dos trulas en medio
de transporte Stuart.

I) OBSERVACIONES
Es muy importante especificar en la solicitud la localizacin y el estado inmunitario del

paciente con vistas a la bsqueda e interpretacin de los resultados.
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Vigencia: 09/2020
7.16 MUESTRAS PARA ESTUDIOS MICOLOGICOS
7.16.1 MICOSIS SUPERFICIALES
A) GENERALIDADES
La eficacia con la que se realice un diagnstico micolgico correcto est vinculada al

grado de especialidad sobre el tema que tengan los profesionales. En primer lugar, es el
mdico clnico (mdico general, internista, infectlogo, hematlogo, dermatlogo entre
otros especialistas) quien sospecha la presencia de una micosis, por lo cual debe
conocer los sntomas y signos de la misma, para solicitar al laboratorio la realizacin de
los estudios micolgicos pertinentes.
Si el mdico no establece un diagnstico presuntivo de una micosis, o no logra obtener

muestras adecuadas en cantidad y calidad, o remite las muestras en contenedores
inapropiados, o con el agregado de medios de transporte o sustancias qumicas no
especficas para un estudio micolgico, o enva la muestra horas/das despus de su
obtencin; el resultado de ello ser la prdida de la muestra o un falso negativo.
B) INDICACIONES
Este examen se solicita habitualmente para el diagnstico de micosis superficiales tales

como: dermatofitosis, candidiasis, pitiriasis versicolor, dermatitis seborreica, entre otras.
Las dermatofitosis corresponden al parasitismo de la piel y sus anexos, causada por un

grupo de hongos queratinoflicos y queratinolticos denominados dermatofitos.
Placas de Petri estril.

hoja de bistur.
Tijeras corta uas.
Pinzas.
Porta objetos.
El tipo de muestra recogida depender de la micosis sospechada y de su localizacin

anatmica.
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LESIONES DE PIEL LAMPIA
Obtener escamas con bistur o portaobjetos, de los bordes activos de la lesin.

Mediante raspado colocar las escamas en placa de Petri estril.
CUERO CABELLUDO
Extraer con pinzas 10-12 cabellos afectados junto con escamas a travs de bistur o
portaobjetos.
Colocar las escamas y pelos en placa de Petri estril.
UAS
Recoger detritus depositados bajo las uas, eliminando las primeras camadas (Cortar las
uas con tijeras o extraer camadas con bistur).
Colocar detritus en placa de Petri estril.
SECRECIONES
Es la nica muestra en la que se permite utilizar medio de transporte Stuart (2 trulas).
No aplica
Se debe obtener muestra suficiente para realizar examen directo al fresco y para un
mnimo de 2 tubos de cultivo.
Transportar la muestra al laboratorio de inmediato en envase resistente y lavable.

El almacenamiento prolongado puede afectar a la viabilidad del hongo.
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Vigencia: 09/2020
I) OBSERVACIONES
Se deber tener en cuenta que la sensibilidad del estudio micolgico est directamente
relacionado con la cantidad de material obtenido por lo cual la muestra debe ser
abundante.
No debe tomarse la muestras si se Administr de antifngicos los das previos a la toma

de muestra, ya que pueden dar lugar a cultivos falsamente negativos.
7.16.2 LQUIDOS ORGNICOS
A) GENERALIDADES
Estas muestras, habitualmente estriles, son las ms valiosas en un laboratorio de

Micologa, no solo por su alta rentabilidad diagnostica, sino tambin por la dificultad de
obtencin o imposibilidad de repeticin, lo que obligara a extremar todas las medidas
para obtener el mayor rendimiento de las mismas.
B) INDICACIONES
Sospecha clnica de infeccin fngica invasiva.
C) MATERIAL NECESARIO
Se utilizar la misma muestra utilizada para estudio bacteriolgico.
Se realizar el mismo procedimiento para estudio bacteriolgico dependiendo del tipo y

localizacin de la muestra.
E) VOLUMEN DE LA TOMA DE MUESTRAS
Debe enviarse como mnimo 1 ml de muestra extra a lo solicitado para estudio

bacteriolgico, dependiendo del tipo de lquido orgnico a estudiar.
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Vigencia: 09/2020
Ser utilizado el tubo N2 tomado para estudio bacteriolgico

Conservar a temperatura ambiente por un tiempo mximo de 2 horas.
I) OBSERVACIONES
Tener siempre en cuenta que cuanto mayor sea el volumen extrado, mayor ser la
probabilidad de aislamiento de un patgeno fngico.
7.16.3 CANDIDIASIS SISTEMICA
A) GENERALIDADES
Para la recuperacin de levaduras de la sangre se recomienda el uso de los mismos

sistemas automatizados de monitorizacin continua utilizados para bacterias.
B) INDICACIONES
Se realiza estudio de candidiasis sistmica a pacientes sospechosos y de forma especial

a pacientes con nutricin parenteral que presenten:
Fiebre mayor de 38C sin foco infeccioso aparente que la explique.
C) MATERIALES A UTILIZAR EN LA TOMA DE MUESTRA
Los frascos habituales de hemocultivos.

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Vigencia: 09/2020
Tomar hemocultivos siguiendo las indicaciones estrictas para la realizacin de este

procedimiento (Ver tema 7.9.1).
Indicar en la solicitud estudio de Candidemia.
Se sugiere solicitar urocultivo, ya que los pacientes con Candidiasis sistmica

frecuentemente eliminan la levadura por la orina.
E) VOLUMEN DE LA TOMA DE MUESTRAS
Extraer la sangre e inocular los frascos de hemocultivo:

Adultos: 10 ml.
Nios: 1-5 ml (frasco peditrico).
Neonatos y bajo peso: 0,5-1,5 ml (frasco peditrico).
4 frascos en caso de adultos

1-2 frascos en caso de nios
Transportar los frascos de hemocultivos inoculados, a temperatura ambiente, en caja

metlica o plstica, evitando el volcamiento de los frascos, al laboratorio para la
incubacin a 35C.
Conservar a temperatura ambiente por un tiempo mximo de 2 horas.
I) OBSERVACIONES
Actualmente, el hemocultivo sigue siendo la mejor tcnica para el diagnstico de una

candidemia, a pesar de su escasa sensibilidad global ( 50%).
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Vigencia: 09/2020
7.17 CULTIVOS ANAEROBIOS
A) GENERALIDADES
Las bacterias anaerobias son microorganismos que no requieren oxgeno molecular

para vivir y multiplicarse, por lo que su cultivo in vitro requiere de medios de cultivo
especficos enriquecidos y de un sistema anaerbico de incubacin que contenga 85%
de N2 , 10% de H2 y 5% CO2 para desarrollarse.
Las bacterias anaerobias estn involucradas en una amplia variedad de enfermedades
humanas tanto de origen endgeno (bacteriemias, abscesos cerebrales, peritonitis,
sinusitis etc.) Como exgeno (intoxicaciones alimentarias, botulismo, ttano, gangrena
gaseosa, etc.)
B) INDICACIONES
Son muestras vlidas cualquier fluido o tejido procedente de localizaciones

habitualmente estriles. En general, no son vlidas las tomas superficiales.
C) MATERIALES A UTILIZAR EN LA TOMA DE MUESTRA
Material de cura estril.

Material quirrgico estril.
Clorhexidina al 2%.
Anestsico local.
Medio de transporte para anaerobio (Portagerm).
Frascos estriles de urocultivos.
Jeringuillas y agujas.
Sondas pequeas.
La aspiracin es el mejor mtodo por su sencillez y facilidad; se emplea para obtener

fluidos (abscesos cerrados, empiemas, lquidos orgnicos y cavidades cerradas como
senos, odo medio, etc.) y a veces tejidos.
La aspiracin percutnea requiere una desinfeccin previa como la descrita en la toma
de hemocultivos. Habitualmente se realiza con jeringuilla y aguja. A veces es necesario
inyectar 1 o 2 ml de suero fisiolgico estril y reaspirar. Las muestras deben ser
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Vigencia: 09/2020
recolectadas del sitio activo de la lesin, tomndose con precaucin para excluir
contaminantes de la superficie y aireacin.
En la aspiracin de fstulas o abscesos profundos abiertos se emplea un catter

conectado a la jeringuilla.
Otros fluidos (bilis, lquido peritoneal, etc.), se puede obtener en el curso de un acto
quirrgico, pero hay que evitar la contaminacin por la flora de localizaciones prximas.
La muestra obtenida se inocular en un frasco Portagerm (Figura 23). No se recomienda

la toma de muestra mediante trulas.
Las biopsias y muestras tisulares: Son muy adecuadas para el aislamiento de

bacterias anaerobias.
El tejido obtenido se depositar en un frasco estril de urocultivo (Ver tema 7.15.4).
Mtodos especiales son aspiracin por puncin transtraqueal, o lavado

broncoalveolar protegido mediante broncoscopio con catter telescpico en muestras
respiratorias o sistemas protegidos para la aspiracin intrauterina.
En los abscesos pulmonares o intraabdominales, se dirigir mediante ultrasonidos o

escaner.
Muestras lquidas: enviar un volumen de 1 a 5 ml.
Tejidos: Si es posible mayor de 1 cm.
Con una muestra tomada adecuadamente es suficiente.
Las muestras deben ser enviadas bajo condiciones anaerbicas, inmediatamente

despus de recolectadas.
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Vigencia: 09/2020
Muestras lquidas
Utilizando el medio de transporte con que cuenta el laboratorio (Portagerm), en envase
resistente y lavable, a temperatura ambiente.
Tejidos y biopsias
Se enviarn en frasco tapa rosca estril (urocultivo).
Las muestras se deben enviar al laboratorio de forma crtica lo antes posible.

En cualquier caso los tejidos no deben ponerse en contacto con formol o cualquier
sustancia.
I) OBSERVACIONES
Las muestras lquidas y/o tejidos abscedados deben ser recolectados por aspiracin y no
mediante trulas porque estos determinan excesiva exposicin de la muestra a los
efectos deletreos del oxgeno y sequedad.
Las muestras no deben ser refrigeradas, porque las bajas temperaturas son perjudiciales
para los anaerobios, debido a que la absorcin de oxgeno es mayor a temperaturas
bajas.
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7.18 TOMA DE MUESTRA DE ASPIRADO NASOFARINGEO.
A) GENERALIDADES
El xito del diagnstico virolgico de los virus respiratorios depende principalmente de la

calidad de la toma de muestra, del almacenamiento y de las condiciones de su
transporte. La muestra ptima y de mayor rendimiento es la muestra obtenida por
aspirado nasofarngeo y como segunda opcin es la muestra obtenida por trula
nasofarngea. Como los virus requieren de clulas epiteliales vivas para replicarse y la
estructura viral generalmente es lbil a las condiciones ambientales como el calor, la
cantidad de virus declinar despus de ser tomada la muestra, por lo que es importante
mantener las muestras siempre en fro y es de suma importancia que transcurra el menor
tiempo posible entre la toma de la muestra y su procesamiento en el laboratorio para
realizar la tcnica de Inmunofluorescencia (IF).
B) INDICACIONES
Estudio de virus respiratorio y bordetella pertussis.

Diagnstico IRA baja grave.
C) MATERIALES (Figura 23)
Kit de aspiracin traqueal.

Sonda de aspiracin N6 o N8.
Gradillas para tubos.
Bao de hielo.
Bomba de vaco. (Red de Vaco).
Recipiente con solucin desinfectante.
Solucin Buffer fosfato pH 7.2, ste en tubos con 3-5ml cada uno.
Solicitar este material al Laboratorio, con orden de peticin de examen correspondiente

(kits aspiracin, bao de hielo con buffer fosfato pH 7.2).
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Vigencia: 09/2020
Fig. 23
Un profesional experimentado del rea de la salud es responsable de tomar la muestra,

la que debe ser obtenida precozmente. Tomar muestra dentro de los primeros cinco das
de inicio de los sntomas, el paciente debe estar en condiciones de ayuno estricto.
La solicitud de estudio microbiolgico debe estar correctamente cumplimentada

indicando:
Nombre y apellidos.
Edad.
Vacunas.
Diagnstico.
Tiempo de evolucin de la enfermedad.
PASOS PARA LA RECOLECCION DE LA MUESTRA.

Lavado de manos.
Tcnica asptica.
Uso de guantes y mascarillas.
Romper el sobre que contiene el Kits de Aspiracin y conectar al final del
tubo con dimetro menor a una sonda de aspiracin N6 o N8 estril.
Conectar el otro extremo de dimetro mayor a la bomba de vaco.
Insertar la sonda de aspiracin por la fosa nasal del paciente, hasta
faringe.
Aspirar la secrecin retirando y girando la sonda suavemente, repetir el
procedimiento en la otra fosa nasal.
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Vigencia: 09/2020
Lavar el interior de la sonda aspirando un volumen aproximado de 3-5 ml

de solucin tampn pH 7,2 fro a travs del tubo colector para arrastrar
toda la secrecin.
Cambiar la tapa del tubo colector, anotar los datos del paciente con lpiz
grafito o una etiqueta pegada al tubo.
Enviar al laboratorio inmediatamente con la orden de peticin de examen.
La muestra debe estar todo el tiempo, hasta su llegada al laboratorio, en
bao de hielo.
Volumen aproximado de 3-5 ml
Con un tubo colector es suficiente
Transportar la muestra al laboratorio de inmediato, en envase resistente y lavable.
Se debe mantener en fro (4-8C), en medio de transporte; no se debe congelar.
I) OBSERVACIONES
Tomar las precauciones necesarias para evitar la formacin de aerosoles y

descontaminar el material antes de lavarlo. Los kits de succin, sondas y conexiones,
sern lavados y esterilizados por gas en el servicio de esterilizacin del Hospital La
Serena para ser reutilizados.
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8. Formato de registros
8.1 Formulario solicitud de examenes para estudio microbiologico.

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9. Anexos
9.1 MEDIOS DE TRANSPORTE

Son medios especiales utilizados para preservar la viabilidad de las bacterias presentes
en las muestras clnicas.
En este laboratorio se utilizan tres medios de transporte: Cary Blair , Stuart y Portagerm.
9.1.1 MEDIO DE TRANSPORTE CARY BLAIR
El medio de transporte Cary Blair (Figura 23), fue ideado para la coleccin y transporte
de muestras clnicas, especialmente para muestras fecales.
Fig. 24
9.1.2 PORTAGERM
Este medio se emplea para el transporte de muestras lquidas al laboratorio cualquiera

que sea el origen y a los cuales se les solicite estudio de anaerobios (el medio permite el
crecimiento de grmenes aerobios y anaerobios)
Es un medio reductor, slido, tamponado .El agar contenido en el medio impide la

difusin del oxgeno aportado por la muestra. Los agentes reductores se combinan con
el oxgeno libre para mantener la anaerobiosis.
El indicador de xido- reduccin permite visualizar la presencia o ausencia de oxgeno:
color azul lavanda: presencia O2; sin color: ausencia de oxgeno.
Se debe introducir la muestra lquida en el frasco, desinfectando el tapn y sin abrirlo,

perforando el tapn con la aguja de la jeringa.
Fig. 25
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APL 1.2
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9.1.3 MEDIO DE TRANSPORTE STUART
Este medio preserva ampliamente la composicin de la flora microbiana original,

presente en la muestra (Fig. 26).
Fig. 26
MODO DE ACCION
La falta de una fuente de nitrgeno previene ampliamente la proliferacin microbiana. La

composicin del medio de cultivo asegura que los microorganismos presentes sean
capaces de sobrevivir lo suficiente por un perodo de tiempo.

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SISTEMA DE GESTION DE LA CALIDAD

Proporcionar la informacin necesaria al profesional que se enfrenta a la toma de

Aplica a la totalidad de las muestras que se solicitan para exmenes microbiolgicos al

3.1 Muestras de sangre

3.2 Muestras del tracto urinario

3.3 Muestras del tracto gastrointestinal

3.4 Muestras de lquidos biolgicos

3.5 Muestras del tracto respiratorio

Muestras del tracto respiratorio inferior

3.6 Muestras del tracto genital

3.7 Muestras de piel y tejidos blandos

3.8 Muestras para estudio micolgicos

3.9 Cultivos anaerobios

Mdico tratante, Enfermera, Matrona; Dentista, Otros profesionales de la Salud:

Tcnicos Paramdicos, Auxiliares de Servicio de los Servicios Clnicos: Transporte

Tcnicos Paramdicos del Laboratorio: Recepcin de la Muestra.

Tcnicos Paramdicos de la seccin de Microbiologa: Siembra de cultivos.

Tecnlogos Mdicos de la seccin de Microbiologa: identificacin y anlisis

Tecnlogo Mdico Encargado de la Seccin de Microbiologa y Jefe del

Manual del estndar general de acreditacin para prestadores institucionales de

Carmen Guerrero Gmez Carlos Snchez Carrillo Sociedad espaola de

Inmaculada Garca Garca ; Fernando Garca Garrote; Jos Elas Garca

Almudena Burillo Antonio Moreno Carlos Salas Sociedad espaola de

Weissfeld, A. Laboratory Diagnosis of Urinary Tract Infections. Cumulative

Comit de Microbiologa Clnica. Sociedad Chilena de Infectologa.

Garcia L. Clinical Microbiology Procedures Handbook. ASM Press. Washington

Montiel F., Lam M. (2001) Seleccin, recoleccin y transporte de muestras para

7. Descripcin del procedimiento

Debido a la gran variedad de agentes potencialmente infecciosos, y la alta probabilidad

Es importante entonces el correcto procesamiento de la muestra, que es responsabilidad

7.1 SOLICITUD DE EXAMENES

Nombres y apellidos del paciente.

7.2 PREPARACIN DEL PACIENTE

7.3 RECOLECCIN DE MUESTRAS MICROBIOLGICAS

Lo ms importante es la correcta recoleccin de una muestra, a pesar de que algunos

Se debe realizar en un ambiente confortable y limpio, en condiciones de mxima

Seleccionar el sitio anatmico exacto de la lesin para tomar la muestra, evitando

Aplicar la tcnica y material apropiados para la obtencin de la muestra.

Identificar correctamente la muestra y anotar cualquier informacin que sea

Poner la muestra recolectada en un envase que favorezca la viabilidad de los

Enviar la muestra en forma rpida y expedita al laboratorio, y en el caso que esto

Es de vital importancia que, antes de realizar cualquier tipo de procedimiento,

Toda la informacin diagnstica que el laboratorio de microbiologa puede proporcionar,

7.4 ROTULACIN DE LAS MUESTRAS

La rotulacin de la muestra se realiza en el Servicio o Unidad clnica de procedencia y

Se diferenciaran 2 formas de rotular las muestras

7.4.1 Rotulo digital (Con cdigo de barra):

Generado por el sistema informtico OMEGA (LIS)

7.4.2 Rotulacin de forma manual:

El no cumplimiento de estas exigencias ser motivo de rechazo de las muestras.

7.5 CONSERVACIN DE LAS MUESTRAS

Conserve a temperatura ambiente, por un tiempo no mayor a 2 horas en un lugar fresco

Conserve en refrigeracin con unidades refrigerantes (4C), por un tiempo no mayor a 2

Transporte inmediatamente al laboratorio (tiempo mximo 30 minutos):

7.6 TRASLADO DE LAS MUESTRAS

El personal que transporta las muestras debe utilizar guantes y pechera.

Encargado de recepcin tiene la responsabilidad de:

7.8 CRITERIOS DE RECHAZO DE SOLICITUDES Y/O MUESTRAS

Los criterios de rechazo de muestras para estudio microbiolgico son fundamentales

Rechazo definitivo Rechazo temporal

- Contenedor sin rtulo (MR8)

En el caso de un rechazo, el funcionario del Laboratorio avisa al servicio

Si al realizar un rechazo temporal este no es resuelto dentro de las 2 hrs de

Se registra en la solicitud del examen la causa del rechazo, hora de aviso y