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Prctica No.

2 Anlisis de cidos nucleicos


Equipo No. 1. 7 B
Medina-Prez BR, Mendoza-Guzmn J, Meza-Hernndez AG, Mota-Rodrguez DL.
Viernes 10:00-13:00. 29 de Septiembre de 2017, 06 de Octubre de 2017 y 13 de Octubre de 2017.
Agosto- Diciembre 2017.
Laboratorio de gentica, Unidad Acadmica de Ciencias Qumicas, Universidad Autnoma de Zacatecas.

Resumen: Los cidos nucleicos (AN) son las biomolculas portadoras de la informacin gentica, su subunidad
estructural es el nucletido (pentosa, base nitrogenada y fosfato). Existen dos tipos de cidos nucleicos que son,
ADN y ARN. Para su estudio, los AN deben aislarse del resto de los componentes celulares. Los mtodos
extraccin de cidos nucleicos depende de la muestra y tipo de AN. Mediante la electroforesis podemos separar
fragmentos de DNA y RNA en funcin de su tamao, visualizarlos mediante una tcnica sencilla de tincin, y de
esta manera determinar el contenido de cidos nucleicos de una muestra, teniendo una estimacin de su
concentracin y grado de pureza. Se realiz la extraccin de DNA y RNA de sangre perifrica por los mtodos
DNazol y Trizol respectivamente, se realiz una corrida electrofortica en gel de agarosa en donde solo se
obtuvo una banda correspondiente a DNA.
Palabras clave: Electroforesis, DNA, RNA, extraccin, gel de agarosa.
Introduccin
Los cidos Nucleicos son las biomolculas Para su estudio, los cidos nucleicos deben
portadoras de la informacin gentica. Son aislarse del resto de los componentes celulares,
biopolmeros, de elevado peso molecular, como lpidos y protenas, ms abundantes que los
formados por otras subunidades estructurales o cidos nucleicos. Asimismo, dependiendo del
monmeros, denominados nucletidos. Cada objeto de estudio debe aislarse de preferencia el
nucletido es una molcula compuesta por la ADN o ARN; as, para estudios de niveles de
unin de tres unidades: un monosacrido (una expresin gnica se extraer ARN, mientras que,
pentosa), una base nitrogenada (purnica para la bsqueda de modificaciones o
adenina, guanina o pirimidnica citosina, alteraciones gnicas, ADN (Brown, 2007).
timina o uracilo ) y uno o varios grupos fosfato
Todos los mtodos extraccin de cidos
(Watson et al, 2006).
nucleicos pueden dividirse en una serie de pasos
Atendiendo a su estructura y composicin existen generales, de tal forma que la necesidad de cada
dos tipos de cidos nucleicos que son, cido paso depende de la muestra y tipo de AN (Faraga
desoxirribonucleico (ADN) y cido ribonucleico et al, 2004):
(ARN), que se diferencian por el azcar (Pentosa)
Liberacin de los cidos nucleicos de las
que llevan: desoxirribosa y ribosa,
bacterias, hongos, muestras biolgicas
respectivamente. Adems, se diferencian por las
(sangre).
bases nitrogenadas que contienen, adenina,
guanina, citosina y timina, en el ADN; y Adenina, Proteccin y estabilizacin de los cidos
guanina, citosina y uracilo en el ARN. El ADN es nucleicos frente a la degradacin. El RNA es
una cadena doble y en el ARN es una cadena mucho ms difcil de estabilizar que el DNA.
sencilla (Lodish et al, 2005). Eliminacin de inhibidores de la separacin.
Para algunas muestras (esputo, sangre)
pueden ser necesarios ms pasos que para separar fragmentos de ADN y ARN en funcin
otras de su tamao, visualizarlos mediante un a tcnica
Concentracin de la muestra y la diana en un sencilla de tincin, y de esta manera determinar
pequeo volumen. el contenido de cidos nucleicos de una muestra,
Colocacin de la diana en un medio acuoso teniendo una estimacin de su concentracin y
compatible con el mtodo de separacin grado de pureza (Lodish et al, 2005).

La extraccin nos permite analizar los cidos En esta prctica se realiz la extraccin de ADN
nucleicos por diferentes tcnicas como lo son: y ARN de sangre perifrica por el mtodo de
Southern blot o Norrthen blot, reaccin en DNazol y Trizol respectivamente para su
cadena de la polimerasa (PCR), electroforesis y posterior anlisis por electroforesis en gel de
construccin de bibliotecas genmicas (Brown, agarosa. En la electroforesis solo se evidenci la
2007). presencia de RNA y en el pocillo del DNA la
banda no estaba presente.
La electroforesis en gel de agarosa es una de las
metodologas ms utilizadas en el laboratorio en
todo lo relacionado con el trabajo de cidos
nucleicos. Mediante la electroforesis podemos

Materiales y mtodos
-Extraccin de DNA
-Extraccin de RNA
-Electroforesis de cidos nucleicos
Resultados

Figura 1. Extraccin de DNA por el mtodo de DNazol. DNA, leucocitos de sangre perifrica ( ,hebras de DNA )

Figura 2. Extraccin de RNA por el mtodo Trizol. RNA, leucocitos de sangre perifrica ( , hebras de RNA)
Tabla 1. Aplicacin de las muestras y resultados de electroforesis. MP (marcador de peso molecular), BC (buffer de carga). Resultados; +++, bandas
definidas de cidos nucleicos en la electroforesis; ++, bandas parcialmente definidas o borrosas de cidos nucleicos en la electroforesis; +, presencia
de bandas muy dbiles en la electroforesis; -, no hay presencia de bandas en la electroforesis.

No. de pozo 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
No. De equipo - 1 2 3 4 4 1 2 3 4
Muestra MP DNA RNA
Descripcin Hind III 10L de muestra + 3L de BC para DNA 10L de muestra + 3L de BC para RNA
Volumen 3L 10L 10L
Resultado +++ - ++ ++ - + + + + +

Figura 3. Electroforesis en gel de agarosa al 1% de RNA y DNA. Pozo 1, marcador de peso molecular . Pozos 2 y 5 no hay presencia de bandas,
pozos 3 y 4 bandas borrosas, pozos 6,7,8,9,10 bandas dbiles o casi nulas. Pozos 3 y 4, numero de pares de bases 23130, corresponde a DNA, pozos
del 6-10, no corresponden a ningn nmero de pares de bases del MP.

Discusin biomolcula de inters de manera adecuada si


se usan los reactivos correctos. El DNA es una
Los resultados obtenidos en la prctica no
molcula polar, pero la reaccin con el etanol
fueron satisfactorios ni coincidieron con lo
a muy baja temperatura hace que se vuelva
reportado en la bibliografa. En la extraccin
apolar e insoluble en el etanol, formndose un
de DNA de leucocitos de sangre perifrica
precipitado justo entre la capa con etanol
(Fig. 1) se observaron las hebras de DNA
lquido y la capa con el extracto. El DNA es
como filamentos blancos a travs de la
el nico componente de la solucin que no es
precipitacin con alcohol absoluto, esto
soluble en el etanol, y se hace visible porque
debido a que la molcula de DNA es ms
las diferentes cadenas se van aglutinando
grande y es bicatenaria. En cambio, en la
entre s al precipitar debido a la accin de
extraccin de RNA de leucocitos de sangre
fuerzas fsicas. Para la extraccin de RNA se
perifrica (Fig. 2), las hebras de RNA fueron
utiliza isopropanol debido a que es ARN es
casi imperceptibles al realizar la precipitacin
insoluble en el mismo permitiendo su
con isopropanol, esto porque el RNA es una
precipitacin.
molcula ms pequea y de cadena sencilla.
Los resultados de la electroforesis (Tabla 1 y
La precipitacin de los cidos nucleicos es
Fig. 3) para el equipo corresponden los
muy importante porque nos permite obtener la
pozos 2 y 7 de la electroforesis. En el pozo 1
se coloc la muestra de DNA y en el pozo 7 Es importante realizar de manera adecuada la
la muestra de RNA. No se obtuvo DNA de extraccin de AN porque es un procedimiento
acuerdo a lo obtenido en la electroforesis imprescindible de la biologa molecular. Una
(Tabla 1 y Fig. 3), estos resultados no vez que se extrae el AN, este tiene numerosos
coinciden con lo que se visualiz en la usos: en ingeniera gentica en animales, en la
extraccin de DNA (Fig. 1), que fueron creacin de medicamentos que pueden
filamentos blancos que corresponden a hebras utilizarse en humanos, es utilizada para el
de DNA, aunque la molcula de DNA es diagnstico mdico, identificacon de
estable debido a su estructura (bicatenaria) criminales e identificacon histrica.
esto no la exime de la degradacin por
factores qumicos o fsicos , debido a que la
electroforesis se realiz una semana despus Conclusin
de la extraccin y a que la muestra se
manipul en considerables ocasiones, esta se Con base en los objetivos establecidos para
pudo degradar y, por lo tanto, en la esta prctica, se realiz un anlisis
electroforesis no se obtuvo un banda y no se electrofortico de las muestras de DNA y
evidenci la presencia de DNA. En cuanto al RNA extradas de leucocitos con el mtodo
ARN, en la electroforesis aparece una banda DNazol y Trizol, respectivamente, para
muy dbil (Tabla 1 y Fig. 3), estos resultados evaluar su cantidad y calidad. En este caso, la
coinciden en cierta manera con la observacin cantidad y calidad de las muestras de DNA y
de la extraccin de ARN (Fig. 2), que fueron RNA fueron muy bajas debido a que las
unas hebras muy delgadas, casi tcnicas de extraccin de cidos nucleicos
imperceptibles que corresponden a hebras de (DNA y RNA) no se realizaron de manera
ARN. Este resultado puede ser consecuencia correcta.
de la inestabilidad de ARN por su cadena Referencias
sencilla y a que no se utilizaron en su totalidad
materiales libres de RNasas durante la Brown TA. (2007). Genomas. 3 ed. Editorial
extraccin del cido nucleico. Por lo tanto, el Mdica Panamericana. Mxico, pp34.
RNA se degrad y solo se observa una banda Faraga J et al. Comparacin entre cinco
muy dbil en la electroforesis. mtodos para la extraccin de ADN. Rev
Todos los equipos obtuvimos los mismos cubana Med Trop. 2004; 56(3): 208-220.
resultados en cuanto a la electroforesis de Lodish et al. (2005). Biologa celular y
RNA, presencia de bandas dbiles, lo que molecular. 5 ed. Editorial Mdica
indica que la tcnica no se realiz de manera Panamericana. Mxico, pp 87, 88 y 410.
adecuada y por lo tanto el RNA se degrad.
Para DNA, solo dos equipos, 3 y 4, Watson JD et al. (2008). Biologa molecular
obtuvieron bandas marcadas de DNA y del gen. 5 ed. Editorial Mdica
corresponden con el nmero de pares de bases Panamericana. Mxico, pp 35, 74, 109-111,
que debe tener el DNA (20-23 Kpb), lo que 137 y 141.
indica que la extraccin y electroforesis de
DNA se realiz de manera adecuada. Nuestro
equipo y el equipo 5 no obtuvimos bandas en
la electroforesis en los pozos
correspondientes a DNA, esto nos demuestra
que tanto la extraccin y la electroforesis no
se realizaron de manera adecuada.

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