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A Primer Parcial
Se unen por medio del enlace covalente (uniones fosfodiester) entre el 5 fosfato de un nucletido y con el tomo de carbono 3 del
nucletido
8. Girasa: Es una enzima tipo DNA topoisomerasa II de E. coli que participa en la replicacin del DNA para reducir la tensin molecular
producto del sobreenrrollamiento, mediante cortes y resellamiento de la molcula dplex.
FUNCION: Se mueve por delante de la horquilla de replicacin, corta y vuelve a unir el DNA de doble hlice para liberar el torque que
se produce por el desenrollamiento en la orquilla de replicacin
9. Helicasa: Enzima codificada por gen rep y cataliza el desenrrollamiento del DNA duplex durante la replicacin del DNA de E. coli.
10. ADN polimerasa: Enzima que cataliza la sntesis de DNA. Requiere de DNA templado molde, de DNA iniciador y de los 4 dNTP
(dATP, dGTP, dCTP, dTTP), acta como el encargado principal de la replicacin y elonga el ADN.
11. Primasa: Enzima que en la forma de primosoma cataliza la sntesis de un "primer" u oligonucletido iniciador de la sntesis de DNA
Sintetiza extensiones cortas de nucletidos o cebadores (10 a 12) , para permitir el inicio de la replicacin
12. Ligasa: Es una enzima que une covalentemente extremos 3' con extremos 5' de cadenas polinucleotdicas.Participa en replicacin y
reparacin de DNA.
Une fragmentos de Okazaki por medio del sellado de las brechas en la estructura de azcar-fosfato del ADN recin sintetizado
13. Factor transcripcional general: Son protenas especficas que requieren cada una de las RNA polimerasas eucariontes para el inicio de
la transcripcin. Cada polimerasa utiliuza un conjunto especfico de TFs.
14. Espliceosoma: Complejo RNA protena que elimina intrones de los RNA eucariontes
16.- Polimerasa Poli A: Secuencia de 50-250 nucletidos de adenina que se agregan como una modificacin post transcripcional al
extremo 3' de RNAm eucariontes mediante la enzima poli A polimerasa. La reaccin se conoce como poliadenilacin.
17.- Factores de Elongacin: (EF en procariontes; eEF en eucariontes+) : Son protenas que se asocian cclicamente con los ribosomas
durante la adicin de cada aminocido a la cadena polipeptdica en el proceso de traduccin.
18.- Duplicacin gentica: Procesos que ocurren en varios organismos, mediante los cuales surge un nuevo gen; por ejemplo, la
duplicacin de un gen individual. En la duplicacin gentica contigua, la secuencia duplicada coexiste dentro de los lmites establecidos
por las seales de inicio y detencin para sntesis de protenas del original, lo cual origina un producto de transcripcin y una protena
ms grandes a expensas de la protena existente.
20.- Definiciones:
ADN glicosilasa: Protena de diferentes tipos que reconocen bases daadas para las cuales son afines e hidrolizan el enlace que las une a
las desoxiribosas. Implicada en la reparacin por escisin de bases.
Polimerasa delta: Las ADN polimerasas delta y dirigen la replicacin de la cadena conductora o leading strand que es la cadena que
crece de 5' a 3' en mismo sentido que crece la nueva copia de ADN.
Primosomas: estructura formada por un mRNA con varios ribosomas unidos, cada ribosoma se une simultneamente al sitio de unin de
los ribosomas en el extremo 5`del mRNA y se mueve hacia el extremo 3`.
Exonucleasa: enzimas que funcionan escindiendo nucletidos uno a uno a partir del extremo terminal de una cadena polinucleotdica.
Estas enzimas catalizan una reaccin de hidrlisis que rompe los enlaces fosfodiester ya sea en el extremo 3' o 5'.
Exonucleasa `5`- 3`: cuya funcin es eliminar el RNA iniciador en la sntesis de la cadena discontinua y tambin interviene en
reparacin de DNA.
ARN polimerasa: Enzima encargada de la transcripcin. Cataliza la sntesis de RNA utilizando como molde templado una hebra de
DNA.
TFIID: Factor de Transcripcin TFIID: Principal componente de unin al ADN de secuencia especfica involucrado en la activacin de
transcripcin de ARN POLIMERASA II.
Anticodon: Es el triplete de nucletidos del tRNA que tiene una secuencia complementaria al codn del mRNA. La interaccin anti
codn con codn es antiparelelas y fundamental en el proceso de traduccin que ocurre asociado a los ribosomas.
TFIIH: El factor TFIIH est involucrado en tres de las principales funciones que ocurren en la clula eucariote: transcripcin, reparacin
del DNA y el control del ciclo celular. Mutaciones en algunas de las subunidades del factor de reparacin/transcripcin TFIIH estn
involucradas en varias enfermedades en humanos. El factor TFIIH interacciona con una gran variedad de factores involucrados en
diferentes procesos de transcripcin, con factores remodeladores de la cromatina y con RNA. Adems de su papel central en la
transcripcin por la RNA polimerasa II, tambin participa en la transcripcin mediada por la RNA polimerasa I. El uso de Drosophila
melanogaster como modelo para estudiar las diferentes funciones de TFIIH ha servido para determinar qu fenotipos son debidos a
defectos en transcripcin y cules a problemas en la reparacin del DNA, as como entender cmo est regulado este factor durante el
desarrollo.
LINE: Repeticiones dispersas ms largas, que consisten en varios miles de pares de base.
Factor sigma: Factor de la enzima RNA polimerasa procarionte que al unirse a la apoenzima forma la holoenzima enzima completa
que es la que reconoce al promotor.
RNA Polimerasa: Enzima encargada de la transcripcin. Cataliza la sntesis de RNA utilizando como molde templado una hebra de
DNA.
Caja de pribnow: Secuencia de 6 pares de bases en extremo 5' del sitio de inicio de la transcripcin de genes en procariontes, el cual es
reconocido por la subunidad digma de la RNA polimerasa. La secuencia consenso de esta caja es TATAAT. Tambin conocido como
caja TATA.
Caja TATA: (Elemento TATA); caja Pribnow para procariontes
Proteina argonauta: Las protenas de la familia Argonauta se asocian al smallRNA (ARN pequeo) y forman complejos ARN-protena
llamados RISC (RNA-Induced Silencing Complexes: complejos de silenciamiento inducidos por ARN). Los complejos RISC usan los
smallRNAs como gua para silenciar de forma especfica los ARN mensajeros que contienen una secuencia complementaria a la del ARN gua.
Los complejos RISC inducen la degradacin de los mensajeros o reprimen su traduccin
Transcripcin primaria: son los productos inmediatos de la transcripcin en las clulas eucariota, son modificados de forma extensa
antes de salir del ncleo para ser traducidos a protenas.
ARN Empalmosoma: El empalmosoma est compuesto por cinco pequeas molculas de ARN nuclear (U1, U2, U4, U5, U6) que,
trabajando junto a protenas, contribuyen a plegar de forma adecuada fragmentos de ARN y luego empalmarlos en el mensaje.
21.- Para que se da el splicing: Mecanismo de corte y reunin de un biopolmero lineal. Eliminacin de intrones del transcrito primario
y unin de exones.
22.- Ribonucleoproteinas: Protenas unidas a trnscritos de ARN nacientes en forma de Partculas de Ribonucleoprotenas. Se hallan
implicadas en una variedad de procesos tales como empaquetamiento del ARN y TRANSPORTE del ARN dentro del ncleo.
23.- Esquema del ARN: El ARN mensajero es el ARN de cadena simple que se forma durante el proceso de transcripcin del ADN al
ARN. Para que se forme la ARN polimerasa debe unirse al ADN ayudada de cofactores de transcripcin. El proceso de transcripcin se
lleva a cabo en el ncleo en eucariotas y en el citoplasma en procariotas.
24.- Hipotesis del bamboleo: Hiptesis propuesta por Francis Crick para explicar como un mismo tRNA puede reconocer de manera
especfica a diferentes codones. De esta manera los 61 tripletes con sentido pueden ser traducidos con un mnimo de 32 tRNAs diferentes.
El balanceo se refiere a un reconocimiento imperfecto que ocurre entre la tercera base del codn con la tercera base del anticodn (en el
sentido de la lectura del mRNA) y ocurre de acuerdo a ciertas reglas especficas.
37. Elgrupo carboxilo del aminocido se pega al extremo 3 de todos los RNAt en laadenina
38. Los mecanismos NMD sirve para: identificarmutaciones y controlar que no seexpresen..
Las protenas DICER, son nucleasas que degradan ARN de doble cadena, formando pequeos fragmentos.
En primer paso de la ruta BER en E. coli implica que una enzima DNA glucosllasa, que
son especficas para los distintos tipos de daos del DNA, reconozca la base qumicamente
alterada (Figura 15.16). Por ejemplo, la uracilo-DNA glicosilasa reconoce la presencia de
uracilo en el DNA. un miembro concreto de un grupo de enzimas denominadas reconoce la
presencia de uracilo en el DNA. Primero, la enzima corta el enlace glucosllico que hay
entre la base y el azcar creando un sitio apirimidfnico (AP). Una enzima denominada
endonucleasa (AP) reconoce el azcar que no tiene su correspondiente base.
La endonucleasa hace un corte en esqueleto fosfodister en el sitio AP. Esto crea una
deformacin en el DNA que es reconocida por el sistema de reparacin por escisin, que se
activa para corregir el error.
59. Ribozima.
La ribozima corta un enlace fosfodister de este sustratocuando est formado por ribonucletidos (es un RNA)
62. LINES son ELEMENTOS NUCLEARES DISPERSOS LARGOS moderadamente REPETIDO (SECUENCIA DE 6
KILOBASES REPETIDAS) sin funcin CODIFICANTE
REPARACIN DIRECTA
Por estos mecanismos se reparan: metilacin de guanina, y en algunos vertebrados dmeros de pirimidina. No intervienen nucleasas ni
ADN-polimerasas.
REPARACIN INDIRECTA
Hay intervencin de nucleasas y ADN-polimerasas. Se necesita hebra molde perteneciente al mismo cromosoma o al homlogo.
* Escisin de base. Reparan casos de alteraciones puntuales en bases nitrogenadas. Se origina un sitio AP y luego se retira el nucletido
AP y se resintetiza la hebra.
* Escisin de nucletido. Reparan alteraciones que distorsionan la conformacin del dplex y que obstaculizaran la transcripcin y
replicacin. Generalmente inducidos por bases alteradas o mal apareadas. Una nucleasa escinde una porcin de la hebra prxima al lugar
del dao. Inmediatamente se resintetiza una nueva siguiendo el molde complementario.
* Recombinacin de regiones homlogas/ Unin de fragmentos terminales de hebras rotas. Reparan lesiones en las que se ven afectadas
ambas hebras, o en las que no existe una hebra complementaria que pueda actuar de molde fiable. Mecanismo ms complejo que los
anteriores.
Ejemplo
Escisin de nucletidos
65. En un opern y en presencia de la sustancia especfica: el opern se encuentra bajo control del promotor por la sustancia
tryptfano, no se transcriben los genes estructurales
66. Componentes de un opern bacteriano
Se replican dando lugar a dos clulas hijas que son asimtricas. Cada una de ellas consta de un centrosoma que tiene caractersticas
diferentes. Un centrosoma permanece inactivo o quieto en una zona de la clula, mientras que el otro se encuentra activo y se mueve
continuamente a lo largo de toda la geografa celular.
Ncleo generativo + ncleo polares de clula central de saco embrionario = cigoto triploide.
Pueden ser:
* Estables: Organizacin de clulas en tejidos, mantenimiento y funcin de lminas de clulas epiteliales, adhesin y comunicacin
celular.
100. la clula hija es el resultado de la divisin del ncleo y citoplasma (citocinesis) que da lugar a la reproduccin de las clulas
mediante el ciclo celular.
101. la clula hija es el resultado de la divisin del ncleo y citoplasma (citocinesis) que da lugar a la reproduccin de las clulas
mediante el ciclo celular.
RAIZ
HIPOCOTILO
HOJAS PRIMARIAS