1. En 1948, cuando se creía que el material genético de los seres vivos
eran las proteínas, de cuya estructura se sabía muy poco, la genialidad clarividente de un hombre, Linus Pauling, le llevó a escribir “I think that enzymes are molecules that are complementary in structure to the activated complexes of the reactions that they catalyze”. Explica, en términos termodinámicos (energía libre), las implicaciones que ello tiene en la catálisis. Consideremos la reacción de unión al centro activo de la enzima, bien del sustrado en su estado activado: E + S ǂ ↔ ESǂ, cuya variación de energía libre de Gibbs venimos denotando como Gb, o bien del sustrato en su estado basal: E + S ↔ ES, Gs. Por otro lado, hemos visto en clase que la variación de energía libre de activación para la reacción catalizada (Gǂc ) y no catalizada (Gǂnc) se comparan de la siguiente forma: Gǂc = Gǂnc + Gb - GS. De esta última ecuación, se desprende que cuanto más estable sea la unión del sustrato activado al centro activo de la enzima (más negativo Gb) mayor será el efecto catalítico de la enzima (mayor la diferencia Gǂnc - Gǂc). Por tanto, el genial Pauling estaba en lo cierto.
2. Si la velocidad de una reacción catalizada es 1014 veces más rápida
que esa misma reacción sin catalizar ¿cuál es la diferencia entre las respectivas energías libres de activación?
3. Consideremos dos reacciones catalizadas cuyas energías de
activación son 50 y 100 kJ/mol, respectivamente. Explica razonadamente cuál de ellas será más sensible a un cambio de temperatura. (Indicación: trata de formalizar el concepto de sensibilidad). Siguiendo la indicación definiremos sensibilidad como las veces que aumenta la velocidad de reacción al aumentar la temperatura en 10º (aquí, evidentemente podíamos haber tomado cualquier otro incremento arbitrario de T). Así, pues, teniendo en cuenta esta definición y la ecuación de Arrhenius, tendremos: k(T2)/k(T1) = exp(10Ea/RT1T2), donde obviamente T2=T1+10. Si esbozamos el grafo de esta función exponencial tendremos 6
k(308K)/k(298K) 4
1 20 40 60 80 100 120 140
Ea (kJ/mol)
Observamos claramente que cuanto mayor es la energía de activación mayor es
la sensibilidad de la velocidad de reacción a la temperatura.
¿Tendría este fenómeno algo que ver con la fotorrespiración?
4. La rubisco tiene actividad carboxilasa y actividad oxigenasa, ¿qué
problema se le plantea a las plantas en latitudes tropicales, en relación con estas actividades mencionadas? Haz una discusión razonada sobre dicha problemática (Consejo: haz un pequeño trabajo de documentación sobre la rubisco y su papel biológico).
La rubisco juega un importante papel en la fijación de carbono (CO 2)
que viene mediado por la actividad carboxilasa. Sin embargo, dado que esta reacción compite con la reacción de oxigenación, en las latitudes tropicales, debido a la mayor temperatura, esta competencia se resuelve a favor de la reacción de oxigenación (ambas reacciones tienen distinta energía de activación, por lo que sus sensibilidades a los cambios de temperatura van a ser diferentes). Por este motivo, en latitudes tropicales aparece una estrategia de fijación de carbono denominada metabolismo C4 que, junto con la estrategia de metabolismo CAM, plantea una solución a la problemática de la fotorrespiración (reacción de oxigenación catalizada por la rubisco).