TAREA BIOQUIMICA 2017

La calificación de la tarea será para calificar la participación

1. Explique las características de las enzimas: nitrogenasa, nitrato reductasa y nitrito reductasa.
Pesos moleculares, cofactores, mecanismo,  G (estos últimos si lo encuentran).
Nitrogenasa
Cataliza la reducción de N2 a NH3
Dinitrogenasa, proteína de FeMo: formada por dos sub unidades α2β2 que
contiene Fe y Mo
Una proteína de 200kD con subunidades
DinitrogenasaReductasa, proteína de Fe-S: Dimero de subunidades idénticas de
64kD que contiene Fe
Nitrato reductasa
es un homodimero compuesto de 2 subunidades idénticas de 105 KDa,
conteniendo cada subunidad tres grupos prostéticos : equivalente de FAD, hemo-
Fe y un complejo de Molibdeno.
Verifica la transformación de NO3 en NO2
NO3 + NAD(P)H+H+ NO2 - + NAD(P)+ + H2O
∆G0 = -34 dcal mol-1 (pH = 7)
Nitrito reductasa
63 kD
Cataliza la conversión de NO2 a NH4
Incluye un cofactor hemo y un grupo 4Fe-4S la reacción catalítica nitrito de
ferredoxina reductasa como donante de electrones, seguido de un periodo de seis
electrones nitrito reductasa y hemo objeto de cluster 4Fe-4S se transfiere en el
nitrito de extremo, este último se reduce a iones amonio.
2. Explique el mecanismo de las transaminasas, describa la síntesis de un aminoácido incluyendo
enzimas y regulación.
Las transaminasas también conocidad como aminotransferasas,
catalizan las reaciones de transaminacion, es decir la
desaminacion de los aminoácidos .
Estas reaciones ocurren en dos etapas
1. E grupo amino es tranferido a la enzima,
produciendo el correspondiente α-oxoacido y la enzima
aminada.
Aminoacidp + enzima ↔ α-oxoacido + enzma-NH2
2. El grupo amino es tranferido a un
oxoacido aceptor(α-cetoglutarato) formando el aminoácido
producto (glutamato) y regenerando la enzima
α-oxoacido + enzma-NH2 ↔ enzima + glutamato

Asparagina
La síntesis de la asparagina comienza a partir de oxalacetato
que se desaminaa a aspartato, posterirmente una amidacion del
 aspartato por la asparagina sintetasa para formar asparagina, esto se lleva acabo
hidrolizando ATP a AMP + PPi

3. Del artículo “ A Multispecific Quintet of Aromatic Aminotransferases That Overlap Different

Biochemical Pathways in Pseudomonas aemginosa” explique cómo realizaron el experimento,
porque obtuvieron las mutantes de aminotransferasas y la especificidad de las 5
aminotransferasas ante diferentes sustratos. (4 puntos)
4. Del articulo de Kristina Prodouz, diga que método se utilizó para la purificación de la enzima
(solo decir método) que peso molecular tiene y que aminoácidos predominan en la enzima.
5. En el articulo de Mauro Tiso, sobre bacterias intestinales, con que microrganismos hacen los
experimentos, que ocurre con E. coli en presencia de nitrato y oxigeno en la formación de
NH3 y que ocurre con las bacterias lácticas, igualmente en presencia de nitrato y presencia de
oxigeno. Y como se sabe que el nitrito es convertido primero a nitrito y después a NH3 en E.
coli y L. plantarum. Podría explicar la figura 5.
6. Del artículo de Florence Mus, sobre fijación de nitrógeno, como se realiza la simbiosis entre
Rizobium y planta, ( que hace la planta para que sea detectada por rizobium). Que aporta la
planta y que aporta el microrganismo
7. Del artículo de Donald Kaifield, como eran los primeros organismos, si la atmosfera era
reductora. Las nitrogenasas son sensibles al oxigeno?
8. Del artículo de Conrado Moreno. Podrías explicar la figura 1.
9. Del articulo Matthieu Driandorge, porque la aminotransferasa que cataliza la transminacion
de preferanto a arogenato porque se le llama una enzima homelees?
10. Cuáles son los precursores de la síntesis de aminoácidos?
α-Cetoglutarato Piruvato 3-Fosfoglicerato Fosfenolpiruvato Oxalacetato Ribosa-5-fosfato
Alanina Serina Triptófano Aspartato Histidina
Glutamato Valina Glicina Fenilananina Asparagina
Glutamina Leucina Cisteína Tirosina Metionina
Prolina Isoleucina Treonina
Arginina Lisina

11. En qué punto del ciclo de Krebs se incorpora el NH4+, cuales son las enzimas claves en este
proceso.
Biosíntesis de aminoácidos
Se utiliza los intermediarios del ciclo de Krebs de dos manera:
El α-Oxoglutarato + NAD(P)H+ NH4+↔ glutamato + NAD(P)+ + H2o
El α-Oxoglutarato y el oxalacetato son utilizados en la sisntesis de glutamato y
aspartato mediante reacciones de transaminacion
α-Oxoglutarato + alanina ↔ glutamato + piruvato
oxalacetato + alanina ↔ aspartato + piruvato
12. Mencione algunos microrganismos que llevan la oxidación de NH4 a NO2 y de NO2 a NO3.
 Rhizobium
 Streptomicetaceas
 Tiobacterias
 Enterobacterias
  Azotobacter

13. Explique el ciclo de la urea específicamente que enzimas participan y si existe regulación, y en
donde, dibujar el ciclo y puntos de regulación

Reacciones:
1. El amoníaco producido en las mitocondrias, se utiliza junto con el bicarbonato, para
producir carbamoil-fosfato reaccionando con ATP y catalizada por la carbamoil-fosfato-
sintetasa I.Enzima alostérica y modulada (+) por el N-acetilglutamato.
2. El carbamoil-fosfato cede su grupo carbamoilo a la ornitina, para formar citrulina y
liberar Pi. Reacción catalizada por la ornitina transcarbamoilasa. La citrulina se libera al
citoplasma.
3. El segundo grupo amino procedente del aspartato reacciona con la citrulina para
formar argininosuccinato. Esta reacción catalizada por la argininosuccinato sintetasa
citoplasmática la cual necesta ATP.
4. El argininosuccinato se hidroliza por la arginino succinato liasa, para formar arginina
libre y fumarato.
5. El fumarato ingresa en el ciclo de Krebs y la arginina libre se hidroliza en el citoplasma,
por la arginasa citoplasmática para formar urea y ornitina.
 6. La ornitina puede ser transportada a la mitocondria para iniciar otra vuelta del ciclo de
la urea.
En resumen, el ciclo de la urea consta de dos reacciones mitocondriales y cuatro
citoplasmáticas
Regulación
El flujo del N a través del ciclo de la urea dependerá de la composición de la dieta. Una
dieta rica en proteínas aumentará la oxidación de los aminoácidos, produciendo urea por
el exceso de grupos aminos, al igual que en una inanición severa.
La Carbamil-fosfato-sintetasa l es activada por N-acetilglutamato, la cual es activada por
la arginina, aminoácido que se acumula cuando el ciclo de la urea es lenta.
14. Como se conecta e ciclo de la urea al ciclo de Krebs
El fumarato producido en la reacción de la argininosuccinato, ingresa a la
mitocondria, donde la fumarasa y malato deshidrogenasa forma oxalacetato.

El aspartato que actúa como dador de N en el ciclo de la urea, este se forma a

partir del oxalacetato por transaminación desde el glutamato a α- cetoglutarato.

15. Que reacciones ocurren en mitocondria y cuales en citoplasma y cuales requieres ATP
El primer grupo amino que ingresa al ciclo proviene de amoniaco mitocondrial, el
cual se utiliza junto con el bicarbonato, para producir carbamoil-fosfato. Esta
reacción es dependiente de ATP y atalizada por la carbamoil-fosfato-sintetasa I.
El carbamoil- fosfato cede su grupo carbamoilo a la ornitina, para formar citrulina
y liberaPi. La citrulina se libera al citoplasma.