DNA BARCODING:

´´EL CODIGO DE BARRAS DE LA VIDA´´

Gerardo Gallego – Harold Suárez B.

Unidad de Agrobiodiversidad y Biotecnología

Centro Internacional de Agricultura Tropical
Mayo 2009
El planeta tierra es el hogar
de aproximadamente 10
millones de especies de
plantas y animales

El cerebro humano sólo

puede identificar unos
cientos de especies,
representando una pequeña
fracción de la diversidad de
la vida

Consortium for the Barcode of Life

 ¿Cómo identificar, organizar y
clasificar de una manera simple
la biodiversidad existente en
nuestro planeta?
VI Latin America Regional Meeting 2009
Los códigos de barras funcionan para
los artículos del supermercado….Por
qué no para animales y plantas?
 Código de barras…

Un código de barras es un
código basado en la
representación de un grupo de
líneas paralelas verticales de
distinto grosor y espaciado que
en su conjunto contienen una
información determinada y
única correspondiente a un
elemento determinado.
Ventajas

-Evitar errores de digitación

Stoeckle et al. 2008. Am. Scient Inc.

-Búsquedas rápidas de artículos

- Rápido control del stock de mercancías

- Organización sistemática de los productos

- Individualización de cada articulo, con un código único

- Agilizar la lectura de artículos en las cajas registradoras

- Estadísticas comerciales (número de artículos vendidos)

- Control global de los productos ofrecidos en un sitio determinado

Código de barras Código de barras
comercial de ADN
 ¿Qué es el código de barras de ADN?

El código de barras de ADN es

una herramienta desarrollada
en el año 2003 por el biólogo
Paul Hebert del Instituto de
Biodiversidad de Ontario en la
Universidad de Guelph
Dr. Paul Hebert
(Canadá), consiste en la
comparación de una secuencia
corta de ADN de condiciones
uniformes dentro del genoma
utilizada para identificar
cualquier especie de ser vivo.

Photos: Andrew Tingle

 Cual secuencia genómica se utiliza para la
implementación del código de barras de ADN?

La iniciativa del código de barras

propone emplear información dentro
de una misma región génica (gen
mitocondrial de la Citocromo c
Oxidasa I = COI), en todas las
especies vivientes y con condiciones
de secuenciación universalmente
aceptadas y estandarizadas
El gen COI

Célula

Mitocondrias

El gen COI (Citocromo

oxidasa), es uno de los 13
genes que codifican
proteínas en el genoma
mitocondrial
ADN
mitocondrial
AGCTGCTAGTGATGATCTATCGATGTCAGAA…….
Comparación entre secuencias COI
 Aplicación final de código de barras de ADN

Librería de Código de barras

(Secuencias relacionadas con el
nombre del espécimen)
Muestras Análisis Comparación
colectadas con una librería
Vectores de enfermedades humana

Plantas patógenas
Analizador
de
Código de
barras Especies en vía de extinción

Muestras de
tejido Secuencias
código de
barras Especies invasoras y exóticas
 Apis mellifera Abeja

Apis rupestris Abejorro

Turdus migratorius Zorzal pechirrojo

Catharus guttatus Zorzal Ermitaño

Consortium for the Barcode of Life

Las secuencias genéticas codificadas por medio de colores, sirven para

identificar 4 especies diferentes, con las barras grises se indican las
diferencias entre ellas.
Detección de la variación en las secuencias COI

Consortium for the Barcode of Life

Las diferencias en el código de barras

de ADN ayudan a visualizar las
diferencias entre secuencias y definen
las distancias genéticas entre
especies.
 Definición de especies altamente relacionadas a nivel filogenético

La comparación de secuencias
COI muestra como difieren entre 1
o 2 nucleótidos de un total de 648,
las secuencias de chimpancés (en
la posición del nucleótido 60) y los
gorilas (nucleótido 70) con
respecto a la secuencia de los
humanos.
Código de barras de ADN:

10 Razones
 Consorcio para el código de barras
de la vida

Misión: explorar y desarrollar el potencial del

código de barras genético como herramienta
práctica para identificar especies en
investigación taxonómica, estudios de
conservación de biodiversidad, y aplicaciones
para la ciencia y la sociedad.
 1. Posibilidad de trabajar con pequeños
fragmentos

Con el código de barras se pueden

identificar especies a partir de
pequeños trozos o fragmentos del
cuerpo de un individuo. Además se
pueden identificar dietas y
organismos asociados ,
identificando fragmentos en el
estomago de la especie en estudio.
 2. Organismos en cualquier etapa del desarrollo

Posibilidad de identificar
especies en cualquier
momento de su desarrollo,
desde huevos y semillas,
larvas y plántulas hasta
animales adultos y plantas.
 3. Desenmascarar especies muy parecidas
morfológicamente

Distinguir entre especies muy parecidas morfológicamente,

dentro de las cuales se pueden encubrir organismos
peligrosos. Lo que ayuda a tener un punto de vista mas
exacto de la diversidad. Por ejemplo: Los mosquitos
Anopheles son vectores de la malaria humana. Solo unas
pocas de las 430 especies conocidas transmiten la
infección.
 4. Reducir la ambigüedad

Escrito como una secuencia de 4 nucleótidos discretos – CAGT-

a lo largo de una región local uniforme sobre el genoma, un
código de barras de la vida provee una identificación digital. Una
librería de códigos de barras digitales podría brindar una
referencia no ambigua que facilitaría la identificación de
especies.
 5. Hacer ir más lejos la experiencia…

La desconcertante diversidad de
cerca de 2 millones de especies
conocidas, confina a los expertos
en identificación morfológica a
solo una pequeña parte de los
reinos de plantas y animales. Con
los códigos de barras y otras
herramientas tecnológicas, los
científicos podrían identificar
rápidamente los organismos
conocidos y facilitar el rápido
reconocimiento de nuevas
especies.
 6. Democratizar el acceso

Una librería estandarizada que le facilite a las personas

nombrar y conocer los nombres de las especies que se
encuentran a su alrededor. Esto ayudará a la identificación
de especies abundantes o raras, nativas o invasoras y
especialmente un mejor entendimiento de la biodiversidad
local y global.
 7. Abre el camino para una guía de electrónica
portátil de fácil manejo en campo

El código de barras para

identificación biológica se puede
relacionar con técnicas de
secuenciación avanzada del ADN,
junto con el desarrollo de la
miniaturización de dispositivos
electrónicos y el almacenamiento
computarizado de la información.
Para finalmente obtener dispositivos
electrónicos y portables para
identificación de organismos en
campo, utilizando sólo un fragmento
de tejido.
8. Nuevas hojas en el árbol de la vida

Desde Darwin, los biólogos

buscan un sistema de
clasificación natural que pueda
ser representado en arboles de
genealogías y que muestren la
historia evolutiva de las
especies. Las similitudes y
diferencias del código de barras
de ADN encontradas entre los 2
millones de especies reportadas,
podría ayudar en la elaboración
del árbol de la vida sobre la
tierra.

http://vivirmexico.com/
 9. Demuestra el valor de las colecciones

La compilación de los códigos

de barras comienzan con los
muchos millones de
especímenes de museos,
herbarios, zoológicos, jardines
y otros repositorios biológicos.
Ayudando a todas estas
instituciones a enfocar sus
esfuerzos en la preservación y
en incrementar el conocimiento
para la preservación de la
biodiversidad de la tierra.
10. Mayor velocidad en la escritura de la enciclopedia
de la vida

Compilando una librería del

código de barras, relacionados
con datos de pasaporte de los
especímenes y sus nombres
binomiales, se podría
incrementar el acceso publico
al conocimiento biológico,
además se podrían desarrollar
enciclopedias on-line de la
vida en la tierra, donde se
incluya cada una de las
especies existentes de plantas
y animales.

www.pantanodelzular.es
Aplicación del código de barras de ADN en investigaciones
especificas:

1. El caso de Neoleucinodes elegantalis

(Lepidoptera: Crambidae)
FUNDAMENTOS EN TAXONOMIA MOLECULAR PARA EL
DESARROLLO DE CONTROL BIOLÓGICO DEL
PERFORADOR DEL FRUTO Neoleucinodes elegantalis
(Lepidoptera: Crambidae) EN FRUTAS SOLANÁCEAS
ANDINAS EXÓTICAS
Introducción

En Colombia y Venezuela, el
barrenador del tomate,
Neoleucinodes elegantalis
(Lepidóptera: Crambidae), es la
plaga más importante
relacionada con frutas de la
familia solanácea.

N. elegantalis es un insecto
Neotropical ampliamente
distribuido en centro y sur
América, incluyendo Puerto
Rico, Cuba, Granada y las Islas
Trinidad
En Colombia las poblaciones de este insecto causan pedidas por
encima del 60.3%, este numero es similar a lo observado en
Venezuela, donde el insecto es considerado una de las mayores
pestes en las áreas cultivadas con tomate de árbol.

En estudios desarrollados en Colombia, Venezuela y Brasil, el

insecto también ha mostrado variación en términos de respuesta a
feromonas sexuales.

Esas reacciones diferenciales a plantas hospederas, sugiere la

posible ocurrencia de un complejo de especies que puedo o no estar
relacionado filogenéticamente, o incluso podría sugerir la presencia
e biotipos especializados en ataques específicos.
Objetivos:

1. Identificar posibles biotipos de Neoleucinodes elegantalis encontradas en

diferentes cultivos de solanáceas en Colombia y Venezuela

2. Caracterizar todos los especímenes de N. elegantalis disponibles en la

colección desarrollada en Colombia por CORPOICA (Corporación
Colombiana de Investigación Agropecuaria) y muestras obtenidas en
Venezuela por el MIZA (Museo del Instituto de Zoología Agrícola)

3. Identificar la variabilidad genética en poblaciones de N. elegantalis que

afectan frutas solanáceas y relacionar esas posibles diferencias con la
ubicación geográfica en plantas hospederas cultivadas y silvestres para
Colombia y Venezuela
Integración de diferentes análisis

a. Análisis molecular (código de barras de ADN)

b. Caracterización morfométrica

c. Evaluación de la actividad de feromonas sexuales en ambientes

naturales

d. Ensayos biológicos para determinar la compatibilidad reproductiva

Metodología

1. Selección de muestras
Muestras colecciones:
- CORPOICA
- MIZA

2. Corte de los últimos 3 segmentos

del abdomen para extracción de ADN
 3. Extracción de ADN total
(protocolo de Gilbertson et al. 1991).

4. Amplificación del gen Citocromo

oxidasa COI, mediante PCR

www.yayabo.net
5. Secuenciación de la región COI amplificada para cada individuo

Secuencia COI

6. Análisis Bioinformático

a. Comprobación de secuencias vía BLAST (NCBI) Secuencia-COI

b. Alineamiento de secuencias COI

c. Generación de arboles filogenéticos

y análisis de similitud de especies
7. Análisis filogenético desarrollado por CBOL
(Consortium for the barcode of life)

8. Anotación de secuencias en
bases de datos y
librerías de códigos de barras
de ADN

codigo-de-barras-de-adn.blogspot.com
GRACIAS!!!