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Nesta Era, a flora dos continentes era caracterizada por um elevado número de
gimnospérmicas, que constituíam o principal alimento dos dinossauros herbívoros
como, por exemplo, os quadrúpedes.
Quanto à flora, foi nesta Era que se deu o aparecimento de plantas com flor: as
angiospérmicas. Esta espécie gradualmente ocupou o lugar previamente ocupado
pelas gimnospérmicas – tornaram-se a principal fonte de alimento para os seres
herbívoros. Isto deu-se devido às características que possuíam relacionadas com as
suas cores, os odores que libertavam e o néctar que produziam, que vieram a facilitar
a sua relação de simbiose com outros seres vivos e, assim, a dispersão das suas
sementes foi feita de um modo mais eficaz.
Com este impedimento muitas das cadeias alimentares foram quebradas pela
sua base: a fotossíntese parou e sem esta as plantas verdes morreram; a morte das
plantas verdes os herbívoros não tinham forma de se alimentar e sem estes os
carnívoros ficavam com falta de alimento. Com isto grande parte dos animais teria
morrido, sobrevivendo aqueles que se conseguiam alimentar de carne já em processo
de decomposição. Quanto à flora foram capazes de sobreviver as plantas com
semente e/ou com raízes subterrâneas visto que permaneciam protegidas no solo até
que fosse restabelecido o equilíbrio acima deste e as condições voltassem a ser
favoráveis ao seu desenvolvimento. Quando isso aconteceu, tendo-se assentado a
poeira sobre o solo, ter-se-á originado a camada de argila encontrada por Alvarez.
Apesar da grande aceitação que esta teoria tem também gerou controvérsia na
comunidade paleontológica. Alguns paleontólogos defendiam que a extinção em
massa teria ocorrido de forma lenta e gradual e outros suponham que o elevado teor
de irídio encontrado na camada de argila poderia ter sido trazido por uma atividade
vulcânica muito intensa, visto que se calcula que este seja muito elevado no interior da
crusta terrestre.
Mesmo não havendo consenso universal sobre o que terá levado à extinção
em massa que ocorreu no fim da Era Mesozóica um facto sobre o qual não há dúvidas
é que todos os dinossauros desapareceram, acontecimento este que proporcionou aos
mamíferos um caminho para a sua evolução e a exerção do seu domínio na Era que
se seguiu.