9/30/2017 Supplementary Block 1: Introduction to Microbiology – ...

Christina Radeka 7
My Connect Courses Library Resources Content Collection

H Supplementary Materials Supplementary Block 1: Introduction to Microbiology

Supplementary Block 1: Introduction to Microbiology

Printable View of:Block 1: Introduction to Microbiology

Print  
 
File: I. Introduction to Microbiology
 
I. Introduction to Microbiology

Knowledge of microbiology and immunology is essential to the modern dental hygienist both in the interactions with clients
and with other members of the dental team. The two most important and common oral diseases, caries and periodontitis
are infections, caused by specific bacteria with virulent factors that cause the disease symptoms. However, these two
diseases are multi­factorial and are not only dependent on high numbers of specific bacteria but also on several
environmental forces and the immunocompetence of the host. The latter factor is particularly important in the
pathogeneses of periodontitis since disease symptoms and progression vary widely according to the immune status of the
host. Although the immune response is essential in protecting the oral cavity and preventing systemic invasion of oral
microbes, activities of the immune cells may contribute to disease symptoms. Other diseases, such as tuberculosis that
are important to the hygienist, are also finely tuned to the host’s immune status.

Infection control is of foremost importance to the dental hygienist to prevent the transmittance of disease in the dental
environment and to protect the hygienist and his/her client. New challenges in microbiology and immunology are
constantly presented to the dental team such as current problems of:

Contamination of dental unit water lines
Latex allergies
New guidelines for the prophylaxis of preventing infective endocarditis
Oral conditions that are often the first sign of acquired immuno­deficiency syndrome (AIDS)
The adoption of universal precautions
New infections such as SARS, Avian flu, drug resistan 'superbugs'

This course is designed to make the dental hygienist familiar with all of the aspects of microbiology and
immunology that are necessary for the competence of the dental hygienist. It is hoped that the student
will both benefit from, and enjoy learning about the world of the microbe and the body’s mechanisms in
preventing invasion.

Microbes are bacteria, viruses, fungi and protozoa, organisms too small to be seen with the unaided eye. Fig. 1.1
Bacteria, fungi and protozoa require a light microscope (fig. 1­1) whereas viruses are too small to be seen
unless an electron microscope is used. (fig. 1­2)

Most microbes are beneficial or essential to the world and play a major role in:

the carbon, oxygen, sulfur, and nitrogen cycles
the food chains and webs
the production of food, antibiotics, and genetic engineering
decomposing and recycling the earth’s materials Fig. 1.2

Only a small percentage of microbial species cause disease; this course will specifically deal only with this small segment.

 
File: II. Morphology of Bacteria
 
II. Morphology of Bacteria

In this section, you will learn about:

characteristics of bacteria
cellular structures
classification

https://connect.ubc.ca/webapps/blackboard/execute/content/file?cmd=view&content_id=_4336820_1&course_id=_111522_1&framesetWrapped=true 1/5
9/30/2017 Supplementary Block 1: Introduction to Microbiology – ...
 
File: Characteristics of Bacteria
 
Characteristics of Bacteria

Size:

Bacteria are the smallest of the unicellular organisms, and are approximately 1­1.5µm wide and 2­6µm long, one thousand
bacteria can sit comfortably on a typewritten period. Because their surface area to volume is so large, bacteria have a very
rapid metabolic rate and if conditions are ideal, some bacteria may grow to twice their size and divide in 20 minutes in a
process called binary fission.

Shape:

Bacteria may be one of 3 major shapes: (fig. 1­7)

a. spheres or cocci e.g. streptococci (fig. 1­8)
b. rods or bacilli e.g. poryphyromonas (fig. 1­9)
c. spirilla or spirochetes (fig. 1­10)

Fig. 1.7 Fig. 1.8 Fig. 1.9 Fig. 1.10

Recently, a square­shaped bacteria has been discovered in the Red Sea, but it is not a human pathogen.

 
File: Cellular Structures
 
Cellular Structures

Flagella:

If a bacteria has flagella (flagellum sing.) it has the ability to move, and this confers a real advantage to
the bacterium as it can chemotactically find nutrients. The possession of flagella is a virulence property.
The flagellum, composed of a protein ­ flagellin, is inserted into the cytoplasmic membrane, projects
through the bacterial cell wall and can be arranged in several ways. (fig. 1­11)

A special flagella­like appendage called an axial filament, wraps around spirochete bacteria and gives them
mobility. (fig. 1­12)
Fig. 1.11
Fimbriae, Pili:

Pili are proteinaceous hair­like projections, coded for by plasmids and involved in the transfer of nucleic
acid during conjugation between two bacteria (see Block 2).

Fimbriae are coded by chromosomal DNA, cover the bacteria’s surface and function in adherence of the
bacteria (adhesins) to host tissue, and to other bacteria. They are considered virulence mechanisms since Fig. 1.12
many bacterial species that have lost the ability to produce fimbriae can no longer adhere to host tissue
and cause disease, becoming non­pathogenic. Recently, authors have not made a clear distinction between the two terms
and they are currently used interchangeably. Pili and fimbriae proteins are antigenic and induce the production of host
antibodies.

Capsules, Slimes:

Bacteria often have an extracellular, polysaccharide surface layer called a capsule, if attached to the cell, or slime if
secreted from the cell and remains loosely associated with the cell. A capsule confers a selective advantage to a bacterium
since it may function in adherence, storage of food, and prevention of desiccation. It offers resistance to bacteriophages,
disinfectants, and some antibiotics. The capsule is a virulence property as it prevents phagocytosis of the bacteria by
neutrophils and macrophages unless the bacteria become opsonized by anti­capsule antibodies. Oral streptococci produce
capsules of glucan (dextrans) or fructans (levans) that aid in their binding to oral tissues and the tooth surface.

Endospores:

As a normal stage in the bacterial life cycle, a few genera of gram positive rods form an intracellular body called an
endospore in response to detrimental changes in the environment. Endospores are not considered to be a virulent property
but confers an advantage to the bacteria: the strictly aerobic Bacillus group and the anaerobic Clostridia group.

Endospores are very important to the dental hygienist for two reasons:

1. Endospores are the most heat and chemical resistant of all microbial components and a substance is not considered
to be sterile unless the spores are destroyed.
2 They are used on spore test strips to determine the efficacy of autoclaves chemiclaves and hot air ovens Bacillus
https://connect.ubc.ca/webapps/blackboard/execute/content/file?cmd=view&content_id=_4336820_1&course_id=_111522_1&framesetWrapped=true 2/5
9/30/2017 Supplementary Block 1: Introduction to Microbiology – ...
2. They are used on spore test strips to determine the efficacy of autoclaves, chemiclaves and hot air ovens. Bacillus
stearothermophilus spores are used to test autoclaves and chemiclaves and Bacillus subtilis for hot air ovens.

Ribosomes:

The bacterial or prokaryotic ribosome is smaller than the eucaryotic one (70s versus 80s), yet translates bacterial proteins
in a very similar fashion. The primary importance in the differences found between the ribosomal proteins is that the
bacterial ones will bind to certain antibiotics whereas those of eucaryotes, including humans, do not. Thus, certain
antibiotics will prevent protein translation and the bacterial cell will not grow or divide and will ultimately die. Antibiotics
that bind reversibly to the ribosome are bacteriostatic and those that bind in an irreversible fashion are bacteriocidal.

DNA:

Bacteria have a single, double­stranded circular piece of DNA with genes that code for approximately 1000 ­ 3000
proteins. Bacteria are thus haploid, and a mutation in their genes will be rapidly evident.

Plasmids:

Plasmids are autonomously replicating extrachromosomal, circular DNA molecules that code for substances that enhance
the ability of bacteria to grow in certain environments especially the human body. The plasmids are not essential to the
bacteria but are very important medically as they commonly code for antibiotic resistance and virulence factors such as
exotoxins. Plasmids regulate their own replication and vary in size, ranging from of 5­100 genes. Plasmids may be passed
from one bacteria to another of the same, or even different species and are the most rapid form of acquiring antibiotic
resistance by a bacteria. These transferable plasmids are called conjugative or F (fertility) plasmids, and are passed in a
cell to cell contact called conjugation. (Block 2, Genetics)

Cell Wall:

The cell wall of a bacteria is essential in protecting it from osmotic pressure differences between its
cytoplasm and that of its environment and acts as a filter to prevent some substances from entering and
leaving the cell. Only one group of bacteria, the Mycoplasma, lack a wall but have sterols in their cell
membrane and are generally restricted to the human respiratory or urogenitary tract. Bacteria may have
an assortment of structures projecting from its wall, such as pili, fimbriae, flagella and a capsule. (fig. 1­
13)
Fig. 1.13
The most important component of the bacteria’s wall is the peptidoglycan layer, a polysaccharide unique to
bacteria. It consists of chains of two sugars, N­acetylmuramic acid, alternating with N­acetylglucosamine
acid, held together by peptide cross ­ bridges. The thickness of the peptidoglycan layer is one of the major
differences between the wall of a gram positive and gram negative bacteria (fig. 1­14).

Gram positive bacteria have a much thicker layer of peptidoglycan and this often makes them more
resistant than gram negative bacteria to heat and drying. The wall of gram positive bacteria has unique
uronic acids, such as teichoic acid, and lipoteichoic acids. These function in adherence to mammalian
Fig. 1.14
tissue and may have toxic effects in the host cell.

The wall of gram negative bacteria may be thinner than that of a gram positive one, but is more complex. The
peptidoglycan is surrounded by an external membrane that contains a glycolipid called lipopolysaccharide (LPS), or
endotoxin. This layer is extremely important to the bacteria and human host. It is protective to the gram negative bacteria
and acts as a filter, preventing many antibiotics, chemicals and toxic materials from entering the cell. For this reason,
gram negative bacteria are more difficult to destroy with disinfectants and some antibiotics than are gram positive
bacteria. The LPS is a prime virulent property of a bacteria and, depending on its concentration, route of entrance into the
body or location within the body, may cause fever, hemorrhage, septicemia, shock and abortion. The outer membrane is
highly hydrophobic but is studded with pores or channels that, with transport mechanisms, allow ions and other materials
into the cell.

The endotoxin of oral gram negative bacteria plays a major role in the pathogenesis of periodontal bacteria and both
directly and indirectly contributes to oral connective tissue and bone destruction.

Major differences between Procaryotic and Eucaryotic cells:

Fig. 1.15

Procaryotes Eucaryotes

Bacteria Animals

  Plants/Algae

https://connect.ubc.ca/webapps/blackboard/execute/content/file?cmd=view&content_id=_4336820_1&course_id=_111522_1&framesetWrapped=true 3/5
9/30/2017 Supplementary Block 1: Introduction to Microbiology – ...

  Fungi

  Protozoa

Nuclear membrane, golgi apparatus, mitochondria,
No nuclear membrane, or membraned organelles
endoplasmic reticulum, chloroplasts

Paired chromosomes (mitosis, meiosis ­ possible
Single, circular chromosome of DNA
and occurs during cell replication)

70 S ribosome 80 S ribosome

cell wall of peptidoglycan cell wall of cellulose, chitin

flagella with defined number and organization of
simple flagella structure
microtubules

 
File: Classification
 
Classification

Every known organism, both living and extinct, has a unique name which consists of the genus and the species, for
example: Homo sapiens (man) or Porphyromonas gingivalis (periodontal bacteria). This system is called binomial
nomenclature. The ‘name’ must either be written in italics with the Genus capitalized, or each genus and species must be
separately underlined.

e.g. Streptococcus mutans or Streptococcus mutans

To arrive at a specific name for an organism is a challenging task and necessitates proceeding through many levels of
classification to arrive at the correct location. The criteria used to identify an organism are based on its morphological,
physiological characteristics, its reproductive compatibility, and nucleic acid composition.

The science of classifying organisms is called Taxonomy and it attempts to give each species an identifying, unique Latin
name. It was first created by Carolus Linnaeus (1707­1778), a Swedish botanist who devised seven categories from broad
to more specific criteria. The categories are:

1. Kingdom
2. Phylum
3. Class
4. Order
5. Family
6. Genus
7. Species

Prior to the discovery of microbes there were only two kingdoms, Plantae and Animalia. Now, there are five, according to
some sources:

1. Monera ­ Bacteria, blue­green algae
2. Protista ­ Protozoa
3. Fungi ­ Yeasts and molds
4. Plantae ­ Plants
5. Animalia ­ Animals

Other sources, e.g. Samaranayaki, have bacteria, fungi and protozoan belonging to the Kingdom Protists.

Members of the Monera, primarily bacteria, have a feature that distinguishes them from all other species; they lack a true
nucleus and do not have a nuclear membrane to separate their nucleic material from the cytoplasm of the cell. Thus, we
refer to the Monera species as being Procaryotic (or Prokaryotic) and all other species that have a true nucleus as being
Eucaryotic (or Eukaryotic). In this course we will refer to the bacteria as being Procaryotes and all higher forms of life as
Eucaryotes.

Bacterial species are often a collection of strains that descended from a single cell. The classification scheme of bacteria
that is most widely used today is presented in Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. However, as new techniques
are discovered for identifying bacteria reclassification is often necessary. Thus Bacteroides gingivalis has become
Porphyromonas gingivalis and Bacteroides melaninogenicus is Prevotella intermedia.

Wh i di d h d ddi i l h ll h T i i h bli i
https://connect.ubc.ca/webapps/blackboard/execute/content/file?cmd=view&content_id=_4336820_1&course_id=_111522_1&framesetWrapped=true 4/5
9/30/2017 Supplementary Block 1: Introduction to Microbiology – ...
When viruses were discovered, they posed an additional challenge to the Taxonomist since they are obligate parasites.
They cannot exist or replicate unless they are in a living host cell and have taken over the machinery or cellular
components of the cell to make viral proteins and viral nucleic acids. Viruses, whose name is derived from the Latin word
for poison, are placed in a special position between living and non­living cells.

https://connect.ubc.ca/webapps/blackboard/execute/content/file?cmd=view&content_id=_4336820_1&course_id=_111522_1&framesetWrapped=true 5/5