public class EjemploEliminarDeArreglo {

public boolean eliminar(int[] arreglo, int elemento) {

boolean resultado = false;
for (int i = 0; i < arreglo.length; i++) {
if (arreglo[i] == elemento) {
for (int j = i; j < arreglo.length - 1; j++) {
arreglo[j] = arreglo[j+1];
}
arreglo[arreglo.length - 1] = 0;
resultado = true;
}
}
return resultado;
}

public void ejemploEliminar(int[] arreglo, int numero) {

//mencionaste no usar librerías externas de Java para
//eliminar el elemento, pero no mencionaste
//si no debían usarse para otras funciones como
//mostrar su contenido
System.out.println(Arrays.toString(arreglo));
if (eliminar(arreglo, numero)) {
System.out.println(
String.format(
"Se eliminó %d. Ahora el arreglo es: %s",
numero, Arrays.toString(arreglo)));
} else {
System.out.println("El arreglo sigue intacto.");
}
}

public static void main(String[] args) {

//arreglo definido de manera estática
int[] arreglo = { 1, 2, 3, 4, 5 };
EjemploEliminarDeArreglo ejemplo = new EjemploEliminarDeArreglo();
System.out.println(Arrays.toString(otroArreglo));
//eliminando los números 3, 10 y 4 del arreglo
ejemplo.ejemploEliminar(arreglo, 3);
ejemplo.ejemploEliminar(arreglo, 10);
ejemplo.ejemploEliminar(arreglo, 4);

//el mismo caso de antes pero asignamos los valores del arreglo desde un for
int[] otroArreglo = new int[5];
//solo a modo de demostración, imprimimos el contenido del arreglo
//será algo como [0, 0, 0, 0, 0]
//porque eso es un arreglo de enteros vacío en Java
System.out.println(Arrays.toString(otroArreglo));
//ahora, le asignamos elementos
for (int i = 1; i <=5; i++) {
otroArreglo[i-1] = i;
}
//y lo volvemos a mostrar en la consola
//ahora luce [1, 2, 3, 4, 5] como lucía `arreglo`
//antes que le eliminaran sus datos
System.out.println(Arrays.toString(otroArreglo));
}
}