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¿QUÉ ES LA BIOQUÍMICA?
En realidad lo que va estudiar la bioquímica son las sustancias que se encuentran presente en los organismos
vivos que las podemos resumir en cuatro macromoléculas o biopolimeros: Carbohidratos, proteínas, lípidos y
ácidos nucleicos (conocer su estructura química y su función biológica), y la totalidad de reacciones quimicas
que ocurren con estas macromoléculas. En conclusión la bioquímica se va encargar del estudio de estas
macromoléculas y de sus respectivas reacciones en los organismo vivos.
La bioquímica pude dividirse en tres áreas principales
1. La química estructural de los componentes de la materia viva y la relación de la función biológica con
la estructura química.
2. El metabolismo, la totalidad de reacciones quimicas que se producen en la materia viva.
3. Genética molecular, la química de los procesos y las sustancias que almacenan y transmiten la
información biológica.
METABOLISMO
Al conjunto de reacciones quimicas que ocurren en un organismo vivo se denomina metabolismo.
De este esquema que se muestra en la parte superior, se puede observar que el metabolismo se puede dividir
en dos fases:
1. Catabolismo: Reacciones que tienden a romper moléculas.
2. Anabolismo: Fabricar moléculas, sintetizar moléculas desde CO2 y H2O hasta monómeros, y desde
monómeros hasta Biomoléculas, este es un proceso un poco mas complejo al anterior.
Ambos procesos suceden simultáneamente en los organismos vivos y tienen que estar bien
interrelacionados, si algo falla va dar lugar a la aparición de un fenómeno biológico. Ambos procesos
tienen que estar continuamente comunicándose, en el catabolismo se produce energía (ATP), esta energía
es necesaria para poder realizar la síntesis de las macromoléculas, tanto se fabrica y tanto se gasta, no
podemos desfasarnos.
De
estos 0,75 % hay elementos que se encuentran en los organismos vivos en un porcentaje inferior al 0,001 % es
el caso del cobre, manganeso, cobalto. Zinc, iodo, molibdeno, vienen a ser los “elementos trazas”, estos se
diferencian de los microelementos ya que los elementos trazas no son indispensables para vivir, pero su
presencia en los organismos vivos nos da una buena calidad de vida, si falta alguno de ellos el organismo vivo
sobrevive, pero lo mas probable es que desarrolle alguna enfermedad por la falta de alguno de estos
elementos.
MACRONUTRIENTES EN EL SUELO
Los Macronutrientes esenciales para las plantas son carbono, hidrogeno, oxigeno, nitrógeno, fosforo, potasio,
calcio, magnesio y azufre. El carbono, hidrogeno y oxigeno se obtienen de la atmosfera, mientras que los
restantes Macronutrientes se obtienen del suelo. De estos últimos, el nitrógeno, el fosforo y el potasio son los
que mas probablemente puedan ser deficitarios y normalmente se agregan al suelo como fertilizantes.
Los suelos deficientes en calcio son relativamente raros, la aplicación de cal, un proceso usado para tratar los
suelos ácidos, mantiene un suministro de calcio mas que adecuado para las plantas. En los suelos alcalinos, la
presencia de niveles altos de sodio, magnesio y potasio produce a veces deficiencia de calcio, ya que estos
iones compiten con el calcio por la disponibilidad a las plantas.
La mayor parte del 2.1 % de magnesio en la corteza terrestre esta fuertemente enlazado en los minerales
(materia orgánica o arcilla con propiedades de intercambio iónico), la disponibilidad de magnesio para las
plantas depende de la proporción calcio/magnesio. Si esta proporción es demasiado alta, el magnesio no puede
estar disponible para las plantas. Similarmente, niveles excesivos de potasio o sodio pueden causar deficiencia
de magnesio.
El azufre es asimilado por las plantas como ion sulfato, SO4 -2, este ion sulfato esta presente en el suelo bajo la
forma de minerales de sulfatos insolubles inmovilizados o como sales solubles. Además una atmosfera
contaminada con SO2, pueden matar la vegetación en algunas áreas. Si es un suelo deficiente en azufre no
sustenta bien el crecimiento de las plantas, debido a que el azufre es un componente de algunos aminoácidos
esenciales y también de la tiamina y la biotina.
MICRONUTRIENTES EN EL SUELO
El boro, el cloro, el cobre, el hierro, el manganeso, el molibdeno (para la fijación de nitrógeno) y el zinc son
considerados micronutrientes esenciales de las plantas. Las plantas solo necesitan estos elementos a niveles
muy bajos y frecuentemente son tóxicos a niveles más altos. La mayoría de estos elementos funciona como
componentes de enzimas esenciales. El manganeso, el hierro, el cloro y el zinc pueden estar involucrados en
la fotosíntesis. Es posible que el sodio, el silicio, el níquel y el cobalto, también puedan ser nutrientes
esenciales para algunas plantas.
MOLÉCULAS
Cuando estos elementos se juntan, van ha formar enlaces, originando moléculas; estas moléculas al estar
presente en los organismos vivos recibe el nombre de “Biomoleculas”.
De todas estas Biomoléculas tenemos que el agua constituye el 75 % del peso total, las macromoléculas
constituyen el 23 %, prácticamente todo gira alrededor de las cuatro macromoléculas y del agua.
El ADN que viene a ser la macromolécula mas importante desde el punto de vista bioquímico, debido a que
contiene la información genética tan solo es el 0.5 %, y el RNA constituye un 2 %, de los cuales hay tres
clases de RNA, el RNA mensajero, el de transferencia y el ribosómico, no se sabe mucho de las funciones que
cumple el RNA ribosómico, lo único que se sabe es que se encuentra dando volumen a los ribosomas, sin
embargo se han hecho estudios con este RNA y se ha determinado que diferentes especies se encuentran
emparentadas, existe un alto grado de homología, lo que se hizo en este estudio fue extraer este RNA
ribosómico del humano y del mono y se hizo un análisis para ver si existía homología, y se encontró que
existía una correspondencia al rededor del 85 % al 95%, esto indica que hay una alta homología, si hacemos lo
mismo pero esta vez con el RNA ribosómico del mono y el RNA ribosómico de un insecto, se compara el
resultado que se obtiene es que el grado de homología es del 25 % al 35%, pero si comparamos el RNA
ribosómico de una tortuca con el RNA ribosómico de un lagarto, el grado de homología se encuentra
alrededor del 80 % al 90 %. Esto me da a entender que existe una alta homología entre especies semejantes,
esto hace pensar que el RNA ribosómico debe de servir para algo, no solo serviría para dar volumen a los
ribosomas.
Las moléculas orgánicas (metabolitos intermediarios) aproximadamente son el 2 %, estas se forman durante el
procesamiento de las Biomoléculas, los organismos vivos rompen sus carbohidratos, proteínas, lípidos, ácidos
nucleicos hasta unidades muy pequeñas, estos pedacitos de moléculas que se han obtenido producto de la
ruptura de las macromoléculas se denominan moléculas orgánicas, estas vienen a ser moléculas, que a lo largo
de una ruta o proceso metabólico se han formado como moléculas efímeras, duran un tiempo muy corto,
sirven tan solo como moléculas de paso a lo largo de una ruta metabólica, que ni bien se forman
inmediatamente dan paso a otra molécula, entiéndase por ruta metabólica a todas las reacciones quimicas que
ocurren desde una molécula hasta un producto final (desde A hasta E).
Finalmente los iones inorgánicos constituyen el 1 %, estos vienen a ser las sales inorgánicas, que van a
formar los sistemas bufferados, nosotros necesitamos movilizar todas estas moléculas en sistemas bufferados
para poder controlar el pH.
Se designan como quimiorganotrófos, aquellos que necesitan moléculas orgánicas complejas tales como la
glucosa como dadores electrónicos. Los organismos que pueden emplear dadores electrónicos inorgánicos
sencillos, tales como el sulfuro de hidrogeno, el amoniaco o el azufre, reciben el nombre de quimiolitótrofos.
La tabla superior muestra la clasificación de todos los organismos en cuatro grupos principales:
quimiorganótrofos, quimolitótrofos, fotoorganótrofos y fotolitótrofos, de acuerdo con sus fuentes de energía y
de carbono.
La gran mayoría de los organismos son o fotolitótrofos o bien quimiorganótrofos. Aunque los otros dos grupos
de organismos comprenden relativamente pocas especies no deben considerarse como curiosidades raras.
Algunos de ellos desempeñan papeles muy importantes en la biosfera, particularmente los microorganismos
del suelo, que fijan el nitrógeno molecular u oxidan el amoniaco a nitrato. Recuérdese, también, que casi la
mitad de la materia viva de la Tierra es microbiana y que la mayor parte de la vida microbiana se desarrolla en
el suelo y en los mares.
Aquellos organismos, que emplean el oxígeno molecular como último aceptor de electrones de sus dadores
electrónicos orgánicos se denominan aerobios, y los anaerobios, que emplean como aceptor electrónico
alguna otra molécula en lugar del oxígeno. Muchas células pueden vivir o bien aeróbicamente, o bien
anaeróbicamente, y a estos organismos se les llama facultativos. Pueden emplear el oxígeno cuando disponen
de él, y en caso contrario pueden emplear algunos compuestos orgánicos como aceptores electrónicos. Los
organismos que no pueden utilizar el oxígeno en ninguna circunstancia son los anaerobios estrictos; de hecho
muchos de ellos son intoxicados por el oxígeno. La mayor parte de las células heterótrofas, en particular las de
los organismos superiores, son facultativas, y si disponen de oxígeno prefieren utilizarlo porque les permite un
empleo más económico de sus moléculas combustibles.
Es importante observar que no todas las células de un organismo determinado son de la misma clase, y que
algunos tipos de células poseen gran flexibilidad metabólica. Por ejemplo, en las plantas superiores, las
células verdes que contienen clorofila en las hojas son autótrofas fotosintéticas, mientras que las células de las
raíces son heterótrofas. Es más, la mayor parte de las células de las hojas verdes actúan como autótrofos
fotosintéticos a la luz solar, pero como heterótrofos en la oscuridad.
Los organismos vivos existentes en la naturaleza son independientes en el aspecto nutritivo de varias maneras.
Las más fundamentales son los ciclos del carbono y del oxígeno en la biosfera, en la cual las células
fotosintéticas y las células heterótrofas aerobias se alimentan literalmente unas a otras en una relación
llamada sintropía. Las células fotosintéticas producen compuestos orgánicos, tales como la glucosa, a partir
del CO2 atmosférico y del agua y a expensas de la energía solar. Las células heterotróficas utilizan compuestos
orgánicos producidos por las células fotosintéticas corno combustibles y sillares de construcción; el dióxido
de carbono formado como producto final de su metabolismo vuelve a la atmósfera para ser utilizado de nuevo
por las células fotosintéticas. Acompaña al ciclo del carbono el intercambio de oxígeno entre los organismos
fotosintéticos y heterotróficos. La mayor parte de los organismos fotosintéticos producen oxígeno, que es
utilizado, a su vez, por los heterótrofos para oxidar los combustibles.
MACROMOLÉCULAS
Los biopolimeros son moléculas demasiado grande y de elevado peso molecular. Los carbohidratos son uno
de ellos, los seres vivos los almacenamos como polisacáridos, cuya unidad monomérica vienen a ser los
monosacáridos; los carbohidratos desempeñan funciones energéticas (almidón en las plantas y glucógeno en
los animales) y algunas de ellas son estructurales como el caso de la celulosa que forma las paredes celulares
de los vegetales,
Las proteínas tienen como unidad manomérica a los aminoácidos, que estructuralmente son un poco mas
complejos que los monosacáridos, ya que los monosacáridos son compuestos monofuncionales, tienen un
grupo carbonilo que puede ser un aldehído o una cetona, mientras que los aminoácidos viene a ser
bifuncionales ya que estos presentan dos grupos funcionales con reactividad muy semejante entre ellos el
grupo amino y el grupo carboxilo, este grupo amino puede ganar un protón, se cargara positivamente,
mientras que el grupo carboxilo puede perder un protón y se convierte en un carboxilato, esto hace que las
proteínas sean moléculas “anfotéricas”, mejor dicho se pueden comportar como ácidos o como bases según el
medio en el que se encuentren, si el medio es acido el grupo amino jala un protón (NH3 +), el aminoácido se
cargara positivamente (forma catiónica: Básica), y si el medio es básico el grupo carboxilo pierde un protón
(COO-), el aminoácido se cargara negativamente (forma aniónica: Acida). Las funciones de los carbohidratos
son estructurales (se encuentran formando canales en las membranas celulares), pero de todas la función mas
importante es la catalítica (enzimática), casi todas las enzimas tienen naturaleza proteica, también ejercen
funciones regulatorias (hormonales), pero hay algunas hormonas como es el caso de la insulina y del glucagon
que ejercen funciones estructurales.
Los lípidos son moléculas complejas no polares que se dividen en lípidos saponificables, por que se pueden
romper (hidrolizar), y los no saponificables, por que no se pueden romper, en este grupo tenemos a los
esteroides, terpenos y las prostaglandinas; sin embrago el grupo mas importante vienen a ser los
saponificables, que se subdividen a su vez en lípidos simples y complejos, los lípidos simples son aquellos
que al hidrolizarlos se obtiene ácidos grasos y un alcohol, mientras que los complejos son aquellos que al
hidrolizarlos obtenemos ácidos grasos, un alcohol mas un grupo fosfato. Los lípidos son moléculas
estructurales y son los fosfolipidos (lípido compuesto) que forman las membranas celulares, mientras que los
triacilgliceroles (lípidos simples) ejercen funciones energéticas, incluso son mucho mas enérgicos que los
carbohidratos, pero no son de primera opción para utilizarlos como fuente de energía, los de primera opción
siempre son los carbohidratos.
Finalmente los ácidos nucleicos, sus unidades monoméricas reciben el nombre de nucleótidos, estos son mas
complejos ya que están formados por un azúcar (ribosa para el ARN o desoxiribosa para el ADN), un grupo
fosfato y una base nitrogenada que puede ser púrica o pirimidínicas; las bases nitrogenadas puricas están
formadas por la Adenina y la guanina, mientras que las bases nitrogenadas pirimidinicas están formadas por
Citosina, Uracilo y Timina; en el ARN vamos a tener : Adenina, Guanina, Uracilo y Citosina, en el caso del
ADN vamos a tener: Adenina, Guanina, Timina, Citosina; una base púrica siempre se une a una base
pirimidínica, la Adenina se une a la Timina formando dos puentes de hidrogeno, mientras que la Guanina se
une a la Citosina formando tres puentes de hidrogeno; la función primordial del ADN es el almacenamiento de
la información genética y el ARN interviene en los procesos de transcripción y traducción de la información
genética.