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Prévoir l’imprévisible
Une introduction à la
biostatistique

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Prévoir l’imprévisible
Une introduction à la
biostatistique

Raluca Balan
Gilles Lamothe

Traduit par Didier Alexandre Bilodeau

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Catalogage avant publication de Bibliothèque et Archives nationales du Québec
et Bibliothèque et Archives Canada
Balan, Raluca M.
Prévoir l’imprévisible : une introduction à la biostatistique
Traduction de : Expect the Unexpected : A First Course in Biostatistics
Comprend des réf. bibliogr.
ISBN 978-2-7605-3489-6
1. Biométrie - Manuels d’enseignement supérieur. 2. Sciences naturelles - Méthodes statistiques.
3. Probabilités. 4. Statistiques. I. Lamothe, Gilles, 1971- . II. Titre.
QH323.5.B3414 2012 570.1’5195 C2012-940887-5

Les Presses de l’Université du Québec reconnaissent l’aide financière du gouvernement

du Canada par l’entremise du Fonds du livre du Canada et du Conseil des Arts du Canada
pour leurs activités d’édition.
Elles remercient également la Société de développement des entreprises culturelles (SODEC)
pour son soutien financier.

Mise en pages : Gilles Lamothe

Couverture : Michèle Blondeau
Traduction : Didier Alexandre Bilodeau

2012-1.1 – Tous droits de reproduction, de traduction et d’adaptation réservés

© 2012 Presses de l’Université du Québec
Traduction de Expect the Unexpected : A First Course in Biostatistics, 2011, World Scientific Publishing,
ISBN 978-981-4291-32-3.
Dépôt légal – 3e trimestre 2012
Bibliothèque et Archives nationales du Québec / Bibliothèque et Archives Canada
Imprimé au Canada

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 Préface

Des chercheurs ont essayé pendant plusieurs années de découvrir le sens

des derniers mots de Hamlet :  Tout le reste est silence ?  dans la pièce de
théâtre de Shakespeare. Dans un film de 2007 du même titre, dans la ville de
Bucharest en 1911, un acteur âgé de 19 ans décide de devenir un réalisateur
de film (un rêve utopique à l’époque), après qu’il réalise que le cinéma peut
sauvegarder la magie des performances de théâtre pour l’éternité. Ce livre
fut créé du désir de trouver une réponse à la même question, à laquelle nous
faisons face à la fin de chaque semestre lorsque nous terminons d’enseigner
un cours. Serait-il possible de sauvegarder, pour des générations futures
d’étudiants, certaines parties de l’atmosphère vibrante de la salle de classe
et de leur partager cette expérience incroyable ?
Ce manuscrit fut développé par les auteurs des notes de cours pour le
cours MAT 2779  Introduction à la biostatistique  (et le cours équivalent
MAT 2778  Probabilités et statistique pour les sciences naturelles ), qui
furent enseignés à l’Université d’Ottawa depuis 2003 jusqu’à présent. Pen-
dant ces années, ces notes ont constamment évoluées et ont été enrichies
avec plus d’exemples, un processus qui continuera sans doute au cours des
années à venir. Cependant, la plupart des exemples qui sont inclus dans
ce livre sont nouveaux et n’ont pas été utilisés en salle de classe avant
maintenant.
Sauf si une source d’information spécifique est mentionnée, tous les
exemples du livre utilisent des données hypothétiques. Les exemples sont
habituellement basés sur une situation de la vie quotidienne, qui est
connectée d’une façon très simple aux sciences naturelles. Des données
générées par des logiciels sont évitées, et les résultats de simulations ne
sont pas discutés.

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viii Prévoir l’imprévisible – Une introduction à la biostatistique

Le but de ce livre est d’introduire et d’explorer l’utilité de di-

verses méthodes statistiques et probabilistiques, par l’entremise d’exemples
simples et non-techniques, permettant au lecteur de comprendre rapidement
les nouveaux concepts et de les appliquer à des situations plus complexes
plus tard. Quelques exemples utilisés dans le livre attirent l’attention sur
divers problèmes du monde d’aujourd’hui, liés à des problèmes environne-
mentaux, au changement climatique, à la perte de biodiversité et à leur
impact sur la faune et la population humaine.
Le livre est divisé en deux parties. La partie I introduit les concepts
fondamentaux et les règles de la théorie des probabilités, tandis que la
partie II se concentre sur les statistiques. Cet ordre réflète la philosophie
des auteurs que la théorie des probabilités se situe au fondement de la
statistique et qu’il est important de comprendre le sens du hasard avant
d’effectuer toute analyse de données. Ceci explique pourquoi le sujet des
statistiques descriptives est discuté seulement dans la partie II, et non au
début tel qu’il semble être la pratique commune lors de l’enseignement de
la statistique.
Dans une adresse par Raymond Pearl à la Société Statistique Américaine
en 1914, intitulée  Le Service et l’Importance des Statistiques à la Biolo-
gie , il mentionna trois contributions importantes des méthodes statis-
tiques à la biologie : (i) pour décrire un groupe d’individus en termes des
attributs et des qualités du groupe ; (ii) pour mesurer la précision d’une
estimation avec un haut niveau de confiance ; (iii) pour mesurer le degré
d’association entre les variations d’une série de caractères ou d’événements
(voir [46]). Ces trois méthodes fondamentales sont discutées en longueur
dans ce manuel.
La biostatistique représente un sujet interdisciplinaire qui se situe à l’in-
tersection de la biologie et de la statistique, et qui consiste de l’étude des
méthodes quantitatives ou statistiques appliquées à la biologie. Ce sujet a
une histoire récente, ses origines datant de Francis Galton, un cousin de
Charles Darwin, qui était intéressé par le problème d’hérédité. Il utilisa des
techniques quantitatives (telles qu’ajuster une droite pour décrire l’associa-
tion entre deux variables) pour répondre à des questions biologiques.
Le domaine de la biostatistique (aussi connue sous le nom de biométrie)
est né à la fin du 19e siècle et au début du 20e siècle, surtout en raison des
travaux de Karl Pearson (le fondateur du premier département de statis-
tique au monde à l’Université Collège de Londres) et de Ronald Fisher (un
pionier dans le domaine des plans expérimentaux). Les deux ont développé
des méthodes statistiques pour répondre aux questions des sciences biolo-

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 Préface ix

giques. En effet, les travaux de Gregor Mendel sont restés inaperçus pour
plusieurs années par les biologistes, puisqu’ils n’étaient pas habitués de pen-
ser en termes quantitatifs ou statistiques. Ce fut Pearson et ses pairs qui
ont redécouvert les travaux de Mendel et les lois de l’hérédité.
Le but de ce livre est de présenter aux étudiants de la biologie le rai-
sonnement et la modélisation statistique, qui sont très importants au fon-
dement de la biologie moderne.
Cette œuvre fut traduite de l’anglais au français par Didier Alexandre
Bilodeau. Nous sommes fiers d’avoir eu l’opportunité de travailler avec
Didier. Nous voulons le remercier pour la très grande qualité de son travail.

Ottawa, le 13 février 2012.

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Tout au long de cet ouvrage, les chiffres entre crochets
font référence à la bibliographie.

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 Table des matières

Préface vii

Probabilité 1
1. Introduction aux probabilités 3
1.1 Interpréter les probabilités . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3

2. La génétique élémentaire et les probabilités 9

2.1 Dendrogrammes et carrés de Punnett . . . . . . . . . . . 9
2.2 Méthodes de calcul . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
2.3 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20

3. Axiomes de probabilité 25
3.1 Diagrammes de Venn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
3.2 La règle d’addition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30
3.3 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32

4. Probabilité conditionnelle 37
4.1 Définition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
4.2 La règle de la multiplication . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
4.3 La formule de Bayes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
4.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48

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xii Prévoir l’imprévisible – Une introduction à la biostatistique

5. Indépendance 53
5.1 Indépendance statistique . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
5.2 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57

6. Variables aléatoires discrètes 61

6.1 Définition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
6.2 La loi binomiale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
6.3 La loi de Poisson . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
6.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70

7. Variables aléatoires continues 75

7.1 Définition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
7.2 La loi normale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
7.3 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81

8. Exercices supplémentaires (Probabilité) 85

Statistique 91

9. Introduction à la statistique 93
9.1 Échantillonage aléatoire et description de données . . . . 93
9.2 Distribution d’échantillonage et estimation ponctuelle . . 107
9.3 Vérifier la normalité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
9.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121

10. Intervalles de confiance 127

2
10.1 Intervalles de confiance pour la moyenne : σ connue . . . 127
10.2 Intervalles de confiance pour la moyenne : σ 2 inconnue . . 135
10.3 Intervalles de confiance pour la proportion . . . . . . . . . 138
10.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143

11. Test d’hypothèse 147

11.1 Test d’hypothèse pour la moyenne : σ 2 connue . . . . . . 147
11.2 Test d’hypothèse pour la moyenne : σ 2 inconnue . . . . . 155
11.3 Test d’hypothèse pour la proportion . . . . . . . . . . . . 160
11.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 165

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 Table des matières xiii

12. Comparaison de deux échantillons indépendants 167

12.1 Plan d’expérience/d’étude . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167
12.2 Intervalles de confiance et tests pour les moyennes . . . . 169
12.3 Intervalles de confiance et tests pour les proportions . . . 184
12.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188

13. Échantillons appariés 193

13.1 Intervalles de confiance pour µD . . . . . . . . . . . . . . 193
13.2 Test d’hypothèse pour µD . . . . . . . . . . . . . . . . . . 197
13.3 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 200

14. Données catégoriques 207

14.1 Test d’indépendance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 207
14.2 Test d’homogénéité . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 213
14.3 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 218

15. Régression et corrélation 223

15.1 Droite des moindres carrés . . . . . . . . . . . . . . . . . . 223
15.2 Modèle de régression . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 227
15.3 Corrélation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 239
15.4 Exercices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245

16. Exercices supplémentaires (Statistique) 253

17. Tableaux 267

Bibliographie 273

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puq.ca

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