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Guías de Laboratorio
BIOQUIMICA
Preparado por:
DAVID 2007
UNIVERSIDAD AUTONOMA DE CHIRIQUI
DEPARTAMENTO DE QUIMICA
Experimento 1.
Preparación de Soluciones Amortiguadoras
I. Objetivos:
Al finalizar esta práctica el estudiante estará en capacidad de:
CH3COOH ↔ CH3COO- + H+
CH3COONa → CH3COO- + Na+
IV. Procedimiento
X mL 91 86 80 75 70 65 60 55 50 44 39
pH 3.0 3.2 3.4 3.6 3.8 4.0 4.2 4.4 4.6 4.8 5.0
X mL 34 29 24 19 14
PH 5.2 5.4 5.6 5.8 6.0
V. Actividades:
Resuelva:
1. ¿Cuál es el pH de una mezcla de 5mL de acetato de sodio 0.1 M y 4 mL
de ácido acético 0.1 molar?
2. Cuál es el cambio que ocurre en el pH al agregar a la mezcla anterior
1.0 mL de HCI 0.1M
3. Explique el sistema de amortiguamiento del pH en el plasma de los
mamíferos.
1. Objetivos:
2. Introducción:
3. Materiales y reactivos:
3.2. Soluciones de ác. glutámico y glicina al 0.5% en HCl 0.1M; NaOH 0.2M;
HCl 2%; leche de vaca, de cajita; etanol 95%; éter.
4. Procedimiento:
4. Cuestionario:
4.1. ¿Por qué no se alcanza el pH 1 con HCl 0.1M en las soluciones en las que
se prepararon los aa.?
4.3. Por qué las moléculas con grupos ionizables se hacen menos solubles en
el punto isoeléctrico.
4.5. ¿Por qué es necesario lavar la caseína precipitada con alcohol (Etanol
95%) y éter.
Experimento 3.
Pruebas Cualitativas para aminoácidos y proteínas
I. Objetivos:
Al finalizar el experimento el estudiante podrá:
IV. Procedimiento.
a. Reacción de la ninhidrina:
Coloque 1 mL de la solución de aa. en un tubo de ensayo y ajuste el
pH cerca de la neutralidad; agregue 5 gotas de la solución de
ninhidrina y deje hervir por 2 minutos. Un color azul-púrpura
constituye una prueba positiva. (En el caso de prolina e hidroxiprolina
es amarillo).
b. Reacción xantoproteica:
Agregue volúmenes iguales de ácido nítrico concentrado a
aproximadamente 0.5 mL de la solución de aa., deje enfriar y observe
el cambio de color. Agregue suficiente NaOH 10M para que la
solución sea fuertemente alcalina. El cambio de coloración, de
amarillo a naranja brillante es indicativo de un resultado positivo.
Repita la prueba con una solución de fenol. La fenilalanina debe dar
una reacción negativa o débilmente positiva.
V. Actividades.
Experimento 4.
Separación y cuantificación de fracciones proteínicas
del suero.
I. Objetivos:
1. Aplicar la técnica de precipitación salina selectiva
para separar las diferentes fracciones de proteína
presentes en una mezcla.
2. Determinar el porcentaje de composición de una
mezcla de proteína mediante análisis colorimétrico.
IV. Procedimiento.
Determinación de las Proteínas Totales
Tubo Suero Albúmina NaCl 0.9 Biuret Agitar Repos
% h ar
A = 0.1 mL - 1.9 mL 8.0 mL por inversión 10 min.
muestra
A.1 = - 0.1 mL 1.9 mL 8.0 mL por inversión 10 min.
Patrón
A.2= blanco - - 2.0 mL 8.0 mL por inversión 10 min.
Determine la lectura en el colorímetro a 540 nm.
VI. Actividades:
Resuelva:
1. Que diferencia hay entre suero y plasma.
2. Cuales son las globulina (Inmunoglobulinas o anticuerpos) mas
abundantes en el plasma. Describa algunas de sus características.
3. Señale la diferencia de solubilidad de las proteínas del suero.
Experimento 5
Electroforesis de proteínas del suero humano
en gel de poliacrilamida bajo condiciones
desnaturalizantes (sds-page)
INTRODUCCIÓN
Electroforesis
Matrices de soporte
Separación de proteínas
Las proteínas son compuestos anfotéricos, por lo tanto su carga neta está determinada por el
pH del medio en el que están suspendidas. En una solución con un pH por encima de su punto
isoeléctrico, una proteína tiene una carga neta negativa y en un campo eléctrico migra hacia el
ánodo, mientras que migrará hacia el cátodo a pHs por debajo de su punto isoeléctrico. La
carga presente en una proteína es independiente de su tamaño y varía de una proteína a otra,
por lo tanto, la separación electroforética de proteínas bajo condiciones no desnaturalizantes se
realiza en virtud de su carga y tamaño.
Un sistema continuo tiene un gel de separación sencillo y usa el mismo amortiguador en los
tanques y en el gel, en un sistema discontinuo, un gel de poro grande y no restrictivo, llamado
gel de apiñamiento, es colocado en la parte superior del gel de separación, llamado gel de
resolución. Cada gel está hecho con un amortiguador diferente, y el amortiguador de los
tanques es diferente al de los geles. La mayor ventaja de los sistemas de amortiguador
discontinuos sobre los continuos es que pueden agregarse volúmenes relativamente grandes
de muestras de proteína diluída a los geles sin comprometer la resolución, esto se debe a que
las proteínas son concentradas en zonas extremadamente estrechas durante su migración en
el gel de apiñamiento. La resolución alcanzada con un sistema discontinuo es muy superior a la
obtenida con sistema continuo.
La justificación teórica de proceso electroforético en los sistemas discontinuos será discutida en
la sesión de laboratorio.
Geles de poliacrilamida
Los geles de poliacrilamida se obtiene polimerizando monómeros de acrilamida
(CH2=CHCONH2) en cadenas largas y entrecruzándolas con un compuesto bifuncional como
N,N’-metilenbisacrilamida ( CH2(NHCOCH=CH2)2, usualmente llamada bisacrilamida). La
polimerización es iniciada mediante la adición de persulfato de amonio ó riboflavina, y se usa
N,N,N’,N’-tetrametilenetilendiamina (TEMED) como acelerador del proceso de polimerización.
Ambos iniciadores de polimerización generan radicales libres, el persulfato de amonio
espontáneamente en solución (enlace peróxido), y la riboflavina mediante fotodescomposicion.
El tamaño de poro efectivo de los geles de poliacrilamida depende inversamente de la
concentración de acrilamida, y se usan geles con concentraciones de acrilamida desde 2.5%
(moléculas con peso mayor de 106) hasta 30% (polipéptidos con peso de ~2000). Para una
concentración de monómero dada, las propiedades del gel varían con la proporción de agente
entrecruzador usado, al aumentar éste el tamaño de poro decrece, alcanzando un mínimo
cuando representa un 5% de la cantidad total de monómero.
pH
Los límites prácticos de pH para realizar PAGE están entre pH 3 y 10, ya que algunas
reacciones hidrolíticas (como desaminación) ocurren a pHs extremos. La elección del pH para
PAGE depende de dos consideraciones opuestas, a pHs cercanos al punto isoeléctrico de las
proteínas a separar, la diferencia de carga entre ellas es grande, aumentando la posibilidad de
separación, sin embargo, al ser pequeña la carga, los tiempos de corrido son largos, llevando a
un aumento en el ensanchamiento de banda. En SDS-PAGE los complejos polipéptido-SDS
están negativamente cargados en un rango amplio de pH, por lo tanto el pH no es crítico.
Las bandas pueden ser evidenciadas mediante diferentes métodos como tinción con
colorantes, revelado “fotográfico”, autorradiografía ó con marcaje fluorescente. En la presente
aplicación se usará marcaje con plata, método altamente sensible y rápido. Las bandas de
proteína son fijadas en la posición final después de la electroforesis precipitando las proteínas
con metanol y ácido acético, las bandas son sensibilizadas con tiosulfato de sodio, que mejora
el contraste entre las bandas teñidas y el fondo del gel, posteriormente el gel se trata con
nitrato de plata, los iones plata se complejan con la proteina, y en un paso posterior, similar al
revelado fotográfico, los iones plata complejados sufren una reducción mucho mas rápida que
los iones plata libres, formando partículas coloidales de plata en las dos superficies del gel,
preferencialmente sobre las bandas de proteína, haciéndolas visibles. Los límites de detección
son del orden de ng de proteina.
Las albúminas del suero pertenecen a una familia multigénica de proteínas que conforman la
mayor fracción de proteínas solubles en el sistema circulatorio, estas desempeñan diversas
funciones fisiológicas, como regulación de la presión osmótica, transporte y distribución de un
gran número de ligandos endógenos y exógenos que incluyen ácidos grasos, aminoácidos,
esteroides, metales como calcio, cobre y zinc y fármacos. Las alpha1 globulinas incluyen a-1-
antitripsina, a-1-antiquimotripsina y a-1-lipoproteína (LDH), entre otras. Entre las alpha2
globulinas están la a-2-macroglobulina (inhibidor de proteasas), haptoglobulina (se une a
hemoglobina libre), proteína C (inhibidor de factores de coagulación), ceruloplasmina
(transportador de cobre) y a-2-lipoproteína (VLDL). Las beta1 globulinas incluyen
transferrina(capta hierro) y hemopexina. Las beta2 globulinas incluyen plasminógeno, b-2-
lipoproteína (LDL) y alguna proporción de IgA. El fibrinógeno también migra en esta región. Las
gamma globulinas consisten en las inmunoglobulinas IgM, IgA e IgG.
La electroforesis es usada para separar las globulinas de las albúminas, ya que los niveles de
cada fracción son de importancia en diagnóstico clínico. La muestra preferida es el suero, ya
que el fibrinógeno contenido en el plasma a menudo obscurece cambios en los niveles de las
beta y gamma globulinas. Otras muestras usadas son el fluido peritoneal u orina.
Mediante la electroforesis pueden separarse y cuantificarse unas 100 proteínas presentes en el
suero, los niveles obtenidos son útiles para diagnosticar gamopatías monoclonales (asociadas
al cáncer), cirrosis, hepatitis autoinmune, artritis reumática, osteomielitis, bronquitis,
leishmaniosis, lepra, leucemia, enfermedades inmunológicas, SIDA, mielomas , desórdenes
renales, carcinomas, infecciones agudas, diabetes, embarazo, estrés, daño celular y
desnutrición entre otros estados clínicos.
MATERIALES Y EQUIPOS
Cámara de electroforesis
Fuente de voltaje
Enfriador a 4°C
Solución stock monómero (Acrilamida 29,2%, bisacrilamida 0,8%)
Amortiguador Tris-HCl 1,5M pH 8,8
Amortiguador Tris-HCl 0,5M pH 6,8
Amortiguador Trisbase-glicina pH 8,3 (5X)
Solución stock SDS 10%
Persulfato de amonio al 10% (recién preparado)
TEMED
Amortiguador reductor para las muestras : SDS 2-mercaptoetanol
Glicerol Azul de bromofenol
Amortiguador pH 6,8
Fijador A (Metanol 50%, ácido acético 5%)
Fijador B (Metanol 50%)
Sensibilizador (Tiosulfato de sodio 0,02%)
Marcador (Nitrato de plata 0,1%)
Revelador (Formaldehído 0,04%, carbonato de sodio 2%)
Enjuage (Acido acético 5%)
Agua desionizada
SECCIÓN EXPERIMENTAL
Preparación de la muestra
La muestra de suero centrifugada y dializada (Opcional) se diluye hasta unas cuatro veces en
el amortiguador reductor y se calienta a 95°C por 4 minutos.
Sembrado de la muestra y corrido de la electroforesis
Revelado de la placa
PREGUNTAS
REFERENCIAS
http:/www.uct.ac.za/microbiology/sdspage.html
http://member.aol.com/neskander/Electro.html
- Manejo de la celda de electroforesis, receta del fabricante.
Bio-Rad. Mini-PROTEAN II Electrophoresis cell instruction manual
- Muy buen manual, enfoque teórico-práctico sobre las diferentes técnicas usadas en
electroforesis.
Hames, B. D. and Rickwoon, D. Gel electrophoresis of proteins. A practical approach.IRL press
Ltd. 1981
Ureasa
(NH2)2CO 2NH3 + CO2
Urea Amoniaco
IV. Procedimiento.
Prepare los siguientes tubos de ensayo:
Tubo Urea 0.25 M Amortiguador (mL) Agua (mL) HgCl Enzima
(mL)
1 0.5 4.5 7.0 - Reposar 3.0 mL Reposar
2 1.0 4.5 6.5 - por 5 3.0 mL por
3 2.0 4.5 5.5 - minutos 3.0 mL 30
4 5.0 4.5 2.5 - Todos 3.0 mL minutos
5 7.5 4.5 - - los 3.0 mL A 30 0C.
6 7.5 4.5 - 8 gotas tubos 3.0 mL
Después de los 30 min, adicionar del tubo 1 al tubo 5, 8 gotas de.
HgCl2 Agitar
Para:
Tubo 1 =Volumen promedio de HCl x Molaridad de HCl = m mol de NH 3 /
min.
Experimento 7.
Estudio de Inhibición de la Fenoloxidasa de la papa
I. Objetivos:
a. Determinar la actividad enzimática de la fenoloxidasa presente en
extractos de papa.
E + S ES E + P
V0 = Vmáx [S]
KM + [S]
IV.Procedimiento.
Es importante que antes de iniciar el procedimiento de extracción
de la enzima, todos los materiales estén en frío, incluyendo el NaF,
la licuadora y el sistema de filtración previamente lavado con agua
fría. También se recomienda tener los tubos de ensayo listos con
las soluciones necesarias para medir la actividad.
1 2 3 4 5 6
SOLUCIONES/TUBO
mL Amortiguador pH 6 4 4 4 4 4 4
mL Agua destilada 9 7 5 3 1 11
mL de Pirogalol 1% 2 4 6 8 10 -
Ajustar el cronómetro y el espectrofotómetro a 475 nm. Proceder con un tubo a la vez y añadir
la enzima.
mL Enzima 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Estudio de inhibición con ác. Benzoico 0.02%
mL Amortiguador pH 6 4 4 4 4 4
mL Agua destilada 8 6 4 2 0
ml de DOPA 1% 2 4 6 8 10
V. Actividades:
Experimento 8
Determinación Cualitativa de Carbohidratos.
I. Objetivos:
1. Realizar pruebas cualitativas para detectar carbohidratos con
base en la formación furfural.
2. Ensayar la prueba para azúcares reductores.
3. Realizar pruebas cualitativas para polisacáridos.
IV.Procedimiento.
1. Pruebas basadas en la formación de furfurales
IV. Actividades.
Resuelva:
¿Qué es un grupo acetal y que es un grupo hemiacetal?
a) sacarosa de lactosa
b) ribosa de fructuosa
c) amilosa de amilopectina
I. Objetivos:
1. Extraer el glucógeno presente en una muestra de hígado de pollo.
2. Caracteriz
ar mediante pruebas químicas el glucógeno extraído.
Presenta ramificaciones cada 8-12 glucosas con una cadena muy larga
(hasta 300.000 glucosas). Se requiere dos enzimas para su hidrólisis
(Glucogenofosforilasa) y alfa (1-6) glucosidasas, dando lugar a unidades de
glucosa. Dado que los seres vivos requieren una parte constante de energía,
una parte importante de metabolismo de los azucares esta relacionado con los
procesos de formación de almidón y glucógeno y su posterior degradación.
IV.Procedimiento.
Corte en trozos pequeños 50 g de hígado de pollo
Caliente en un erlenmeyer de 250 mL con mucha precaución y
usando lentes de seguridad 36 mL de KOH al 50 %
Adicione inmediatamente los trozos de hígado en el erlenmeyer que
contiene el KOH.
Caliente en baño maria durante 40 min. Agite el matraz de ser necesario
Después del calentamiento adicione 30 mL de agua.
Adicione 70 mL de etanol. Agite
El floculado formado es principalmente glucógeno.
Tape y deje reposar por 10 min.
Adicione la mezcla en los tubos de centrifugación.
Centrifugue por 5 min. a velocidad máxima
Recoja el precipitado y ensaye la prueba de Molish.
Glicerol quinasa
Glicerol + ATP Glicerol – 3P + ADP
Glicerolfosfato oxidasa
Glicerol 3P + O2 Dihidroxiacetona-P + H2O2
peroxidasa
H2O2 + 4-Aminofenazona + p-clorofenol Quinona + agua
Procedimiento:
Preparar los siguientes tubos de ensayo:
DETERMINACIÓN DE COLESTEROL:
Colesterol esterasa
Esteres de colesterol colesterol + ácidos
grasos
Colesterol oxidasa
Colesterol + O2 colest –4-en-3 ona +
H2O2
Peroxidasa
H2O2 + 4 aminoantipirina + Fenol quinoneimina + 4 H 2O
Procedimento:
30 uL de agua destilada
30 uL del patrón de 30 uL de suero humano,
colesterol plasma con heparina o
EDTA
3 mL de reactivo para 3 mL de reactivo para 3 mL de reactivo para
colesterol colesterol colesterol
PROCEDIMIENTO:
CALCULAR:
V. Actividades: