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la fijación de CO2
contexto en el que se desarrolló. Aunque hay muchos ejemplos de CO2 carboxilasas fijadores
que se utilizan para efectos metabólicos distintos de asimilación de carbono, tales como la
conservación de la energía, anaplerosis, y redox-balanceo [1 ??, 2,3?, ?? 9, 10], esta revisión se
centrará en los autótrofos proceso de fijación de CO2 que son relevantes para electrofuel
producción, además de los microorganismos huésped primarias que están siendo considerados
actualmente que utilizan hidrógeno (Tabla 1).
La vía de fijación de CO2 más ubicuo es el calvinista Benson-Bassham ciclo (CBB) encuentra en
las plantas, algas, cianobacterias, bacterias púrpuras, y también en algunas proteobacterias,
tales como Ralstonia eutropha. R. eutropha es un metabólicamente diversa bacteria,
facultativamente autotrófico que puede crecer en azúcares, ácidos grasos, aminoácidos,
triacilglicéridos así como en H2 / CO2 [5 ??, 6,7,8,11?]. Trabajo previo en R. eutropha se ha
centrado en su capacidad de almacenar el exceso de carbono como polihidroxialcanoatos
[12,13] (PHAs) y ahora esfuerzos buscan para desviar el flujo de carbono de distancia de
almacenamiento PHA y en otras dianas moleculares. Por ejemplo, R. eutropha es un anfitrión
propuesto para la producción de isobutanol a través de la 2- vía cetoisovalerato de
aminoácidos de cadena ramificada síntesis [11?] a partir de H2 y CO2. Esta estrategia tiene
isobutanol y otros alcoholes superiores de azúcares [14,15], así como en Clostridium
cellulolyticum para producir isobutanol a partir de celulosa [16]. R. eutropha también se puede
utilizar electroquímicamente formiato generados como el donante de electrones para la
producción de isobutanol y 3-metil-1-butanol [1 ??, 2,3? 17 ??]. Además, se está utilizando R.
eutropha, de junto con la generación electroquímica in situ de de hidrógeno a través de
catalizadores polypryridyl-oxo de molibdeno atado a la superficie celular, para la producción
de una variedad moléculas que incluyen n-butanol (a través de la biosíntesis de PHA),
farneseno (a través de la biosíntesis de isoprenoides) y de cadena larga alcanos (a través de la
biosíntesis de ácidos grasos) [1 ??, 2,3?, 4,18?]. microorganismos anaerobios que se sabe que
fijar el CO2 suelen utilizar el ciclo de TCA reductora (RTCA) o la madera-Ljungdahl (W-L) y la
vía. El más energéticamente eficiente vía para la fijación de CO2 es la
Estos organismos son obvias para los anfitriones electrofuel el desarrollo, la producción y ya
butanol ha sido diseñado en Clostridium ljungdahlii [5 ??, 6,7,8,11?, ?? 17, 21?]. Acetógenos,
como Sporomusa ovata, también están siendo exploradas por su capacidad para crecer
directamente sobre cátodos de grafito y aceptar electrones para síntesis microbiana
[12,13,22].
Las vías más recientemente descubiertos para biológica la fijación de CO2 implica la
producción de 3-hidroxipropionato (3HP), dicarboxilatos (DC) y / o 4-hidroxibutirato
A pesar de los estudios que utilizan sustratos marcados con isótopos mostraron que la mayor
parte del flujo de carbono entra metabolismo central a través de la succinil-CoA en lugar de
acetil-CoA [9 ??, 10,14,15,24]. Los detalles enzimáticas de esta vía recientemente se ha
completado con la bioquímica caracterización de una epimerasa y una mutasa [11?, 16,25], y
la identificación del gen que codifica una CoA-ligasa [26]. La vía de 3HP / 4HB está siendo
diseñado en un huésped hipertermofílico, Pyrococcus Furiosus, para la producción de n-
butanol a partir de H2 / CO2 [3?, 12,13], donde la diferencia 308C casi óptima entre la
temperatura de crecimiento de P. Furiosus (Topt = 988C) y M. sedula (Topt = 738C) está siendo
explotada por un temperatura dependent estrategia de producción. Alrededor 708c, donde el
DESCRIPCION DE LA FIGURA:
DESCRIPCION DE LA FIGURA:
Dibujo esquemático de los módulos primarios bioquímicos implicados en la formación de
electrofuel. Intracelular reducción de la potencia se genera a partir de gas de hidrógeno a
través de las enzimas hidrogenasa. ciclo de la fijación de carbono incorpora el carbono
inorgánico en el metabolismo central a través de intermediarios clave. la síntesis microbiana
de la molécula de combustible objetivo pasa a través endógeno y / o las vías metabólicas de
ingeniería.
Una importante característica intrínseca a los diversos CO2- la fijación de las vías es la
tolerancia de las enzimas y redox moléculas portadoras de oxígeno. El ciclo de CBB, el 3HP
bicicleta, y el ciclo de 3HP / 4HB (con la excepción de unasola enzima, deshidratasa 4
hidroxibutiril-CoA) son todas las vías tolerantes de oxígeno que operan en aeróbico
organismos. El ciclo de RTCA, la vía W-L, y el ciclo de DC / 4HB se encuentran todos en los
organismos anaerobios; todos éstos utilizan ferredoxina reducida como sensible al oxígeno
portador de electrones y contienen enzimas sensibles al oxígeno, por ejemplo, CO
deshidrogenasa / acetil-CoA sintasa y sintasa piruvato [6]. Algunas especies de aeróbica H2-
oxidante bacterias, tales como Hydrogenobacter thermophilus, utilizan el ciclo RTCA; sin
embargo, tienen bioquímica especial adaptaciones para proteger contra procesos aeróbicos
[28]. En la práctica, el requisito de O2 para apoyar crecimiento microbiano presenta desafíos
de seguridad explosión electrofuel a la producción a gran escala utilizando gas hidrógeno como
sustrato. Hay algunos diseños de reactores que intentan minimizar el riesgo con
electrocombustibles hosts aerobios (como Ralstonia), manteniendo separados los gases de
oxígeno e hidrógeno [11?]. Utilizando hosts anaerobias, tales como Clostridium spp. y P.
Furiosus, evita el problema por completo. Sin embargo, un estudio reciente de la
desintoxicación de oxígeno en P. Furiosus mostró que el organismo es notablemente aero-
tolerante (Hasta 8% O2 vol / vol). Esta propiedad sería ventajoso en el procesamiento
biológico, especialmente bajo condiciones donde mantener estricta anoxia es costoso [11?,
29].
El creciente interés en la fijación del carbono biológico para producción microbiana de los
combustibles y productos químicos básicos ha dado lugar a un extenso análisis de la
termodinámica y características cinéticas de las seis vías conocidas. Boyle y Morgan realizó el
análisis de flujo para determinar la el flujo de carbono y la demanda de energía para la síntesis
de biomasa de CO2, utilizando la máxima producción de biomasa como la función objetivo
[30?]. Ellos encontraron que la energética coste de metabolitos básicos comunes variaron en
los diferentes Vías para la fijación de CO2, lo que indica que ciertas vías pueden ser más
eficientes en la producción de un determinado producto de una precursor sola. En promedio,
encontraron que el W-L vía y el ciclo RTCA fueron la mayor cantidad de energía rutas
eficientes, seguido por el ciclo de DC / 4HB, la ciclo de 3HP / 4HB, el 3HP-bicicleta, y por último
la CBB camino. La misma tendencia se ha observado en otro flujo analiza el equilibrio [31].
Las reacciones en las vías de fijación de carbono ayudó a una mayor dilucidar las limitaciones
termodinámicas locales que conforman la energética global y reveló un patrón característico
en el perfil de las reacciones de las enzimas de fijación de carbono [34 ??]. La inspección de los
potenciales de reducción de halfreactions en las vías de fijación de carbono revela
generalizada agrupaciones de reacciones basadas en el tipo de reacción. Es específicamente la
reducción de carboxilación y carboxilo reacciones que son los más energéticamente
desfavorable en la vía y por lo tanto requieren la mayor parte del empuje energético para
superar. Esto se logra ya sea directamente por el acoplamiento de la reacción a la liberación de
energía a partir de ATP hidrólisis, o indirectamente mediante el acoplamiento de la hidrólisis
de otro enlace de alta energía (por ejemplo tioéster) a la energía reacción desfavorable. Casi la
totalidad de las inversiones de ATP en cada vía de fijación de carbono están acoplados directa
o indirectamente a la carboxilación y las reacciones de reducción de carboxilo.
Algunos caminos apuntan a reducir los requisitos de ATP de fijación de carbono mediante el
acoplamiento desfavorable reacciones a exergónica reacciones distintas de la hidrólisis de ATP.
En el caso de la vía de W-L en acetógenos, este estrategia se usa para reducir la inversión ATP a
un solo molécula de ATP durante la formación de piruvato [5 ??]. rutas sintéticas no están
limitados por el enzimática el perfil de las vías naturales. Más bien, la perspectiva de la
combinación de enzimas en formas novedosas parece prometedor para mejorar la eficiencia
de la vía o reducir el coste energético. El uso de un modelado basado en restricciones enfoque
y el dibujo de todo el conjunto de aproximadamente 5000 conocidas enzimas metabólicas,
Bar-Incluso et al. predicho en vías silico con tasas más rápidas que cinéticos los de origen
natural [35]. Ellos describen una familia de rutas sintéticas que utilizan PEP carboxilasa y la
núcleo del ciclo C4 en plantas, lo que ellos llaman el "C4- ciclos glyoxylate '. Todas estas vías
producen glioxilato, el cual se asimila con el metabolismo central a través de la vía glicerato
bacteriana similar, y se prevé que tienen tasas globales de CO2 a la formación de productos
que son 2-3 veces más rápido que los del proceso de CBB. Sin embargo, Estas tasas son
inferiores a los reportados para el RTCA, DC / 4HB, y 3HP / 4HB ciclos.
Además de las enzimas que catalizan carboxilaciones y las reacciones de reducción carboxilo,
la conversión de CO2 e hidrógeno para electrocombustibles también depende de
las dos enzimas que activan estos dos gases, a saber,
la utilización de hidrógeno
de suma importancia.
solo átomo de hierro coordinado por ligandos diatómicas (monóxido de carbono y cianuro). En
los -enzimas [NiFe], el hierro
y en el montaje y la maduración de su
a través de MBH.
podría ser utilizado para fijar el CO2 por una vía sintética. En el
?, El pKa
108 M? S 1? 1).
descrito para los organismos que utilizan el ciclo de CBB, sin embargo
bicarbonato en lugar de CO2 como sustrato [32 ??], por lo tanto, una
los esfuerzos deberían permitir a los ejércitos clostridiales sean flexibles electrofuel
[70 ??, 71]. También hay un informe reciente de la alteración del gen
heterótrofos se demostró recientemente por primera vez en P. furiosus [27 ??]. La expresión
heteróloga de la primera
[3?].
Conclusión
Expresiones de gratitud
Este trabajo se describe aquí fue financiada en parte por el Departamento de EE.UU.
95ER20175 a MWA).