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Bioquímica
CURSO METODOLÓGICO DE 3 CREDITOS
PREGRADO.
Biomoléculas
BIOQUÍMICA
Bucaramanga
2016
ESCUELA DE CIENCIAS BÁSICAS, TECNOLOGÍA E INGENIERÍA - ECBTI
Bioquímica
CURSO METODOLÓGICO DE 3 CREDITOS
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BIOMOLÉCULAS
BIOMOLÉCULAS (Componentes químicos de la Célula)
Agua H2O
Inorgánicas
Sales minerales NaCl, CaCO3, Ca3(PO4)2
Oxígeno molecular O2
Biomoléculas Glúcidos C, H y O
Lípidos C, H y O
Orgánica
Proteínas C, H, O, N y S
Ácidos nucleicos C, H, O, N y P
Tomado de http://www.bioygeo.info/pdf/Bioquimica.pdf
Las biomoléculas inorgánicas son las que no están formadas por cadenas de
carbono e hidrógeno, como son el agua, las sales minerales o los gases. Las
moléculas orgánicas están formadas por cadenas de carbono
BIOMOLÉCULAS INORGÁNICAS
El agua es el líquido que más sustancias disuelve, por eso decimos que es el
disolvente universal. Esta propiedad, muy importante para la vida, se debe a la
polaridad de la molécula de agua y su capacidad para interaccionar con otras
sustancias que presenten grupos polares o con carga iónica (alcoholes, azúcares
con grupos -OH, aminoácidos y proteínas con grupos que presentan cargas
positivas y negativas), lo que da lugar a disoluciones moleculares. También las
moléculas de agua pueden disolver sustancias salinas que se disocian formando
disoluciones iónicas.
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Además del agua, existen otras biomoléculas inorgánicas como las sales minerales.
En función de su solubilidad en agua se distinguen dos tipos: insolubles y solubles.
Forman estructuras sólidas, que suelen tener función de sostén o protectora, como:
Funciones catalíticas. Algunos iones, como el Cu+, Mn 2+, Mg2+, Zn+,...actúan como
cofactores enzimáticos.
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Las biomoléculas son las moléculas constituyentes de los seres vivos. Los cuatro
bioelementos más abundantes en los seres vivos son el carbono (C), hidrógeno
(H), oxígeno (O) y nitrógeno (N), representando alrededor del 99 por ciento de la
masa de la mayoría de las células.
Los compuestos del carbono fabricados por los organismos vivos están divididos en
cuatro grandes grupos: carbohidratos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos. Estos
son distintos en sus propiedades físicas y químicas, pero los tres primeros son
similares metabólicamente, al menos, en el hecho de que son fuentes de energía
para los organismos. El rompimiento de las moléculas orgánicas complejas da como
resultado la liberación de energía
http://www.virtual.unal.edu.co/cursos/ciencias/2000024/lecciones/cap01/01_01_00.htm
4.- Permiten la posibilidad de que con pocos elementos se den una enorme variedad
de grupos funcionales (alcoholes, aldehídos, cetonas, ácidos, aminas, etc.)
con propiedades químicas y físicas diferentes.
GLÚCIDOS
LÍPIDOS
Con ácidos
grasos Moléculas formadas por la Diacilglicérido: la glicerina + dos ácido
(Saponificables) unión de: ácidos grasos + graso.
glicerina (Glicerol).
Ácido graso es saturado: todos los carbonos están unidos por enlaces simples.
CH3–(CH2)7–CH=CH– (CH2)7–COOH
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El extremo carboxilo del ácido graso es soluble en agua y muy polar; en cambio, la
cadena hidrocarbúrica es insoluble en agua y no polar. El extremo carboxilo
soluble queda incorporado al agua como una capa, quedando las colas de los
ácidos grasos fuera de la superficie del agua.
Fosfoglicéridos o glicerofosfolípidos
ROL BIOLÓGICO
FOSFOLÍPIDO
Los fosfolípidos son un tipo de lípidos antipáticos compuestos por una molécula
de glicerol, al que se le unen dos ácidos grasos (1,2-diacilglicerol) y un grupo fosfato.
FOSFOGLICÉRIDO
las cabezas polares en contacto con el agua y las colas hidrófobas "escondidas" y
enfrentadas entre si.
https://sites.google.com/a/ps.edu.pe/biologiaps/bioquimica/lipidos/clasificacion-de-los-
lipidos
http://www.edu.xunta.es/centros/iespuntacandieira/system/files/03_L%C3%ADpidos.pdf
EJEMPLOS DE FOSFOGLICÉRIDOS
PROTEÍNAS
Las proteínas son las biomoléculas que más diversidad de funciones realizan en los
seres vivos; prácticamente todos los procesos biológicos dependen de su presencia
y/o actividad.
Son proteínas casi todas las enzimas, catalizadores de reacciones metabólicas de
las células; muchas hormonas, reguladores de actividades celulares; la
hemoglobina y otras moléculas con funciones de transporte en la sangre; los
anticuerpos, encargados de acciones de defensa natural contra infecciones o
agentes extraños; los receptores de las células, a los cuales se fijan moléculas
capaces de desencadenar una respuesta determinada; la actina y la miosina,
responsables finales del acortamiento del músculo durante la contracción; el
colágeno, integrante de fibras altamente resistentes en tejidos de sostén.
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AMINOÁCIDO Y PROTEÍNAS
La información en las células reside en el genoma, que está formado por DNA
menos en el caso de algunos virus que es RNA. El DNA es donde se almacena la
información. El alfabeto del DNA con cuatro símbolos (nucleótidos) y él de proteínas
con 20 (aminoácidos) se denomina código genético. El código muestra que
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mediante una asignación en tripletas (64 posibles), de modo redundante, pero sin
ambigüedad es posible asignar un código para cada uno de los 20 aminoácidos.
El código genético que posibilita la traducción libre de ambigüedad del lenguaje del
DNA al de las proteínas, requiere de reconocimientos estructurales específicos
(información analógica) entre aminoácidos y RNA de transferencia (t-RNA) y entre
aminoacil-RNA-sintetasas (aa-rnasa) y t-RNA y entre aquellas y aminoácidos.
El Código Genético
http://www.scientificpsychic.com/fitness/aminoacidos1.html
= ó ó
= í ,
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Ahora conocemos que la información genética puede fluir del RNA a ADN
En los ácidos nucleicos nunca están sin sustituir. Todas la bases tienen grupos que
pueden formar puentes de hidrógeno con más facilidad que la purina y la pirimidina.
En el DNA las purinas serán adenina y guanosina mientras que las pirimidinas serán
timina y uracilo. En el RNA las purinas son las mismas pero las pirimidinas serán
uracilo y citosina pero nunca timina. Las bases nitrogenadas se unen mediante un
enlace N-glicosídico. El N es el 1-pirimidinas y el 9-purinas.
Base nitrogenada + azúcar → nucleósido + P → nucleótido
El P siempre está en el carbono 5´ del azúcar. Los nucleótidos pueden tener más
de un grupo P.
Molécula de adenina del DNA
CH2 unido a ribosa y ésta a una base
Estas formas existen libres en la naturaleza y son muy importantes para la célula.
Al enlace que une P con otro átomo se le llama fosfoanhidro. Si las base en la
adenina tendremos AMP, ADP ó ATP respectivamente. Todos los nucleótidos de la
misma cadena están orientados de la misma forma y se une el 3´ de un nucleótido
con el 5´ del siguiente. Al principio siempre habrá un P libre (5´) y al final un OH (3´).
Se representan siempre en dirección 5´ → 3´,que es la dirección en que se
sintetizan. El enlace que une dos nucleótidos es fosfodiéster y el esqueleto es muy
regular, siendo lo único que varía las bases. Esta secuencia de bases es la que
recoge el código genético.
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El fosfato tiene pKa ≈1 por lo que a pH fisiológico estará disociado, por lo que habrán
cargas negativas que no estarán desestabilizando porque están asociadas a cargas
positivas casi siempre. Como la estructura ha de abrirse para llevar a cabo sus
funciones, la molécula de DNA podrá desnaturalizarse (separación de las dos
cadenas). Esto se consigue cuando la temperatura sube (temperatura de fusión). A
esta temperatura encontraremos 50% de doble hélice y 50% de cadena sencilla.
Cuanto mayor sea la cantidad de citosina y timina mayor será la temperatura de
fusión porque habrá que romper más puentes de hidrógeno.
Al formarse la doble hélice aparecen unos surcos que serán de dos tipos:
Estos surcos son importantes porque a través de ellos se pueden ver las bases.
> DNA-A: cuando el DNA está en condiciones de deshidratación. Es más ancha (11
nucleótidos por vuelta). Tiene un hueco en el centro porque las bases están un poco
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> DNA-Z: doble cadena enrollada a la izquierda de 12 residuos por vuelta. Aparece
cuando en la cadena hay citosina y timina alternadas y siempre en cortos
fragmentos.
Estructura del RNA
En las bacterias el DNA es de doble hélice y circular, uniendo los extremos 5´ y 3´.
En las células eucariotas existe en las mitocondrias y cloroplastos. Tiene una
propiedad muy importante y es que se puede superenrollar, lo que se podría
considerar como estructura terciaria. Hay 2 tipos de superenrollamiento:
Se enrolla sobre sí misma tantas veces como le demos vueltas o se las quitemos.
Cuando no está superenrollado se dice que está relajado. La forma relajada siempre
está en un plano.
Procariotas
El genoma de un virus puede estar formado por DNA ó RNA y con cualquier
combinación. En general las bacterias tienen DNA de doble cadena cerrada y los
eucariotas doble cadena de DNA abierta. El genoma es el conjunto de material
genético. Todos los genes están en la misma molécula. El tamaño del genoma
puede ser de unos 5000 genes y 106 pares de bases. De estos genes sólo algunos
estarán repetidos y estos codificarán para un mismo RNA. La mayor parte de los
pares de bases tienen significado. Esto sería el cromosoma de la bacteria que en
una bacteria está superenrollado para que ocupe un espacio menor, pero no lo
veremos circular. Aparte existen otras pequeñas moléculas de DNA llamadas
plásmidos. Son circulares y no llevan incorporadas proteínas esenciales, en muchos
casos incorporan resistencias a los antibióticos.
En procariotas es muy frecuente que las proteínas que trabajan juntas tengan
coordinada su expresión. La forma de expresión es el operón, y si se expresan
conjuntamente es porque se expresan con un único mensajero. A los mensajeros
con más de una información se les llama policistrónicos. Es muy frecuente en
procariotas pero rarísimo en eucariotas.
Eucariotas
En el genoma de los eucariotas no todos los genes están en la misma molécula sino
en varias llamadas cromosomas. El número de genes es mucho mayor al igual que
el tamaño. Molécula de DNA lineal. Muchos más genes repetidos aunque los
policistrónicos no suelen aparecer. Tiene zonas codificadas que no sirven para nada
y en algunos casos están muy repetidas. Los exones es lo que se expresa y los
intrones lo que no. Los intrones pueden ser eliminados con facilidad obteniendo así
la proteína final.
El DNA está formado por cromatina, asociado a proteínas siendo mayoría las
histonas, que tienen cargas positivas por lo que se enlazarán al DNA que tiene
negativas. La cromatina estará difusa en el núcleo y cuando se va a dividir se
compacta y se pueden ver bien los cromosomas.
Tipos de histonas: Hay 5 tipos: H1, H2A, H2B, H3 Y H4. Se organizan formando un
octámero sobre el que se enrolla el DNA. Al octámero de histonas rodeado por 2
vueltas y pico de DNA se le conoce como nucleosoma y el DNA que hay entre
nucleosomas es el DNA espaciador. A la H1 se le llama sellando del nucleosoma.
Forman una especie de collar de perlas.
Estructura del gen
Un gen es una unidad de expresión y siempre dará lugar a un RNA. Algunos RNA
dan lugar a proteínas (mRNA 6%), otros funcionan como RNA en la célula (rRNA
80%), tRNA (15%) y 5nRNA (RNA del núcleo, muy pequeño, algunos con función
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catalítica y otros que no se sabe bien su utilidad). El proceso por el cual se obtiene
RNA es la transcripción. El lugar donde se inicia la transcripción es el promotor.
Asociado a cada gen hay elementos reguladores que tienen que estar delante del
promotor y constan de dos partes:
- Una proteína.
http://www.fisicanet.com.ar/quimica/q2_bioquimica.php
http://www.fisicanet.com.ar/quimica/bioquimica/ap07_adn.php
http://www.fisicanet.com.ar/quimica/bioquimica/ap07_adn.php
Flujo de información: es siempre unidireccional.
Grupos funcionales
El carbono puede formar hasta cuatro enlaces con otros átomos (cada enlace
representa uno de los electrones del carbono y uno de los electrones del átomo que
se enlazan).
La diversidad de los productos químicos orgánicos se debe a la infinidad de
opciones que brinda el carbono para enlazarse con otros átomos. Los químicos
orgánicos más simples, llamados hidrocarburos, contienen sólo carbono y átomos
de hidrógeno; el hidrocarburo más simple (llamado metano) contiene un solo átomo
de carbono enlazado a cuatro átomos de hidrógeno.
GRUPOS FUNCIONALES
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FUNCIONES OXIGENADAS
Las funciones oxigenadas son las que contienen, además de átomos de carbono
y de hidrógeno, átomos de oxígeno
Compuesto Descripción Se nombran Ejemplo
ALCOHOLES Un alcohol es un Los alcoholes que 2-Hexanol (Hexan-2-ol)
CH3CHOHCH2CH2CH3
(R – OH) compuesto que contienen sólo un grupo –
contiene uno o más OH se nombran añadiendo
grupos hidroxilos (-OH) la terminación –ol al nombre
enlazados a un radical del hidrocarburo
carbonado R correspondiente del cual
deriva.
ÉTERES los éteres son los éteres se nombra la Metoxietano (Etil metil éter)
CH3 OCH2 CH2CH3
(R – O – R´) derivados de los cadena más sencilla unida
alcoholes en los que el al oxígeno (RO-) terminada
hidrógeno del grupo – en –oxi (grupo alcoxi)
OH es reemplazado seguido del nombre del
por un radical R´ hidrocarburo que
corresponde al otro grupo
sustituyente
ALDEHÍDOS En los aldehídos, el Se elige como cadena 2-Metilpentanal
CH3 CH2 CH2CH(CH3)CHO
(R –CHO) grupo carbonilo (C=O) principal la cadena más
se encuentra unido a larga que contenga al grupo
un radical R y a un –CHO. Si se encuentra
hidrógeno. alguna instauración (doble o
triple enlace) se elegirá
como cadena principal la
que contenga al grupo –
CHO y la citada
instauración. El nombre del
compuesto se obtiene
añadiendo al nombre del
compuesto que constituye
la estructura principal la
terminación –al
CETONAS En las cetonas el grupo Se obtiene añadiendo la 2-Hexanona (Hexan-2-ona)
CH3COCH2 CH2 CH2CH3
(R – CO – R´) principal es también el terminación –ona al nombre
grupo carbonilo (C=O), del compuesto que
pero a diferencia de los constituye la estructura
aldehídos no es un principal.
grupo terminal Cuando el grupo carbonilo
se encuentra como grupo
sustituyente en una cadena
y no es el grupo principal,
entonces se nombra con el
prefijo –oxo
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AMINAS Las aminas son los Las aminas pueden ser Pentanamina (Pentan-2-
amina)
(R – NH2) derivados orgánicos primarias, secundarias y
CH3CH(NH2)CH2 CH2CH3
del amoniaco, donde terciarias según presenten
uno o más grupos uno, dos o tres radicales R
alquilo o arilo están unidos al átomo de
unidos al átomo de nitrógeno.
nitrógeno. Como clase,
las aminas
comprenden algunos
de los compuestos
biológicos más
importantes que se
conocen
AMIDAS Las amidas son En todas las proteínas, tanto Etanamida (Acetamida)
derivadas de los ácidos animales como vegetales, el CH3CONH2
(R- CO –
que se forman a partir de grupo amida se encuentra
NH2) la combinación de un repetido miles de veces en
ácido con amoniaco o forma de cadenas
con una amina, las
proteínas tienen la Se trata de un grupo terminal
estructura de amidas
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complejas, de cadena
larga
NITRILOS El grupo –CN es Los nitrilos se añade el Propanonitrilo (Cianuro de
etilo)
(R – CºN) terminal, por lo que sufijo –nitrilo al nombre del CH3 CH2CN
debe ir en el extremo hidrocarburo
de la cadena. correspondiente a la
cadena carbonada.
http://www.gobiernodecanarias.org/educacion/3/usrn/lentiscal/1-cdquimica-
tic/ficherosq/apuntesformulacionOrganica.htm#alcanos
http://www.uam.es/departamentos/ciencias/qorg/docencia_red/qo/l1/gfunc.html
alquenos CH3CH=CH2
Propeno
(homo)
aromáticos
Tolueno
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(hetero)
aromáticos
3-Metilpiridina
alquinos CH3-CC-CH3
2-Butino
haluros de CH3-CH2-Br
-halógeno
alquilo Bromuro de etilo
alcoholes CH3-CH2-OH Etanol
-OH
fenoles Ph-OH Fenol
aminas CH3-NH2
-NH2
primarias Metilamina
aminas (CH3)2NH
-NH-
secundarias Dimetilamina
aminas (CH3)3N
terciarias Trimetilamina
boranos (CH3)3B
Trimetilborano
CH3Li Metillitio
-metal
organometálicos (CH3)2Mg Dimetilmagnesio
(Li, Mg, Al, etc.)
(CH3)3Al Trimetilalano
aldehídos
Etanal
cetonas
Propanona
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iminas
Metilimina de la
propanona
ácidos
carboxílicos
Ácido acético
ésteres
Acetato de etilo
amidas
Acetamida
haluros de acilo
anhídridos
Cloruro de acetilo Anhídrido
acético
CH3CN
nitrilos -CN Acetonitrilo
ácidos CH3CH2CH2SO2OH
-SO2-OH
sulfónicos Ácido propanosulfónico
Una vez reconocidos los grupos funcionales que contiene una molécula hay que
determinar cuál es la función principal, según el siguiente orde
Las aminas pueden ser primarias, secundarias y terciarias según presenten uno, dos o tres radicales
R unidos al átomo de nitrógeno. Para nombrar las aminas primarias (R – NH2) se puede proceder de
dos formas.
Una consiste en considerar el grupo R como un alcano al cual se le añade la terminación – amina.
En este caso hay que buscar para el grupo –NH2 el localizador más bajo posible. La segunda forma
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Para nombrar las aminas secundarias (R1 – NH – R2) y terciarias (R1 – NR2R3) se toma como
estructura principal aquella que contenga un radical R con mayor prioridad de acuerdo con los
criterios de selección de cadena principal ya vistos y para indicar que los otros radicales se unen al
nitrógeno se utiliza la letra N seguido del nombre del radical correspondiente.
También se pueden nombrar las aminas secundarias y terciarias indicando los nombres de todos los
radicales sustituyentes seguidos del sufijo –amina.
Si existen dos grupos –CHO se elegirá como cadena principal la que contiene a
dichos grupos y se nombran de igual manera que en el caso anterior finalizando
con el sufijo –dial y si además hay presentes instauraciones se les debe asignar
los localizadores más bajos. Cuando el grupo –CHO, siendo el grupo principal, se
encuentra unido a un sistema cíclico el nombre se formará indicando el sistema
cíclico seguido de la terminación –carbaldehído.
Los hidrocarburos simples son compuestos orgánicos que sólo contienen carbono
e hidrógeno. Estos hidrocarburos simples vienen en tres variedades (llamadas
alcanos, alquenos y alquinos) dependiendo del tipo de enlace carbono-carbono
(sencillo, doble o triple) que ocurre en la molécula.
Alcanos
He aquí los nombres y los prefijos para los primeros diez alcanos.
Átomos
Nombre de Fórmula
de Prefijo Fórmula semidesarrollada
alcanos Química
carbono
1 Meth Metano CH4 CH4
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http://www.profesorenlinea.cl/Ciencias/Biomoleculas.html
http://www.profesorenlinea.cl/Quimica/grupos_funcionales.html
Funciones oxigenadas
A continuación, un cuadro resumen de los grupos funcionales (con su correspondiente función química)
donde participan átomos de carbono, hidrógeno y oxígeno.
Grupo Función o
Fórmula Estructura Prefijo Sufijo
funcional compuesto
Grupo alcoxi (o
Éter R-O-R' -oxi- R-il R'-il éter
ariloxi)
-al
Aldehído R-C(=O)H oxo-
-carbaldehído
Grupo carbonilo
R-C(=O)-
Cetona oxo- -ona
R'
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Importante:
Nótese que en las funciones alcohol y éter hay sólo enlaces sencillos (de la forma C – O), en cambio en todas
las otras funciones oxigenadas hay enlaces dobles (de la forma C = O). Este aspecto es muy importante para
definir el número de átomos de hidrógeno que tiene algún compuesto químico. (Ver: PSU: Química,
Pregunta 08_2005).
Funciones nitrogenadas
A continuación, un cuadro resumen de los grupos funcionales (con su correspondiente función) donde
participan átomos de carbono, hidrógeno y nitrógeno.
Grupo
Función o
funciona Fórmula Estructura Prefijo Sufijo
compuesto
l
Grupo
amino
Imina R-NCR2 _ _
Grupos
R-
amino
Amida C(=O)N( _ _
y
-R')-R"
carbonilo
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Grupo nitro
alquil isocianur
Isocianuro R-NC _
Grupo o
nitrilo
Grupo R-N=N-
Azoderivado azo- -diazeno
azo R'
R1R2N-
_ Hidrazina _ -hidrazina
NR3R4
-
_ Hidroxilamina -NOH _ hidroxilamin
a
Funciones halogenadas
A continuación, un cuadro resumen de los grupos funcionales donde participan átomos de carbono,
hidrógeno y elementos halógenos.
Fórmula del
Tipo de compuesto Prefijo Sufijo
Grupo funcional compuesto
http://organica.fcien.edu.uy/gf/nitrilos.htm
http://corinto.pucp.edu.pe/quimicageneral/contenido/72-grupos-funcionales.html
Las enzimas son el medio por el cual los organismos canalizan el flujo de energía y
materia. Son proteínas específicas que catalizan las reacciones químicas que tienen
lugar en las células —metabolismo celular—, acelerándolas hasta hacerlas casi
instantáneas, sin consumirse. Sin la acción catalítica de los enzimas, las reacciones
químicas serían tan lentas que el metabolismo celular no podría desarrollarse.
Las enzimas contienen una superficie de unión denominada sitio activo, los
sustratos se unen al sitio activo de las enzimas, que en general es una pequeña
hendidura o grieta en una molécula proteínica grande. Sin embargo, el sitio activo
no es sólo el lugar de unión. Varias de las cadenas laterales de los aminoácidos que
se encuentran en este sitio participan de forma activa en el proceso catalítico.
Estos catalizadores se llamaron enzimas (de términos griegos que signifi can “en
levaduras”). Las enzimas son los mediadores del metabolismo, encargados de
todas las reacciones que ocurren en una célula. Sin las enzimas, las reacciones
metabólicas se producirían con tanta lentitud que serían imperceptibles.
La primera evidencia de que las enzimas son proteínas la obtuvo James Sumner de
la Cornell University en 1926, cuando cristalizó la enzima ureasa a partir de las
semillas de Canavalia ensiformis e identificó su composición.
Una reacción química ocurre cuando las moléculas que chocan poseen una
cantidad mínima de energía denominada energía de activación (Ea) o en bioquímica,
energía libre de activación (ΔGǂ).
Las enzimas las sintetizan los seres vivos. Son proteínas que poseen un efecto
catalizador al reducir la barrera energética de ciertas reacciones químicas. Actúan
en pequeñas cantidades y su producción está directamente controlada por genes.
1. Tamaño. Las enzimas son proteínas o ácidos nucleicos, más grandes que los
substratos, grupos funcionales. Las enzimas tienen pesos moleculares (desde
12,000 a 1 millón de Daltons)
2. Especificidad. La mayoría de las enzimas son específicas de los substratos que
usan y las reacciones que catalizan. La ureasa tiene como sustrato la urea; la
glucoquinasa, la glucosa, etc.
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CLASES DE ENZIMAS
Clases de Enzimas
El nombre de las enzimas es el del sustrato + el sufijo: -asa. Los nombres de las
enzimas revelan la especificidad de su función:
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Ejemplo: Deshidrogenasas.
Transferasas Transfieren grupos activos (obtenidos de la ruptura de ciertas moléculas) a
otras sustancias receptoras. Suelen actuar en procesos de interconversión de
monosacáridos, aminoácidos, etc.
Ejemplo: epimerasas.(mutasa)
Liasas Catalizan reacciones en las que se eliminan grupos (H2O, CO2 y NH3) para
formar un doble enlace o añadirse a un doble enlace, capaces de catalizar la
reducción en un sustrato. En la parte de enzimas Sustrato es una molecula que
sobre actua en una enzima, el sustrato se une al sitio activo de la enzima, y se
forma un complejo enzima-sustrato. El sustrato por acción de la enzima es
transformado en producto y es liberado del sitio activo, quedando libre para
recibir otro sustrato.
Las enzimas proteicas, son proteínas globulares con actividad catalítica, que puede
ser conjugadas o necesitar de cofactores. La apoenzima es la parte proteica de
una enzima, desprovista de los cofactores o coenzimas que puedan ser necesarios
para que la enzima sea funcionalmente activa. La apoenzima es catalíticamente
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ACTIVADORES ENZIMÁTICOS
ACTIVADORES ENZIMÁTICOS
Algunas enzimas necesitan para su actividad iones inorgánicos específicos que reciben el
nombre de activadores o cofactores. Los activadores que se necesitan con más frecuencia
son los iones de hierro, cobre, manganeso, magnesio, cobalto y zinc.
LOS COFACTORES
http://www.coenzima.com/coenzimas_nad_y_nadh
4. Holoenzimas. Son las enzimas conjugadas que tiene actividad catalítica alta
porque están unidas a su coenzima o cofactor.
http://www.bionova.org.es/biocast/tema14.htm
LAS ISOENZIMAS
Las isoenzimas se definen como enzimas que cumplen la misma función pero
difieren ligeramente en su estructura primaria y por lo tanto, en su carga eléctrica.
Isoenzima se definen “como cualquiera de dos o más variantes de una enzima
particular (con propiedades catalíticas semejantes) cuyas secuencias de
aminoácidos están codificadas en genes alélicos estructurales.
4.En el mismo individuo y en el mismo tejido, pero en diferentes fases del desarrollo,
como es el caos de la Piruvato quinasa (EC 2.7.1.40), de la que se conocen dos
formas la fetal y la adulta.
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INHIBIDOR ENZIMÁTICO
La actividad de una enzima puede ser disminuida o eliminada completamente por
la acción de ciertas sustancias a las cuales se las conoce con el nombre genérico
de inhibidores enzimáticos. Encontrados en la naturaleza y también son diseñados
y producidos como parte de la farmacología y la bioquímica. Los venenos naturales
son inhibidores enzimáticos que han evolucionado para defender a la planta o
animal contra depredadores. Los inhibidores artificiales como medicamentos, o
insecticidas como el malathion, herbicidas como el glifosato, o desinfectantes como
el triclosán
Los inhibidores enzimáticos también son usados en la naturaleza y están implicados
en la regulación del metabolismo. Por ejemplo, las enzimas en una ruta metabólica
pueden ser inhibidas por los productos resultantes de sus respectivas rutas. Este
tipo de retroalimentación negativa retarda el flujo a través de la ruta cuando los
productos comienzan a acumularse y es una manera importante de mantener la
homeostasis en una célula
La inhibición enzimática tiene gran importancia, en los procesos metabólicos, en
farmacología, por el uso de medicamentos con acciones inhibitorias y toxicología en
el desarrollo de herbicidas e insecticidas.
Los inhibidores pueden clasificarse en dos grandes grupos:
1) Irreversibles.
Los inhibidores irreversibles usualmente modifican una enzima covalentemente, y
por lo tanto la inhibición no puede ser invertida. Los inhibidores irreversibles + la
enzima = enlaces covalente y modifican su estructura química a nivel de residuos
esenciales de los aminoácidos necesarios para la actividad enzimática.
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Las posibles formas de reaccionar del sustrato y el inhibidor con la enzima pueden
presentarse por las ecuaciones:
En este caso, las posibles formas de reaccionar del sustrato y el inhibidor con la
enzima se representan por las ecuaciones siguientes no puede ser revertido por un
aumento de la concentración de sustrato. El sustrato no puede desplazar al inhibidor
unido a la enzima. Experimentalmente ambos tipos de inhibición pueden distinguirse
fundamentalmente mediante la aplicación del método de Lineweaver y Bur
Enzimas alostéricas
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Las enzimas alostéricas tienen por lo general una estructura proteica más compleja
que la de las enzimas no regulables, están constituidas por subunidades. Además
pueden responder a la acción de más de un efector alostérico (positivos y
negativos), en cuyo caso poseen en su estructura un sitio alostérico distinto para
cada uno de ellos.
Desde ese punto de vista las enzimas alostéricas pueden clasificar en tres grandes
grupos:
a) Homotróficas: el mismo sustrato puede actuar como modulador, generalmente
positivo.
b) Heterotróficas: moduladas positiva o negativamente por sustancias distintas del
sustrato para cada una de las cuales la enzima posee un sitio específico de
reconocimiento.
c) Homotróficas-heterotróficas: responden a efectos regulatorios del mismo
sustrato y de sustancias distintas del mismo.
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LA CINÉTICA ENZIMÁTICA
CINÉTICA ENZIMÁTICA
k1 Activado K2
E+S [ES] E+P
k-1
K= constante de velocidad.
E= Enzima.
ES= unión el sito activo de la enzima al sustrato
P= Producto
[ ]= Concentración
La enzima se une al sustrato para formar un complejo que alcance el estado activado y luego
puede descomponerse para formar nuevamente sustrato más enzima sin cambio alguno o bien
puede descomponerse para formar enzima y producto. La enzima queda finalmente inalterada
ya que es solo un catalizador.
Por lo tanto la Ecuación de Michaelis-Menten está formada por dos rectas (Fig. 19
- 4) donde la velocidad es proporcional a la concentración de substrato y la otra en
que la velocidad es independiente de la concentración de sustrato durante la
saturación total de la enzima.
Debido a que la ecuación de Michaelis - Menten representa una curva, el cálculo de
Km y Vm para cada enzima se hace complejo y se necesitan muchos puntos para
determinar los valores con exactitud. De esta manera se hizo un arreglo matemático
por la dupla Lineweaver-Burk para convertir la curva en una recta, que solo puede
ser definida por al menos 2 puntos (Fig. 20b - 4), comparada a la Michaelis-Menten
(Fig. 20a-4) que necesita muchos puntos de definición. De esta manera se cambió
la expresión, pero no el análisis y se hizo mucho más fácil la determinación gráfica
de Km y Vmáx.
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Bibliografía
Lehninger. Principios de Bioquímica, 4ª ed. D.L. Nelson y M. M. Cox. Ediciones
Omega, S.A. 2006