eplicación de ADN

Replicación de ADN. La doble hélice es desenrrollada y cada hebra hace de plantilla para la síntesis de
la nueva cadena. El ADN polimerasa añade los nucleótidos complementarios a los de la cadena original.

El proceso de replicación de ADN es el mecanismo que permite al ADN duplicarse (es decir,
sintetizar una copia idéntica). De esta manera de una molécula de ADN única, se obtienen dos
o más "réplicas" de la primera. Esta duplicación del material genético se produce de acuerdo
con un mecanismo semiconservador, lo que indica que los dos polímeros complementarios
del ADN original, al separarse, sirven de molde cada una para la síntesis de una nueva
cadena complementaria de la cadena molde, de forma que cada nueva doble hélice contiene
una de las cadenas del ADN original. Gracias a la complementación entre las bases que
forman la secuencia de cada una de las cadenas, el ADN tiene la importante propiedad de
reproducirse idénticamente, lo que permite que la información genética se transmita de una
célula madre a las células hijas y es la base de la herencia del material genético.
La molécula de ADN se abre como una cremallera, por ruptura de los puentes de
hidrógeno entre las bases complementarias en puntos determinados: los orígenes de
replicación. Las proteínas iniciadoras reconocen secuencias de nucleótidos específicas en
esos puntos y facilitan la fijación de otras proteínas que permitirán la separación de las dos
hebras de ADN formándose una horquilla de replicación. Un gran número
de enzimas y proteínas intervienen en el mecanismo molecular de la replicación, formando el
llamado complejo de replicación o replisoma. Estas proteínas y enzimas son homólogas
en eucariotas y arqueas, pero difieren en bacterias.

Índice
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 1Características generales del ADN
 2Semiconservadora
 3Secuencial y bidireccional desde puntos fijos
o 3.1El origen de replicación
o 3.2Secuencialidad
o 3.3La replicación avanza en forma de horquilla
o 3.4Bidireccionalidad
 4Semidiscontinua
 5ADN Polimerasas
 6Modo de operación
 7Proceso general
o 7.1Iniciación
o 7.2Elongación
o 7.3Terminación (de los genomas lineales)
 8Véase también
 9Notas
 10Referencias
 11Bibliografía
 12Enlaces externos

Características generales del ADN[editar]

 Es una cadena molecular, quiere decir que es una sustancia constituida por distintos tipos
de moléculas sencillas ligadas entre sí para así ir formando cadenas.
 Es bastante largo y extremadamente delgado. Si aumentáramos cien veces el tamaño del
núcleo celular alcanzaría el tamaño de la punta de un alfiler, mientras que el ADN plegado
en ese mismo núcleo alcanzaría la longitud de un campo de fútbol.
 Hay cuatro tipos de eslabones, esos son las moléculas denominadas nucleótidos en la
cadena. Sus nombres son: ácido adenílico (adenina), ácido guanílico (guanina), ácido
citidílico (citosina) y ácido timidílico (timina) y las abreviaturas, A, G, C, T, para cada una.

Semiconservadora[editar]

Tres posibles modelos de replicación. a) Conservadora, b) Dispersora, c) Semiconservadora

(mecanismo real).

En cada una de las moléculas hijas se conserva una de las cadenas originales, y por eso se
dice que la replicación del ADN es semi conservadora. Hasta que finalmente se pudo
demostrar que la replicación es semiconservadora, se consideraron tres posibles modelos
para el mecanismo de la replicación:
 Semiconservadora (modelo correcto). En cada una de las moléculas hijas se conserva
una de las cadenas originales.
 Conservadora. Se sintetiza una molécula totalmente nueva, copia de la original.
 Dispersora, o dispersante. Las cadenas hijas constan de fragmentos de la cadena antigua
y fragmentos de la nueva.

Experimento de Meselson y Stahl.

El experimento de Meselson y Stahl en 1958 permitió demostrar que el mecanismo real se

ajusta a la hipótesis de replicación semiconservadora. Para ello se hicieron crecer células
de Escherichia coli en presencia de nitrógeno-15, un isótopo del nitrógeno más pesado de lo
habitual. En consecuencia, el isótopo se incorporó a las cadenas de ADN que se iban
sintetizando, haciéndolas más pesadas.
Una vez conseguido el primer objetivo, las células fueron transferidas a un medio que
contenía nitrógeno-14, es decir, un medio más ligero, donde continuaron su crecimiento
(división celular, que requiere la replicación del ADN). Se purificó el ADN y se analizó
mediante una centrifugación en gradiente de cloruro de cesio, en donde hay más densidad en
el fondo del tubo que en la parte media del mismo.
En la primera generación (figura 2.b) se obtuvo una única banda de ADN con densidad
intermedia. En la segunda generación (figura 2.c) se obtuvieron dos bandas, una con densidad
ligera y otra con densidad intermedia o híbrida. En la tercera generación se obtuvieron dos
bandas, una ligera (con una abundancia del 75 %) y otra intermedia (con el 25 % restante).
La banda intermedia o híbrida representa una molécula de ADN que contiene una cadena
pesada (original) y otra ligera (recién sintetizada). Las cadenas ligeras representan una
molécula de ADN en la que las dos cadenas han sido sintetizadas (no existían aún cuando las
células se pusieron en presencia de nitrógeno-15).
El hecho de que cada vez haya más moléculas ligeras y se mantenga el número de moléculas
intermedias demuestra que la replicación del ADN es semiconservadora. Si fuera
conservadora, aparecería siempre una banda pesada y el resto ligeras (figuras 1.a, 1.b, 1.c) .
Si fuera dispersante sólo aparecerían bandas híbridas de densidad intermedia en todas las
generaciones.1

Secuencial y bidireccional desde puntos fijos[editar]

Los orígenes de replicación son los puntos fijos a partir de los cuales se lleva cabo la
replicación, que avanza de forma secuencial formando estructuras con forma de horquilla. Por
otro lado, la replicación se lleva a cabo bidireccionalmente, es decir, a partir de cada origen se
sintetizan las dos cadenas en ambos sentidos.
El origen de replicación[editar]
La cantidad de ADN que se puede sintetizar a partir de un único origen de replicación se
denomina replicón o unidad funcional de replicación. El genoma bacteriano es un replicón
único circular. En organismos eucarióticos, la replicación del ADN se inicia en múltiples
orígenes a la vez (hay uno cada 20 kb aproximadamente), es decir, hay varios replicones.2

En las células eucariotas hay varios replicones.

Experimento de Cairns.

Los experimentos realizados por Cairns (1963) con bacterias Escherichia coli permitieron
determinar la existencia de ese punto fijo u origen de replicación a partir del cual el genoma
empezaba a replicarse. Los experimentos consistían en mantener un cultivo de E.
coli creciendo en un medio que contenía timidina tritiada (timina marcada con tritio), de forma
que el ADN quedara marcado radiactivamente pudiendo efectuarse una autorradiografía. A
continuación se observaba al microscopio. Los resultados indicaban que la replicación en E.
coli se iniciaba en un punto concreto (OriC).3
Secuencialidad[editar]
Sueoka y Yoshikawa (1963) realizaron estudios genéticos de complementación
de mutaciones que permitieron determinar que desde los orígenes la replicación avanza de
forma secuencial. Trabajaron con Bacillus subtilis porque era posible obtener cultivos
sincronizados de forma que todas las células del cultivo estuvieran en la misma fase del ciclo
celular. El método consistía en la conjugación bacteriana de cepas silvestres con cepas
mutantes incapaces de sintetizar determinados aminoácidos. Conociendo la localización de
los genes que codifican las proteínas implicadas en la síntesis de los diferentes aminoácidos
en el cromosoma bacteriano, y haciendo crecer las bacterias receptoras en un "medio mínimo"
(donde sólo pudiesen crecer las que hubieran recibido alguno de estos genes), al extraer ADN
a diferentes tiempos se observó que, tras la última extracción aparecía con mayor frecuencia
el gen implicado en la síntesis de uno de los aminoácidos (el correspondiente a la "posición
1"), que el gen adyacente implicado en la síntesis de otro aminoácido ("posición 2"). De la
misma forma, el gen que ocupaba la "posición 3" aparecía con menor frecuencia que el que
ocupaba la "posición 2", y así sucesivamente.
Como los primeros genes en replicarse en la bacteria donadora serían los primeros en
transferirse, el experimento permitió demostrar, a partir de las frecuencias relativas de los
diferentes genes en las bacterias receptoras, que la replicación sigue un orden (es
secuencial).
La replicación avanza en forma de horquilla[editar]
Debido a que en la célula ambas cadenas de la doble hélice de ADN se duplican al mismo
tiempo, éstas deben separarse para que cada una de ellas sirva de molde para la síntesis de
una nueva cadena. Por eso, la replicación avanza con una estructura en forma
de horquilla formándose una burbuja u ojo de replicación (también llamada estructura θ
cuando el ADN es circular debido a la similaridad entre la letra griega y la forma que adopta el
cromosoma bacteriano en estados intermedios de replicación, no obstante pudiendo aparecer
estructuras alternativas),3 que avanza en dirección a la región de ADN no duplicado dejando
atrás los dos moldes de ADN de cadena simple donde se está produciendo la replicación.2
Bidireccionalidad[editar]
El movimiento de la horquilla es bidireccional en la mayoría de los casos, es decir, a partir de
un punto se sintetizan las dos cadenas en ambos sentidos. Esto ocurre en la mayoría de los
organismos, pero se dan excepciones en algunos procariontes debido a que los mecanismos
de replicación que tienen lugar dependen de la propia estructura de su material hereditario (si
el ADN es circular, lineal, bicatenario o monocatenario).3 Así, en casos particulares como
el ADN mitocondrial, algunos plásmidos y algunos genomas monocatenarios
de fagos pequeños, la replicación se da unidireccionalmente pudiendo haber uno o dos
orígenes de replicación.
Distinción entre la replicación unidireccional y la bidireccional mediante el recuento de copias de genes
marcadores. O es el origen de replicación y A, B, C, D, E son genes marcadores.

En la mayoría de los casos la replicación es bidireccional.

No obstante, la replicación se puede considerar, de forma general, bidireccional.
La evidencia experimental del crecimiento bidireccional de la hebra de ADN viene dada por
una técnica basada en el marcaje radiactivo del ADN usando timidina marcada con tritio.
Primero se añade timidina sin marcar y luego marcada con tritio; siguiendo el rastro de tritio se
observa hacia dónde se ha replicado la molécula de ADN.3 También se puede, mediante el
recuento de copias de genes marcadores, determinar si la replicación es unidireccional o
bidireccional. Otras técnicas se basan en medir la distancia desde los ojos de replicación
hasta los extremos de un ADN lineal (o circular convertido en lineal mediante enzimas de
restricción).

Semidiscontinua[editar]
La replicación es semidiscontínua.

La replicación siempre se produce en sentido 5' → 3', siendo el extremo 3'-OH libre el punto a
partir del cual se produce la elongación del ADN. Esto plantea un problema, y es que las
cadenas tienen que crecer simultáneamente a pesar de que son antiparalelas, es decir, que
cada cadena tiene el extremo 5' enfrentado con el extremo 3' de la otra cadena. Por ello, una
de las cadenas debería ser sintetizada en dirección 3' → 5'.
Este problema lo resolvieron los científicos japoneses Reiji Okazaki y Tsuneko Okazaki en la
década de 1960, al descubrir que una de las nuevas cadenas de ADN se sintetiza en forma de
trozos cortos que, en su honor, se denominan fragmentos de Okazaki. Su longitud suele variar
entre 1000 y 2000 nucleótidos en las bacterias y entre 100 y 400 nucleótidos en eucariontes.
La cadena que se sintetiza en el mismo sentido que avanza la horquilla de replicación se
denomina hebra adelantada (en inglés, leading strand, que a veces se traduce por líder o
conductora) y se sintetiza de forma continua por la ADN polimerasa, mientras que la que se
sintetiza en sentido contrario al avance se denomina hebra rezagada o retrasada (en
inglés, lagging strand), cuya síntesis se realiza de forma discontinua teniendo que esperar a
que la horquilla de replicación avance para disponer de una cierta longitud de ADN molde.2

ADN Polimerasas[editar]
Artículo principal: ADN polimerasa

Este artículo o sección necesita referencias que aparezcan en una publicación

acreditada.
Este aviso fue puesto el 14 de julio de 2009.
Estructura en 3D de un ADN polimerasa.

El ADN polimerasa es la enzima que cataliza la síntesis de la nueva cadena de ADN a partir
de desoxirribonucleótidos y de la molécula de ADN plantilla o molde que es la que será
replicada. La enzima copia la cadena de nucleótidos de forma complementaria
(A por T, C por G) para dar a cada célula hija una copia del ADN durante la replicación.

Modo de operación[editar]
En cada horquilla de replicación, el ADN polimerasa y otras enzimas sintetizan dos nuevas
cadenas de ADN que son complementarias respecto a las dos cadenas originales. Durante
este proceso, el ADN polimerasa reconoce una base nucleotídica no apareada de la cadena
original y la combina con un nucleótido libre que tiene la base complementaria correcta.
Luego, el ADN polimerasa cataliza la formación de nuevos enlaces covalentes que ligan el
fosfato del nucleótido libre entrante con el azúcar del nucleótido previamente agregado en la
cadena hija en crecimiento. De esta forma, el ADN polimerasa sintetiza el esqueleto de
azúcar-fosfato de la cadena hija.

Función correctora exonucleasa 3' → 5' de las ADN polimerasas.

Los ADN polimerasas también realizan otras funciones durante el proceso de replicación.
Además de participar en la elongación, desempeñan una función correctora y reparadora
gracias a su actividad exonucleasa 3', que les confiere la capacidad de degradar el ADN
partiendo de un extremo de éste. Es importante que existan estos mecanismos de corrección
ya que de lo contrario los errores producidos durante la copia del ADN darían lugar
a mutaciones.
Proceso general[editar]

 La helicasa rompe los puentes de hidrógeno de la doble hélice, abriendo las dos hebras,
permitiendo el avance de la horquilla de replicación.
 La topoisomerasa relaja la tensión provocada por el superenrollamiento del ADN al abrirse
las dos hebras.
 Las proteínas SSB estabilizan las cadenas abiertas y las mantienen separadas una de
otra.
 El cebador fragmentos de ARN que se unen a la cadena molde por puentes de hidrógeno
para que el ADN polimerasa III reconozca donde debe unirse para empezar a añadir
nucleótidos.
 El ADN polimerasa I reemplaza los cebadores de ARN por nucleótidos de ADN.
 El ADN polimerasa II interviene en la corrección de errores.
 El ADN polimerasa III sintetiza la cadena complementaria de forma continua en la hebra
adelantada y de forma discontínua en la hebra rezagada, ya que solo puede sintetizar en
dirección 3'→ 5'.
 El ARN primasa sintetiza el cebador de ARN necesario para la síntesis de la cadena
complementaria a la cadena rezagada.
 El ADN ligasa une los fragmentos de Okazaki.
El proceso se puede dividir en 3 fases: iniciación, elongación y terminación.
Iniciación[editar]
Mediante consumo de ATP en dirección a la horquilla de replicación, es decir, en dirección 3'
→ 5' en la hebra rezagada y 5' → 3' en la hebra adelantada, la helicasa actúa rompiendo
los puentes de hidrógeno que mantienen unida la doble hélice.3 El siguiente conjunto de
proteínas reclutadas son las denominadas proteínas SSBnota 1 encargadas de la estabilización
del ADN monocatenario generado por la acción de las helicasas, impidiendo así que el ADN
se renaturalice o forme de nuevo la doble hélice, de manera que pueda servir de molde. Estas
proteínas se unen de forma cooperativa, por lo que su unión al DNA conforme avanza la
helicasa es rápida. Por otro lado, conforme las helicasas van avanzando se van
generando superenrollamientos en la doble cadena de ADN por delante de la horquilla y si
éstos no fueran eliminados, llegado a un punto el replisoma ya no podría seguir avanzando.
Las topoisomerasas son las enzimas encargadas de eliminar los superenrollamientos cortando
una o las dos cadenas de ADN y pasándolas a través de la rotura realizada.2
Elongación[editar]
Enzimas que participan en la replicación de E. coli: helicasa, proteínas SSB, topoisomerasa, ARN
primasa, Holoenzima ADN Pol III.

En el siguiente paso, el ADN Pol III cataliza la síntesis de las nuevas cadenas
añadiendo nucleótidos sobre el molde. Esta síntesis se da bidireccionalmente desde cada
origen, con dos horquillas de replicación que avanzan en sentido opuesto. Cuando el avance
de dos horquillas adyacentes las lleva a encontrarse, es decir, cuando dos burbujas se tocan,
se fusionan, y cuando todas se han fusionado todo el cromosoma ha quedado replicado.
Puesto que el ADN Pol III necesita de un extremo 3'-OH libre, es necesario que un ARN
primasa catalice la formación de un fragmento corto específico de ARN llamado cebador, que
determinará el punto por donde la ADN polimerasa comienza a añadir nucleótidos. Así,
durante la síntesis, en cada horquilla de replicación se van formando dos copias nuevas a
partir del cebador sintetizado en cada una de las dos hebras de ADN que se separaron en la
fase de iniciación, pero debido a la unidireccionalidad de la actividad polimerasa de la ADN Pol
III, que sólo es capaz de sintetizar en sentido 5´ → 3', la replicación sólo puede ser continua
en la hebra adelantada; en la hebra rezagada es discontinua, dando lugar a los fragmentos de
Okazaki.
La mitad del dímero del ADN Pol III sintetiza la hebra adelantada y la otra mitad la hebra
rezagada.3 La elongación de la hebra rezagada ocurre por medio del modelo del trombón.
Hebra rezagada: síntesis de cebadores, unión de fragmentos de Okazaki y eliminación de los cebadores

Enzimas que participan en la eliminación de cebadoresy unión de los fragmentos de Okazaki.

El cebador de ARN está pintado en azul y el ADN que lo reemplaza en naranja.

En la hebra rezagada, cuando el ADN Pol III hace contacto con el extremo de otro fragmento
de Okazaki contiguo, el cebador de ARN de éste es eliminado y los dos fragmentos de
Okazaki de ADN recién sintetizado son unidos. Una vez se han juntado todos se completa
la doble hélice de ADN. La eliminación de cebadores también se da en la hebra conductora,
de síntesis continua, pero debido a que en ésta hay un solo cebador es un proceso que sólo
tiene lugar una vez, mientras que en la hebra rezagada se dará tantas veces como fragmentos
de Okazaki haya.
En la eliminación del cebador (también denominado iniciador o primer) intervienen dos
enzimas: por un lado el ADN Pol I, que va eliminando el ARN con su actividad exonucleasa 3'
→ 5' y simultáneamente rellenando con ADN mediante su actividad polimerasa 5' → 3'
(proceso denominado nick-traslation). Al final queda rotura (o "mella") entre el extremo 3'-OH
libre y el fosfato 5' de la cadena sintetizada; por último, el ADN ligasa sella esa rotura
catalizando la reacción de condensación entre el grupo fosfato y el OH de
la desoxirribosa del nucleótido contiguo, completando el enlace fosfodiéster; para ello, es
preciso hidrolizar una molécula de ATP.2
Nota: diversos autores difieren en los enzimas implicados en esta etapa. Para algunos no es
el propio ADN Pol I la que rellena el hueco tras eliminar el primer, sino que lo hace el ADN Pol
III (la misma que polimeriza el resto de la cadena). Del mismo modo, algunos autores siguen
empleando el término ribonucleasa o (RNasa) para referirse al ADN Pol I en esta etapa, ya
que hasta hace poco se desconocía que la propia ADN Pol I tenía la capacidad exonucleasa 5'
→ 3, y se pensaba que esto lo realizaba otro enzima, que recibía este nombre genérico.
Terminación (de los genomas lineales)[editar]
El final de la replicación se produce cuando al ADN polimerasa III se encuentra con una
secuencia de terminación. Se produce entonces el desacople de todo el replisoma y la
finalización de la replicación.

Véase también[editar]
 Genética molecular
 Ciclo celular
 Mitosis
 Punto de control
 Dogma central de la biología molecular