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energía energía
1 U Abs260 = 50 µg DNA / ml
1 U Abs260 = 40 µg RNA / ml
Espectros de absorción de ácidos
nucleicos y proteínas en el UV próximo
Espectrofotometría de ácidos nucleicos
Curva de
Además, las medidas de A260 se pueden usar para
desnaturalización
estudiar la desnaturalización de los ácidos nucleicos, de un DNA ante
o sus interacciones con proteínas u otros ligandos temperaturas ssDNA
crecientes
Si se representa la A260 de una disolución de un DNA
en función de la temperatura se ve una curva sigmoidal
A temperatura baja está como DNA de doble hélice o
dsDNA, y el apilamiento de las bases en su interior
provoca una disminución de su capacidad de absorción dsDNA
Al aumentar la temperatura, el DNA se va abriendo o
desnaturalizando, dando hebras sencillas o ssDNA.
Por ello desaparece el bloqueo de la absorción por las
bases y aumenta la A260: es el efecto hipercrómico
La temperatura de fusión o melting Tm es el punto
medio en la desnaturalización del dsDNA a ssDNA. Es
característico para cada molécula de DNA porque su
valor depende de su composición en bases: a mayor
contenido de G+C, más alta es su Tm
La Tm también aumenta con la fuerza iónica o
concentración salina
Ambas características tienen repercusiones de gran
interés a nivel biológico y técnico
Tm (ºC)
Espectrofotometría de proteínas
Cromóforos proteicos
Aminoácidos Grupos
aromáticos prostéticos
Enlace
peptídico
La región de mayor absorción por las proteínas es el intervalo 180-220 nm, debido a
las transiciones electrónicas que provoca la absorción de energía por los enlaces
peptídicos. Sin embargo, esta zona no se suele usar para realizar medidas, porque
hay muchos otros compuestos biológicos que también absorben en ella
En el intervalo de 230-300 nm hay absorción por los grupos aromáticos de Trp, Tyr
y Phe. Por ello, para medir la concentración proteica normalmente se suele usar la
A280, ya que a esa λ no absorben otros compuestos. Aunque varía con las proteínas
porque depende de su composición en aminoácidos, aproximadamente:
1 U A280 ≈ 1 mg de proteína / ml
Como mencionamos, algunas proteínas tienen grupos prostéticos o iones metálicos,
que suelen presentar absorción en la zona del visible, con λmax características de cada
uno a las que se pueden medir y estudiar las proteínas correspondientes
Colorimetría. Determinación de la concentración de proteína
Además de la medida directa, la concentración de proteína se puede medir mediante
métodos colorimétricos basados en la generación de cromóforos por un método
químico. En general, estos métodos dan mayor especificidad y sensibilidad
Recta (o curva) patrón
Cuando no se conoce o no es aplicable el coeficiente de extinción molar ε, que
permite correlacionar absorbancia y concentración, hay que realizar una recta de
calibrado o recta patrón para cada experimento
Esta permite calcular la correlación entre cantidad de proteína y absorbancia, y
por tanto calcular la concentración de una muestra problema de Abs conocida
A510
y = 0,0034 x
0,24 = 0,0034 x
x = 0,24 / 0,0034 = 70 µg de proteína
en el tubo problema
Proteína (µg)
OD600
Ensayos enzimáticos
Consisten en realizar una medida de la velocidad inicial
V0 de una reacción enzimática mediante la medida del
V0 nM/seg
aumento de la absorbancia del producto de la reacción en
función del tiempo, que es proporcional a su aumento de
concentración. Se puede hacer usando productos
coloreados, fluorescentes o luminiscentes
Cuando la concentración de sustrato es saturante, V0 es
proporcional a la cantidad o concentración de enzima
[E] µM
Sustratos cromogénicos
Lo más habitual es usar un sustrato cromogénico sintético que no absorbe luz de una λ
determinada, y que el enzima transforma en un producto que sí la absorbe
Entre los sistemas cromogénicos más
empleados están los que usan el para-
nitrofenol o la para-nitroanilina como
producto final coloreado, que tienen un No absorbe a 410 nm Absorbe
a 410 nm
máximo de absorción a 405-410 nm
Para ello se sintetiza un sustrato en el
que el cromógeno esté unido a un radical Tripsina
molecular susceptible de ser atacado
por el enzima que se desea medir. Esa Nα-Benzoil-L-Arginina p-Nitroanilida Nα-Benzoil-L-Arginina p-Nitroanilina
unión provoca que el reactivo no absorba
Ensayos enzimáticos
Absorbancia
lactato deshidrogenasa:
piruvato + NADH + H+ ↔ lactato + NAD+
Además, estos enzimas y reacciones se pueden
emplear para medir otras reacciones acopladas a
ellas a través de un intermediario común
Por ejemplo, la medida de alanina aminotransferasa
se puede acoplar a la lactato deshidrogenasa a través
del piruvato, poniendo todos los reactivos y enzimas
en el mismo tubo
alanina aminotransferasa:
alanina + α-cetoglutarato ↔ piruvato + glutamato
lactato deshidrogenasa:
piruvato + NADH + H+ ↔ lactato + NAD+