Bacterias como proveedores de vitaminas para su huésped: una microbiota

intestinal perspectiva

Las bacterias del ácido láctico (LAB) relacionadas con los alimentos, así como el intestino humano

comensales como las bifidobacterias pueden sintetizar de nuevo y suministrar vitaminas. Esto es

importante ya que los humanos carecen de capacidad biosintética para la mayoría de las vitaminas y

estos deben ser así proporcionados exógenamente. Aunque las vitaminas están presentes en una

variedad de alimentos, las deficiencias aún ocurren, principalmente debido a desnutrición como

resultado de la ingesta insuficiente de alimentos y porque de malos hábitos alimenticios. Leches

fermentadas con altos niveles de Bgroup vitaminas (como el folato y la riboflavina) pueden ser

producidas por LAB-promovido y posiblemente promovido por bifidobacterias biosíntesis. Además,

ciertas cepas de LAB producen complejo de vitamina cobalamina (o vitamina B12). En esta revisión,

alimentos fermentados con niveles elevados de vitaminas del grupo B producidos por LAB utilizados

como cultivos iniciadores serán cubiertos. En Además, habilidades genéticas para la biosíntesis de

vitaminas por seleccionado comensales humanos intestinales serán discutidos

Introducción

Las vitaminas son micronutrientes esenciales que normalmente son encontrados como precursores de

varias enzimas que son necesarias para reacciones bioquímicas vitales en todas las células vivas. Los

humanos son incapaces de sintetizar la mayoría de las vitaminas y en consecuencia, debe obtenerse

exógenamente. Los el uso de microorganismos productores de vitaminas puede representar una

alternativa más natural y amigable para el consumidor a la fortificación utilizando pseudovitaminas

químicamente sintetizadas, y permitiría la producción de alimentos con elevada concentraciones de

vitaminas que tienen menos probabilidades de causar efectos secundarios indeseables. Las vías

bioquímicas involucrado en la biosíntesis de vitamina B por microorganismos alimentarios han sido

previamente descritos en detalle [1]. El tracto gastrointestinal humano (TGI) está colonizado por un gran
variedad de microorganismos conocidos como microbiota intestinal, con hasta 1011 bacterias por gramo

de contenido intestinal [2].

Además de su impacto en diferentes funciones humanas [2], la microbiota intestinal juega un papel

fundamental en los alimentos digestión y recuperación de energía, mientras que también puede actuar

como un importante proveedor de vitaminas. En los humanos ha sido demostrado que los miembros de

la microbiota intestinal son capaces de sintetizar vitamina K, así como la mayoría de los solubles en

agua Vitaminas B, como biotina, cobalamina, folatos, nicotínicos ácido, ácido pantoténico, piridoxina,

riboflavina y tiamina [3]. A diferencia de las vitaminas dietéticas, que son adsorbido en el tracto proximal

del intestino delgado, el captación predominante de vitaminas producidas microbianamente ocurre en

el colon [4,5].

El género Bifidobacterium actualmente abarca 39 especie (revisado en [6]) y sus miembros representan

componentes clave de la microbiota intestinal humana [7,8,9].Varios informes han destacado la

importancia de las bifidobacterias en la regulación de la homeostasis intestinal, modulando respuestas

inmunitarias locales y sistémicas, y protección

contra enfermedades inflamatorias e infecciones [10,11] Además, algunas especies de bifidobacterias

son afirmó convertir una serie de compuestos dietéticos en moléculas bioactivas promotoras de la salud,

como conjugado ácido linoleico y ciertas vitaminas [12,13]. Especial Se ha demostrado que las cepas

bifidobacterianas exhiben producción de vitaminas [14-16], aunque su biosíntesis

habilidades no han sido examinadas en detalle y serán discutido aquí.

Biosíntesis de folato por los comensales del intestino humano

El ácido fólico del grupo B está involucrado en varios funciones metabólicas como la replicación del

ADN, la reparación y metilación y síntesis de nucleótidos, vitaminas y ciertos aminoácidos. La síntesis

de nuevo de folato requiere ambos 6-hidroximetil-7,8-dihidropterin pirofosfato (DHPPP) y ácido para-

aminobenzoico (pABA). Las propiedades biosintéticas del folato de las bifidobacterias han sido

verificado, aunque la biosíntesis de folato parece ser restringido a ciertas especies / cepas, que
conducen a la identificación de alto nivel (por ejemplo, Bifidobacterium bifidum y Bifidobacterium longum

subsp. infantis) y bajo nivel especies productoras de folato (por ejemplo, Bifidobacterium breve,

Bifidobacterium longum subsp. longum y Bifidobacterium adolescentis)

[dieciséis]. Tales hallazgos han sido confirmados por estudios in vivo: administración de ácido fólico de

alta producción cepas se ha demostrado que causa un aumento en el nivel fecal de folato tanto en ratas

como en humanos [17,18]. Con el advenimiento de la genómica microbiana, ahora es posible para

interrogar la composición genética de microorganismos para características específicas (revisadas en

[19]). La primera década de exploración molecular de los comensales intestinales, en particular

bifidobacterias y lactobacilos, ha proporcionado sin precedentes ideas sobre la adaptación genética de

estos bacterias al intestino humano a través de la decodificación de su secuencias del genoma

(probiogenómica) [20]. La adaptación genómica es obvia en muchas bifidobacterias

genomas donde codifican más del 9% de los genes anotados enzimas implicadas en el metabolismo

de carbohidratos [21,22].

Sin embargo, la disección de genomas bifidobacterianos tiene también reveló características

interesantes con respecto a la vitamina capacidades biosintéticas (Figura 1). Sin rutas completas para

la biosíntesis de biotina, pantotenato, piridoxina, cobalamina y menaquinona están presentes en

cualquier de los genomas bifidobacteriales secuenciados hasta ahora, sin embargo, se predice que

codifican vías completas para la síntesis de shikimate y por lo tanto se espera que produzcan chorismate

[23-27,28, 29,30], un precursor de la biosíntesis de folato.

Sin embargo, aunque todas las bifes completas disponibles Se espera que los genomas dobacteriales

especifiquen aminodesoxiclorisima sintasa (EC 2.6.1.85), un gen especificando una supuesta 4-amino-

4-deoxychorismate liasa (EC 4.1.3.38) solo se puede encontrar en el genoma de B. adolescentis

ATCC15703 y B. dentium Bd1 [27], que se espera que logren la biosíntesis de novo de pABA (Figura

2). Por el contrario, B. animalis subsp. Lactis no parece poseer todo el camino para DHPPP biosíntesis

o el gen que codifica dihidropteroato sintasa (EC 2.5.1.15) (Figura 2). Por lo tanto, B. animalis subsp.

Lactis se espera que sea auxótrofo para folatos o DHP, y por lo tanto sería incapaz de biosíntesis de

folato, incluso en presencia de pABA (Figura 2).

Los lactobacilos son otro grupo común de intestino humano comensales y han sido investigados

recientemente como posibles productores de folato [31]. El género Lactobacillus contiene más de 100

especies reconocidas que muestran una notable filogenético, fenotípico y ecológico diversidad [32,33].

La caracterización genética de lactobacilos está mejor desarrollado que el de las bifidobacterias, pero

los mecanismos moleculares que impulsan su interacción con el intestino humano sigue siendo en gran

medida desconocido (revisado en [20]). Debido a su potencial comercial, la capacidad de producir folato

se ha investigado en varios lactobacilos de una variedad de orígenes ecológicos. En este contexto, los

lactobacilos de diversos alimentos fermentados han sido investigado como cultivos iniciadores para la

fabricación de productos lácteos fortificados con folato, mientras que los lactobacilos aislados del

intestino humano se han explorado como productoras de folato probióticos [34-38,39] ] La disponibilidad

del genoma secuencias de varios lactobacilos proporcionaron una importante contribución a la genética

subyacente de la biosíntesis de folato en este grupo de microorganismos [40]. Por ejemplo, los

lactobacilos no parecen albergar los determinantes genéticos para la síntesis de pABA de novo, con la

excepción de Lactobacillus plantarum WCFS1 [41], lo que sugiere que la la gran mayoría de los

lactobacilos son incapaces de sintetizar ácido fólico en ausencia de pABA. Biosíntesis de riboflavina La

riboflavina (vitamina B2) juega un papel esencial en el celular metabolismo, siendo el precursor de las

coenzimas flavín mononucleótido (FMN) y dinucleótido flavina adenina (FAD), que actúan como

portadores de hidrógeno en muchos reacciones redox biológicas. Biosíntesis microbiana de riboflavina

de los precursores guanosina trifosfato (GTP) y D-ribulosa 5-fosfato se produce a través de siete

enzimáticos pasos, con estudios detallados realizados para Bacillus subtilis [42] y Escherichia coli [43],

y revisado recientemente [44]

Las concentraciones de riboflavina pueden variar en ciertos productos lácteos debido a las tecnologías

de procesamiento y a la acción de microorganismos durante el procesamiento de alimentos [1]. Ha sido

demostrado que la mayoría de los cultivos iniciales de yogur disminuyen la ribo- concentraciones de

flavina, mientras que otros pueden aumentar los niveles de esta vitamina esencial hasta el 160% de la
concentración inicial presente en la leche no fermentada [45]. Selección de se encontraron mutantes

espontáneos resistentes a la roseoflavina ser un método confiable para obtener sobreproducción de

riboflavina natural cepas de varias especies comúnmente utilizadas en el industria alimentaria [46].

Hasta ahora la información fragmentaria está disponible en el nuevo síntesis de riboflavina por bacterias

entéricas, en el caso de bifidobacteria las enzimas necesarias para la biosíntesis de esta vitamina

parece ser parcial o completamente ausente de la mayoría de las bifidobacterias actualmente

disponibles genomas [19]. Sin embargo, uno no puede excluir

(Figura 1 Leyenda continua) La ruta de biosíntesis de folato de Bifidobacterium dentium Bd1 obtenida

del programa de reconstrucción de vía metabólica. En el recuadro sobre los genes correctos implicados

en la biosíntesis de folato se mapean los genomas de B. dentium Bd1. La ruta metabólica describe

cómo pABA se sintetiza a partir de corismato como un punto de ramificación de la ruta de biosíntesis

de aminoácidos aromáticos. La síntesis de folato continúa a través de una reacción de condensación

entre DHPPP y pABA. Esta ruta compleja es catalizada por diversas enzimas, como la dihidropteroato

sintasa (CE 2.5.1.15), dihidrofolato sintasa (EC 6.3.2.12) y dihidrofolato reductasa (EC 1.5.1.3)

la posibilidad de que microbios múltiples y coexistentes las especies son capaces de síntesis de novo.

Biosíntesis de vitamina B12 El término vitamina B12 generalmente se usa para describir un tipo de

corrinoide de cobalto, particularmente de la cobalamina (cbl) grupo. Los animales, plantas y hongos son

incapaces de cobalamina producción y es la única vitamina que es exclusivamente producido por

microorganismos, particularmente por anaerobios [47-49]. Uno de los primeros organismos modelo

utilizado para el estudio de la biosíntesis fue P. freudenreichii que es utilizado en la producción comercial

de vitamina B12. Lactobacillus reuteri CRL1098 demostró ser la primera Cepa de LAB capaz de producir

un compuesto de tipo cobalamina con un espectro de absorción muy parecido al de cobalamina

estándar pero con un tiempo de elución diferente, mientras que la producción de cobalamina se

confirmó usando diferentes bioensayos [50]. Sin embargo, la actividad biológica de este la

pseudovitamina B12 aún no está clara. Evidencia genética de la biosíntesis de cobalamina por L. reuteri
Entonces se obtuvo CRL 1098 y se demostró que a al menos 30 genes están involucrados en la síntesis

de novo de la vitamina (Figura 3). La organización genética (mazorca y cbi) genes) son muy similares

a los de Salmonella enterica y Listeria innocua [51]. Recientemente, la vía genética responsable de la

síntesis de novo de vitamina B12 por L. reuteri se describió para dos cepas de L. reuteri [52]. Una

característica distintiva del grupo de mazorcas de L. reuteri es la presencia de genes de hemo en el

medio del cúmulo. En los organismos respiratorios Listeria y Salmonella con grupos de mazorcas

similares, los genes del dobladillo se encuentran en una diferente posición en su genoma. La presencia

de los genes del dobladillo en el grupo de mazorcas es una característica que solo ha sido observado

en ciertos genomas de Clostridium [53]. Recientemente, la transcripción de un vasto conjunto de genes

implicados en la cobalamina síntesis en masa madre preparada con cepa L. se describió la ATCC 55730

de reuteri [54]. Además de la cepa CRL1098, otras cepas de L. reuteri se demostrado ser capaz de

producir algunos corrinoides como L. reuteri DCM 20016 [55], JCM1112 [36] y CRL 1324 y 1327, cepas

aisladas de la vagina humana [56]. Recientemente, una cepa productora de reuterina de L. coryniformis

se demostró que produce un compuesto de tipo cobalamina [57]. Notablemente, propionibacteria y L.

reuteri normalmente ocurren en el intestino humano y, por lo tanto, puede cumplir (parcialmente) el

Requerimiento de vitamina B12 del anfitrión

Biosíntesis de otras vitaminas del grupo B Además de riboflavina, folato y vitamina B12, niveles

elevados de otras vitaminas del grupo B, por ejemplo, niacina y piridoxina, han sido reportados para

ciertos LAB utilizados en yogur, queso y fermentaciones [58,59]. Por ejemplo, los aumentos en la

concentración de tiamina y piridoxina fueron demostrado como resultado de la fermentación de soja con

Streptococcusthermophilus ST5 y Lactobacillus helveticus R0052, o B. longum R0175 [60]. Síntesis de

novo de vitamina K por bacterias intestinales La vitamina K actúa como un cofactor de la enzima que

convierte residuos específicos de glutamil en un número limitado de proteínas a residuos g-

carboxiglutamilo (Gla). El requerimiento diario para la vitamina K se cumple con la filoquinona dietética

que está presente en las plantas, y, hasta cierto punto, por compuestos que contienen poliisoprenilo

producidos por bacterias conocido como menaquinonas sintetizadas en el intestino humano [61]. Sin
embargo, la síntesis de menaquinona puede no ser completamente dependiente de la microbiota

intestinal como animales carecer de una microbiota intestinal aún puede producir menaquinona [62].

Microbioma intestinal humano y biosíntesis de vitaminas Aunque la secuenciación y el ensamblaje del

genoma completo tienen históricamente se ha utilizado para el estudio de organismos individuales,

informes recientes han demostrado la validez de este enfoque para investigar comunidades mixtas

microbianas [2,63,64]. En este contexto, el muestreo de la información genética del ser humano

microbiota intestinal, también conocida como microbioma intestinal humano, nos permitió obtener

información sobre las características genéticas de bacterias entéricas [64]. Para delinear si y a que

medida en que el microbioma entérico proporciona fisiológica características que no fueron

evolucionadas por su anfitrión humano, el Se analizó el potencial metabólico de las secuencias

microbianas mediante la clasificación de todos los genes microbianos identificados basado en la

Enciclopedia de Kioto de Genes y Genomas así como los grupos ortólogos agrupados (COG). Estos

análisis mostraron que el microbioma intestinal distal de dos temas se enriquece para una variedad de

COG involucrados en síntesis de aminoácidos esenciales y vitaminas, como los requeridos para la

síntesis de deoxietilulosa 5-fosfato (DXP), un precursor de las vitaminas tiamina y pirodoxal [64].

Recientemente, la combinación de 22 recientemente metagenomas fecales secuenciados de individuos

de cuatro los países permitieron la identificación de tres clusters robustos, enterotipos con nombre, que

no son específicos de una nación o continente [sesenta y cinco]. Notablemente, metabolismo de

vitaminas las vías se mostraron altamente representadas en todos enterotipos, mientras que dos

enterotipos fueron particularmente enriquecido en genes que especifican las enzimas biosintéticas para

biotina, riboflavina, pantotenato, ascorbato, tiamina y producción de folato. Estos filogenéticos y

funcionales las diferencias entre los enterotipos reflejan así diferentes combinaciones de cadenas

tróficas microbianas con un probable impacto en las interrelaciones sinérgicas con el huésped humano

[sesenta y cinco].

Recientemente, estudios transcriptómicos dirigidos a explorar upregulated genes de bifidobacterias que

residen en muestras fecales de sujetos adultos identificaron la presencia de bifidobacterias genes

predichos para estar involucrados en la biosíntesis de varias vitaminas B y folato altamente expresados
cuando las bifidobacterias se encuentran en su nicho ecológico natural [66-68]. Dado que es casi

imposible de cuantificar o demostrar la producción de vitaminas por organismos individuales del

microbioma humano usando métodos tradicionales (p. HPLC, ensayos microbiológicos), estos y otros

'ómicos' enfoques pueden proporcionar evidencia de tal vitamina in situ producción, mientras que

también permite el desarrollo de metodologías para aumentar su producción.

Conclusiones

El aumento de las concentraciones de vitamina del grupo B en fermentado / funcional alimentos es

posible a través de juiciosa selección de especies microbianas y condiciones de cultivo. Se espera que

la industria alimentaria explote la novela y cepas eficientes de producción de vitaminas para producir

fermentado productos. Se espera que dichos productos proporcionen beneficios económicos para los

fabricantes de alimentos ya que aumentó Las concentraciones de vitamina "natural" serían una

importante rasgo de valor agregado sin aumentar los costos de producción. Con la disponibilidad cada

vez mayor de secuencias de genoma es no solo es posible identificar potenciales productores de

vitaminas cepas, sino también para entender los mecanismos entrelazados para su biosíntesis, todo lo

cual será explotado para aumentar las capacidades de producción de vitaminas en el TGI de humanos.