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Prácticas de Química
Computacional
ˆ (r, R) E (r, R)
H
Aproximación de Born-Oppenheimer:
Tratamiento de núcleos y e- por separado debido a su diferente masa (mN >> me)
(r,R) e (r;R)(R)
Introducción General
ˆ (r, R) E (r, R)
H r (electrones) R (núcleos) = 22 partículas
N S N N
Z 1
ˆ Tˆ Vˆ H
H n n
ˆ
e He ( 2 )
ˆ 1
i
2 A
16 partículas
N N
Z A ZB
Energía Potencial de la Molécula E e Vn E e V(R )
A 1 B A R AB
Hückel: Fundamentos Teóricos
ˆ H
H ˆ H
ˆ H
ˆ
e
K
i c
a 1
ai a
c1 1 c2 2
Hückel: Fundamentos Teóricos
c1 1 c2 2
h c1 1 c2 2 h c1 1 c2 2 c12 H11 2c1c2 H12 c22 H 22
c1 1 c2 2 c1 1 c2 2 c12 2c1c2 S12 c22
H ab a hˆ b H ba
S ab a b Sba
S aa a a 1
c12 2c1c2S12 c22 c12 H11 2c1c2 H12 c22 H22
Hückel: Fundamentos Teóricos
Hab
H aa a ĥ a a* ĥ a d
Integral de Coulomb:
energía de un electrón descrito por el orbital a en el campo de la molécula
Todas iguales Haa=Hbb=
H ab a ĥ b a* ĥ b d
Integral de Resonancia:
energía de solapamiento entre orbitales a y
Hab=- si a y b son átomos directamente enlazados
Hab=0 si a y b no están directamente enlazados
Hückel: Fundamentos Teóricos
S ab ab
= 0 si a≠b (despreciamos solapamiento)
Determinante de Hückel
H 11 H 12 S 12
0
H 12 S 12 H 22
x
x 1
0 0
1 x
Hückel: Fundamentos Teóricos
x 1
0 x2 -1 = 0 x = 1
1 x
+
x = +1 =+
x
x = -1 =- -
Ecuaciones Seculares
H 11 c1 H 12 S12 c2 0 c1 c2 0
c1 c2
H 12 S12 c1 H 22 c2 0
1
c1 c 2
2
Hückel: Fundamentos Teóricos
Soluciones del método Hückel: Orbitales
1ª solución = - 1
c1 c 2
2
1 1
1 2
2 2
1
2ª solución = + c1 c2
2
1 1
1 2
2 2
Hückel: Fundamentos Teóricos
Construcción Determinante Hückel: Generalización
1 2
1 2 3 4
3
4
1,3-Butadieno (C4H6) Ciclobutadieno(C4H4)
1 2 3 4 1 2 3 4
1 x 1 0 0 1 x 1 1 0
2 1 x 1 0 2 1 x 0 1
3 0 1 x 1 3 1 0 x 1
4 0 0 1 x 4 0 1 1 x
Hückel: Fundamentos Teóricos
Cálculo de Propiedades Moleculares
OMs
E n
i 1
i i ni número ocupación del orbital i (0,1,2)
OMs
qa i ai
n C
i 1
2 Carga neta Q = 1-qa
OMs
ab n C
i 1
i ai Cbi Orden total = 1+ab
Hückel: Fundamentos Teóricos
Extensión a Sistemas con Heteroátomos
X = +hX
XY = kXY
Programa a usar:
http://www.chem.ucalgary.ca/SHMO/index.html
2. Superficies de Energía
Potencial
Superficie de energía potencial
• Energía de una molécula (E).
H
E H TN Te Vee VNe VNN
No se puede resolver exactamente
• Aproximación de Born-Oppenheimer.
He (R)e (r;R) Ee (R)e (r;R) He Te Vee VNe
• Energía potencial es la energía de una molécula para una posición relativa
dada (fija) de los núcleos (R son las coordenadas de los átomos).
La superficie de energía potencial es el
V(R) Ee (R) VNN (R) conjunto de valores de la energía potencial
para todas posiciones relativas de todos los
átomos y corresponde a la función V(R).
Molécula de H2O
r1
o
r2 La energía potencial dependerá de
tres coordenadas
H H
Coordenadas internas.
Ejemplo: H2O
N. Tipo Ref distancia Ref ángulo
1 Orden
r31
o
r21
1 O
2 H 1 0.942
H 312 H
3 2 3 H 1 0.942 2 103.7
El ángulo diedro formado por cuatro átomos i-j-k-n se define como el ángulo
entre dos planos, uno conteniendo los átomos i,j,k y el otro los átomos j,k,n.
2 3
1
Ejemplo: HCOOH 5
2 1
3
4
Muchas veces solo una o dos coordenadas internas son importantes o tienen
variaciones significativas en el proceso que se estudia. En estos casos se puede
representar V(R) frente a esas pocas coordenadas obteniéndose una superficie
de potencial reducida.
Cl
Cl
10 Cl
8
Cl
6
Cl
Cl
4 Cl
Cl 2
0
-180 -120 -60 0 60 120 180
Cl ClCCCl (grados)
Puntos estacionarios de la superficie.
De la superficie de energía potencial se puede deducir las fuerzas que sienten
los átomos.
V(R )
Fi
R i
• Hay puntos (un conjunto de coordenadas determinado) en la superficie
para los que las fuerzas que sienten todos los átomos es cero
o
la derivada de V con respecto a cada una de las coordenadas es cero .
A estos puntos se les denomina puntos estacionarios.
Sobre dos dimensiones pueden ser:
* Mínimos
* Máximos
* Puntos de Silla
Cl
10 Cl
8
Cl
6
Cl
Cl
4 Cl
Cl 2
D E‡
DEconf
0
-180 -120 -60 0 60 120 180
Cl ClCCCl (grados)
H a + H bH c H aH b + H c Rab0.74 Å
Rbc2.2 Å
Productos
Rbc0.74 Å
Rab2.2 Å
Reactivos
H a + H bH c H aH b + H c
Rab
Rbc
Rab 0.93 Å
Rbc0.93 Å
H a + H bH c H aH b + H c Camino de Reacción
H
H
-
1,9 2,9
Y C X- 2,3 2,1
Y C X
H
H
HH
2,9 Å
2,1 Å
1,6 Å H
3,2 1,6
-
1,9 Å
Y C X
2,3 Å 3,2 Å H
H
E (Kcal/mol)
Ea 11 kcal/mol
Er 6 kcal/mol
c.r.
Importancia de los mínimos
• Los mínimos nos indican las coordenadas para las que tenemos estructuras
estables.
• Para pasar de reactivos a productos hay que pasar cerca del punto silla.
Camino de reacción:
• Camino a través de la superficie de potencial que une dos mínimos y pasa por
un punto silla.
• Une los reactivos con los productos a través del estado de transición.
Cálculo de la energía potencial.
V(R) E ele (R) VNN (R)
- Mecánica Cuántica (QM)
• Se puede obtener dentro de dos
metodologías generales - Mecánica Molecular (MM)
- Dependiendo del método los términos energéticos pueden ser diferentes, pero
en general los mas usados son:
2
5
4
1
Vdie kdie 1 cosn
2 3
qiq j
Vele
2
40 rij
1
Ángulo de Torsión
1
Venl kenl (b benl ) 2
2
1
Vang kang ( ang ) 2
2
Parametros Variable
1
Vdie kdie 1 cosn kang ang (ángulo formado
2 por tres átomos)
qiq j
Vele
40 rij kdie n (ángulo diedro
formado por 4
12 6 átomos)
ij ij
Vvdw 4ij qi qj rij (distancia entre
rij rij
dos átomos i y j)
Programa a usar:
Chem3D