Cariotipo automatizado de imágenes de cromosomas en metafase basadas en características de
textura
Miembros de la faculta de Karunagappally en india, presentaron en Agosto de 2016 en la
conferencia Internacional de Ciencia de la Información (ICIS) el análisis para la detección de trastornos genéticos, mediante un cariotipo automatizado de imágenes de Cromosomas en metafase. Esta investigación se desarrolló mediante un método basado en la clasificación de cromosomas en clase de Denver. Al obtener las imágenes de la metafase adquiridas por una cámara acoplada a un microscopio, se aplica un preprocesamiento para mejorar la calidad de la imagen, eliminando cualquier tipo de perturbación, para luego realizar la separación de los cromosomas por técnicas de segmentación. Seguidamente se realiza una clasificación de siete grupos de Denver (AG) para los cromosomas que no fueron unidos. Se realizó un proceso de extracción de características que permite la clasificación de pares de cromosomas para finalmente aplicar un clasificador de red neuronal artificial. Este proceso se llevó a cabo a partir de 1628 cromosomas, lo cual presento un 75% de precisión general en el proceso de clasificación. Los autores de la investigación deducen que al aumentar el número de cromosomas de entrenamiento, es posible mejorar la precisión del proceso.
Un método novedoso para la detección de centrometros y longitudes en imágenes
microscópicas de cromosomas humanos
En el año 2011 en la conferencia de ingeniería biomédica en Iraní, se presentó un algoritmo que
permite la detección de centrómeros y de longitud en cromosomas humanos. Los autores Sahar Jahani y S. Kamaledin Setarehdan desarrollaron un diagrama de cinco bloques que permite llevar a cabo la investigación . El proceso se realiza a partir de una imagen de entrada a la cual se le aplica una serie de técnicas, primeramente una binarización de imagen donde es necesario aplicar una extracción de eje medial (MA), el siguiente paso en el algoritmo es la rotación del cromosoma, para luego colorear la imagen utilizando una máscara de nivel gris (GLM) la imagen resultante se lleva a cabo por un proceso de análisis de histograma que identifica la ubicación del centrómero. El estudio se realizó a partir de 62 imágenes de cromosomas, donde la comparación de resultados por un experto y de manera automática se realiza para cada uno de los cromosomas, con un error absoluto de 3.6 y 5.2 pixeles.
Identificación automática de anomalías cromosómicas en el cariotipo en metafase utilizando
imágenes apareadas en cromosomas humanos
En la segunda conferencia internacional sobre ingeniería basada en el conocimiento e innovación (
KBEI) miembros de la Universidad de ciencias y tecnologías de Tehran,Iran presentaron una investigación que tiene como objetivo obtener la identificación automática de anomalías cromosómaticas en cariotipos humanos. La investigación se realizó con un total de 40 cariotipos de cromosomas, utilizando el sistema cytovision con el software IKAROS. Para la extracción de características de los cromosomas las imágenes obtenidas fueron procesadas por diferentes técnicas. El proceso comienza con la eliminación del ruido por medio de un filtrado, seguidamente se aplica la técnica de segmentación. Para separar las imágenes de la metafase fue necesario utilizar un umbral, se aplicó un adelgazamiento, poda y extensión del esqueleto del cromosoma. Para la extracción de características se tiene en cuenta la longitud, posición del centrómero y un perfil de densidad. Las diferentes imágenes fueron analizadas por medio del software de Matlab. Los resultados obtenidos fueron acertados comparándolos con el método manual.