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Microbiologia General

Trimestre 16-P
6. Factores ambientales
FACTORES AMBIENTALES

 Temperatura
 pH
 Presión
 Concentración de sales
 Actividad de agua (aw)
 Oxígeno
Los factores ambientales afectan:
Velocidad de reacciones celulares
El metabolismo
Los requerimientos nutricionales
La composición de la BM
6. Factores ambientales
Temperaturas cardinales
Cada microorganismo tiene 3 temperaturas cardinales:

Mínima   la fluidez de la membrana: debajo de esta T no hay


crecimiento

Óptima  Máxima tasa de crecimiento y reacciones enzimáticas


Reacciones y actividades
Máxima   tasa de enzimáticas ocurren a su
máxima velocidad
crecimiento: daño en
Tasa de crecimiento
Velocidades crecientes en
Óptimo
biomoléculas  cesa reacciones y actividades

la actividad  a >T no
enzimáticas

hay crecimiento
Mínimo Máximo

Temperatura
Se congela la membrana; el Desnaturalización de proteínas;
proceso de transporte es tan colapso de la membrana; lisis
lento que no hay crecimiento térmica
Clasificación con base en la temp. óptima
Con base en su temperatura óptima de crecimiento, los
organismos se clasifican en 4 grupos:

 Psicrófilos: 13°C (< 0°C – 20°C)  Termófilos: 60°C (45 – 80°C )


 Mesófilos: 37°C (15 - 45°C)  Hipertermófilos: 90°C (T > 80°C)

Termófilos
Yo solo
puedo Hipertermófilos
Mesófilo vivir Mesófilos
Tasa de crecimiento

entre 25
y 40°C
Yo amo
el calor Psicrófilos

Termófilo
Temperatura (°C)
Mecanismos de adaptación

 Psicrófilos (Top < 20°C):


 Menor tamaño celular (pequeños)

 Enzimas con  Top  pueden desnaturalizarse a Tamb

 MC:  contenido de AG insaturados  mantiene Yo amo el frío


la fluidez y evita que se cristalice

 Termófilos (Top > 60°C): Psicrófilo

 Biomoléculas termoestables

 Cambios en aa de proteínas  mayor estabilidad a  T

 MC:  contenido de AG saturados de cadena larga y


ramificados; presencia de lípidos cíclicos
Psicrófilos
Antártico
Ártico
Montañas
Pyrolobus fumarii
Profundidad del océano
(óptima 106ºC)

Hipertermófilos
Geisers
Respiraderos hidro- o geo-
termales

Psychrobacter
( 4-15ºC)
Ejemplos de temperaturas cardinales
Temperaturas cardinales (°C)
Microorganismo
Mínima Óptima Máxima
Bacterias
Mycrococcus cryophilus -4 10 24
Escherichia coli 10 37 45
Thermus aquaticus (Taq 50 ~70 80
polimerasa)

Hongos
Candida scottii 0 ~10 17
Saccharomyces cerevisiae 1-3 28 40
Thermomyces ibadanensis 31 42-47 61
Archaea
Methanogenium frigidum 0 15 18
Methanothermus 60 83 93
Pyrococcus abyssi 67 96 102
Pyrolobus fumarii 90 106 113
6. Factores ambientales
Acidez y alcalinidad:ph
 pH: función logarítmica  1 unidad de pH implica el
cambio en 10 unidades en la [H+]  pH = log [H+]

Ec. de Henderson-Hasselbalch

 La acidez/alcalinidad se expresa en una escala en la


que la neutralidad es pH 7
 pH   alcalinos
 pH   ácidos

 Cada organismo tiene un rango de pH dentro del cual


puede crecer y tiene un pH óptimo
Con base en el pH óptimo de crecimiento, los
organismos se clasifican en 3 grupos:

Acidófilos extremos mol/L de:


H+ OH-
Ácido
Acidófilos
Acidófilos
extremos
Neutrófilos
Acidófilos
Alcalófilos

pH citoplásmico
Alcalófilos extremos
Neutralidad Neutrófilos

Acidófilos Neutrófilos Alcalófilos


Tasa de crecimiento

Alcalófilos

Alcalófilos
extremos
Básico

pH
Mecanismos de adaptación
Organismos que viven en pH extremos:
Si el pHint<5: muerte  destrucción de biomoléculas
Mantienen el citoplasma a pH ~ 7

 Alcalófilos (pHop ≥ 9):


 Bombeo de H+ externos hacia el citoplasma  pHint ~ 8  pHext 

 MC impermeable a iones -OH

 PC con carga superficial (-)

 Acidófilos (pHop ≤ 2-3):


 Bombeo de H+ internos hacia el exterior  pHint ~ 6.5  pHext ~ 2

 MC con transportadores que dependen de H+

 Cargas superficiales (+)


Acidófilos: C. caldarium
Hongos más tolerantes
que bacterias: Ejemplos

Bacterias acidófilas obligadas  Thiobacillus Aguas/suelos


volcánicos

Arqueas  Sulfolobus y Thermoplasma


Fluidos gástricos

Jugo de limón

Algas  Cyanidium caldarium (pH 3.3-3.5 a


Drenaje ácido
Vinagre
42°C, pero puede vivir a pH ~ 1) Suelos ácidos

Tomates
Col
Maíz/salmón
Agua pura

Alcalófilos  suelos y lagos carbonatados


Agua de mar

Suelos alcalinos

La mayoría del género Bacillus


Jabón
Amoniaco casero
ejemploS
pH
Organismo Hábitat
Mínimo Óptimo Máximo

Thiobacillus thiooxidans Áreas ricas en azufre (ácidas) 0.5 2.0-2.8 4.0-6.0

Sulfolobus
Manantiales ácidos de azufre 1.0 2.0-3.0 5.0
acidocaldarius

Bacillus acidocaldarius Manantiales ácidos calientes 2.0 4.0 6.0

Zymomonas lindneri Ambientes con alta [azúcar] 3.5 5.5-6.0 7.5

Lactobacillus
Animales, MO en descomposición 4.0-4.6 5.8-6.6 6.8
acidophilus

Staphylococcus aureus Animales, cavidad nasal, piel 4.2 7.0-7.5 9.3

Escherichia coli Intestinos de animales 4.4 6.0-7.0 9.0

Streptococcus
Patógeno de animales 6.5 7.8 8.3
pneumoniae
Natronoarchaeum
Lagos y suelos sódicos, salinas 6.0 8.0-9.0 9.5
(arquea)
6. Factores ambientales
Presión atmosférica
Con base en la presión óptima, los
organismos se clasifican en 3 grupos:
1 MPa = 9.9 Atm
Piezosensibles (Patm  1 atm)
Barotolerantes o
Piezotolerantes ( 600 atm) Piezotolerantes
Barófilos o
Piezófilos (P óptima: 500 atm) Piezófilos

Tasa de crecimiento
Barosensibles o
Piezosensibles
197 395 592 790 987

Atm
Mecanismos de adaptación
 Piezófilos
 Lípidos de la MC con moléculas empacadas más
apretadas   en la fluidez
  proporción de AG insaturados

Methanococcus
janaschii

Profundidades del océano


(psicrófilos)
Methanococcus janaschii
Piezófilo-termófilo Respiraderos hidrotermales
(óptimos: 75 MPa, 90ºC) (termófilos)
6. Factores ambientales
 Organismos que viven en ambientes con  P
osmótica  osmófilos*
 Con base en la [NaCl]* óptima de crecimiento 
4 grupos:
 No halófilos (≤0.1 M: 0.6%) Halotolerante Halófilo
(S. aureus) (Vibrio fischeri)
Halotolerantes (0.6 M: 1-6%*) 
crecen mejor sin NaCl

Tasa de crecimiento
Halófilos (1.25 M: 6-15%) 
necesitan NaCl
Halófilo extremo
Halófilos extremos (>4 M: 15 - No halófilo (Halobacterium
salanarium)
30%*)  arqueas (E. coli)

Concentración de NaCl
0M 5M
(29%)

* Osmofília  generalmente se usa para


* Soluto encontrado de forma natural organismos que crecen con  [azúcar]
* Mar: ~3.5% NaCl * Los organismos halófilos son osmófilos
* Mar Muerto: 33.7% NaCl
Mecanismos de adaptación
Halobacteriales (Archaea)
Halófilos: Haloanaerobiales (Bacteria)
MC con diferencias en composición Halobacteriu
m salinarum
 osmolaridad intracelular   [KCl] (4 M NaCl)

Enzimas dependientes de sales

Acumulación de osmoprotectores* en el
citoplasma:
Estabilizan y protegen enzimas
Protección de ác. nucleicos y MC Lagos salados
Protegen vs. congelación, desecación Mares (3.5% NaCl): mar muerto
y desnaturalización (calor y [sal])
Salinas
Lagos salados alcalinos (África,
lago de Texcoco)
* Pequeñas moléculas muy solubles 
principalmente aa y alcoholes (polioles)
6. Factores ambientales
 aw  relación entre la presión de vapor* de un
sustrato (P) y la presión de vapor del agua pura
(P0), a la misma T:

 aw  medida de la cantidad de agua disponible


(p. ej.):
 Agua pura  todas las moléculas disponibles:  aw

 Sol. saturada de NaCl  una parte importante de las moléculas de


agua participa en la solvatación de los iones de la sal disuelta:  aw

 Si la cantidad de solutos en el medio  (osmolaridad)  


aw :
 [solutos]   osmolaridad   aw

* Presión (a una T dada) en la que la fase líquida y el vapor se


encuentran en equilibrio dinámico (= presión de saturación)
Actividad de agua (aw)
 Organismos que viven en ambientes secos:  aw
 xerófilos
 Xerotolerantes
 Xerofilos (aw < 0.85)

 La mayoría de los microorganismos necesita  aw


para crecer: aw Material Microorganismos

1.000 Agua pura Spirillum


Streptococcus, E.
0.995 Sangre humana
coli
Pseudomonas,
0.980 Agua de mar
Vibrio
0.900 Jamón Cocos Gram (+)

0.800 Mermelada Hongos filamentosos


0.700 Cereales, frutos secos Hongos xerófilos

0.600 Depósitos de sal Algunas arqueas


 Reducción de aw como estrategia para limitar el
crecimiento bacteriano  gran importancia en
industria alimentaria: ???

Almíbares  aw del alimento  evita


el crecimiento de bacterias
Salmueras  conservación: desecación
Salazones (desecación con sal)
Deshidratación
Adición de solutos
Frutos secos
Carnes saladas
Néctares de flores
Desiertos
Salinas (camas de evaporación
donde se produce sal)

Wallemia sebi (hongo xerófilo)


Mecanismos de adaPtación

Xerófilos  mecanismos que ayudan a combatir la


desecación:

 Acumulación de osmoprotectores* en el citoplasma 


protección de membranas y proteínas ( potencial hídrico*)

 Producción de polisacáridos extracelulares que retienen H2O

 Diferenciación  estructuras resistentes a la desecación ???

 MC con permeabilidad restringida  mantiene sales fuera y


solutos orgánicos dentro

* Pequeñas moléculas muy solubles  aa y alcoholes (polioles)


* Tendencia del agua a moverse de un área de  [ ] a una de  [ ]
Relación aw – osmofília - halofílica

Cuál es la relación entre osmofilia, halofilia y aw?

Crecen mejor en [sal] donde


la mayoría de los microorg.
Tasa de crecimiento

se inhibe

No Osmófilos
halófilos Halófilos extremos
Osmotolerantes
Halotolerantes

aW

E. coli S. aureus Halococcus (arquea)


6. Factores ambientales
Con base en sus requerimientos de O2, los organismos se clasifican en:

Aerobios: Anaerobios:
crecen en crecen en
presencia de O2 ausencia de O2
Aceptor final de ē ≠ O2
Aceptor final de ē = O2
Estrictos. El O2 es tóxico: no
Estrictos. El O2 es el aceptor tienen enzimas que eliminan
final de ē para la captación ERO (Clostridium)
de energía química
Facultativos. Metabolismo
energético anaerobio/
aerobio  depende de la
disponibilidad de aceptores
Microaerófilos. Requieren
de ē (S. cerevisiae)
[O2] menores a la atmosférica
(2 - 10% y no 20%)
Aerotolerantes. Metabolismo
energético anaerobio, toleran
el O2 (bacterias lácticas).
Aero-dúricos
 La relación de un organismo con el O2 depende de la
presencia de enzimas que eliminan especies
reactivas de oxígeno (ERO: iones, radicales libres, peróxidos):

1O •O2- H2O2
2
Singulete de oxígeno Radical Peróxido de
(molécula de alta energía) superóxido hidrógeno

 Enzimas que destruyen los radicales tóxicos de


oxígeno:
 Superóxido-dismutasa (SOD) 2 •O2- + 2H+  H2O2 + O2

 Peroxidasas (POX) H2O2 + AA*  2 H2O + DHA

 Catalasa (CAT) 2 H 2 O2  O2 + 2 H 2 O

Efectos de las ERO en las células:


Daños al ADN
Oxidación de ácidos grasos en lípidos
* AA: sustrato reducido Oxidación de aa en proteínas
DHA: sustrato oxidado Inactivación de enzimas por oxidación de cofactores
Ejemplo: reacción de la catalasa

Experimento para probar si un microorg. tiene actividad catalasa:


 Dos gotas de H2O2 (30%)  en cada gota se adiciona una carga de
bacterias con el asa microbiológica

CAT (+): burbujeo


intenso de O2 
Catalasa Catalasa
producto de la
negativo positivo
reacción
Efectos del oxígeno en el crecimiento

Aerobios Anaerobios Anaerobios Aero-


Micro-aerófilos
estrictos facultativos estrictos tolerantes
Crecim. aerobio: Crecim. aerobio: Crecim. aerobio y Crecim. anaero- Crecim.
solo donde hay  solo donde hay anaerobio; > crecim. bio: solo donde uniforme: el O2
[O2]  [O2] en presencia de O2 no hay O2 no tiene efecto

Alta

[O2]

Baja

Utilizan O2 [O2] normales  Utilizan O2 No toleran O2 Toleran O2


[ERO] letales
SOD+ SOD+ SOD+ SOD- SOD+
CAT+ CAT  nivel CAT+ CAT- CAT-
6. Factores ambientales
Extremófilo: organismo que se desarrolla en ambientes
extremos
Físicos (temperatura, radiación, presión)
Geoquímicos (desecación, salinidad, pH, ERO, potencial redox)

Glaciar Perito Géiseres del


Moreno, Argentina Psicrófilos Termófilos Tatio, Chile

T < 15°C T 60 – 80°C


T > 80°C
Salina en Guerrero Desierto de
Negro, México Halófilos Xerófilos Atacama, Chile

[NaCl] > aw < 0.85


3.5%

Lago alcalino Laguna ácida,


Ascotan, Chile Alcalófilos Acidófilos Costa Rica

pH > 9 pH < 5
Proceso industrial “Producto” Ventajas Organismo

Hidrólisis de almidón: dextrinas Bacillus


a-amilasa  estabilidad
y jarabe de maíz stearothermophilus
 cantidad de
Blanqueo de papel Xilanasas Termófilos
blanqueador
Procesado de alimentos, pan,
Proteasas Estable a  T’s Termófilos
cerveza, detergentes
Maduración de quesos, Proteasas
Estable a  T’s Psicrófilos
producción de leche neutras
Surfactantes, limpieza de
Biorremediación Eficientes en  T’s Psicrófilos
derrames
Degradación de polímeros en Proteasas, amilasas, Detergentes
Psicrófilos
detergentes lipasas mejorados
Degradación de polímeros en Celulasas, proteasas,
Estables a  pH Alcalófilos
detergentes amilasas, lipasas
Glicerol, solutos Halófilos
Productos farmacéuticos Producción a  $
compatibles (Dunaliella)

Surfactantes para farmacéuticos Membranas Halófilos


Grupo “Producto” Usos
ADN polimerasa Amplificación de ADN por PCR
Proteasas y lipasas Detergentes, alimentos (pan), cerveza
Hiper-
Amilasas Hidrólisis de almidón, prod. de jarabes de maíz
termófilos
Xilanasas Blanqueo de papel
Deg. de petróleo Surfactantes para recuperación de petróleo

Proteasa, lipasa, amilasas Detergentes, cervecería


Proteasas y lipasas Maduración quesos, solución para limpiar lentes
Psicrófilos
b-galactosidasa Hidrólisis de lactosa
Surfactantes Biorremediación

PHAs Plásticos médicos


Polímeros reológicos Recuperación de aceites/petróleo
Halófilos Lípidos Aceite para calentamiento
Osmoprotectores Protecc. de células y proteínas para usos indust.
Microorganismos Biorremedación, ferment. de alimentos salados

Proteasa, celulasa, lipasas Detergentes


Pectinasas Papeles finos, tratamiento de aguas
Alcalófilos
Halófilos-alcalófilos Recuperación de aceites/petróleo
Microorganismos Antibióticos

Microorg. que oxidan S Recup. de metales y desulfuración de carbón


Acidófilos
Microorganismos Ácidos orgánicos y solventes