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Cann
I
..
Principios de
virologia molecular
Alan J. Cann
Este libra de Principios de virologia molecular, que es
la traducci6n de la cuarta edici6n en ingles ha tenido
exito extraordinario. Constituye una introducci6n
esencial a la vimlogia moderna, desde un enfoque
molecular; es una obra clara y concisa, siendo este
uno de sus mas importantes logros.
9 78
Principios de virologia molecular
Alan J. Cann
University of Leicester, UK
Traducci6n de
Javier Buesa Gomez
Doctor en Medicina
Profesor Titular de Universidad
Departamento de Microbiologia y Ecologia
Universidad de Valencia
Esta edici6n de Principles of Molecular Virology, 4a. ed., de Alan J. Cann se publica con
acuerdo con ELSEVIER INC, 200 Wheeler Road, 6th floor, Burlington, MA 01803, USA
Nota:
Tanto ELSEVIER INC como Editorial Acribia no asumen ninguna responsabilidad por
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ISBN: 978-84-200-1135-6
www.editorialacribia.com
Reservados todos los derechos para los paises de habla espanola. Este libra no podra ser reproduci-
do en forma algtma, total o parcialmente, sin el permiso de los editores.
Deposito legal: Z-3 .922/2009 Editorial ACRIBIA, S.A.- Royo, 23 - 50006 Zaragoza (Espana)
INDICE DE CONTENIDO
Prefacio a la cuarta edici6n ....... ........... .......... ......... ....... ..... .... ...... ...... .... ..... ..... IX
Prefacio a la tercera edici6n .... ............ .............................................. ................ XI
Prefacio a la segunda edici6n .... ...... .......... ...... ..... .. .. ...... ...... .......... ..... ..... ......... xm
Prefacio a la prim era edici6n ............... ..... ............... .......................................... xv
Capitulo 1 Introducci6n ....... .. ..... ..... ............ ............ ....... ..... ........... ... ......... .... ... 1
Los virus son distintos de los organismos vivos .......... .......................... ........... 2
La historia de la virologia ...... ...... .... ........ ......... .......... .. ..... .... ....... .... .... ... ... ... .... 3
Sistemas de hues pedes vivos ................. ............... ..... .......... ..................... ......... 5
Metodos de cultivo celular . ... ... .. ... .. .... . .. ... .. ... .. ... ... .. ... .... ... .. .. ... ...... .. ........... ... .. 7
Metodos serol6gicos/inmunol6gicos ...... .. ... ..... .... .. .......... .... ... ......... .... ... ....... ... 8
Estudios ultraestructurales ............... ..... ........... .................... ................ .............. 9
«Biologia molecular»..... ...... .... ... ...... ... .. .. ... ......... .. ... .. .......... ......... ... ......... .. .. .. .. 17
Bibliografia .... ... ... ........ ..... ....... .... ..... ....... ..... ....... ...... ..... .. ... ................ ......... .. ... 22
Capitulo 2 Particulas ..... ... ... .... .... .. ...... .... .. .. ... ....... .. .... ... ..... .. ........ .. ....... ...... .... .. 25
Funci6n y formaci on de las pa1ticulas viricas ..... ... ... ......... .. ...... ...... ... ....... .... ... 25
Simetria de la capside y arquitectura de virus .......... ...... ..... ..... ... ... .... ... .... .. .. .... 27
Virus envueltos .... .... ... ......... .... ... .......... ...... ... ... .... ...... ...... ...... ......... ... ....... ...... .. 39
Virus de estructura compleja ........ .............. .............. ... ........... ... ........ ............. .. . 42
Interacciones proteina-acido nuclei co y empaquetamiento del genoma .... ... ... 47
Receptores viricos: Reconocimiento y union .. .......... ..... ................ ......... .......... 51
Otras interacciones de la capside virica con la celula hospedadora .... .......... .. . 52
Resumen. .......... .. .... ........ ......... .... ....... ..... ....... ...... ...... .... ...... .. ...... .... .... ......... .... . 52
Bibliografia ...... .. .... ... ...... ... ... .......... ............ ........ ....................... .................. ...... 53
Capitulo 3 Genomas .... ... ........... .. ..... ...... ... ......... ..... .... .... ....... ... ........... .. ....... .... .. 55
Estructura y complejidad de los genomas virales ....... .............. ......... .. ........... .. 55
Genetica molecular ... ............ .............. ... .... .. ... .... ...... .. .... ... ....... .... .... ..... .. .. ... ... .. 58
Genetica virica .... .. ............................ ........................................................... ...... 61
Mutantes viricos .... .... .. .... .. .. ......... ............ .. .. ... ... ..... .... .. .... .. .... ....... ................... . 63
Supresi6n .. ................. ................ .......... ............................ ............. ........... ..... ..... 66
Interacciones geneticas entre virus .................. ....... ......... ........................ .......... 67
Interacciones no geneticas entre virus..... .......................................................... 70
Genomas «grandes» de ADN ...... ...... .................................. .. .... .. .................... .. 71
Genomas «pequeiios» de ADN... .. ............ ..... ..... ......................... ...................... 74
Virus ARN de cadena positiva .. ... ..... ........... .... .... .. .... ....... ...... ... .. ..................... 78
Virus ARN de polaridad negativa ................ ............................. .................... .... 81
Virus con genomas segmentados y multipartitos .. ..... ......... ........ ...... ...... ... ....... 83
Transcripci6n inversa y transposici6n ............ ...... ......................................... .... 87
Evoluci6n y epidemiologia .... ..... ..... .. ...................... ...... ............................. .. ..... 95
Resumen.. .. ........... .. .......... .. ......... .. ... .. ................ .. .... ... ... ..... ....... .. .... ...... .. ..... .. ... 99
Bibliografia .. ........ .. .... .. .. .. .. ..... .. .............................. .. ...... .. .... .................. ........... 99
Capitulo 5 Expresion ........... .. ................. ......................... ......... ......... ... .............. 129
Expresi6n de la informacion genetica ...... .. ............. ............. ....................... ...... 129
Control de la expresi6n genica en procariotas ...................... ............................ 130
Control de la expresi6n en e1 bacteri6fago 'A .................................................... 131
Control de la expresi6n genica en eucariotas ..... ... ............................................ 135
Est:rategias de codificaci6n del genoma ..... ...... ...................... .................... ...... . 13 7
Control transcripcional de la expresi6n ....... .... ........ .... ................. ...... .. ............ 148
Control post-transcripcional de la expresi6n ... .. .... .... .... .. ..... .... .......... .. .... .. ...... 153
Resutnen ........ ...... .. ....... ............ ...... ...... .................. ....... ... .............. ........... ......... 161
Bibliografia ........ .. ..... .. .... ... ..... ..... ........................................... .. ................. .. .... .. 162
Capitulo 6 Infeccion ....... ........ ............... ... .... ............. ..... ... ..... .. ........ .. ... .............. 163
Infecciones viricas de plantas .. ..... .......................... ...... ............ .. .. ............... ...... 164
Respuestas inmunitarias a las infecciones viricas en animales ...................... .. 167
Virus y apoptosis....... ....... ............. ...... ... ... .................... ..................................... 172
Interferones ..... ...... ............. ..... ..... ............ ..... ........................................ ..... .... ... . 17 4
Evasion de la respuesta inmunitaria por los virus....... ...... ......... .. .... ................. 178
Interacciones virus-hospedador ....... .. .. ............ .. ............ ... ... .. .... ..... .. .... ........... .. 181
El curso de las infecciones viricas ... .. .... ... .... .. ................................................... 190
Vectores virales y terapia genica .................... .................................. ....... ... ....... 197
Quimioterapia de las infecciones viricas .. ................................ ...... .......... ......... 198
Resutnen ···············'·················· ·· ···· ·········································· ·· ························· 204
-
Bibliografia .................... ............ ..... .. .... .... ....... ..................... .... ......................... 204
Capitulo 7 Patogenesis .............................................................. ,.. ....................... 207
Mecanismos de lesion celular .... .......... .. .. ............... ............ .................... ........... 209
Virus e inmunodeficiencia ... .. .... .. ..... ............. ... ............... ..... ... .... ........ ... .... ... .. .. 211
Enfermedades relacionadas con virus .................. ...... ....................................... 220
Bacteri6fagos y enfennedad hum ana ...... .. ..... ..... ... ....... ...... ..... ..... ... ... .... ..... ..... 223
Transformaci6n celular por virus ... ...... ... ....... .......... ........ ... ..... ..... ...... ...... ........ 224
Virus y cancer ... .................................................................................. ... ....... ..... 236
Virus nuevos y emergentes .. ........ .. ............... ... ........... ............ .. ...... ................ ... 239
Zoonosis ................ ..... .. .. ... .................. ......... ... ... .... .......... ...... .. .. ...... ........... ..... .. 245
Bioterrorismo .......... ... ...... ....... .................. ...... .. .............. .. .. ....... ....... ................. 246
Resumen............ ............... .. ............ ...... ........ .. .... .......... ........... .. ........... ............ .. 24 7
Bibliografia ..................................................................................... ... ................ 247
Capitulo 8 Agentes subvirales: genomas sin virus, virus sin genomas ......... 249
Satelites y viroides .. ........... ..... .............. ... .......... ......... ...... ........ .. ... .. ........ .... ... ... 249
Priones ....................................................... ............... .... ..... .... ......................... ... 253
Resumen..... .. .. ........ .... ............. ........ ........ .. ... .. .. ..... .... ... ... ........... ............... .. ....... 267
Bibliografia ...... ............. .. .............. .. ..... .. ..... .. ... .. .. . .. .. ....... ...... .. ... .. ..... .. ....... ....... 267
Alan J. Cann
Universidad de Leicester, R. U.,
alan.cann@leicester. a c. uk
Abril 2005
* N.
-
del Editor: El CD acompafia a Ia edici6n inglesa.
- ., - ~.----.... .. --
CAPiTULO 1
INTRODUCCION
Existe una mayor diversidad biologica entre los propios virus que entre todo el
conjunto de bacterias, plantas y animales. Este hecho es el resultado del exito que estos
agentes tienen parasitando todos los grupos conocidos de organismos vivos, y com-
prender esta diversidad es la clave para .entender las interacciones entre los virus y sus
organismos hospedadores. Este libro trata sobre «virologia molecular» en uil sentido
bastante amplio; esto es, «virologia a nivel molecular» o quiza incluso «moleculas y
virus». Las interacciones proteina-proteina, proteina-acido nucleico y proteina-lipido
determinan la estructura de las particulas viricas, la sintesis y la expresion de los
genomas virales y los efectos que los virus tienen sobre la celula hospedadora. Esto es
virologia a nivel molecular.
Sin embargo, antes de entrar en materia, es necesario comprender la naturaleza de
los virus. Seria Util tambien conocer algo sobre la historia de la virologia o, mas exac-
tamente, de como surgio la virologia como una disciplina independiente para entender
mejor sus objetivos actuales y sus direcciones futuras. Estos son los propositos de este
capitulo introductorio. Algunos lectores pueden desconocer los fundamentos de algu-
nas tecnicas mencionadas en el mismo. Para ellos podria ser de ayuda la consulta de la
Principios de virologia molecular
bibliografia citada al final del capitulo para familiarizarse con estos metodos. En este y
en los capitulos siguientes, las palabras escritas en color se definen en el glosario
(Apendice 1).
Ningun virus conocido posee el potencial genetico o metabolico para generar la ener-
gia necesaria para desarrollar todos los procesos biologicos (por ej., la sintesis de macro-
moleculas). Son por tanto totalmente dependientes de la celula hospedadora para esta
funcion. A menudo se plantea la pregunta de si los virus estan vivos o no. Una opinion es
que dentro de la celula hospedadora los virus estan vivos, mientras que fuera son simple-
mente ensamblajes de compuestos quimicos metabolicamente inertes. Esto no quiere
decir que nose produzcan cambios quimicos en los virus extracelulares, como se expli-
cara en otro Iugar, pero no son en el sentido del «crecimiento» de un ser vivo.
Un error frecuente es considerar que los virus son mas pequefios que las bacterias.
Aunque esto es cierto en la mayoria de los casos, el tamafio solo no sirve para distin-
guir entre ambos. Los virus mas grandes conocidos (Mimivirus, por mimetizar micro-
bios) tienen 400 nm de diametro, mientras que las bacterias mas pequefias (por ej.,
Mycoplasma, Ralstonia pickettii) tiene solo de 200 a 300 nm de longitud. Aunque
siempre habra algunas excepciones e incertidumbres en los casos de organismos de-
masiado pequefios para ser observados y en muchos casos dificiles de estudiar, en la
mayoria, las directrices anteriormente expuestas son suficientes para definir un virus.
lntroducci6n
LA HISTORIA DE LA VIROLOGiA
Es frecuente considerar los sucesos que ocurrieron antes de nuestra propia expe-
riencia personal como prehistoricos. Se ha escrito mucho sobre la virologia como una
«nueva» disciplina en biologia, y esto es cierto en lo referente al reconocimiento for-
mal de los virus como agentes diferentes a otros seres vivos. Sin embargo, hoy com-
prendemos que nuestros antepasados no solo eran conscientes de los efectos de las
infecciones viricas, sino que en ocasiones desarrollaron estudios sobre las causas y la
prevencion de estas enfermedades. Probablemente el primer registro escrito de una
enfermedad virica aparezca en un jeroglifico de Menfis, la capital del imperio antiguo
de Egipto, dibujado aproximadamente en el afio 3700 a.C., que representa a un sacer-
dote del templo mostrando los signos tipicos de una poliomielitis paralitica. El faraon
Ramses V, que murio en 1196 a.C. y cuya momia extraordinariamente bien preservada
se conserva en un museo de El Cairo, se cree que fallecio de viruela: el parecido entre
las lesiones pustulosas del rostro de la momia y otras de pacientes mas recientes es
asombroso.
La viruela fue endemica en China hacia e1 afio 1000 a. C. Como defensa se desarro-
llo la practica de la variolizacion. Tras reconocer que los supervivientes de brotes de
Principios de virologia molecular
viruela quedaban protegidos de poste1iores contagios, los chinos inhalaron las costras
secas de lesiones de viruela como si se tratase de rape o, en modificaciones posterio-
res, inocularon el pus de lesiones realizando escoriaciones en el antebrazo. La
variolizaci6n se practic6 durante siglos, y se mostr6 como un metodo efectivo para
prevenir la enfermedad, aunque arriesgado, porque el resultado de la inoculaci6n era
siempre incierto. iEl propio Edward Jenner estuvo a punto de morir como resultado de
la variolizaci6n a los 7 afios de edad! No es sorprendente que esta experiencia le im-
pulsase a encontrar un tratamiento altemativo mas seguro. El 14 de mayo de 1796
utiliz6 material de una infecci6n por viruela de las vacas de la mano de Sarah Nemes,
una ordefiadora de Berkeley, su villa natal en el condado de Gloucestershire, para va-
cunar con exito al nifio de 8 afios James Phipps. Atmque al principio fue discutida, la
vacunacion frente a la viruela fue casi universalmente adoptada durante el siglo XIX.
Este exito temprano, aunque triunfo de la observaci6n cientifica y del razonamien-
to, no se bas6 en una verdadera comprensi6n de la naturaleza de los agentes infeccio-
sos, que surgi6 independientemente de otra linea de pensamiento. Antony van
Leeuwenhoek (1632-1723), un comerciante holandes, construy6 los primeros micros-
copios simples con los que identific6 bacterias como los «animalculos» que observ6 en
sus preparaciones. Sin embargo, no fue hasta que Robert Koch y Louis Pasteur alla por
1880 conjuntamente propusieran la «teoria germinal» de la infecci6n que la relevancia
de los microorganismos se hiciera evidente. Koch defini6 sus cuatro famosos criterios
conocidos como «postulados de Koch», que todavia son considerados generalmente
como la prueba de que un agente infeccioso es responsable de una enfermedad especi-
fica:
• El agente debe estar presente en cada caso de la enfermedad.
• El agente debe aislarse del huesped y cultivarse in vitro.
• La enfermedad debe reproducirse cuando un cultivo puro del agente se inocula a un
hospedador susceptible sano.
• El mismo agente tiene que ser recuperado de nuevo del hospedador infectado expe-
rimentalmente.
Posteriormente, Pasteur trabaj6 intensamente en rabia, la cual identific6 como una
enfermedad causada por un «virus» (que significa «veneno» en latin), pero a pesar de
ello no distingui6 entre bacterias y otros agentes productores de enfermedad. En 1892,
Dimitri Iwanowski, un botanico ruso, demostr6 que extractos de plantas de tabaco
enfermas podian transmitir la enfermedad a otras plantas tras pasar a traves de filtros
de ceramica suficientemente finos para retener las bacterias mas pequefias conocidas.
Desafortunadamente, no lleg6 a comprender el significado de sus observaciones. Unos
pocos afios despues (1898), Martinus Beijerinick confirm6 y ampli6 los resultados de
lwanowski con el virus del mosaico del tabaco (VMT) y fue el primero en desarrollar
el concepto modemo de virus, que el describi6 como contagium vivum fluidum («ger-
men vivo soluble»). Freidrich Loeffler y Paul Frosch (1898) demostraron que un agen-
te similar era responsable de la fiebre aftosa del ganado, pero, a pesar de la compren-
si6n de que estos agentes recien descubiertos causaban enfermedades tanto en animales
como en plantas, la gente no acept6 la idea que de que podian tener algo que ver con
lntroducci6n
enfermedades humanas. Esta resistencia fue finalmente disipada en 1909 por Karl
Landsteiner y Erwin Popper, quienes demostraron que la poliomielitis era causada por
un agente filtrable: la primera enfermedad humana reconocida como causada por un
virus.
Frederick Twort (1915) y Felix d'Herelle (1917) fueron los primeros en reconocer
que los virus infectan bacterias, que d'Herelle denomin6 bacteri6fagos («devoradores
de bacterias»). En 1930 yen las decadas siguientes, vir6logos pioneros como Salvador
Luria, Max Delbruck y muchos otros utilizaron estos virus como sistemas modelo para
investigar muchos aspectos de la virologia, incluida la estructura (Capitulo 2), geneti-
ca (Capitulo 3) y replicaci6n de los virus (Capitulo 4). Estos agentes relativamente
simples han demostrado ser, desde entonces, muy importantes para nuestro conoci-
miento de todos los tipos de virus, incluyendo los de los humanos, que son mucho mas
dificiles de propagar y estudiar. La continuaci6n de la historia de la virologia es un
relato del desarrollo de herramientas experimentales y de sistemas con los cuales los
virus puedan ser examinados, que han abierto nuevas areas de la biologia, incluyendo
no solo la biologia de los propios virus sino tambien, inevitablemente, la biologia de
las celulas hospedadoras de las que estos agentes son totalmente dependientes.
zado por estos metodos un numero creciente de genes de virus animales y de plantas,
pero los resultados no han sido siempre los esperados, y en muchos casos ha resultado
dificil cornparar las observaciones realizadas con las recogidas de infecciones experi-
mentales. No obstante, este metodo va a ser sin duda ampliamente utilizado conforme
se vayan resolviendo las dificultades tecnicas asociadas ala construccion de organis-
mos transgenicos .
Los cultivos celulares comenzaron a principios del siglo XX con cultivos de orga-
nos completos, luego progresaron a metodos que comprendian celulas individualizadas,
bien cultivos de celulas primarias (celulas somaticas de un animal de experimenta-
cion o tomadas de un paciente humano, que pueden mantenerse en cultivo durante un
periodo breve de tiempo) o bien lineas celulares inmortalizadas, que, en las condicio-
nes adecuadas pueden continuar creciendo en cultivo indefinidamente.
En 1949, John Enders y sus colegas fueron capaces de propagar virus de la polio en
cultivos de celulas humanas primarias. Este logro marco el comienzo de lo que algu-
nos han considerado «la edad de oro de Ia virologia» y condujo al aislamiento y Ia
identificacion durante los aiios 50 y 60 de muchos virus asociados con enfermedades
humanas: por ejemplo, muchos enterovirus y virus respiratorios, tales como los adeno-
virus. El aislamiento de virus ampliamente distribuidos en Ia poblacion hizo compren-
der que las infecciones viricas subclinicas son muy comunes; por ejemplo, incluso
durante las epidemias por las cepas mas virulentas de virus de la polio se producen
aproximadamente 100 infecciones subclinicas por cada caso de paralisis por
poliomielitis.
Renato Dulbecco fue el primero que en 1952 cuantifico con precision virus anima-
les utilizando un ensayo de placas de !isis. En esta tecnica se preparan diluciones del
virus con las que se infectan celulas crecidas en monocapas, que despues se recubren
con agar blando para impedir la difusion del virus. Este destruye las celulas en focos
localizados que se observan como calvas o placas al tefiirse la monocapa (Figura 1.1).
Mediante el recuento del numero de placas se determina directamente el nfunero de
particulas viricas infecciosas inoculadas al cultivo. La misma tecnica puede ser aplica-
da para clonar un virus (es decir, aislar una forma pura a partir de una mezcla de tipos ).
Esta tecnica fue us ada durante un tiempo para cuantificar el numero de particulas viricas
infectivas en suspensiones de bacteriOfagos aplicadas a «cespedes» confluentes de
bacterias en placas de agar, pero su aplicacion a virus de eucariotas permitio rapidos
avances en el estudio de la replicacion viral. Los ensayos de plaqueo reemplazaron las
tecnicas anteriores de dilucion limite, tal como el analisis de Ia dosis infecciosa al 50%
en cultivo celular («tissue culture infectious dose», TCID 50 en ingles), que consiste en
un metodo estadistico para medir la poblacion virica en cultivo; las tecnicas de dilu-
cion limite pueden utilizarse todavia en algunas circunstancias, por ejemplo con virus
que no son citopaticos y no producen placas (por ej ., el virus de Ia inmunodeficiencia
humana).
Principios de virologfa molecular
Hacer diluciones
seriadas del virus
0 0
0
Los ensayos de plaqueo se realizan aplicando una diluci6n adecuada de una preparaci6n de
virus a una monocapa confluente o semiconfluente de celulas susceptibles. Tras dejar un tiempo para
que el virus se fije a las celulas y las infecte, el medio llquido se sustituye por un medio de cultivo
semi solido que contenga un polimero como agarosa o carboximetilcelulosa, que restringe Ia difusi6n de
las particulas viricas desde las celulas infectadas. Tras un periodo de incubaci6n, el medio generalmente
se retira y las celulas se tifien para hacer mas facilmente visibles los agujeros (placas o calvas) en Ia
monocapa. Cada placa resulta por tanto de Ia infecci6n por una sola unidad ora de placa (u.f.p. ).
Los estudios ultraestructurales pueden ser considerados de tres tipos: metodos fisi-
cos, metodos quimicos y microscopia electr6nica. Las mediciones fisicas de particulas
Principios de virologfa molecular
(I)
Directa: lndirecta:
(2)
I \
Sustrato
incoloro
Directa: lndirecta:
Leyenda:
A Anticuerpo primario
Molecula «detectora»: complemento, enzima,
is6topo radioactive o colorante fiuorescente
Figura 1.2 Es dificil no sobreestimar la importancia de las tecnicas serol6gicas en virologia. Los
cuatro ensayos ilustrados en los diagramas de esta figura se han utilizado durante muchos afios y tienen
una amplia aplicaci6n. (a) La reacci6n de fijaci6n del complemento se basa en que el complemento es
secuestrado por complejos antigeno-anticuerpo. Gl6bulos rojos «sensibilizados» recubiertos de anti-
cuerpos, complemento a una concentraci6n conocida, antigeno virico y el suero problema se afiaden a
pocillos de una placa de microtitulaci6n. En ausencia de anticuerpos frente al antigeno virico, el com-
plemento libre causa Ia !isis de los gl6bulos rojos sensibilizados (hem6lisis). Si, por el contrario, el
suero contiene anticuerpos frente al virus a un titulo suficientemente alto, el complemento sera «fijado»
y no quedara disponible para producir hem6lisis. Se calcula el titulo del suero problema efectuando
diluciones seriadas del mismo y midiendo cuantitativamente la cantidad de anticuerpos antivirus que
contiene. (b) La inmunojluorescencia se realiza con anticuerpos conjugados covalentemente con una
molecula fluorescente que emite una luz coloreada caracterfstica cuando se ilumina por luz de una
longitud de onda diferente, tal como la rodamina (roja) o la fluoresce ina (verde). En la inmunofluores-
(contimla)
lntroducci6n
(continuaci6n)
cencia directa, el propio anticuerpo frente al virus esta conjugado con el marcador fluarescente, mien-
tras que en Ia indirecta un segundo anticuerpo que reacciona con el anticuerpo antivirus es el que esta
marcado. La inmunofluorescencia se puede utilizar no s6lo para identificar celulas infectadas con virus
en poblaciones de celulas o en cortes de tejidos, sino tambien para detenninar Ia localizaci6n subcelular
de proteinas viricas concretas (par ej ., en el nucleo o en el citoplasma). (c) Los ensayos inmunoenzimaticos
(«enzyme-linked immunosorbent assays», ELISA en ingles) son metodos rapidos y sensibles para iden-
tificar y cuantificar pequefias cantidades de antigenos vfricos o de anticuerpos antivirus. Se tapiza Ia
superficie de una placa de multiples pocillos con un antigeno (cuando el ELISA sea para detectar anti-
cuerpos) o con un anticuerpo (cuando el ELISA sea para detectar antigenos ). A continuaci6n se afiade un
anticuerpo especifico para el antigeno analizado, conjugado con una enzima (como fosfatasa alcalina o
peroxidasa de rabano p icante). Como en Ia inmunofluorescencia, el ELISA puede ser disefiado para
detectar directa o indirectamente el antfgeno. Tras una corta incubaci6n, un sustrato incoloro es conver-
tido par Ia enzima en un producto coloreado, amplificando Ia sefial producida par muy pequeiias canti-
dades de antigeno. La intensidad del producto puede facilmente ser medida en un espectrofot6metro
(«lector de placas»). Los ensayos de ELISA pueden ser automatizados y par tanto sirven para analizar
rutinariamente grandes cantidades de muestras clfnicas. (d) El Western blot se utiliza para analizar una
proteina virica especifica en una mezcla compleja de antigenos. Las preparaciones que contienen antigenos
viricos (particulas, celulas infectadas o muestras clfnicas) se someten a electroforesis en un gel de polia-
crilamida. Las proteinas en el gel se transfieren a una membrana de nitrocelulosa o nylon y se inmovilizan
en sus posiciones relativas en el gel. Los antigenos especificos se detectan incubando la membrana con
anticuerpos dirigidos contra el antigeno de interes. Utilizando marcadores con proteinas de tamafios
moleculares conocidos se puede detem1inar el peso molecular y Ia concentraci6n relativa de antigeno en
las muestras analizadas.
Principios de virologia molecular
-
~ Virus purificado
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Densidad
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Absorci6n ultravioleta - 10
Figura 1.4 Existen diferentes tecnicas de sedimentaci6n que pueden aplicarse para estudiar los virus.
En Ia centrifugaci6n zonal (mostrada aqui) las particulas viricas se colocan sobre un gradiente de densi-
dad preformado, por ejemplo, una soluci6n de sacarosa o una soluci6n salina de densidad creciente
desde Ia porci6n superior al fondo del tubo (arriba de Ia figura). Tras un periodo de tiempo en una
ultracentrifuga, el gradiente se separa en un numero de fracciones, que se analizan buscando en ellas Ia
presencia de particulas viricas. En Ia figura, el acido nuclei co del genoma viral se detecta por su absor-
ci6n de luz ultravioleta (abajo). Este metoda puede emplearse tanto para putificar particulas viricas o
acidos nucleicos como para determinar sus caracteristicas de sedimentaci6n. En Ia centrifugaci6n
isopicnica o en equilibria, Ia muestra se encuentra en una mezcla hom6loga que contiene una sal densa
como cloruro de cesio. Durante su centrifugaci6n, se establece un gradiente de densidad en el tuba, y Ia
muestra forma una banda en Ia fracci6n con una densidad equivalente a Ia suya propia. Este metodo
puede ser utilizado por lo tanto para determinar Ia densidad de las particulas viricas y es empleado
habitualmente para purifica.r ADN plasmidico.
cartan cualquier estudio (por ej., el virus de la hepatitis C). El virus purificado debe
producir tambien redes paracristalinas suficientemente grandes para causar una
difracci6n significativa de la fuente de radiaci6n. Para algunos virus esto es relativa-
mente f:kil, y forman cristales suficientemente grandes para resultar visibles a simple
vista que producen una intensa difracci6n. Esto es particulamente cierto con algunos
virus de vegetales, como el virus del mosaico del tabaco (que fue cristalizado por
primera vez por Wendell Stanley en 1935) y el virus del mosaico del nabo amarillo
(VMNA) (turnip yellow mosaic virus, TYMV en ingles), cuyas estructuras fueron las
primeras en ser determinadas en los afios 50. Es significative que las estructuras de
estos dos virus representen los dos tipos fundamentales de pmiiculas viricas:
dal, en el caso del VMT, e · para el VMNA (ver Capitulo 2). En muchos
Principios de virologia molecular
casos, sin embargo, solo se logra preparar cristales microscopicos. Una respuesta parcial
a este problema consiste en utilizar fuentes mas potentes de radiacion que permitan obte-
ner buenos datos de pequefios cristales. Durante las ultimas decadas se han construido
potentes fuentes sincrotron que generan intensas emisiones de radiacion que se estan
utilizando actualmente con estos propositos; sin embargo existe un limite, mas alla del
cual esta estrategia de fuerza bruta no ofrece mas beneficios. Algunos virus impmiantes
se resisten firmemente a ctistalizar; este problema es particulam1ente frecuente con los
virus de formas irregulares -por ejemplo, los que tienen una envoltura extema lipidica-
y hasta el momenta no se ha conseguido dilucidar la estructura atomica completa de alta
resolucion de muchos virus de este tipo (por ej., VIH). Modificaciones en las tecnicas
basicas de difraccion (tales como la dispersion de electr·ones por conjuntos de proteinas
asociadas a membranas y criomicroscopia electronica) pueden ayudar en el futuro a aportar
mas informacion, pero es improbable que estas variaciones resuelvan completamente el
problema. Una limitacion mas es que algunos de los virus mas grandes, tales como los
poxvirus, contienen cientos de proteinas diferentes y por el momenta son demasiado
complejos para ser analizados con estas tecnicas.
La resonancia magnetica nuclear (RMN) esta siendo cada vez mas utilizada para
detenninar la estructura atomica de todo tipo de moleculas, incluyendo proteinas y
acidos nucleicos. La limitacion de este metoda es que solo sirve para ana!izar molecu-
las relativamente pequefias, antes de que las seiiales obtenidas se vuelvan tan confusas
que resulten imposibles de descifrar con la tecnologia actual. Por el momenta, ellimite
de tamafio superior de esta tecnica restringe su uso para moleculas con un peso mole-
cular menor de 30.000 a 40.000, Io que es un tamafio considerablemente menor al que
tienen las particulas viricas mas pequefias. No obstante, este metoda puede resultar de
utilidad en el futuro, seguramente para examinar proteinas viricas aisladas, e incluso
viriones intactos.
Los estudios quimicos pueden ser aplicados para analizar no solo Ia composicion
quimica completa de los virus y la naturaleza del acido nucleico que compone su genom a,
sino tambien Ia eshuctura de la particula y el modo en que los componentes individuales
se relacionan unos con otros en la capside. Muchos estudios clasicos sabre eshuctura
viral se han basado en la disrupcion escalonada y gradual de las particulas por una altera-
cion lenta del pH o por una adicion progresiva de agentes desnaturalizantes como urea,
fenol o detergentes. Bajo estas condiciones se puede obtener a veces informacion valiosa
de experimentos relativamente sencillos. Por ejemplo, cuando se afiade urea gradual-
mente a preparaciones de particulas purificadas de adenovirus, estas se deshacen de una
forma ordenada y escalonada, liberando agregados de proteinas viricas que revelan la
composicion de las particulas. En el caso del TMV se han llevado a cabo estudios simi-
lares sabre la organizacion de la capside, mediante renaturalizacion de las proteinas de Ia
capside bajo distintas condiciones (Figura 1.5). En terminos sencillos, los reactivos em-
pleados para desnaturalizar las capsides de virus pueden indicar la base de las interaccio-
nes que se establecen entre sus componentes. Las proteinas que se unen por interaccio-
nes electrostaticas pueden separarse al aiiadirse sales ionicas o alterando el pH; aquellas
que se unen por interacciones hidrofobicas, no ionicas, pueden ser eluidas por reactivos
como la urea; las proteinas que interaccionan con componentes lipidicos se pueden eluir
con detergentes no ionicos o solventes organicos.
lntroducci6n
Figura 1.5 La estructura y !a estabilidad de las particulas viricas pueden examinarse mediante estudios
de desnaturalizaci6n y renaturalizaci6n progresivas. A una fuerza i6nica determinada, las proteinas purifi-
cadas de !a capside del virus del mosaico del tabaco (VMT) se ensamblan espontaneamente en diferentes
estructuras, dependiendo del pH de !a soluci6n. A un pH alrededor de 6,0 las particulas formadas tienen
una estructura muy similar ala de las particulas viricas infecciosas. Cuando el pH se incrementa aproxima-
damente a 7,0 se ensamblan estructuras en forma de disco. A valores de pH mas elevados, los mon6meros
individuates de Ia capside no son capaces de ensamblarse en estructuras mas complejas.
Canon
} de electrones
0 0 Lentedel
condensador
.
Pnmera
lente del
condensador
0
__ Muestra
0 0
Lente
intermedia Segunda
lente del
0
condensador
Imagen
final
Figura 1.6 Principios del funcionamiento de los microscopios electr6nicos de transmisi6n y de banido.
«BIOLOGiA MOLECULAR»
I
Hibridaci6n en fase s61ida
(a) acidos
Mezclanucleicos
complejafijados \ (c) Eliminar Ia sonda
de (b) Anadir Ia sonda marcada no hibridada
a membrana y permitir su hibridaci6n y analizar Ia cantidad
de nitrocelulosa o nylon con Ia secuencia diana de marcador ligado
~ /\
>:-C?~>..----=-----,
quier aplicaci6n de los ordenadores a !a biologia. Esto puede incluir cualquier cosa
desde la inteligencia artificial y Ia rob6tica hasta el analisis gen6mico. Mas especifica-
mente, el tennino alude al procesamiento por ordenador de datos de secuencias biol6-
gicas, incluyendo el analisis estructural de proteinas. La bioinf01matica permite inferir
la funci6n a partir de la secuencia lineal, y esto es aplicable a todas las areas de Ia
biologia. Debido a la avalancha de informacion sobre nuevas secuencias, los ordena-
dores cada vez se utilizan mas para hacer predicciones sobre secuencias nucleotidicas
Principios de virologfa molecu lar
Primer ciclo
Segundo ciclo
Figura 1.8 La reacci6n en cadena de la polimerasa (PCR) se fundamenta en Ia especificidad del aco-
plamiento de bases entre unos cebadores constituidos por oligonucle6tidos sinteticos cortos y las se-
cuencias complementarias presentes en una mezcla complej a de acidos nucleicos, para promover Ia
sintesis de ADN utilizando una ADN polimerasa termoestable. Se efecruan multiples ciclos de acopla-
miento de cebadores, extension y desnaturalizaci6n termica en un proceso automatico, que da como
resultado Ia amplificaci6n masiva (un incremento de 2n veces tras n ciclos de amplificaci6n) de la
secuencia diana situada entre los dos cebadores.
(Figura 1.9). Ello incluye detectar pautas de lectura abiertas («open reading frames»,
ORFs en ingles), las secuencias de aminoacidos de las proteinas codificadas por ellas,
regiones de control de genes, como promotores y sefiales de corte y empalme, y las
estructuras secundarias de proteinas y de acidos nucleicos. Sin embargo, especialmen-
te en el caso del ARN, la estructura secundaria adoptada por las moleculas es casi tan
importante como la secuencia nucleotidica primaria para determinar las reacciones
biol6gicas que esa molecula puede experimentar. Es necesario tener precauci6n en
interpretar esta informacion predecida mas que real, y la validez de tales predicciones
no deberia ser aceptada sin dudar, a no ser que sea confirmada por datos bioquimicos
lntroducci6n
!' l l l j l l i i l l i i l j l l 11 l l i l l j l l l l l l 11 l j l l l l l l l l l j l i l l l l l 11 jl 11 1 1 ' ' ' ' 1 ' ' ' ' 1 111111111 1 111111111 1 1 1111 ') 9.719
- LTR
poliproteina env
ex6n o
c::=======:::J
ex6n D - LTR*
• region repetida ex6n ex6n • regi6n repetida
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ARNm
transcrito primario
HXB2 gen6mico
intr6n setial poli-A
intr6n
Leyenda: = secuencia
codificante/intr6n/ex6n =ARN - otras caracteristicas
rrmrrrrrl - 1.000-2.000 nt
Figura 1.9 Un ejernplo del empleo de un ordenador para almacenar y procesar infmmaci6n digitalizada
de una secuencia de acido nucleico. Esta figura muestra un analisis de todas las pautas de lectura abier-
tas (open reading frames, ORFs en ingles) presentes en un provirus de VIH-1. Se muestran los ORFs
presentes en los tres genes principales de los retrovirus, gag, pol y env. Este complejo ana!isis dur6
solamente unos segundos con un ordenador personal corriente. De forma manual, este trabajo habria
costado varios dias.
y/o geneticos. No obstante, cuando la estructura de una proteina haya sido detem1ina-
da por cristalografia de rayos X o RMN, su forma puede ser modelada y explorada en
tres dimensiones en computadores (Figura 1.1 0).
Figura 1.10 Estmctura tridimensional del dominio de union al ADN del antigeno T de SV40 recons-
truido utilizando un ordenador a partir de datos obtenidos por resonancia magnetica nuclear (RMN).
Principios de virologfa molecular
Virus de la hepatitis B 4 75
SV40 6 100
Virus herpes simplex 80 95
Mimivirus 900 10
Escherichia coli 4.288 60
Levadura 6.600 40
Caenorhabditis elegans 19.000 40
Drosophila 14.000 25
Arabidopsis 25.000 40
Raton 100.000 10
Hombre 100.000 10
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Kuby,J., Goldsby, R., Kindt, TJ., and Osborne, B. (2003). Immunology. W.H. Freeman,
NewYork. ISBN 0716749475.
lntroducci6n
PARTiCULAS
El
Principios de virologia molecular
VirusADN
Poxviridae
·
~J 0
-~
\~ ,.:;,
.,. --~
~-
Hepadnaviridae
0
Retroviridae
Virus ARN
( )
Fi/oviridae
Orthomyxoviridae
0Bunyaviridae
•
•
Arenaviridae (Coronavirus) (Torovirus)
Coronaviridae
Pie de figura
Partfculas
secretadas por vertebrados como defensa contra la infeccion. En los virus con genomas
de una sola cadena, la rotura de un simple enlace fosfodiester o la modificacion quimica
de un solo nucleotido es suficiente para inactivar esa particula virica, haciendo imposible
la replicacion de su genoma. (,Como se consigue la proteccion frente a todo esto? Las
subunidades proteicas de una capside virica son multiples y redundantes (es decir, exis-
ten muchas copias por particula). El dafio ocasionado a una o mas subunidades puede
afectar a su funcion, pero rara vez un dafio restringido destruye la infectividad de la
particula virica completa. Esto convierte a la capside en una barrera eficaz.
Las capas de proteina que rodean a la particula virica son muy resistentes, tan fuertes
como un plastico duro, como el Perspex® o el Plexiglas®, aunque, por supuesto son
solamente una milmillonesima parte de un metro mas o menos de diametro; sin embargo,
tambien son ellisticas y capaces de deformarse hasta un tercio sin romperse. Esta combi-
nacion de fuerza, flexibilidad y tamafio pequefio significa que fisicamente es dificil (aun-
que no imposible) romper particulas viricas mediante presion fisica.
La superficie extema de un virus es tambien responsable del reconocimiento y la
primera interaccion con la celula hospedadora. Inicialmente, esto consiste en la union
especifica de una proteina virica de adhesion a una molecula receptora de la celula.
Sin embargo, la capside juega tambien un papel iniciando la infeccion al entregar el
genoma de una forma en que puede interaccionar con la celula hospedadora. En algunos
casos este es un proceso simple que consiste en descargar el genoma dentro del citoplas-
ma de la celula. En otros casos, esta etapa es mucho mas compleja; por ejemplo, los
retrovirus llevan a cabo intensas modificaciones del genoma viral cuando todavia esta
dentro de la particula virica, convirtiendo dos moleculas de ARN de simple cadena en
una molecula de ADN de doble cadena, antes de conducirlo al nucleo celular. Por tanto,
el papel de la capside es vital para que los virus puedan establecer una infeccion.
Para conseguir formar particulas infecciosas, los virus deben superar dos problemas
fundamentales. Primero, tienen que ensamblar la particula utilizando la informacion dis-
ponible en los propios componentes que forman la particula. Segundo, las particulas
adquieren formas geometricas regulares, a pesar de que las proteinas de las que estan
fabricadas tienen formas irregulares. (,Como resuelven estos organismos tan simples es-
tas dificultades? La solucion a ambos problemas radica en las leyes de la simetria.
Es posible imaginar una particula virica cuya cubierta extema (la capside) consistie-
ra en una sola proteina hueca, que al plegarse para adquirir su conformacion madura
Figura 2.1 Diagrama ilustrando las formas y tamaiios de virus de familias que incluyen pat6genos de
animales y de humanos. Los viriones estan dibujados a escala, aunque se han permitido licencias artis-
ticas a! representar sus estructuras. En algunos se muestran las secciones de capside y envoltura, con la
representaci6n del genoma. Para los virus muy pequefios solo se representan los tamaiios y los tipos de
simetria. (Cortesia de F.A. Murphy, Facultad de Veterinaria, Universidad de California, Davis).
Principios de virologia molecular
Capsides helicoidales
El virus del mosaico del tabaco es el representante de una de las dos principales
clases estructurales que se observan en los virus, los de simetria helicoidal. La forma mas
simple de ordenar multiples subunidades proteicas identicas es utilizando la simetria
rotacional y ordenar las proteinas con formas irregulares alrededor de la circunferencia
de un circulo para formar un disco. Multiples discos pueden ser ap ilados uno encima del
otro para formar un cilindro, con el genoma virico recubierto por la cubierta proteica o
contenido en el centro hueco del cilindro. Los estudios de desnaturalizacion y de transi-
cion de fase del VMT sugieren que esta es la forma que adquiere esta particula (ver
Capitulo 1).
Un examen mas detallado de la particula del VMT por cristalografia de rayos X reve-
la que la estmctura de la c:ipside realmente consiste en una helice mas que en una pila de
Partfculas
discos. Una helice puede defmirse matematicamente por dos parametros: su amplitud
(diametro) y su inclinaci6n (la distancia recorrida por cada vuelta completa de la helice)
(Figura 2.2). Las helices son estructuras bastante simples que estan formadas por un
apilamiento de componentes repetidos con una relaci6n constante (amplitud e inclina-
ci6n) unos con otros. Debe tenerse en cuenta que si estas simples condiciones se rompen,
se forma una espiral en vez de una helice, y esta espiral es bastante poco adecuada para
contener un genoma virico. En terminos de subunidades proteicas individuates, las heli-
ces se describen por el numero de subunidades por giro de la he lice, f.l, y por el incremen-
to axial por subunidad, p; por tanto, la inclinaci6n de una he! ice, P, es igual a:
P = f.l Xp
Para el VMT, f.l = 16,3; es decir, existen 16,3 moleculas de cubierta proteica por
giro de la helice, y p = 0,14 nm. Por lo tanto, la inclinaci6n de la heiice del VMT es
16,3 x 0,14 = 2,28 nm.
Las particulas del VMT son estructuras rigidas en forma de varilla, pero algunos virus
helicoidales muestran una flexibilidad considerable, y las particulas viricas helicoidales
mas largas a menudo estan curvadas o dobladas. Flexibilidad es probablemente un atri-
Inclinaci6n de la belice
P =2,28 nm
11 =16,3
(subunidades/vuelta de helice)
- - -.- p=0,14 nm
-J- ·Incremento axiaVsubunidad
Figura 2.2 El virus del mosaico del tabaco (VMT) tiene una capside que consiste en muchas molecu-
las de una proteina ordenada en una sola capa manteniendo una relaci6n constante, formando una helice
con una inclinaci6n de 2,28 A.
Principios de virologia molecu lar
buto importante. Las particulas helicoidales largas estan probablemente sometidas a fuerzas
de ciza11amiento, y su habilidad por doblarse reduce la probabilidad de rotura o dafio.
Que la simetria helicoidal es una forma eficaz de crear una particula a partir del
ordenamiento de una sola subunidad proteica se ve confirmado por el hecho de que un
gran numero de diferentes tipos de virus ha evolucionado con este tipo de organizaci6n
de la capside. Entre las capsides helicoidales mas sencillas se encuentran las de los cono-
cidos bacteriOfagos de la familia lnoviridae, como M13 y fd . Estos fagos tienen unos
900 nm de longitud y 9 nm de diametro, y las particulas contienen cinco proteinas (Figu-
ra 2.3). La principal proteina de la cubierta es un producto del gen fagico 8 (g8p) y
existen de 2.700 a 3.000 copias de esta proteina por particula,junto con aproximadamen-
te 5 copias de cada una de las cuatro proteinas minoritarias de la capside (g3p, g6p, g7p
y g9p) localizadas en los extremos de la particula filamentosa. La estructura primaria de
la proteina principal de la cubierta g8p explica muchas de las propiedades de la particula.
Las moleculas maduras de g8p consisten en unos 50 aminoacidos (una secuencia sefial
de 23 aminoacidos es escindida de una proteina precursora durante su translocaci6n a la
membrana extema de la bacteria hospedadora) y su estructura es casi completamente en
Figura 2.3 Representaci6n esquematica de una particula del fago Ml3 de Enterobacterias (Inoviridae).
La proteina principal de la cubierta g8p se ordena helicoidalmente, con las subunidades solapandose
como las escamas de un pez. Otras proteinas de Ia capside requeridas para Ia actividad biol6gica del
virion se loca1izan en ambos extremos de .la particula. El inserto muestra las interacciones hidrof6bicas
entre los mon6meros de g8p (region sombreada).
Partlculas
a -helice, de manera que la molecula forma una corta varilla. Existen tres dominios
distintos en esta varilla. Una region cargada negativamente en el extremo amino-termi-
nal que contiene aminoacidos acidos forma la superficie hidrofilica de la particula
virica, y una region basica, cargada positivamente, en el extremo carboxi-terminal re-
viste el interior del cilindro proteico adyacente al ADN genomico, cargado negativa-
mente. Entre estas dos regiones existe una region hidrofobica que es responsable de
las interacciones entre las subunidades g8p que permiten la formacion de la particula
fagica y la estabilizan (Figura 2.3). Las particulas de inovirus se mantienen unidas por
las interacciones hidrofobicas entre las subunidades proteicas de Ia cubierta, como se
demostro por el hecho de que las particulas se deshacen en presencia de cloroformo, a
pesar de que no contienen ningun componente lipidico. Las subunidades g8p en las
sucesivas vueltas de la helice se entrelazan con las subunidades de las vueltas inferio-
res y se inclinan en un angulo de aproximadamente 208° respecto al eje longitudinal de
Ia particula, solapandose unas con otras como las escamas de un pez. El valor de f..l
(subunidades proteicas por vuelta completa de la Mlice) es 4,5 y p (incremento axial
por subunidad) = 1,5 nm.
Debido a que el ADN del fago se empaqueta en el interior de la particula helicoidal,
la longitud de la particula depende de la longitud del genoma. En todas las preparacio-
nes de inovirus se encuentranpo/ifagos (que contienen mas de una longitud de genoma
de ADN), minifagos (formas abortivas que contienen 0,2-0,5 longitudes de genoma de
ADN) y maxifagos (formas geneticamente defectivas que contienen mas de una longitud
de genoma de ADN). La plasticidad de estas particulas filamentosas ha sido aprovechada
por los biologos moleculares para convertir el genoma del fago M13 en un vector de
clonacion. La insercion de un ADN extrafio en este genoma resulta en particulas fagicas
recombinantes que son mas largas que los filamentos silvestres. A diferencia de la mayo-
ria de los virus, no existe un limite estricto en la longitud del genoma de ADN que puede
ser empaquetado en la particula; sin embargo, conforme el tamafio del genoma de M13
aumenta, su eficacia de replicacion disminuye. Mientras que los genomas de fagos re-
combinantes 1 a 10% mas largos que el tipo silvestre no muestran desventajas significa-
tivas, los que tienen 10 a 50% mas longitud que el tipo Silvestre replican significativa-
mente mas despacio. Con incrementos superiores al 50% del genoma normal se hace
progresivamente mas dificil aislar fagos recombinantes.
La estructura de Ia capside de inovirus explica tambien los sucesos que ocurren des-
pues de la infeccion de celulas bacterianas hospedadoras adecuadas. Los fagos inovirus
son especificos de celulas masculinas (es decir, requieren la presencia del pilus F en la
superficie de Escherichia coli para poder infectar). El primer evento en la infecci6n es la
interacci6n entre g3p localizado en un extremo del filamento junto con g6p y el extremo
del pilus F. Esta interacci6n provoca un cambio confmmacional en g8p. Inicialmente su
estruchrra cambia de ser 100% a -Mlice a 85% a-helice, causando un acortamiento del
filamento. El extremo de la parti cula adherido al pilus F se abre, exponiendo el ADN del
fago. Posteriormente un segundo cambio conformacional en las subunidades g8p reduce
su contenido de a -helice del 85% al 50%, provocando que la pmiicula fagica forme un
hueco esferoidal de unos 40 nm de diametro y expeliendo el ADN fagico, iniciando la
infeccion en la celula hospedadora.
Principios de virologia molecular
Muchos virus de plantas muestran simetria helicoidal (Apendice 2). Estas particulas
oscilan desde aproximadamente 100 nm (tobravirus) hasta unos 1.000 nm (closterovirus)
de longitud. El ejemplo mejor estudiado, como ya se ha indicado anteriormente, es el
VMT del grupo tobamovirus. No esta claro por que tantos miembros de este grupo han
adoptado esta estructura, pero podria estar relacionado bien con la biologia de la celula
vegetal hospedadora o bien con la forma en que se transmiten de unos huespedes a otros.
No existen virus animales helicoidales desnudos (es decir, no envueltos). De nuevo,
este hecho posiblemente refleje aspectos de la biologia de la celula hospedadora 0 de la
transmisi6n de los virus, pero las razones no estan claras. Un gran numero de virus ani-
males se basan en la simetria helicoidal, pero todos constan de una envoltura lipidica
externa (ver mas adelante). Existen demasiados virus con esta estructura para ser citados
individualmente, pero esta categoria incluye muchos de los pat6genos humanos mas
conocidos, como los virus gripales (Orthomyxoviridae), virus de la parotiditis y virus del
sarampi6n (Paramyxoviridae) y virus de la rabia (Rhabdoviridae). Todos ellos poseen
genomas de ARN se una sola cadena, de polaridad negativa (ver Capitulo 3). El disefio
molecular de todos estos virus es similar. El acido nucleico viral y una proteina basica
con afinidad por el acido nuclei co se condensan juntos en la celula infectada para formar
una nucleocapside helicoidal. Este complejo ARN-proteina sirve para proteger al fragil
genoma viral de dafios quimicos y fisicos, y en algunos casos provee tambien otras fun-
ciones asociadas con la replicaci6n viral. La envuelta y sus proteinas asociadas derivan
de membranas de la celula hospedadora y se afiaden a la nucleocapside del virus durante
la replicaci6n (ver Capitulo 4).
Algunos de estos virus animales, helicoidales y envueltos, son relativamente simples
en su estructura; por ejemplo el virus de la rabia y el muy similar virus de la estomatitis
vesicular (VSV) (Figura 2.4). Estos virus estan construidos alrededor del ARN genomico
de polaridad negativa, que en los rhabdovirus tiene unos 11.000 nucle6tidos (11 kilobases
[kb]) de longitud. El genoma de ARN y la proteina basica de la nucleoproteina (N) inte-
raccionan para formar una estructura helicoidal con una inclinaci6n de aproximadamen-
te 5 nm, que, junto con otras dos proteinas, L y NS (que constituyen la ARN polimerasa;
ver Capitulo 4), conforman el nucleoide o core de la particula virica. Existen de 30 a 35
vueltas de la helice de la nucleoproteina en el core, que mide unos 180 nm de longitud y
80 nm de diametro. Los mon6meros individuales de la proteina N tienen aproximada-
mente 9 x 5 x 3 nm, y cada uno cubre unos nueve nucle6tidos del ARN gen6mico. Como
en el caso de las particulas de fagos filamentosos descritas anteriormente, el papel de la
proteina N es estabilizar el ARN gen6mico y protegerlo de dafios fisicos, quimicos y
enzimaticos. Igual que en la mayoria de los virus envueltos, la nucleocapside esta rodea-
da de una capa amorfa que interacciona tanto con el core como con la envuelta lipidica,
estableciendo un nexo entre ambos. Esta capa se denomina matriz. La proteina matriz
(M) es usualmente lamas abundante de la particula virica; por ejemplo, existen aproxi-
madamente 1.800 capias de la proteina My unas 1.250 capias de la proteina N en las
particulas de VSV. La envuelta lipidica y sus proteinas asociadas seran comentadas mas
adelante con mas detalle.
Es evidente que muchos virus de diferentes grupos han evolucionado en torno a la
simetria helicoidal. Virus simples con pequefios genomas utilizan esta arquitectura para
Partfculas
Figura 2.4 Las particulas de rabdovirus, como el virus de Ia estomatitis vesicular, tienen una
nucleocapside helicoidal intema rodeada de una envuelta lipidica extema y sus proteinas asociadas.
ofrecer proteccion a sus genomas sin necesidad de codificar multiples proteinas de capside.
Particulas viricas mas complejas utilizan esta estructura como la base de la particula,
para elaborar sabre ella capas adicionales de proteina y lipido.
Una forma altemativa de construir una capside virica es organizar las subunidades
proteicas en forma de una estructura hueca cuasiesferica, encerrando el genoma en ella.
Este criteria de ordenar las subunidades en la superficie de un cuerpo solido es un poco
mas complejo que construir una helice. En teoria, se pueden construir diversos cuerpos
solidos con subunidades repetidas; par ejemplo, un tetraedro (cuatro caras triangulares),
un cuba (seis caras cuadradas), un octaedro (ocho caras triangulares), un dodecaedro
(dace caras pentagonales), y un icosaedro, un cuerpo solido constituido par 20 caras
triangulares organizadas alrededor de la superficie de una esfera (Figura 2.5).
A comienzos de los 60, el examen directo al microscopic electronico de pequefios
virus «esfericos» revelo que en realidad tenian simetria icosaedrica. A primera vista, no
resulta obvio por que este patron fue escogido por distintos grupos de virus; no obstante,
aunque en teoria es posible construir virus con capsides basadas en organizaciones si-
Principios de virolog fa molecular
metricas mas sencillas, como tetraedros o cubos, existen razones practicas por las que
esto no ocurre. Como se explico antes, es mas economico en terminos de capacidad
genetica disefiar una capside basada en muchas subunidades proteicas identicas y repeti-
das que en pocas subunidades grandes. Es improbable que un simple tetraedro constitui-
do por cuatro moleculas proteicas identicas sea lo suficientemente grande como para
incluso contener al mas pequefio genoma viral. AU.n si lo fuese, es probable que los
huecos entre las subunidades fuesen tan grandes, que la particula resultase agujereada y
fracasase en su principal funcion de proteger al genoma viral.
Con el objeto de construir una capside con subunidades repetidas, un virus debe «sa-
ber» las reglas que establecen como deben organizarse estas. Para un icosaedro , las
reglas se basan en la simetria rotacional de un solido, conocida como simetria 2-3-5, que
tiene las siguientes caracteristicas (Figura 2.5):
• Un eje de simetria rotacional doble a traves del centro de cada arista.
• Un eje de simetria rotacional triple a traves del centro de cada cara.
• Un eje de simetria rotacional quintuple a traves del centro de cada vertice.
Debido a que las moleculas proteicas tienen formas inegulares y no son tri{mgulos
equilateros regulares, la capside helicoidal mas simple se construye utilizando tres subu-
nidades identicas para formar cada cara triangular. Esto significa que son necesarias 60
Ejes dobles
de rotaci6n ~:::::-:;/---\\-:::,.....
Ejes triples
de rotaci6n
Ejes quintuples
de rotaci6n
Figura 2.5 Ilustraci6n de la simetria 2-3-5 de un icosaedro. Icosaedros mas complejos (de rangos
superiores) pueden definirse por el numero de triangulaci6n de la estructura, T= f 2 x P. Los icosaedros
regulares tienen caras constituidas por triangulos equilateros y se forman cuando el valor de Pes 1 6 3.
Todos los demas valores de P dan Iugar a estructuras mas complejas con una distorsi6n hacia Ia izquier-
da o hacia Ia derecha.
Particulas
subunidades identicas para construir una capside completa. Unos pocos virus sencillos
se construyen de este modo; por ejemplo, bacteriOfagos de la familia Microviridae,
como <j>X174. Durante el ensamblaje de este bacteri6fago se forma una particula precur-
sora vacia llamada procapside. El ensamblaje de la procapside requiere la presencia de
dos proteinas andamio (<<Scaffolding proteins») que son componentes estructurales de la
procapside, pero que no se encuentran en el virion maduro.
En la mayoria de los casas, el analisis revela que las capsides icosaedricas viricas con-
tienen mas de 60 subunidades, por las razones de economia genetica antes comentadas.
Esto representa una dificultad. Un icosaedro regular, compuesto de 60 subunidades iden-
ticas, es una estructura muy estable, porque todas las subunidades estan unidas de una
forma equivalente (es decir, muestran la misma distancia relativa unas respecto a otras y
cada una ocupa un estado de minima energia libre). Con mas de 60 subunidades es imposi-
ble que todas esten ordenadas de una forma totalmente sirnetrica, con uniones equivalentes
con todas las subunidades vecinas, ya que un icosaedro regular verdadero consta s6lo de 20
subunidades. Para resolver este problema Caspar y Klug propusieron en 1962 la idea de la
cuasiequivalencia. Su idea fue que las subunidades en casi el mismo ambiente local es-
tablecen enlaces casi equivalentes con sus vecinas, permitiendo el autoensamblado de
capsides icosaedricas a partir de multiples subunidades. En el caso de estos icosaedros de
rango superior, la simetria de la particula viene definida por el numero de triangulacion
del icosaedro (Figura 2.5). El numero de triangulaci6n, T, se define por la ecuaci6n:
Figura 2.7 Las particulas de picornavirus son estructuras icosaedricas con nfunero de triangulaci6n
T = 3. Tres proteinas viricas (VPl, 2 y 3) constituyen la superficie de Ia particula. Una cuarta proteina,
VP4, no esta expuesta en la superficie del virion, pero esta presente en cada una de las 60 unidades
repetidas que integran la capside.
Particulas
~====dlo=""
a = Mlice
==t> ~=lamina
Figura 2.8 Subunidad estructural en «barril Pde ocho cadenas antiparalelas» encontrada en todas las
capsides incosaedricas T = 3 de virus ARN.
Principios de virologia molecular
Poliprotefna naciente
~
!
Pl
!
Escisi6n autocatalitica
I Prot6mero
Proteasa (3CO)
Virion maduro
(1558, antfgeno M)
©
~
! Proteasa (3CD)
~
~ -
Promotor-i
(antfgeno 58) Pentamero Proviri6n
(antfgeno 148) (antfgeno N)
mucho acerca de su interaccion con las celulas hospedadoras y con el sistema inmunita-
rio. En los ultimos afios se ha aprendido mucho, no solo sobre estos virus, sino tambien
sobre la identidad de su receptor celular, ICAM-1 (ver mas adelante y Capitulo 4). Ade-
mas, se ha dilucidado la estructura inrnunologica de varias particulas de picornavirus. Se
han publicado varios estudios que han aplicado anticuerpos monoclonales para mapear
sitios antigenicos en la secuencia aminoacidica primaria del virus, estudiando su reacti-
vidad con virus mutantes o empleando peptidos sinteticos para bloquear su union. La
informacion obtenida de estos experimentos se ha utilizado para identificar diversos si-
tios de neutralizacion por anticuerpos en la superficie de la particula virica. Algunos de
ellos conesponden a regiones lineales contiguas de la secuencia primaria de aminoaci-
dos de las proteinas de la capside; otros, conocidos como sitios conformacionales, resul-
tan de tramos separados de aminoacidos que se aproximan en el virion maduro. Con la
resolucion detallada de las estructuras de la capside de picornavirus, estas regiones han
sido identificadas fisicamente en la superficie de la particula. Conesponden sobre todo a
bucles hidrofilicos expuestos de secuencias de aminoacidos, facilmente accesibles para
la union con anticuerpos y que estan repetidos en cada subensamblaje pentamerico de la
capside. Ahora que se conocen los requerimientos fisicos de estos sitios antigenicos, esta
informacion esta siendo utilizada para manipularla artificialmente, incluso para construir
«quimeras antigenicas» con las propiedades estructurales de un virus pero expresando
sitios antigenicos cruciales de otro. Con la aplicacion de las henamientas actuales de
disefio asistidas por ordenador, es probable que mejore la eficacia en el disefio y la cons-
truccion de este tipo de quimeras. De hecho, es probable que estos virus compuestos se
conviertan en las vacunas del futuro.
Particulas
VIRUS ENVUELTOS
~ MADURACION
~ LIBERAC ION
Proteinas de Ia
celula hospedadora
Glicoproteinas
virales
1 GEMACION
Membrana celular
Proteina de
nucleocapside viral matriz
Figura 2.10 Las particu las viricas envueltas se forman por gemaci6n a traves de una membrana de la
celula hospedadora, proceso durante el que se ven rodeadas de una bicapa lipidica derivada de la mem-
brana celular. En algunos virus, el ensamblaje y la gemaci6n ocurren simult{meamente, mientras que en
otros un core preformado empuja a traves de la membrana.
Proteinas matriz
Estas proteinas son a menudo los principales antigenos de los virus envueltos y pro-
porcionan puntas de contacto con el ambiente extemo, desempefiando frecuentemen-
te diversas funciones importantes; por ejemplo, la hemaglutinina de los virus gripales
es necesaria para union al receptor, fusion de membranas y hemaglutinacion. Las
proteinas de canales de transporte contienen numerosos dominios transmembrana
hidrofobicos que forman un canal recubierto de proteinas a traves de Ia envuelta. Esto
permite al virus alterar la permeabilidad de la membrana (por ej., canales ionicos).
Estas proteinas son importantes pues modifican el ambiente intemo del virion, per-
mitiendo o incluso dirigiendo cambios necesarios para la maduracion de la particula
y el desarrollo de infectividad (por ej., proteina M2 de virus influenza).
Mientras que existen muchos virus envueltos de vertebrados, solo unos pocos virus de
plantas tienen envueltas Jipidicas. La mayoria de ellos pertenecen ala farniliaRhabdoviridae,
cuya estructura ha sido ya comentada (ver Simetria helicoidal). Ademas de los rhabdovirus
de plantas, solo unos pocos bunyavirus que infectan plantas y miembros del genero
Tospovirus tienen envueltas lipidicas. La relativa escasez de virus envueltos en los vegeta-
les probablemente refleje aspectos de la biologia de la celula hospedadora, en particular los
referentes a los mecanismos de Iiberacion de los virus de las celulas infectadas, que re-
Principios de virologfa molecular
quieren una brecha en la rigida pared celular. Esta restricci6n no se aplica a los virus de
organismos procariotas, en los que existen varias familias de virus envueltos (por ej.,
Cystoviridae, Fuselloviridae, Lipothrixviridae y Plasmaviridae).
La mayoria de los virus pueden encuadrarse en una de las tres clases estructurales
antes resumidas (es decir, aquellos con simetria helicoidal, simetria icosaedrica o virus
envueltos); sin embargo, existen muchos virus cuya estructura es mas compleja. En es-
tos casos, aunque a menudo se emplean los principios generales de simetria ya descritos
para construir prute de la cubierta del virus (este termino resulta aqui apropiado pues
estos virus a menu do tienen varias capas de proteinas y lipidos ), los virus mas g1·andes y
complejos no pueden ser definidos simplemente por una ecuaci6n matematica, como una
sencilla helice o un icosaedro. Debido ala complejidad de algunos de estos virus, han
desafiado los intentos por determinar sus estructuras at6micas detalladas utilizando las
tecnicas descritas en el Capitulo 1.
Un ejemplo de ellos son los Poxviridae. Estos virus son particulas ovales o «en forma
de ladrillo» de 200 a 400 nm de longitud. De hecho, estas particulas son tan grandes que
fueron observadas por vez primera en 1886 en linfa vacunal, utilizando microscopios
6pticos de alta resoluci6n, y fueron considerados en aquel momento esporas de micrococos.
La superficie extema del virion esta marcada con lineas paralelas, a veces ordenadas en
forma helicoidal. Estas particulas son muy complejas y se ha visto que contienen mas de
100 proteinas diferentes (Figura 2.12). Durante su replicaci6n se observan dos formas de
particulas: extracelulares que contienen dos membranas y particulas intracelulares que
s6lo tienen una membrana intema. Los poxvirus y otros virus con estructura compleja
(como el virus de la fiebre porcina africana) obtienen sus membranas de forma diferente
"-...
- -e
.
Envuelta externa
\ .
Cuerpo lateral
/ •
Envuelta del core
Capa en empalizada
•
• •
• • • • •
Figura 2.12 Las particulas de Poxvirus son los virus mas complejos conocidos y contienen mas de
100 proteinas de codificaci6n virica, organizadas en una variedad de estructuras intemas y extemas.
Particulas
a los virus envueltos «simples» como los retrovirus o virus influenza. En vez de salir por
gemaci6n en la superficie celular o en un compartimento intracelular, adquiriendo asi
una sola membrana, estos virus complejos son envueltos por el reticulo endoplasmatico,
adquiriendo dos capas de membrana (Figura 2.13).
Observadas bajo el microscopio electr6nico las fmas secciones de poxvirus revelan
que la superficie extema del virion se compone de lipidos y proteinas. Esta capa rodea al
core o nucleoide, que es bic6ncavo (en forma de pesas), y a dos «cuerpos laterales» cuya
func i6n es desconocida. El core se compone de una nucleoproteina fuertemente compri-
mida y del genoma de ADN bicatenario que esta enrollado a su alrededor. Antigenicamente
los poxvirus son muy complejos, induciendo tanto anticuerpos especificos como produc-
tores de reacciones cruzadas, de ahi que sea posible vacunar contra una enfermedad con
otro virus (por ej ., el uso del virus vacuna para inrnunizar contra Ia viruela). Los poxvims
y cierto numero de otros virus complejos tambien enfatizan Ia verdadera complejidad de
algunos virus; existen al menos diez enzimas presentes en las particulas de poxvims, la
mayoria implicadas en el metabolismo del acido nucleico y en la replicaci6n del genoma.
Los poxvims constituyen las particulas mas complejas conocidas, y a pesar de que ya
se ha determinado la secuencia nucleotidica completa de varios representantes de esta
familia (ver Capitulo 3), no se ha logrado aun elucidar completamente la estmctura de
estas particulas. Este es un caso extremo en virologia, incluido aqui como contrapunto a
la descripci6n de algunos de los virus mas sencillos ofrecida antes. En otros casos, la
estmctura de la particula de virus complejos se ha investigado mucho mas completamen-
(a)
• •
(b)
• •
Figura 2.13 (a) Los virus envueltos simples adquieren su envuelta de una sola capa a! sa!ir por gema-
ci6n a traves de la superficie celular o en el interior de compartimentos intracelulares. (b) Los virus
envueltos comp!ejos adquieren multiples capas al verse envueltos por el reticulo endoplasmatico o por
otras membranas celulares.
Principios de virologia molecu lar
te. Uno de los principales ejemplos de tales virus son los fagos con cola de enterobacte-
rias. El orden Caudovirales comprende las familias Myoviridae, Siphoviridae y
Podoviridae, ha sido intensamente estudiado por razones excelentes; estos virus se pro-
pagan facilmente en bacterias, se pueden obtener en titulos elevados y se purifican con
facilidad, permitiendo los estudios bioquimicos y estructurales. La cabeza de las particu-
las consiste esencialmente en una cubierta icosaedrica con una simetria T = 7 que se une
a traves de un collar a una cola helicoidal reh·actil. En el extrema de la cola hay un disco
que interviene en la adhesion a la celula bacteriana y tambien en la penetracion a traves
de la pared celular bacteriana por medio de enzimas del tipo de lisozima asociadas con el
disco. Ademas de estas estructuras, unas finas fibras protei cas se unen al disco y, junto
con este, participan en la union a receptores en la pared de la celula huesped. La
estructura de estos fagos es realmente bastante mas compleja que esta simple descrip-
cion; por ejemplo, en la cabeza existen varias proteinas intemas y poliaminas asocia-
das con el ADN genomico y hay una estructura intema en forma de tubo en el interior
de la vaina extema de la cola helicoidal. En la celula bacteriana infectada hay vias
separadas de ensamblaje de la cabeza y de la cola de la particula, que se unen en un
estadio tardio para construir los viriones (Figura 2.14). Estos virus son un ejemplo de
como se pueden construir particulas complejas a partir de los principios sencillos antes
comentados. Un ejemplo aim mas claro de este fenomeno lo proporciona la estructura
de las particulas de geminivirus, que consisten en dos icosaedros gemelos T = 1. A
cada icosaedro le falta una subunidad morfol6gica, y los icosaedros se unen en un
punto tal que la particula madura contiene 110 proteinas monomericas organizadas en
22 subunidades morfol6gicas.
Los miembros de la familia Reoviridae tienen capsides icosaed1icas T = 13, desnu-
das, compuestas por una doble capa de proteinas con una estructura compleja (Figura
2.15). Se ha establecido la estructura del core transcripcionalmente activo del virus de la
lengua azul, la cual constituye la mayor estructura determinada hasta el momenta a una
resolucion atomica (3,5 A). La capside extema de este virus tiene aproximadamente 80 nm
de diametro y la capside intema o core mide unos 60 nm. La estructura de la capside
extema es compleja y no se ha determinado todavia con una resolucion atomica, pero ha
sido analizada a un resolucion menor de 3 nm por tecnicas altemativas de investigacion
estructural como la criomicroscopia electronica y procesamiento de imagenes. Aunque
estos metodos proporcionan una resolucion estructural que es unas diez veces menor que
la de la difraccion de rayos X, estas tecnicas son utiles para estudiar estructuras comple-
jas o fragiles que no pueden ser cristalizadas. El genoma del virus de ARN de doble
cadena esta empaquetado dentro del core, rodeado de complejos transcripcionales en los
vertices de la particula. Estos segmentos genomicos mantienen un orden durante la trans-
cripcion. Doce espiculas sobresalen del core a traves de la capside extema. Las particu-
las de Reoviridae son muy estables en el medio ambiente; esto es especialmente cierto en
el caso de los rotavirus, que se diseminan a menudo a traves del agua de bebida contami-
nada. Las particulas de rotavirus en material fecal conservado a temperatura ambiente
son capaces de mantener su infectividad durante 7 meses y no son muy susceptibles a los
desinfectantes que contienen cloro, lo que demuestra la eficacia con la que estas comple-
jas particulas protegen a su fragil genoma de ARN.
Particulas
Clavija • • • Cuiia
t ~ ···
""
•
,.----...
Pre-cabeza I (solo core, sin ADN) Placa base
..____.., t
t
Pre-cabeza II (sin ADN)
•
~
t t
Tuba
Collar aiiadido
t
·~~.
"-.... /
! eor,
I
- : - \ Fibras de Ia cola
\
I
Fago T4 complete
Figura 2.14 Version simplificada del ensamblaje de las patticu las del fago de enterobacterias T4
(Myo viridae). Las secciones de Ia cabeza y de Ia cola se ensamblan separadamente y son unidas en una
fase relativamente tardia. Este complejo proceso fue desatTollado laboriosamente mediante el aisla-
miento de fagos mutantes en cada uno de los genes viricos implicados. Ademas de las principales protei-
nas estructurales, un nllinero menor de proteinas de «andamiaje» estan implicadas en !a configuraci6n
de tan compleja particula virica.
VP6(Hel}
~ VPl(Pol)
1
VP4(Cap)
1
Complejo
transcriptasa
VP3(T2)
Segmentos gen6micos
50nm
Figura 2.15 Las particulas de reovirus constan de proteinas organizadas como una doble capside
icosaedrica rodeando un core. Este diagrama representa Ia informacion conocida sobre Ia estructnra de
una particula del virus de Ia lengua azul. (Basado en datos suministrados por Peter Mertens, Instituto de
Salud Animal, Reina Unido).
Persistencia
en el medio
ambiente
Peplomeros
(envuelta con glicoproteinas)
Poliedrina
----
~--
-- ..:.....---- Virus ADN
_ , . - Proteinas de capsid
Proteinas de union
Virion
aADN
Particula virica por gemacion: Particula virica ocluida:
replicacion y diseminacion Producida en Ia infeccion tardia;
de celula a celula en el insecto liberacion al ambiente cuando
el insecto muere
Figura 2.16 Algunas particulas de baculovirus existen en dos fmmas: una relativamente simple de
pmticula producida por gemaci6n, que se encuentra en el interior del insecta hospedador y otra forma
crista! ina, incluida en proteina, responsable de Ia resistencia en el media ambiente.
muy potente. Se pueden expresar genes foraneos clonados bajo el control del promotor de
la poliedrina; por tanto, los baculovirus han sido convertidos en vectores de expresi6n.
Los virus superan esta dificultad empaquetando, junto con el genoma, algunas moleculas
cargadas positivamente para neutralizar esta repulsion de la carga negativa. Estas molecu-
las incluyen pequefios iones cargados positivamente (Na, Mg, K, etc.), poliaminas, y varias
proteinas que se unen a acidos nucleicos. Algunas de estas ultimas son de codificacion
virica y contienen aminoacidos con cadenas laterales basicas, como arginina y lisina, que
interaccionan con el genoma. Hay muchos ejemplos de tales proteinas: por ejemplo, las
proteinas NC de retrovirus, N (nucleocapside) de rabdovirus y NP (nucleoproteina) de
virus influenza. Muchos virus con genomas de ADN bicatenario tienen proteinas basicas
tipo histonas estrechamente asociadas al acido nucleico. De nuevo, algunas de estas son de
codificaci6n virica (par ej ., el polipeptido VII de adenovirus). En otros casos, sin embargo,
el virus puede usar proteinas celulares; por ejemplo el genoma de poliomavirus adopta una
estructura parecida ala cromatina constituida por cuatro proteinas histonas celulares (H2A,
H2B, H3 y H4), de forma similar al genoma de la celula hospedadora.
· El segundo problema que tienen que resolver los virus es como lograr la especifici-
dad requerida para seleccionar y encapsidar el genoma viral distinguiendolo de los aci-
dos nucleicos celulares. En la mayoria de los casos, durante las ultimas etapas de la
infecci6n virica, cuando se produce el ensamblaje de las particulas viricas (ver Capitulo
4), la transcripci6n de los genes celulares se ha reducido y se ha acumulado un gran
numero de genomas virales. Esta sobreproducci6n de genomas facilita, pero no elimina,
el problema del empaquetamiento del genoma especifico. Por lo tanto, se requiere una
proteina de capside o nucleocapside codificada por el virus para lograr este extremo, y
muchos virus, incluso aquellos con genomas cortos y compactos, como los retrovirus y
rabdovirus, codifican este tipo de proteina.
Los virus con genom as segmentados (ver proximo capitulo) encaran un problema ana-
dido: no solamente tienen que encapsidar solo acidos nucleicos viricos y excluir moleculas
de la celula hospedadora, sino que tienen ademas que empaquetar uno de cada segmento
gen6mico requerido. Es importante asumir que durante el ensamblaje los virus frecuente-
mente cometen errores. Estos pueden cuantificarse midiendo las proporciones particula/
infectividad; la proporci6n entre el nlimero total de particulas viricas (contadas por micros-
copia electronica) en una preparaci6n virica y el numero de particulas capaces de generar
una progenie infecciosa (medida por ensayos de plaqueo o por diluci6n limite). Este valor
resulta ser en algunos casos varios miles de particulas por cada virion infeccioso, y s6lo
rara vez se aproxima a una raz6n 1/ 1; no obstante, los calculos demuestran que virus tales
como influenza presentan unas proporciones particula/infectividad mucho mas bajas de las
que se lograrian empaquetando al azar ocho segmentos gen6micos distintos. Actualmente
se cree que cada particula de virus influenza contiene mas de ocho segmentos gen6micos,
posiblemente 9 a 11. Esta redundancia puede ser suficiente para asegurar que una propor-
cion razonable de particulas viricas en la poblaci6n contendra al menos uno de cada ocho
segmentos requeridos y sera por tanto infeccioso. Sin embargo, no es seguro que esto sea
asi, y es posible que los virus influenza tengan un mecanismo todavia no descubierto (por
ej ., incorporacion de complejos de ribonucleoproteina durante la morfogenesis) que asegu-
re una dotacion genetica completa en la mayoria de las particulas.
El otro miembro de la ecuaci6n de empaquetamiento lo constituyen las secuencias
nucleotidicas especificas (la sefial de empaquetamiento) que permiten al virus selec-
Particulas
cionar acidos nucleicos genomicos vfricos entre el conjunto de origen celular. Se han
identificado las sefiales de empaquetamiento de varios genomas virales. Como ejemplos
encontramos la sefial x (psi) en los genomas de retrovirus murinos, que se han utilizado
para empaquetar genomas de vectores de retrovirus sinteticos en particulas viricas, y las
secuencias responsables de empaquetar los genomas de varios virus ADN (algunos ade-
novirus y herpesvirus), que han sido definidas claramente y de modo inequivoco. No
obstante, a partir de diversos estudios resulta evidente que un empaquetamiento preciso
y eficaz del genoma requiere informacion no solo de la secuencia nucleotidica lineal,
sino tambien de regiones de la eshuctura secundaria formadas por el plegamiento del
acido nucleico genomico en formas complejas. En muchos casos han fracaso los intentos
por encontrar una secuencia sefial de empaquetamiento Unica, lineal. La razon probable
es que en la mayoria de los virus la clave para la especificidad del empaquetamiento del
genoma radica en la estructura secundaria del genoma.
Como ocurre con otros muchos aspectos del ensamblaje de los virus, en muchos
casos no sabemos la forma en que se controla el empaquetamiento; no obstante, la
clave debe estar en interacciones moleculares especificas entre el genoma y la capside.
Hasta hace poco, apenas se habia estudiado la estructura fisica de los genomas virales
en el interior de las particulas viricas, aunque en los ultimos afios se ha investigado
intensamente la genetica del empaquetamiento. Esto es una pena, porque sin esta in-
fonnacion dificilmente seremos capaces de entender completamente este importante
aspecto de la replicacion virica; pero es comprensible, pues las tecnicas que habitual-
mente se emplean para deterrninar la estructura de las capsides viricas (por ej ., difraccion
de rayos X) rara vez proporcionan informacion sobre el estado del genoma dentro de
su cubierta proteica. De todas formas, en algunos casos existe ya disponible un detalla-
do conocimiento sobre el mecanismo y la especificidad de la encapsidacion del genoma.
Esto se refiere tanto a virus con simetria helicoidal como a algunos con simetria
icosaedrica.
Indudablemente el mecanismo de empaquetamiento mejor conocido es el del VMT,
un virus vegetal ARN helicoidal de polaridad +. Ello se debe a Ia relativa simplicidad de
este virus, que tiene solamente una proteina principal de cubierta y que se ensambla in
vitro espontaneamente a partir de sus componentes purificados, ARN y proteina. En el
caso del VMT, el ensamblaje de las particulas se inicia por la asociacion de agregados
preformados de moleculas de proteina de capside («discos») con los residuos 5. 444-5.518
en el genoma de ARN de 6,4 kb, conocidos como la «secuencia de origen de ensamblaje
(«origin of assembly sequence», OAS) (Figura 2.17). Los discos pianos tienen 17 subu-
nidades por anillo, cerca de las 16,34 subunidades por vuelta que se encuentran en el
virion maduro. De hecho, los discos no son completamente simetricos, ya que tienen una
marcada polaridad. El ensamblaje comienza cuando un disco interacciona con el OAS
en el ARN genomico. Esto conviet1e a los discos en «arandelas de cierre» con estructura
helicoidal, cada una de elias conteniendo en 3' subunidades protei cas de capside. Mas
discos se afiaden a esta estructura, convirtiendose en la confonnacion en «arandela de
cierre». El ARN es anastrado al interior de la estructura en construccion como lo que se
conoce como un «bucle viajero», lo que le da este nombre a este procedimento de forma-
cion de particulas. El ARN viral (ARNv) es atrapado y queda por tanto enterrado en la
Principios de virologia molecu lar
3' 5'
El ARN se une al disco
r
3'
\
\
5'
3' 5'
Figura 2.17 Ensamblaje de particulas de virus del mosaico del tabaco (VMT).
cubierta madura de g8p (junto con las proteinas accesorias). Las fuerzas que dirigen este
proceso no se comprenden totalmente, pero las interacciones proteina-acido nucleico
que ocurren parecen ser bastante simples e incluyen fuerzas electrostaticas contrarias y
la union de bases de ADN con cadenas laterales de proteinas. Esto se confirma por la
plasticidad del genoma de Ml3 y su capacidad de encapsidar libremente material genetico
extra.
Las interacciones proteina-acido nucleico en otros virus helicoidales, tales como los
rabdovirus, son bastante mas complejas. En la mayoria de los virus helicoidales envuel-
tos, primero se forma un core de nucleoproteina que despues se ve rodeado por proteinas
matriz, Ia envuelta y sus glicoproteinas asociadas (Figura 2.4). Nose ha determinado la
estructura detallada del core, pero parece tener estriaciones cruzadas separadas por 4,5 a
5,0 nm, cada una probablemente equiparable a una vuelta del complejo proteina-ARN
(bastante similar al VMT). La proteina matriz muestra un patron aparentemente hexagonal,
y no esta claro si esto esta relacionado con la estructura de la nucleocapside subyacente
o c6mo se forma el extrema redondeado de la particula virica.
Bastante menos se sabe de como se organiza el genoma dentro de particulas viricas
con sirnetria icosaedrica. Existen, sin embargo, algunas excepciones a esta afirmacion.
Estas son los virus ARN icosaedricos T= 3, cuyas subunidades son en su mayor parte los
motivos estructurales denominados <run barrilj3 de ocho cadenas antiparalelas», comen-
tado anteriormente. En el virus del moteado de la vaina de la judia (VMVJ) («bean pod
mottle virus», BPMV), un comovirus T = 3 con un genoma bipmtito, Ia c1istalografia de
rayos X ha demostrado que el ARN esta plegado de tal manera que adopta una simetrfa
icosaedrica, equivalente a Ia de Ia capside que lo rodea. Las regiones que contactan con
proteinas de la capside son de simple cadena y parece que interaccionan por fuerzas
electrostaticas mas que mediante enlaces covalentes. La estructura at6mica de <jlX174
tambien muestra que una porcion del genoma de ADN interacciona con residuos de
arginina expuestos a la superficie interna de la capside, de forma similar que en VMVJ.
Parece que se esta produciendo un consenso respecto al estado fisico de los acidos
nucleicos en el interior de capsides viricas icosaedricas. De forma similar a como las
capsides icosaedricas de muchos virus no relacionados geneticamente se basan en mono-
meros con un motivo estructural comlin en «barrilj3 de ocho cadenas antiparalelas», los
genomas en su interior tambien parecen mostrar una simetria icosaedrica, cuyos vertices
interaccionan con aminoacidos basicos en la superficie interna de Ia capside. De esta
manera, estos motivos estructurales comunes pueden con el tiempo explicar como los
virus empaquetan selectivamente los acidos nucleicos genomicos necesarios, e incluso
podrian Ilegar a ofrecer la posibilidad de disefiar drogas especificas que inhiban estas
interacciones.
Actualmente estan identificadas las moleculas que utilizan diversos virus de grupos
taxonomicos diferentes como receptores celulares. La interaccion de la superficie exter-
na de un virus con un receptor celular es un acontecimiento importante, que determina
Principios de virologia molecular
RESUMEN
Este capitulo no intenta ser una lista completa de todas las estructuras viricas que se
conocen actualmente, sino que intenta ilustrar con ejemplos algunos de los principios
que controlan el ensamblaje de virus y las dificultades del estudio de estas diminutas
estructuras. Los lectores deberan consultar articulos cientificos y bases de datos para
conocer los detalles de las estructuras viricas conocidas y de muchas que continuamente
aparecen. No obstante, existe una serie de motivos estructurales repetidos que se encuen-
tran en muchos grupos diferentes de virus. Lo mas obvio es considerar la division de
muchas estructuras viricas en aquellas basadas en simetrias helicoidal e icosaedrica.
Mas sutilmente, estructuras proteicas comunes como el motivo estructural en «barril ~ de
ocho cadenas antiparalelas» encontrado en muchas capsides icosaedricas T = 3 y el ple-
gamiento icosaedrico del ARN genomico presente en el interior de algunos de estos
virus empiezan a conocerse. Las particulas viricas no son inertes. Muchas estan dotadas
Partfculas
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CAPiTULO 3
GENOMAS
-
Principios de virologia molecular
ner la informacion genetica en una forma que pueda ser reconocida y descifrada por ese
tipo particular de celula parasitada. El c6digo genetico utilizado por el virus debe coinci-
dir o al menos ser reconocido por el organismo hospedador. De forma similar, las sefiales
de control que dirigen la expresion de los genes virales deben ser apropiadas para el
hospedador. En el Capitulo 4 se describen los metodos de replicaci6n de los genomas
virales y el Capitulo 5 trata con mas detalle de los mecanismos que regulan Ia expresion
de la informacion genetica virica. El proposito de este capitulo es describir la diversidad
de los genomas virales y examinar como y por que se han producido estas variaciones.
Aunque la biologia molecular ha desanollado un gran numero de tecnicas para
manipular proteinas, el poder de esta tecnologia se ha centrado por lo general en aci-
dos nucleicos. Ha existido una relacion intensa y sinergica entre los avances en virologia
dependientes de esta nueva tecnologia y las oportunidades que los virus mismos han
proporcionado al desarrollo de nuevas tecnicas de investigacion. Asi, el primer genoma
completo que fue secuenciado (en 1977) fue el de un virus, el bacteri6fago <j>Xl74. Se
escogi6 este virus por diversas razones. Primero, posee uno de los genomas mas pe-
quefios (5.386 nt). Segundo, es posible propagar grandes cantidades del fago en Es-
cherichia coli, purificarlo facilmente y extraer el ADN gen6mico. Tercero, el genoma
de este fago consta de ADN monocatenario que pudo secuenciarse directamente por
los metodos de terminacion de cadena. Aunque en aquellos momentos se estaban desa-
nollando tambien metodos de secuenciacion de ADN bicatenario, <j>X174 demostr6 la
utili dad de los bacteri6fagos con genomas de simple cadena como vectores de clonaci6n
para secuenciacion de ADN, y algunos fagos como M13 se han aplicado posteriormen-
te con este prop6sito.
En los ultimos afios se han estudiado intensamente las estructuras de los genomas
virales y las secuencias nucleotidicas porque el potencial de la tecnologia del ADN
recombinante ha centrado su atencion en esta area. Seria err6neo presentar la biologia
molecular como el unico medio de solucionar los problemas sin resolver en virologia,
pero seria tambien una insensatez ignorar las oportunidades que ofrece y la explosion
de conocimiento que ha originado en las ultimas decadas.
Algunos de los bacteri6fagos mas sencillos se han citado anteriormente como ejem-
plos de los genomas mas pequefios y menos complejos. En el otro extremo de la escala,
los genomas de los virus mas gran des con ADN bicatenario, como los herpesvirus y los
poxvirus, son suficientemente complicados como para haber escapado hasta la fecha
de un analisis funcional completo (a pesar de que se conocen las secuencias nucleoti-
dicas completas de los genomas de un elevado numero de ellos). Muchos de los virus
ADN de eucariotas se parecen estrechamente a sus hospedadores en cuanto a la biolo-
gia de sus genomas.
Algunos genomas de virus ADN forman complejos con histonas celulares para for-
mar una estructura similar a la cromatina dentro de la particula virica. Una vez dentro
del nucleo de la celula hospedadora, estos genomas se comportan como cromosomas en
miniatura satelites, siguiendo los dictados de las enzimas celulares y el ciclo celular:
• Kates descubri6 en 1970 que los RNAs mensajeros del virus vacuna estan poliade-
nilados en sus extremos 3' la primera observaci6n de este hecho.
Genomas
• Roberts y Sharp descubrieron por vez primera en 1977 la escision de genes conte-
niendo intrones no codificantes y ex ones codificantes de proteinas, asi como RNAs
mensajeros empalmados.
• Los intrones en procariotas se descubrieron primero en el genoma del bacteriofago
T4 en 1984. Varios ejemplos de este fenomeno se han descubierto ya en T4 yen
otros fagos. Todos son similares, de la clase I con autoempalmes («self-splicing»);
sin embargo, esta observacion plantea un punto importante. La impresion conven-
cional es que los genomas procariotas son mas pequefios y replican mas velozmen-
te que los de los eucariotas y de ahi que puedan ser considerados «aerodinamicos».
El genoma del fago T4 consta de 160 kpb de ADN de doble cadena y esta muy
condensado; por ejemplo, los promotores y las secuencias de control de la traduc-
cion estan anidadas dentro de regiones codificantes de genes superpuestos. La pre-
sencia de intrones en genomas de bacteriOfagos, que estan bajo una implacable y
constante presion para excluir «secuencias basura», indica que estos elementos
geneticos deben haber desarrollado mecanismos para escapar o neutralizar esta pre-
sion y para persistir como parasitos dentro de parasitos.
Todos los genomas viricos experimentan una presion para minimizar su tamafio.
Por ejemplo, los virus con hospedadores procariotas deben ser capaces de replicar lo
suficientemente rapido para mantenerse al ritmo de sus celulas hospedadoras, y esto se
refleja en la naturaleza compacta de muchos bacteri6fagos (pero no de todos). Los
genes superpuestos son frecuentes y la maxima capacidad genetica se comprime al
minimo tamafio genomico. En los virus con hospedadores eucariotas existe tambien
presion sobre el tamafio del genoma. Aqui, sin embargo, la presion incide principal-
mente sobre el tamafio del genoma empaquetado en la particula virica, es decir, la
cantidad de acido nucleico que es incorporada dentro del virion. En consecuencia,
estos virus muestran habitualmente una compresion enorme de la informacion geneti-
ca si se comparan con la baja densidad de informacion contenida en los genomas de las
celulas eucariotas.
Como se afirmo anteriormente, existen excepciones a esta sencilla regla. Algunos
bacteriofagos (por ej., la familia Myoviridae, como T4) tienen genomas relativamente
grandes, de hasta 170 kpb. El mayor genoma virico actualmente conocido es el de
Mimivirus con aproximadamente 1,2 Mpb, que contiene alrededor de 1.200 marcos
abiertos de lectura, de los que solo un 10% muestran alguna similitud con proteinas de
funcion conocida. Entre los virus de eucariotas, herpesvirus y poxvirus tambien tienen
genomas relativamente grandes, de hasta 235 kpb. Es significativo que estos genomas
viricos contienen muchos genes implicados en su propia replicacion, particularmente
enzimas dedicadas al metabolismo de los acidos nucleicos, por tanto, estos virus esca-
pan parcialmente a las restricciones de la bioquimica de la celula hospedadora codifi-
cando un aparato bioquimico adicional. El castigo es que tienen que codificar toda la
informacion necesaria para que una particula compleja y grande empaquete el genoma,
tambien una presion en sentido ascendente sobre el tamafio del genoma. Las ultimas
secciones de este capitulo contienen descripciones detalladas tanto de genomas peque-
fios y compactos como de grandes y comp1ejos.
Principios de virologia molecular
GENETICA MOLECULAR
Como se afirmo anteriormente, las nuevas tecnicas de biologia molecular han teni-
do una gran influencia en centrar mucha atencion en el genoma viral. Esta fuera de los
objetivos de este libro dar cuenta detallada de esta tecnologia. De hecho, se asume que
los lectores tienen ya unos solidos conocimientos en los principios que sustentan estas
tecnicas, asi como del vocabulario empleado. No obstante, quiza merezca la pena in-
vertir un poco de tiempo en ilustrar como algunas de estas tecnicas han sido aplicadas
a la virologia, observando que estas tecnicas nuevas son complementarias y no reem-
plazan a las tecnicas virologicas clasicas . Inicialmente, cualquier investigacion sobre
un genoma viral generalmente incluira preguntas sobre:
• Composicion; ADN o ARN, monocatenario o bicatenario, lineal o circular.
• Tamafio y nfunero de segmentos.
• Estructuras terminales.
• Secuencia de nucleotidos.
• Capacidad codificante; marcos abiertos de lectura.
• Sefiales de regulacion; activadores de la transcripcion, promotores y terminadores.
Es posible diferenciar dos tipos de estrategias para el analisis molecular de los
genomas viricos: el analisis ffsico de la estructura y la secuencia nucleotidica, esen-
cialmente realizada in vitro, y un enfoque mas biologico, examinando las relaciones
estructura-funcion de genoma vfricos intactos y de elementos geneticos individuales,
implicando generalmente un analisis in vivo del fenotipo viral.
El punto habitual de inicio para el analisis ffsico de los genomas virales ha sido el
aislamiento de acidos nucleicos con diversos grados de pureza a partir de preparacio-
nes de virus. En cierto sentido, esto es todavia verdad para la biologia molecular, ann-
que ha disminuido el enfasis en la purificacion conforme las tecnicas de clonacion
molecular se han hecho mas avanzadas. Los genomas viricos de ADN pueden analizar-
se directamente por digestion con endonucleasas de restriccion sin recurrir a la clonacion
molecular, y este enfoque fue logrado por primera vez en 1971 con el ADN de SV40.
Los primeros fragmentos de ADN que fueron clonados molecularmente fueron frag-
mentos de restriccion del ADN del bacteri6fago A, que se clonaron en el ADN genomico
de SV40 por Berg y colaboradores en 1972. Por lo tanto, ifueron genomas viricos
tanto los primeros vectores de clonacion como los acidos nucleicos que primero se
analizaron por estas tecnicas! Como se comento antes, el genoma de <j)X174 fue el
primer replicon secuenciado completamente.
Posteriormente, genomas de fagos como el de M13 fueron intensamente modifica-
dos para ser aplicados como vectores para secuenciacion de ADN. La enzimologfa de
nucleasas ARN-especificas estaba comparativamente bastante avanzada en ese mo-
mento, de forma que se pudo emplear un abanico de enzimas con sitios de corte espe-
cificos para analizar e incluso determinar la secuencia de genomas de virus ARN (la
primera secuencia nucleotidica corta de ARNs de transferencia - ARNt- fue determi-
nada a mediados de los afios 60). No obstante, el analisis directo de ARN por estos
metodos era laborioso y notablemente diffcil. El analisis de secuencias de ARN no
Genomas
Figura 3.1 En Ia electroforesis en gel se coloca una mezcla de acidos nucleicos (ode proteinas) en el
gel, que se desplaza a traves de Ia matriz del gel cuando se le aplica un campo electrico. La carga
negativa neta debida a los grupos fosfato de las moleculas de acido nucleico se traduce en un movimien-
to desde el catodo hacia el anodo. Las mo!eculas mas pequeii.as son capaces de trasladarse a traves de Ia
matriz del gel mucho mas rapidamente, y por tanto migran mas lejos que las molecu!as mas grandes, que
se retrasan, causando una separaci6n clara de las moleculas basada en sus tamaii.os.
Principios de virologia molecular
especifica del virus. El primer hecho que se produce cuando estos genomas viricos
penetran en la celula es que son copiados por la polimerasa, produciendo bien transcritos
de polaridad positiva que son utilizados directamente como ARNm, o moleculas de
doble cadena, conocidas como intermediarios replicativos (IR) o formas replicativas
(FR), las cuales sirven como moldes para mas rondas de sintesis de ARNm. Por lo
tanto, como los ARN(- ) purificados no pueden ser traducidos directamente y no se
replican en ausencia de la polimerasa viral, estos genomas son intrinsecamente no
infecciosos. Recientemente se han desarrollado sistemas que permiten rescatar virus
con genomas de polaridad negativa de acidos nucleicos clonados o purificados. Tales
experimentos son frecuentemente calificados como «genetica reversa»; es decir, la
manipulaci6n de un genoma de ARN(- ) a traves de su intermediario de ADN. Todos
estos sistemas dependen de un complejo de ribonucleoproteina que puede servir como
un molde para la replicaci6n del genoma por una ARN polimerasa ARN-dependiente,
pero pueden consistir en uno de dos enfoques:
• Formaci6n del complejo in vitro: se mezclan proteinas viricas purificadas de celu-
las infectadas con ARN transcrito de ADNc clonado para formar complejos que se
introducen despues en celulas susceptibles para iniciar la infecci6n. Este metodo ha
sido usado con paramixovirus, rabdovirus y bunyavirus.
• Formaci6n del complejo in vivo : complejos de ribonucleoproteina formados in vitro
se introducen en celulas infectadas con una cepa de virus auxiliar. Este metodo se
ha utilizado con virus influenza, bunyavirus y virus ARN de doble cadena como
reovirus y bimavirus.
Estas estrategias abren posibilidades para la investigaci6n genetica de virus con
ARN de polaridad negativa y de doble cadena que antes no existian.
GENETICA ViRICA
del genoma son las mas intensamente marcadas, las cercanas al extrema 5' del
genoma, las que menos.
MUTANTES ViRICOS
«Mutante», «cepa», «tipo», «variante» e incluso «aislado» son terminos todos ellos
utilizados bastante alegremente por los vir6logos para diferenciar virus particulares
unos de otros y respecto al original virus «parental», «Silvestre» o «de calle». Mas
exactamente, estos terminos se aplican generalmente asi:
• Cepa: diferentes lineas o aislados del mismo virus (por ej., de distintas localizacio-
nes geograficas o pacientes).
• Tipo: diferentes serotipos de un mismo virus (por ej., varios fenotipos de neutrali-
zaci6n por anticuerpos).
• Variante: un virus cuyo fenotipo difiere de la cepa silvestre original, pero del que
no se conoce la base genetica que explique esa diferencia.
Mutaciones espontaneas
En algunos virus, las tasas de mutaci6n pueden ser tan elevadas como 1o-3 a 10-4
por nucle6tido incorporado (por ej., en retrovirus, como el virus de la inmunodeficien-
cia humana o VIH), mientras que en otros pueden ser tan bajas como I0-8 a I0- 11 (por
ej., en herpesvirus), lo que es semejante a las tasas de mutaci6n en el ADN celular.
Estas diferencias se deben a los mecanismos de la replicaci6n gen6mica, con tasas de
error generalmente superiores para las ARN polimerasas ARN-dependientes que para
las ADN polimerasas ADN-dependientes. Algunas polimerasas de virus ARN tienen
funci6n de correcci6n de errores, pero por lo general las tasas de mutaci6n son consi-
derablemente mas elevadas en los virus ARN que en los virus ADN. Para un virus, una
mutaci6n es una bendici6n contradictoria.
La capacidad de generar variantes antigenicas que puedan escapar de la respuesta
inmunitaria es una ventaja clara, pero las mutaciones tambien originan muchas parti-
culas defectivas, pues la mayoria de las mutaciones son deletereas. En los casos mas
extremos (por ej., VIH), la tasa de error es de 10-3 a I0-4 por nucle6tido incorporado.
El genoma de VIH tiene aproximadamente 9,7 kb, por lo que habra de 0,9 a 9,7 muta-
ciones en cada genoma copiado. Por tanto, en este caso, el virus silvestre realmente
consta de un tipo mayoritario y pasajero que domina el equilibria dinamico (esto es,
una poblaci6n de genomas) presente en todos los cultivos del virus. Estas mezclas de
variantes moleculares se conocen como cuasiespecies y tambien ocurren en otros vi-
rus ARN (por ej., picornavirus). Sin embargo, la mayoria de los tipos virales que inte-
gran una cuasiespecie no seran infectivos o tendran serias desventajas y por tanto seran
rapidamente eliminados de la poblaci6n replicante. Este mecanismo es una fuerza im-
portante en la evoluci6n de los virus (ver Evoluci6n y Epidemiologia).
Principios de virologia molecular
Mutaciones inducidas
Historicamente, la mayor parte de los amilisis geneticos de virus se han realizado
con virus mutantes aislados de poblaciones tratadas con mutagenos. Los mutagenos se
pueden dividir en dos tipos:
• Los mutagenos in vitro que modifican quimicamente los acidos nucleicos y no re-
quieren replicacion para ser activos. Ejemplos de ellos incluyen el acido nitroso, la
hidroxilamina y los agentes alquilantes (por ej., nitrosoguanidina).
• Los mutagenos in vivo requieren acidos nuclei cos metab6licamente activos (es de-
cir, replicando) para ejercer su actividad. Estos compuestos se incorporan en los
acidos nucleicos de nueva sintesis y causan mutaciones que se introducen durante
las sucesivas rondas de replicaci6n. Ejemplos de ellos son los analogos de nucle6-
sidos como el 5-bromouracilo que produce emparejamientos eiToneos de pares de
bases; agentes intercalantes (por ej., colm·antes de acridina) que se intercalan entre
las bases causando inserciones y deleciones, y la radiaci6n UV, que causa la forma-
cion de dimeros de pirimidina que son escindidos del ADN por mecanismos de
reparacion que son mucho mas proclives a introducir eiTores que las enzimas habi-
tualmente utilizadas en la replicacion del ADN.
Los experimentos que implican mutagenos quimicos adolecen de los siguientes
inconvenientes:
• La seguridad es importante, pues los mutagenos son carcin6genos y son frecuente-
mente muy t6xicos. Es desagradable trabajar con estos compuestos .
• Es necesario ajustar cuidadosamente la dosis utilizada de mutageno para producir
un promedio de 0,1 mutaciones por genoma, de lo contt·ario los virus resultantes
contendran numerosas mutaciones que pueden complicar la interpretacion del
fenotipo . Por tanto, muchos de los virus que resulten no contendran ninguna muta-
cion, y el cribado de mutantes puede resultar muy laborioso.
• No hay control de d6nde se producen las mutaciones, y a veces es dificil o imposi-
ble aislar mutaciones en un gen particular o en una region de interes.
Por estas razones, los metodos biologicos moleculares especificos de sitio, como la
mutagenesis dirigida por oligonucleotidos o basada en PCR, son ahora mucho mas
frecuentemente utilizados. Junto con las tecnicas como la digestion enzimatica (para
crear deleciones) y el «linker scanning» (para crear inserciones), actualmente es posi-
ble introducir casi cualquier tipo de mutaci6n con precision y seguridad en cualquier
sitio especifico de un genoma virico.
El fenotipo de un mutante virico depende del tipo de mutacion(es) que tiene y tam-
bien de su localizacion en el genoma. Cada una de las clases de mutaciones que se
citan a continuacion pueden ocuiTir de forma natural o ser inducidas artificialmente en
v1rus:
Genomas
SUPRESION
Las interacciones geneticas entre virus a menudo ocurren naturalmente, pues los
organismos hospedadores frecuentemente son infectados por mas de un virus; sin em-
bargo, estas situaciones son generalmente demasiado complicadas para ser analizadas
con exito. Experimentalmente se pueden analizar las interacciones geneticas en infec-
ciones mixtas (superinfecciones) de celulas en cultivo. De este tipo de experimentos
se pueden obtener dos tipos de informacion:
• La asignacion de mutantes a dos grupos funcionales conocidos como grupos de
complementacion .
• El ordenamiento de mutantes en un mapa genetico lineal mediante analisis de fre-
cuencias de recombinacion .
La complementacion resulta de la interaccion de productos de genes viricos du-
rante la superinfeccion, que causa un incremento de produccion de uno o ambos virus
parentales, mientras que ambos virus se mantienen sin modificar geneticamente. En
esta situacion, uno de los virus en una infeccion mixta provee de un producto de un
gen funcional para otro virus que es defectivo en dicha funcion (Figura 3.2). Si dos
mutantes son defectivos en la misma funcion, no se produce el incremento en la
replicacion y se dice que ambos estan en el mismo grupo de complementacion. La im-
portancia de esta prueba radica en que permite un analisis funcional de mutaciones
desconocidas cuando se conoce la base bioquimica de cualquiera de las mutaciones de
un grupo de complementacion particular. En teoria, el numero de grupos de
complementacion es igual al numero de genes en un genoma virico. En la practica
existen generalmente menos grupos de complementacion que genes, ya que las muta-
ciones en algunos genes son siempre letales y en otros son no esenciales y por tanto no
pueden puntuar en este tipo de test. Hay dos tipos posibles de complementacion:
• Complementacion alelica (intragenica), que ocurre cuando diferentes mutantes tie-
nen defectos complementarios en la misma proteina (es decir, en diferentes domi-
nios funcionales) o en distintas subunidades de una proteina multimerica (aunque
esto es raro ).
• Complementacion no alelica (intergenica), que resulta de mutantes con defectos en
diferentes genes, y es el tipo mas comun.
La complementacion puede ser asimetrica; esto es, solo uno de los virus parentales
(mutantes) replicara. Puede tratarse de una restriccion parcial o absoluta. Cuando la
complementacion ocurre naturalmente, lo habitual es que un virus silvestre competen-
te en replicacion rescate a un mutante defectivo en replicacion. En estos casos el tipo
silvestre se denomina un «virus auxiliar», como en el caso de los retrovirus transfor-
mantes defectivos que contienen oncogenes (ver Figura 3.3 y Capitulo 7).
Principios de virologfa molecular
Figura 3.2 Los grupos de complementaci6n de virus influenza (u otro) contienen todos una mutaci6n
en el rnismo gen virico, hacienda imposible el rescate de otro genoma virico mutante del mismo grupo
de complementaci6n.
Virus mutante
{d:ectivo en repli~ci6n) /
c
Gen delecionado
0
D~============D
lnfecci6n mixta
D
D
+
D
D
@
Figura 3.3 Los virus auxiliares son virus competentes en replicaci6n. que son capaces de rescatar
genomas defectivos en replicaci6n en una infecci6n mixta, permitiendo su multiplicaci6n y disemina-
ci6n.
puede ser importante in vivo. Por ejemplo, se ha sugerido que el rescate de provirus
defectivos, largo tiempo latentes, de VIH durante el prolongado curso clfnico del sin-
drome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA), puede ser origen de un incremento en
la diversidad antigenica y contribuir a la patogenesis de la enfermedad. La recombina-
cion ocurre frecuentemente en la naturaleza; por ejemplo, los reordenamientos en los
genomas de los virus influenza han causado epidemias de afectacion mundial
(pandemias) que han matado a millones de personas (Capitulo 6). Esto convierte a
estas interacciones geneticas en asuntos de considerable interes pnictico y no simple-
mente un tema academico esteril.
Virus A: Virus B:
GenomaA Genoma B
CapsideA Capside B
® ®
lnfecci6n mixta
® ~ i® Progenie de viriones
mezclados
fenotipicamente
~ ~ ~ ~
® ~®
Segundo pase:
,.... el fenotipo
lo determina
el genoma viral
Figura 3.4 La mezcla fenotipica se produce en infecciones mixtas, originando particulas viricas gene-
ticamente sin modificar que tienen ciertas propiedades del otro tipo parental.
Alphaherpesviriuae
lnfecciones latentes en ganglios sensitivos; tamafw del genoma de 120 a 180 kpb
Simplexvirus Virus herpes humanos 1 y 2 (VHS-1, VHS-2)
Varicellovirus Virus herpes humano 3 0/VZ)
Betaherpesvirinae
Gammaherpesvirinae
lnfectan celulas de estirpe linfoblastica; tamaiio del genoma de 105 a 175 kpb
Lymphocryptovirus Virus herpes humano 4 (VEB)
R11adinovirus Virus herpes humano 8 (VHH-8)
Genomas
(a)
0 50 100 152
kbp
Figura 3.5 (a) Genomas de algunos virus herpes (por ej ., virus herpes simplex) en dos secciones
covalentemente unidas, UL y Us, cada una de ellas flanqueda por repeticiones invertidas. (b) Esta orga-
nizaci6n permite la formaci6n de cuatro formas isomericas diferentes del genoma.
secuenciada. Las secuencias nucleotidicas estan siendo utilizadas cada vez mas como
un criterio principal en la clasificaci6n de los virus herpes; por ejemplo, en el caso del
recientemente descubierto virus herpes humano 8 (VHH-8; ver Capitulo 8). Antes del
desarrollo de la secuenciaci6n de nucle6tidos, el genoma de VHS ya habia sido inten-
samente mapeado por ana.Iisis genetico convencional, incluido el estudio de un amplio
nttmero de mutantes s.t. El genoma de VHS es probablemente el genoma virico com-
plejo mas intensamente estudiado.
En contraste con los virus herpes, los genomas de los adenovirus consisten en
ADN bicatenario lineal de 30 a 38 kpb, variando el tamafio exacto de unos grupos a
otros. Estos genomas viricos contienen de 30 a 40 genes (Figura 3.6). La secuencia
terminal de cada cadena de ADN es una repetici6n invertida de 100 a 140 pb; por
tanto, las cadenas simples desnaturalizadas pueden constituir estructuras en forma
de bucle de cadena sencilla selladas por extremos de cadena doble. Estas estructuras
son importantes para Ia replicaci6n del ADN, ya que existe una proteina de 55 kDa
conocida como proteina terminal, que esta unida covalentemente al extremo 5' de
cada cadena. Durante la replicaci6n del genoma, esta proteina actlla como cebador,
iniciando Ia sintesis de las nuevas cadenas de ADN. Aunque los genomas de adeno-
virus son considerablemente mas pequefios que los de los herpesvirus, Ia expresi6n
de su informacion genetica es bastante mas compleja. La expresi6n de grupos de
genes es controlada por unnumero limitado de promotores compartidos. Se generan
multiples ARNm por mecanismos de «corte y empalme» («splicing») y patrones
altemativos de este proceso se utilizan para expresar una diversidad de polipeptidos
de cada promotor (ver Capitulo 5).
Principios de virologia molecular
Genes precoces
inmediatos Genes tardios
Proteina
terminal \ If
5' ) -- - - - - - - - - - - - - - - - - - -- 3' cadena derecha
, cadena izquierda
3'---------------------~ 5
t_____j
\ Proteina
Genes precoces Genes precoces Genes precoces terminal
0 5 10 15 20 25 30 35 36-39
kbp
lntegraci6n en el
genoma celular
Figura 3.7 Los extremos cohesivos de los sitios cos en el genoma del bacteri6fago A son unidos entre
si en las celulas nuevamente infectadas para formar una molecula circular. La integraci6n de esta forma
circular en el cromosoma de Escherichia coli ocurre por un reconocimiento especifico y digestion a
nivel del sitio att en el genoma del fago.
produce largos concatemeros de ADN. Estos son digeridos por una endonucleasa es-
pecifica, pero a diferencia del fago A., las longitudes de los ADNs incorporados en la
particula son algo mas largos que el genoma completo (Figura 3.8); por lo tanto, algu-
nos genes estan repetidos en cada extremo del genoma y el ADN empaquetado en la
particula fagica contiene informacion repetida. jLos genomas de bacteri6fagos no son
necesariamente tan pequefios ni tan simples!
Como otros ejemplos de genomas pequefios de ADN consideraremos dos grupos de
virus animales: los parvovims y los poliomavirus. Los genomas de parvovirus son de
ADN lineal, no segmentado, monocatenario, de unas 5 kb. La mayoria de las heb~as de
ADN empaquetadas en los viriones son de polaridad (- ), pero algunos parvovirus
empaquetan cantidades iguales de cadenas (+) y (- ), y parece ser que todos empaque-
tan al menos una proporci6n de cadenas de polaridad (+). Estos son genomas muy
Principios de virologia molecular
j
Digestion por endonucleasa
de concatemeros gen6micos
B c D E A B c D E A B c
A B c D E A B c D E A B
A B c D E A B B c D E A B c
A B c c c
~·
D E A B D E A B
ADN gen6mico
Figura 3.8 La redundancia terminal en el genoma del bacteri6fago T4 origina la repetici6n de cierta
informacion genetica.
pequefios, e incluso los parvovirus competentes en replicacion contienen solo dos genes:
rep, que codifica proteinas implicadas en la transcripcion, y cap, que codifica las pro-
teinas de la capside. No obstante, la expresion de estos genes es bastante compleja,
pareciendose al patron visto en los adenovirus, con multiples fenomenos de «splicing»
en cada gen (Capitulo 5). Los extremos del genoma tienen secuencias palindromicas
de unos 115 nt, que forman horquillas (Figura 3.9). Estas estructuras son esenciales
para la iniciacion de la replicacion del genoma, de nuevo enfatizando la importancia
de las secuencias en los extremos del genoma.
Los genomas de los poliomavirus consisten en moleculas de ADN bicatenario y cir-
cular de aproximadamente 5 kpb. La arquitectura del genoma de poliomavirus (es decir,
el numero y ordenamiento de los genes y la funcion de las sefiales y sistemas regulado-
res) ha sido estudiado con gran detalle a nivel molecular. Dentro de las particulas, el
ADN virico adopta una forma superenrollada y esta asociado con cuatro histonas celula-
res: ];I2A, H2B, H3 y H4 (ver Capitulo 2). La organizacion genomica de estos virus ha
evolucionado para empaquetar la maxima informacion (seis genes) en el minima espacio
(5 kpb). Esto se ha logrado utilizando ambas cadenas del ADN genomico y genes
solapantes (Figura 3.10). VPI esta codificada por un marco abierto de lectura (ORF)
Genomas
T
TT
C-G- 50
C-G
A- T
G- C
C- G
G-C
G- C 40 20
G-C I I
C- GGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAA3'
T I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I
G- CCGGAGTCACTCGCTCGCTCGCG CGTCTCTCCCTCACCGGTTGAGGTAGTGA TCCCCAAGGAS'
C-G I I -
G-C 100 120
G- C
G-G- 80
C-G
C- G
C-G
G- C
A A
A
Figura 3.9 Las secuencias palindr6rnicas en los extremos de los genomas de parvovirus generan es-
tructuras en horquilla implicadas en la iniciaci6n de Ia replicaci6n.
exclusivo, pero los genes VP2 y VP3 se superponen de manera que VP3 esta contenido
dentro de VP2. El origen de replicaci6n esta rodeado de regiones no codificantes que
controlan la transcripci6n. Los poliomavirus tambien codifican antigenos T, que son pro-
teinas que pueden ser detectadas por sueros de animates con tumores inducidos por
poliomavirus. Estas proteinas se unen al origen de replicaci6n y muestran actividades
Origen de
replicaci6n
Figura 3.10 La organizaci6n compleja del genoma de los poliomavirus permite Ia compresi6n de
mucha informacion genetica en una secuencia relativamente corta.
Principios de virologfa molecular
complejas, en las que estan comprendidas tanto la replicaci6n del ADN como la trans-
cripci6n de los genes virales. Este tema se expone mas ampliamente en el Capitulo 7.
Picornavirus
5' UTR Proteinas Proteinas 3' UTR
5, estructurales no estructurales / 3'
Togavirus
5' UTR Proteinas Proteinas 3' UTR
5
, I no estructurales estructurales / ,
3
@-1_._1_______,__ _,.""'--""'-""-"''-=-'~-='-"--':Jl,.,._,j-poli (A)
Flavivirus
5' UTR Proteinas Proteinas 3' UTR
, I estructurales no estructurales
5
@--11 [ 1
/
I
3'
Coronavirus
Proteinas
no estructurales
5'
@--1~~============~======================~~---
J : __ _ __ _ __ ___J_ __ _ _ __ _ _ _ __ _ _----' 3' (A)
-poli
Proteinas
estructurales
Picornavirus
Togavirus
Flavivirus
El genoma de flavivims esta constituido por ARN de una sola cadena, de polaridad
(+), de unos 10,5 kb, con las siguientes propiedades:
• Tiene una caperuza («cap») en 5' metilada, pero en la mayoria de los casas el ARN
no esta poliadenilado en su extrema 3 ' .
• La organizacion gen6mica difiere de lade los togavirus (ver antes) en que las pro-
teinas estmcturales son codificadas en la porcion 5' del genoma, y las no estructu-
rales en la porcion 3 '.
• La expresi6n es similar a la de los picornavirus, incluyendo la producci6n de una
poliproteina .
Principios de virolog fa molecular
Coronavirus
La mayoria (pero no todas) las familias de vims de plantas tienen genomas ARN de
polaridad (+). El genom a de tobamovims vims del mosaico del tabaco (VMT) es un
ejemplo bien estudiado (Figura 3.12):
• El genoma del VMT es una molecula de ARN de 6,4 kb que codifica cuatro genes.
• Existe un «cap» metilado en 5 ', y el extrema 3' del genoma contiene extensas es-
tmcturas secundarias, pero no secuencias poli(A) .
0 2 3 4 5 6 6,4 kb
5' 3'
Proteina de movimiento I 30k I
5' 3'
Proteina de capside o:z:m
Figura 3.12 Organizaci6n del genoma del virus del mosaico del tabaco (VMT).
Genomas
Los virus con genomas de ARN de sentido negativo tienen algo mas de diversidad
que los virus de polaridad positiva ya comentados. Posiblemente a causa de las dificul-
tades en la expresi6n, tienden a tener genomas mas grandes codificando mas informa-
cion genetica. Debido a ello, la segmentaci6n es una caracteristica frecuente, aunque
no general, de estos virus (Figura 3.13). Ninguno de estos genomas es infeccioso como
ARN purificado. Aunque recientemente se ha encontrado en algunas celulas eucari6ti-
cas un gen que codifica una ARN polimerasa ARN dependiente, la mayoria de las
celulas no infectadas no contienen suficiente actividad de esta enzima para permitir
una infecci6n virica, y, debido a que un genoma de polaridad negativa no puede ser
traducido como un ARN mensajero sin la polimerasa virica empaquetada en cada par-
ticula, estos geriomas son efectivamente inertes. Algunos de los virus descritos en esta
secci6n no tienen estrictamente polaridad negativa, sino que tienen genomas con am-
bas polaridades o ambisense, con una porci6n de sentido (+) y otra de sentido (-).
Estrategias de codificaci6n en ambos sentidos se encuentran tanto en virus de plantas
(por ej ., el genero Tospovirus de los bunyavirus, y los tenuivirus como el virus del
rayado del arroz (rice stripe virus)) como en virus animales (el genero Phlebovirus de
los bunyavirus y los arenavirus).
Bunyavirus
Bunyavirus
L
L 3' L-------------~------------~
--
5'
N
M 3' i G1 G2 Is' 5 3' 0 5' 0 3' [ [ ] 5'
-N
--+N55 N55
z ~
L
5' 5 3' 1
--GP
Is'
Orthomyxovirus
,--------.
Gen 1 PB1 Gen2 PB, Gen 3 PA
Paramyxovirus
3'11 NP II P/C II M }-
;> F II HN II L li s'
Arenavirus
Los genomas de arenavirus constan de ARN monocatenario lineal. Tienen dos seg-
mentos gen6micos: L (5,7 kb) y S (2,8 kb). Ambos tienen una organizaci6n en ambos
sentidos, como los anteriores.
Orthomyxovirus
Paramyxovirus
Rhabdovirus
la capacidad codificante total del genoma entero. Sin embargo, la desventaj a de esta
estrategia es que todos los segmentos genomicos tienen que ser empaquetados en cada
particula virica o el virus sera defectivo como resultado de una perdida de informacion
genetica. En general, no se comprende como se logra este control del empaquetamiento.
Separando los segmentos genomicos en diferentes particulas (la estrategia de la
multiparticion) se elimina la necesidad de la clasificacion exacta pero se introduce un
nuevo problema, al tener que ser captadas todas las particulas viricas diferenciadas por
una misma celula hospedadora para que se establezca una infeccion productiva. Esta
es quiza la razon por la que los virus multipartidos solo se encuentran en plantas.
Muchas de las fuentes de infeccion por virus de plantas, tal como Ia inoculacion por
insectos chupadores de savia o tras dafio fisico de tejidos, ocasionan un gran inoculo
de particulas viricas infecciosas, ofreciendo oportunidades de que una sola celula sea
inicialmente infectada por mas de una particula.
La genetica de los genomas segmentados es esencialmente la misma que la de los
genomas no segmentados, con la adicion de la recombinacion de segmentos, como se
comento antes. Las recombinaciones pueden ocurrir tanto si los segmentos son empa-
quetados en particulas individuales como si lo son en la configuracion multipartida. La
recombinacion es un modo muy eficaz de lograr con rapidez una amplia diversidad
genetica, esta podria ser otra razon para su evolucion. La segmentacion del genoma
tiene tambien implicaciones en la reparticion de la informacion genetica y en la forma
en que esta es expresada, que sera mas ampliamente considerada en el Capitulo 5.
Para eritender Ia complejidad de estos genomas, considere la organizacion de un
genoma virico segmentado (virus influenza A) y la de un genoma multipartido
(geminivirus). El genoma del virus influenza se compone de ocho segmentos (en in-
fluenza A y B; de siete en influenza C) de ARN monocatenario de polaridad negativa
(Tabla 3.2). La identidad de las proteinas codificadas por cada segmento genomico fue
ARNm
5' (15-22 nt mas corto que el ARNv)
~-N 13 -~GCXAAAGCAGG -------! 1---- AAAA/
1
ARNv
3' (8 segmentos gen6micos)
ucc5uuuccucc - - - - - - 1 f-- -- GGAACAAGAUGA 5'
j
ARNe
5' (intermediarios replicati vos)
3
pppAGC~AAAGCAGG ------1 f---- CCUUGUUUCUACU '
AV ~ (M P)
AC4
BVl (NSP)
AC2 (TrAP)
Ty
~====================~ITTIO
jTYA (gag) I
TYB (pan
Retrovirus
~~=============================ITTIO
gag
pol
env
Figura 3.17 La organizaci6n genetica de retrotransposones tales como genomas Ty (arriba) y de retro-
virus (debajo) muestra diversas similitudes, incluyendo Ia presencia de repeticiones terminales directas
largas (LTRs) en cada extremo.
Principios de vi rologia molecular
tor que controla la transcripcion de un ARNm terminal redundante de 5,6 kb. Este
contiene dos genes: TyA, con homologia con el gen gag de los retrovirus, y TyB, ho-
mologo al gen pol. La proteina codificada por TyA es capaz de formar una particula
pseudovirica («virus-like particle», VLP) mas o menos esferica, de 60 nm de diametro.
El transcrito de 5,6 kb puede ser incorporado en tales particulas, resultando la forma-
cion de unas estructuras intracelulares conocidas como Ty-VLPs. A diferencia de ver-
daderos virus, estas pat1iculas no son infecciosas para las levaduras, pero si son capta-
das accidentalmente por una celula pueden llevar a cabo Ia transcripcion inversa de su
contenido de ARN para formar un elemento Ty de ADN bicatenario, que se puede
integrar en el genoma de la celula hospedadora (ver mas adelante).
La principal diferencia entre retrotransposones tales como Ty, copia (un elemento
similar encontrado en Drosophila melanogaster) y retrovirus verdaderos es la presen-
cia de un gen adicional en los retrovirus, env, que codifica una glicoproteina de envol-
tura (ver Capitulo 2). La proteina de envoltura es responsable de la union al receptor
y ha permitido a los retrovirus escapar del estilo de vida de los retrotransposones para
formar una verdadera partfcula virica y propagarse ella misma ampliamente mediante
Ia infeccion de otras celulas (Figura 3.17). Los genomas de retrovirus tienen cuatro
caracteristicas 1micas:
• Son los imicos virus que son verderamente diploides.
Son los unicos virus ARN cuyo genoma es producido por Ia maquinaria transcrip-
cional celular (sin ninguna participacion de una polimerasa de codificacion virica).
• Son los unicos virus cuyo genoma requiere un ARN celular (ARNt) para su replica-
cion.
• Son los unicos virus ARN de polaridad (+) cuyos genomas no sirven directamente
como ARNm inmediatamente tras la infeccion.
Durante el proceso de Ia transcripcion inversa (Figura 3 .18), las dos moleculas de
ARN de cadena sencilla de polaridad (+)que constituyen el genoma virico son conver-
tidas en una molecula de ADN de doble cadena algo mas larga que los mol des de ARN
debido a la duplicacion de las secuencias repetidas directas en cada extremo; las repe-
ticiones terminales largas (LTRs) (Figura 3.19). Algunos pasos de la transcripcion in-
versa mantienen ciertos misterios; por ejemplo, los saltos que aparentemente efectUa la
polimerasa de un extreme al otro de la cadena molde. De hecho, estos pasos pueden
explicarse por la observacion de que la conversion completa del ARN de retrovirus en
ADN de doble cadena solo sucede en una particula parcialmente decapsidada y no
puede ser duplicado fielmente in vitro con los reactivos libres en solucion . Esto indica
que la conformacion de los dos ARNs dentro de la ucleocapside de retrovirus esta-
blece el curso de Ia transcripcion inversa; los saltos no existirian, ya que los extremes
de las cadenas estan probablemente adyacentes uno respecto al otro dentro del core.
La transcripcion inversa tiene importantes consecuencias para la genetica de retro-
virus. Primero, es un proceso muy propenso a errores, porque la transcriptasa inversa
no realiza las funciones de correccion llevadas a cabo por las ADN polimerasas ADN-
dependientes. Esto origina la introduccion de muchas mutaciones en los genomas de
retrovirus y, consecuentemente, una rapida variacion genetica (ver mutaciones espon-
Genom as
La sintesis <<salta»
~
a otro extrema
de Ia cadena molde
Extension
de Ia primera cadena
lnicio de Ia sintesis
de Ia segunda cadena
Extension
de Ia segunda cadena
La ARNasa H degrada
el cebador ARNt
3'1 I U3 I R I us IS'
5'1 U3 I R I us I PBS 13'
La sintesis de Ia segunda
cadena continua tras
<<saltar» a otro extrema
3' II I I
JB~
t
I U3 I R I us I S'
de Ia primera cadena S'l U31 R I US _
LTR
Clave
DARN viral
D ADNc de nueva sintesis
Figura 3.18 Mecanismo de transcripci6n inversa de genomas de retrovirus, en el cual dos moleculas
de ARN son convertidas en un solo provirus de ADN de doble cadena (con terminaciones redundantes).
Provirus integrado
U3 R lusF=;~ U3 R I us!
~~ 'rno.oipd6o I
.
~
U3
I"R
1us F=;J===i U3 R Iusj
j ARNm
Figura 3.19 Produccion de infmmacion repetida en las repeticiones terminales largas (LTRs). Ade-
mas de su papel en Ia transcripcion inversa, estas secuencias contienen importantes elementos de control
implicados en Ia expresion del genoma viral, incluyendo un promotor de Ia transcripcion en Ia region U3
y una sefial de poliadenilacion en Ia region R.
mecanismo responsable de esto, si una de las dos cadenas difiere de la otra (por ej., por
la presencia de mutaciones) y se produce una recombinaci6n, entonces los virus resul-
tantes senin distintos geneticamente de cualquiera de los virus parentales.
Tras completarse la transcripci6n inversa, el ADN bicatenario migra al nucleo, to-
davia asociado a proteinas viricas. Los productos maduros del gen pol son en realidad
un complejo de polipeptidos que incluyen tres actividades enzimaticas distintas:
transcriptasa inversa y ARNasa H, que estan implicadas en la transcripci6n, e integrasa,
que cataliza la integraci6n del ADN virico en la cromatina de la celula hospedadora,
tras lo cual se conoce como provirus (Figura 3.20). Despues de la transcripci6n inver-
sa se encuentran tres tipos de ADN bicatenario en las celulas infectadas por retrovirus:
ADN lineal y dos formas circulares que contienen bien uno o dos LTRs. Segun la
estructma en los extremos del provirus, se crey6 en un principia que el circulo con los
dos LTR era la forma usada para la integraci6n. En afios recientes se han desanollado
sistemas para estudiar in vitro la integraci6n del ADN de retrovirus y muestt·an que es
la forma linealla que se integra. Esta discrepancia puede ser resuelta por un modelo en
el que los dos extremos de los dos LTRs son mantenidos en estrecha proximidad por el
complejo transcriptasa inversa-integrasa. El resultado neto de la integraci6n es que se
pierden 1 a 2 bp de los extremos de cada LTR y se duplican 4 a 6 pb de ADN celular a
cada lado del provirus. No esta claro si existe alguna especificidad respecto al sitio de
integraci6n en el genoma celular. Lo que es obvio es que no existe una sola secuencia
Genomas
gag env
Provirus integrado:
• perdida de 2 pb en cada extremo de los LTRs
• repeticiones directas de 6 pb de ADN celular
flanquean Ia inserci6n
diana, pero es posible que existan muchas regiones o sitios en el genoma eucariotico
que sean sitios mas probables que otros para la integraci6n.
Despues de la integraci6n, el ADN del provirus se convierte esencialmente en una
colecci6n de genes celulares y su expresi6n queda a merced de Ia celula. No existe meca-
nismo alguno para la escisi6n precisa de provirus integrados, algunos de los cuales se
sabe que han quedado fosilizados en genomas de primates durante millones de aiios de
evoluci6n, aunque los provirus a veces se pueden perder o alterar por modificaciones del
Pri ncipios de virolog\a molecular
Figura 3.21 Estructura, organizaci6n y potencial de codificaci6n de proteinas del genoma del virus de
la hepatitis B (VHB).
Genomas
EVOLUCION Y EPIDEMIOLOGiA
~,
ARN 358
---...
VII
ARN 19S VI ~
II\
,t
Ill
; ''
'
IV ' Cadena y
v VIII
.A.......
'
Cadena~
~2
Figura 3.22 Estructura, organizaci6n y potencial de codificaci6n de proteinas del genoma del virus
del mosaico de la coliflor (VMCo).
cultades para estos amilisis. Exceptuando las epidemias en las que los sintomas agu-
dos son evidentes, Ia principal evidencia de infeccion virica disponible para el
epidemiologo es Ia presencia de anticuerpos antiviricos en los pacientes. Esta informa-
cion a menudo proporciona una imagen incompleta, y a menudo resulta dificil calcular
si una infeccion virica ocurrio recientemente o en algun momenta en el pasado. Tecni-
cas altemativas, como el aislamiento de virus en plantas o animales de experimenta-
cion, son laboriosas e imposibles de aplicar a grandes poblaciones. La biologia mole-
cular proporciona tecnicas sensibles, nipidas y sofisticadas para detectar y analizar Ia
informacion genetica almacenada en los genomas viricos y ha resultado ser una nueva
area de investigacion: Ia epidemiologia molecular.
Familias:
Picornaviridae, Potyviridae (no segmentados)
, Comoviridae (segmentados) ,
5 3
®-1.....--.------r~ 0l ll.__....._ll_ _. . _.~
l poli(A)
5' UTR Proteinas estructurales VPg Proteinas Proteasa Replicasa 3' UTR
no estructurales
Familias:
Togaviridae, Tobravirus, Tobamovirus (no segmentados)
, Bromoviridae (seg mentados) ,
5 3
@>-0 .---------,.. ~~..._1_ _ _ _ _ _ ___._1......~ poli(A)
5' UTR Proteinas Proteinas estructurales 3' UTR
no estructurales
Familias:
Paramyxoviridae, Rhabdoviridae (no segmentados)
Bunyaviridae, Arenaviridae (segmentados)
5'
~~~~r--1----,.,11
3
,~~~----_-_1
3' UTR Nucleoproteina Matriz Glicoproteina Replicasa 5' UTR
Figura 3.23 Similitudes en la funci6n y la organizaci6n de los genomas de diferentes familias de virus
permiten agruparlas juntas en «superfamilias».
RESUMEN
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CAPiTULO 4
REPLICACION
-
tituyo una mejora del sistema anterior, existen todavia problemas para distinguir
Principios de virologia molecular
virus que son morfologicamente similares pero que causan sintomas clinicos distin-
tos (por ej., varios picornavirus). Durante esa epoca, Ia serologia se convirtio en
una ayuda importante para clasificar los virus y Ia morfologia de las particulas
continua siendo hoy un aspecto importante para la clasi:ficacion de los virus.
3. Clasificacion funcional: En los ultimos afios se ha puesto un mayor enfasis en la
estrategia de replicacion de los virus. Esto es especialmente cierto para la composi-
cion y la estructura del genoma viral y las restricciones que este impone sobre Ia
replicacion. Esta estrategia se ha acelerado mediante el desarrollo de la biologia
molecular, debido a la importancia capital del genoma viral para esta nueva tecno-
logia. El analisis molecular de los genomas viricos permite una rapida e inequivoca
identi:ficacion de cepas viricas individuales, pero ademas resulta tambien uti! para
predecir las propiedades de un virus nuevo, desconocido previamente, cuando pre-
senta una estructura genomica familiar. (La clasi:ficacion de los virus se describe en
el Apendice 2).
En un senti do teleologico (es decir, atribuyendo a un organism a inanimado como
un virus un proposito consciente), el unico objetivo de un viruses replicar su informa-
cion genetica. La naturaleza del genoma viral es par tanto fundamental en determinar
que pasos son necesarios para conseguir este objetivo. En realidad, se puede producir
en estos procesos una sorprendente cantidad de variaciones, incluso con virus con
estructuras genomicas aparentemente similares. La razon de esto reside en Ia compar-
timentalizacion, tanto de las celulas eucariotas en los compartimentos nuclear y
citoplasmatico como de la informacion genetica y la capacidad bioquimica en el genoma
virico y Ia celula hospedadora.
El tipo de celula infectada por un virus tiene un profunda efecto sobre el proceso de
replicacion. Para los virus de procariotas, la replicacion refleja en cierto modo la
relativa simplicidad de sus celulas hospedadoras. Para los virus de eucariotas el tema
es frecuentemente mas complejo. Existen muchos ejemplos de virus animales que ex-
perimentan distintos ciclos replicativos en diferentes tipos celulares; no obstante, la
capacidad codi:ficante del genoma obliga a todos los virus a escoger una estrategia de
replicacion. Esta puede ser una que implique una intensa dependencia de la celula
hospedadora, en cuyo caso el genoma virico puede ser muy compacta y necesitara
codi:ficar solo la informacion esencial para unas pocas proteinas (por ej., parvovirus).
Altemativamente, grandes y complejos genomas viricos, tales como los de poxvirus,
codi:fican la mayor parte de la informacion necesaria para la replicacion, y el virus solo
depende de la celula para Ia provision de energia y la maquinaria de sintesis macromo-
lecular, como los ribosomas (ver Capitulo 1). Virus con un estilo de vida de ARN (es
decir, genoma ARN mas ARNs mensajeros) no tienen necesidad aparente de entrar en
el nucleo, aunque durante el curso de Ia replicacion algunos lo hacen. La mayoria de
los virus de ADN, como cabria esperar, replican en el nucleo, donde se replica el ADN
celular y donde esta localizada Ia maquinaria bioquimica necesaria para este proceso.
Sin embargo, algunos virus con genoma ADN (por ej., los poxvirus) han evolucionado
para contener su:ficiente capacidad bioquimica y ser capaces de replicar en el citoplas-
ma, con minimos requerimientos de las funciones celulares. La mayor parte de este
Rep licaci6n
Los bacteriOfagos han sido utilizados ampliamente por los vir6logos como mo-
delos para comprender Ia biologia de los virus. Esto es particularmente cierto para la
replicaci6n virica. Dos experimentos especialmente significativos que ilustran la na-
turaleza fundamental de los virus se realizaron con bacteri6fagos. El primero de ellos
fue llevado a cabo por Ellis y Delbruck en 1939 yes habitualmente denominado el
experimento de un «solo estallido» o «curva de multiplicaci6n en un paso» (Figura
4.1). Este fue el primer experimento que mostr6 las tres fases esenciales de la repli-
caci6n virica:
Primer Segundo
Periodo de latencia estallido estallido
7
1 X 10 f-
5! 1x 10" r-
'B""
Q)
'0
:€ci.
; 1 X 10 5 Tamafio del estallido
'
__...c _ _ ._ - - - - - - - - - - - - - - -
4
1 X10 -
I I I I I
0 10 20 30 40 50 60 70 80
Tiempo tras Ia infecci6n de las celulas (minutes)
Figura 4.1 Curva de crecimiento en un solo paso o experimento de un solo estallido. Inicialmente
realizado por Ellis y Delbruck en 1939, este cll\sico experimento ilustra Ia verdadera naturaleza de Ja
replicaci6n virica. En el texto se proporcionan mas detalles del experimento. En este experimento en
particular, se muestran dos estallidos (cosechas de particulas fagicas de las celulas).
Principios de virologia molecu lar
• Iniciaci6n de la infecci6n.
• Replicaci6n y expresi6n del genoma virico.
• Liberaci6n de viriones maduros de la celula infectada.
En este experimento, los bacteri6fagos se aiiadieron a un cultivo de bacterias en
crecimiento nipido y tras unos pocos minutos, el cultivo fue diluido, previniendo efi-
cazmente mas interacciones entre las particulas fagicas y las celulas. Este sencillo
paso es la clave de todo el experimento, ya que efectivamente sincroniza la infecci6n
de las celulas y permite que las fases siguientes de replicaci6n en una poblaci6n de
celulas individuates y particulas vfricas sea observada como side una sola interacci6n
se tratase (de un modo muy parecido a como la clonaci6n molecular de acidos nucleicos
permite el anatisis de poblaciones de moleculas de acidos nucleicos como una sola
especie). Se tomaron muestras repetidas del cultivo a breves intervalos y se analizaron
las celulas bacterianas sembrandolas en placas de agar y las particulas vfricas
plaqueandolas sobre monocapas de bacterias. Como se observa en la Figura 4.1 , se
produce un incremento de la concentraci6n de particulas fagicas de forma escalonada
a lo largo del tiempo, representando cada incremento en la concentraci6n de fagos un
ciclo replicativo viral. Los datos de este experimento tambien se pueden analizar de un
modo diferente, trazando una grafica con los numeros de unidades formadoras de
placa (u.f.p.) por bacteria en funci6n del tiempo (Figura 4.2). En este tipo de ensayo,
una unidad formadora de placa puede ser tanto una sola particula virica extracelular
como una celula bacteriana infectada. Ambas se pueden distinguir mediante la disrup-
ci6n de las bacterias con cloroformo antes de sembrarlas, lo que Iibera las partfculas
fagicas intracelulares, ofreciendo asi el recuento total de virus (es decir, las patiiculas
intracelulares mas las extracelulares).
Algunas caracteristicas adicionales de la replicaci6n virica son visibles en la grafi-
ca de la Figura 4.2. Inmediatamente despues de la diluci6n del cultivo existe una fase
de 10 6 15 minutos en la que no hay particulas fagicas detectables; se conoce como el
periodo de eclipse. Representa un tiempo en el que las particulas viricas han desapa-
recido tras penetrar en las celulas, liberando sus genomas como un requisito previa a
Ia replicaci6n. En esta fase, las particulas ya no son infecciosas y por lo tanto no se
pueden detectar por ensayo de placas. El periodo de Iaten cia es el tiempo antes de que
aparezca la primera partfcula virica extracelular y tiene una duraci6n de 20 a 25 minu-
tos para la mayorfa de los bacteri6fagos. Unos 40 minutos despues de que las celulas
hayan sido infectadas las curvas del numero total de partfculas viricas y de virus extra-
celular se superponen porque las celulas infectadas se han lisado y han liberado todos
los fagos intracelulares. Se puede calcular la producci6n (es decir, elnumero) de parti-
culas vfricas por celula infectada a partir del incremento total del titulo de fagos.
Siguiendo el desarrollo de los ensayos de placas para virus animales en la decada
de 1950, los experimentos de un solo estallido se realizaron con muchos virus de
eucariotas, con resultados similares (Figura 4.3). La principal diferencia entre estos
virus y los bacteri6fagos es que el intervalo de tiempo requerido para la replicaci6n es
mucho mas largo, y se mide en horas, y en algunos casos en dias, en vez de en minutos
tras la infecci6n. Esta diferencia refleja la muy inferior velocidad de crecimiento de las
Replicaci6n
100 r- Periodo
de eclipse
Producci6n
10 r-
"'
::;
:a;
.!2
ci.
"""'
:0
I I I
0
10 20 30 40
Tiempo (minutos)
0,01 L
Figura 4.2 Amilisis de los datos de un experimento de un solo estallido. A diferencia de lo que mues-
tra la Figura 4.1, el niunero total de unidades formadoras de placa (u.f.p.) producidas, aqui los datos que
se representan son las u.f.p./celula bacteriana, lo que refleja los hechos acontecidos en una celula infec-
tada «tipica». Las etapas de Ia replicaci6n nombradas en Ia gratica se defmen en el texto.
1.000 r=
f::
1-
~--- -- -- --- ----- - - - -; .
1-
1-
100 r
I-
f-
r Producci6n
I-
I-
r Periodo
r de
Iaten cia
10 f::
~
1-
1 I
0 2 4 6 8 10 12
Tiempo tras Ia infecci6n (h)
Figura 4.3 La replicaci6n de virus eucari6ticos liticos ocurre de un modo muy similar a Ia de los
bacteri6fagos. Esta figura representa un experimento de un solo estallido aplicado a un picornavirus
(por ej ., poliovirus). Este tipo de resultado solo se puede producir en una infecci6n sincronizada, en Ia
que se utiliza una elevada multiplicidad de infeccion.
mente en una batidora que no destruy6 las celulas bacterianas pero que fue suficiente-
mente intenso para separar las capsides viricas de la superficie de las celulas. El anali-
sis de Ia radiactividad contenida en los sedimentos celulares y en el sobrenadante del
cultivo (conteniendo cubiertas vacias de fagos) demostr6 que Ia mayor parte de la
radiactividad en las particulas marcadas con 35 S pennanecia en el sobrenadante, mien-
tras que con las particulas marcadas con 32 P la mayor parte de la radiactividad habia
penetrado en las celulas. Este experimento indicaba que era el genoma de ADN del
bacteri6fago el que habia entrado en las celulas para iniciar Ia infecci6n. .
Aunque esto pueda ahora parecer obvio, en el tiempo en que se realiz6 este experi-
mento se estableci6 una gran controversia sobre si un polimero con una simple estruc-
tura como un acido nucleico, que se sabia formado por solo cuatro mon6meros, era
suficientemente complejo para ser portador de la infmmaci6n genetica. (En aquel mo-
mento se creia comunmente que las proteinas, constituidas por mezclas mucho mas
complejas de mas de 20 aminoacidos diferentes, eran las portadoras de los genes y que
el ADN era probablemente un componente estructural de celulas y virus). Juntos, estos
Replicaci6n
80
"'~
"0
Sintesis de ADN celular
e-00 60 r-- (control de celulas
no infectadas)
(.)
-"
"0
s"'
"0
u
~ 40 r--
'6
~
Q)
"0
Sintesis de ADN celular
(celulas infectadas)
20 r- Sintesis de ADN viral
Figura 4.4 Bioquimica de la infecci6n virica. Esta grafica muestra la velocidad de sintesis de ADN
celular y virico (basado en la incorporaci6n de nucle6tidos marcados con radiois6topos a material de
elevado peso molecular) en celulas no infectadas e infectadas con herpesvirus.
EL CICLO DE REPLICACION
l.
Principios de virologfa molecular
Fago T2 - genoma marcado con 32p Fago T2- capsides marcadas con 35S
~<p0
\i(Cj)
f L
l _____ ·--~
l_nf_ec_c_io_n_d_e_E_._co_h_
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~~~
tl r __H
_o_m_o_g-en-e-iz_a_re_n_m
_ e_z_c-la-do_r__,
Q 9Q
<:&;;:> 0 &
£2v~ Separar celulas bacterianas y
capsides fagicas por centrifugaci6n
1
El sobrenadante contiene El sobrenadante contiene
25% de radioactividad 85% de radioactividad
Figura 4.5 El experimento de Hershey-Chase, realizado en 1952, demostr6 que la informacion gene-
tica en los virus estaba codificada por acidos nucleicos y no por proteinas. En el texto se proporcionan
los detalles del experimento.
estas etapas se han estudiado con gran detalle, y existe una cantidad tremenda de infor-
macion sobre ellas. Otras etapas han resultado mucho mas dificiles de estudiar, y se
dispone de ellas de mucha menos infonnacion.
Adsorci6n
Como las fases de la replicacion viral que se describen aqui son puramente arbitra-
rias y debido a que la replicacion completa implica necesariamente un ciclo, se puede
comenzar a explicar la replicaci6n virica en cualquier etapa. Aunque es discutible, lo
mas 16gico es considerar Ia primera interacci6n de un virus con una nueva celula
hospedadora como el momento de partida del ciclo. Tecnicamente, la adsorcion del
virus consiste en una union especifica de una proteina vi rica de adhesion ( o
«antirreceptor») a una molecula del receptor celular. Actualmente se conocen muchos
Rep licaci6n
O-
Nucleo
Citoplasma
\; Proteinas
Figura 4.6 Esquema general de replicacion virica. Para mas detalles, consu ltese el texto.
ejemplos de receptores virales, y una lista completa seria demasiado larga para incluir-
la aqui (ver Figura 4.7 y la seccion de Bibliografia al final del capitulo).
Las moleculas de receptores diana en las superficies celulares pueden ser proteinas
(generalmente glicoproteinas) o los residuos carbohidrato presentes en las glicoproteinas
o glicolipidos. Los primeros son generalmente receptores especificos en los que un
virus puede usar una proteina particular como un receptor. Los grupos carbohidrato
\ ;\
\
\ l
l i
a \
# ..~
.
\·~
....l ~~··
# •
~
l
• I
2 3 4 5 6 7 8 9 10
Figura 4.7 Representacion esquematica de algunos receptores virales; las flechas indican sitios de
union de virus. (1) Receptor de poliovirus (RPV). (2) CD4: Vlli. (3) Antigeno(s) carcinoembrionario(s):
virus de Ia hepatitis del raton (MHV) (coronavirus). (4) ICAM-1: mayoria de rinovirus. (Notese que del
1 al 4 todos son molecul as pertenecientes a Ia superfamilia de las inmunoglobulinas). (5) integrina
VLA-2: virus ECHO. Receptor LDL: algunos rinovirus. (7) Arninopeptidasa N: coronavirus. (8) Acido
sialico (en glicoproteinas): influenza, reovirus, rotavirus. (9) Transportador de aminoacidos cationicos:
virus de Ia leucemia murina. (10) Transportador de fosfato sodio-dependiente: virus de Ia leucemia del
mono gib6n.
Principios de virologia molecular
flanquean (Figura 4.8). Las evidencias bioquimicas obtenidas de unas drogas inhibitorias
que bloquean la union de particulas de RVH a las celulas indican que la interaccion
entre ICAM -1 y la particula virica se produce en el suelo de este canon. A diferencia de
otras areas de la superficie del virion, los aminoacidos que forman las superficies inter-
nas del canon estan relativamente conservados. Se ha sugerido que estas regiones es-
tan protegidas de la presion antigenica porque las moleculas de anticuerpos son dema-
siado grandes para penetrar en la grieta. Esto es importante, porque cambios radicales
a este nivel, aunque permitirian al virus escapar de una respuesta inmunitaria, trastor-
narian Ia union al receptor. Por consiguiente, se ha visto que el sitio de union del
rece tor se extiende por debajo de los bordes del canon y que los sitios de union de los
anticuerpos neutralizantes se extienden sobre los bordes del mismo. De todas maneras,
los residuos mas significativos para los sitios de union del receptor y de los anticuer-
pos monoclonales estan separados unos de otros. En los poliovirus existe un canon
similar que se extiende alrededor de cada vertice, eje de simetria quintuple, de la capside.
Las regiones muy variables de Ia capside a las que se unen los anticuerpos se localizan
en los «picos» a ambos !ados de esta hendidura, que es nuevamente demasiado estre-
cha para permitir que los anticuerpos se unan a los residuos de su base. Los residuos
invariables en los !ados de Ia hendidura interaccionan con el receptor.
Incluso dentro de la familia Picornaviridae hay variacion. Aunque 90 serotipos de
RVH utilizan ICAM-1 como receptor, unos 10 serotipos utilizan proteinas relaciona-
das con el receptor de la lipoproteina de baja densidad (LDL, «low density lipoprotein»).
Se ha descrito que el virus de la encefalomiocarditis (VEMC) utiliza la molecula
inmunoglobulina de adhesion a celula vascular (VCAM-1 , «vascular cell adhesion
molecule 1») o glicoforina A. Diversos picornavirus utilizan integrinas como recepto-
res: algunos virus entericos citopaticos humanos huerfanos (ECHO, «enteric cytopathic
Poliovirus
Pvr
.
Membrana celular
Figura 4.8 Las particulas de rinovirus tienen una profunda hendidura en su superficie, conocida como
«canon», situada entre los tres mon6meros (VPl , 2 y 3) que constituyen cada cara de la particula.
Principios de virologia molecular
Penetraci6n
Membrana celular
0
Citoplasma
g
La particula es translocada
! a !raves de Ia membrana
par el receptor
v
"' n"""" !
La particula es liberada
en el citoplasma y el receptor
pm '" "'"'"
0
Figura 4.10 Translocaci6n de particulas viricas en teras a traves de Ia membrana celular por receptores
de Ia superficie celular.
3. Fusion de la envuelta del virus (solo aplicable a virus envueltos) con la membrana
celular, bien directamente en la superficie celular o tras endocitosis en una vesicula
citoplasmatica (Figura 4.12), que requiere la presencia de una proteina de fusion
especifica en la envoltura viral; por ejemplo, la hemaglutinina de virus influenza o
las glicoproteinas transmembrana (TM) de retrovirus. Estas proteinas promueven
la union de las membranas celular y virica que resulta en la entrada directa de la
Principios de virologfa molecular
ENDOCITOSIS
ooo ooo o oo oO 0
.-----------~-l Membrana celular
lnvaginacion
recubierta
Adherencia Union
EXOCITOSIS
Membrana celular
Vesicula secretoria
Adherencia Union
Membrana celular
Virus
extracelular
e Union al receptor
~·'ru?'
\SA!.V Fusion
------, de membranas
I
Figura 4.12 Fusion de membrana inducida por virus. Este proceso es dependiente de !a presencia de
una proteina de fusion especifica en !a superficie del virus que, bajo circunstancias particulares (por ej.,
!a acidificacion de !a vesicula que contiene al virus), se activa e induce la fusion de la membrana de la
vesicula y la envuelta del virus.
Decapsida 6n
La dec psidacion es el termino general que se utiliza para definir los hechos que
ocurren tras la cio , en Ia cualla ca del virus es completa o parcialmente
retirada y el o virico expuesto, generalmente en forma de un complejo de
nucleoproteina. Desafortunadamente, la decapsidacion es una de las fases de la repli-
cacion virica que ha sido menos estudiada y es relativamente poco comprendida. En
cierto sentido, la eliminacion de la que ocurre durante la fusion de membra-
nas forma parte del proceso de decapsidacion. La fusion entre las envueltas viricas y
las membranas del endosoma es dirigida por las proteinas de fusion del virus. Se activa
generalmente por Ia exposicion de un dominio de fusion previamente oculto, como
resultado de un cambia conformacional en la proteina inducido por el bajo pH dentro
de Ia vesicula, aunque en algunos casos Ia actividad de fusion es estimulada directa-
mente por la union al . Los sucesos iniciales en la decapsidacion pueden ocu-
rrir dentro de los endosomas, siendo promovidos por el cambia de pH cuando el
endosoma se acidifica o directamente en el citoplasma. Se pueden utilizar ion6foros
como Ia monesina o Ia nigericina o cationes como Ia cloroquina y el cloruro amonico
para bloquear Ia acidificacion de estas vesiculas y para detenninar si los sucesos se
producen despues de la acidificacion de los endosomas (por ej., Ia fusion de membra-
Principios de virologfa molecular
Virion infective
Particulas <<A»/cubiertas vacias
(1508)
0f' 00
.. /
~
J 1 lnvaginaci6n recubie:L_Parti
ARN liberado al citoplasma
a !raves del canal
~~m~,.~~'1~1"'-0 ~ ~
Figura 4.13 Penetraci6n celular y decapsidaci6n de poliovirus.
Replicaci6n
Adhesion
y penetraci6n __.---=-----------------------..
Nucleo
I
0--
Expresi6n
inmediata precoz
(a)
__.. 0 --..
Replicaci6n
---+-
- 0
- - - - • Liberaci6n
Ensam blaje
Expresi6n
'' '~ Expresi6n
\ precoz (13) \
(latencia)
tardfa (y)
Figura 4.14 Representaci6n esquematica del patron de replicaci6n de los virus de !a clase I. Los
detalles sobre los sucesos que acontecen a los genomas de cada tipo se explican en el texto.
Principios de virologfa molecu lar
Expresi6n de
protefnas NS
Q •
- -----f--- j\
Q a ----t----
I
Expresi6n de
protefnas CAP
0 Ensamblaje/maduraci6n
Liberaci6n
0
Figura 4.15 Representaci6n esquematica del patron de replicaci6n de los virus de la clase II.
Replicaci6n
Endosoma
Proteolisis
G Endo/lisosomas
p ..
enetrac1on
Nticleo
@ . .
Endoc1tos1s
-
Transcripci6n
secundarla
0
~
'\_
""'
Ao
V
Partfcula
«core»
Trans-
cr~pci6_n
/
___---- / pnmana
Ens~m~laje
de caps1de
/ -esese--- '\_
___
"'
~
Sintesis de
- - - 2icula (g cadena (-)
replicasa (+)
Liberaci6n
Figura 4.16 Representacion esquematica del patron de replicacion de los virus de Ia clase III.
segmentados (orden Mononegavirales) (Figura 4.18), para los que el primer paso
en la replicaci6n es la transcripci6n del genoma de ARN (-) por la ARN polimerasa
ARN-dependiente virica para producir ARNm monocistr6nicos, que tambien sir-
Adhesion
y penetraci6n ,
O
decapsidaci6n Nticleo
o --
\ ---+-
Expresi6n
&--
nsamblaje,
maduraci6n
0 ---+-
0
\Ropli~ci6o
---+-
;:,,oopor proteasa
Figura 4.17 Representacion esquematica del patron de replicacion de los virus de Ia clase IV.
Principios de virologia molecular
Adhesion
0
y penetraci6n lntermediario Nucleo
Decapsidaci6n replicativo (+)
Ensamblaje/
maduraci6n
Expresi6n
0
Liberaci6n
Protefnas
Figura 4.18 Representaci6n esquematica del patron de replicaci6n de los virus de ]a clase V.
ven como moldes para la posterior replicaci6n del genoma. (Nota: algunos de estos
virus tienen ademas organizaci6n en ambos sentidos («ambisense»). (b) Genomas
segmentados ( Orthomyxoviridae ), que llevan a cabo Ia replicaci6n en el nucleo,
con ARNm monocistr6nicos para cada uno de los genes virales producidos por la
transcriptasa virica a partir del genoma virico completo (ver Capitulo 5).
• Clase VI: ARN de cadena sencilla de polaridad (+)con intermediario ADN (Figu-
ra 4.19). Los genomas de retrovirus son de ARN de polaridad (+) pero linicos en
que son diploides y no sirven directamente como ARNm, pero si como moldes para
Ia transcripci6n inversa a ADN (ver Capitulo 3).
• Clase VII: ADN de doble cadena con ARN intermediario (Figura 4.20). Este grupo
de virus tambien depende de Ia transcripci6n inversa, pero, a diferencia de los re-
h·ovirus (clase VI), este proceso ocune dentro de Ia particula virica durante su ma-
duraci6n. AI infectar una nueva celula, el primer suceso que ocune es la reparaci6n
del genoma bicatenario incompleto, seguido de la transcripci6n (ver Capitulo 3).
Ensamblaje
I MADURACI6N I
ADHES\6N
/®~ LIBERAC\6N
Union a\ receptor
Proteinas
regu\adoras
{~-~-1 ESIDAC\6N I
I REPLICACI6N
NUCLEO 0
D===f==U 0
0 0
0 0
0 0
IEXPRESI6N GENICAI
Figura 4.19 Representaci6n esquematica del patron de replicaci6n de los virus de la clase VI.
los de otras membranas en que tienen una difusi6n lateral limitada en la membrana, y
tambien pueden ser separados fisicamente por centrifugaci6n en gradiente de densidad en
presencia de algunos detergentes. Las bolsas lipidicas han sido implicadas en varias fun-
ciones celulares, como la clasificaci6n apical de proteinas y la transducci6n de sefiales,
pero tambien son utilizadas por virus como plataformas de entrada en las celulas (por ej.,
VIR, SV40 y rotavirus) y como lugares de ensamblaje, gernaci6n y liberaci6n de la mem-
brana celular (por ej., virus influenza, VIR, virus del sararnpi6n y rotavirus).
Como en las fases tempranas de la transcripci6n, no siempre es posible distingujr el
ensamblaje, la maduracion y la liberacion de las pmticulas viricas como etapas diferen-
ciadas y separadas. El sitio de ensamblaje tiene una profunda influencia en todos estos
procesos. En la mayoria de los casos las membranas celulares son empleadas para anclar
proteinas viricas, y este hecho inicia el proceso de ensamblaje. A pesar de los estudios
Principios de virolog fa molecular
Adhesion
y penetraci6n NtJcleo
Decapsidaci6n
"x ARN
Ensablaje Maduraci6n Liberaci6n
---
ADNccc
0 --t+-
~,=9
I Tr mversa
0
Figura 4.20 Representaci6n esquematica del patron de replicaci6n de los virus de Ia clase VII.
realizados, nose comprende bien como se lleva a cabo el control del ensamblaje viraL En
general, se piensa que al incrementarse los niveles intracelulares de proteinas viricas y de
moleculas de genomas se alcanza una concentracion critica y que esto desencadena el
proceso. Muchos virus alcanzan niveles elevados de componentes de nueva sintesis con-
centnindolos en compartimentos subcelulares, lo que resulta visible al microscopio opti-
co, y que se denominan cuerpos de inclusion . Estos son caracteristicos de las ultimas
etapas de la infeccion de celulas por muy diferentes virus. El tamafio y la localizacion de
cuerpos de inclusion en celulas infectadas es con frecuencia una caracteristica de ciertos
virus en particular; por ejemplo, la infeccion por el virus de la rabia provoca grandes
«corpusculos de Negri» perinucleares, observados por vez primera por Adelchi Negri en
1903. Altemativamente, las concentraciones locales de componentes estructurales viricos
pueden ser provocadas por interacciones laterales entre proteinas asociadas a membra-
nas. Este mecanismo es particularmente importante en los virus envueltos liberados de
la celula por gemacion (ver mas adelante).
Como se expuso en el Capitulo 2, la formacion de las particulas viricas puede ser un
proceso relativamente simple que es dirigido solo por interacciones entre las subunidades
de la capside y controlado por las leyes de la simetria. En otros casos, el ensamblaje es un
proceso muy complejo con multiples pasos, que implican no solamente a las proteinas
estructurales viricas sino tambien a proteinas «andamio» de codificacion virica y celular,
que acman como moldes para guiar el ensamblaje de los viriones. La encapsidacion del
genoma virico puede ocurrir bien precozmente durante el ensamblaje de la particula (por
ej., muchos virus con simetria helicoidal se forman alrededor del genoma) o en una etapa
tardia, cuando el genoma es introducido en una cubierta de proteina casi completada.
Maduraci6n
Glicoprote in as
%
Envuelta ----;.125, ·~ . ~
'!'.:"\ ~ Polimerasa
(]),. ~- 4)
Nucleocapside -----;-t.-
•
r:y. ,;"= ~
Genoma ~ • .i) Matriz
i MADURACION
(]>
~II~
:;;.-" 4)
::::: .:::::-
ry J' ~\f)
~ LIBERACION
~ ~
(?-
-
0,. \\ /f EJ
-::;:::.
~ .q)
hoopod,do" \ ;~ _ II
Proteina de 1
11 Genoma
" 'Proteina
matriz
Membrana celular
Figura 4.21 Liberaci6n de virus por gemaci6n. Este es el proceso por el que las particulas viricas
envueltas adquieren sus membranas y las proteinas asociadas.
Liberaci6n
RESUMEN
BIBLIOGRAFiA
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Schneider-Schaulies, J. (2000). Cellular receptors for viruses: links to tropism and
pathogenesis. Journal of General Virology, 81: 1413-1429. ·
CAPiTULO 5
EXPRESION
aprendizaje
Las celulas bacterianas ocupan un segundo Iugar despues de los virus en la especi-
ficidad y la economia de sus mecanismos de control geneticos, y posiblemente el pri-
mer lugar en lo que se refiere a la intensidad con que estos mecanismos han sido estu-
diados. EI control genetico se ejerce tanto a nivel de la transcripci6n como en los
estadios posteriores (post-transcripcionales) de la expresi6n genica.
La iniciaci6n de la transcripci6n es regulada primariamente de una forma negativa
mediante la sintesis de proteinas represoras que actuan en trans , que se fijan a las
secuencias del operador situadas por delante de las que codifican la proteina. Conjun-
tos de genes relacionados metab6licamente son agrupados y regulados de forma coor-
dinada, constituyendo «operones». La transcripci6n de estos operones tfpicamente pro-
duce un ARNm policistr6nico que codifica varias proteinas diferentes. Durantes etapas
posteriores de expresi6n, la transcripci6n tambien se regula mediante un numero de
mecanismos que acruan, como en la famosa frase de Mark Ptashne, como «interrupto-
res geneticos», encendiendo o apagando la transcripci6n de los distintos genes. Tales
mecanismos incluyen la antiterminaci6n, que es controlada por factores que acruan en
trans, que promueven la sintesis de transcritos mas largos que codifican informacion
genetica adicional, y por varias modificaciones de la ARN polimerasa. Factores cr
(sigma) bacterianos son apoproteinas que afectan a la especificidad de la holoenzima
Expresi6n
ARN polimerasa por diferentes promotores . Varios bacteriOfagos (por ej., el fago
SPOl de Bacillus subtilis) codifican proteinas que funcionan como factores cr alterna-
tives, secuestrando la ARN polimerasa y alterando la proporci6n de genes fagicos que
son transcritos. El fago T4 de Escherichia coli codifica una enzima portadora de una
modificaci6n covalente (ribosilaci6n de difosfato de adenosina [ADP]) de la ARN
polimerasa de la celula hospedadora. Se cree que esto es para eliminar la necesidad de
la holoenzima polimerasa por el factor cry para lograr un efecto similar al de la produc-
ci6n de factores cr modificados por otros bacteri6fagos.
A nivel post-transcripcional, la expresi6n genica en bacterias se regula tambien
mediante el control de la traducci6n. El ejemplo mejor conocido entre los virus de este
fen6meno procede del estudio de los bacteri6fagos de la familia Leviviridae, como
R17, MS2 y Q~. En estos fagos, la estructura secundaria del ARN de simple cadena
que constituye el genoma fagico regula, no solo las cantidades de las diferentes protei-
nas del fago que se traducen, sino que tambien opera como un control temporal del
interrupter que regula las proporciones entre las distintas proteinas producidas en las
celulas infectadas.
El genoma del fago A ha sido estudiado en gran detalle e ilustra varios de los meca-
nismos comentados anteriormente, incluyendo la acci6n de proteinas represoras en la
regulaci6n de la lisogenia versus la replicaci6n litica, y la antiterminaci6n de la trans-
cripci6n por factores que actuan en trans codificados por el fago. Ha sido tal el impacto
de estos descubrimientos que no se puede considerar completa una discusi6n sobre el
control de la expresi6n genica en los virus sin un examen detallado de este fago.
El fago A fue descubierto por Esther Lederberg en 1949. Los experimentos realiza-
dos por Andre Lwoff en 1950 en el Institute Pasteur demostraron que cuando se irra-
diaban con luz ultravioleta algunas cepas de Bacillus megaterium dejaban de crecer y
posteriormente se !isaban, liberando una cosecha de particulas fagicas. Junto con
Francois Jacob y Jacques Monad, Lwoff demostr6 posteriormente que las celulas de
algunas cepas bacterianas contenian un bacteri6fago en forma latente, conocido como
profago, y que se podia conseguir que el fago altemase entre ciclos de replicaci6n
lisogenicos (no productivos) y liticos (productivos).
Tras muchos afios de estudio, nuestro conocimiento sabre A se ha depurado y se ha
convertido en un ejemplo de uno de los sistemas de control geneticos mejor compren-
didos y mas elegantes que nunca se hayan investigado. En la Figura 5.1 se muestra un
mapa genetico simplificado de A. Para la regulaci6n del ciclo replicative del fago se
pueden ignorar los genes estructurales que codifican los componentes de la cabeza y
de la cola de la capside virica. Los componentes pertinentes implicados en el control
genetico son los siguientes :
1. PL es el promotor responsable de la transcripci6n dellado izquierdo del genoma de
A, que incluye N y cl/1.
Principios de virologfa molecular
,
,,
ell/ I
pla
N I cl I
FP. ~ro ell
I
nut
ol o.
Figura 5.1 Mapa genetico simplificado del bacteri6fago /....
Expresi6n gemica
inmediata precoz
Expresi6n genica
precoz tardia
Establecimiento lnfecci6n
de lisogenia litica
Bloqueo de Ia
transcripci6n PLy PR estan activos
desde PLYPR
Figura 5.2 Control de Ia expresi6n del genoma del bacteri6fago /.... V ease el texto para una descripci6n
detallada de los sucesos que ocurren en una celula recien infectada y durante Ia infecci6n litica o Jisogenica.
son capaces de superar esta restricci6n y permiten la transcripci6n completa desde PLy
PR. El complej o ARN polimerasa-proteina Q s6lo permite la transcripci6n completa
desde PR. Conforme los niveles de las proteinas ell y de ciii se acumulan en la celula,
la transcripci6n del gen represor cJ se pone en marcha desde su propio promotor.
Principios de virologia molecu lar
Sintesis de proteina
represora de cl
La inhibici6n de Ia
transcripci6n desde
PLy PR causa lisogenia
A alias concentraciones
Ia proteina represora
de cl se une a los seis
sitios operadores,
inhibiendo su propia
transcripci6n
Figura 5.3 Control de la lisogenia en bacteri6fago /... Vease el texto para mas detalles.
Expresi6n
Si esto es asi, (,Como abandonan estas celulas este estado y entran en un ciclo
rep licativo Htico productivo? El estres fisiologico y especialmente la irradiacion ultra-
violeta de las celulas provoca !a induccion de una proteina celular, RecA. Esta protei-
na, cuya funcion normal es inducir la expresion de genes celulares y permitir a la
celula adaptarse y sobrevivir en condiciones ambientales alteradas, escinde la proteina
represora cl. Por si solo, esto no seria suficiente para prevenir ala celula de reentrar en
el estado lisogenico; sin embargo, cuando Ia proteina represora no esta unida a OR, cro
es transcrito por PR. Cro tambien se une a OR, pero a diferencia de cl, que se une
preferentemente a! extremo derecho de OR, la proteina Cro lo hace preferentemente a!
extremo izquierdo de OR, previniendo la transcripcion de ci e incrementando su propia
transcripcion en un bucle de retroalimentacion positiva. Por tanto, el fago queda ence-
rrado en un ciclo litico y no puede retornar al estado de lisogenia.
Esta descripcion es una version muy simplificada del control genetico de la expre-
sion en fago A. Se conocen muchos detalles acerca de los mecanismos moleculares con
los que este sistema funciona , pero debido a que esta materia podria facilmente ocupar
un libro entero, no se dispone aqui del espacio suficiente para contarlo todo. Los deta-
lles moleculares del sistema A no solo son de particular interes, sino que tambien han
configurado nuestro entendimiento de la regulacion genetica en las celulas procariotas
y eucariotas . La resolucion de las estructuras de las proteinas involucradas en el es-
quema anterior nos ha permitido identificar los principios fundamentales tras la obser-
vacion de que muchas proteinas de organismos no relacionados pueden reconocer y
unirse a secuencias especificas en moleculas de ADN. Los conceptos de proteinas con
dominios independientes para unirse al ADN y de dimerizacion, de cooperacion entre
proteinas en Ia union al ADN, y la formacion de bucles de ADN que permiten a las
proteinas unirse a sitios distantes para interaccionar entre elias han smgido todos ellos
del estudio de A. Es importante leer las referencias bibliograficas que se citan al final
de este capitulo para entender completamente los matices de la expresion genica en
este complejo bacteri6fago, asi como para tener en cuenta el disefio y el funcionamien-
to de este sistema cuando se lean los ejemplos de la regulacion de la expresion genica
descritos en el resto del capitulo.
varias kilobases. Esto resalta la flexibilidad del ADN, que permite a las proteinas unirse
en sitios distantes para interaccionar unas con otras, como ya se vio anteriormente en las
interacciones proteina-proteina en la regulacion de la expresion genica del fago A.. La
transcripcion de los genes eucariotas resulta en !a produccion deARNm monocistronicos,
cada uno de los cuales se transcribe desde su propio promotor individual.
En el siguiente estadio, !a expresion genica es influenciada por la estructura del
ARNm producido. La estabilidad de los ARNm eucariotas varia considerablemente,
alcanzando algunos una larga vida media en la celula (es decir, varias horas). La vida
media de otros, tipicamente de los que codifican proteinas reguladoras, puede ser muy
breve (es decir, unos pocos minutos). La estabilidad de los ARNm eucariotas depende
de la velocidad en que son degradados. Esto viene determinado por factores como sus
secuencias terminales, que consisten en estructuras con una caperuza («cap») metilada
en el extrema 5' y acido poliadenflico en el extrema 3 ', asi como por el conjunto de su
estructura secundaria. Sin embargo, la expresion genica esta regulada tambien por fe-
nomenos de corte y empalme («splicing») diferenciales de ARNs heterogeneos nu-
cleares (AR~hn) precursores en el nucleo, que pueden alterar el significado genetico
de distintos ARNm transcritos desde un mismo gen. En las celulas eucariotas, el con-
troles ejercido tambien durante la exportacion del ARN desde el nucleo al citoplasma.
Finalmente, el proceso de traduccion ofrece mas oportunidades para el control de la
expresion. La eficacia con la que diferentes ARNm se traducen varia enormemente. Es-
tas diferencias resultan en gran parte de la eficacia con la que los ribosomas se unen a los
distintos ARNm y reconocen los codones AUG de inicio de la traduccion en diferentes
contextos de secuencias, asi como de la velocidad a la que distintas secuencias son con-
vertidas en proteinas. Algunas secuencias actlian como potenciadoras de la traduccion,
ejerciendo una funcion analoga a la de los potenciadores de la transcripcion.
El motivo de proporcionar esta extensa lista de mecanismos de expresion de los
genes eucariotas es que todos son utilizados por virus para controlar la expresion genica.
Ejemplos de cada tipo sedan en las secciones siguientes. Si esto parece extraordinario,
debe recordarse que el control de la expresion genica en las celulas eucariotas fue
desvelado en gran parte utilizando virus como sistemas modelo; por lo tanto, encontrar
ejemplos de estos mecanismos entre los viruses realmente asistir a una profecia cum-
plida.
Poliomavirus y papilomavirus
Los poliomavirus son intensamente dependientes de la maquinaria celular, tanto
para la replicacion como para la expresion genica. Los poliomavirus codifican factores
que actuan en trans (los antigenos T) que estimulan la transcripcion (y la replicacion
del genoma). Los papilomavirus en particular dependen de la celula para su replica-
cion, que solo ocurre en queratinocitos diferenciados terminalmente y no en otros tipos
celulares, aunque codifican varias proteinas reguladoras en trans (Capitulo 7).
Adenovirus
Los adenovirus tambien dependen estrechamente del aparato celular para su trans-
cripcion, pero poseen varios mecanismos que regulan especificamente la expresion genica.
Estos incluyen activadores de la transcripcion que actuan en trans como la proteina
EIA, y la regulacion post-transcripcional de la expresion, que es lograda mediante corte
y empalme de los ARNm y de los ARNs VA codificados por los virus (Capitulo 7). La
infeccion por adenovirus de las celulas se divide en dos etapas, precoz y tardia, comen-
zando esta ultima en el momento en que se produce la replicacion del genoma; no obs-
tante, estas fases estan menos diferenciadas en los adenovirus que en los herpesvirus.
Herpesvirus
Estos virus son menos dependientes de las enzimas celulares que los de los grupos
anteriores. Codifican muchas enzimas implicadas en elmetabolismo del ADN (por ej .,
timidina kinasa) y varios factores de actuacion en trans que regulan la expresion tem-
poral de los genes virales, controlando las fases de la infeccion. La transcripcion del
genoma complejo se regula esencialmente en un modo en cascada (Figura 5.4). Tras la
transcripcion del genoma por la polimerasa II celular se producen almenos 50 protei-
nas de codificacion virica. Se sintetizan tres clases distintas de ARNm:
• a: ARNm precoces inmediatos que codifican cinco reguladores de la transcripcion
virica que acman en trans.
• ~: ARNm precoces (retrasados) que codifican mas proteinas reguladoras no estruc-
turales y algunas proteinas estructurales menores.
• y: ARNm tardios que codifican las principales proteinas estructurales.
Expresi6n
genes fl
Auto-regulaci6n de Ia
expresi6n de genes a
8
Figura 5.4 Control de la expresi6n del genoma de herpesvims. Las particulas de herpesvirus contie-
nen una proteina Hamada factor de iniciaci6n de la transcripci6n del gena (a-FIT) que estimula Ia
expresi6n del gen a en las celulas recien infectadas, iniciando una cascada de sucesos estrechamente
regulados que controlan la expresi6n de Ia dotaci6n completa de unos 70 genes del genoma viral.
Poxvirus
La replicacion del genoma y la expresion de los genes en los poxvirus es casi inde-
pendiente de los mecanismos celulares (excepto para el requerimiento de ribosomas
Principios de virologia molecular
Los parvovirus, tanto los aut6nomos como los dependientes de un virus auxiliar, son
muy dependientes de asistencia extema para su expresi6n genica y para la replicaci6n
del genoma. Esto probablemente sea por el tamafio tan pequefio de sus genomas, que no
les pennite codificar el aparato bioquimico necesario; asi, parecen baber desarrollado
una forma extrema de parasitismo, utilizando las funciones normales presentes en el
nucleo de sus celulas hospedadoras, tanto para la expresi6n como para la replicaci6n
(Figura 5.5). Los miembros del genera Dependovirus, defectivo en replicaci6n, de Ia
familia Parvoviridae son totalmente dependientes de la superinfeccion con adenovims
o herpesvims para Ia provision de funciones auxiliares esenciales para la replicaci6n.
Los genes de adenovirus requeridos como auxiliares son los genes reguladores de Ia
transcripci6n como E l A, mas que los genes estructurales tardios, pero se ha demostrado
que el tratamiento con luz ultravioleta, cicloheximida o algunos carcin6genos pueden
reemplazar el requerimiento de virus auxiliares. Por lo tanto, la ayuda requerida parece
ser una modificaci6n del ambiente celular (probablemente afectando a Ia transcripci6n
del genoma defectivo del parvovims) mas que una proteina virica especffica.
Los Geminiviridae tambien corresponden a esta clase de estructura gen6mica (Fi-
gura 3.15). La expresi6n de sus genomas es bastante diferente de lade los parvovirus,
pero no obstante, tambien depende estrechamente de funciones celulares. Existen mar-
Expresi6n
1
2 - - - - . . . . / ' - - -- - -
3
Dependovirus
4
5
6
1 ------------
23---
- --
- --
-----------
4~
Virusaut6nomos 5 ~
6 ---------------
7 --------------
8 ---------------
9---------------
Palindrome
terminal
Of-r:::::===r-c=:=:::t--0
- I. 1
Palindrome
terminal
REP CAP
0 2 3 4 5
kb
Figura 5.5 La transcripci6n de los genomas de parvovirus depende en gran medida de factores de Ia
celula hospedadora y da como resultado Ia sintesis de ARNm subgen6micos, generados por cortes y
empalmes, que codifican dos proteinas: Rep, que esta implicada en Ia replicaci6n del genoma, y Cap, Ia
proteina de [a capside (vease el texto).
cos de lectura abierta en ambas orientaciones en el ADN virico, lo que significa que
tanto las cadenas de sentido (+)como(- ) se transcriben durante la infecci6n. Los me-
canismos implicados en el control de la expresi6n genica no han sido completamente
investigados, pero al menos algunos geminivirus (subgrupo I) pueden utilizar el proce-
so de corte y empalme (splicing).
Todos los virus con genomas de ARN de doble cadena se diferencian claramente de
sus hospedadores, los cuales por supuesto poseen genomas de ADN de doble cadena;
por lo tanto, aunque cada virus tiene que ser bioquimicamente «compatible» con su
celula hospedadora, existen diferencias fundamentales entre los mecanismos de expre-
si6n genica del virus y los de la celula hospedadora. Los reovirus tienen genomas
multipartidos (ver Capitulo 3) y replican en el citoplasma de Ia celula infectada. Es
Principios de virologia molecular
caracteristico de los virus con genomas ARN monocistr6nico que se produzca un ARNm
monocistr6nico por cada segmento gen6mico (Figura 5.6).
Tras la infecci6n se produce temprano la transcripci6n de los segmentos gen6micos
de ARNbc por la actividad de la transcriptasa especifica del virus en el interior de las
particulas subvirales parcialmente decapsidadas. AI menos cinco actividades enzimati-
cas estan presentes en las particulas de reovirus para llevar a cabo este proceso, aunque
no dependen necesariamente de peptidos separados (Tabla 5.2, Figura 2.12). Esta trans-
cripci6n primaria genera transcritos con cap que no estan poliadenilados, que dejan el
I TRANSCRIPCION PRIMARIA
c§>--
@-
@-- Liberaci6n de ARNm precoces
con cap en 5'
@)--
@- j
..._ Replicaci6n del genoma - - - - - - - - 1
TRANSCRIPCION SECUNDARIA
Liberaci6n
de ARNm tardios
j
Proteinas estructurales I
Figura 5.6 La expresi6n de los genomas de reovirus es iniciada por una enzima transcriptasa empa-
quetada dentro de cada particula virica. Posterionnente se producen sucesos estrechamente regulados,
dependiendo Ia expresi6n de los ARNm tardios, que codifican las proteinas estructurales de Ia replica-
cion previa del genoma.
Expresi6n
core viral para ser traducidos en el citoplasma. Los distintos segmentos genomicos son
transcritos/traducidos con diferentes frecuencias, lo que quiza constituye la principal
ventaja de un genoma segmentado. El ARN es transcrito de forma conservadora; es
decir, solo se emplean las cadenas de polaridad (- ), resultando en la sintesis de ARNm
de sentido (+), a los que se afiade la caperuza dentro del core (todo esto sucede sin
sintesis de novo de proteinas). La transcripcion secundaria ocurre mas tardiamente
durante la infeccion en el interior de partfculas producidas en las celulas infectadas y
genera transcritos que no tienen caperuza ni estan poliadenilados. El genoma se repli-
ca en forma conservadora (comparable ala replicacion de ADN semi-conservadora).
Se producen cadenas de sentido (+) en exceso que sirven como ARNm tardios y como
moldes para la sintesis de cadenas de sentido (- ) (es decir, de cada cadena se producen
muchas cadenas (+), no una de cada una como en una replicacion semiconservadora).
Este tipo de genoma se encuentra en muchos virus anima les y de plantas (Apendi-
ce 2). Tanto en lo que se refiere al numero de familias de virus diferentes como al
numero de virus individuales, esta es la clase de genoma viral mas abundante. Funda-
mentalmente, estos genomas viricos acman como ARNs mensajeros y ellos mismos
son traducidos inmediatamente tras la infeccion de la celula hospedadora (Capitulo 3).
No es sorprendente que con tantos miembros, esta clase de genomas viricos muestre
una diversidad muy amplia de estrategias para controlar la expresion genica y la repli-
cacion del genoma; no obstante, en term inos muy generales, los virus en esta clase
pueden subdividirse en los dos grupos siguientes :
1. Produccion de una poliproteina comprendiendo la totalidad de la informacion ge-
netica del virus, que posteriormente es digerida por proteasas para producir precur-
sores y polipeptidos maduros: estas digestiones pueden ser una forma sutil de regu-
lar la expresion de la informacion genetica. Digestiones alternativas dan como
resultado la produccion de varias proteinas con propiedades diferentes a partir de
un mismo precursor (por ej ., en picornavirus y potivirus) (Figura 5.7). Algunos
virus de plantas con genomas multipartidos utilizan una estrategia muy similar para
Principios de virologia molecular
PICORNAVIRUS
AUG UAG
VPgs~ l A'I-1-B---.-1C
D-jl-r~ I J' poli(A)
O,....I.,.,----,-R-Pdr-P-R0--.1_ _P_O_L----1~
- --,--1-D---.-IP_R_
Productos de traducci6n
~
' 1 - - - - - - - , - : Poliproteina --,.'_ _ _ _ _ _.,
' '
: :-P1---:-P2-, P3---
[iJI 1ABCD II 2ABC lABCD
105K
+
I 9sK ~~
5~
148K ~;qr~~
1
.l7K 23K 58K 4K 24K 87K 58K 4K24K
87 K
J~
Digestiones
alternativas
Los genomas de los virus ARN de sentido positivo son traducidos frecuentemente para
formar una poliproteina, que posteriom1ente es digerida por una proteasa codificada por el virus para
formar los polipeptidos maduros.
NsP3 NsP4
I I
c~ "'
Q)
~~ F._1_5_o_ _.
-Q:::J
·u t5
u :::J
:::J ~
-o<;;
~ Q)
~ 0
Q) c
"Ocn
5' t Traducci6n par lectura a !raves del genoma
CAP r-----~------~------------~------, 3'
1
"'Q)
uu ARN
c 0
ou ' - - - - - r - -- - -- - . . - -- -- - - - . . J poli(A) gen6mico (+)
~
Q)
~c.
., en
J
Traducci6n
p230
E"'
·c .~
(LQ) Transcripci6n
e
-9;
1Procesamiento proteolitico 1
_i NsP3
c:::=J c:::=J c:::=J ---
3' 5' ARN(- )
I I complementario
S, Replicaci6n
~ Transcripci6n
ARN (+)
CAP I gen6mico
5' 3'
CAP 1 lpoli(A)
ARNm (+)
subgen6mico
[:=J '---,....------'
Procesamiento
proteolitico
DD
Figura 5.8 Algunos genomas viricos de polaridad positiva (por ej., los togavirus) se expresan en dos
rondas separadas de traduce ion, requiriendo Ia producci6n de un ARNm subgen6mico en una fase pos-
terior de Ia replicaci6n.
3', - - - - - - - - - - -- - - -- - - - , 5'
I I (ARN de entrada)
~ Traducci6n Nuevas
proteinas
Transcripci6n w~r;;:~:~ / virales
del ARN de entrada ARNm
~ Replicaci6n
Transcripci6n secundaria
/
del ARN progenie
5' ----------------------------~ 3'
\__5
( :.: l l
Viriones
:~: '~'"'"'
Figura 5.9 Esquema general de la expresi6n de genomas viricos de ARN de polaridad negativa.
Expresi6n
Los retrovirus son quiza los ultimos casos de dependencia de la maquinaria trans-
cripcional celular. El genoma de ARN constituye un molde para la transcripci6n
inversa a ADN; estos son los l'micos virus con ARN de polaridad (+) cuyo genoma no
funciona como ARNm tras penetrar en la celula hospedadora (Capitulo 3). Una vez
integrado en el genoma de la celula, el provirus de ADN esta bajo el control de la
celula hospedadora, y se transcribe exactamente igual que otros genes celulares. Al-
gunos retrovirus, sin embargo, han desarrollado un numero de mecanismos trans-
cripcionales y post-transcripcionales que les permite controlar la expresi6n de su
informacion genetica, y esto se comenta con mayor detalle mas adelante en este ca-
pitulo.
Uder NP P/C M F HN L
5'
Frecuencia
de transcripci6n
Direcci6n
de transcripci6n
Figura 5.10 Los genomas de paramixovirus muestran «polaridad transcripcional». Los transcritos de
los genes situados en el extrema 3' del genoma son mas abundantes que los de los genes pr6ximos a!
extrema 5 ', permitiendo Ia regulaci6n de las concentraciones relativas de proteinas estructurales (genes
3 ') y no estructurales (genes 5 ') producidas.
Principios de virologia molecular
La expresion de los genomas de estos virus 'es compleja y relativamente poco com-
prendida. Los hepadnavirus contienen distintas pautas de lectura abiertas solapadas,
claramente disefiadas para comprimir la mayor cantidad de informacion posible en un
genoma compacta. El gen X codifica un trans-activador transcripcional que se cree
analogo a la proteina tax del virus de la leucemia humana de celulas T (VLTH). Al
menos se producen dos ARNm de promotores independientes, cada uno de los cuales
codifica varias proteinas y el mayor tambien sirve como molde para la transcripcion
inversa durante la forrnacion de la particula virica (Capitulo 3). La expresion de los
genomas de caulimovirus es igualmente compleja, aunque hay similitudes con los
hepadnavirus en que se producen dos transcritos principales, 35S y 19S. Cada uno de
ellos codifica varios polipeptidos, y el transcrito de 35S es el molde para la transcrip-
cion inversa durante la fonnacion del genoma viral.
Habiendose revisado las estrategias generales utilizadas por los distintos grupos de
vims para regular la expresion genica, el resto de este capitulo se dedicara a dar expli-
caciones mas detalladas sobre ejemplos especificos de algunos vims mencionados an-
teriormente, comenzando por el control de la transcripcion en SV40, un miembro de la
familia Polyomaviridae. Pocos as, viricos o celulares, han sido estudiados con
tanto detalle como SV40, que ha constituido un paradigma para el estudio de los meca-
nismos de transcripcion eucarioticos (especialmente la replicacion del ADN; ver Ca-
pitulo 6) durante muchos afios. En este sentido, SV40 proporciona un equivalente a
nivel eucariota del genoma del bacteri6fago 'A. Existen sistemas in vitro tanto para la
transcripcion como para la replicacion del genoma de SV40, y se cree que se conocen
todas las proteinas viricas y celulares de union al ADN implicadas en ambos procesos.
El genoma de SV40 codifica dos antigenos T («antigenos tumorales») conocidos como
antigeno T mayor y antigeno T menor, de acuerdo con los tamafios de las proteinas
(Figura 5.11). La replicacion del genoma de ADN de doble cadena de SV40 ocurre en
el nucleo de la celula hospedadora. La transcripcion del genoma es llevada a cabo por
la ARN polimerasa II celular, y el antigeno T mayor juega un papel crucial regulando
la transcripcion del genoma viral. El antigeno T menor no es esencial para la replica-
cion viral, pero perrnite que el ADN virico se acumule en el nucleo. Ambas proteinas
contienen «sefiales de localizacion nuclear», de lo que resulta su acumulacion en el
nucleo, adonde migran tras ser sintetizadas en el citoplasma.
Poco despues de la infeccion de las celulas perrnisivas, los ARNm precoces se
expresan desde el precoz, que contiene un fuerte c de
la transcripcion (repeticiones de secuencias de 72 pb), permitiendole ser activo en
celulas recien infectadas (Figura 5.12). Las proteinas precoces sintetizadas son los dos
antigenos T. Conforrne el antigeno T mayor se acumula en el nucleo, la transcripcion
de los genes precoces es reprimida por la union directa de la proteina a la region de
Expresi6n
Repeticiones de 21 pb
(sitios de union a SP1)
~'
;\'-,
'SPh
SPl
este sistema con la descripcion proporcionada antes del control de la expresion genica
del bacteri6fago A.
Otra area en la que el control de la transctipcion viral ha recibido mucha atencion
es en lade los retrovirus humanos, el virus de la leucemia de celulas T humanas (VLTH)
(«human T-cellleukaemia virus», HTLV en ingles) y el virus de la inmunodeficiencia
humana (VIH). El ADN integrado de los provirus se forma por la transcripcion inver-
sa del ARN genomico de los retrovirus, como se describe en el Capitulo 3. La presen-
cia de numerosos sitios de union para factores de transcripcion celulares en las repeti-
ciones terminales largas («long terminal repeats», LTRs) de estos virus ha sido analizada
por anilisis de huellas o «footprinting» con ADNasa I o por ensayos de cambio de
movilidad electroforetica («gel shift assays») (Figura 5.13). Juntos, estos elementos
«distales» (tales como los sitios de union de NF-KB y SPl) y los elementos «proxima-
les» (tal como la caja TATA) constituyen un promotor funcional de la transcripcion en
la region U3 del LTR (Capitulo 3). Sin embargo, la actividad basal de estos promotores
por si misma es relativamente debil y solo resulta en una transcripcion limitada del genoma
del provirus por la ARN polimerasa II. Ambos VLTH y VIH codifican proteinas que son
reguladores positivos de la transcripcion que actuan en trans : la proteina Tax de VLTH
y la proteina Tat de VIH (Figura 5.14). Estas proteinas incrementan la transcripcion des-
de el LTR viral al menos en 50 a 100 veces el nivel basal con el promotor «no ayudado».
A diferencia del antigeno T y del promotor precoz de SV40, ni la proteina Tax ni la
proteina Tat (que no tienen similitud estructural una con otra) se unen directamente a su
respectivo LTR. Estudios recientes han ilustrado como acman estas proteinas.
Figura 5.13 Factores de transcripcion celulares que interaccionan con LTRs de retrovims. Estas pro-
teinas de union a ADN participan en Ia regulacion de los niveles de transcripcion basales y trans-
activados desde el promotor en Ia region U3 del LTR.
Expresi6n
taxO CJ
rex • O Codifican:
ARNm: - - - - - - - - - - -- - gag, pro, pol
- - - - - - - - - env
tax/rex
•
5' LTR 3' LTR
V IH
pro pol vpr rev
I I 100 env
gag
c=::J •oovpu
vif tat
D Codifican:
rev
ARNm: gag, pro, pol
env
J Proteinas
reguladoras
0 2 3 4 5 6 7 8 9 10
(kb)
La proteina Tat de VIH se une a una estructura en horquilla en el extrema 5' de los
ARNm transcritos desde el LTR, conocida como elemento de respuesta a la trans-
activaci6n («trans-activation response -TAR- element»). Varias proteinas celulares tam-
bien se unen a TAR, aunque el modo en que interaccionan con Tat no se ha definido
claramente. Tat es el primer ejemplo documentado de la regulaci6n de la expresi6n de
genes virales mediante el control de la elongaci6n por laARN polimerasa II. En ausen-
cia de Tat, la iniciaci6n desde el LTR es efectiva, pero la transcripci6n esta dificultada
porque el promotor forma un complejo polimerasa pobremente procesable, que se des-
prende del molde de ADN prematuramente. En presencia de Tat unida a TAR, se forma
un complejo de iniciaci6n de la transcripci6n diferente, que es competente para com-
pletar la transcripci6n del genoma de VIH.
Las proteinas Tax de VLTH y Tat de VIH son reguladores positivos del promotor
basal en el LTR del •irus y estan bajo el control del virus, pues la sintesis de estas
proteinas depende de los promotores que ellas mismas activan (Figura 5.15). Por si
CITOPLASMA
..
NUCLEO
,-------- ---------
'
Proteinas reguladoras 0 ?
gag, pro, pol, ARNm
ARN
~ .~
'-- tax/tax rex/rev . ____ __ 0 __ ,.~ / iTraducci6n J
Proteinas
estructurales
de los cuales se expresa desde su propio promotor, hacienda de ese modo innecesario
realizar mecanismos de splicing para producir el repe1iorio necesario de proteinas.
Uno de los ejemplos mejor estudiados del fen6meno de corte y empalme o ajuste
(splicing) de ARNm viricos es la expresi6n del genoma de los adenovirus (Figura
5 .16). Varias «familias» de genes de adenovirus se expresan mediante cortes y empal-
mes diferenciales de transcritos precursores de ARNhn . Esto es pmiiculannente cierto
para los genes precoces que codifican proteinas reguladoras que actuan en trans in-
mediatamente despues de la infecci6n. Las primeras proteinas en ser expresadas, E1A
y E1B, son codificadas por una unidad transcripcional en el extrema izquierdo de la
cadena derecha del genoma de adenovirus (Figura 5.16). Estas proteinas son primaria-
mente proteinas trans-reguladoras comparables a las proteinas Tax y Tat antes descri-
tas, pero estan tambien involucradas en la transformacion de las celulas infectadas
por adenovirus (Capitulo 6). Se producen mediante splicing cinco ARNm poliadenilados
(13S, 12S, liS, lOS, 9S) que codifican cinco polipeptidos relacionados con E1A (que
contienen 289, 243, 217, 171 y 55 aminoacidos, respectivamente) (Figura 5.1 7). Todas
estas proteinas se traducen desde el mismo marco abierto de lectura y tienen los mis-
mos extremos amino y carboxi-terminal. Las diferencias entre elias son una conse-
cuencia del splicing diferencial de la unidad transcripcional EIA y causa importantes
diferencias en sus funciones . Los peptidos de 289 y de 243 aminoacidos son activadores
transcripcionales. Aunque estas proteinas activan la transcripci6n desde todos los pro-
motores precoces de adenovirus, se ha descubierto que tambien parecen ser «promis-
cuos», activando la mayoria de los promotores que responden ala ARN polimerasa II
-- ----....
~
LS
~ L4
--..
E: -J
-]
-ill-
-
E4
E2A
-- E2B
Figura 5.16 Transcripci6n del genoma de adenovirus. La flechas indican Ia posicion de los exones en
el genoma virico, que se unen por cortes y empalmes (<<Splicing») para producir familias de proteinas
viricas.
Expresi6n
125
139
I~ I 104
poli(A)
A ~~
87 104
115 poli{A)
104
105 poli{A)
95 poli(A)
Figura 5.17 Expresi6n de las proteinas de adenovirus ElA. Las cifras encima de cada recuadro son
los numeros de aminoacidos codificados por cada ex6n.
y que contienen una caja TATA. No existen secuencias comunes obvias en todos estos
promotores, y no hay evidencia de que las proteinas ElA se unan directamente al ADN.
Las proteinas E1A de distintos serotipos de adenovirus contienen tres dominios con-
servados: CR1, CR2 y CR3. Las proteinas ElA interaccionan con muchas otras protei-
nas celulares, primeramente a traves de su union a los tres dominios conservados. ElA
puede tanto activar como reprimir la transcripcion mediante la union de sus compo-
nentes a la maquinaria basal de transcripcion; activando proteinas que se unen a un
promotor corriente arriba y secuencias potenciadoras y proteinas reguladoras que con-
trolan la actividad de factores de union al ADN.
La sintesis de E1A inicia una cascada de activacion transcripcional poniendo en
marcha la transcripcion de otros genes precoces de adenovirus: E1B, E2, E3 y E4
(Figura 5.16). Despues de que el genoma virico se haya replicado, esta cascada even-
tualmente termina con la transcripcion de los genes tardios que codifican las proteinas
estructurales. La transcripcion misma de E1A es un proceso balanceado y autorregulado.
Los genes precoces imnediatos de virus ADN tien~n caracteristicamente fuertes ele-
mentos potenciadores por delante de sus promotores. Esto es porque en una celula
recientemente infectada no existen proteinas viricas y el potenciador se requiere para
estimular la expresion del genoma virico. Las proteinas precoces-inmediatas sintetiza-
das son activadores de la transcripcion que ponen en marcha la expresion de otros
genes viricos, y ElA funciona exactamente en esta direccion; sin embargo, aunque
E1A trans-activa a su propio promotor, la proteina reprime la funcion de su elemento
potenciador corriente arriba, de modo que, a altas concentraciones, tambien regula
negativamente su propia expresion (Figura 5 .18).
Principios de virologia molecular
--+
E2
--+
E4
E1 B E3
--+
E2
--+
E4
la expresion diferencial del genoma virico pero, por lo que se sabe, no alteran sustan-
cialmente la expresion de los ARNm celulares. Parece que ambas proteinas funcionan
de un modo muy similar y, aunque no estan relacionadas una con otra en lo que se
refiere a sus secuencias de aminoacidos, se ha demostrado que la proteina Rex de
VLTH es capaz de ser sustituida funcionalmente por la proteina Rev de VIH. Las se-
cuencias reguladoras negativas en los genomas de VLTH y de VIH causan la retencion
de los ARNm en el nucleo de la celula infectada. Estas secuencias se localizan en las
regiones de los intrones eliminados de los ARNm resultantes por cortes y empalmes y
que codificanlas proteinas Tax/Tat y Rex/Rev (Figura 5.14); por lo tanto, estas protei-
nas se expresan inmediatamente despues de la infeccion. Tax y Tat estimulan la trans-
cripcion potenciada desde el LTR del virus (Figura 5 .15); no obstante, los productos de
los ARNm que codifican los genes gag, poly env no sujetos a splicing o sometidos a
un splicing parcial solo se expresan en la celula cuando existe suficiente proteina Rex/
Rev. Ambas proteinas se unen a una region con estructura secundaria formada por una
secuencia particular en el ARNm y se encuentran entre el nucleo y el citoplasma ya que
contienen tanto una se:fial de localizacion nuclear como una se:fial de exportacion nu-
clear, aumentando la exportacion del ARNm virico no sometido a splicing al citoplas-
ma, donde es traducido y actUa como el genoma virico durante la formacion de la
particula.
La eficiencia con la que se traducen los distintos ARNm varia considerablemente y
es determinada por diversos factores, incluyendo la estabilidad y la estructura secun-
daria del ARN, pero el principal factor parece ser la secuencia nucleotidica que rodea
al codon AUG de inicio de la traduccion que es reconocido en los ribosomas. La se-
cuencia mas favorable para la iniciacion es GCC(A/G)CCAUGGG, aunque puede ha-
ber variaciones considerables dentro de esta secuencia. Diversos virus utilizan varia-
ciones de esta secuencia para regular las cantidades de proteina sintetizada desde un
solo ARNm. Ejemplos de esto incluyen las proteinas Tax y Rex de VLTH, que son
codificadas por pautas abiertas de lectura solapadas en el mismo ARNm de 2,1 kb
doblemente cortado y empalmado (Figura 5.14). El codon AUG de inicio de la traduc-
cion para la proteina Rex esta corriente arriba del de Tax, pero ofrece un contexto
menos favorable para el inicio de la traduccion que el que ofrece la secuencia que
rodea al codon AUG de Tax. Esto se conoce como el mecanismo de «escaneado per-
meable» (leaky scanning), porque se cree que los ribosomas escanean el ARNm antes
de comenzar la traduccion. En consecuencia, la concentracion de proteina Rex en las
celulas infectadas por VLTH es considerablemente menor que la de proteina Tax, a
pesar de que ambas son codificadas por el mismo ARNm.
Los de picornavirus ilustran un mecanismo alternativo para controlar el
inicio de la traduccion. Aunque estos genomas son economicos geneticamente (es de-
cir, han descartado la mayoria de los elementos de control que actua c, y expre-
san su capacidad completa de codificacion como una sola poliproteina), han manteni-
do largas regiones no codificantes (RNCs) en sus extremos 5 ', que comprenden
aproximadamente el 10% del genoma completo. Estas secuencias estan implicadas en
la replicacion y posiblemente en el empaquetamiento del genoma virico. La traduccion
de la mayor parte de los ARNm celulares se inicia cuando los ribosomas reconocen el
Principios de virologfa molecular
extrema 5' del ARNm y analizan la secuencia nucleotidica hasta que llegan a un codon
AUG de iniciacion. Los genomas de picomavims no se traducen de esta forma. El
extrema 5' no tiene una estmctura en cap y por tanto no es reconocido por los riboso-
mas del mismo modo que otros ARNm, pero esta modificado por la adicion de la
proteina VPg (ver Capitulos 3 y 6). Existen tambien multiples codones AUG en el
extrema 5' no codificante por delante del inicio de las secuencias codificantes de la
poliproteina, que no son reconocidos por los ribosomas . En las celulas infectadas por
picornavims una proteasa virica digiere el «complejo de union a cap» de 220 kDa que
esta implicado en la union de la estmctura en cap m7G en el extrema 5' del ARNm
durante el inicio de la traduccion. La traduccion de ARNm de picomavims mutados
artificialmente in vitro y la constmccion de genomas bicistronicos de picomavims por-
tando sefiales 5' no codificantes en mitad de la poliproteina han conducido a! concepto
de «plataforma de aterrizaje» del ribosoma o «sitio intemo de union al ribosoma»
(«internal ribosomal entry site», IRES). En vez de escaneando a lo largo del ARN
desde el extrema 5 ', los ribosomas se unen al ARN a traves del IRES y comienza la
traduccion intemamente. Este es un metoda preciso para controlar la traduccion de las
proteinas viricas. Muy pocos ARNm celulares utilizan este mecanismo, pero se ha
demostrado que es empleado por diversos vims, incluidos los picomavims, el vims de
la hepatitis C, los coronavims y los flavivims.
Muchos vims pertenecientes a distintas familias comprimen su informacion geneti-
ca codificando diferentes polipeptidos en marcos de lectura abiertos superpuestos. El
problema con esta estrategia consiste en la descodificacion de la informacion. Si cada
polipeptido es expresado por un ARNm transcrito desde su propio promotor, las se-
cuencias que actuan en cis requeridas para controlar y coordinar la expresion pueden
anular cualquier ventaja genetica ganada. Lo que es mas importante, existe el proble-
ma de regular coordinadamente la transcripcion y la traduccion de multiples mensajes
diferentes; por lo tanto .es altamente deseable expresar varios polipeptidos desde un
mismo transcrito de ARN, y los ejemplos antes descritos ilustran varios mecanismos
por los que esto se puede lograr; principalmente, splicing diferencial y control de la
exportacion de ARN desde el nucleo o iniciacion de la traduccion.
Un mecanismo adicional conocido como «desplazamiento del marco de lectura» es
utilizado por diversos grupos de virus para lograr el mismo proposito. Los ejemplos
mejor estudiados de este fenomeno vienen de los genomas de retrovims, pero muchos
virus utilizan un mecanismo similar. Este desplazamiento del marco de lectura se des-
cubrio primero en virus, pero ahora se sabe que tambien ocurre en celulas procariotas
y eucariotas. Los genomas de retrovirus se transcriben para producir al menos dos
ARNm con cap en 5' y poliadenilados en 3 '. ARNm producidos por cortes y empalmes
codifican proteinas de envoltura, asi como, en retrovims mas complejos como VLTH
y VIH, proteinas adicionales como las Tax/Tat y Rex/Rev (Figura 5.14). Un transcrito
largo y no sujeto a «splicing» codifica los genes gag, pro y pol y tambien forma el
ARN genomico empaquetado en los viriones. El problema que tienen que resolver los
retrovims es como expresar tres proteinas diferentes a partir de un solo transcrito lar-
go. El ordenamiento de los tres genes varia en los distintos vims. En algunos casos
(por ej., VLTH) ocupan tres marcos de lectura diferentes, mientras que en otros (por
Expresi6n
ej., VIH) el gen de la proteasa (pro) constituye una extension en el extremo 5' del gen
pol (Figura 5 .19). En este ultimo caso, la proteasa y la polimerasa (es decir, la
transcriptasa inversa) se expresan como una poliproteina que hade ser autocatalitica-
mente digerida en las proteinas maduras en un proceso similar a1 de la digestion de las
poliproteinas de picornavirus.
En los limites entre cada uno de los tres genes existe una secuencia particular que
usualmente consiste en un tramo de nucleotidos repetidos, tal como UUUAAAC (Fi-
gura 5.20). En notable que esta secuencia se encuentra raramente en secuencias
codificantes de proteinas y, por lo tanto, parece ser usada especificamente para este
tipo de regulacion. La mayoria de los ribosomas al encontrar esta secuencia la traduci-
nl.n sin dificultad y continuanin a lo largo del transcrito hasta alcanzar un codon de
parada de la traduccion. Sin embargo, una parte de los ribosomas que intenten traducir
esta secuencia «resbalanin» un nucleotido para atnl.s antes de continuar traduciendo el
mensaje, pero ahora en una pauta de lectura diferente (es decir, - 1). Por este motivo,
esta secuencia UUUAAAC se ha denominado la secuencia «resbaladiza», y el resulta-
do de este desplazamiento de la pauta de lectura 21 es la traduccion de una poliproteina
gag
pro
0 pol
= ## g;
Desplazamiento
de paula de lectura
gag ribosomal
pol
...........
~
gag ~1-'-p_ro+l---'-po_l_ _ _ _ , - - - - - ,
Supresi6n
de parada
<S""'"'"
resbaladiza>> j
j
5'
3'pseudonudo
poco mas lejos esta una secuencia adicional complementaria con los nucleotidos del
bucle, que permite un apareamiento de bases entre estas dos regiones del ARN. El
resultado neto de esta combinacion de secuencias es la formacion de lo que se conoce
como un pseudonudo de ARN. Esta estructura secundaria en el ARNm causa que los
ribosomas que estan traduciendo el mensaje hagan una pausa en la secuencia resbala-
diza corriente arriba, y este enlentecimiento o pausa del ribosoma durante la traduc-
cion incrementa la frecuencia con la que ocurre el desplazamiento de la pauta de lectu-
ra, aumentando asf las concentraciones relativas de protefnas codificadas por marcos
de lectura corriente abajo . Es facil imaginar como se puede ajustar finamente este
sistema mediante mutaciones sutiles que alteren la estabilidad de la estructura del
pseudonudo y asf modificar la expresion relativa de los diferentes genes.
El ultimo metoda de control de la traduccion a considerar es la supresion de la
terminacion. Este es un mecanismo similar en muchos aspectos al del desplazamiento
de la pauta de lectura que permite que se expresen multiples polipeptidos de marcos de
lectura individuales en un mismo ARNm. En algunos retrovirus, como el virus de la
leucemia murina (VLM), el gen pro esta separado del gen gag por un codon de parada
UAG en vez de por una secuencia resbaladiza y un pseudonudo (Figura 5.19). En la
mayorfa de casos, la traduccion del ARNm del VLM term ina en esta secuencia, dando
lugar a las protefnas Gag; sin embargo, en algunas ocasiones, el codon de parada UAG
es suprimido, y la traduccion continua, produciendo una poliproteina Gag-Pro-Pol,
que posteriormente se digiere a sf misma para producir protefnas maduras. El efecto
global de este sistema es muy parecido al del desplazamiento de la pauta de lectura
ribosomal, estando controladas las proporciones relativas de protefnas Gag y Pro/Pol
por la frecuencia con que los ribosomas atraviesan o terminan en el codon AUG de
parada.
RESUMEN
BIBLIOGRAFiA
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CAPiTULO 6
INFECCION
u
VMT:
Prole ina
P30
ARN gen6mico
m<f)
w
0
E VMC:
Figura 6.1
Viriones
CPMV intactos
n
Movimientos de proteinas en plantas.
Vacunaci6n Dosis
prima ria de recuerdo
<J)
~ ~
0
e-
Q) lgG
:::l
0
-~
(1)
Q)
"0
0
0
~
<J)
0
:a
f=
lgM
I 1
0 2 3 4 5 6 7
Tiempo (semanas)
muestra una version muy simplificada de Ia respuesta inmune ala infeccion en mami-
feros. La infeccion virica induce al menos tres clases de anticuerpos: inmunoglobulina
G (IgG), IgM e IgA. IgM es una molecula grande, multivalente, que es muy efectiva
provocando entrecruzamientos con grandes dianas (por ej., paredes de celulas bacte-
rianas o flagelos), pero que probablemente sea menos importante en la lucha contra las
infecciones viricas. En contraste, la produccion de IgA es muy importante para la pro-
teccion inicial frente a las infecciones viricas. La IgA secretoria es producida en las
superficies mucosas y produce una «inmunidad de mucosas», un factor importante en
la prevencion de las infecciones viricas. La induccion de inmunidad de mucosas de-
pende en gran medida de la via de presentacion de los antigenos al sistema inmunolo-
gico y de su reconocimiento por este. A este respecto, antigenos similares incorpora-
dos a diferentes sistemas de presentacion de vacunas (ver Prevencion y terapia de las
infecciones viricas, mas adelante) pueden conducir a muy distintos resultados, y la
inmunidad de mucosas es un factor tan importante que vacunas parecidas pueden va-
riar considerablemente en su grado de eficacia. La IgG es probablemente la clase de
anticuerpo mas importante para la neutralizacion directa de particulas viricas en suero
y otros liquidos biologicos (a los que difunde).
La neutralizacion directa de virus por anticuerpos es el resultado de una variedad
de mecanismos, que incluyen cam bios conformacionales en la caps ide virica provoca-
dos por la union de los anticuerpos, o bloqueo de la funcion de la molecula diana para
el virus (es decir, la union al receptor) por impedimento esterico. Una consecuencia
secundaria de la union de los anti cuerpos es Ia fagocitosis de moleculas diana recubiertas
de anticuerpos («opsonizadas») por celulas mononucleadas 0 leucocitos polimorfo-
nucleares. Este proceso es mediado por la presencia de receptor para Fe en la superfi-
cie de estas celulas, pero, como ya se comento en el Capitulo 4, en algunos casos la
lnfecci6n
Anticuerpo
Receptores Fe ~
CCDA
(dependiente de anticuerpos)
Lisis celular especifica
(restring ida por MHC)
J
f 1 ur 6.3 Diagrama ilustrativo de los tres mecanismos efectores principales de Ia inmunidad celular.
Principios de virologia molecular
Linfoquinas
por ej., IL-2
LFA-3 ~
MHCII ~ ~
ICAM-l~ ~~S:; T~
tl"~ ~TCR
02
~"""' CelulaT
~ CD4 helper
LFA-1
Figura 6.4 Proteinas de superficie celular implicadas en el reconocimiento imnunol6gico. Los con-
tactos directos entre celulas provocan seiiales de celula a celula que regulan Ia respuesta imnunitaria.
VIRUS Y APOPTOSIS
Fasl FNT
OTROS ONCOGENES
ACTIVADO RES ACTIVADOS
Membrana
Fas RFNT
plasmatica
clAP Daiio Activaci6n ciclo celular
FADD TRADD aiADN ( 0, u, E2F, c-Myc)
RB
MITOCO NDRIA
lniciador de
caspasas
PER MEABILIDAD
EFECTOR DE
CASPASAS
ACTIVADO
(CASPASA-3)
DE TRANSICION
DIANAS
DE CASCADA
DE CASPASAS
lnhibici6n de
sintesis proteica
J
6.5 Perspectiva general de la apoptosis. Los terminos en verde son de mayor impottancia en la
infecci6n virica.
Principios de virologia molecular
• Activacion de p53: virus que interaccionan con p53 (Capitulo 7) pueden causar
detenci6n del crecimiento o apoptosis (por ej., adenovirus, SV40, papilomavirus).
• Disregulacion transcripcional: virus que codifican proteinas reguladoras de la
transcripci6n pueden activar una respuesta apopt6tica (por ej., Tax de VLTH).
• Expresion de proteinas extrafias: la sobreexpresi6n de proteinas viricas en etapas
tardias del ciclo replicativo puede causar tambien apoptosis por una variedad de
mecamsmos.
En respuesta a este sistema celular de alanna, muchos, si no la mayoria de los virus,
han desarrollado mecanismos para contranestar este efecto y reprimir la apoptosis:
• Homologos de Bcl-2: diversos virus codifican hom6logos de Bcl-2 (un regulador
negativo de la apoptosis) (por ej., E1B-19k de adenovirus, KSbcl-2 de VHH-8).
• Inhibicion de caspasa: las caspasas son una familia de cistefn proteasas que son
importantes inductoras de la apoptosis. Inhibir estas enzimas es una forma eficaz de
prevenir la apoptosis (por ej., p35 de baculovirus, serpinas , viAP: «inhibidores de
la apoptosis»).
• lnhibicion de Fas/FNT: los virus han desanollado diversos mecanismos para blo-
quear los efectos de Fas/FNT, incluyendo sefiales de bloqueo a traves de la mem-
brana plasmatica (por ej., E3 de adenovirus), mimetizadores del receptor para el
factor de necrosis tumoral (RFNT) (por ej., cnnA de poxvirus), mimetizadores de
factores de sefiales de muerte (vFLIPs), e interacciones con factores de sefiales
como el dominio de muerte asociado a Fas (Pas-associated death domain, FADD
en ingles) y el dominio de muerte asociado a RFNT (TNFR: associated death domain,
TRADD en ingles) (por ej ., LMP-1 de VHH-4 [VEB]).
• Inhibicion de p53: varios virus que interaccionan con p53 han desanollado protei-
nas para contrarrestar posibles activaciones de la apoptosis (por ej., E1B-55k y E4
de adenovirus, antigeno T de SV40, E6 de papilomavirus).
• Miscehinea: muchos otros mecanismos estan siendo descritos actualmente en di-
versos virus (por ej., VIH, influenza, reovirus).
En ausencia de tales mecanismos inhibitorios, la mayoria de los virus habrian sido
sencillamente incapaces de replicarse, a causa de la muerte de la celula hospedadora
antes de que se hubiese completado su ciclo replicativo; sin embargo, hay evidencias
de que al menos algunos virus utilizan la apoptosis en su propio beneficio. Virus con
ARN de senti do positivo como poliovirus, virus de la hepatitis A y el virus Sindbis con
ciclos liticos de replicaci6n parecen ser capaces de regular la apoptosis, inicialmente
reprimiendola para que tenga lugar la replicaci6n y despues induciendola para permitir
la liberaci6n de particulas viricas de la celula.
INTERFERONES
el mecanismo responsable es tal que, por ejemplo, los retrovirus aviares se agrupan en
nueve grupos de interferencia (del A al I), basados en su capacidad de infectar varias
razas de pollos, faisanes, perdices, codomices, etc. o lineas celulares derivadas de
estas especies. En este caso, la incapacidad de un virus en particular por infectar las
celulas de algunas razas se debe a la expresion de la glicoproteina de envoltura de un
provirus endogeno presente en las celulas, que secuestra al receptor celular necesario
para la infeccion por el virus exogeno. En otros casos el mecanismo de la interferencia
virica esta menos claro.
En 1957, Alick Isaacs y Jean Lindenmann estaban estudiando este fenomeno y rea-
lizaron el siguiente experimento. Expusieron fragmentos de membrana corioalantoidea
de polio en cultivo celular a virus influenza inactivado con luz ultravioleta (UV) (virus
no infectivo ). Observaron que el medio «acondicionado» de estos experimentos (que
no con tenia virus infectivo) inhibia la infeccion por virus influenza (infectivo) en cul-
tivos separados de nuevos fragmentos de membrana corioalantoidea. Llegaron a la
conclusion de que un factor soluble, que ellos llamaron «interferon», era producido
por las celulas como resultado de la infeccion virica, y que este factor podia proteger
de la infeccion a otras celulas. Como resultado de esta observacion tan sugestiva, el
interferon se convirtio en la gran esperanza de la virologia y se penso que podria ser el
equivalente directo del uso de los antibioticos para tratar las infecciones bacterianas.
La verdadera situacion ha resultado ser mucho mas compleja de lo que se penso en
un principia. Los interferones no tienen propiedades antiviricas, sino que por lo gene-
ral sus efectos son ejercidos indirectamente por medio de su principal funcion como
proteinas de regulacion celular. Los interferones son intensamente potentes; menos de
50 moleculas por celula muestran evidencias de actividad antiviral. Por lo tanto, si-
guiendo el descubrimiento inicial de Isaacs y Lindemnann, se emplearon muchos aiios,
que fueron bastante poco productivos, tratando de purificar cantidades diminutas de
interferon producido naturalmente. Esta situacion cambio con el desarrollo de la biolo-
gia molecular que permitio la clomicion y la expresion de los genes del interferon, que
ha conducido a rapidos avances en nuestro conocimiento durante los ultimos 15 aiios.
Los tres tipos de interferon son a, By y.
• Interferon a: Existen al menos 15 especies moleculares de interferon a , todas las
cuales estan estrechamente relacionadas, diferenciandose algunas de elias por un
cambio en un solo aminoacido. Son sintetizadas predominantemente por linfocitos.
Las proteinas maduras contienen 143 aminoacidos, con un minimo de homologia
del 77% entre los diferentes tipos. Todos los genes que codifican interferon a se
localizan en e1 cromosoma humano 9, y se piensa que la duplicacion de genes es
responsable de esta proliferacion de genes.
• Interferon B: El gen linico para el interferon Bse locali za tambien en el cromosoma
humano 9. La protein a madura contiene 145 aminoacidos y, a diferencia del interferon
a , esta glicosilada, con aproximadamente un 30% de homologia con otros interfe-
rones. Es sintetizado predominantemente por fibroblastos.
• Interferon y: El gen unico para el interferon y se localiza en el cromosoma humano
12. La proteina madura contiene 146 aminoacidos, esta glicosilada, y tiene tma
Principios de virologfa molecular
lnterferones
lnterferones
~ I I J
I PKR (inactivo)
L
PKR (activo)
I eiF2a
L
1
1
1 -- --L--
eiF2a-PO+
(inactivo)
nismo de la 2' ,5' -oligo A. Un tercer mecanismo bien establecido depende del gen Mx, un
gen de una sola copia localizado en el cromosoma humano 21, cuya transcripci6n es
inducida por el IFN a y por el IFN ~ , pero no por el IFN y. El producto de este gen inhibe
la transcripci6n primaria del virus influenza pero no Ia de otros virus. No se conoce su
modo de acci6n. Ademas de estos tres mecanismos, hay constancia de otros muchos
efectos de los interferones. Inhiben la penetracion y la decapsidacion de SV40 y de
algunos otros virus, posiblemente por alterar la composici6n o la estructura de la mem-
brana celular; inhiben la transcripci6n primaria de muchos genomas vfricos (por ej.,
SV40, VHS) y tambien Ia transformacion celular por retrovirus. No se han logrado
explicar completamente los mecanismos moleculares que median estos efectos.
En conclusion, se puede a:firmar que los interferones son armas potentes contra la
infecci6n virica, pero que acman mas como un trabuco que como una «bala magica».
Los importantes efectos secundarios (fiebre, nauseas, malestar) que resultan de su po-
derosa acci6n regulatoria celular determinan que no se vayan a utilizar nunca para el
tratamiento habitual de infecciones vfricas triviales; no son la cura del resfriado co-
mun. No obstante, conforme se va comprendiendo mejor el potencial de regulaci6n
celular de los interferones, estan encontrando un uso mas amplio en el tratamiento de
algunos canceres (por ej., el uso del IFN-a en el tr·atamiento de la leucemia de celulas
peludas o tricoleucemia). Los usos terapeuticos actuales de los interferones se resu-
men en la Tabla 6. L Las perspectivas a largo plazo de su aplicaci6n como antivirales
son mas inciertas, exceptuando posiblemente su uso en infecciones que comprometan
la vida, cuando no exista otra altemativa terapeutica (por ej., hepatitis vfrica cr6nica).
Enfermedad Virus
Tum ores
Enfermedades congenitas
Como antes se describi6, los LTCs s6lo pueden responder a antigenos extrafios
cuando son presentados en complejos MHC de clase I sabre la celula diana. Diversos
virus interfieren con la expresi6n de MHC I o son capaces de desbaratar este proceso y
evadir la respuesta LTC. Tales mecanismos incluyen la regulaci6n negativa de la ex-
presion de MHC I por los adenovirus y la interferencia con el procesamiento de antigeno
requerida para formar un complejo MHC I-antigeno de los herpesvirus.
Los antigenos MHC II son esenciales en la respuesta inmune adaptativa para esti-
mular el desarrollo de clones de celulas efectoras en respuesta a un antigeno. De nue-
vo, los herpesvirus y los papilomavirus interfieren con el procesamiento y la expresi6n
en superficie de los complejos MHC II-antigeno, inhibiendo la respuesta LTC.
INTERACCIONES VIRUS-HOSPEDADOR
Piel: abrasi6n/herida
artr6podos vectores ~~~f-
Figura 6.8 Diagrama esquematico que ilustra los posibles sitios de entrada de virus al cuerpo.
I •
Adenovirus Conjuntiva
Picornavirus: enterovirus 70 Conjuntiva
Papilomavirus Tracto genitourinario
Herpesvirus Tracto genitourinario
Retrovirus: virus de la inmunodeficiencia humana (VIH),
virus de Ja leucemia de celulas T humana (VLTH) Tracto genitourinario
leta (luz solar), etc., aunque algunos virus escasos son bastante resistentes a estos agen-
tes. Esto es particularmente importante para los que se transmiten por medio de agua o
alimentos contaminados; no solo tienen que ser capaces de sobrevivir en el medio
ambiente basta que sean ingeridos por un nuevo huesped, sino que, como la mayoria se
transmiten por la via fecal-oral, deben ser capaces de sobrevivir el paso a traves del
est6mago para infectar el intestine antes de ser eliminados por las heces. Una forma de
superar el estres del medio ambiente es aprovecharse de un vector secundario para
transmitirse entre los hospedadores primaries (Figura 6.9). Como sucede con los virus
de plantas (vease mas arriba), el virus puede o no replicar en el vector. Los virus sin un
vector secundario tienen que con:fiar en una transmisi6n continua de huesped a hues-
ped y haber desarrollado varias estrategias para lograrlo (Tabla 6.5):
• Transmisi6n horizontal: Es la transmisi6n directa de los virus de huesped a hues-
ped. Esta estrategia se basa en una alta tasa de infecci6n para mantener la poblaci6n
virica.
• Transmision vertical: Es la transmisi6n de un virus de una generaci6n de hospe-
dadores a la siguiente. Puede ocurrir por la infecci6n del feto antes, durante o
escaso tiempo despues del nacimiento (por ej., mediante la lactaci6n). Mas rara-
mente, puede consistir en la transmisi6n directa del virus a traves de la misma
Insecto vector
Calor
Enzimas: Radiaci6n
proteasas, ultravioleta
nucleasas
Figura 6.9 Transmisi6n de virus a traves del medio ambiente. Algunos virus han adoptado el uso de
vectores como insectos u otros artr6podos para evitar los riesgos ambientales.
lnfecci6n
Patron Ejemplo
Transmisi6n horizontal
Humano-humano (aerosol) Influenza
Humano-humano (fecal-oral) Rotavirus
Animal-humano (directo) Rabia
Animal-humano (vector) Bunyavirus
Transmisi6n vertical
Placenta-feto Rubeola
Madre-hijo (nacimiento) Virus herpes simplex (VHS), virus de la inmunodefi-
ciencia humana (VIH)
Madre-hijo (lactancia) VIH, virus de la leucemia de celulas T humanas
(VLTH)
Linea germinal En raton, retrovirus; en humanos (?)
Infecciones localizadas
Papillomavirus Dermis
Rhinovirus Tracto respiratorio superior
Rotavirus Epitelio intestinal
Infecciones sistemicas
Enterovirus Epitelio intestinal Tejido linfoide, SNC
Herpesvirus Orofaringe o tracto genitourinario Tejido linfoide, SNC
Principios de virologia molecular
Virus influenza
(infecci6n localizada,
el virus es eliminado
par via respiratoria)
Superficie apical
Lumen
Epitelio
\
Membrana basolateral
Tejidos
subepiteliales
Tras la infecci6n primaria en el sitio de infecci6n, la siguiente etapa puede ser la dise-
minaci6n por el hospedador. Ademas del contacto directo celula a celula, existen dos
mecanismos para la diseminaci6n por el organismo:
Via torrente sanguineo: los virus pueden alcanzar la sangre circulante por inocu-
laci6n directa; por ejemplo por artr6podos vectores, por transfusion sanguinea o
mediante el uso de drogas intravenosas (compartiendo jeringuillas no esteriles). El
virus puede viajar libre en el plasma (por ej. , togavirus, enterovirus) o en asocia-
ci6n con hematies (orbivirus ), plaquetas (VHS), linfocitos (VEB, CMV) o monocitos
(lentivirus). La viremia primaria habitualmente precede yes necesaria para la dise-
minaci6n del virus a otras regiones del cuerpo por la circulaci6n sanguinea, y se ve
seguida de una viremia secundaria, mas generalizada, de titulo viral mas elevado,
conforme el virus alcanza otros tejidos diana o replica directamente en las celulas
san guineas.
• Via sistema nervioso: como antes, la diseminaci6n de virus al sistema nervioso es
precedida generalmente por una viremia primaria. En algunos casos, Ia disemina-
ci6n ocurre directamente por contacto con neuronas en el sitio de la infecci6n pri-
maria; en otros casos, ocurre por via de Ia corriente sanguinea. Una vez en los
nervios perifericos, el virus puede diseminarse al SNC por transporte axonal a lo
largo de las neuronas. El ejemplo clasico de esto es el virus herpes simplex (ver
Infecciones latentes, mas adelante ). Los virus pueden cruzar las uniones sinapticas
lnfecci6n
Deslizamiento antigemico:
acumulaci6n gradual
de mutaciones
Saito antigenico:
cambia brusco
del tipo antigenico
Figura 6.11 Saito («shift;>) y desli zamiento («drift;>) antigenico en virus influenza.
lnfecci6n
1889: ~(HA)
--
1890 (NA)
H2N2 -:
~
1900:
1900
H3N2 --
~
1910
~
1920
1918:
H1N1
--
~
~
H1N1
<< Espanola»
59 aiios
1930
68 aiios
1940
1950: 59 aiios
1950
~ -
1957: -
H2N2 -
~
1968:
H3N2
~
--=
- ~
H3N2
1970 <<Hong Kong»
0
1977:
H1Nl --
~
1990
???
Los patrones de las infecciones viricas se pueden dividir en una variedad de tipos
distintos.
lnfecci6n abortiva
Una infeccion abortiva tiene lugar cuando un virus infecta una celula (o un hues-
ped) pero no puede completar el ciclo replicativo completo, causando asi una infec-
cion no productiva. El resultado de tales infecciones, sin embargo, no es necesaria-
mente insignificante; por ej emplo, la infeccion por SV40 de celulas de roedor no
permisivas a veces causa la transformacion de las celulas (ver Capitulo 7).
lnfecci6n aguda
lnfecci6n cr6nica
lnfecci6n persistente
~ - jtf) .
~ lnfeccion
persistente
~
s;{ ---....__ ~
Raton adulto .
Muerto
~ Virus eliminado
jtP
~ -
Li nfocitos T
Raton
inmunosuprimido
~ _l jiffo
~ -
Linfocitos T
Raton
reciE'm nacido
~ _l ~
Figura 6.13 Infecci6n persistente en ratones por el virus de !a coriomeningitis linfocitaria (VCML).
Principios de virologia molecular
No esta claro que factores determinan la supervivencia o la muetie de los ratones in-
fectados con el VCML, pero existen evidencias de que el resultado depende de la
respuesta inmunitaria frente al virus. En ratones adultos inmunosuprimidos infectados
por la via del sistema nervioso central (SNC), se establece una infecci6n persistente en
la que el virus noes eliminado (debido a que el sistema inmunol6gico noes funcional) ,
pero, curiosamente, estos ratones no son matados por el virus. No obstante, si se inyec-
tan linfocitos T singenicos, especificos del VCML, a estos ratones persistentemente
infectados, los animales desarrollan la sintomatologia completa del cuadro patogenico
de la infecci6n por VCML y mueren. Cuando se infectan ratones recien nacidos, cuyo
sistema inmunol6gico esta inmaduro, por la via del SNC, tambien desarrollan una in-
fecci6n persistente, pero en este caso, si son inyectados posteriormente con linfocitos
T singenicos, especificos del VCML, eliminan el virus y los ratones sobreviven a la
infecci6n. No se comprenden completamente los mecanismos que controlan estos su-
cesos, pero es evidente que existe un delicado balance entre el virus y el animal hospe-
dador, y que la respuesta inmunitaria frente al virus es parcialmente responsable de la
patologia de la enfermedad y de la muerte de los animates.
No rara vez, las infecciones persistentes pueden ser el resultado de la producci6n
de particulas defectivas interfirientes (D.I.) (ver Capitulo 3). Tales particulas contie-
nen una deleci6n parcial del genoma virico y son defectivas en replicaci6n, pero son
mantenidas y pueden incluso tender a acumularse durante las infecciones porque pue-
den replicarse en presencia de un virus auxiliar competente en replicaci6n. La produc-
ci6n de particulas D.I. es una consecuencia comun de las infecciones viricas de anima-
tes, particularmente por virus ARN, pero tambien ocurre con virus ADN y virus de
plantas y puede ser reproducida in vitro por pases continuos con titulo alto del virus.
Aunque no son capaces de replicar elias mismas de forma independiente, las particulas
D.I. no son necesariamente inertes geneticamente y pueden alterar el curso de una
infecci6n por llevar a cabo recombinaciones con el genoma de un virus competente en
replicaci6n. La presencia de particulas D.I. puede influir profundamente sobre el curso
y el resultado de una infecci6n virica. En algunos casos, son capaces de moderar la
patogenesis, mientras que en otros la potencian, agravando los sintomas de la enferme-
dad. Ademas, como las particulas D.I. causan efectivamente una expresi6n genica res-
tringida (porque tienen deleciones genicas), pueden originar una infecci6n persistente
por un virus que normalmente provoca una infecci6n aguda y que es rapidamente eli-
minado del organismo.
lnfecci6n latente
ria localizada. Posteriormente, el virus viaja por mecanismos de transporte axonal ba-
cia el sistema nervioso. En el se esconde en los ganglios de las raices dorsales, como
en el ganglia trigemino, estableciendo una verdadera infeccion latente. El sistema ner-
vioso es un lugar privilegiado desde un punto de vista inmunologico y noes patrullado
por el sistema inmunitario del mismo modo que el resto del cuerpo; no obstante, el
principal factor en la latencia es la capacidad del virus de restringir su expresion genica.
Esto elimina la posibilidad de reconocimiento de las celulas infectadas por el sistema
inmunitario. La expresion genica restringida se logra por una regulacion estrecha de la
expresion de genes a, que es un modo esencial de control de la replicacion de los
herpesvirus (Capitulo 5). Se ha centrado un gran interes en los ARNm fabricados por
el VHS durante la infeccion latente; se conocen como transcritos asociadas ala latencia
(«latency-associated transcripts», LATs) y suscitan la posibilidad de establecer un pa-
ralelismo entre la latencia de VHS y la Iisogenia en el bacteriOfago 'A. Recientemente
se ha demostrado, sin embargo, que los LATs promueven la supervivencia de las neu-
ronas tras haber sido infectadas por VHS inhibiendo la apoptosis . La funcion anti-
apoptosis podria promover la reactivacion por:
• Proporcionar mas neuronas infectadas latentemente para futuras reactivaciones.
• Proteger a las neuronas en las que ocurre la reactivacion.
• Proteger neuronas previamente no infectadas durante una reactivacion.
Cuando se reactiva por diversos estimulos, el VHS viaja de vuelta a traves de los
nervios sensitivos para causar manifestaciones perifericas, tales como herpes labial o
ulceras genitales. No esta completamente aclarado que constituye un estimulo provo-
cador de reactivacion, pero existen muchas posibilidades, incluidos factores psicologi-
cos y fisicos. La reactivacion periodica establece el patron de la infeccion, en ocasio-
nes con reapariciones muy dolorosas de la sintomatologia para el resto de la vida del
hospedador. Peor incluso que esto, la inmunosupresion en la vida posterior del sujeto
puede causar una reactivacion de la infeccion latente (lo que indica que el sistema
inmunologico desempefia normalmente un papel protector, ayudando a suprimir estas
infecciones latentes), dando lugar a una infeccion muy grave, sistemica, que en oca-
siones amenaza la vida del paciente.
De una forma en cierto modo similar a los herpesvirus, las infecciones por retrovi-
rus pueden originar una infeccion latente. La integracion del provirus en el genoma
del hospedador da Iugar ala persistencia del virus durante toda la vida del organismo
hospedador y puede causar un patron episodico de enfermedad. En cierto modo, el
sindrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA), que resulta de la infeccion por VIH,
muestra aspectos de este patron de infeccion. La patogenesis del SIDA se discute con
mas detalle en el Capitulo 7.
dad. La primera estrategia se basa en dos enfoques: higiene publica y personal, que
quizas juegue el principal papel en la prevenci6n de las infecciones viricas (por ej., el
suministro de agua potable y la eliminaci6n correcta de las aguas residuales; una buena
practica medica que incluye la esterilizaci6n del instrumental quirurgico) y la vacuna-
cion , que hace uso del sistema inmunol6gico para combatir las infecciones viricas. La
mayor parte del dafio que sufren las celulas durante las infecciones viricas ocurre muy
pronto, a menudo antes de que aparezcan los sfntomas clinicos. Esto hace muy dificil
el tratamiento de la infecci6n virica; en consecuencia, ademas de que resulta mucho
mas barata, la prevenci6n de la infecci6n virica es sin duda mejor que la curaci6n.
Para disefiar vacunas eficaces, es importante comprender tanto la respuesta inmu-
nitaria frente ala infecci6n virica (ver anteriormente) como las fases de la replicaci6n
virica que son mas adecuadas como dianas para la intervenci6n inmunol6gica. Para
resultar eficaces, las vacunas tienen que estimular el mayor numero posible de meca-
nismos de defensa del organismo. En la practica, esto generalmente significa tratar de
imitar a la infecci6n sin, por supuesto, causar patogenesis; por ejemplo, utilizando
vacunas gripales de administraci6n nasal y vacunas frente a la poliomielitis de admi-
nistraci6n oral. Para ser eficaz, no es necesario conseguir el 100% de inmunizaci6n de
los vacunados. La «inmunidad de rebafim> es el resultado de 1a interrupci6n de la trans-
misi6n de un virus, que sucede cuando una proporci6n suficientemente alta de la po-
blaci6n ha sido vacunada. Esta estrategia es mas efectiva cuando no existe un hospeda-
dor alternativo para el virus (por ej., el sarampi6n) yen la practica es la situaci6n que
generalmente se produce, pues es imposible lograr un 100% de cobertura con ninguna
vacuna. De todas formas, esta es una empresa arriesgada; si la protecci6n de la pobla-
ci6n desciende por debajo de un nivel critico, es facil que ocurran epidemias . Existen
tres tipos basicos de vacunas: vacunas de subunidades, vacunas inactivadas y vacunas
de virus vivos.
Vacunas de subunidades
Vacunas inactivadas
Las vacunas inactivadas se producen por exposicion del virus a un agente desnatura-
lizante bajo condiciones controladas con precision. El objetivo es causar la perdida de la
infectividad del virus sin perder antigenicidad. Obviamente esto implica lograr un balan-
ce delicado; sin embargo, las vacunas inactivadas tienen ciertas ventajas, como ser gene-
ralmente inmunogenos eficaces (si estan adecuadamente inactivadas), ser relativamente
estables y no implicar riesgo de infecciones asociadas a la vacuna (si estan adecuada-
Principios de virologia molecular
Esta estrategia se basa en el uso de virus con patogenicidad reducida para estimular
una respuesta inmunitaria sin causar enfermedad. La cepa vacunal puede ser un virus
natural (por ej., el uso del virus de Ia viruela de las vacas por Edward Jenner para
vacunar contra la viruela) o atenuado artificialmente in vitro (por ej ., la vacuna oral de
Ia poliomielitis obtenida por Albert Sabin) . La ventaja de las vacunas atenuadas es que
son buenos inmun6genos e inducen una inmunidad suficiente para toda la vida. Frente
a esta ventaja se encuentran sus numerosas desventajas. Con frecuencia son bioquimi-
ca y geneticamente inestables y pueden perder infectividad (volviendose inutiles) o
revertir su virulencia de forma inesperada. A pesar de intensos estudios, no es posible
producir una vacuna atenuada a la carta, y parece que no existen unos mecanismos
generales por los cuales diferentes virus puedan atenuarse de forma fiable y segura.
Tambien es posible la contaminaci6n de los preparados vacunales con otros virus, po-
siblemente pat6genos; este fue el modo en que se descubri6 por vez primera SV40 en
las vacunas orales de poliovirus en 1960. El uso inapropiado de las vacunas de virus
vivos, por ejemplo en pacientes inmunocomprometidos o en mujeres embarazadas,
puede causar enfermedades asociadas a las vacunas, mientras que la misma vacuna
administrada a un individuo sano puede ser perfectamente segura.
A pesar de estas dificultades, la vacunaci6n contra las infecciones viricas ha sido uno
de los grandes triunfos de la medicina durante el siglo XX. La mayor parte de las histo-
rias con exitos son el resultado del uso de vacunas vivas atenuadas, por ejemplo, el uso
del virus vacuna contra la viruela. El 8 de mayo de 1980 la Organizaci6n Mundial de la
Salud (O.M.S.) declar6 oficialmente enadicada la viruela, Ia prirnera enfermedad causa-
da por un virus eliminada del mundo. La O.M.S. se propane actualmente erradicar la
poliomielitis en el afio 2008, asi como reducir la incidencia y la mortalidad del saram-
pi6n e introducir la vacunaci6n frente al virus de la hepatitis B a nivel mundial.
Las vacunas vi vas no tienen por que basarse en las proteinas estructurales del virion.
Por ejemplo, la infecci6n por el papilomavirus humano (PVH) se asocia con carcino-
ma cervical (Capitulo 7). Dos proteinas reguladoras del PVH, E6 y E7, se expresan de
forma constante en las celulas tumorales, y estan en desarrollo vacunas basadas en
virus vacuna recombinante expresando las proteinas E7 y E7 de PVH 16 y 18 para la
lnfecci6n
prevenci6n y el tratamiento del cancer cervical. Esto plantea otro aspecto importante.
Aunque la prevenci6n de la infecci6n mediante vacunaci6n profilactica es la opci6n
preferida, las vacunas terapeuticas post-exposici6n pueden resultar de gran valor para
modificar el curso de algunas infecciones viricas. Un ejemplo de ello lo constituye el
virus de la rabia, cuyo curso de la infecci6n puede ser muy prolongado y hay tiempo
para inducir una respuesta inmunitaria eficaz mediante la vacunaci6n post-exposici6n,
previniendo asi la replicaci6n secundaria del virus en el SNC, que es responsable de la
patogenesis de la rabia. Otros ejemplos potenciales pueden encontrarse en tumores
asociadas a virus, como el carcinoma cervical inducido por el PVH, como se ha descri-
to anteriormente.
Las vacunas de ADN y ARNi son los mas recientes tipos de vacunas, y consisten
solamente en una molecula de ADN que codifica el antigeno o los antigenos de interes
y, posiblemente, moleculas coestimuladoras como citoquinas. El fundamento de estas
vacunas es que el ADN es expresado in vivo, produciendo pequefias cantidades de
proteina antigenica que sirven para estimular la respuesta inmunitaria, de forma que se
pueda generar una rapida respuesta protectora cuando se enfrente al antigeno real. En
teoria, estas vacunas podrian fabricarse con rapidez, y deberian inducir con eficacia
ambas respuestas inmunitarias, humoral y celular. Los estudios clinicos iniciales han
indicado que es necesario recorrer todavia un camino hasta que este tecnologia experi-
mental se convierta en una realidad practica.
Se ha descubierto que un fen6meno descrito hace relativamente poco, conocido como
ARN interfiriente (ARNi) puede ser utilizado para inhibir in vitro la replicaci6n virica de
una amplia variedad de virus, incluidos el virus de la hepatitis C, poliovirus, virus in-
fluenza, rotavirus, virus de la hepatitis B, virus respiratorio sincitial (VRS) y papilomavirus.
Como reminiscencia del estimulo de los interferones, el ARNbc sirve como estimulo
para el ARNi. Una enzima muy conservada en la evoluci6n de los eucariotas, denomina-
da Dicer, digiere el ARNbc en fragmentos de 21 a 23 nucle6tidos de longitud conocidos
como ARNs pequefios inhibidores (ARNpi), que finalmente causan la destrucci6n del
ARN hom6logo diana. En algunas especies, pero aparentemente no en la humana, los
ARNpi pueden dirigir tambien la sintesis de mas ARNbc, provocando una amplificaci6n
del efecto y permitiendo su diseminaci6n de celula a celula. Si se logran solucionar los
problemas tecnicos asociadas actualmente ala introducci6n de los ARNpi en las celulas,
la tecnologia del ARNi podria convertn·se en una nueva e importante herramienta en el
tratamiento y la prevenci6n de las infecciones viricas.
Se estan desarrollado virus para ser utilizados como sistemas de transporte y entre-
ga en el tratamiento de enfermedades hereditarias y tambien adquiridas. La terapia
genica ofrece:
Principios de virologia molecular
Cuanto mas pequefio sea el valor del indice quimioterapeutico, mejor. En la practi-
ca, para producir una droga clinicamente uti! y segura se requiere habitualmente una
lnfecci6n
Cualquiera de las etapas de la replicaci6n virica puede constituir una diana para una
intervenci6n antiviral. Los unicos requerimientos son:
• El proceso diana tiene que ser esencial para la replicaci6n.
• La droga debe ser activa contra el virus pero tiene que tener una «toxicidad acepta-
ble» para el organismo hospedador.
El grado de toxicidad que es «aceptable» varia considerablemente; por ejemplo,
entre una cura para el resfriado comlin, que puede venderse libremente al publico y ser
tornado por millones de personas, y una droga utilizada para tratar infecciones viricas
fatales como el SIDA.
La fase de adsorci6n del ciclo replicativo puede ser inhibida por dos vias: por agen-
tes que mimetizan la proteina de union del virus (PUV) y que se unen al receptor
celular o por agentes que mimetizan al receptor y se unen a la PUV. Los peptidos
sinteticos son la clase mas 16gica de compuestos que pueden ser usados con este obje-
tivo. Aunque esta es una prometedora linea de investigaci6n, existen considerables
problemas con el uso clinico de estas sustancias, principalmente el alto coste de los
peptidos sinteticos y las pobres propiedades farmacocineticas de muchas de estas mo-
leculas sinteticas.
Es dificil dirigirse especificamente contra las etapas de penetraci6n/decapsidaci6n
del ciclo de replicaci6n virica ya que se sabe relativamente poco sabre elias. La
decapsidaci6n en particular depende en gran medida de enzimas celulares y por tanto
es una diana pobre para interferirla, aunque, al igual que la penetraci6n, a menudo se
ve influenciada por una o mas proteinas viricas. Dos drogas activas sabre los virus
influenza A son la amantadina y la rimantadina. La acci6n de estos dos agentes estre-
chamente relacionados consiste en bloquear los canales de iones en la membrana celu-
lar. La diana para ambas drogas es la proteina matriz M 2 del virus influenza, pero Ia
resistencia a ellas puede tambien mapear en el gen de la hemaglutinina. Esta acci6n
bifasica resulta de la incapacidad de las celulas tratadas con droga de bajar el pH del
compartimento endos6mico (funci6n que normalmente es controlada par el producto
del gen M 2), que es esencial para inducir cambios conformacionales en la proteina HA
que permiten la fusion de membranas (ver Capitulo 4).
Muchos virus han desarrollado sus propias enzimas especificas para replicar sus
acidos nucleicos viricos a expensas de los celulares. Con frecuencia las polimerasas
viricas poseen suficiente especificidad para que puedan ser la diana de un agente
antiviral, y este hecho ha determinado que Ia mayoria de las drogas especificas antivirales
actualmente en usa sean inhibidores de las polimerasas. La mayoria de estas drogas
funcionan como analogos de sustratos de la polimerasa (es decir, nucle6sidos/nucle6-
tidos), y su toxicidad varia considerablemente, desde algunos que son bien tolerados
(por ej., aciclovir) a otros que son bastante t6xicos (por ej., azidotimidina o AZT). Se
presenta un problema con la farmacocinetica de estos analogos de los nucle6sidos y es
que su vida media caracteristica es de 1 a 4 horas. Los analogos de los nucle6sidos son,
de hecho, pro-drogas, ya que deben ser fosforiladas antes de que resulten activas, lo
cual es clave para su selectividad de acci6n:
Principios de virologia molecular
• El aciclovir es fosforilado por la timidina kinasa del VHS con 200 veces mas efica-
cia que por enzimas celulares.
• El ganciclovir es 10 veces mas eficaz contra el CMV que el aciclovir, pero tiene
que ser fosforilado por una kinasa codificada por el gen UL97 de CMV antes que
resulte farmacol6gicamente activo.
• Se han desarrollado otros analogos de los nucle6sidos derivados de estas drogas y
activos frente a herpesvirus (por ej., valciclovir y famciclovir). Estos compuestos
han mejorado sus propiedades farmacocineticas, como mejor biodisponibilidad oral
y vidas medias mas largas. Ademas de ellos existen otros productos que no son
analogos de los nucle6sidos que inhiben a las polimerasas viricas; por ejemplo, el
foscarnet, que es un analogo de pirofosfato que interfiere con la union de nucle6tido
trifosfatos por ADN polimerasas viricas.
• La ribavirina es un compuesto con un espectro muy amplio de actividad frente a
muy diferentes virus, especialmente contra muchos virus ARN de polaridad (-).
Esta droga acma como un mutageno de ARN, incrementando 10 veces la mutagenesis
de genomas de virus ARN y una perdida del 99% en la infectividad tras un solo
ciclo de infecci6n virica en presencia de ribavirina. La ribavirina es por tanto bas-
tante diferente a los otros analogos de los nucle6sidos antes descritos, y es probable
que su uso se generalice mas en el futuro.
La expresi6n de los genes viricos es menos susceptible de ser interferida qufmica-
mente que la replicaci6n genomica, porque los virus son mucho mas dependientes de
la maquinaria celular para la transcripci6n, el corte y empalme (splicing) de los ARNm,
la exportaci6n citoplasmatica y la traducci6n que la replicaci6n. Hasta la fecha no se
han desarrollado drogas de aplicaci6n clinica que discriminen entre la expresi6n genica
virica y celular. Como con la penetraci6n y la decapsidacion, no se comprenden bien
los procesos de ensamblaje, maduracion y liberacion de la maymia de los virus, por
lo que no se han considerado todavia dianas de tratamientos antivirales, a excepci6n de
las drogas anti-influenza oseltamivir y zanamivir, que son inhibidores de la neuramini-
dasa del virus influenza. La neuraminidasa esta implicada en la liberaci6n por gema-
ci6n de las partfculas viricas de las celulas infectadas, y se cree que estas drogas redu-
cen la diseminaci6n del virus a otras celulas.
El aspecto mas llamativo de la quimioterapia antiviral es el escaso numero de dro-
gas disponibles para uso clfnico. Como si esto no fuese suficientemente negative, exis-
te ademas el problema de la resistencia a los antivirales. En la practica, Ia velocidad y
la frecuencia con la que surgen estas resistencias, cuando se usan estas drogas para
tratar infecciones viricas, varia considerablemente, y depende en gran medida de la
biologia del virus implicado mas que de la naturaleza quimica del compuesto. Para
ilustrar este aspecto, se describen a continuaci6n dos casos extremos.
El aciclovir, utilizado para tratar las infecciones por virus herpes simplex (VHS), es
facilmente la droga antiviral mas ampliamente empleada. Esto es particularmente cier-
to en el caso del herpes genital, que causa ulceras genitales dolorosas y recurrentes. Se
calcula que en los Estados Unidos sufren este proceso 40 a 60 millones de personas.
Afortunadamente, la resistencia al aciclovir surge con poca frecuencia. Esto se debe en
lnfecci6n
parte a la elevada fidelidad con que se copia el ADN genomico de VRS (Capitulo 3).
Los siguientes mecanismos conducen a una resistencia al aciclovir:
• Mutantes del gen VRS pol, que no incorporan aciclovir.
• Mutantes de la timictina kinasa (TK), en los que la actividad TK esta ausente (TK-) o
disminuida, o muestra una especificidad de sustrato alterada.
Por extrai:lo que parezca, es posible encontrar en aislados clinicos de VHS mutacio-
nes que dan Iugar a estos fenotipos con una frecuencia entre I0- 3 y 10-4. La discrepancia
entre este dato y la frecuencia tan baja con la que se describen resistencias clinicas pro-
bablemente se deba a la observaci6n de que Ia mayorfa de los mutantes pol/TK parecen
ser atenuados (por ej., los mutantes TK- de VRS no se reactivan del estado latente).
Por el contrario, el tratamiento con azidotimidina (AZT) de la infecci6n por VIR es
mucho -menos efectivo. En individuos infectados por VIR no tratados, el AZT produce
un incremento en las cifras de celulas CD4+ en un plaza de 2 a 6 semanas. Sin embar-
go, este efecto beneficioso es transitorio; tras 20 semanas, los recuentos de celulas T
CD4+ generalmente revie1ien a las cifras iniciales. Esto se debe, en parte, al desarrollo
a resistencia al AZT en las poblaciones VIR tratadas y ala toxicidad del AZT sabre la
hematopoyesis, ya que el indice quimioterapeutico del AZT es mucho peor que el del
aciclovir. La resistencia al AZT se inicia por la adquisici6n de una mutaci6n en el
codon 215 del gen de la transcriptasa inversa (TI) del VIR. En conjunci6n condos a
tras mutaciones adicionales en el gen TI se desarrolla un fenotipo de resistencia com-
pleta al AZT. Tras 20 semanas de tratamiento, el 40 al 50% de los pacientes con VIR
tratados desarrollan al menos dos de estas mutaciones. Esta alta frecuencia se debe a la
naturaleza propensa al error de la transcripci6n inversa (Capitulo 3). Debido al eleva-
do numero de genomas de VIR que estan replicandose en los pacientes infectados
(Capitulo 7), continuamente se producen errores. Se ha demostrado que las mutacio-
nes que confieren resistencia ya se encuentran en las poblaciones de virus no tratadas.
Por tanto, el tratamiento con AZT- no causa, sino que simplemente selecciona los virus
resistentes del conjunto total. Con otras drogas inhibidoras de la TI, como la didanosina
(ddi), se puede desarrollar un fenotipo resistente por el cambia de un solo par de bases,
pero la ddl tiene un indice terapeutico mas bajo que el AZT y niveles relativamente
bajos de resistencia pueden hacer a esta droga ineficaz. No obstante, algunas combina-
ciones de mutaciones de resistencia pueden dificultar la replicaci6n del VIR y la resis-
tencia a un inhibidor de la TI puede contrarrestar la resistencia a otro. La estrategia
actual en la terapeutica de las infecciones por VIR se conoce como TARGA (terapeu-
tica anti-retroviral de gran actividad) y emplea combinaciones de diferentes drogas, tal
como un inhibidor de Ia proteasa mas dos nucle6sidos inhibidores de la TI. Cuando se
disefian los regimenes de combinaciones son importantes los mecanismos moleculares
de resistencia y las interacciones entre las drogas:
• Combinaciones tales como AZT + ddl o AZT + 3TC tienen patrones antagonistas
de resistencia y son eficaces.
• Combinaciones tales como ddC + 3TC que muestran resistencia cruzada deben
evitarse.
Principios de virologia molecu lar
RESUMEN
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CAPiTULO 7
PATOGENESIS
La infeccion vfrica causa una variedad de cambios que son detectables mediante el
examen visual o bioquimico de las celulas infectadas. Estos cambios son el resultado
de la produccion de proteinas y de acidos nucleicos viricos, pero tambien de las altera-
ciones de las capacidades biosinteticas de las celulas. El parasitismo intracelular de los
virus secuestra componentes celulares como los ribosomas y las materias primas que
normalmente se dedicarian a sintetizar moleculas necesarias para las celulas. Las celu-
las eucariotas tienen que llevar a cabo una sintesis constante de macromoleculas, tan-
to si estan creciendo y dividiendose como si estan en estado de inactividad. Una celula
en crecimiento claramente necesita sintetizar mas proteinas, mas acidos nucleicos y
mas de toda una miriada de componentes para incrementar su tamaiio antes de dividir-
se; sin embargo existe un requerimiento mucho mas fundamental para esa actividad.
La funcion de todas las celulas es regulada por la expresion controlada de su informa-
cion genetica y la posterior degradacion de las moleculas producidas. Dicho control
depende de un delicado y dinamico balance entre sintesis y degradacion, que determi-
na los niveles intracelulares de todas las moleculas importantes en la celula. Esto es
particularmente cierto en el control del ciclo celular, que determina el comportamiento
de las celulas en division (ver Transformacion celular por virus ADN, mas adelante).
En terminos generales, en las celulas infectadas por virus pueden ser reconocidos va-
rios cambios fenotipicos comunes. Estos cambios se denominan a menudo efectos
citopaticos (e.c.p. ) del virus, e incluyen:
• Forma alterada: Las celulas adherentes que normalmente estan pegadas a otras
celulas (in vivo) o a un sustrato artificial (in vitro) pueden adoptar una morfologia
redondeada diferente de su apariencia aplanada normal. Son eliminados de Ia celu-
la los procesos de ampliacion (con extensiones de la superficie celular que semejan
zarcillos) implicados en la adhesion y la movilidad.
• Despegamiento del sustrato: Para las celulas adherentes, esta es la fase de dafio
celular que sigue a la anterior. Ambos efectos son causados por la degradacion
parcial o la disrupcion del citoesqueleto, que normalmente es responsable de man-
tener la forma de la celula.
• Lisis: Este es el caso mas extremo, cuando la celula entera se rompe. Se pierde la
integridad de la membrana, y la celula se puede hinchar por la absorcion de liqui-
dos extracelulares y finalmente estalla. Este es un caso extremo de daiio celular, y
es importante tener en cuenta que no todos los virus inducen este efecto, aunque
puedan causar otros efectos citopaticos. La lisis es beneficiosa para un virus en el
sentido de que constituye un metoda de liberar nuevas particulas viricas de una
celula infectada, sin embargo, existen vias alternativas para lograr esto, como la
liberacion por gemacion (Capitulo 4).
• Fusion de membranas: Las membranas de las celulas adyacentes se fusionan, dando
Iugar a una masa de citoplasma que contiene mas de un nucleo, conocida como
sincitio o, dependiendo del numero de celulas que se fusionan, una celula gigante.
Las celulas fusionadas tienen una vida corta y posteriormente se lisan; aparte de los
Principios de virologia molecular
efectos directos del virus, no pueden tolerar mas de un nucleo no sincronizado por
celula.
• Permeabilidad de membranas: Diversos virus causan un aumento en la permeabi-
lidad de membranas, permitiendo la entrada de iones extracelulares como el sodio.
La traducci6n de algunos ARNm viricos es resistente a altas concentraciones de
iones de sodio, permitiendo la expresi6n de genes viricos a expensas de mensajeros
celulares.
• Cuerpos de inclusion: Estas son areas de la celula en las que se han acumulado
componentes viricos. Se trata frecuentemente de sitios de ensamblaje de viriones y
algunas inclusiones celulares consisten en acumulos cristalinos de particulas viricas.
No esta claro si estas estructuras dafian ala celula, pero frecuentemente estan aso-
ciadas a virus que causan !isis celular, como los herpesvirus y el virus de la rabia.
• Apoptosis: La infecci6n virica puede activar la apoptosis («muerte celular progra-
mada» ), un mecanismo altamente especifico implicado en el crecimiento normal y
el desarrollo de los organismos (ver Capitulo 6).
En algunos casos se conoce una gran cantidad de detalles sobre los mecanismos
moleculares del dafio celular. Algunos virus que causan lisis celular muestran un fen6-
meno conocido como «apagado» (en ingles, «shutoff>>) al principia de la infecci6n.
Este «apagado» es el repentino y dramatico cese de la mayoria de la sintesis
macromolecular de la celula hospedadora. En celulas infectadas por poliovirus, el apa-
gado es el resultado de la producci6n de la proteina virica 2A. Esta molecula es una
proteasa que digiere el componente p220 de eiF-4F, un complejo de proteinas necesa-
rio para la traducci6n dependiente de caperuza («cap») de los ARNs mensajeros en los
ribosomas. Debido a que el ARN de los poliovirus no tiene una una caperuza metilada
en el extremo 5', pero esta modificado por la adici6n de la proteina VPg, el ARN virico
continua siendo traducido. En las celulas infectadas por poliovirus se puede observar
la disociaci6n de los ARNm y los polirribosomas del citoesqueleto, y esta es la raz6n
de la incapacidad de !a celula de traducir sus propios mensajeros. Unas pocas horas
despues del cese de la traducci6n, se produce la lisis celular.
En otros casos, el cese de la sintesis molecular es el resultado de diferentes meca-
nismos moleculares. De muchos virus no se conoce la secuencia de sucesos que se
producen. En el caso de los adenovirus, la proteina del pent6n (parte de la capside
virica) tiene un efecto t6xico sobre las celulas. Aunque se desconoce la acci6n precisa
que tiene sobre las celulas, la incorporaci6n de proteina del pent6n purificada a celulas
en cultivo provoca su muerte rapida. La producci6n de toxina por bacterias pat6genas
es un fen6meno corriente, pero este es el unico caso bien establecido de una molecula
codificada por un virus con una acci6n similar a una toxina*. Sin embargo, algunos de
los componentes normales de las celulas liberados por la !isis pueden tener efectos
t6xicos sobre otras celulas, y los antigenos que no son reconocidos como «propios»
* N. del T.: Recientemente se ha descrito tambien en rotavirus que Ia proteina virica no estructural NSP4
acrua como una enterotoxina.
Patogemes is
por el cuerpo (por ej., proteinas nucleares) pueden causar activacion inmunitaria e
inflamacion. La protefna E3-11.6K de adenovirus se sintetiza en pequefias cantidades
desde el promotor E3 en las etapas tempranas de la infeccion, y en grandes cantidades
desde el promotor principal tardio en las etapas tardias de la infeccion (Capitulo 5).
Recientemente se ha demostrado que E3-11.6K es necesaria para la !isis de las celulas
infectadas por adenovirus y la liberacion de particulas viricas desde el nucleo.
La fusion de membrana es el resultado de la accion de proteinas de codificacion
virica necesarias para la infeccion de las celulas (ver Capitulo 4), caracteristicamen-
te, las glicoproteinas de los virus envueltos. Uno de los mejores ejemplos conocidos
de tales proteinas precede del virus Sendai (un paramixovirus), que se ha utilizado
para inducir fusion celular durante la producci6n de anticuerpos monoclonales (Ca-
pitulo 1). Al menos 9 de las 11 glicoproteinas conocidas de virus herpes simplex
(VHSNHH-1) han sido caracterizadas en relacion con su papel en la replicaci6n viral.
Varias de estas proteinas estan implicadas en la fusion de la envuelta del virus con la
membrana celular y tambien en la penetracion en la celula. La producci6n por fusio-
nes celulares de sincitios es una caracteristica de la infeccion por VHS.
Otro virus que causa fusion celular es el virus de la inmunodeficiencia humana
(VIH). La infecci6n de las celulas CD4+ con algunos, pero no con todos los aislados de
VIH, causa fusion de celula con celula y la produccion de sincitios o celulas gigantes
(Figura 7.1). La proteina responsable de esto es Ia glicoproteina transmembrana de la
envuelta del virus (gp41), y se ha identificado por analisis genetico molecular al domi-
nic situado cerca del extreme amino-terminal como el responsable de esta actividad
fusogenica. Debido a que el VIH infecta celulas CD4+ y Ia disminucion en el numero
de estas celulas cruciales del sistema inmunol6gico es el defecto mas obvio en el SIDA,
inicialmente se crey6 que la destrucci6n directa de estas celulas por el virus era Ia base
de la patogenesis del SIDA. Aunque Ia muerte directa por VIH se produce induda-
blemente in vivo, ahora se piensa que la patogenesis del SIDA es considerablemente mas
compleja (ver Virus e inmunodeficiencia, a continuaci6n). Muchos retrovirus animales
tambien causan muerte celular y, en la mayoria de los casos, parece que la proteina de la
envuelta del virus es necesaria, aunque puede haber mas de un mecanisme implicado.
VIRUS E INMUNODEFICIENCIA
CD4
l
sin infectar porVIH
UNION
l FUSION
Sincitio
Figura 7.1 Mecanismo de fusion celular inducida por Vlli. La glicoproteina de Ia envuelta del virus,
que juega un papel en las particulas viricas en Ia union al receptor y la fusion de membrana, se expresa
en Ia superficie de las celulas infectadas. Las celulas CD4+ no infectadas que entran en contacto con
estas celulas infectadas se fusionan juntas para formar un sincitio multinucleado.
Todavia no esta claro que proporcion de la patologia del SIDA esta causada direc-
tamente por el virus y que proporcion se debe al sistema inmunitario. Se han sugerido
muchos modelos para explicar como causa inmunodeficiencia el VIH. Estos mecanis-
mos no son mutuamente excluyentes y realmente es probable que la perdida subyacen-
te de celulas CD4+ en el SIDA sea multifactorial, como se describe despues.
Diversidad antigenica
I ' - 1
0 2 4 6 8 10
Tiempo tras Ia infecci6n (afios)
Celulas CD4•
I I
0 2 4 6 8 10
Tiempo tras Ia infecci6n (afios)
Figura 7.2 Teoria del umbral de la diversidad antigenica en la patogenesis del SIDA. Cada linea de la
grafica superior muestra la abundancia relativa (te6rica) de una cepa individual de VIH (tipo antigenico)
en un solo caso de SIDA. La grafica inferior muestra la carga vfrica total (es decir, el numero total de
cepas VIH) y las cifras de celulas CD4+ predichas por un modelo infonnatico.
Principios de virologfa molecular
Anergia de celulas T
Apoptosis
lnduccion
tat Aumento de la sintesis de FasL; expresi6n reprimida de super6xido dismutasa
dependiente de manganeso; activaci6n de kinasas dependientes de ciclina
Represion
tat Inducci6n de Bcl-2
vpr Supresi6n de la actividad del factor de transcripci6n NF-KB
Superantlgenos
Disbalance Th1/Th2
~
=------------ ~
=-------
MHCII MHCII
Antigeno Superantigeno
Va v~ Va v~
Receptor de celula T Receptor de celula T
Ca c~ Ca c~
-------= CELULA T
=-------- .--------:::'
CELULA T
-------
Mecanismo normal de presentaci6n El superantigeno hace un «cortocircuito»
de antigeno en el mecanismo normal de presentaci6n
del antigeno
puesta de celulas Thl, que son efectivas en el control (pero no en la eliminacion) del
virus. En un momenta determinado se produce una perdida (relativa) de la respuesta
Thl y entonces predominan las celulas Th2 en la respuesta al VIH. Se ha descrito que
al menos algunas variantes del virus pueden inhibir Ia respuesta de LTCs al VIH. La
hipotesis era que, por tanto, Ia respuesta dominante Th2 humoral, no seria efectiva en
mantener a un bajo nivel Ia replicacion del VIH, y la carga viral se incrementaria,
causando el SIDA. Aunque esta era en gran medida una propuesta teorica, esta inter-
pretacion condiciona nuestra idea de Ia respuesta inmunitaria frente a muy distintos
patogenos, no solo al VIH. Ningun estudio experimental, sin embargo, ha demostrado
un cambia real del patron Thl a Th2 de expresion y secrecion de citoquinas que se
asocia a la progresion de la enfermedad, por lo que no existe una evidencia demostrada
de Ia implicacion de este mecanismo en el SIDA.
Macr6fago
Respuesta
celular
IFNy
Celula NK
frV..
~
Celula T CD4• naive
Celula T inmadura yo ~ ---+----- - -
Celula presentadora
Monocito ® !L-4 j
rry
~
IL-4
IL-5
!L-6
_IL-_1o
_
de antigeno (CPA)
_. Respuesta
humoral
'0:}) TH2
Bas6filo «:])
Figura 7.4 Regulaci6n de las respuestas inmunitarias celular y humoral. IFN, interferon; IL,
interleuquina; Th, celula T-helper o colaboradora.
cia del VIH es necesaria para el desarrollo del SIDA, y que es vital que la diseminaci6n
a nivel mundial de la infecci6n por VIH sea controlada. La labor por desarrollar vacu-
nas anti-VIR esta en marcha, pero debido a la compleja biologia del virus se esta
demostrando que son extraordinariamente dificiles de conseguir. Resulta de vital im-
portancia un mejor conocimiento de la patogenesis del SIDA y, en particular, del papel
que juega el sistema inmunol6gico en las etapas iniciales de la enfermedad, para per-
mitir el desarrollo de terapias mas apropiadas para el SIDA. La terapia anti-retroviral
de gran actividad (TARGA; ver Capitulo 6) tiene un efecto espectacular sabre la supre-
si6n de la producci6n de virus y restaura temporalmente las poblaciones de celulas
CD4+. Desafortunadamente, debido ala larga vida media de las celulas infectadas, el
tiempo que se estima necesario para erradicar al VIH del organismo es aproximada-
mente de 12 a 60 afios; algo que no resulta alcanzable actualmente debido a los fallos
de la terapia por la toxicidad de las drogas y la resistencia viral.
INFECCION
Producido par el virus Producido inmuno/6gicamente
~ ~
DaFio celular I . - - 1- - - - - - - ,
. DaFio celular
l
t Permeabilidad capilar
l
Deshidrataci6n I _, Hipovolemia
l
SHOCK
/I -- !,,--A-ci-do-s-is-,a-n-o-xi-a--,
SSD tras la infeccion primaria por el virus del dengue ocurren aproximadamente en 1
cada 14.000 y en 1 cada 500 pacientes, respectivamente; no obstante, tras infecciones
secundarias por el virus del dengue, Ia incidencia de la FHD es de 1 en 90 y del SSD de
1 en 50 pacientes, ya que los anticuerpos con reactividad cruzada frente al virus pero no
neutralizantes estan ya presentes. Estas cifras ilustran los problemas de la infeccion cru-
zada con diferentes serotipos del virus del dengue, y las dificultades que se han de afron-
tar para desarrollar una vacuna segura contra el virus. El virus del dengue se comenta
mas adelante en este capitulo (ver la seccion de Virus nuevos y emergentes).
Otra situacion en la que vacunas antivirales han causado un incremento en la pato-
logia en vez de una prevencion de la enfermedad es la aparicion del sindrome de Reye
post-vacunal. El sindrome de Reye es un trastomo neurologico consistente en edema
agudo cerebral que ocurre casi exclusivamente en nifios. Es bien conocida como una
complicacion rara tras la infeccion por diversos virus, pero mas habitualmente por
virus influenza y virus varicela-zoster (VVZ). Los sintomas incluyen vomitos frecuen-
tes, intensas cefaleas, cambios de conducta, astenia extrema y desorientacion. Las po-
sibilidades de contraer el sindrome de Reye se incrementan si se administra aspirina
durante el comienzo de la enfermedad. Se desconocen por completo las bases de la
patogenesis de esta enfermedad, pero algunos de los casos mas desgraciados se han
producido tras la administracion de vacunas experimentales frente al virus influenza.
El sindrome de Guillain-Barre es una enfermedad igualmente misteriosa en la que
la desmielinizacion de los nervios causa paralisis parcial y debilidad muscular. El co-
mienzo del sindrome de Guillain-Barre sigue generalrnente a una infeccion aguda de
tipo virico, pero nunca se ha asociado firmemente un agente a esta enfermedad. La
enfermedad de Kawasaki es similar al sindrome de Reye en que aparece en nifios, pero
se diferencia en que provoca una grave lesion cardiaca. Igual que el sindrome de
Guillain-Barre, la enfermedad de Kawasaki parece que surge tras infecciones agudas.
La enfermedad misma no es infecciosa, pero parece presentarse en forma de epide-
mias, lo que sugiere que la causa sea un agente infeccioso. Se ha propuesto un gran
numero de patogenos bacterianos y viricos que podrian estar asociadas con la indue-
cion de !a enfermedad de Kawasaki, pero tam bien se desconoce la causa subyacente de
esta patologia. Parece como que la propia infeccion aguda, mas que un patogeno deter-
minado, es la responsable de la aparicion de estas enfermedades.
En los ultimos afios se ha llevado a cabo la busqueda de un agente responsable de
una enfermedad nueva denominada sindrome de fatiga cronica (SFC) o encefalomielitis
mialgica (EM). A diferencia de las patologias antes descritas, el SFC es una enferme-
dad mal definida que no es aceptada por todos los medicos. Algunas investigaciones
recientes han descartado la idea de que el VEB pueda causar el SFC, pero se ha suge-
rido una diversidad de otras causas posibles, incluyendo otros herpesvirus, enterovirus
y retrovirus. Algunos informes han propuesto que la infeccion por el virus del saram-
pion antes del desarrollo de una madurez inmunologica completa (es decir, antes de los
2 afios de edad) puede estar asociada a colitis ulcerosa y enfermedad de Crohn. Esta
idea es verosimil, ya que el virus del sarampion puede infectar y persistir en celulas
endoteliales en el tracto gastrointestinal y causar una respuesta inmunitaria con forma-
cion de celulas gigantes; sin embargo, hay que conseguir mas evidencias para que esto
Patogenesis
~Pueden los bacteriOfagos, virus que son solo capaces de infectar a celulas
procarioticas, desempefiar un papel en las enfermedades humanas? Sorprendentemente,
la respuesta es afirmativa. Las cepas de Escherichia coli productoras de toxina de
Shiga (Stx) (ECTS) son capaces de producir enfermedades intestinales transmitidas
por alimentos, como diarrea y colitis hemomigica. El serotipo 0157:H7 de E. coli
enterohemomigico, elllamado «microbia de las hamburguesas», ha despertado mucho
interes en los ultimos afios. Las infecciones por ECTS pueden conducir a complicacio-
nes fatales, como el sfndrome hemolitico-uremico, asf como a trastomos neurol6gicos.
Las principales caracterfsticas de virulencia de estas cepas de bacterias son su capaci-
dad de colonizar el intestino (un rasgo natural de E. coli) y de producir y secretar
«toxinas de Shiga», que pueden lesionar las celulas endoteliales y tubulares y provocar
un fracaso renal agudo. Al menos 100 serotipos diferentes de E. coli producen toxinas
Stx, y las bacterias ECTS se encuentran frecuentemente en el intestino del ganado
bovina y de otros animales domesticos como ovejas, cabras, cerdos y caballos. Se
puede producir la contaminaci6n fecal de la came, generalmente en el momenta del
sacrificio. La came picada como la de las hamburguesas es particularmente peligrosa,
ya que la contaminacion bacteriana superficial se convierte en profunda en el interior
de la came, donde no puede ser inactivada por la coccion.
~Que tiene esto que ver con los bacteri6fagos? Se conocen varios tipos de Stx, que
se clasifican en dos tipos principales: toxina Shiga 1 (Stxl) y toxina Shiga 2 (Stx2).
Los genes de las toxinas Stx 1 y Stx2 son codificados por el genoma de profagos
lisogenicos parecidos a lambda introducidos en la bacteria. Es sabido que estimulos
como la luz UV o la mitomicina C inducen a estos profagos a liberar cosechas de
particulas fagicas que pueden infectar y lisogenizar otras bacterias susceptibles en el
intestino, lo que causa la alta prevalencia de bacterias ECTS (hasta el 50% del ganado
en algunas explotaciones). Se ha demostrado en estudios recientes que el escandaloso
y excesivo uso de los antibi6ticos como «promotores del crecimiento» en la cria de
animales de granja, e incluso el tratamiento con antibi6ticos de personas con infeccio-
nes, puede estimular la producci6n de partfculas fagicas y contribuye al incremento en
la prevalencia de bacterias ECTS yen el numero de victimas mortales humanas. Otros
detenninantes de virulencia bacteriana tambien son codificados por fagos lisogenicos
(por ej., la toxina difterica, las toxinas eritrogenicas de Streptococcus, las enterotoxi-
nas de Staphylococcus), aunque las presiones selectivas que mantienen estos procesos
nose conocen todavia. Los datos que se van obteniendo de las secuencias de genomas
bacterianos indican claramente que los fagos han sido responsables de la diseminaci6n
de los determinantes de virulencia en una amplia gama de pat6genos.
Principios de virologia molecular
La otra area en la que los bacteri6fagos pueden influir en las enfermedades huma-
nas es la bacteriofagoterapia; el uso de bacteri6fagos como antibi6ticos. Esta no es una
idea nueva, pues los experimentos iniciales fueron realizados (sin exito) al poco tiem-
po del descubrimiento de los bacteri6fagos hace casi 100 afios (Apendice 3); sin em-
bargo, con el desarrollo progresivo de resistencias de las bacterias a los antibi6ticos y
la aparici6n de «supermicrobios» inmunes a todos los tratamientos, el interes por esta
idea ha experimentado un resurgimiento. Aunque atractiva en teoria, esta estrategia
adolece de una serie de defectos:
• Los bacteri6fagos son bastante especificos en su empleo de receptores y por tanto
en las cepas de bacterias que pueden infectar; por tanto, son agentes antibacterianos
de «espectro reducido».
• Las bacterias expuestas a los bacteri6fagos desarrollan rapidamente resistencia a la
infecci6n reduciendo la expresi6n o mutando el receptor del fago.
• La liberaci6n de endotoxinas como consecuencia de la intensa lisis de bacterias en el
organismo puede producir un shock t6xico.
La administraci6n reiterada de bacteri6fagos resulta en una respuesta inmunitaria
que neutraliza las particulas fagicas antes de que puedan actuar.
Podria ser, sin embargo, que esta resultase ser una terapia util para ciertas infeccio-
nes bacterianas que no pueden ser tratadas por metodos convencionales. Recientemen-
te se ha demostrado que unos anticuerpos producidos por bioingenieria pueden ser
dirigidos al cerebro por vectores fagicos, y esta nueva estrategia esta siendo explorada
para el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer y de la adicci6n a la cocaina.
Tipo Ejemplo
Proteinas G asociados a membrana e-ras: tres hom6logos diferentes del gen e-ras, cada
(seiial de transduce ion) uno identificado en un tipo diferente de tumor
y transducido por un retrovirus diferente
Tiempo Eficacia
de formacion en Ia formacion
Tipo de virus del tumor del tumor Tipo de oncogen
• Genes reparadores del ADN: Estos genes aseguran que cada cadena de informa-
cion genetica sea copiada fielmente durante la division de la celula en su ciclo
celular. Las mutaciones en estos genes conducen a un incremento en la frecuencia
de otras mutaciones (por ej., en enfermedades como la ataxia-telangiectasia y el
xeroderma pigmentoso ).
La funcion de los productos de los oncogenes depende de su localizacion celular
(Figura 7.6). Varias clases de oncogenes se asocian con el proceso de transduccion de
sefial; la transferencia al nucleo de la informacion resultante de la union de ligandos
extracelulares a receptores celulares (Figura 7.7). Muchas de las kinasas en estos gru-
pos tienen un tipo comun de estructura con dominios funcionales conservados presen-
tes en las regiones transmembrana hidrofobica e intracelular hidrofilica (Figura 7.8).
Estas proteinas se asocian con las membranas celulares o se encuentran en el citoplas-
ma. Otras clases de oncogenes localizados en el nucleo estan normalmente encargados
del control del ciclo celular (Figura 7.9). Los productos de estos genes vencen lares-
triccion entre las fases G 1 y S del ciclo celular, que es el momento clave de control que
previene la division celular descontrolada. Algunos oncogenes viricos no son suficien-
tes por si solos para producir un fenotipo completo de celula transformada; no obstan-
te, en algunos casos pueden cooperar con otro oncogen con funcion complementaria
para producir el fenotipo transformado completo; por ejemplo, el gen ElA de adenovi-
rus mas el gen ElB o el gen e-ras transforma las celulas NIH3T3 (una linea celular de
fibroblastos de raton). Esto ultimo subraya el hecho de que la oncogenesis es un proce-
so complejo, en multiples etapas.
Principios de virologia molecular
Oncogenes nucleares
reguladores de Ia transcripci6n,
reguladores del ciclo celular
No todos los retrovirus son capaces de transformar celulas; por ejemplo, los lentivirus
como el VIH no transforman celulas, aunque son citopaticos. Los retrovirus que pueden
transformar celulas se clasifican en tres grupos: transductores, activadores en cis y
activadores en trans. Las caracteristicas de estos tres grupos se muestran en la Tabla 7.4.
Si hay oncogenes en todas las celulas, wor que la transformaci6n ocurre como resultado
de una infecci6n virica? La causa es que los oncogenes pueden ser activados de una de
dos maneras, bien por cambios sutiles de la estructura normal del gen o por interrupci6n
del control normal de la expresi6n. Los genes transformantes de los retrovirus transfer-
mantes agudos (v-anes) se derivan de los genes c-ones, con los que tienen una alta
homologia, y se piensa que han sido transducidos por virus; sin embargo, la mayoria de
los v-anes poseen ligeras alteraciones respecto a sus progenitores c-ones. Muchos con-
tienen pequefias modificaciones en Ia secuencia que alteran Ia estructura y Ia funci6n de
la oncoproteina producida. Otros contienen pequefias deleciones de parte del gen. La
mayoria de las oncoproteinas de los retrovirus transformantes agudos, defectives en re-
plicaci6n, son proteinas de fusion, que contienen secuencias adicionales derivadas de
genes viricos, comunrnente secuencias del gen gag en el extrema amino-terminal de la
proteina. Estas secuencias adicionales pueden alterar la funci6n de la localizaci6n celu-
lar de la proteina, y estas anomalias generan Ia transforrnaci6n .
Patog€mesis
Factor de crecimiento
Mensajero
intracelular
\ Proteina diana \
OJ ------------ ~
ViaAMPc Via Ca 2+
Altemativamente, los virus pueden causar una expresi6n anormal de una oncopro-
teina no alterada. Esto podria suceder por sobreexpresi6n de un oncogen bajo el con-
trol de un promotor virico en vez de bajo su promotor celular normal, o bien puede ser
la expresi6n temporal inapropiada de una oncoproteina que trastoma el ciclo celular.
Los genomas de retrovirus transformantes cr6nicos no contienen oncogenes. Estos
virus activan c-ones por un mecanisme conocido como activaci6n insercional. Un
provirus que se integra en el genoma celular proximo a una secuencia c-one puede
activar indirectamente la expresi6n del gen, de un modo analogo a aquel por el que los
v-anes han sido activados por transducci6n (Figura 7.10). Esto puede ocurrir si el
provirus se integra por delante del gen c-one, que podria ser expresado por media de
una transcripci6n a traves del genoma virico mas las secuencias siguientes; sin embar-
go, la activaci6n insercional puede suceder tambien cuando un provirus se integra
despues de una secuencia c-one o por delante, pero en orientaci6n invertida. En estos
casos, la activaci6n es el resultado de elementos potenciadores («enhancers») en el
Principios de virologfa molecular
Membrana
celular
,._ Acido miristico
H2N -
src ICOOH
0 Dominios
transmembrana H gag I yes I
Dominio de 250
Hgag 1 Actina fgr I (f)
H I "'
I mos I J :.;;:
"'c
-~
(f)
Figura 7.8 Familia de las proteina kinasas de retrovirus implicadas en Ia transformaci6n. Muchas de
estas moleculas son proteinas de fusion que contienen secuencias amino-tenninales derivadas del gen
gag del virus. La mayo ria de este tipo contiene el acido graso miristato, que se afiade a! extremo N-tenninal
de Ia proteina tras su traducci6n, y que ancla Ia proteina a Ia superficie intema de Ia membrana citoplas-
matica de Ia celula hospedadora. En ciertos casos, se ha demostrado que esta modificaci6n post-
traduccional es esencial para Ia acci6n transformante de Ia proteina.
F~_D_IV_IS_Io_· N_-'
p53
Rb
Figura 7.9 Diagrama esquematico mostrando las fases del ciclo celular eucari6tico.
Patogenesis
.JII ..
Provirus c-one
Provirus c-one
c-one Provirus
-
•
Figura 7.10 Mecanismos por los que los oncogenes celulares pueden ser transcripcionalmente activa-
dos por mutagenesis insercional de retrovirus.
promotor viral (Capitulo 5). Estos pueden actuar incluso cuando el provirus se integra
a una distancia de varias kilobases del gen c-one. Los ejemplos mas conocidos de este
fenomeno suceden en pollos, en los que la insercion del virus de la leucosis aviar
(avian leukosis virus, ALV) activa el gen myc, y en ratones, en los que la insercion del
virus del tumor mamario del raton (mouse mamma1y tumour virus, MMTV) activa el
gen int.
La transformacion por el tercer tipo de retrovirus se produce por un mecanismo
bastante diferente. El virus de la leucemia de celulas T humanas (VLTH) (human T-cell
leukaemia virus, HTLV) y algunos virus relacionados de animales codifican una pro-
teina activadora de la transcripcion en el gen viral tax. La proteina Tax actlia en trans
estimulando la transcripcion desde el LTR del virus. Se cree que la proteina activa
tambien la transcripcion de muchos genes celulares por su interaccion con factores de
transcripcion (Capitulo 5); sin embargo, la oncogenesis por VLTH (es decir, la forma-
cion de un proceso leucemico) tiene un periodo de latencia de 20 a 30 a:fios. En conse-
cuencia, la transformacion celular (que se puede reproducir in vitro) y la formaci on de
un tumor (que no se puede) no son la misma cos a; se necesitan acontecimientos adicio-
nales para el desarrollo de una leucemia. Se cree que para que se produzca un proceso
maligno son tambien necesarias las anomalias cromosomicas que pueden producirse
Principios de virologia molecular
A diferencia de lo que sucede con los oncogenes de los retrovirus, los genes trans-
formantes de los virus de ADN productores de tumores no tienen hom6logos celulares.
Algunas familias de virus conADN son capaces de transfonnar celulas (Tabla 7.5). En
terminos generales, las funciones de sus oncoproteinas son mucho menos diversas que
las de las codificadas por los retrovirus. Son principalmente proteinas nucleares impli-
cadas en el control de la replicaci6n del ADN que directamente afectan al ciclo celular.
Logran sus efectos interactuando con proteinas celulares que normalmente parecen
tener un efecto regulador negativo de la proliferaci6n celular. Dos de las proteinas
celulares mas importantes implicadas son conocidas como p53 y Rb.
p53 fue originahnente descubierta en virtud del hecho de que forma complejos con
el antigeno T de SV40. Ahara sabemos que tambien interactUa con oncoproteinas de
otros virus ADN, incluyendo las de los adenovirus y los papilomavirus. El gen que
codifica p53 se ve alterado o mutado en la mayoria de los tumores, lo que implica que
la perdida del producto genico normal se asocia con la aparici6n de celulas transfonna-
das con malignidad. Cuando se inyectan las celulas tumorales con la proteina nativa
muestran in vitro una tasa disminuida de divisiones celulares y una tumorigenicidad
disminuida in vivo. Los ratones transgenicos que no poseen un gen p53 intacto se
desarrollan con nonnalidad pero son susceptibles a la formaci6n de tumores esponta-
neos; por lo tanto, esta clara que p53 juega un papel fundamental en el control del ciclo
celular. Se cree que es un supresor tumoral o un «anti-oncogen» y se le ha llamado «el
guardian del genoma». p53 es un factor transcripcional que activa la expresi6n de
algunos genes celulares, principalmente WAFl , que codifica una proteina que es un
inhibidor de las kinas as ciclina-dependientes G 1, causando la detenci6n del ciclo celu-
lar en la fase G 1 (Figura 7.9). Debido a que estos virus requieren la replicaci6n del
ADN celular para su propia propagaci6n, ello explica por que sus proteinas transfer-
mantes tienen como objetivo p53.
II '
Papilomavirus:
PVB-1 E5 receptor FCDP
PVH E6 p53
E7 Rb
Patogemesis
Rb se descubrio cuando se observo que el gen que codifica esta proteina esta siem-
pre dafiado o delecionado en un tumor del nervio optico conocido como retinoblastoma;
de ello se concluyo que la funcion normal de este gen es tambien la de un supresor
tumoral. La proteina Rb forma complejos con un factor de transcripcion llamado E2F.
Este factor se necesita para la transcripcion de genes de adenovirus, pero E2F participa
tambien en la transcripcion de genes celulares que conducen a celulas en reposo a la
fase S. La formacion de complejos inactivos E2F-Rb tiene el mismo efecto general que
la accion de p53; la detencion del ciclo celular enGl. La liberacion de E2F por susti-
tucion de complejos E2F-Rb con complejos E1A-Rb, antigeno T-Rb o E7-Rb estimula
la replicacion de ADN celular y virico.
El antigeno T de SV40 es una de las proteinas viricas descritas que se unen a p53.
En el Capitulo 5 se describe el papel del antigeno T mayor en la regulacion de la
transcripcion de SV40. La infeccion de las celulas por SV40 o por otros poliomavirus
puede dar Iugar ados resultados:
• Infeccion productiva (litica).
• Infeccion no productiva (abmiiva).
El resultado de la infeccion parece estar determinado en primer Iugar por el tipo
celular infectado; por ejemplo, el poliomavirus del raton establece una infeccion litica
en celulas de raton, pero una infeccion abortiva en celulas de rata 0 de hamster, mien-
tras que SV40 provoca una infeccion litica en celulas de simio pero una infeccion
abortiva en celulas de raton. De todas formas, el antigeno T esta tambien implicado en
la replicacion del genoma ademas de en la transcripcion. La replicacion del ADN de
SV40 se inicia por la union del antigeno T mayor a la region origen del genoma (Figu-
ra 7.11 ). La funcion del antigeno T se controla mediante fosforilacion, que disminuye
la capacidad de la proteina de unirse al origen de SV40.
El genoma de SV40 es muy pequefio y no codifica toda la informacion necesaria
para la replicacion del ADN; por lo tanto, es esencial que la celula hospedadora entre
en fase S, cuando el ADN celular y el genom a virico se replican juntos. Las interaccio-
nes proteina-proteina entre el antigeno T y la ADN polimerasa a estimulan directa-
mente la replicacion del genoma viral. Se conocen todas las regiones exactas del antigeno
nn p105-RB
Uni6naiADN II
Pola, p53
I
1
ATPas a, union al ATP
I
L__________________~l 708
Helicasa
Figura 7.11 Regiones del antigeno T de SV40 implicadas en interacciones proteina-proteina. Se mues-
tran tambien otros dominios funcionales de la proteina que intervienen en la replicaci6n del ADN viral,
incluidos los dominios de Ia helicasa, Ia ATPasa y la seiial de localizaci6n nuclear (SLN).
Principios de virologia molecular
T que se unen al ADN, ala ADN polimerasa a, a p53 y aRb (Figura 7.11 ). La inactiva-
ci6n de proteinas supresoras de tumor unidas al antigeno T causa que las celulas deteni-
das en G 1 pasen a fase S y se dividan, y este es el mecanismo que provoca la transforma-
ci6n; no obstante, la frecuencia con que celulas infectadas abortivamente resultan trans-
formadas es baja (alrededor de 1 X w-5). Por lo tanto, la funci6n del antigeno T es alterar
el ambiente celular para permitir la replicaci6n del ADN virico. La transformaci6n es
una consecuencia rara y accidental del secuestro de proteinas supresoras de tumor.
Las proteinas inmediatas-precoces de adenovirus son amilogos en muchos aspectos
del antigeno T de SV40. E1A es un regulador transcripcional que actua en trans de los
genes precoces de adenovirus. Como el antigeno T, la proteina ElA se une a Rb,
inactivando el efecto regulador de esta proteina, permitiendo la replicaci6n del ADN
virico y, de forma accidental, estimulando la replicaci6n del ADN celular (ver antes).
EIB se une a p53 e intensifica los efectos de ElA. El efecto combinado de las dos
proteinas se puede observar en el fenotipo de las celulas transfectadas con ADN conte-
niendo estos dos genes (Tabla 7.6). No obstante, la interacci6n de estas proteinas con
la celula es mas complicada que la simple inducci6n de sintesis de ADN. La expresi6n
de E1A sola causa que las celulas sufran apoptosis. La expresi6n combinada de EIA y
EIB vence esta respuesta y pennite a las celulas transformadas sobrevivir y crecer.
Las infecciones genitales por papilomavirus humanos (PVH) son muy comunes,
produciendose en mas del 50% de los adultos j6venes sexualmente activos, y general-
Trans-activaci6n
VHB Replicaci6n de c-one por el
~
L
Hepatoc1l0 ccn
Hepatoc1to
infectado transformaci6n
cr6nicamente maligna
Figura 7.12 Posibles mecanismos de formaci6n del carcinoma hepatocelular causado porIa infecci6n
por el virus de Ia hepatitis B.
Patogemesis
mente son asintomaticas. Algunos serotipos de PVH parecen estar asociadas con un
bajo riesgo de desarrollar posteriormente canceres anogenitales, como el carcinoma
cervical, tras un periodo de incubacion de varias decadas. Cada afio se diagnostican
500.000 casos nuevos de neoplasia cervical, haciendo que esta sea una de las tres
causas mas frecuentes a nivel mundial de muerte por cancer en mujeres. El PVH es una
causa fundamental del cancer cervical; el 93% de todos los canceres cervicales dan
positivo a uno o mas tipos de alto riesgo de PVH. De los 60 tipos de PVH reconocidos
actualmente solo cuatro de ellos parecen estar asociadas con un alto riesgo de forma-
cion de tum ores (VPH -16, 18, 31 y 45). De nuevo la transformacion esta mediada por
productos de genes precoces del virus; sin embargo, las proteinas transformantes va-
rian de un tipo de papilomavirus a otro, como se muestra en la Tabla 7.5. En terminos
generales, parece ser que dos o mas proteinas tempranas cooperan a menudo para dar
lugar a un fenotipo transformado. Aunque algunos papilomavirus pueden transformar
celulas por si solos (por ej., PVB-1) otros parecen requerir la cooperacion de un oncogen
celular activado (por ej., PVH-16/ras). En los papilomavirus bovinos, la proteina E5
es la responsable de la transformacion. En PVH-16 y PVH-8, las proteinas E6 y E7 son
las implicadas.
Para mayor confusion, en muchos casos se mantiene en las celulas tumorales
todo o parte del genoma de papilomavirus, incluidos los genes supuestamente trans-
formantes , mientras que en otros casos (por ej., PVB-4) el ADN del virus se puede
perder tras la transformacion, lo que puede indicar un posible mecanismo de «golpea
y corre» en la transformacion. Parece que distintos papilomavirus utilizan mecanis-
mos ligeramente diferentes para lograr la replicacion del genoma, por lo que la
tranformacion celular puede proceder de vias ligeramente diferentes. Es importante
que se alcance una mejor comprension de estos procesos. No existe una evidencia
clara de que los adenovirus o los poliomavirus participen en la formacion de tumores
humanos. Por el contrario, la evidencia de que los papilomavirus estan habitualmen-
te implicados en la formacion de carcinomas malignos de pene y de cuello uterino es
cada vez mas clara.
En los ultimos afios se ha tenido evidencia de que p53 y Rb son importantes sensores
celulares para la apoptosis. La perdida de estas proteinas activa la apoptosis, el princi-
pal mecanismo anti-cancer de las celulas; por tanto, los virus que interfieren con estas
proteinas han tenido que desarrollar mecanismos para contrarrestar su efecto (ver la
discusion en el Capitulo 6).
Principios de virolog fa molecular
VIRUS Y CANCER
del linfoma de Burkitt, el virus se ha encontrado en todos los tumores que se han
estudiado. Se piensa que algunos factores ambientales, como el consumo de
nitrosaminas en pescados en salaz6n, tambien participan en Ia formaci6n del CNF
(comparese con el papel de Ia malaria en Ia formaci6n dellinfoma de Burkitt).
• Linfomas de celulas B en individuos inmunosuprimidos (por ej., en pacientes de
SIDA).
• Algunas formas clonales de enfermedad de Hodgkin.
• Sindrome l:infoproliferativo asociado a X, una rara enfermedad que se observa usual-
mente en varones, en los que la infecci6n por VEB causa una respuesta hiperinmune,
causando a veces una forma fatal de fiebre glandular y a veces cancer de ganglios
linfaticos. Este sindrome es un defecto hereditario debido a un gen defectuoso en el
cromosoma X.
La transformaci6n celular por el VEB es un proceso complejo que implica las inte-
racciones cooperativas entre varias proteinas virales. Tres explicaciones posibles de Ia
relaci6n entre el VEB y el linfoma de Burkitt son:
1. VEB inmortaliza un gran nillnero de linfocitos B; simultaneamente, Ia malaria cau-
sa una inmunosupresi6n de celulas T. Existe por tanto una gran numero de celulas
diana en las que un tercer evento (por ej ., una translocaci6n cromos6mica) da como
resultado la formaci6n de una celula con una transformaci6n maligna. La mayoria
de los tumores de linfoma de Burkitt contienen translocaciones que afectan al cro-
mosoma 8, que ocasionan Ia activaci6n del gen c-myc, lo que apoya esta hip6tesis.
2. La malaria genera una activaci6n policlonal de celulas B. El VEB posteriormente
inmortaliza una celula que contiene una translocaci6n c-myc preexistente. Este me-
canismo seria practicamente indistinguible del anterior.
3. jEl VEB es simplemente un virus transeunte! Ellinfoma de Burkitt existe tambien
en Europa y Norteamerica, aunque es muy raro en estas regiones; no obstante, el
85% de estos pacientes no estan infectados por el VEB, lo cual implica que hay
otras causas para el linfoma de Burkitt.
Aunque nose ha demostrado formalmente, parece probable que bien (1) y/o (2) es
Ia verdadera explicaci6n del origen del linfoma de Burkitt.
Otro caso en el que un virus aparece asociado a Ia formaci6n de un tumor humano
es el VHB respecto al carcinoma hepatocelular (CHC). La hepatitis es una inflamaci6n
del higado y como tal no es una enfermedad simple. Debido al papel primordial que
desempefia el higado en el metabolismo, muchas infecciones virales pueden afectar al
higado, sin embargo, al menos siete virus infectan y dafian especificamente a los hepa-
tocitos. Ni siquiera dos de ellos pertenecen a la misma familia (ver Capitulo 8). El
VHB es el miembro prototipo de Ia familia Hepadnaviridae y causa Ia enfermedad
antiguamente conocida como «hepatitis serica». Esta enfermedad se distinguia clinica-
mente de Ia «hepatitis infecciosa» (causada por otros tipos de virus de hepatitis) en los
afios 30. La infecci6n por el VHB era antiguamente el resultado de Ia inoculaci6n con
suero humano (por ej ., transfusiones sanguineas, trasplantes de 6rganos), pero todavia
es comun entre adictos a drogas intravenosas, a los que se transmite por compartir
jeringuillas y agujas; no obstante, el virus tambien se transmite sexualmente, por in-
Principios de virologfa molecu lar
gesti6n oral y de la madre al nifio, lo que causa brotes familiares de infecci6n por
VHB . En los paises desarrollados se analiza actualmente toda donaci6n de sangre,
6rgano o tejido para VHB, y el riesgo de transmisi6n es extremadamente bajo. El virus
no se replica en cultivos celulares y su patogenesis ha sido motivo de intensas investi-
gaciones. La infecci6n por el VHB puede tener tres posibles resultados:
1. Una infecci6n aguda seguida de una recuperaci6n completa con imunidad frente a
la reinfecci6n (>90%).
2. Hepatitis fulminante, desanollada con rapidez y de corta duraci6n, causando fraca-
so hepatico y una mortalidad aproximadamente del 90% (<1% de los casos).
3. Infecci6n cr6nica, dando lugar al establecimiento del estado de portador con per-
sistencia del virus (aproximadamente 10% de casos).
Existen unos 350 millones de portadores cr6nicos de VHB en todo el mundo. La
pob1aci6n total del mundo es de 6.000 millones aproximadamente; por lo tanto alrede-
dor de un 5% de la poblaci6n mundial esta persistentemente infectada por el VHB.
Todos estos portadores cr6nicos del virus tienen un riesgo 100 a 200 veces mayor que
los no portadores de desarrollar CHC. El CHC es un tumor raro en Occidente, donde
representa <2% de los canceres fatales. La mayor parte de los casos que ocurren en
Occidente estan relacionados con el alcohol, y este es un dato importante respecto a la
patogenesis del tumor; sin embargo, en el Sudeste asiatico y en China, el CHC es el
cancer fatal mas comun, llegando a suponer alrededor de medio mi116n de muertes
cada afio. El virus podria originar la formaci6n del tumor por tres vias diferentes: acti-
vaci6n directa de un oncogen celular (o varios), trans-activaci6n de un oncogen celu-
lar (o de varios ), o indirectamente por via de la regeneraci6n tisular (Figura 7 .12).
Como con el VEB y ellinfoma de Burkitt, la relaci6n entre el VHB y el CHC no esta
totalmente clara:
• La cirrosis (un endurecimiento del higado que puede ser resultado de infecciones o
de la acci6n de varios t6xiyos, como el alcohol) parece ser un requisito previo para
el desarrollo de CHC. Parece ser que el dafio hepatico cr6nico induce regeneraci6n
tisular y que fallos en los mecanismos de reparaci6n del ADN provocan finalmente
una transformaci6n maligna. Otros virus no relacionados que causan hepatitis cr6-
nica activa, como el virus de Ia hepatitis C (VHC), un flavivirus, estan tambien
asociadas con la producci6n de CHC tras un largo periodo de latencia.
• Diversos cofactores, como aflatoxinas y nitrosaminas, pueden inducir tumores si-
milares al CHC en animales de experimentaci6n sin padecer infecci6n virica. Por
lo tanto, tales sustancias pueden estar tambien implicadas en el CHC humano (ver
nitrosaminas y CNF, mas arriba).
• No hay una evidencia fmne de la integraci6n de genoma del VHB o incluso de la
persistencia de genes concretos del VHB (por ej., el gen X, que codifica una protei-
na trans-activadora funcionalmente analoga ala proteina tax de VLTH) en las celu-
las tumorales.
Es posible que todos los mecanismos mostrados en la Figura 7.12 puedan producir-
se in vivo. El factor de riesgo fundamental es el desarrollo de una infecci6n cr6nica en
Patogemesis
vez de una infeccion aguda por el VHB. Esto en si mismo viene determinado por una
serie de otros factores:
• La edad: La frecuencia de la infeccion cronica disminuye con la edad en el momen-
to de la infeccion.
• El sexo: Para la infeccion cronica la proporcion varon:mujer es 1,5: 1; para la cirrosis
la proporcion varon:mujer es 3:1.
• CHC: la proporcion varon:mujer es 6:1.
• Via de infeccion: Las infecciones orales o sexuales dan lugar a un menor numero
de casos de infeccion cronica que las infecciones sericas.
Hasta que no se comprenda mucho mejor la patogenesis y el curso habitual de la
infeccion por el VHB, es improbable que entendamos las razones de estas diferencias.
Podria haber un final feliz en esta historia. Una vacuna eficaz y segura que previene la
infeccion por VHB est<i ya disponible y esta siendo ampliamente utilizada en las areas
del mundo en las que esta infeccion es endemica, como parte de un Programa Amplia-
do de Inmunizacion de la O.M.S. Esto permitira prevenir en el futuro un millon de
muertes anuales causadas por el CHC y la enfermedad por VHB.
.;,Que constituye un agente infeccioso «nuevo»? .;,Son virus que nose habian encon-
trado nunca antes, o son virus previamente conocidos que parecen haber cambiado su
comportamiento? En esta seccion se describira y se intentara explicar el conocimiento
actual sobre una serie de agentes que cumplen los criterios mencionados. Gran parte
de la informacion aqui presentada no es el resultado de muchos afios de estudio, sino
que se deriva de investigaciones muy recientes sobre estos «nuevos» agentes infeccio-
sos. En las ultimas decadas, se han producido varias epidemias masivas e inesperadas
causadas por algunos virus. En la mayoria de las ocasiones, estas epidemias no han
sido producidas por virus completamente nuevos (es decir, desconocidos anteriormen-
te) sino por virus que eran bien conocidos en las areas en las que actualmente estan
produciendo brotes epidemicos de enfermedad. Estos virus se conocen como virus
emergentes (Tabla 7.7). Existen muchos ejemplos de tales virus que parecen haber
modificado misteriosamente su comportamiento con el tiempo, con efectos significati-
vos en su patogenesis.
Uno de los ejemplos mejor conocidos de este fenomeno es el virus de la poliomielitis.
Se sabe que la poliomielitis y su virus causal han existido en las poblaciones humanas
durante al menos 4.000 afios. La mayor parte de este tiempo, el patron de la enferme-
dad fue endemico en vez de epidemico (es decir, un nivel bajo y continuo de infeccion
en areas geograficas determinadas). Durante la primera mitad del siglo XX, se produjo
un cambio en el patron de incidencia de la poliomielitis en Europa, Norteamerica y
Australia, volviendose epidemico, con numerosos brotes epidemicos anuales de para-
lisis infantil. Aunque no tenemos muestras de poliovirus de siglos pasados, los sinto-
mas clinicos de la enfermedad no dan motivos para pensar que el virus haya cambiado
Principios de virologia molecular
. . . Otras especies
Homb. re Ammales domest1cos c=tP
- . de mosquitos
Q
'(~
(/\_
\5~
Aves
silvestres
~ .
r-'\... ~tro: ammal~s
./"" / /
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~-v- ~VECTOR
VECTOR PRIMARIO
00
v
PRIMARIO
Mosquito domesticas
Aves 7~
. .Avets
s1 1ves res
HOSPEDADORES
FINALES
=4J }5
Animales
~~
Aves Animales
domesticos salvajes
estas enfermedades se basan en dos enfoques que consisten en controlar los insectos
vectores responsables de Ia transmisi6n del virus a los humanos yen desarrollar vacu-
nas para proteger a las poblaciones humanas. No obstante, ambas estrategias presen-
tan considerables dificultades, la primera en terminos de evitar dafios ambientales y Ia
ultima en terminos de comprender la patogenesis del virus y en desarrollar vacunas
apropiadas (ver la discusi6n anterior sobre la patogenesis del virus del dengue). El
virus de la fiebre del valle del Rift fue aislado por primera vez de ovejas en 1930 pero
ha causado epidemias de repetici6n en Africa subsahariana durante los ultimos 20 afios,
con tasas de infecci6n humana en las areas epidemicas tan altas como el 35%. Esta es
una enfermedad epizo6tica, transmitida de las ovejas a los humanos por diferentes
mosquitos. Se piensa que Ia construcci6n de presas, que incrementa las poblaciones de
mosquitos, el aumento de ovejas y sus movimientos, asi como los de las poblaciones
humanas, son responsables del recrudecimiento de esta enfermedad.
El genero Hantavirus (Bunyaviridae) constituye un motivo de preocupaci6n. Los
hantavirus causan millones de casos de fiebres hemorragicas cada afio en muchas zo-
nas del mundo. A diferencia de los arbovirus, los hantavirus se transmiten directamen-
te de roedores hospedadores a los humanos (por ej., a traves de las heces) en vez de a
traves de un vector invertebrado. Los hantavirus causan dos enfermedades agudas: Ia
fiebre hemorragica con sindrome renal (FHSR) y el sindrome pulmonal por hantavirus
(SPH). La FHSR se reconoci6 por primera vez en 1951 tras un brote entre las tropas
norteamericanas estacionadas en Corea. En 1993, el SPH fue descrito en los Estados
Unidos, y un nuevo virus, el virus Sin Nombre, fue identificado como Ia causa. Actual-
mente se sabe que al menos tres hantavirus distintos causan FHSR y que cuatro dife-
rentes virus SPH. Basta 199 5 el SPH se habia diagnosticado en 102 pacientes en 21
estados de los Estados Unidos, en siete pacientes en Canada y en tres en Brasil, con
una tasa de mortalidad global del 40% aproximadamente. Esta estadistica elustra el
potencial patogenico de los virus emergentes.
El virus del Oeste del Nilo es un miembro del complejo antigenico de Ia encefalitis
japonesa del genera Flavivirus (familia Flaviviridae). Todos los miembros conocidos de
este complejo son transmisibles por mosquitos, y muchos de ellos causan enfermedades
febriles en los seres humanos, a veces letales. El virus del Oeste del Nilo se aisl6 primero
en el distrito «West Nile» (Oeste del Nilo) de Uganda en 1937, pero actualmente es en
realidad el flavivirus con mas amplia distribuci6n geografica, incluyendo Africa y Eurasia.
De forma inesperada se declar6 en 1999 un brote de encefalitis por arbovirus en humanos
causada por el virus del Oeste del Nilo en Nueva York y sus alrededores (EE. UU.). En esta
ocasi6n, el virus parece haber sido transmitido desde pajaros silvestres, domesticos y ex6-
ticos por mosquitos del genero Culex (un mosquito urbana que prolifera en condiciones
de sequedad); un patron clasico de transmisi6n de arbovirus. El ARN del virus del Oeste
del Nilo ha sido detectado en mosquitos que sobreviven al inviemo y en aves, y Ia enfer-
medad es ahara endemica en todos los Estados Unidos, causando brotes cada verano.
Los virus de plantas tambien pueden ser responsables de enfermedades emer-
gentes. El grupo III de gemini virus se transmiten por insectos vectores (moscas blan-
cas) y sus genomas estan constituidos por dos moleculas circulares de ADN de sim-
ple cadena (Capitulo 3). Estos virus causan grandes perjuicios en las cosechas de
Principios de virologia molecular
VHH-8 puede aislarse de linfocitos y de tejido tumoral y parece tener una distribu-
cion menos ubiquitaria y cosmopolita que otros VHHs, es decir, puede estar asocia-
do solo con un estado especifico de enfermedad ( comparese con VHS, VEB). Sin
embargo, el virus no esta presente en lineas celulares derivadas de SK, lo que su-
giere que factores autocrinos o paracrinos pueden estar implicados en la forma-
cion del SK. Existe cierta evidencia que el VHH-8 puede tambien causar otros
tumores, como linfomas de celulas B (± VEB como colaborador).
Aunque muy distintas infecciones viricas pueden afectar al higado, al menos seis
virus parecen infectar y dafiar especificamente a los hepatocitos. jNi siquiera dos de
ellos pertenecen ala misma familia ! La identificacion de estos virus ha sido una larga
historia:
Virus de la hepatitis B (VHB) (hepadnavirus): 1963
Virus de la hepatitis A (VHA) (picornavirus): 1973
• Virus de la hepatitis delta (VHD) (deltavirus; ver Capitulo 8): 1977
Virus de la hepatitis C (VHC) (flavivirus): 1989
Virus de la hepatitis E (VHE): 1990
VGB-CNHG: 1995
• «Virus transmitido por transfusion» (VTT): 1998
Continuan circulando informes sobre la existencia de otros virus de hepatitis. Se
describe que algunos de ellos son sensibles al cloroformo (es decir, envueltos) mien-
tras que otros no lo son. Esto puede sugerir la existencia de multiples virus, todavia no
descritos, pero ello es improbable. Aunque la mayoria de las causas viricas de hepatosis
infecciosa humana han sido ya identificadas, es posible en el futuro se describan mas
virus productores de hepatitis.
ZOO OS 5
BIOTERRORISMO
Junto con las amenazas de los virus emergentes, el mundo afronta actualmente el
uso potencial de virus como armas terroristas. Aunque este asunto ha sido objeto de
mucha atenci6n por los medias de comunicaci6n, la realidad es que la liberaci6n
deliberada de tales pat6genos podria tener menor impacto sanitaria de lo que gene-
ralmente se percibe. Muchos gobiemos dedicaron considerables recursos al desarro-
llo de virus como armas de guerra antes de decidir que su utilidad militar era muy
limitada. Los Centros de Control de Enfermedades de EE. UU. (Centers for Disease
Control, CDC) solo reconocen dos tipos de virus como armas terroristas potencial-
mente peligrosas: la viruela y agentes productores de fiebres hemorragicas como
filovirus y arenavirus. Virus emergentes como el virus Nipah y los hantavirus tam-
bien se consideran posibles amenazas futuras; sin embargo, esto contrasta con un
numero muy superior de especies bacterinas y toxinas . La raz6n de esto es que los
pat6genos bacterianos serian mucho mas faciles de preparar y diseminar para grupos
terroristas que los virus. La amenaza potencial del bioterrorismo es en realidad in-
significante comparada con el numero real de muertes causadas cada afio por infec-
ciones en todo el mundo. De todas maneras, este es un asunto que los gobiernos
estan tratando con gran seriedad.
Patogenesis
RESUMEN
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CAPiTULO 8
AGENTES SUBVIRALES:
GENOMAS SIN VIRUS,
VIRUS SIN GENOMAS
SATELITES Y VIROIDES
Los satelites son moleculas pequefias de ARN que son absolutamente dependientes
de la presencia de otro virus para su multiplicaci6n. jlncluso los virus tienen sus pro-
pios parasitos! La mayoria de los satelites estan asociados a virus de plantas, pero unos
cuantos estan asociados a bacteriOfagos o a virus animales (por ej ., el genero Depen-
dovirus, que son satelites de los adenovirus). Se distinguen dos clases de satelites:
virus satelites, que codifican sus propias proteinas de cubierta, y ARNs satelites (o
<<Virusoides»), que utilizan las proteinas de cubierta de un virus auxiliar (Apendice 2).
Entre las propiedades tipicas de los satelites se incluyen las siguientes:
Principios de virologia molecular
30 60 90 120 150
(<<potato spindle tuber viroid», PSTVd; los nombres de los viroides se abrevian «Vd»
para distinguirlos de los virus). Los viroides no codifican ninguna proteina y se re-
plican por medio de la ARN polimerasa de clase II celular o posiblemente por el
producto de un gen de ARN polimerasa dependiente de ARN en algunas celulas
eucariotas. No se conocen los detalles de Ia replicacion, pero es posible que ocurra
por un mecanisme de circulo rodante seguido de una escision autocatalitica y una
auto-ligacion para producir el viroide maduro.
Todos los viroides comparten una caracteristica estructural com(m: una region cen-
tral conservada del genoma que se cree que esta implicada en su replicacion (Figura
8.2). Un grupo de viroides es capaz de formar una estructura en cabeza de martillo, que
le confiere las propiedades enzimaticas de una ribozima (una molecula de ARN
autocatalitica, que se escinde a si misma). Esta actividad se utiliza para escindir las
estructuras multimericas producidas durante el curso de Ia replicacion. Otros viroides
emplean enzimas desconocidas del nucleo de Ia celula hospedadora para lograr este
objetivo. Algunos viroides (por ej., el viroide del cadang-cadang del cocotero, «coconut
cadang-cadang viroid» o CCCVd) causan enfermedades graves y letales en sus plan-
tas hospedadoras. Otros causan desde efectos patogenicos inaparentes (por ej., el viroide
latente dellupulo, «hop latent viroid» o HLVd) a sintomas !eves (por ej., el viroide de
Ia pie! cicatrizada de Ia manzana, «apple scar skin viroid» o ASSVd). No esta claro
como causan los viroides los sintomas patologicos, pero obviamente tiene que ser el
resultado de alguna perturbacion del metabolismo normal de la celula huesped. Mues-
tran algunas similitudes con algunas secuencias de celulas eucarioticas, en particular
con un intron encontrado entre los ARNs ribosomales 5,8 S y 25 S y con el ARNsn U3
que esta implicado en fenomenos de corte y empalme (splicing); por tanto se ha suge-
rido que los viroides pueden interferir con el procesamiento post-transcripcional del
ARN en las celulas infectadas. Experimentos in vitro con Ia proteina kinasa PKR de
mamifero purificada (Capitulo 6) han demostrado que Ia kinasa es activada (fosforilada)
intensamente por cepas de viroides que causan sintomas graves, pero mucho menos
por cepas poco patogenas. La activacion de un homo logo vegetal de PKR podria ser el
suceso clave en Ia patogenesis por viroides (vease la discusion sobre respuesta de hi-
persensibilidad en el Capitulo 6).
Tl
P~l,. ~ C j: T2
C
------'~cc - cccc~
~GGUGGCC~
y
Dominio Region Region Region Dominio
izquierdo patog€mica central variable terminal
terminal conservada derecho
Tamafio y composici6n del genoma: 1.640 nt Homologia de secuencia con la region central
(unas cuatro veces el tamafio de los viroides conservada implicada en la replicaci6n
de plantas) de un viroide
Molecula de ARN circular de simple cadena
Dependencia del VHB para su replicaci6n;
el ARN del VHD se empaqueta en cubiertas
de lipidos con proteinas del VHB
Codifica una sola proteina, el antigenoo
Agentes subvirales: omas sin virus, virus sin enomas
t
9 0
,,OJ 842 957 1.000 1.100 1.200 1.300 1.400 1.500 1.597
I: : : : }-1.636
:771
'
t
685
: 585 485 385 285 185 85 1.663
~
~
Figura 8.3 Estruchrra del ARN del virus de Ia hepatitis 8. La region en el extremo izquierdo del
genoma recuerda mucho a! ARN de viroides de plantas, como el viroide del tubercula fusiforme de Ia
patata (PSTVd), que se muestra para su comparaci6n.
escisi6n es llevada a cabo por el dominio ribozima presente en el ARN de VHD, el unico
ejemplo conocido de una ribozima en un genoma de virus animal. El VHD se encuentra
universalmente, en cualquier lugar donde se produzcan infecciones por el VHB. Las
interacciones entre VHB y VHD son dificiles de estudiar, pero parece que el VHD poten-
cia los efectos patogenicos de la infecci6n por el VHB. La hepatitis fulminante (con una
tasa de mortalidad aproximadamente del 80%) es 10 veces mas comun en co-infecciones
que en infecciones producidas solo por el VHB. Como el VHD requiere al VHB para su
replicaci6n, esta siendo controlado por la acunacion frente al VHB (Capitulo 6).
P ONES
Todas las enfermedades por priones comparten una patologia subyacente similar,
aunque existen diferencias significativas entre distintas entidades. Varias enfermeda-
des se caracterizan por la sedimentacion de depositos anormales de proteina en diver-
sos 6rganos (por ej., rifi6n, bazo, higado o cerebra). Estos depositos «amiloides» con-
sisten en el acumulo de varias proteinas en forma de placas o fibrillas , dependiendo de
su origen; por ejemplo, la enfermedad de Alzheimer se caracteriza por el deposito de
placas o «madejas» compuestas por proteina ~-amiloide. Ninguna de estas amiloidosis
convencionales es una enfermedad infecciosa, e intensas investigaciones han demos-
trado que no se pueden transmitir a animales de experimentacion. Son resultado de
errores end6genos del metabolismo causados por una gran variedad de factores desco-
nocidos. Los depositos amiloides parecen ser intrinsecamente citot6xicos. Aunque no
estan claros los mecanismos moleculares implicados en la muerte celular, es este efec-
to el que da su nombre a las «encefalopatias espongiformes», debido a los agujeros
caracteristicos que se observan al microscopio en las secciones del tejido cerebral afec-
tado; estos agujeros estan causados por perdida neuronal y gliosis. Asi, el deposito de
amiloide es una etapa final, relacionando las amiloidosis convencionales con las EET
y explicando el dafio tisular que se observa en ambos tipos de enfermedades, pero sin
revelar nada sobre las causas subyacentes. No se puede establecer el diagn6stico defi-
nitivo de EET en base a criterios clinicos y se requiere la demostraci6n de acumulos de
la proteina prionica (PrP) en tinciones inmunohistoquimicas en tejido cerebral post-
mortem, estudios de genetica molecular o transmisi6n experimental a animales, como
se expone en las secciones siguientes.
EET en animales
Tembladera o <<Scrapie»
Descrita por primera vez hace mas de 200 afios, la tembladera de las ovejas es una
enfermedad que ocurre de forma natural en muchas partes del mundo, aunque no esta
Agentes subvirales: genomas sin virus, virus sin genomas
40.000 . . . . - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - . . . . ,
37.280
35.090 Total de cases de EEB en Rei no Unido: 183.803
35.000
30.000
Prohibici6n
de despojos 25.359 Prohibici6n
especificados 24.438
25.000 de consumo
de vacuno humano
de vfsceras
20.000 de oveja, cabra
15.000
Prohibici6n
de protefnas
de rumiantes
en piensos
14.407 14562 j
y ciervo
l
10.000 8.149
7.228
4.393
5.000 3.235 230!
2.514
446 1.443 1.202 1.144 612
0
1987 1988 1989 1990 1991 1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003
y antes
Figura 8.4 Incidencia declarada de la encefalopatia espongiforme bovina (EEB) en el Reino Unido.
Principios de virologia molecular
que las ovejas son susceptibles) a traves del pienso infectado (vease mas adelante). No
esta claro el modo natural de transmitirse entre ovejas. Los corderos nacidos de ovejas
infectadas con tembladera son mas propensos a desarrollar la enfermedad, pero la ra-
z6n de esto nose conoce. Nose ven sintomas de la enfermedad en ovejas de menos de
un afio y medio de edad, lo que indica que el periodo de incubaci6n de la tembladera
tiene al menos esta duraci6n. Las primeras sefiales de infectividad pueden detectarse
en las amigdalas, los n6dulos linfaticos mesentericos y los intestinos de ovejas de 10 a
14 meses de edad, lo que sugiere una via oral de infecci6n. El agente infectivo esta
presente en las membranas del embri6n, pero no se ha demostrado en el calostro ni en
la leche o en los tejidos de los corderos recien nacidos.
de 1992. Desde entonces el numero de casos nuevas ha comenzado a bajar; sin embar-
go, una variedad de falsas suposiciones se pueden identificar en los siguientes razona-
mientos.
Se sabe ahora que ninguno de los procesos de transformaci6n utilizados antes o
despues de los afios 80 inactiva completamente la infectividad de los priones; por lo
tanto, el ganado podria haber estado expuesto a los ptiones de la tembladera en todos
los paises del mundo donde hubiese esta enfermedad y se usasen harinas camicas, no
s61o en el Reino Unido en la decada de los 80. Por ejemplo, la incidencia de temblade-
ra en los Estados Unidos es dificil de determinar, pero en los 8 afios siguientes al
incremento en la compensaci6n econ6mica a 300 d6lares en 1977 por el sacrificio de
ovejas infectadas, el numero de casos declarados ascendi6 diez veces, alcanzando un
pico de unos 50 rebafios afectados por afio.
La encefalopatia espongifom1e bovina no es tembladera. Las propiedades biol6gi-
cas de los agentes de la tembladera y de la EEB son distintas; por ejemplo, la
transmisibilidad a diferentes especies animales y los patrones de lesiones producidas
en los animales infectados (vease Biologia molecular de priones, mas adelante). No
existe evidencia que demuestre la suposici6n de que la EEB es la tembladera en las
vacas. La unica interpretacion plausible basada en los conocimientos actuales es que la
EEB se origin6 como un pri6n end6geno bovina (de lavaca) que se amplific6 por el
consumo por las vacas de proteinas derivadas del ganado en forma de harinas carnicas .
Por tanto, la aparici6n de la EEB en el Reino Unido parece deberse al azar junto a unas
malas practicas en la cria de animales ( es decir, por el uso de harinas camicas para
alimentar a rumiantes).
La distribuci6n declarada a nivel internacional de EEB esta refiida con los hechos
reales. Alemania, Espana e Italia importaron cada una aproximadamente 13.000 cabe-
zas de ganado britanicas ademas de 1.200 toneladas de harinas carnicas inglesas en el
momenta algido de la epidemia, mientras que los Estados Unidos importaron 126 ca-
bezas de ganado y 44 toneladas de harinas carnicas del Reino Unido. Aproximadamen-
te 40.000 toneladas de harinas carnicas se exportaron del Reino Unido entre 1985 y
1988; Francia sola import6 al menos 17.000 toneladas durante este periodo y s6lo ha
declarado 20 casos de EEB comparados con los casi 100.000 en el Reino Unido duran-
te el mismo periodo. De 1985 a 1990, el Reino Unido export6 57.900 animales. Estos
animates habrian dado Iugar a 1.668 casos de EEB de haber permanecido en el Reino
Unido, pero s6lo una pequefia fracci6n de estos casos han sido declarados por los
paises receptores. El Departamento de Agricultura de los Estados Unidos mantiene
que nose han confirmado casos de EEB en los Estados Unidos, pero se ha encontrado
ETV en este pais en visones alimentados con «vacas donantes» y nunca alimentados
con ovejas; por lo tanto, no podian haber estado expuestos a tembladera (ver Biblio-
grafia).
Respecto a la EEB, aUn permanecen importantes preguntas sin responder. Muchas
de elias surgen del elevado numero de animates infectados (> 41 .000) nacidos despues
de la prohibici6n de los piensos de 1988. Ahora se admite por lo general que la prohi-
bici6n de los piensos se aplic6 incorrectamente y ademas s6lo se impuso al pienso de
ganado vacuno. Los mismos fabricantes que producian pienso para ganado bovino
Agentes subvirales: genomas sin virus, virus sin genomas
estaban elaborando tambien piensos con harinas camicas para ganado ovino, porcino y
para aves de corral, facilitando que se produjesen contaminaciones. Como resultado,
en marzo de 1996 se prohibi6 en el Reina Unido el uso de harinas camicas de mamife-
ros en la alimentaci6n animal. Ahara se sabe que se puede producir la transmisi6n
vertical de EEB en rebafios con una frecuencia del 1 al 10%. De igual manera, existe la
posibilidad de que se produzca la transmisi6n ambiental, similar a la que se sabe ocu-
rre con la tembladera (como se coment6 mas arriba). Ademas del perjuicio econ6mico
causado por la EEB, la principal preocupaci6n actualmente es el posible riesgo para la
salud humana (como se comenta despues).
3 meses. Esta forma constituye el 90% de todos los casos de EET humanas, pero
solo un 1% aproximadamente de los casos de ECJ esponidicos son transmisibles al
raton.
• latrogenico/adquirido: estos ocurren por situaciones de riesgo reconocidas (por
ej., neurocirugia, trasplantes). Unos 50 casos de EET fueron causados en indivi-
duos jovenes que recibieron inyecciones de hormona de crecimiento humana o
gonadotrofinas, derivadas de extractos de ghindulas hipofisarias obtenidas de cada-
veres, una practica que ya se ha sustituido por la obtencion de hormonas por inge-
nieria genetica.
• Familiar: un 10% aproximadamente de EET humanas son familares (es decir, he-
reditarias). Se sabe que diversas mutaciones en el gen PrP humano dan Iugar a
encefalopatias espongiformes con caracter autosomico dominante, adquiridas por
transmision hereditaria mendeliana (Figura 8.5).
El kuru fue la primera encefalopatia espongiforme investigada en detalle, y posi-
blemente constituya una de las historias mas fascinantes que hayan surgido como re-
sultado de investigaciones epidemiologicas. Esta enfermedad ocurria principalmente
en 169 poblados habitados por las tribus Fore en las tierras altas de Nueva Guinea. Los
primeros casos se registraron en los aiios 50 y cursaban con una perdida progresiva del
control neuronal voluntario, seguido de muerte en menos de 1 aiio tras la aparicion de
los sintomas. La clave del origen de la enfermedad fue proporcionada por el perfil de
las victimas; nunca fue vista en niiios pequeiios, raramente en hombres adultos, y era
mas frecuente en adolescentes varones y hembras, asi como en mujeres adultas. Los
nativos Fore practicaban el canibalismo ritual como rito para honrar a sus difuntos.
Mujeres y niiios participaban en estas ceremonias, pero no los hombres adultos, lo que
explica la distribucion por edades y sexos de la enfennedad. El periodo de incubacion
del kuru puede ser superior a 30 aiios, pero en la mayoria de los casos es algo mas
corto. La practica del canibalismo ritual fue desaconsejada a final de los aiios 50 y la
incidencia del kuru disminuyo entonces drasticamente. Actualmente el kuru ha des-
aparecido.
Deleci6n de octarrepetici6n
Polimorfismos naturales:
Q, M129V
PlOSL
I
V1801
P102L F198S V2101
E200K
Y145STOP
La descripci6n anterior cubre el panorama conocido de las EET humanas, que ha sido
laboriosamente elaborado durante varias decadas. No existe evidencia alguna de que
ninguna encefalopatia espongiforme humana haya sido adquirida habitualmente por via
oral (por ej., comiendo cordero infectado de tembladera). Hay buenas razones para que
esto sea asi (vease Biologia molecular de priones, a continuaci6n); sin embargo, en abril
de 1996 se publico un articulo que describia en el Reino Unido una nueva variante de
ECJ (vECJ) (ver Bibliografia). Aunque en numero relativamente pequefio, estos casos
comparten caracteristicas inusuales que los distinguen de otras fonnas de ECJ:
• Edad precoz de aparici6n o de fallecimiento (27 afios de media, comparado con 65
afios en la ECJ).
• Duraci6n prolongada de la enfermedad (13 meses de media, comparado con 3 me-
ses para Ia ECJ).
Presentaci6n predominantemente psiquiatrica, incluyendo ansiedad, depresi6n, re-
traimiento y cambios de conducta mas que sintomas neurol6gicos.
• Desarrollo posterior de sindrome cerebeloso con ataxia.
• Desarrollo de perdida de memoria y trastomos de la memoria en progresi6n hasta
discapacidad cognitiva grave.
• Desarrollo de mioclonias (contracciones musculares involuntarias) en la mayoria
de los pacientes.
• Ausencia de las caracteristicas tipicas del electroencefalograma (EEG) de la ECJ.
Cambios neuropatol6gicos espongiformes, perdida neuronal y gliosis astrocitica,
mas evidente en los ganglios basales y en el talamo.
La caracteristica neuropatol6gica mas llamativa y consistente es la formaci6n de
placas amiloides semejantes a las que se veian en el kuru, extensamente distribuidas
por todo el cerebro y el cerebelo.
El Comite Asesor Oficial de la Encefalopatia Espongiforme del Reino Unido con-
cluy6 que «la vECJ es una enfermedad previamente no reconocida y consistente», y
que «aunque no hay evidencias directas de un vinculo, de acuerdo con los datos actua-
tes y en ausencia de una altemativa creible, la explicaci6n mas probable actualmente
es que estos casos estan relacionados con la exposici6n a la encefalopatia espongifor-
me bovina». En 2004, cerca de 150 personas habian fallecido de vECJ en el Reino
Unido y varias mas en otros paises. Los modelos matematicos de la epidemia sugieren
que es probable que el numero maximo de muertes por vECJ en el Reino Unido sea de
14.000 o algo menos; un pensamiento dificilmente consolador.
La evidencia de que los ptiones no son virus convencionales esta basada en el hecho
de que los acidos nucleicos no son necesarios para la infectividad, ya que presentan:
Resistencia a la inactivaci6n por calor: la infectividad se reduce pero no se elimina
por tratamiento a alta temperatura en el autoclave (135°C durante 18 minutos). Se
retiene incluso cierta actividad infectiva despues de tratamiento a 600°C, lo que
Principios de virologfa molecula r
sugiere que un molde molecular inorganico seria capaz de formar un nucleo para la
replicaci6n biol6gica del agente.
• Resistencia a dafio por inadiaci6n: se encontr6 que la infectividad era resistente a
radiaciones ultravioletas de onda corta y a radiaciones inonizantes. Estos tratamientos
inactivan organismos infecciosos al causar dafios a su genoma. Existe una relaci6n
inversamente proporcional entre el tamafio de la molecula de acido nucleico diana
y la dosis de radioactividad o de luz ultravioleta necesarias para inactivarlas; es
decir, las moleculas grandes son sensibles a dosis mucho mas pequefias que las
moleculas mas pequefias (Figura 8.6). Se encontr6 que el agente de la tembladera o
scrapie era altamente resistente a ambos tipos de radiaci6n, luz ultravioleta y radia-
ci6n ionizante, indicando que un acido nucleico presente tendria que tener menos
de 80 nucle6tidos.
• Resistencia a tratamientos conADNasa y ARNasa, psoralenos y ala hidr6lisis cata-
lizada por Zn2+, todos ellos capaces de inactivar acidos nucleicos.
• Sensibilidad a urea, SDS, fenol y otros agentes quimicos desnaturalizantes de pro-
teinas.
@Poxvirus
150 kpb 0
Herpesvirus
(j
(j
.0 oFagoA. E
z z
0
<{
Adenovirus o Virus ADN 0::
<{
Q)
/ de doble cadena Q)
"0 "0
"' 30 kb "'
~
"'gE 15 kpb 0
c
Q) Q)
0> 0>
Q) Q)
"0 "0
0 0 0
<C <C
"'
E Flavivirus
~- ' ,, cpX174*
"'
E
~ ~
VMT '--.?
ARNvirus / ' 3 kb
1,5 kpb de simple cadena ' _Scrapie
<}
I I
HY' 10' 107
Dosis de radiaci6n (rads)
Figura 8.6 Sensibilidad a Ia radiaci6n de los agentes infecciosos. La dosis de radiaci6n ionizante que
se requiere para destruir Ia infectividad de un agente infeccioso depende del tamafio de su genoma. Los
genomas mas grandes (por ej ., virus con ADN bicatenario, linea superior) presentan una «diana» mayor
y son por lo tanto mas sensibles que los genomas mas pequefios (por ej., virus con ARN monocatenario,
linea inferior; Nota: <!>Xl74 tiene un genoma de ADN monocatenario). El agente del scrapie o temblade-
ra es considerablemente mas resistente a Ia radiaci6n que cualquier virus conocido (n6tese Ia escala
logaritmica en el eje vertical) .
Agentes subvirales: genomas sin virus, virus sin genomas
Todo lo anterior indica que se trata de un agente con las propiedades de una
proteina mas que de un virus. Una proteina de 254 aminoacidos (PrPSc) se asocia con
la infectividad del scrapie. La purificaci6n bioquimica de Ia infectividad de este
result6 en la obtenci6n de preparaciones muy ricas en PrPSc, y la purificaci6n de
PrP 8 c result6 en un enriquecimiento en Ia actividad del scrapie. En 1984, Prusiner
determin6 la secuencia de 15 aminoacidos en el extrema de la PrP 8c purificada. Esto
condujo al hallazgo de que todas las celulas de mamifero contienen un gen (Prnp)
que codifica una proteina identica a Ia PrP 8c, llamada PrPc. No se han encontrado
diferencias bioquimicas entre PrPC y Prpsc, aunque, a diferencia de PrPc, la PrP 8 c es
parcialmente resistente a la digestion con proteasas, resultando en Ia formaci6n de
un fragmento de 141 aminoacidos, resistente a proteasa, que se acumula en forma de
fibrillas en las celulas infectadas (Figura 8.7). Solamente una proporci6n del total de
PrPc de los tejidos enfermos esta presente como PrPsc, aunque se ha demostrado que
esta es la forma infecciosa de Ia proteina PrP, ya que la PrPsc altamente purificada es
infecciosa cuando se inocula a animales de experimentaci6n. Igual que con otros
agentes infecciosos, existe un efecto dosis-dependiente que determina una correla-
ci6n entre Ia cantidad de PrPSc en un in6culo y el tiempo de incubaci6n hasta el
desarrollo de la enfermedad.
Por lo tanto, las EET, que se comportan como enfermedades infecciosas, parecen
estar causadas por un gen/proteina end6geno/a (Figura 8.8). La susceptibilidad de una
especie hospedadora a la infecci6n por priones esta co-detenninada por el pri6n del
in6culo y por el gen Prnp. Los periodos de incubaci6n de la enfermedad para distintos
priones aislados varian en diferentes cepas endogamicas de ratones, pero para un aisla-
do determinado de una cepa en concreto son llamativamente estables. Estas observa-
ciones han originado dos conceptos importantes:
1. Variacion de cepas de priones: se han identificado a! menos 15 cepas diferentes
de PrP 8c. Se pueden diferenciar entre si por el tiempo de incubaci6n hasta el inicio
de la enfermedad y por el tipo y la distribuci6n de las lesiones en el sistema nervio-
so central (SNC) en estirpes endogamicas o singenicas de ratones. Por tanto, se
ICHOI CHO
qt} 111 155
CHO GPI
18U 1% 232
Ex6n 2
ARNm PrP
cr
,;,Papel normal?
0110
OD
!
f1 •u •
ootf
Diagrama esquematico del papel de PrP en las EET.
puede analizar la «huella digital» de los priones, y los priones de la EEB pueden
distinguirse de los de la tembladera o de los de la ECJ.
2. Barrera interespecie: cuando los priones se transmiten inicialrnente de una espe-
cie a otra, Ia enfermedad se manifiesta solo despues de un periodo de incubacion
muy largo, si es que lo hace. Tras pases seriados en la nueva especie, a menudo el
periodo de incubacion disminuye dn'tsticamente y despues se estabiliza. Esta barre-
ra interespecie puede ser superada al introducirse un transgen PrP de Ia especie
donante del prion (por ej., hamster) al raton receptor (Figura 8.9).
PrPC y Prpsc, sin embargo, no sufren modificaciones post-transduccionales, y los
genes que las codifican no estan mutados, lo que las diferencia de las formas familiares
de ECJ con herencia mendeliana. No se ha establecido con seguridad como un com-
portamiento aparentemente complejo puede ser «codificado» por una proteina de 254
Agentes subvirales: genomas sin virus, virus sin genomas
Leyenda:
0 Raton
(periodo corto de incubacion)
Transmision inefrcaz
(periodo largo de incubaci6n)
1\ Raton transgenico portador
U del gen PrP del hamster
Figura 8.9 La transrnision experimental de scrapie a animales demuestra la existencia de una barrera
inter-especie aparente. La transmision de hamster a hamster y de raton a raton provoca Ia aparicion de
enfetmedad tras un periodo de incubacion relati vamente corto (75 dias y 175 dias, respectivamente). La
transmision de una especie a otra es mucho menos eficaz, y Ia enfermedad se produce solo despues de un
periodo de incubacion mucho mas largo. La transmision de PrP derivada del hamster a ratones transge-
nicos portadores de varias copias del gen PrP del hamster (el raton mas oscuro en esta figura) es mucho
mas eficaz, mientras que la transrnision de PrP derivada del raton a ratones transgenicos es menos eficaz.
Las transmisiones posteriores desde los ratones transgenicos implican que se habran producido algunas
modificaciones en las propiedades del agente.
cacion ala aparicion de EEB: una mutacion espontanea de un gen PrP bovina causo
priones infecciosos que despues se amplificaron a traves de la cadena alimentaria. En
los ultimos afios la construccion de animales transgenicos ha arrojado mas luz sabre
las ideas anteriores .
La hipotesis de los priones es revolucionaria y ha encontrado de forma justificada
algunas acogidas escepticas. La PrP es una proteina muy dificil de estudiar, ya que
forma fuertemente agregados yes de tamafio heterogeneo, e incluso las mejores prepa-
raciones requieren 1 x 105 moleculas PrP para infectar a un raton. Esto plan tea pregun-
tas sabre si no estara oculto en los agregados de proteinas alglin tipo de agente infec-
cioso no identificado. Todavia es posible plan tear muchas teorias alternativas con varios
niveles de complejidad (y de verosimilitud) que se ajusten a los datos experimentales.
La ciencia progresa mediante la construcci6n de hip6tesis experimentalmente
verificables. Durante muchos afios, la investigacion sabre las encefalopatias espongi-
formes ha avanzado de forma desesperadamente lenta, porque se ha tardado al menos
un afio y muchas veces varios afios en completar un solo experimento. Con el adveni-
miento de la biologia molecular, este se ha convertido en un campo dinamico y en
rapida evolucion. Los proximos afios revelaran sin duda mas informacion sabre la cau-
sa de estas enfermedades y probablemente proporcionaran estimulos para pensar sabre
las interacciones entre los agentes infecciosos y el organismo hospedador en la patoge-
nesis de las enfermedades infecciosas.
lgual que los acidos nucleicos pueden llevar a cabo reacciones enzimaticas, las
proteinas pueden actuar como genes. Reed Wiclcner
RESUMEN
BIBLIOGRAFiA
Collinge, J. (2001). Prion diseases of humans and animals: their causes and molec-
ular basis. Annual Review of Neuroscience, 24: 519-550.
Dodds, J.A. (1998). Satellite tobacco mosaic virus. Annual Review of Phytopathology,
36: 295-310.
Pri ncipios de virologia molecular
--~---
,
Los terminos mostrados en el texto en grita con co se defmen en estc glosario.
ED
Principios de virologla molecular Glosario y abeviaturas
AI~Nhn «ARN hcterogcneo nuclear» o «ARN nuclear pc- C'omplcmcntacion lnteraccion de productos de genes virales en celu-
sado»; los transcritos primario'>, no procesados, las infectadas que causa el incremento de uno o
que sc encucntran en el nuclco de las cclulas cu- ambos mutantes parentalcs sin modifica rse sus
cariotas. genotipos.
AR:":m ARN mensajcro. Cromalina Complejo ordcnado de ADN mas protcinas (h isto-
nas y proteinas cromos6micas no histonas} que sc
Atcnuado Un agcnte pat6geno que ha sido alterado genctica-
CnCUentra en C) n1kle0 de laS CClulaS I .
mentc y mucstra una virulcncia atcnuada; lo!> virus
atenuados son Ia base de las vacunas de virus vtvos Cuasic'Jllh nlcncin Principio que describe el modo de formar un cuer-
(ver Capitulo 6). po solido regular a partir de subunidades con forma
irregular, en el cual las subunidades en casi Ia mis-
Autocrino Producci6n por una cclula de un factor de crcc i-
ma Jocalizact6n forman enlaces casi-cquivalentes
micnto que se requiere para su propto crectmien-
con sus vecinas (ver Capitulo 2).
to; semejante mccanismo de retro-alimentac16n po-
sit iva puede causar transformaci6n cclular (ver Ca- Cun'iic'ipccic Una me/cia complcja de variantcs molcculares de
pitulo 7). gcnomas de virus ARN en rnptda evoluci6n y en
competencia, que ocurre en Ia mayoria de las po-
A\ irulento Un agentc infeccioso sin potencial de produc1r cn-
blaciones de virus ARN.
fcnnedad. Es dudoso que tales agcntes rcalmcntc
existan; incluso los organismos mas mocuos puc- Cuerpos de inclu i6n Estructuras subcelulares formadas como rcsultado
den causar enfcrmedad en ciertas circunstancias (por de Ia infecc16n v1ral; a menudo el Iugar de ensam-
ej., en hucspedcs inmunocomprometidos). blaje del virus (ver Capitulo 4).
llccn,,sidaclon rcrmino general que haec refcrcncia a los sucesos
BnctcriOfngo Un virus que se replica en una cclula bacteriana.
que ocurrcn tras Ia entrada de una particula virica
Bactcri6fngo ntl'mpcntdo L n bacteri6fago capa/ de establecer una infecci6n en Ia cclula hospcdadora, durante los cua les Ia
lisogcnica (comparese con bacteri6fago virulento, cap<>ide cs parcial 0 complctamente ehminada y el
un bactcri6fago que no es capu de establecer una genoma es cxpucsto, gcncralmentc en forma de
infecci6n lisogcnica y que siempre mala a Ia bacte- compleJO de nucleoproteina (ver Capitulo 4}.
na en Ia que se repiJca).
Eclipse, pcriodo de Una fase temprana de Ia infcccion en Ia que las
he Bicatenario, de doble cadena o doble hebra (~icido particulas \in cas han desaparecido tras penetrar
nueleico). en las cclulas, liberando sus genomas en las celu-
Cnha (o ). Una regi6n locall/ada en una monocapa las hospcdadoras como rcquisito prcvio a Ia repli-
cclular en Ia que las cclulas han sido destruidas o caci6n; a mcnudo rcfcrido a los bacteri6fagos (ver
su crecimiento se ha retardado porIa infeccion v ira I. Capitulo 4).
Cnpsidc La cubierta proteica protectora de una particula I· fcctu citop:itlco (e.c.p.) Daf\o celular causado por Ia infecci6n virica; los
virica (ver Capitulo 2). efcctos de Ia infcccion virica sobrc las celulas en
Ccluht inmortnlir.ada Una cclula capaz de crecer indcfinidamente (es de- cultivo, visiblcs med ia nte examcn microsc6pieo o
cir, de div tdirse continuamcnte) en cultivo. Raras visual dirccto (ver Capitulo 7).
vcces las celulal! inmortalizadas aparcccn esponta- l'lcmcnto potcnciador Ver
neamcntc, pues mas frecuentemente surgen por l'mpnlm~ Ver · ,. : · .
mutagenesis como resultado de una Un patron de enfcrmedad que es habitual o recu-
Fndcmin
viral (ver Capitulo 7}. rrente en un area geografica dcterminada (compa-
C'Ciula primaria Una cclula en cultivo cxplantada de un organismo, rar con }.
que es capaz de llevar a cabo un numero limitado de Ver . emerge me.
l~nf~rmcdadcs 'iricn'i
divisioncs (comparese con ). cmcrgcntcs
Principios de virologia molecular Glosario y abevtaturas
Ensamblajc Una fasc tardia de Ia replicaci6n viral durante Ia con respecto a su amplitud e inelinaci6n (\er Ca·
cual -;e almaccnan en un Iugar concreto de Ia cclula pitulo 2).
los componentes necesarios para Ia forrnaci6n de .. ,1: Como una helice.
un vm6n maduro, y se forma Ia estructura basica Hctcrocigosis Empaquetamiento aberrante de multiples genoma
de Ia particula vinca (\ er Capitulo 4 ). que puede en ocasiones gcnerar particulas multi·
Ell\olturn (o em uelta), una membrana extema que poseen mu- p(oidCS (eS dccir, COn mas de Ul1 gcnoma) que Mill
chos virus consistente en una bicapa de lipoprotci- por lo tanto heterocig6ticas.
na. (Nota: algunos 'irus contienen lipidos como lllperplnsia Division celular excesiva o crceimiento de cclulas
parte de una capa compleja extema, pero csta no se anonnalmente grandes; en las plantas, cl resultado
denomina habttualmente envoltura, a menos que se de Ia produccion de areas hinchadas o defonnadas
demuestre claramente una estructura de membrana debido a los efectos de vints vegetales.
en bicapa).
Bi poplnsia Retardo localizado del crccimiento cclular. Nume-
Em uclta/cll\ ucltos Ver r
rosos vims de plantas lo eausan, ocasionando fre-
Epidemia Un patron de enfennedad caracteri/ado por un ra- cuentcmcnte I ' (apartCiOn de areas tnaS
pido incremento en el numero de casos y con dtstri- dclgadas, amarillas, en las hoJas).
bucion geogratica amplia (comparar con 1 I 1 ): lcosaedro Cuerpo solido consistente en 20 caras triangulares
una epidemia que afecta a todo el mundo se deno- organizadas alrededor de Ia superlicte de una esfc-
mma ra; Ia simetria bastca de muchas particulas viricas
Euca riota/euca riot ica Organtsmo cuyo material genctico esta sepamdo del (ver Capitulo 2).
ettoplasma por una membrana nuclear y se encuen- Ll inicio de Ia infeccton stn complctarse el ciclo
lnfl•ccion ahortha
tra di\<tdido en cromosomas diferenciados. tnfectivo, y por tanto, stn producir particulas
Ex on Region de un gen que se expresa como una protci- infectivas (comparese con 11 1 • 1 • d II\ t i .1 ).
na tras Ia climinacion de los " 1 • mediante los Una infecci6n virica «completa» en Ia que se pro-
lnfcccion productha
procesos post-transcripciona les de corte y empal- ducen mas particulas \ iricas infecti vas (comparcse
me («splicinK» ).
con ).
l·agicus Ver ..,· . Una infeccion que afecta a 111ltltiples partes de un
lnfcccion sistcmica
Fagu Ver BactcriOfago. organismo pluncelular.
Fusion Ver Pr• ••·In •I lnmortulizada Ver ' I!!
Gem a cion Un mecantsmo por el que una particula 'iriea se lntron Regton de un gcn ehminada tras Ia transcripci6n
Iibera de una cclula infectada por extrusion a tmvcs por corte y cmpahne («.~p!t£·mg») y. por consiguien-
de una membrana. [I sitio de gcmaci6n puede ser te, no cxpresada como protcina.
Ia superficte celular o puede implicar a las mem-
IRES («internul rihmomc Sitio intemo de entrada al nbosoma, una estructura
branas citoplasmaticas o nuclear, dependtendo del
l'lllry ~ill'>>) secundaria del ARN que se encuentra en Ia regiiln
Iugar de ensamblaje. Las envolturas o em ueltas
5' no codifieante (UTR) de virus de ARN(+). como
viricas sc adquieren durante Ia gemacion.
los picomavirus y los navivirus, que funciOna como
Genom a El actdo nucleico que conticne Ia infom1aci6n ge- una «ahnohadilla» de aterrizajc en el ribosoma, per-
nctica completa de un organismo. mitiendo una iniciacion intema de traduccion del
Gcnomica/gcnomico Vcr (., 1111111 • ARNv.
Hcmaglutinacion La aglutinaci6n (especifica) de hematies por un vi- lsomctrico Un solido que presenta simctria cubica. uno de los
rus u otra proteina. euales es el icosaedro.
Helice Solido cilindrico formado por el apilamiento de kh 1.000 nucleotidos; una unidad de mcdida de las mo·
subunidades repetidas, con una relacion constante lcculas de acido nucleico monocatenarias: a vcccs
Principios de virologia molecular
------------------
(crr6neamcntc) utili.lada para signilicar r ph (vcr a
continuac i6n).
-------------------------------
Glosario y abeviaturas
-
temperatura («temperature sensitive», t.s.) puede scr
capaz de replicar a Ia temperatura pennisiva de 33°C
pero incapaz de replicar a (o estar fuertemente in-
kph 1.000 pares de bases (ver antes); una unidad de
hibido) a una temperatura no permisiva de 38°C.
m edida de las molcculas de acidos nucleicos
bicatcnarios. 1\tuhmtc Ictal condicional Una mutaci6n condicional cuyo fcnotipo nose afcc-
ta (rclativamente) bajo condiciones pcrmisivas, pero
Latencin, periodo de Tiempo tras Ia in fccci6 n antes de que aparczca Ia
que cs fuertemente inhibidora bajo condiciones no
primcra particula de virus cxtracclular (vcr Capi-
tulo 4). pem1isi vas.
Necrosis Muerte cclular, particularmcnte Ia causada por una
Liheraci6n Fase tardia de Ia infccci6n virica durante Ia cual las
influencia ex lema (comparese con 1 10 lltnsts).
nuevas particulas viricas formadas abandonan Ia
celula (ver Capitulo 4). nt Un solo residuo nuclcotidico en una molccula de
Lisogenin Infecci6n latcnte y persistentc de una bacteria por acido nuclcico.
un como el fago A.. Nuclcocflpsidc Un complejo ordcnado de proteinas mas el acido
I .itica/o Ver nuclcico gen6mico de un virus.
Numcro de triangulncion Un factor numerico que define Ia simetria de un
'\1aduraci6n Fase tardia de Ia infecci6n virica durante Ia cual
las nuevas particulas viricas formadas se hacen in- solido icosacdrico.
fecciosas; hab itual mente implica cambios estruc- Oncogcn Un gen que codifica una proteina capaz de indueir
turalcs en Ia particula, resu ltantes de digcstiones celular.
cspeeifieas de las proteinas de Ia capsidc para for- OR I· «Open readingframe» (en inglcs), paula abierta de
mar productos maduros, o cambios conformacio- lectura; region de un gen ode un ARNm que cedi-
nalcs en las protcinas durante su cnsamblajc (ver fica un polipeptido, comprcndida entre un codon
Capitulo 4). AUG de inicio de Ia traducei6n y un codon de para-
l\lczcla fcnotipica Progcnie de virus individualcs resultante de una in- da en el cxtremo 3'. No debe confundirse con el
feeci6n mixta que contiene proteinas estructurales poxvirus denominado orf.
derivada de ambos virus parentalcs. Pandemia Una que afecta a todo el Mundo.
Monocnpn Una capa aplanada de cclulas adherentes contiguas Particulas dcfccth as Particulas resu ltantes de Ia existencia de gcnomas
adherida a Ia superficie s6lida de un recipiente para intcrfiricntcs (D.I.) viricos dclccionados gencticamente que carecen de
cultivo. una o mas funciones esenciales para Ia rcplicaci6n.
'\1onocio;tronico Un ARN mensajero que consiste en el transcrito de ph Par de bases; un solo par de nucle6tidos en una mo-
un solo gen y que por tanto codifica un solo poli- lccula de acido nuclcico de doblc cadena mantcni-
peptido; un genoma virico que produce un ARNm da unida por pucntes de hidr6geno de Watson-Crick.
semejante (comparese ). La fasc de Ia rcplicaci6n virica en Ia que Ia particu-
Pcnctraci(m
'\1osnicio;mo Aparieion de areas mas delgadas, amarillas, en las las vi rica o su genoma cntra en Ia cclula hospedadora
hojas de plantas causadas por efectos citopaticos (vcr Capitulo 4).
de virus de plantas.
Pcriodo de eclipsl Ver .- , r •• vdo de.
l\lultiplicidnd de infcccion El numero (promedio) de particulas viricas que in- Ver tcncia, pcriodo de.
Pcriodo de latcncia
(m.o.i.) fectan a cada celu la en un expcrimento.
Plnca Ver thn.
Mutnnte condicional Un fenotipo mutante que es eompetente en replica-
Pla<tuco Vcr
cion bajo condiciones <<permisivas», pero no bajo
condiciones «restrictivas» o «no perrnisivas»; por JlJfismido Un elemcnto gcnctico cxtracromos6mico capaz de
ej emplo, un virus con una mutaci6n sensible a Ia replicarse aut6nomamente.
Principios de virologia molecular Glosario y abeviaturas
que se c ree responsablc de las encefalopatias es- R<'ccptor Una molccula especifica en Ia superficie de una
pongiformes transrnisibles como Ia enfermcdad de cclula a Ia que se une un virus como paso previo
Cretzfeldt-Jakob (ECJ) o Ia cncefalopatia espongi- para entrar en ella. Pueden scr proteinas, o residuos
forme bovina (EEB) (ver Capitulo 4). g lucosidicos de glucoproteinas o glucolipidos en Ia
Procariota Un organismo cuyo material genctico no esta se- membrana celular (vcr Capitulo 4).
parado del citoplasma celular por una membrana Rl'Combinacilm fnteraccion ftsica de gcnomas viricos en una celula
nu c lear.
supc rinfectada por dos 0 mas virus distintos, que
Profago Forma lisogenica de un bacteri6fago atemperado da Iugar a Ia progenie de genomas que conticnen
integrado en el genoma de Ia bacteria hospedadora. informacion en combinaciones no parcntales.
Promotor Una region rcguladora que , situada l~<'dundnncia terminal Secuencias repetidas presentes en los extremos de
por delante de Ia region codificante de un gen, que una molecula de acido nucleico.
promueve Ia transcripcion facilitando cl ensambla-
Replica sa Enzima responsable de Ia rcplicacion de los
je de proteinas en cornp lejos transcripcionales.
gcnomas de virus ARN (ver ).
Protcina de fusion Una proteina virica responsable de Ia fusion de Ia
Rep Iicon Una molecula de acido nucleico que contiene Ia
• 1h virica(oaveces,de la <{ )conuna
informacion necesaria para su propia rep licacion;
membrana ccl ular y, en consccuencia, de Ia entrada
e n Ia celula (ver Capitulo 4). incluye a los y a otras molcculas como
y ••.•.
Protcina de movimicnto Proteinas especializadas codificadas por virus de
plantas que modifican los plasmodesmas (canales Rctrotrnnspos(m Elcmento genetico transponible rnuy similar a un
que atraviesan las parcdcs eelulares concctando el genoma de retrovirus, unido por repeticiones ter-
ei toplasma de cclulas ad yacentes) y eausan el trans- minalcs largas (ver Capitulo 3).
porte de los acidos nucleicos de una cclula a otra Satelitcs Pequenas molccu las de ARN (500-2.000 nl) que
pcrmitiendo Ia diseminacion de Ia infeccion. ' dependen de Ia presencia de un vims auxiliar para
Protcina 'irica Proteina v irica responsable de Ia interaccion de Ia su replicacion, pero que, a diferencia de los virus
de adhcsiim/adsorcion/union particulas vi rica con un receptor celular especifico. defcctivos, no muestran homologia de secuencia con
Prot coma el gen oma de l virus auxiliar. (Comparese con
Conjunto completo de las proteinas expresadas en
una celula en un mornento dcterminado. ).
Provirus Gcnoma de un retrovir us en fonna de ADN de do- Sccucncias potcnciadoras Ver • 1 "ia•ln ...
ble Cadena intcgrado e n Ia ( romatina de Ia cel ula Scntido ncgativo La cadena de un acido nucleico con una secuenciu
hospedadora. de bases complcmcntaria a Ia cadena que conticnc
Pscudonudo Una estructura secundaria de ARN que causa un Ia secuencia de tripletes de nucleotidos que codili-
desplazamiento de Ia pa uta de lectura durante Ia ca una proteina, o un virus cuyo genoma consiste
\
Pnnc1pios de virologia molecular Glosario y abev1aturas _
en una cadena de sentido ncgativo. Tambien «sen- 1 ranscriptasa Una cnzima, generalmcnte contenida en particulas
lido(- )». viricas, responsable de Ia transcripe16n de genomas
Scntido positho La cadcna de acido nucleico con una secuencia de de vims ARN (ver ).
bases que cont iene Ia sccucncia de tripletes de nu- 1 ransfcccion lnfecci6n de celulas mediada por Ia introducci6n
cle6tidos que codilica una protcina, o un virus cuyo de acido nuclei co \ irico en vez de por particulas
genorna cons1ste en una cadena de sentido positi- viricas.
vo. Tambicn «sentido ( +-)».
Transformacilm Cualquicr cambio en los panimetros morfologicos,
Sciinl de empnquelnrnicnto Una region de un genoma virico con una secucncia bioquim icos 0 de creeimiento de una celula.
nucleotidica particular que interacciona especilica- Transgcnico Un organismo eucari6tico manipulado gcncticamen-
mentc con una(s) protcina(s) virica(s), originando te (animal o planta) que contiene informacion ge-
Ia incorporaci6n del gcnoma en Ia particula virica. nctica adicional de otra especie. Los genes adicio-
<<Siwtoff~> (Apagado o dcsconexi6n, en inglcs). Un ccsc re- nales pueden ser conten1dos y·o cxpresados solo en
pentino y dramatico de Ia mayoria de Ia sintcsis de las cclulas somaticas del organismo transgcnico 0
macromoleculas de Ia cclula hospcdadora, que ocu- en las cclulas de Ia linea gem1inal, en cuyo caso
rre durante algunas infecciones viricas, que causa pueden ser heredados por Ia deseendencia.
daflo y/o muerte cclular (ver Capitu lo 7). ·arnnsmision no prop:1gntha Tcm1ino que describe Ia transmisi6n por mcdio de
Sincitio Masa de citoplasma que contienc varios nucleos hospedadores secundarios (como artr6podos) de
separados, incluidos en una membrana contmua vims que nose replican en el organismo vector (por
rcsultante de Ia fusion de cclulas individuales. ej., geminiv1rus). Tamb1cn se denomina «transmi-
<<..\plidng» (Corte y cmpalme, en inglcs). Modi licaci6n post- si6n no circulativa»; csto es, el virus no circula en
transcripcional de los transcritos de ARN prima- Ia poblaci6n de vectores.
rios que ocurre en cl nucleo de las cclulas Transmi'iiOn propagath a Tcnnino que describe Ia transmi-.i6n por medio de
, durante el cual se eliminan los y se hospedadores secundanos (como artr6podos) de
juntan los para producir los ARNs mcnsa- vims que son capaces de replicarse tanto en cl hos-
jcros C1toplasma11cos. pedador primano como en el vector responsable de
Supcrantigenos Molcculas que establccen un cortocircuito en cl SIS- su transmisi6n (por ej ., reovims de plantas). Tam-
tema inmunitario, causando Ia activaci6n rnasiva de bien sc conoce como «transm isi6n eirculativa», es
cclulas Tal umrse a Ia rcgl()n vanablc de Ia cadena decir, el virus circula en Ia poblaci6n de vectores.
~ del receptor de Ia cclula T (V~) y a molccula-. rransposonc Secucncias e-.pecilicas de ADN que son capaces
MIIC de clase II (hgura 7.3). de 1110\ ersc de una posicion en cl genoma de un
SU()Crinfcccion lnfeccl6n de una -.ola cclula por mas de una parti- organismo a otra (ver Capitulo 3).
cula vinca, especialmentc dos viruo; de d1stinto tipo, 1 ropi mo Los tipos de lejidos o cclulas hospedadoras en que
o mfecci6n deliberada de una cclula designada para puede replicar un virus.
rescatar a un vims mutante. Una medici6n de Ia cantidad de virus viables prc-
Lnidadcs formndoras
uprcsion lnh1b1c16n de un fcnotipo mutante por una scgunda de placa (u.f.p.) sentes en una prcparac16n 'irica; incluye tanto los
mulaci6n supresora, que pucde estar bien en el vims libres como las celulas infectadas contcnicn-
genoma viral o en cl de Ia cclula hospedadora (vcr do particulas viricas infeceiosas («ccntros int\:cti-
Capitulo 3). \OS» ).
Titulo Una medici6n rclativa de Ia cantidad de una sus- \'ncuna Un preparado que contiene una molccula antigO:n1~·n
tancia (por ej., virus o anticuerpos) presente en una o una mczcla de tales molcculas con el lin de indu·
preparaci6n. cir una respuesta inmunitaria. Las vacunas 'iricno;
Principios de virologia molecular
I
La clasificaci6n de los agcntes infccciosos subcelulares es mas compleja de lo qu..:
puede parecer a primcra vista, y cs convenicnte comenzar con varias definiciones:
La Sistematica es la ciencia que organiza la historia de las relaciones evolutivas cntr..:
los organismos.
La Clasificaci6n detcnnina las relaciones evolutivas entre los organismos.
La ldentificac:ion reconoce el Iugar de un organismo en un esquema de elasificaci6n
existente, a mcnudo usando clavcs dicot6micas para identificarlo.
La Taxonomia (nomenclatura) asigna nombres cicntificos de acuerdo con unas reglas
cicntificas acordadas intemacionalmente. Los grupos taxonomicos oficiales (de ma-
yor a menor son):
Reino (por ej., animates, plantas, bacterias; no sc aplica a los virus).
Phylum (por cj., vertebrados; no se aplica a los virus)
Close (grupo de 6rdenes relacionados; no se aplica a los virus)
Orden (grupo de fami lias relacionadas)
Familia (grupo de gcneros relacionados)
Genera (grupo de especies relacionadas)
£specie, el grupo taxon6mico mas pequei'io
La importancia de Ia identificaci6n de los virus sc ha discutido en el Capitulo 4. Los
agentes subcelulares presentan un problema particular para los taxonomistas. Son dema-
siado pequei'ios para scr vistas sin microscopios electr6nicos, sin embargo, cambios muy
pequcfios en su estructura molecular puedcn dar Iugar a agcntcs con propiedades radical-
mente difcrcntes. La gran mayoria de los virus que se conocen han sido estudiados par-
que posccn un potencial pat6geno para los sercs humanos, los anima tes o las plantas; por
lo tanto, los sintomas de Ia enfennedad causada por Ia infecei6n es un criteria utilizado
para facilitar Ia clasificaci6n. La estructura fisica de una particula virica puede determi-
narse directamente (por microscopia electr6nica) o indirectamente (por estudios bioqui-
micos o serol6gicos) y tambicn se utiliza en Ia clasificaci6n. Sin embargo, el analisis de
Ia estructura y Ia secuencia del genoma viral contintta aumentando en importancia, ya
que las tccnicas de biologia molecular proporcionan una via r{tpida y precisa para deice-
tar c idcnti ficar muchos virus distintos.
En 1966 sc estableci6 el Comitc lntcmacional de Nomenclatura de Virus y clabor6 cl
primer esquema unificado de clasificaci6n de virus. En 1973, este comitc ampli6 sus
objetivos y se autodenomin6 Comitc lnternacional de Taxonomia de Virus (C ITY) (en
inglcs, lntemacional Committee on Ta:w nom_v <Jl Viruse.\, ICTV), que se reune cada
cuatro afios. Se han establccido unas nonnas para Ia taxonomia de los virus, algunas de
las cuales son:
Nose emplean los nombres binomiales en latin (por ej., Rhahdovirus cwpio). No sc
dcben uti lizar nombres de personas en Ia nomenclatura. Los nombres deben tcncr
significado internacional.
El nombre de un virus debe tener significado y debe contener el menor numero posi-
blc de palabras. Series de numeros ode letras no son aceptables como nombrcs.
Una espeeie vi rica es una clase politetica ( es decir, un grupo cuyos miemhros tic-
nen siempre varias propiedades en comtm, aunque no haya un solo atributo comim
Clasificaci6n de los agentes infecciosos subcelulares
Principios de virologia molecular ~--
- _...-
.-<E
~
~
presentc en todas sus miembras) de virus que canstituye un linaje de replicaci6n y
que acupa un nicha ecal6gico particular.
O rden Caudovirales: bacteriOfagos con cola
Un genera es un grupo de especies viricas que comparten caracteres comunes. La
aprobaci6n de un genera nuevo esta en dependencia de Ia aeeptaci6n de u na espe- Hospedadores
Familia !!:specie t ipo
cie tipo (es deeir, una especie que presente las caracteristicas t ipieas en las que se (subfam ilia) Genero
basa el genera). Fago T4 cle Enterobacteria.\ Bacterias
Fagos similares a T4 Bacterias
Una familia es un grupa de gcneros con caracteres comunes. La aprobaci6n de una t.~roviridae Fago PI de Enterohacterras
fagos simi lares a PI Bactcrias
fami lia nueva esta en dependencia de Ia aceptac ion de un genera tipo. Fago P2 de Enterobacteri~IS
Fagos similarcs a P2 Bacterias
Fugo Mu de £nterolwcterws
En terminas generales, los grupas de virus relacionados se dividen en familias cu- Fagos simi lares a Mu Bacterias
Fago SPOI de Bacillus
Fagos similarcs a SPOI Bactcrias
yos nombres terminan en el sufijo «viridae» (por ej., Poxviridae). En Ia mayoria de los 11,:11s q,H de 1/alohacterium
Fagos sunilarcs a <)IH Bactcrias
casos, nose ha establecido un nivel superior de clasificacion a Ia familia, aunque re- Fogo T7 de Enterobacteria:~
Poclm·iridae Fagos similarcs a T7 Bactcrias
cientemente se han creado tres ordenes (grupos de familias re lacionadas) (ver Capitu- Fago P12 de £nterohacterras
Fagos similarcs a P22 Bacterias
Fago $29 de Bacillus
lo 3). En unos pocos easos, las familias muy grandes se han subdividido en subfamilias Fagos similarcs a <)129 Bacterias
Fago /, de £nterobacterias
y acaban en el sufijo «virinae». Las subespecies, las ccpas, los aislados, los mutantes y Siphm·iridae Fagos similarcs a A Bacterias
Fago T 1 de £nterohacterias
Fagos similarcs a Tl Bacterias
los recombinantes creados artificialmente en el laboratorio no son reconocidas oficial- Fago T5 de Enterobacteria.~
Fagos s1milarcs a T5 Bactcrias
mente por el C ITV. FCI~O L5 de t.~rcobCicterias
Fagos s1milarcs a L5 Bacterias
Fago c1 de Lactococcus
Los nombres de ordenes, familias, subfamilias, gcneros y especies de virus deben Fagos similarcs a c2 Bacterias
Fagos s1milares a x.:vll l'lrus x.MJ
escribirse en cursiva con Ia primera letra mayuscula. de Methanobacterium
1nvertcbrados
Otros nambres no se escriben con mayuscula, a no ser que sean nombres propios Ascovirus de Spodop1era
Ascoviridae Ascowruv
(por ej., Poliovirus, virus de Ia eneefalitis del rio Murray). jrugiperda
Vcrtebrados
• Este formato debe ser usado solamente cuando se refiere a entidades taxonomieas Adenoviru.~ ovino D
Aclenm•iridae Atadenm•iru~ Vcrtcbrados
Adenovirus de gallina A
oficiales; noes posible centrifugar Ia especie Poliovirus, por ejemplo, pero es posi- Aviadenm•irus Vcrtebrados
Adenovirus hwnano C
ble ccntrifugar poliovirus. Mastodeno1'in1S Vcrtebrados
Adenovirus cle pa1'0 B
Siadenovirus Vertcbrados
La eursiva y Ia mayuscula inicial no se emplean para el uso vemaculo (por ej. , 17rus de Ia .flebre pordna
Asflvirus
rinovirus; pero el genera Rhinovirus), para acronimos (por ej., VII 1-1 ), ni para for- africana .
Invcrtcbrados
mas adjetivadas o posesivos (por ej ., Ia polimerasa de poliovirus). Virus de Ia nucleopolihedrosrs
Nucleopol\•hedrol'iru.~
Baculm·iridae cle Autograplw californica
(Vcr Van Regenmortel, M. H. V. ( 1999). How to write the names of virus species, lnvertebrados
Granr1lovirus
Grcmulovirus
Archives of Virology, 144(5): I 041-1 042). de Cydia pomonella
13acterias
El septimo infom1c del C ITY se publico en el aflo 2000 (Van Regenmortel, M.li.V., Fago PM2 de Alteromonas
Corlicol'iritlae CorticOI'irus Archaea
Fauquet, C.M., Bishop, D.H.L. , Carstens, E.B., eta/., Eds., Virus Taxonomy. Seventh 1/rus SSVI de Sulfololws
Fusellm·iridae Fuse/lm•irus Archaea
Virus SNDV de Suljolobus
Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses . Academic Press, San Gutlal'iridae Gultm•irus Vertcbrados
l'irul' herpes de lctaluridue
Diego, CA, 2000; ISBN 0 123702003), y Ia informacion de estc documento csta extra i- Herpesl'iridae · /C'Ialuril·ims
tipo I
da de dicho informe, con postcriorcs revisioncs en 2004. Mas de 1.550 cspccies de Vcrtcbrados
Virus /re!pes del gal/o 2
virus pertenecientes a 3 ordcnes, 56 familias , 9 subfamilias y 233 gcncros se rccono- Alphaherpes- Mardil'irus Vertebrados
v;111s herpes humano I
drinae Simple.wirus Vertebrados
cen en este informc. Estos virus bien caracterizados son una proporci6n desconocida Virus herpes humano 3
Varice/IOI'irus Vertebrados
del total de virus que cxistcn. En Ia proxima reunion del CITY sc habran afladido Virus herpes del gallo I
lltovirus Vertebrados
indudablcmcntc muchos mas virus a esta lista*. Virus herpes hwnano 5
Bewherpes- Crtomegalo1·irus Vertebrados
Virus herpes murino I
virinae fo,furomegalovirrls Vertebrados
Virus he1pes lwmano 6
Roseolol'irus Vcrtcbr.1dos
• N. del T. : El octavo infonne del CITV se publico en cl a no 2005 (Fauquct, C.M., Mayo, M.A ., ManilofT, Virus herpes Jwmano 4
Gammaherpes- Lymphocrypto1·irr1s Vcrtcbrados
J., Desselbcrger U., Ball, L.A., Eds., Virus Taronomy. Eigth Reporl of the International Commiltee on l'lrus herpes simio 2
virinae Rhadinol'irus
Taxonomy of Viruses, Elsevier/ Academic Press, Londres, 2005; ISBN 0 122499514) y en cl se incluycn
(nmtrmia)
1.938 espccies de virus pertenecientes a 3 6rdenes, 73 fami lias, 9 subfamilias y 287 gcneros.
Principios de virologia molecular Clasificaci6n de los agentes infecciosos subcelulares
-------
Virus AD~ de doblc cadcna (CmrtbmaciOu).
Familia
Familia
(subfamilia) Gcnero Espccic tipo Especie tipo llospedadores
Hospedadores (subfamilia) Gcnero
( nmll mia 1
Clasificaci6n de los agentes infecciosos subcelulares
- -~ ~~·~-~ ..---
Vi;us ARN d-e scntido positi\'o ( Contin~tac{o_[jj~:~
I~' Virus ARN de sentido positivo (Continuacitln). I
(contimia)
Principios de virologfa molecular
--- ~-- ~- -- -- Clasificaci6n de los agentes infecciosos subcelulares
Familia
(subfamilia) G cncro Especic lipo Familia Gcnero Espccie tipo Hospedadores
llospcdadorcs
8onwl'iridae Bornavirus
l'irtt.\ de Ia enfermedad Retr01•iridae A lpharetrOI'irus Vims de Ia leucosis m•iar Vcrtebrados
Vertcbrados
Filo1•iridae de Borna 8etaretro~·irus 11rus del 111mor mwnario Vcrtebrados
Virus simi lares a Marburg I iru.1 Marhurg del raton
Virus similarcs a Ebola Vcrtcbrados
Param1~W1·iridae
Virus £bola Gamnwretm1•irws l'irus de Ia leucemia 111/ll'ina Vcrtebrados
Vcrtcbrados
Para!I~VXOI'irinae Al'ulm•iru.\ DeltaretrOI'irus 1'irus de Ia leucemia h01•ina Vcrtebrados
Virus de Ia en(ermedad Ep.l·iiOIII'etrovirus Vim.~ del sarcoma dermico Vertcbrados
Vcrtebrados
de Nell'casfle de miller
llenipavirus Virus 1-lendra
Vcrtebrados Lenfll'il'lls Virus de Ia imnunodejiciencia Vertcbrados
Aforhillil'lrus
Virus del sarampion humana I
Re.1pirovirus Vcrtcbrados
~1ms Sendai Spu11WI'irus Spullwl•iru.\· humano Vcrtcbrados
Ruhulcn·iru1 Vcrtcbrados
P!l£'/t/1/ol•irlnae Viru.1 de Ia parotl(/itis Metariridae MeUII'irus 1/rus Ty3 de Sacclwromrces Hongos
Pnewnovims Vcrtcbratlos
Vims respiratorio sincitial Vcrtebrados cerel'isiae
humano Errantll'irus lints gypsy de Drosophila In vertebrados
.Metapneumovin1s
Rhahd01•iridae Pneumovirus aviar melanogu.1·ter
Vesiculo1·irus Vcrtcbrados
Virus de Ia e.\lomutitis l'esicular Vcrtebrados P~eudo1·iridae Pseudm·irus 1'irnv Tr 1 de Sacclwromrces ln vertcbrados
de Indiana l.'t!l'£1\'iSiliC!
Ly.ua1·irus I'iru1 rabico
Vcrtcbrados /lemil·ims l'im.\ copia de Drosophila lnvcrtcbrados
Ephen1eroviru.1·
11rus de Ia jiebre (!/imera bol'ina Vcrtebrados mda1wgaster
Vo1·irlwhdo1'iru.\
l'iru1 de Ia necrusi1
Vcrtebrados
hemawpoyetica mfecciosa
C)•torhahdo,•irus
l'iru1 de Ia amarilh·= necr6tica Plantas
de Ia Iechuga
Nuc/eorhahdol•iru,\
17rus del enani.11110 amarillo Plantas
de Ia palata Cru o VII Virus ADN con transcliipc~~n in\'ersa.
Familia Gencro
Espccie tipo Familia Gcncro Especic tipo Hospedadores
Hospcdador
A renaviridae A renal'lrus
l'iru1 cle Ia wriomeningiti.l Vcrtcbrados IIepadnm ·iridae Orthohepadnm·in1s l'irus de Ia hepatitis 8 Vcrtebrados
81111.\'a~·iridae linfocitaria Avihepadnavin1s Virm de Ia hepatitis 8 del palo Vcrtebrados
Orthohun1'lll'in1s I irm 8w~ramll'em
Vcrtcbrados Caulimm ·iridae Caulitnm·irm rims delmosaico de Ia coli/lor Plantas
llanlal'trus
11rus llantaan Badna1•irus linn del moteado amarillo Plantas
Nairo1·irus Vcrtcbrados
I 'i111.1 de Ia enfermedad 01•ina Vcrtcbrados de Commelina
de Nairobi ('avemovinl.\ l'ims delmosaico l'eleado Plantas
Ph/ehol'lrus
I irm .1iciliano de lafiebre de Ia yuca
Vcrtcbrados
de Ia mosca de Ia arena Pewvirus l'ims del1·e teado daro Plantas
Tospo~·irus
Delta11irus 1/rus del bronceado del tomate Plantas de Ia petunia
OphifJI'irus 1/rus de Ia hepatitis delta Vcrtcbrados So_1·mm•irus Jlru.v del moteado clor6tico Plantas
11rus de Ia psorosi.1 Plan tas de Ia soja
Orthomyxoviridae de los dtricos Tllllf:!,I'CJI'il'liS ~1ru.\ bacili/(mne deltungro Plantas
Influenza A virus
~'ims lnjluen=a A delarro=
lnjluen::a 8 vims Vertcbrados
I 'irus Influenza B
Influenza C vims Vertcbrados
1/ms lr!fluen::a C
lsavirus Vertcbrados
Virus de Ia anemia infecciosa Vertcbrados
del salmon
Thogotovirus Vints Thogoto
Tenuivirus Vertcbrados
Vin1s de Ia hoja rayada delmafz Plantas
Principios de virologia molecular
1796: Edward Jenner utiliz6 Ia vJruela de las vacas para \acunar contra Ia viruela
hurnana. Aunque a Jenner habitualrnente se le concede el mcrito de Ia vacuna-
cJon, en realidad Ia , Ia practica de mfectar a las personas dclibera-
damente con viruela para protegerlas de Ia pear forma de esta cnfermedad, se
habia practicado en China al rnenos 2.000 aiios antes. (: n 1774, un granjero lla-
rnado Benjamin Jesty habia vacunado a ~u esposa y sus do~ hijos con viruela
bovina tornada de las ubres de una \aca infcctada y habia escrito sabre su expe-
riencm (ver 1979). Jenner fue Ia prirnera persona en vacunar deliberadamcnte
contra una enfennedad infecciosa (es decir, en utilizar una preparaci6n conte-
niendo una molccula ant1gcmca o una me.tcla de tales molcculas con el fin de
inducir una respuesta inmunitaria).
1885: Louis Pasteur expenmento con Ia \acuna de Ia rabm, utilizando el tennino virus
(del latin, veneno) para descnbir al agente. Aunque Pasteur no distinguia entre
VIruS y OtfOS agentes infecciOSOS, c( introdujo los tcrminos de l 'irus y \'CICIIIWCiOII
(en honor de Jenner) y desarrollo las bases cientificas para Ia estrategia expen-
rnental de Jenner en Ia vacunaci6n.
1886: John Buist (un patologo cscoccs) observ6 «cuerpos clcrnentalcs» en Ia linfa
teii1da de lesiones cutancas de un paciente con viruela y penso que eran csporas
de m1crococos. Sc tr.uaba en realidad de particulas de virus de Ia viruela; sufi-
cientemente grandcs para ser vistas con cl microscopio 6ptico.
1892: Dmiti lwanO\\Ski dcscribi6 el pnmer agente infeccioso «filtrable» el virus del
mosa1co del tabaco (VMT) mas pequeno que cualqu1er bacteria conocida.
lwanowski fue Ia prirnera persona que distingui6 entre virus y otros agentes in-
feccJOsos, aunque no fue plenamente consciente del sigmficado de su hallazgo
1898: Martinus Beijerinick ampho el trabajo con el VMT de lwanowski y fonn6 cl
primer concepto claro de virus, wnfllgium l'ivum .fluidum; un agente infeccioso
vivo y soluble. Be1jerinick confirm6 y amplio el trabajo de lwanowski y fue Ia
persona que desarrollo cl concepto de virus como una entidad distinta.
Freidrich Loeffler y Paul Frosch demostraron que Ia fiebre aftosa es causa-
da por este llpo de a gentes « fi ltrables». Loeffler y Frosch fueron los primero'>
en demostrar que los \ irus pueden infectar a los ani males igual que a Ia-,
plantas.
1900: Walter Reed demostr6 que Ia fiebre amarilla es transmitida por mosquitos. Aun-
que Reed no reparo demasiado en Ia naturaleza del agente causante de Ia fichrc
amarilla, el y SUS coJaboradores fueron los prim erOS en demostrar que Jos \ lrli S
podian ser transmitidos por insecta'> vectores como los mosqUitos.
1908: Kart Landstciner y Erwin Popper demostraron que Ia poliomielitis es causaul<t
por un vi rus. Lands teiner y Popper demostraron por primera vez que Jo., \ im
podian infectar a las personas al igual que a los animates.
Principios de virologia molecular
La historia de Ia virologia
1911 :
Francis Pe)•to~ Rous demostr6 que un virus (el virus del sarcoma de Rous)
1952: Rcnato Dulbecco demostr6 que los virus animalcs pueden fonnar cal vas de una
pu_ede causar cancer en poll as (Premia obel, 1966; vcase 1981 ). Rous fue Ja
pnmera persona que demostro que un virus podia causar cancer. fonna parecida a los (Premia Nobel, 1975). El trabajo de Dulbecco
19 15: penniti6 Ia nipida cuantificacion de los virus animales utilizando ensayos que
Frederick Twort descubri6 virus infectando bactcrias.
19 17:
F~lix d ' Herelle dcscubrio indcpendicntcmentc VIrus de bacterias y acuno el tcr- antes solo habian sido posibles con bacteri6fagos. .
Alfred Hershey y Ma rtha C hase demostraron que e l ADN era el matenal
mmo de . El descubrimiento de los bacteri6fagos ofreci6 una cxce-
lentc oportunidad para estudwr Ia replicacion de los virus en una cpoca antenor genctico de un . Aunque Ia evidencia inicial del ADN_ ~~mo base
a! d~s~rrollo de los cultivos celulares, cuando cl unico modo de estudmr los virus
molecular de Ia herencia genctica se descubrio utilizando un bactenofago, estc
em mlectando organismos entcros. princip1o es par supuesto aplicable a todos los organismos cclulares (jaunque no
1935: a todos los virus!).
Wendell Stanley cristalizo cl VMT y dcmostro que pem1anecc infectivo (Prc-
m~o ~obcl. 1946 ). El lrabajo de Sian ley constituy6 el primer paso hacia Ia des- 1957: llcin7 Fraenkei-Conrat y R.C. Williams demostmron que cuando se incuba-
ban juntas me/clas de ARN purificado del vin1s del mosaico del tabaco y prote~
cnpc1on de Ia estructura molecular de cualqu1er vmJc; y ayudo a desentraiiar Ia
nalura le/a de los virus. na de Ia cub1erta se fonnaban espontaneamcnte particulas viricas. El descubn-
1938: miento de que las particulas viricas podian fonnar-,e espontancamcnte a partir de
Ma:\ Theiler desarrollo una vacuna \iva atenuada contra Ia fiebre amarilla (Pre-
n~Jo Nobel, 195 1). La vacuna de Theiler era tan segura y tan efectiva que jtoda- subunidades puriticadas sin ninguna infonnac1on extcma indieaba que Ia partieula
se encontraba en un estado de encrgia libre minima y era par tanto Ia estructura
vm sc emplea actualmente! Su trabajo salvo mllloncs de vidas y cstableci6 el
modelo para Ia produccion de muchas vacunas posteriores. prcferida por sus componentes. La cstabilidad es una earacteristica importante
1939:
Em~ry Ellis Y Max Dclbruck establecieron el concepto de «cielo de crecimien- de las particulas viricas
Alick Isaacs y J ean Lindemann dcscubrieron cl mtcrfer6n. Aunquc las espe-
to_ vm1l en un paso», esencial para cl conocimiento de Ia replicacion vinca (Pre-
ranlas inieia lmcntc puestas en los mterferones como agentes antiv1rales ~e am-
m•o. No?_el, 1_9_69). Este trabajo estableci6 las bases para Ia comprension de Ia
repl~cac•on vmca; que las particulas 'iricas no crecen. smo que se ensamblan a plio espeetro equivalentes a los antibi6ticos se han disipado. fueron las pnmeras
part1r de sus componentcs preformados. citoquinas en scr estud1adas con detalle.
1940: Carleton Cajdusek propuso que un «virus Iento» era el responsable de Ia enfer-
Helmuth Ruska utilizo un microscopio electr6nico para captar las pnmeras ima-
g~_nes ~e particulas viricas. Junto con otros estudios fis1cos de" irus, Ia visualiza- medad conoc1da como kuru cau~ada por (Premia abel, 1976; vease
CJon d1recta de fue un avanee •mportante en Ia eomprensi6n de Ia es- 1982). Gajdusek demostro que cl curso del kuru era similar al de Ia tembladcra o
lructura de los virus. 1·crapie, que el kuru se podia transmitir a los ch•mp<mccs y que cl agente respon-
1941 :
C~orgc Hirst demostr6 que cl virus in fl uen/a aglutma hematies. t\te fue el sablc em un \irus atipico.
P~llller metoda rapido para euantificar \irus eucariotas. jAhora los \Jrus se po- 196 1: Sydney Brenner, Francois Jacob y Matthew Meselson demos_t ~a~on q~c el
dJan contar! bacten6fago T4 utili/a nbosomas de Ia cClula hospedadora para dmg•r Ia smte-
1945: SJS de proteinas virales. Fste descubrimiento revelo el mecanismo molecular fun-
Salvador Luria y Alfred Hershe) demoslraron que los rc • mutan
(Pre~1~io ob:l, 1969). lste lrabajo prob6 que en los virus operan mccanismos damental de Ia traducc16n proteica.
genct1cos sun dares a los de los organismos celulares y sent6 las bases de Ia com- 1963: Baruch Blumberg descubn6 cl virus de Ia hepatitis B (VIIB) (Premia No?el,
prension de las variaciones antigcnicas de los virus. 1976). Blumberg lleg6 a desarrollar Ia pnmcra vacuna contra cl ~JIB, cons•~e
1949:
~oh~ End~rs,_Thomas Weller y Frederick Robbins fueron capaces de cultivar rada por algunos Ia primera vacuna contra el cancer. debido a Ia mtensa asoc•a-
111 l 'llro polJO:'I':'S Ulllizando cultivos de eclulas humanas (Premio Nobel, 1954 ).
ci6n entre hepatitis 8 y cancer hep{ttico.
Este descubrun~ento permitio posteriormente el aislamiento en culti\OS cclula- 1967: Mark Ptashne aisl6 y estud1o Ia proteina represora de A.. Jacoby Monad fucron
res de muchos virus nuevos. los primcros que postularon a las protcinas represoras como molcculas reg~l ado
1950: ras. Junto al trabajo de Walter Gilbert sobre Ia proteina reprcsom Lac de Escll<'-
Andre Lwoff, Louis Siminovilch y "'iels Kjeldgaard descubrieron bacteri6fa-
richia coli, cl trabajo de Ptashne ilustr6 como las proteinas represoras son un
gos . . en Bacil/u.\ megaterium 1rrad iados con luz ultraviolcta y acuna-
elcmento clave de Ia regulacion gcnica y controlan las reaccioncs de los genes
ron el te:mmo de (Premia Nobel, 1965). Aunque cl concepto de lisogenia
ya ex1stm desde los ai\os 20, este trabajo clarifico Ia cxisteneia de ante las senalcs ambientales.
Theodor Diener descubrio los , agentcs de enfennedadcs de las planta~
Y virulentos, y condujo a estudios posteriores sabre el control de
Ia cxpresi6n genica en procariotas, resultando final mente en Ia hip6tesis del operon que no tienen capside protcica. Los viroidcs son agcntes infecciosos consistcntc~
de Jacob y Monod. en ARN de bajo peso molecular que careeen de capside, y que son responsablcs
de muchas cnfennedades de plantas.
La historia de Ia virologia
El_ Principios de virologia molecular
· · t d I v irus de h
. Robert Ga llo anunciaron el descu b rr m lcn o c •
1970: H oward Temin y David Ba lti m ore d esc ubrieron indcp cnd ientcmentc Ia 1983: Luc Mo ntagm c r Y 1 d 1 S IDA El agentc respon-
inmunodeficiencia humana (V III ). cl agcnte ca~~a c , ~ s. dcsdc cl com ienJ'o
tmnscriptasa inversa en los retrovirus (Premio Nobe l, 1975). El descubrimiento de sable del S IDA fuc ide ntificado en un plazo de solo 2 a 3 ano . .
Ia transcripci6n invcrsa a bria una via para que Ia infonnaci6n genctica Ouycra del
ARN al AD , re fu tando cl llamado «dogma central>>de Ia biologia molecular. de Ia cpiderma. . ·d (US DA) conccd io Ia
1985: El Departamento de Agricultu ra de los ~stados Um OS modificado ucnetica-
1972 : Pa ul Berg c re6 las pn mcras mo lccul as de A DN recomb ina ntc, geno mas de A DN
pnmcra liccncia para comercialiJ'ar cl pnmer o rgantsmo E: I . o. OM G
ci rcular de SV40 contcnie ndo genes de fago )... y el ope ron de Ia galactosa de mente (OM G); un virus para vacunar contra cl herpes porcmo. . pnmcr •
E. coli (Premio Nobe l, 19HO). Esto constituy6 el comien.w de Ia tccno logia del
A DN recombinan te. comercia~. h , R ob Fraley y colaboradores demostraron que las plantas d_c
1973: Pete r Oo herl)' y Rolf Zi nkernagel demostraron las bases del reconocimiento 1986: Rob e rt eac ), , ' Ia roteina de Ia capside del v irus del mosat-
antigcnico por el si'>Le ma inmuno l6gico cclular ( Prermo obe l, 1996). La dc- t~badcol :::a~~n(~~;") c:~,e:e~~~c~~cs ~ Ia infecci6n por este vims. Este. trabaj o
mostracio n de que los linfocitos rcconocen tanto los antigcnos viricos como los co e .. · d, 1 s plantas a los v1rus, un
fac tlit6 una mcjor comprensi6n de Ia rc<,lstencta c a . . .
antigenos del sistema mayor de hrstocompatrbi lidad con el fin de destnur cclulas . . . d 1. a! de los c ult ivadores de plantas durante slglos.
in fec tadas por ' irus estableci6 Ia especi fic idad del s iste ma rnm un itario celula r. obJctlvo pn mo r • • · · C (VIIC ) Ia causa de la
1975: Bernard \1 oss, Aaron S h atkin y colaboradorcs demostraron q ue el ARN men- 1989 : Se identific6 defi nrtivamentc _el vt.n ;: ~eBial~~~~~~~~:l primer a~ente infeccioso
sajero cont 1ene una caperu/a («cap» e n mg lcs) de nuclc6tidos en cl extremo 5', mayoria de los casos de hepattlls 111 n l . •. , , , , or tccnicas m as
identificado por clonaci6n molecular del genom.l, en ve/ de p
que afecta al procesam1ento corrccto d uran te Ia tmd ucci6n. Posteriom1cnte se
descubri 6 que estos ha lla/gos cfectuados en reovinr'> y vi rus vacuna se aplica n a lr•'ldi.Cionales
' ·
(vcase 1994 ).
· · (
· · · 1
b do ) de terap~a ge111ca 1Uman
a en
los A RNm ccl ul ares; un princ ip1o fu ndamental S II, ., a " lbO el primer proced umcnto apro a
1990 : e cv o c. . . b. d· severa ( << H' l'ere com Inned immune
1976: J. Mich ael Bishop y Ha ro ld Varmus detem1i naro n que cl del vi m s un ni no con 111111llnOdeficiCnCIH COI11 111~ a • < • lU\0 cxito. cste
del sarcoma d e Rous se pued e e ncont rar tamb1cn e n eclulas de a111malcs nonna- If' .·, .1, SCI D) utiluando un retrovlfliS \'ector. Aunque no
c e u I<: nc », , fi' cdad gcnctica humana.
les, incluycndo hu manos (Pre m1 o Nobel, 1989). Los p roto-oncogenes son esen- fue el pruner in te n to por corregl~ ~na c:l ~~n ' d ' I ' im s de Ia 'imela ( 185.587
ciales para el desarrollo nonnal, pero pucdcn convertirse en genes rclac ro nados t 993: Se complct6 Ia secucncw nucleottdlca del g~.:noma c I s lotes remanentes de
con el cancer c ua ndo se danan o modi fican rcguladores celulares (por cj., por pb ). L:n un princrpl~ se,pre~cnd~~ ~~bco;~~~~~~:~~~~~~ ~~tuv
icse completada Ia
tra nsduccio n por ' irus). v inl'> de Ia , 1rucla conscrv a os • . , . · d ' fini-
1977: Richard Roberts. e mdepend1entemente Phillip Sh arp, mostraron que los genes sccucncia de su gcnoma; sin embargo, csta decisio n ha sldo po spucsta 111 c
de ade novims estan intercalados con segmentos no codificantes que no especlfi-
dyamenCtch. ano Pat rick Moore y sus colabomdores identificaron el virus he~cs
can estn 1ctums protcicas ( ) (Premio Nobel , 1993). Posten om1ente se des- t 994: uan ,.., K · r t uevo patoge-
cubri6 que cl proceso de corte y empalme («.,p/icing» en ing lcs) de los genes de los h 8 (V llll-8) cl agcnte causal del sarcoma de aposr. ·.~e n
adenov1rus es tamb rc n aphcablc a los genes celularcs; un pnnc1pio fundamental. n~~~~~~~denti fica do ~m;lcando una tccnrca basada en Ia rea~~ ion en caden a de Ia
Fred erick Sanger y colaboradores detennina ron Ia sccue ncia complcta de los . . ( PCR) un 'l11:lli-.is de ddcrcncia de representacron. .
poIrmerasa • • ' · d 1 SIDA La pandcmJa
5 375 nucle6lldos del del bacte n ogafo <!>X 174 ( Prcrmo obel, 1980). 200 t : Se cumplc cl 25 a ni versa rio del descubrimiento del VIrus e b. ·t· aci6n del
Fuc Ia primera secuencia gen6mica completa que se obtuvo de un o rganismo. d I .. . ·onfinnados son una su es 101
de S IDA continila crcclen o; os casos c
1979: La Organizacion \1 undial de Ia Salud deelar6 o ficwlmente c rmd1cada Ia v iruela. total de casos realcs en todo cl mundo.
·d ·
h , no Url 11
leta del genoma um.1 ·
oo'
El ulti mo caso natu ral de vimela se observ6 en Somalia e n 19 77. Esta ha sido Ia e publico Ia secue ncia nucleoli 1ca comp . . .
S c de retrotransposones sum 1a-
primera cnfcm1edad infecc10sa complctamenle clim mada.
apro ·;...imadamcnte del gcnoma humano .,
se compon
.1
. . d. l-ea
? so, del gcnoma que co 1 1 •
198 1: Yo rio llinuma y colaboradorcs ais laron el virus d e Ia leucemia de cclulas T res a retrovims, jen comparacJOn con so o un -· o
humana (YLTII ) de pacien tcs con esta e n fermedad . Aunque se han asociado
genes un icos (no rcpet ldos)! . . d . ·I Vlii/SlDA en todo
varios virus con tumorcs humanos, el V LTH fue cl prime r vi ms huma no identifi-
2003:
r ' dOS de personas \ 1VIe11 0 con C
El niunero de ca-.os con lrn:'" . d. . de SIDA todavia continua c n:-
cado inequh ocamente relacionado con cl cancer. cl m undo alcan/a los 46 mlllones, y Ia pan erma
1982: Stanley Prusine r demostro que las protcinas in fecciosas que c l llam6
cie ndo. . · . mas grande conoctdn,
causan Ia te mb ladera o <<scrapie», u na c nfcnncdad ncurodcgenerativa fatal de El recicn descubierto Mimil'irus se convlcrle en e 1 vrms .
las ovejas (Premio Nobe l, 1997). Este fuc cl a\ ance mas s ignificativo e n cl desa- ..
con un d wmctro e
d 4 oo nm y un genoma de 1.2 Mpb.
. c h· a y postenormcntc
rrollo de nuestro conocimie nto de lo q ue prcv ia me ntc sc habian llamado enfcr- 1::.1 sind romc respiratorio agudo severo (SARS) surge en m .
mcdades por «virus lentos» y que ahora sc conoccn como e ncefalopatias cspon-
se disemina por todo cl mu ndo.
g iformcs transmis ib lcs (EET).
,
INDICE ALFABETICO
A Arbovirus, 242
Arenavirus, 8 1-82, 191
Acci6n antiviral de Ia citotoxicidad celular me- ARN bicatenario (be), 176
diada por anticuerpos (CCDA), 180 ARN de cadena sene ilia de polaridad (-), 120, 146
Aciclovir, 202 con intcnnediario ADN, 122, 147
Acidos nucleicos gcn6micos, II ARN de cadena sene ilia de polaridad ( 1 ), 120, 143
Acidos nucleicos gcn6micos viricos, 49 ARN de doblc cadena, 120, 141
Actuaci6n en cis, 88, 130, 157-158, 161 ARN de los retrovirus, 150
Actuaci6n en trans, 88, 130-13 I, 138, 161, 234 ARN de virus innuerva, secuencias tenninales co-
transcripci6n que funcionan en, 138 muncs en, 85
Adenoviridae, 71, 138 AR gen6m ico, 32, 144
Adenovirus, 138 ARNhn, 137
genomas de, 73 ARN mcnsajeros (ARNrn), 6, 17
organitaci6n del genoma de, 74 estructura en horqui lla, 160
regulaci6n de Ia cxpresi6n, 156 rnonocistr6nicos, 55, 60, 137, 142, 153
transcripci6n del genoma de adenovirus, 154 ARN viral (ARNv), 49, 60
transfonnaei6n de las cclulas infeetadas por, I 54 Autocrina, 225
ADN,6 Autographa ca/ifornica, 46
A DN de eadena sencilla, 120
ADN de doble cadena, 119, 138
ADN de dob le cadena con ARN intermediario, B
122, 148
ADN de simple eadena, 140 Bacillus megaterium, 131
ADN gen6mico, 31, 203 Bacillus .wbti/is, 13 1
Adsorei6n, I 08 Bacteri6fugo atcmpcrado, 88
Adyuvantes, 194 Bacteri6fago ¢X 174, 56
Aedes aeg_l'fJii, 242 Bacteri6fago A., 131, 134, 193
Agentes infeeciosos, sensibilidad a Ia radiaci6n Bacteri6fagos, 3, 17-18, 30, 35, 55-57, I 03, 105,
de los, 262 13 1' 223, 249
/\gentes sub> irales, 249 genornas de, 3
Agrobacterium tumefiu·iens, 164 suspensiones de, 7
Amilisis bioquimicos, 61 Bacteri6fagos y enfennedad hurnana, 223
An{llisis de huellas, I SO Bacu/oviridae, 45
An{llisis de Ia dosis infecciosa al 50% en cultivo Baculovirus, 46
celular (TC!D,0 ), 7 particu las de, 4 7
Am\lisis fisicos, 62 Begmovirus, 86
Anergia de celulas T, 216 Beijerinick, Martinus, 4
Animales transgenicos, 267 Bioinformatica, 18
Anticucrpos monoclonales, 12 Biologia molecular, 17, 62
Antigenos tumoralcs, 148 Bioterrorismo, 246
Apoptosis, 172, 193, 2 16, 235 Bornaviridae, 98
activaci6n de p53, 174 Bunyaviridae, 81
activaci6n de PKR, 173 Bunyavims, 81
desregulaci6n transcripcional, 174
expresi6n de proteinas extraiias, 174
hom61ogos de Bc l-2, 174 c
inhibici6n de caspasa, 174
inhibici6n de Fas/ FNT, 174 Cap, 76, 79
inhibici6n de p53, 174 Capside, 14, 33. 39, 47, 49, 74, 83, 86, I IX.
in terferencia con, 180 124- 125, 127, 13 1,250
miscelanea, 174 - simctria de Ia, 27
seiiales de receptor, 173 - protcina de Ia, 28
Principios de virologia molecular lnd1ce alfabetico
Capstde virica, 17, 27, 52, 114, 127,2 10 Desbalance Th I 'Th2, 217 Eschenchiu coli cnterohemomigico. 223 G
Capstdes, II 0 Dtfracct6n de rayos X, II 1-. spiculas, 40
Capsides de herpe~vints, 118 Dtgesti6n cn.t~m:itiea. 64 btimulaci6n autocrina, 225 Ganciclo\ tr. 202
Capsidcs de pteomavirus, 36 Diversidad antigcnica, 214 1-. \tructuras helieotdales, 85 Gcmact6n, 39, 124. 127
Cflpsides helicoidales, 28 Drogas anttvtrales, 200 Estudtos uhraestructurales. 9 Gcminivints, 84-!!5
Capstdes icosacdncas (tsomctricas), 33, 44, II 0 mctodos 11sicos. 9 Gcn de Ia proteasa. 159
Capstdcs t cosacdnca~ T 3, 52 espectroscopta. II Gen em·. 15 7
Carcinoma hepatocclular (CIIC), 237 E ~oluc10ne~ de sacarosa. I I Gen gug. 21. 157
Carcmoma nasolaringeo (CNF), 236 "ints en uhraeentrifugas. II Gen int. 231
Carga vtral y cmcllca de rcpltcacu)n, 21 H Electroforesis en gel de pohacrilamida (PAGI·), mtcroscopia electrolllca. 9 Gcn magtco 8 (g8p). 30
Caudovirales, 44, 97 59 Gen 111\'C, 231
Eucariotas. 2, 56, 60, 89. I02. I 04. 129, 135. I 58.
Caulimovtnts, 95 Elementos potenctadores (enhacers), I 55, 229 209 Gen pol. 157
Cclulas ascsinas naturales (natural ktller), 170 EnccfalomieiHts mi:ilgtca (EM). 222 control de Ia exprest6n gcnica en. 115 Gen Pmd. 265
mhtbtct6n de Ia hsis por, 179 [ncefalopatia espongtforme bovma (H B). 255.257 produce ton de A R'lm monoctstromco!>, 161 Gen Pmp. 265
Cclulas en monocapas, 7 fncefalopatia espongiforme fclina (II I·). 256 \trusde, 7 Gene!> precoces. 140
Cclulas cucariotas. 4, 52. 70. 251 fnccfalopatia transmbible del \is6n (LTV), 256 Lucari6ucos. 141! Genes reparadorcs del ADN. 227
CCiulas pnmanas, 7 l:.ncefalopatiru. e~pongiformes transmisiblc~ (I IT). [\aston de Ia eascada del comph:mcnto. 181 Genes supresorcs de tumores. 226
Cepas a\'lntlentas, 208 253 holuci6n n.:gresiva. 97 Genes tardios. 140
Chfumydwe, 2 en ammales, 253 Exones. 57 Gencttca molecular. 51!
Ctclo celular cucan6ttco, 230 - humanas, 259 [ :-.penmcnto de llershey-Chase. I 08 Gencttca \tral.
Cicio litico de replicaci6n, 153 origen espor:idico, 259 exprcsi6n de Ia mfom1aCtOn genettca. 129 control posl-transcripc10nal de Ia exprcsiim,
Cirrosis, 238 origen iatrogcnico/adquirido, 259 E:-.prest6n gcmcu, I 19 151
Citomegalovints (CM V), 169 origen famt liar, 259 Genoma. empaquetamtento del. 47
Citoquinas, inhibicion de Ia acci6n de, I XO Cnfermedad de Creutdeldt-Jakob (I:CJ). 259 estratcgtas de codtficaci6n del. 137
Clonact6n b10l6gtca. 61 [nfermedad de Crohn, 222 F - estntctura del. SS
Clonact6n molecular, 59 Enfermedad de desgaste cr6ntco (EDC ), 256 replicaet6n del. 119
Comovtnts T 3, 51 l· nfermedad de llodgkm, 237 Factor acelerador de Ia descompostct6n (DAI ). Genoma btpartlto de bcgmo' irus. organizacion. 86
Complejo transcnptasa mversa-integrasa, 92 Enfermedadcs emergentes, 243 112 Gcnoma de AON, 106
Complcmcntaci6n alclica, 67 Enfennedades emergentes viricas, 245 ractores en /rem\, 153 Genoma de ARN. 252
Complementaci6n asimctnca, 67 EnsamblaJe, 122 Factores autoerinos. 245 Genoma de Ia cclula eueariota. 3
Complementact6n no alclica, 67 LnsamblaJe de los vints. 202 I act orcs pamennos. 24 5 Genoma de los adenovtrus, 154
Cort!, 32, 43-44, 5 1 Lnsayos de cambto de movtltdad electroforcuca. Factores a. 130 Genoma de paptloma' trus. 235
Coronavtrus, 80 150 rago lambda, 74 Genoma de ptcomavtnts. 157
Cmtalogral1a de rayos X, 28 Ensayos de placas. I 04 fagoSP01.131 Genoma de rctrO\ tnts, ISH. 229
Cromallna, 48, 56, 92, 135, 225 [ nsayos de plaqueo. 48 I ago T4, 74 Gcnoma de SV40. 233
Cromatina de Ia cclula hospcdadora, mccantsmo I nsayos mmunoennmaucos (ELISA). II Fagos, 31-32 control de Ia tmnscripci6n, 149
de integract6n de genomas, 93 I nterobacterias T4. ensamblaje de las particulas I amctclovi r, 202 codtfieact6n de, 149
Cuasiequivalencia, 35 del fago de. 45 Familia lnm•iridac, 30 Genoma de VII I. 157
pnncipto de Ia, 17 l:.nttdades mdependtentes, 97 l·amilias de vtrus. funct6n y organitact6n. 91! Genoma de VL. fll. 157
Cuasiespccies, 63 l:ntomopoxvtnts, 46 ftcbrc del dengue hemorr.lgico (1-011). 221 Genoma del bactcri6fago T4, 76
Cuerpos de tnclust6n. 95, 124 Fnvoltura, 90, 158, 250 Ftebre hcmomigtca con sindrome renal (rl l')R). Genoma del fago I, 131
Culttvo celular, mctodos de. 7 Envoltura ltptdtca, 32. 39 243 Genoma del vtrus de ARN, 44
Curtovirus. 86 Envuelta. 117 hebrcs hemorragtcas, causas del shock en. 221 Genoma eucanota, 18
Cydia pomoneflu, 46 rnvuelta de retrovtnts. 126 Filo1iridae. 9!! Genoma f<\gtco, 13 I
Cy.Hoviridue, 42 Enzima transenptasa tnversa (AN poltmerasa l·lavivtnts, 79, 243 Genoma QX 174, 58
ARN dependientc), 18 Focos transformados, 62 Gcnornas, 6, 14, 18, 22, 25, 31, 47, 49, 5 1-52.
l:.n/imru. de <<Splicing». 68 Formaet6n del complejo in vitro, 61 55, 104, 118, 124-125, 128, 137, 148,
D Epidemias, 7, 96, 190, 194, 222, 239,243 Formaci6n del compleJO in vivo, 61 153,243,249,262
l:.pidemiologia, 95 Fuselfol'iridae, 42 Genomas sin vints, 249
Decapsidaci6n, 117, 202 Escaneado permeable, 157 Fusi6n, 125 Genomas <(grandcs» de A DN, 71
Deleciones, 65 Escherichia coli, 3 1, 75, I 05, 223 Fusion de Ia cnvuelta del virus, 115 Genomas «pequciios» de ADN, 74
Dependovirus, 140, 249 - fago en, 56 Fusion de membranas, 41, 116- 117 Gcnomas ambiscnses, 81
Principios de virologia molecular
indice alfabetico
Genomas recombinantes, 198
Genomas segmentados, 48 lnfccci6n productiva, 84, 86, 11 2, 185, 225, 233,
Intcrferon a , 17 5 Mezclas fenotip icas, 70
236
Genomas viricos, I, 17, 48, 102, 125, 129. 149,
lnfccci6n sistcmica, 193, 211 Interferon 13. 17 5 'vlicroscopio elcctr6nico de barrido (MEB). 15
I55, 187, 192. 195 Interferon y, 175 M icroscopio clcctr6nico de transmisi6n ('vi i I ),
lnfecci6n virica, 163. 176
activadores de Ia transcripci6n, 58 lntrones. 57, 153, 157. 25 1 15
bioquimica de Ia, 107
ambisentido, 55 lnvaginacioncs recubiertas, I 14 M icroscopio electninico de un virus (VMT). 15
curso de Ia, 190
analis is lisico de Ia estructura, 58 Microscopios e lectr6nicos de transmi si6n y de
evo luci6n, 95
complejidad de los, 55 barrido. prineipios del funcionamiento
multiplicidad de, 106
polandad ncgativa, 55 K de los, 16
pre\ cnci6n y tcrapia de Ia. 193
polaridad positiva, 55 Microl'lridae, 35
quim ioterapia de Ia, 198
promotores y ten111nadores, 5S Koch, postulados de, 4 M 1111i\ irus, 55. 83
\ ia sistema ner\ ioso. 1R6
sccucncia nueicotidica, 58 Min1fagos, 3 I
via torrentc sanguinco, 186
transcripcion invcrsa de, 96 Molccula inmunoglobulina de adhesion a ct!lula
lnfecci6n vinca de eclulas epitelialcs polariLadas
G licoforina, I I I L vascular (VCAM), Ill
IX6 '
G licoprotcinas, 39 Molcculas receptoras en Ia cc lula, 27, 39
lnfecc16n \ irica de los organismos. 163
<llicoprotcinas de virus innucn 7 a. I 12 ln fcccu)n \inca de plantas, 164 Lcsi6n cclular, mecanismos de, 209 \Jolluscum contagwmm. 179
G licoprotcinas transmcmbrana TM 1I 5 mecanicamente, 164 Le•·il·iridae, 55 Monoc1str6nicos, 80. I 20. 146-147
Granulovirus, 46 Liberacion, 123. 125-12X. I34 Mononega\ irales, 98, 121
propagac ion vegetativa/esqucjes, 164
Gran/ima. 172 scm ilias, 164 Liberaci6n de Ia ccl ula. 39 Morfologia de placa, 65
Gripe. pandemws de. 189 vectores. 164 Liberaci6n de Ia cclula por gemacion, 125 Muertc celular dirccta, 214
lnfecci6n \irica en animales, respuestas inmunl- Libcracion de los vims, 202 Muertc indirccta de cclu las infcctadas por V1H,
tanas. 167 Libcracion de lOS VlniS de las CCiulas infectadas, 214
II lnfeec10nes abortivas, 195 41 Mutaciones compcnsatorias, 66
lnh•bic•6n de Ia prcsentaci6n de antigeno restrin- Liberaci6n de los \ irus por gemaci6n, I 26 Mutaciones de rctroceso, 66
llantadrus, 8 I, 243, 246 gida por "v111C I, 179 Line<~s cclularcs mmortaliLadas, 7 Mutagenos in l'itro. 64
I lcmaglutinacion. 9, 41, 11 2 lnhibiei6n de Ia presentacion de antigeno rcstnn- Lmfa \ acuna1. 42 Mut{lgenos in l'ii'O, 74
I lcmaglutmina. 4 1 gida por MIIC II, 179 Lmfocitos T clloto:..icos (LYCs), 170 Mutantcs condiciona les, 65
llcmo lisis, 10 lnh1bidores metab61icos, 176 Linfoma de Burkitt, 236 Mutantcs viricos, 63
Hepadnm·iridae, 94, 237 lnmumdad humoral, evasion de Ia. 180 Lipoprotcina de baja dcnsidad (LDL). Ill tipos de. 64
llerpes .1aimiriJ, 21 1 lnmunodeficiencia combmada grmc (SCI D). 198 Lipothri.niridae, 42 !l~rcoplasma, 2
llei]JesJ•iridae. 7 1. 118 lnmunoensayos foca lcs. 61 L1sogenia, 88. I 3 I. I 34, 193 !1/rol'lridae. 44, 57, 97
llerpesmus, 52. 63, 72, 138, 211, 244 lnmu no nuoresceneia, 1o Lul ultmvio1eta (UV), 62
v!rus herpes humano 6 (VIIII -6), 244 lnmunoglobuhna lgA, 168
v1rus herpes humano 7 (VIfll-7). 244 lnmunoglobulina lgG, 168 N
virus herpes humano X (VIIII-8). 244 lnmunoglobulina lgM, 168 1\1
l lctcrocigosis, 70 lntcraeel6n de Ia capslde \ irica con Ia eclula hos- NecrOSIS, I 72
II ibridaci6n de ac1dos nuclc 1cos. 19 pedadora, 52 Maduracion. 123-124 N1dovirales. 98
I Iongo Podospora, 266 lnteraeei6n proteina-acido nucleico, 18 Maduraci6n de Ia cclula, 39 1trosoguanidina, 74
lnteracciones proteina-acido nuclcico, 47 Maduraci6n de Ia particula, 4 I Nodaviridae, 36
lntcracc•oncs \ in1s-hospedador. 181 Maduracion de los virus, 202 Nuclcocapsidc, 32, 39, 45, 48, 5 1-52, 85. 90, 116,
mucosas, 18 I
Mamivirus, 2 11 8, 146- 147
piel, 181
Mapas de recombinaci6n, 62 Nucleoide core, 32
lcosaedro, 33 tracto d igcstivo, 1X1 Mapas de reordenamicnto, 62 Nudeopo~t·hedro1•irus, 46
lcosacdro regular, 35 tracto respiratorio, 183
Mapas de traduccion, 62 Nuclcoprote ina, 32, 48
lcosac~.ros con ntlmcros de triangulac•6n, 36 lransmision horizontal, 184 Mapas de transcripc1o n, 62 Numero de triangulaci6n T, 35-36
Infccc10n abortiva. 190 transmisi6n vertical, 184
Mapas lisicos, 62
Interferon, 174
- transformaci6n de las cclulas, 190 Marcadores b1oquimicos, 65
lnfecci6n aguda, 190 decapsidacion de SY40, 178
Marco abierto de lectura (ORF), 76 0
In fccci6n cr6nica, 191 - hepat itis vi rica cr6nica, 178
Mastrevirus, 86
lnfeeci6n latente, 192 - penetraci6n de SV40. 178
Maxifagos, 3 I Oncogenes, 67, 225, 227
lnfeccion no productiva (abortiva), 233 - transcripei6n prima ria de genomas vfricos 178
Mctodo «Wcstem blot», II Oncogenes de los retrovirus, 232
lnfecci6n pcrsisten te, 191 transforac i6n cclular por rctro' irus, 178 '
Mctodos inmunol6gicos. 8 Oncogenes y proto-oncogenes, 226
usos tcrapcuticos del, 179
Mctodos serol6gicos, 8 Oncoprotefnas, localizaci6n subcelular, 228
lndice alfabet1co
Principios de virologia molecular
Siphm•iriclm.!, 44. 97 u [Virus. efectos c 1t opati co~ del] Virus de Ia mrnunodeficicnc.a hurnana (VIII), 61,
Si:.tcma pnncipal de histocompatibilidad (M IIC), 170 apopto'is. 2 I 0 11 3, 169, 2 13
S illo mtcrno de union al nbosoma ( I Rr~). 79, 158 Un1dades formadoras de plaea (ufp), !!, 104 cuerpos de mdusion. 210 anomallas mmunol6g1cas en Ia infccci<in pm
Splic111g, 73. 76. 146 despegan11ento del sustrato. 209 cl, 213
Staphrlocon·IH. 213 lom1a alterada. 209 Virus de Ia lcngua azul. 46
Sm·pto<"O<'< 11.1, 113 v fus16n de membrana,, 209 Virus de Ia leucem ia humana de cclulas T (VLI H).
Supcrantigcnos, 217 IJ\IS, 209 14X, 23 1
Supcri nfecc16n, 67, 69-70, !!6 Vaeunaellin, 4, 194, 198, 220, 241 pem1eab1hdad de memhmnas. 210 expresilln de los genomas de, 151
upre~16n, 66 Vacunas, 38, 194. 222, 239, 241, 243 enfcrmcdades rclac1onadas con. 220 \1rus de Ia leucemia munna ( VLM). 16 1
Supre\16n de Ia tenninacio n, 161 Vaeunas ant1-VIll, 2:!0 - evasi6n de Ia rcspucsta inmunitaria por los. Vin1s de Ia leucosiS a\ mr (Al V), 23 1
Supre~16n cxtragcmca, 67 Vacunas de ADN, 197 178 V1rus de Ia parotiditis (Parwm'\0\'ll'lllae), 32
Supr..:~wn 1ntragcmca. 66 Vacunas de ARN1, 197 hospcdadorc'> proeanotas, 57 Virus de Ia policdros1s e1toplasm:\tica, 46
Vac unas de subumdades, 194 interacc1ones gcnctica'> entre. 67 Virus de Ia rabta (Rhahdm·lrulae), 32
Vacuna~ 111ae11vadas, 19'i - interacc1oncs no genetiC<" entre. 70 \ 1rus de plantas ARI\ de polandad ( ). 80
T \ acunas VlfiCas \1\as (atenuadas). 196 rcp!Jcacit)n de los. 124 Vim., del hronceado del tornate (TSWV), 244
Valc1clm 1r. 202 sa Ito ant1gcmco. I XX \ 1rus del mosa1co de Ia coliflor (VMCo), 95
Tccn1ca de 1\orthem blot, 19 Van l eeuwcnhocl.., Antony, 4 - llpode,61 Virus del mosau.:o del chicharo ({ PM V), 165
Tccn1ca de Southern blot, 19 Variohtaci6n, 3. 5 tram.fonnac11in celu lar por. 224 Virus delmosa ico delnabo amarillo (VVINA), 13
Tccmcas de sedimentac1bn, 13 Vcctores v1ralcs y tcrapia gcnica, 197 - transm1s1on a travcs del med1o ambiente del. Vin•s del mosa1co del tabaco (VMT). 15, 2!!-29.
Tccn1ca~ moleculares in dtro, 12 Verdadera rcversu)n, 66 IX4 16'i
Tembladera (scrapie), 253-254 V III (\ irus de Ia inmunodcfic1cncia humana). 6 "vanante. 6\ - ensamblaJe de particulas de, 50
Tcrapia gcnica, \ectores ' 1rales en. 199 expres16n de los gcnomas de, 151 Virus AD . 26 orgamtaci6n del genoma del, 80
Titulo, med ici6n de, 9 mccanismo de fus16n eelular inducida por, 212 tmnsfonnac16n cclular por, 232 Virus dclmoteado de Ia \'a lila de Ia JUdia ( VM VJ),
Titulo alto del virus, 192 Virion, 39.41-42, 57. XI. 9 1, 94 122. 127, 147. VIrus arumales cn\-uehos. n 'il
Titulo de fagos, I 04 196 \m1s 1\R:-J de cadena negati\a, organitacilin ge- Virus del saramp16n (Pamm\'.\ 0\'irida<'), 12
Tilulos de anticucrpos. 244 Vinon mfccc1oso, 4!! ni1m1ca de, !!2 Vims del tumor mamario del ratbn (M~1TV), 23 1
Toga' 1rus. 79, 145 Vmom:s. 2, 16, 39. 44. 52, 75, 86. 95, I 04, 15!! \ims AR de cadena po'itl\a, 7X \1rus e mmunodeficiencia. 21 1
Tospm m1s, 4 I, !! 1-82 Vmoncs ICOsacdncns, 74 organ11ac1im gcn6m1ca de, 78 Vims l·bola, 246
To\111a de Sh1ga (St.\), 223 Vinones maduros, 119, 128 Virus ARN. 26 Vims emergcntes. 99. 2W. 242
I ranscnpcu.>n 111\'crsa, !!7 Virou.le. J, 25, 250, 252 \'irus \Ri" de polaridad negativa, 81 Virus e ntcrieos cllopallcos humanos hucrfanos
Transeripc1on que actua en tmm, 150 caps1dc de, 3 \ 1rus \RI\ ICosacdricos T• J, 51 (£CliO). Ill
Transcnptasa, 122, 142. 151 cmohura de, 1 \1ru., au\lllare-.. 67. 69 Vims cmucltos. 39, 42. 70, 124, 127
Transcntos asoc1ados a Ia latencm ( L \ 1). 193 \ 1ro1de de Ia p1el e1catritada de Ia mant.ana (Assad). Vm1s con AR m policistrimlco. 120 Virus gnpales ( Orthomncmrulae), 32
Transducc16n de seiiales. mecanismos celulares 251 Viru>. con cnvohura externa lip1dica. 14 Vints hehc01dales en"uehos, 51
de. 229 Viroide del cadang-cadang del cocotcro (CCCVd), V1rus con genomas segmcntados y muhpartitos. Virus herpes, 72
Transfece16n, 60, 62 251 83 genoma de. 73
Transfonnac16n celular. 208, 224 V1roide del tubercula fu\1forme de Ia pat,lta \m1s de Fp-.tcm-Barr (\I B). 169. 180. 212. 2.16 \'in" herpes humano 8 (\ 1111-8). 73
d1smmuc16n de Ia neees1dad de facture~ de ( PSTVd). 25 I v1rus de estmctura complc_ta, 42 V1rus hcrpc' simples (VII S). 72. 169. 192. 202.
CreCIITIICnto, 225 Virmde latente del lllpulo ( IILVd). 251 Virus de eucanntas, I 04 211
fornmci6 n de coloruas en medin ~cmis6l 1do, 225 Virologia, h1storia de Ia, 3 Virus d~.: Ia coriomening111s linfoc1taria (VCML). Virus influenta, 43, 84, 115
genoma 'irico. 225 s1stema de hues pedes "IHh, 5 191 gntpos de eomplementac1on de. 68
pcrd1da de Ia dependeneia de anclaJe, 224 tccn1ca.., serol6g1cas. I 0 V1ms de Ia cncefalomiocardills (\ EMC). Ill madur..1cion del. 118
pcrd1da de Ia inh1b1e1(m por conucto. 22'i Virolog•a molecular, I Virus de Ia enfern1edad de l\lard.• 211 segmentos genom1cos de, 84
Transmisi6 n ep1dcm1ca, 241 Virucla, 3 Virus de Ia cstomatlll'> "vestcular (VSV), 33.71 Virus mfluenLa inacti\'ado con luz ultraviolcta
Transm1s1bn no propagall'va, !!6 Virus, I Vims de Ia fiebre afiosa o glosopeda, 79 (UV), 175
Transposicion, 87 arquncctura de. 27 Vims de Ia ticbrc porema africana, 42 Vints lilleos. 127
Transposones, !!7 cepa de, 63 Virus de Ia gnp.:. I !!7 Virus mutantes. mutacl()ncs e~ponnineas, 63
Tropismo, 70, 113, 187, 21 1 control transcripcional d e Ia expresu)n, 148 Virus de Ia hepalltis ll (VII B). 94, 195. 234. 216 - mutaciones induc1das, 64
Trop1smo de VJH. 114 deslitam1ento anllgemco, 1&7 Virus de Ia hepa11t1s delta (V I ID). estructura del origen de, 63
Tropismo dual, 236 distinci6n con los organismos vivos, 2 ARN del, 253 Virus Nipah, 246
T_I'III OV/f'IIS, 145 cfectos citopaticos del, 209 propiedades del, 252 Vints nucvos, 239
Principios de virologia molecular