Nota 2: Este arquivo foi originalmente criado para a análise de redes de interações entre peixes limpadores e clientes. No entanto, os mesmos cálculos podem ser usados para qualquer tipo de rede.
1. Cálculo da degree centrality (centralidade por grau) da espécie
a. Conceito: i. Grau da espécie i é o número de interações da espécie i ii. A grau máximo em uma rede é o número de espécies da rede (número de clientes + número de limpadores) -1 (- a própria espécie) iii. A centralidade por grau da espécie i é o grau da espécie i dividido pelo grau máximo. b. Cálculo i. No Excel 1. Conte o número de 1s (grau) de cada espécie de limpador e cliente. 2. Calcule a centralidade seguindo 1.a.iii
2. Cálculo da closeness centrality (centralidade por proximidade) da espécie
a. Conceito: i. A proximidade é a menor distância em número de interações entre duas espécies ii. A proximidade máxima acontece quando duas espécies estão diretamente ligadas (distância = 1) iii. A soma das proximidades da espécie i com todas as outras espécies indica o quão próxima a espécie i está do resto das espécies da rede iv. Se a espécie i apresenta proximidade máxima com todas as outras espécies da rede, então a soma das proximidades é igual ao número de espécies na rede - 1 v. A centralidade por proximidade da espécie i é igual ao (número de espécies na rede-1)/(soma das proximidades da espécie i) b. Cálculo i. No Pajek 1. Selecione: File/Network/Read a. Abra o arquivo de interesse 2. Net/Vector/Centrality/Closeness/All 3. O programa gera um arquivo chamado “All closeness centrality in...” que contém a centralidade por proximidade das espécies 4. Salve este arquivo. O Arquivo salvado pode ser aberto no Excel ou no Notepad 5. Lembre-se que o arquivo salvo está organizado da seguinte forma: em primeiro lugar vem as linhas e depois as colunas. Entao se a espécie i de interesse é representada pela primeira coluna em uma matriz com 10 linhas e 5 colunas, o valor de da espécie i é o décimo-primeiro do arquivo. 3. Cálculo da betweenness centrality (centralidade por intermédio) da espécie a. Conceito: i. Geodésia é a menor distância entre duas espécies em uma rede ii. A espécie i intermedia a interação entre duas outras espécies j e k se a espécie i compõe a geodésica entre a espécie j e k. iii. A centralidade por intermédio da espécie i é igual ao (número de geodésicas que a espécie i intermedia)/(número de geodésicas da rede) b. Cálculo i. No Pajek 1. Selecione: File/Network/Read a. Abra o arquivo de interesse 2. Net/Vector/Centrality/Betweenness 3. O programa gera um arquivo chamado “Betweenness centrality in...” que contém a centralidade por proximidade das espécies 4. Salve este arquivo. O Arquivo salvado pode ser aberto no Excel ou no Notepad 5. Lembre-se que o arquivo salvo está organizado da seguinte forma: em primeiro lugar vem as linhas e depois as colunas. Entao se a espécie i de interesse é representada pela primeira coluna em uma matriz com 10 linhas e 5 colunas, o valor de da espécie i é o décimo-primeiro do arquivo.