INSTITUTO POLITÉCNICO

NACIONAL
ESCUELA NACIONAL DE
CIENCIAS BIOLÓGICAS

Informe de práctica
Práctica No. 5

Diversidad microbiana en el suelo

Grupo 4QM1
OBJETIVOS
1. Determinar la diversidad de algunos grupos microbianos en una muestra de
suelo rizosférico.
2. Comparar la diversidad microbiana de diferentes comunidades (muestras
de suelo de la práctica de campo) mediante la aplicación de índices de
similitud.

RESULTADOS
Calculo del porcentaje de humedad en la muestra de suelo (Equipo 4).
Pi= Peso Inicial= 102.5 g.
Pf= Peso Final= 101.1 g.
Pi − Pf
%Humedad = { } X100
10
102.5 − 101.1
%Humedad = { } X100 = 𝟏𝟒%
10
Calculo del porcentaje de humedad en la muestra de suelo (Equipo 8).
Pi= Peso Inicial= 97.3 g.
Pf= Peso Final= 95.4 g.
Pi − Pf
%Humedad = { } X100
10
97.3 − 95.4
%Humedad = { } X100 = 𝟏𝟗%
10
Tabla 1. “Parámetros fisicoquímicos del suelo de las diferentes estaciones”

ESTACIONES / EQUIPO
PARÁMETROS 1/1 1/2 3/3 3/4 5/5 6/6 7/7 6/8
pH 7.29 7.46 7.03 7.81 7.9 8.18 8.4 8.25
Temperatura (°C) 19 16 12 12 20 10 13 11
% Humedad 2 7 3 14 24 17 22 19

Tabla 2. “Cuantificación (UFC/g de Suelo) De Los Diferentes Grupos Microbianos”

 Bacterias mesofílicas aerobias Actinomicetos
Estación
/ Equipo No. de UFC/g UFC/g No. de UFC/g UFC/g
Dilución Dilución
Colonias (B.H.) (B.S.) Colonias (B.H.) (B.S.)

1/1 10-4 114 1.14x107 1.16 x107 10-4 15 1.5x105 1.53x105

1/2 10-4 116 1.17x107 1.25 x107 10-3 10 1x105 1.07x105

3/3 10-5 109 1.09x108 1.12 x108 10-4 23 2.3x106 2.3x106

3/4 10-3 143 1.43x106 1.66 x106 10-3 6.5 6.5x104 7.5x104

5/5 10-4 60.5 6.05x106 7.9 x106 10-4 13 1.3x106 1.7x106

6/6 10-3 173 1.73x106 2.08 x106 10-3 15 1.5x105 1.8x105

7/7 10-4 57 5.7x106 7.30 x106 10-4 24 2.4x106 3.06x106

6/8 10-3 143 1.43x106 1.76 x106 10-3 11 1.1x105 1.35x105

Pseudomonas fluorescentes Bacillus sp.

Estación
/ Equipo No. de UFC/g UFC/g No. de UFC/g UFC/g
Dilución Dilución
Colonias (B.H.) (B.S.) Colonias (B.H.) (B.S.)

1/1 10-4 2 2x105 2.04 x105 10-4 2 2x105 2.04 x105

1/2 10-3 65 6.5x104 6.98 x104 10-3 7 7x104 7.5 x104

3/3 10-5 7 7x106 7.21 x106 10-5 3 3x106 3.09 x106

3/4 10-4 14 1.4x106 1.62 x106 10-4 4 4x105 4.65 x105

5/5 10-4 5.5 5.5x105 7.23 x105 10-5 6 6x106 7.89 x106

6/6 10-4 4 4x105 4.81 x105 10-4 1 1x105 1.20 x105

7/7 10-3 4 4x104 5.12 x104 10-3 2 2x104 2.56 x104

6/8 10-3 10 1x105 1.23 x105 10-3 90 9x105 1.11 x106

Estación Bacterias Corineformes Hongos Filamentosos

/ Equipo No. de UFC/g UFC/g No. de UFC/g UFC/g
Dilución Dilución
Colonias (B.H.) (B.S.) Colonias (B.H.) (B.S.)

1/1 10-2 11 1.1x104 1.1 x107 10-3 10.5 1.5x105 1.53x105

1/2 10-1 230 2.3x104 2.4 x104 10-2 64 1x105 1.07x105

3/3 10-2 103 1.0x105 1.0 x105 10-4 32.5 2.3x106 2.3x106

3/4 10-2 5.5 5.5x103 6.3 x103 10-3 9.5 6.5x104 7.5x104

5/5 10-2 47 4.7x104 6.1 x104 10-4 3 1.3x106 1.7x106

6/6 10-1 219 2.1x104 2.5 x105 10-2 9.5 1.5x105 1.8x105

7/7 10-3 3 3x104 3.8 x104 10-4 16.5 2.4x106 3.06x106

6/8 10-1 153 1.5x104 1.8 x105 10-2 23 1.1x105 1.35x105

Unidades formadoras de colonias sobre gramo (UFC/g) a

log (UFC/g) (B.S.)

base seca por estación de muestreo

9
8
7
6
5
4
3
2
1
0
1 (Eq 1) 1 (Eq 2) 3 (Eq 3) 3 (Eq 4) 5 (Eq 5) 6 (Eq 6) 7 (Eq 7) 6 (Eq 8)

Estación (Equipo)

Bacterias Mesofilicas Aerobias Actinomicetos Pseudomonas fluorescentes

Bacillus spp Bacterias corineformes Hongos filamentosos

Figura 1: Representación gráfica de los valores del cálculo del logaritmo base diez de las
unidades formadoras de colonia sobre gramo (UFC / g) en base seca de bacterias
mesofílicas aerobias, actinomicetos, Pseudomonas flouorescentes, Bacillus sp, bacterias
corineformes y hongos filamentosos obtenidas al sembrarse una alícuota de muestra de
agua traída de las cascadas de Atlihuetzia, registradas por los equipos de la sección 2,
del grupo 4QM1.

Tabla 3. “Morfología Colonial de las Cepas Dominantes de Bacterias Mesofílicas

Aerobias En Agar CPS-E”

Característica Colonia 1 Colonia 2 Colonia 3

Color Blanca Blanca Naranja

Tamaño 8 mm 6 mm 4 mm
Forma Circular Lobulado Circular
Bordes Entero Ondulado Entero
Elevación Plano Plano Plano
Luz Reflejada Brillante Brillante Brillante
Luz Transmitida Opaca Opaca Opaca
Superficie Lisa Lisa Lisa
Aspecto Húmeda Húmeda Húmeda
Consistencia Butirosa Butirosa Butirosa
Pigmento Difusible No No No

Tabla 4. “Morfología Colonial De Los Diferentes Grupos Microbianos”

Pseudomonas Bacillus Bacterias

Característica Actinomicetos
fluorescentes sp. Corineformes

Color Blanca Amarillo Blanca Morado

Tamaño 2 mm 6 mm 6 mm 2 mm
Forma Circular Circular Miceliode Lobulada
Bordes Entero Entero Ondulado Ondulado
Elevación Convexa Plana Plana Plana convexa
Luz Reflejada Mate Brillante Brillante Brillante
Luz
Opaca Opaca Opaca Opaca
Transmitida
 Superficie Lisa Lisa Lisa Lisa
Aspecto Seco Húmedo Húmedo Húmedo
Consistencia Dura Butirosa Butirosa Butirosa
Pigmento
No Amarillo No No
difusible

ABUNDANCIA Y DIVERSIDAD ENTRE EL MEDIO CPS-EL Y EL MEDIO AAP

(COMPARACIÓN).

COEFICIENTE DE SIMILITUD.

Sitio de
muestreo
Colonia
1
Colonia
2
Colonia
3
Colonia
4
Colonia
5
Colonia
6
Colonia
7
Colonia
8 Σ
Ecosistema 1 + + + + - - + - 5
Ecosistema 2 + + + + - + - - 5
Ecosistema 3 + + + + + - - - 5
Ecosistema 4 - + + + + + - - 5
Ecosistema 5 + + + + + - - - 5
Ecosistema 6 - + + + - + - - 4
Ecosistema 7 + + + - - + + - 5
Ecosistema 8 - + + + - + - + 5
Ya que se obtienen dos coeficientes iguales se procede a agrupar cada uno
de los ecosistemas mediante cuadros separados y comparar cuál de ellos
tiene el coeficiente más alto.

1er cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.88

2do cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.88

3er cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.88

Ya que en los tres casos se obtienen coeficientes iguales se agrupa cada
uno de los ecosistemas mediante cuadros separados y comparar cuál de
ellos tiene el coeficiente más alto.

1er cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.84

2do cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.84

3er cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.84

4to cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.84

Ya que en el tercer y cuarto cuadro se obtienen coeficientes iguales se
agrupa cada uno de los ecosistemas mediante cuadros separados y
comparar cuál de ellos tiene el coeficiente más alto.

1er cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.82

2do cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.82

Al ser iguales ambos cuadros, ya que solo hay una diferencia en el acomodo
de los ecosistemas y no en la agrupación solo se toma en cuenta uno de
ellos y se procede a realizar lo mismo que en las veces anteriores ya que
presentan 2 coeficientes iguales.
1er cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.80

2do cuadro obtenido de la agrupación de los ecosistemas con coeficiente de 0.80

El coeficiente mayor de los cuadros realizados es el segundo por lo que se

procede a agruparlo para obtener el coeficiente de similitud de todos los
ecosistemas agrupados.
DISCUSIÓN

Los microorganismos en el suelo se verán afectados por variables como el pH,

temperatura y humedad del suelo.

El pH se mantuvo casi constante en todas las estaciones con muy poca variación,
por su parte la temperatura varió entre cada estación lo que repercute en el
crecimiento de los microorganismos favoreciéndolos o afectándolos, dependiendo
del grupo microbiano.

En cuanto a la humedad, fue uno de los factores que más cambió a lo largo de las
estaciones con un intervalo del 2% al 24%; es necesario recordar que a menor
humedad existe menos agua disponible para los microorganismos. Y un exceso de
humedad puede limitar la cantidad de oxígeno, produciéndose un ambiente
anaeróbico y favoreciendo una serie de procesos donde el oxígeno no sea el
aceptor final de electrones como la desnitrificación y metanogénesis.

Bacterias Mesofílicas Aerobias

Son un grupo que por lo general son heterótrofas, donde la mayoría de estas
bacterias donde su pH óptimo es en la neutralidad, pero tienen rangos de
crecimientos que van desde pH de 6 a 8. Necesitan una actividad de agua muy
alta y son el grupo microbiano que se encuentran en mayor proporción, con una
variación entre 106 y 108 UFC/g de suelo.

Su predominio se explica ya que a algunas bacterias producen endosporas y

quistes latentes que les proporcionan resistencia a las variaciones de temperatura,
los niveles extremos de pH y a la desecación del suelo. De esta forma pueden
crecer de nuevo cuando encuentran condiciones favorables. Otras se protegen de
la depredación y de la desecación emitiendo una cápsula de sustancias mucoides.
Otras se desplazan en la solución del suelo mediante un flagelo para encontrar
más fácilmente el sustrato alimenticio.

Pseudomonas fluorescentes

Las Pseudomonas pertenecen al grupo de las BMA por lo cual tienen

características similares en cuanto requerimiento de humedad y el pH para su
crecimiento. A estas bacterias se les atribuye el incremento los fosfatos, nitrógeno,
sulfatos, amonio y la movilización del potasio.

En la estación 3 se obtuvo la mayor cantidad de estos microorganismos mientras

que en la 1 y 7 la menor cantidad.
Bacillus sp.

Las especies del género Bacillus son microorganismos que pertenecen al grupo
de bacterias mesofílicas aerobias, por lo que sus condiciones de crecimiento e
cuanto a temperatura, pH y humedad son relativamente iguales.

Uno de los principales microorganismos que se encuentran en los suelos son las
bacterias y dentro de este grupo, las formadoras de endosporas, el género
Bacillus sp. La endospora es una estructura especializada resistente a los efectos
letales del calor, sequedad, congelación, radiación y químicos tóxicos. En
consecuencia, las bacterias forman esta estructura para resistir las condiciones
adversas del ambiente, también la pueden llegar a formar como una defensa
metabólica. Por lo tanto, la formación de la endospora está dada por las
condiciones del medio en que se encuentran estas bacterias. Estas endosporas
pueden sobrevivir independientemente de la célula madre y pueden ser aisladas
desde una gran variedad de sustratos, dada su resistencia al aire seco, al largo
periodo de sobrevivencia bajo condiciones adversas, y a sus características
termorresistentes, ya que pueden llegar a soportar desde 80°C a 100°C de
temperatura. Es por esta razón que las diversas condiciones no afectarían de un
modo importante para su desarrollo y cuantificación, ya que al ser sembradas
estas bacterias encuentran los requerimientos necesarios.

En todas las estaciones se encontró este grupo de microorganismos, debido a lo

antes mencionado, Bacillus sp. Es un grupo de bacterias que debe encontrarse en
gran cantidad en suelos y no deben encontrarse impedimentos para su
crecimiento, como sucedió en la estación 3 y 5, las demás estaciones obtuvieron
un crecimiento constante de este microorganismo.

Actinobacterias

Son bacterias que se ven favorecidas cuando se encuentran en pH alcalino y se

ven desfavorecidas en pH ácidos. En zonas templadas, se alcanzan densidades
de población entre 108 y 1011 UFC/g de suelo.

Se reproducen por conidias y estas son resistentes a condiciones difíciles de

temperatura, acidez y humedad. Esto les permite germinar cuando se restablecen
las condiciones favorables para su desarrollo. En suelos secos los actinomicetos
pueden tener un buen crecimiento.

Dado que las bacterias se alimentan de compuestos orgánicos como azúcares y

proteínas, se concentran en los residuos verdes de las plantas jóvenes y en la
rizósfera donde se alimentan de células muertas y sustancias orgánicas liberadas
por las raíces (exudados).
En las estaciones 3,5 y 7 se encuentran en mayor proporción debido a que
encuentran el pH favorable (sin acercarse a la acidez) hacia un pH alcalino 7.03-
8.4. En la estación 3/4 a pesar de tener un pH optimo no se lograron aislar un
mayor número de colonias quizás por las características del suelo rizosférico ya
que era una mezcla entre suelo “normal” y arena.

Bacterias Corineformes

Las bacterias Corineformes son bacilos Gram positivos que se agrupan en

palisadas también denominadas "letras chinas". Uno de los géneros principales
es Corynebacterium cuyas especies son patógenas de humanos, animales y
plantas. El grupo Corineforme rara vez produce un crecimiento filamentoso, pero
posee componentes en su pared celular similares a los de los Actinobacterias.

En las estacione 3/3 encontramos el mayor número de estos microorganismos. Al

ser bacterias en donde no afecta mucho la humedad. El factor determinante fue el
pH el cual se vio favorecido en pH alcalino, pH que esta estación tiene. La
estación 3/4 cumple con el pH pero quizás al alto grado de contaminación
existente y no necesariamente con materia orgánica pudo afectar a las bacterias
corineformes.

Hongos Filamentosos

Los Hongos tienen un pH de crecimiento de entre 2 a 9. La mayoría de los hongos

encuentran su crecimiento ideal en pH ácidos, además de ser organismos
mesofílicos en su mayoría.

Crecen en forma de red extendiéndose como micelio hasta su estado reproductivo

donde dan origen a esporas sexuales o asexuales. Son importantes degradadores
aerobios de material vegetal en descomposición en suelos ácidos. Producen
enzimas y metabolitos que contribuyen al ablandamiento y a la transformación de
sustancias orgánicas. También estas enzimas forman parte de la actividad de
otros microorganismos.

La cuantificación de estos hongos es difícil ya que estos organismos en su forma

vegetativa liberan al ecosistema millones de conidios o esporas. Que pueden
germinar cuando se les coloca en medios de cultivo adecuados. El número
“normal” determinado es de entre 104 y 105 UFC/ g de suelo.

En la estación 3/3 se encontró una mayor cantidad estos microorganismos y en

las demás estaciones los valores se mantuvieron constantes, siendo también un
valor “normal” en la estación 1 donde se encuentra la principal zona de descarga
de contaminantes no necesariamente orgánicos, por lo que el desarrollo de los
hongos filamentosos se vio desfavorecido.

La comparación de comunidades microbianas a partir de cajas Petri con medio

CPS-EL y medio AAP se realizó mediante el Índice de Sorensen que nos indica
grado de diferenciación en cuanto a composición de especies que existe entre dos
o más comunidades, este índice solamente considera la presencia o ausencia
(incidencia) de especies. Los datos utilizados en este índice son de tipos
cualitativos, de todos los coeficientes con datos cualitativos el índice e Sorensen
es el más satisfactorio y los valores varían entre 0 a 1. El valor arrojado por el
coeficiente de similitud de todos los ecosistemas (8) agrupados corresponde a
0.67 un valor que tiende a acercarse a 1, este dato nos indica que la diversidad de
microorganismos en el suelo no es muy amplia o también puede interpretarse que
la similitud entre estos ecosistemas es muy parecida.

CONCLUSIONES

 El grupo de microorganismo con mayor presencia en el suelo rizosférico de

las cascadas de Atlihuetzia, Tlaxcala corresponde al grupo de las bacterias
mesofílicas aerobias.
 El grupo de microorganismo con menor presencia en el suelo rizosférico de
las cascadas de Atlihuetzia, Tlaxcala corresponde al grupo de
Pseudomonas fluorescentes.
 Los índices de similitud de las muestras se hacen en función de la
coincidencia de presencia y de abundancia de las características del par de
comunidades que se comparan.
 La diversidad microbiana en las diferentes comunidades no es muy grande.

Cuestionario
1.- ¿En qué tipo de suelos predominan los hongos y los actinomicetos y por
qué?
En suelo rizosférico ya que las plantas absorben del suelo por medio de sus
raíces agua y nutrientes entonces es justo donde se concentran, alrededor de las
raíces estando disponibles también para los microorganismos que habitan ahí,
además los actinomicetos al fijar nitrógeno y los hongos al descomponer materia
orgánica proporcionan los nutrientes de forma simple para las plantas. Algunas
plantas producen sustancias que benefician el crecimiento de hongos y
actinomicetos además de brindarles un ambiente adecuado y en algunos casos
protección frente a otros microorganismos.
2.- ¿A qué puede atribuirse la dominancia de ciertas bacterias sobre otras
poblaciones en su muestra de suelo?
A que estas poblaciones dominantes pueden ser autóctonas de ese hábitat por lo
tanto son capaces de crecer en las condiciones ambientales propias del lugar, son
capaces de tener actividad metabólica, son funcionales y competitivos, en cambio
algunas otras poblaciones recesivas que fueron aisladas pueden ser poblaciones
alóctonas y quizá las condiciones ambientales no sean las ideales para estos
microorganismos. Cabe mencionar que solo se aislaron y se analizaron pequeñas
cantidades de los microorganismos totales que hay en la muestra de suelo ya que
muchos de estos microorganismos no se desarrollan en los medios de cultivo que
se utilizaron en el laboratorio.
3. ¿Qué influencia tiene la rizosfera sobre la distribución de
microorganismos en el suelo?
Cerca de las raíces se encuentra una humedad relativa más alta comparada a la
humedad del suelo donde no hay raíces, gracias a la absorción del agua que
hacen las plantas; la porosidad del suelo, gracias a la estructura de las raíces
ayuda a la aireación; la formación de micro y macro agregados de materia
orgánica, crean un ambiente lleno de nutrientes y el pH forman un hábitat ideal
para los microorganismos, además, la rizosfera puede considerarse como una
zona de amortiguamiento microbiológico, donde la microbiota sirve de protección a
la planta de algún patógeno. En los primeros centímetros del suelo existe mayor
cantidad de restos orgánicos y O2 por lo que allí se dispone la mayor cantidad de
microorganismos con metabolismos aeróbicos.

Literatura consultada
 Valverde, T. Ecología y medio ambiente. Primera Edición. Ed. Pearson.
México. (2005).
 Thompson Louis M. y Frederick. R. Troeh. Los suelos y su fertilidad. Cuarta
edición. Editorial Reverté (2005) Barcelona, España. ISBN: 84-291-1041-0
pp. 44 y 45.
 Julio L.G. “Fijación y movilización biológica de nutrientes” Volumen 1. Ed.
Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Madrid, 1991. Página 207
(Libro electrónico)