Mol�cula

Ir a la navegaci�nIr a la b�squeda
Para otros t�rminos similares, v�ase Mol�cula (desambiguaci�n).

Representaci�n esquem�tica de los �tomos (bolas negras) y los enlaces moleculares

(barras blancas-grises) de una mol�cula de Fullereno C60, es decir, una sustancia
elemental formado por sesenta �tomos de carbono.
En qu�mica, una mol�cula (del nuevo lat�n molecula, que es un diminutivo de la
palabra moles, 'masa') es un grupo el�ctricamente neutro y suficientemente estable
de al menos dos �tomos en una configuraci�n definida, unidos por enlaces qu�micos
fuertes (covalentes o enlace i�nico).1?2?3?4?5?6?

En este estricto sentido, las mol�culas se diferencian de los iones poliat�micos.

En la qu�mica org�nica y la bioqu�mica, el t�rmino "mol�cula" se utiliza de manera
menos estricta y se aplica tambi�n a los compuestos org�nicos (mol�culas org�nicas)
y en las biomol�culas.

Antes, se defin�a la mol�cula de forma menos general y precisa, como la m�s peque�a
parte de una sustancia que pod�a tener existencia independiente y estable
conservando a�n sus propiedades fisicoqu�micas. De acuerdo con esta definici�n,
pod�an existir mol�culas monoat�micas. En la teor�a cin�tica de los gases, el
t�rmino mol�cula se aplica a cualquier part�cula gaseosa con independencia de su
composici�n. De acuerdo con esta definici�n, los �tomos de un gas noble se
considerar�an mol�culas aunque se componen de �tomos no enlazados.7?

Una mol�cula puede consistir en varios �tomos de un �nico elemento qu�mico, como en
el caso del ox�geno diat�mico (O2),8? o de diferentes elementos, como en el caso
del agua (H2O).9?Los �tomos y complejos unidos por enlaces no covalentes como los
enlaces de hidr�geno o los enlaces i�nicos no se suelen considerar como mol�culas
individuales.

Las mol�culas como componentes de la materia son comunes en las sustancias

org�nicas (y por tanto en la bioqu�mica). Tambi�n conforman la mayor parte de los
oc�anos y de la atm�sfera. Sin embargo, un gran n�mero de sustancias s�lidas
familiares, que incluyen la mayor parte de los minerales que componen la corteza,
el manto y el n�cleo de la Tierra, contienen muchos enlaces qu�micos, pero no est�n
formados por mol�culas. Adem�s, ninguna mol�cula t�pica puede ser definida en los
cristales i�nicos (sales) o en cristales covalentes, aunque est�n compuestos por
celdas unitarias que se repiten, ya sea en un plano (como en el grafito) o en tres
dimensiones (como en el diamante o el cloruro de sodio). Este sistema de repetir
una estructura unitaria varias veces tambi�n es v�lida para la mayor�a de las fases
condensadas de la materia con enlaces met�licos, lo que significa que los metales
s�lidos tampoco est�n compuestos por mol�culas. En el vidrio (s�lidos que presentan
un estado v�treo desordenado), los �tomos tambi�n pueden estar unidos por enlaces
qu�micos sin que se pueda identificar ning�n tipo de mol�cula, pero tampoco existe
la regularidad de la repetici�n de unidades que caracteriza a los cristales.

Casi toda la qu�mica org�nica y buena parte de la qu�mica inorg�nica se ocupan de

la s�ntesis y reactividad de mol�culas y compuestos moleculares. La qu�mica f�sica
y, especialmente, la qu�mica cu�ntica tambi�n estudian, cuantitativamente, en su
caso, las propiedades y reactividad de las mol�culas. La bioqu�mica est�
�ntimamente relacionada con la biolog�a molecular, ya que ambas estudian a los
seres vivos a nivel molecular. El estudio de las interacciones espec�ficas entre
mol�culas, incluyendo el reconocimiento molecular es el campo de estudio de la
qu�mica supramolecular. Estas fuerzas explican las propiedades f�sicas como la
solubilidad o el punto de ebullici�n de un compuesto molecular.

Las mol�culas rara vez se encuentran sin interacci�n entre ellas, salvo en gases
enrarecidos y en los gases nobles. As�, pueden encontrarse en redes cristalinas,
como el caso de las mol�culas de H2O en el hielo o con interacciones intensas pero
que cambian r�pidamente de direccionalidad, como en el agua l�quida. En orden
creciente de intensidad, las fuerzas intermoleculares m�s relevantes son: las
fuerzas de Van der Waals y los puentes de hidr�geno. La din�mica molecular es un
m�todo de simulaci�n por computadora que utiliza estas fuerzas para tratar de
explicar las propiedades de las mol�culas.

�ndice
1 Definici�n y sus l�mites
2 Tipos de mol�culas
3 Descripci�n
4 Mol�culas en la teor�a cu�ntica
4.1 Aproximaci�n de Born-Oppenheimer
5 V�ase tambi�n
6 Referencias
6.1 Bibliograf�a
6.2 Enlaces externos
Definici�n y sus l�mites
De manera menos general y precisa, se ha definido mol�cula como la parte m�s
peque�a de una sustancia qu�mica que conserva sus propiedades qu�micas, y a partir
de la cual se puede reconstituir la sustancia sin reacciones qu�micas. De acuerdo
con esta definici�n, que resulta razonablemente �til para aquellas sustancias puras
constituidas por mol�culas, podr�an existir las "mol�culas monoat�micas" de gases
nobles, mientras que las redes cristalinas, sales, metales y la mayor�a de vidrios
quedar�an en una situaci�n confusa.

Las mol�culas l�biles pueden perder su consistencia en tiempos relativamente

cortos, pero si el tiempo de vida medio es del orden de unas pocas vibraciones
moleculares, estamos ante un estado de transici�n que no se puede considerar
mol�cula. Actualmente, es posible el uso de l�ser pulsado para el estudio de la
qu�mica de estos sistemas.

Las entidades que comparten la definici�n de las mol�culas pero tienen carga
el�ctrica se denominan iones poliat�micos, iones moleculares o mol�culas ion. Las
sales compuestas por iones poliat�micos se clasifican habitualmente dentro de los
materiales de base molecular o materiales moleculares.

Las part�culas est�n formadas por mol�culas. Una mol�cula viene a ser la porci�n de
materia m�s peque�a que a�n conserva las propiedades de la materia original.Las
mol�culas se encuentran fuertemente enlazadas con la finalidad de formar
materia.Las mol�culas est�n formadas por �tomos unidos por medio de enlaces
qu�micos.

Tipos de mol�culas
Las mol�culas se pueden clasificar en:

Mol�culas discretas: constituidas por un n�mero bien definido de �tomos, sean estos
del mismo elemento (mol�culas homonucleares, como el dinitr�geno o el fullereno) o
de elementos distintos (mol�culas heteronucleares, como el agua).

Mol�cula de dinitr�geno, el gas que es el componente mayoritario del aire

Mol�cula de fullereno, tercera forma estable del carbono tras el diamante y el

grafito
Mol�cula de agua, "disolvente universal", de importancia fundamental en
innumerables procesos bioqu�micos e industriales

Representaci�n poli�drica del ani�n de Keggin, un poliani�n molecular

Macromol�culas o pol�meros: constituidas por la repetici�n de una unidad

comparativamente simple -o un conjunto limitado de dichas unidades- y que alcanzan
pesos moleculares relativamente altos.

Representaci�n de un fragmento de ADN, un pol�mero de importancia fundamental en la

gen�tica

Enlace pept�dico que une los p�ptidos para formar prote�nas

Representaci�n de un fragmento lineal de polietileno, el pl�stico m�s usado

Primera generaci�n de un dendr�mero, un tipo especial de pol�mero que crece de

forma fractal

Descripci�n
La estructura molecular puede ser descrita de diferentes formas. La f�rmula
molecular es �til para mol�culas sencillas, como H2O para el agua o NH3 para el
amon�aco. Contiene los s�mbolos de los elementos presentes en la mol�cula, as� como
su proporci�n indicada por los sub�ndices.

Para mol�culas m�s complejas, como las que se encuentran com�nmente en qu�mica
org�nica, la f�rmula qu�mica no es suficiente, y vale la pena usar una f�rmula
estructural o una f�rmula esqueletal, las que indican gr�ficamente la disposici�n
espacial de los distintos grupos funcionales.

Cuando se quieren mostrar variadas propiedades moleculares, o se trata de sistemas

muy complejos como prote�nas, ADN o pol�meros, se utilizan representaciones
especiales, como los modelos tridimensionales (f�sicos o representados por
ordenador). En prote�nas, por ejemplo, cabe distinguir entre estructura primaria
(orden de los amino�cidos), secundaria (primer plegamiento en h�lices, hojas,
giros�), terciaria (plegamiento de las estructuras tipo h�lice/hoja/giro para dar
gl�bulos) y cuaternaria (organizaci�n espacial entre los diferentes gl�bulos).

Figura 1. Representaciones de la terpenoide, atisano, 3D (centro izquierda) y 2D

(derecha). En el modelo 3D de la izquierda, los �tomos de carbono est�n
representados por esferas azules; las blancas representan a los �tomos de hidr�geno
y los cilindros representan los enlaces. El modelo es una representaci�n de la
superficies molecular, coloreada por �reas de carga el�ctrica positiva (rojo) o
negativa (azul). En el modelo 3D del centro, las esferas azul claro representan
�tomos de carbono, las blancas de hidr�geno y los cilindros entre los �tomos son
los enlaces simples.
Mol�culas en la teor�a cu�ntica
La mec�nica cl�sica y el electromagnetismo cl�sico no pod�an explicar la existencia
y estabilidad de las mol�culas ya que de acuerdo con sus ecuaciones una carga
el�ctrica acelerada emitir�a radiaci�n por lo que los electrones necesariamente
perder�an energ�a cin�tica por radiaci�n hasta caer sobre el n�cleo at�mico. La
mec�nica cu�ntica provey� el primer modelo cualitativamente correcto que adem�s
predec�a la existencia de �tomos estables y proporcionaba explicaci�n cuantitativa
muy aproximada para fen�menos emp�ricos como los espectros de emisi�n
caracter�sticos de cada elemento qu�mico.

En mec�nica cu�ntica una mol�cula o un ion poliat�mico se describe como un sistema

formado por {\displaystyle N} N electrones de masa {\displaystyle m} m y
{\displaystyle M} M n�cleos de masas {\displaystyle m_{j}} {\displaystyle m_{j}}.
En mec�nica cu�ntica las interacciones f�sicas de estos elementos se presentan por
un hamiltoniano cu�ntico, cuyos autovalores ser�n las energ�as permitidas del
sistema y cuyas autofunciones describir�n los orbitales moleculares de la mol�cula,
y de esos objetos se podr�n deducir las propiedades qu�micas de la mol�cula. En lo
que sigue se designar� mediante e, la carga de cada electr�n, mientras que la de
cada n�cleo, con {\displaystyle Z_{j}} {\displaystyle Z_{j}} protones, ser�
{\displaystyle Z_{j}e} {\displaystyle Z_{j}e}. Para estudiar este sistema es
necesario analizar el siguiente hamiltoniano cu�ntico:

(1) {\displaystyle {\hat {H}}_{mol}=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla

_{x_{j}}^{2}-\sum _{j=1}^{M}{\frac {\hbar ^{2}}{2m_{j}}}\nabla _{y_{j}}^{2}+V(x,y)}
{\displaystyle {\hat {H}}_{mol}=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla
_{x_{j}}^{2}-\sum _{j=1}^{M}{\frac {\hbar ^{2}}{2m_{j}}}\nabla _{y_{j}}^{2}+V(x,y)}

definido sobre el espacio de funciones antismetrizadas de cuadrado integrable

{\displaystyle L_{sym}^{2}(\mathbb {R} ^{3(N+M)})} {\displaystyle L_{sym}^{2}
(\mathbb {R} ^{3(N+M)})}, las coordenadas asociadas a las posiciones de los
electrones vienen dadas por {\displaystyle x=(x_{\dot {a}}2,\dots ,x_{N})\in
\mathbb {R} ^{3N}} {\displaystyle x=(x_{\dot {a}}2,\dots ,x_{N})\in \mathbb {R}
^{3N}} y la de los n�cleos at�micos vienen dadas por {\displaystyle
y=(y_{1},\dots ,y_{M})\in \mathbb {R} ^{3M}} {\displaystyle y=(y_{1},\dots
,y_{M})\in \mathbb {R} ^{3M}}. Y las interacciones electrost�ticas entre electrones
y n�cleos vienen dadas por el potencial {\displaystyle V(x,y)} {\displaystyle
V(x,y)} que se puede escribir como:

(2) {\displaystyle V(x,y)={\frac {1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac {e^{2}}{\|x_{i}-

x_{j}\|}}-\sum _{i,j}{\frac {Z_{j}e^{2}}{\|x_{i}-y_{j}\|}}+{\frac {1}{2}}\sum
_{i\neq j}{\frac {Z_{i}Z_{j}e^{2}}{\|y_{i}-y_{j}\|}}} {\displaystyle V(x,y)={\frac
{1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac {e^{2}}{\|x_{i}-x_{j}\|}}-\sum _{i,j}{\frac
{Z_{j}e^{2}}{\|x_{i}-y_{j}\|}}+{\frac {1}{2}}\sum _{i\neq j}{\frac
{Z_{i}Z_{j}e^{2}}{\|y_{i}-y_{j}\|}}}

donde el primer t�rmino representa la interacci�n de los electrones entre s�, el

segundo la interacci�n de los electrones con los n�cleos at�micos, y el tercero las
interacciones de los n�cleos entre s�. En una mol�cula neutra se tendr� obviamente
que:

{\displaystyle \sum _{j=1}^{M}Z_{j}=N} {\displaystyle \sum _{j=1}^{M}Z_{j}=N}

Si {\displaystyle M=1} {\displaystyle M=1} se tendr� un �tomo polielectr�nico si

{\displaystyle Z_{1}>1} {\displaystyle Z_{1}>1}, y un �tomo hidrogenoide si
{\displaystyle Z_{1}=1} {\displaystyle Z_{1}=1}.

Aproximaci�n de Born-Oppenheimer
Resolver el problema de autovalores y autofunciones para el hamiltoniano cu�ntico
dado por (1) es un problema matem�tico dif�cil, por lo que es com�n simplificarlo
de alguna manera. As� dado que los n�cleos at�micos son mucho m�s pesados que los
electrones (entre 103 y 105 veces m�s) puede suponerse que los n�cleos at�micos
apenas se mueven comparados con los electrones, por lo que se considera que est�n
congelados en posiciones fijas, con lo cual se puede aproximar el hamiltoniano (1)
por la aproximaci�n de Born-Oppenheimer dada por:

(3) {\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)=-\sum _{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}

{2m}}\nabla _{x_{j}}^{2}+V(x,y)} {\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)=-\sum
_{j=1}^{N}{\frac {\hbar ^{2}}{2m}}\nabla _{x_{j}}^{2}+V(x,y)}

definido sobre el espacio de funciones {\displaystyle L_{sym}^{2}(\mathbb {R}

^{3N})} {\displaystyle L_{sym}^{2}(\mathbb {R} ^{3N})} y donde {\displaystyle
y\in \mathbb {R} ^{3M}} {\displaystyle y\in \mathbb {R} ^{3M}} es la posici�n de
los n�cleos que para el an�lisis se considera fija. El resultado b�sico de este
an�lisis viene dado por el siguiente resultado matem�tico:

Teorema de Kato

Los operadores {\displaystyle {\hat {H}}_{m}ol} {\displaystyle {\hat {H}}_{m}ol} y

{\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}(y)} {\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}
(y)} son autoadjuntos y acotados inferiormente.

Tosio Kato
La propiedad de ser autoadjunto implicar� que las energ�as son cantidades reales, y
el que sean acotados inferiormente implicar� que existe un estado fundamental de
m�nima energ�a por debajo del cual los electrones no pueden decaer, y por tanto,
las mol�culas ser�n estables ya que los electrones no pueden perder y perder
energ�a como parec�an predecir las ecuaciones del electromagnetismo cl�sico. Dos
resultados matem�ticos adicionales nos dicen como son las energ�as permitidas de
los electrones dentro de una mol�cula:10?

Teorema HVZ para �tomos y mol�culas BO

El espectro esencial {\displaystyle \sigma _{ess}({\hat {H}}_{mol,N}^{BO})=[\Sigma

_{N},\infty )} {\displaystyle \sigma _{ess}({\hat {H}}_{mol,N}^{BO})=[\Sigma
_{N},\infty )}, donde {\displaystyle \Sigma _{N}=\inf({\hat {H}}_{mol,N-1}^{BO})}
{\displaystyle \Sigma _{N}=\inf({\hat {H}}_{mol,N-1}^{BO})}, la energ�a
{\displaystyle \Sigma _{N}} {\displaystyle \Sigma _{N}} se denomina umbral de
ionizaci�n.

W. Hunziker, C. Van Winter y G. M. Zhislin

Adem�s dentro de la mec�nica cu�ntica puede demostrarse que pueden existir iones
positivos (cationes, con carga positiva comparable al n�cleo at�mico), mientras que
no es igual de f�cil tener iones negativos (aniones), el siguiente resultado
matem�tico implica tiene que ver con la posibilidad de cationes y aniones:10?

Teorema

Para {\displaystyle N<\sum _{j}Z_{j}+1} {\displaystyle N<\sum _{j}Z_{j}+1}, el

hamiltoniano {\displaystyle {\hat {H}}_{mol,N}^{BO}} {\displaystyle {\hat
{H}}_{mol,N}^{BO}} tiene un n�mero infinito de autovalores (energ�as permitidas)
por debajo del umbral de ionizaci�n {\displaystyle \Sigma _{N}} {\displaystyle
\Sigma _{N}}, adem�s los estados ligados {\displaystyle \Psi _{N}^{(i)}
(x_{1},x_{2},\dots ,x_{N})} {\displaystyle \Psi _{N}^{(i)}(x_{1},x_{2},\dots
,x_{N})}, con energ�as {\displaystyle E_{N}^{(i)}<\Sigma _{N}} {\displaystyle
E_{N}^{(i)}<\Sigma _{N}} satisfacen la cota exponencial

{\displaystyle \int _{\mathbb {R} ^{3N}}|\Psi _{N}^{(i)}(x)|^{2}e^{2\alpha \|

x\|}d^{3N}x<\infty ,\qquad \forall \alpha <{\sqrt {\Sigma _{N}-E_{N}^{(i)}}}}
{\displaystyle \int _{\mathbb {R} ^{3N}}|\Psi _{N}^{(i)}(x)|^{2}e^{2\alpha \|
x\|}d^{3N}x<\infty ,\qquad \forall \alpha <{\sqrt {\Sigma _{N}-E_{N}^{(i)}}}}