Bioquimica clase I

Introducción a la Bioquímica
Definición de la Bioquímica

Es la química de los sistemas biológicos, es el estudio de los componentes

químicos en las células vivas y que relaciones o qué tipo de comunicación
mantienen entre ellas, para llevar a cabo reacciones metabólicas.

Es la química del carbono, en términos más precisos.

 Estudia la estructura, propiedades y función de las biomoleculas que

forman a los seres vivos
 Analiza cómo estas biomoleculas interactúan entre sí para generar
procesos metabólicos que son procesos dinámicos.
 Como estas biomoleculas interactúan entre sí para formar estructuras
mucho más complejas que son complejos macromoleculares, que a su vez
se asocian para crear organelos, los organelos forman células, luego
tejidos, hasta llegar a la formación del órgano.
 Como los seres vivos son capaces de extraer energía de los ecosistemas
biológicos del medio en el que se encuentren
 Los mecanismos de cómo nos perpetuamos, como somos capaces de
generar múltiples copias de nosotros

¿Por qué un estudiante de medicina debe estudiar la bioquímica?

Los estudiantes de medicina deben tener un conocimiento de cómo funciona el

sistema biológico humano y una vez teniendo ese conocimiento se puede
intervenir o modificar con distintas estrategias generales, que pueden ser
farmacológicas, quirúrgicas, etc.

Pero para eso se necesita conocer cómo funciona el sistema biológico, como se
puede reparar y las bases fundamentales.

Y eso es lo que hace la bioquímica, quirúrgicamente o farmacológicamente,

permite conocer a nivel molecular las estructuras de los procesos que hacen
posible la vida.

También permite la mejor comprensión de las bases moleculares de las

enfermedades, ya que existen más de 4000 enfermedades cuyo origen está en
una mutación del genoma.

La bioquímica permite desarrollar procesos que permitan diagnosticar esas

alteraciones, por ejemplo:
Existen enzimas marcadoras en sangre que indican que un tejido se está
dañando, hay unas enzimas que están en el hígado (aspartaco aminotransferasa)
que sirven para indicar a los médicos si hay daño hepático, porque en condiciones
normales ellas tienen una concentración determinada en sangre, entonces cuando
existen lesiones en los tejidos, estos se rompen y el contenido de la célula se
daña; Entonces a partir de esto se puede decir que si el funcionamiento de esta
enzima o de estas enzimas marcadoras, que tienen su localización en el
citoplasma de las células del hígado y esas células están sufriendo algún tipo de
daño, se va a liberar a la circulación y entonces se puede detectar.

Todos esos conocimientos los ofrece la bioquímica.

Otro ejemplo, es que al conocer los niveles de glucosa que hay en sangre y al ver
que una persona está por encima de ese nivel se podría estar presentando una
diabetes.

Entonces, permite desarrollar drogas y nuevas estrategias para poder intervenir

ese sistema.

¿Que distingue a los organismos vivos de los objetos inanimados?

Los organismos vivos son altamente complejos, tanto en estructura como en

organización.

Tienen capacidad de extraer energía de su entorno, transformarla y usarla (Los

seres humanos por ser heterótrofos la extraemos a través de los alimentos
consumidos en la dieta y las plantas lo pueden hacer mediante el mecanismo de la
fotosíntesis).Los alimentos son ricos en electrones que son removidos
enzimáticamente, lo que conlleva a la liberación de energía que luego es
almacenada temporalmente en algunas moléculas como el ATP para
posteriormente ser usada en algunas actividades.

La capacidad de autoreplicarse y crear múltiples copias de sí mismo, y así mismo

la capacidad de autoregularse, y esa información esta codificada en el material
genético (DNA)

Los sistemas biológicos que componen la célula siempre tienen una función y si
no se conoce aún es porque no se ha investigado bien, ya sea a nivel
macroscópico o microscópico.

La materia inanimada a diferencia de los seres vivos está compuesta por mezclas
sencillas y poseen un nivel de organización casi inexistente
La materia inerte no usa la energía y por lo tanto no la procesa, si no que más bien
por las condiciones del entorno tiende a degradarse.

Tampoco tienen capacidad de autoreplicarse ni perpetuarse

¿Cómo la materia viva se diferencia de forma tan radical de la inerte, que

también está formada por la misma clase de átomos?

No existe una respuesta

¿Puede ser un ser vivo más que la suma de sus partes inanimadas?

Sí, porque todos están organizados de manera tal que puedan cumplir funciones
específicas.

¿Por dónde pasa la frontera que separa lo vivo de lo no vivo?

Estas son grandes preguntas que no tienen respuestas aun, hay muchas teorías y
especulaciones al respecto pero nada en concreto.

¿Qué procesos se llevaron a cabo para que la materia inerte adquiriera la

condición de materia viva?

Insistentemente no hay respuesta, no se sabe el límite en el cual una roca pudo

convertirse en un ser vivo.

La bioquímica actualmente ante estas preguntas establece que las moléculas que
forman a los seres vivos interactúan entre sí para crear la actividad que llamamos
vida, de acuerdo a las mismas leyes que rigen la materia inanimada.

Caracteristicas que distinguen a los seres vivos

1. Sus moléculas están formadas por las mismas subunidades monomericas

Esto involucra a toda la escala biológica, desde la bacteria hasta los seres
humanos.

Se sabe que los seres vivos contienen miles y miles de moléculas distintas pero se
sabe que cada una de esas moléculas, por ejemplo, proteínas, acidos nucleicos,
carbohidratos y lípidos están formados a su vez por un número reducido y común
de subunidades monomericas unido covalentemente, teniendo una aparente
complejidad determinada por pocos elementos.

Por ejemplo se sabe que en el DNA hay 4 desoxiribonucleotidos y eso es en toda

la escala biológica
Respecto a las proteínas están formadas por 20 aminoácidos también en toda
escala biológica, desde seres muy inferiores hasta los llamados “superiores”
(seres humanos)

Los glúcidos están formados por monosacáridos específicos, los lípidos son
mucho más complejos pero tomando un ejemplo representativo como puede ser
un acido graso igualmente están formados por moléculas que son las mismas en
todos los seres vivos.

Estas unidades son las mismas en todos los seres vivos pero la variabilidad se da
debido a que la unión covalente de las subunidades monomericas se efectúa en
distintas combinaciones y así se dan distintos niveles de complejidad en cada
organismo.

2. Capacidad de absorber y transformar energía del entorno

Esta energía es requerida para mantener funciones biológicas y básicas, procesos

en los cuales el organismo requiere energía, por ejemplo la biosíntesis,
reconstrucción de nuevos tejidos, pero también en el mantenimiento de funciones
de procesos de neurotransmisión en las membranas celulares, muy necesarios y
que son procesos que requieren mucha energía, también está la contracción
muscular, el proceso de transporte activo etc.

3. Somos sistemas termodinámicos abiertos

Intercambiamos, excretamos, liberamos (Transpiracion, liberación de CO2 con la

respiración, consumimos oxígeno, liberamos calor, absorbemos calor en caso de
una temperatura alta en el ambiente) y solo los seres vivos tenemos esas
capacidades de intercambiar materia y energía con el entorno.

4. No estamos en equilibrio con nuestro entorno

Estamos alejados del equilibrio debido a que nuestras concentraciones internas no

son iguales a las del ambiente, cuando el ser vivo muere, se igualan las
concentraciones con el entorno.

El hecho de mantener las concentraciones adecuadas es un proceso que requiere

energía

5. Nos encontramos en un estado estacionario dinámico

Mantenemos una concentración constante de la composición química de las
moléculas que forman parte de nuestro organismo, ese hecho de mantener las
concentraciones constantes también requiere energía y esto requiere de un
sistema que contribuye a que eso se pueda llevar a cabo.

Por ejemplo: En los exámenes de hemoglobina hay valores promedios

12 mg/dl

14 mg/dl

Y en meses al repetir el examen sale el mismo valor promedio, un año después

igual y así sucesivamente, pero no es la misma hemoglobina, ya que como toda
estructura biológica está sometida también a deterioro por interacción con otras
moléculas, por deformaciones, etc., pero en paralelo a esto que se activan
procesos que degradan y disminuye su concentración en sangre, hay toda una
maquinaria que se encarga de permitir el ingreso de nuevas proteínas y por eso la
hemoglobina se mantiene regular en sangre.

Pero esto es gracias a los dos procesos, uno que degrada la hemoglobina y otro
de biosíntesis, produciendo un equilibrio y manteniendo un valor constante, pero
todo debido a un proceso previo.

Por ello estamos en equilibrio estacionario pero como no es estático, es un

proceso dinámico.

Otro ejemplo es en los exámenes de glucosa cuyos valores normales son entre

60 mg/dl

110 mg/dl

Si dicho valor se mantiene constante, no quiere decir que esa glucosa en sangre
no está siendo utilizada, al contrario, está siendo utilizada en diversos procesos
como su oxidación para obtener energía, está siendo almacenada y convertida en
ácidos grasos o almacenada como glucógeno en el hígado y músculos, etc. Pero a
la vez está ingresando al organismo mediante la dieta; Entonces hay una
concentración que parece estacionaria pero no es estática, es dinámica.

6. Dependemos de la radiación solar

La vida en el planeta depende en más del 99.9% de la energía que proviene de la

radiación solar
Un ejemplo son las plantas con la fotosíntesis, que en pocas palabras le quitan los
hidrógenos al agua para colocárselos al carbono e hidratarlo, de ahí viene el
nombre de “carbohidratos” y en ese proceso es necesario obtener energía, la cual
proviene del sol. Por eso cuando comemos una planta o un animal que ha comido
pasto (por ejemplo) estamos consumiendo energía proveniente del sol.

7. El proceso de obtención de energía en los seres vivos es a través de

reacciones de óxido – reducción

En los sistemas biológicos para la liberación u obtención de energía es a través de

reacciones de óxido reducción,

Una sustancia que pierde electrones – Se oxida

Una sustancia que gana electrones – Se reduce

Por ejemplo, en las plantas cuando se toman los hidrógenos del agua para
colocárselos al carbono, el agua se oxida.

8. Las enzimas son las que catalizan (aceleran) las reacciones químicas

Las reacciones no ocurren de manera espontánea, son aceleradas por

catalizadores biológicas, las enzimas, tipos especializados de proteínas que tienen
la función de convertir una sustancia A en una sustancia B, en este caso
Reactante A en Producto B.

Las enzimas son moléculas con actividad catalítica, que hacen que diversas
reacciones ocurran, ya que de manera espontánea no se van a producir

Frecuentemente son proteínas pero hace más de 30 años se comenzaron a notar

diversas moléculas que no son de naturaleza proteica pero tienen funciones
catalíticas, que son las llamadas Ribozimas las cuales son RNA con función
catalítica.

Cada reacción es catalizada por una enzima diferente con una función específica

La mayoría de estas reacciones catalizadas por las enzimas lo hacen de forma

secuencial, una tras otra: A – B – C – D etc., y se conoce como vías o rutas
metabólicas.

Por ejemplo, la glucolisis, si hay oxigeno son 10 reacciones, si no hay oxigeno son
11, el ciclo de Krebs son 8 reacciones, etc., Hay una red interconectada, cada
reacción catalizada por una enzima especializada diferente.
¿Qué papel hace la enzima?: Para convertir al reactante A en el producto B se
requiere de una energía denominada “Energia de activación”, para pasar a un
estado de transición en el cual no se sabe si es completamente reactante o
producto, y una vez alcanzado ese estado se desencadenan un conjunto de
procesos para que la reacción se lleve a cabo.

¿Cuál es la diferencia entre una reacción catalizada y una no catalizada?: La no

catalizada por la enzima requiere de un mayor nivel de energía de activación para
que la reacción se pueda llevar a cabo, mientras que en la catalizada, la enzima
se encarga de reducir la energía de activación para que el proceso se lleve a cabo
en un periodo de tiempo más corto.

9. Las reacciones químicas están autoreguladas

Son varios mecanismos de autoregulacion en las reacciones existentes

Por ejemplo: La modificación covalente es cuando le agregas un fosfato a la

enzima y ésta entonces cambia su actividad, y puede incrementar o disminuir,
dependiendo del tipo de enzima

O Inhibicion por producto final (Retroalimentacion negativa), que se trata de que

muchas veces el producto final de una reacción actúa como inhibidor sobre la
enzima para impedir que esta siga trabajando.

Dependiendo de las necesidades que se tenga se requerirá un determinado

producto, de manera que cuando la necesidad sea satisfecha se regula o inhibe el
funcionamiento de la enzima catalizadora de esa reacción para impedir que
continúe catalizando la reacción.

Y esta inhibición ocurre en la primera o segunda enzima de la cadena como

mecanismo de ahorro de energía.

10. Acoplan sus reacciones endergonicas con las exergonicas

Desde el punto de vista energético las reacciones pueden clasificarse en dos

grandes grupos

Las exergonicas son las que liberan energía

Las endergonicas absorben energía

En una reacción, por ejemplo, en reacciones exergonicas A se convierte en

producto B y como libera energía el producto B tendrá menos cantidad de energía
que tiene A, es decir su valor de energía va a ser menor que 0 (Estas son
reacciones favorecidas que se dan de manera espontánea)
En una reacción endergonica D se va a convertir en C, pero el producto tiene más
contenido de energía que el reactante, es decir que su valor de energía va a ser
mayor que 0. (Es un proceso desfavorable porque requiere energía y no se da de
forma espontánea).

La naturaleza acopla aquellas reacciones que liberan energía con las que la
absorben.

Cuando hay un valor negativo automáticamente se sabe que es una reacción

exergonica y esta favorecida; y viceversa con las endergonicas.

11. En los ácidos nucleicos es donde esta codificada la información genética

Es decir es donde se encuentran las instrucciones del organismo, de donde parte

el ser vivo de cero, su mecanismo de autoensamblarse y de autoregularse para
perpetuarse.

El proceso requiere una alta fidelidad para evitar mutaciones

La información genética termina expresándose en secuencias de proteínas

12. Capacidad de evolucionar

De lo contrario seguiríamos siendo coacervados y no hubiésemos podido cambiar

como lo hemos hecho, por lo tanto evolucionar es una condición primordial de los
seres vivos.

Por ejemplo, los cambios en el DNA a partir de las replicaciones de este, pueden
hacer que se matifique alguna pequeña mutación.

La selección natural es un ejemplo en la evolución debido a que dependiendo del

entorno o el ambiente en donde un ser vivo se envuelve sus próximas
generaciones irán cambiando sus características para adaptarse o correría peligro

Resumen:

 Sus moléculas están formadas por las mismas subunidades monomericas

 Tienen capacidad de tomar y transformar energía de su entorno
 Son sistemas termodinámicos abiertos
 No están en equilibrio con su entorno
 Se encuentran en estado estacionario dinámico, no estático
 Sus necesidades energéticas dependen directa o indirectamente del sol
 Obtienen su energía de reacciones de óxido – reducción
 Las enzimas son las que catalizan las reacciones químicas
  Las reacciones químicas están autoreguladas
 Acoplan sus reacciones enzimáticas endergonicas y exergonicas
 La molécula de DNA es la portadora de la información genética
 Tiene la capacidad de evolucionar

¿De qué estamos hechos? De un grupo de elementos particulares, que provienen

de hace miles de millones de años.

Estamos formados de aproximadamente 30 elementos presentes en la tabla

periódica.

Y lo que representa más del 90% es Carbono, Hidrogeno, Nitrogeno, Oxigeno,

Azufre y fosforo

Todos son de bajo número atómico

Ellos representan aproximadamente más del 99% de la masa de la celula y el otro

1% puede estar representado por otro elemento como Sodio, Calcio, Magnesio,
Hierro, etc.

Tienen una característica importante estos elementos que conforman los seres
vivos, que es la capacidad de crear enlaces simples, dobles y triples, a eso se le
llama versatilidad desde el punto de vista molecular.

Una característica importante de los elementos que conforman al ser vivo tiene
que ver con la valencia, ya que debido a su número tiene la capacidad de formar
enlaces con otros elementos.

Importancia estructural del carbono en las biomoleculas

 Representa el 50%
 Puede formar enlaces sencillos, dobles y triples con el oxígeno y el
nitrógeno
 Pueden presentar estructuras lineales, ramificadas y cíclicas (Como el
benceno por ejemplo)
 También puede formar estructuras tridimensionales mediante uniones
simples
 Forma los conocidos grupos funcionales (Agrupaciones de átomos
particulares que determinan la reactividad de muchas sustancias) Por ej:
Alcoholes, aminas, amidas, carboxilo, cetona, etc.